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当前共找到 726 篇文献，本页显示第 661 - 680 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 661 | 2025-10-07 |
GCLink: a graph contrastive link prediction framework for gene regulatory network inference
2025-Mar-04, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf074
PMID:39960893
|
研究论文 | 提出一种基于图对比学习的链接预测框架GCLink，用于从单细胞RNA测序数据推断基因调控网络 | 引入图对比学习策略聚合基因的特征和邻域信息，减少对样本量的依赖并提升预测潜在基因调控相互作用的能力 | 未明确说明模型在极稀疏数据场景下的性能表现 | 开发能够从单细胞RNA测序数据准确推断基因调控网络的计算方法 | 基因调控网络和基因间调控相互作用 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图对比学习链接预测模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 662 | 2025-10-07 |
Benchmarking copy number aberrations inference tools using single-cell multi-omics datasets
2025-Mar-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf076
PMID:40037644
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研究论文 | 本研究对五种从单细胞RNA测序数据推断拷贝数变异的计算方法进行了全面性能评估 | 首次对单细胞多组学数据集中的拷贝数变异推断工具进行独立综合基准测试 | 仅评估了五种计算方法，可能未涵盖所有可用工具 | 评估和比较从单细胞RNA测序数据推断拷贝数变异的计算工具性能 | 五种最先进的拷贝数变异推断计算方法 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 663 | 2025-10-07 |
Single cell immunoprofile of synovial fluid in rheumatoid arthritis with TNF/JAK inhibitor treatment
2025-Mar-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57361-0
PMID:40038288
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析类风湿关节炎患者滑膜液中免疫细胞的特征及其在TNF/JAK抑制剂治疗后的变化 | 首次在单细胞水平揭示滑膜液来源的致病细胞（SPP1巨噬细胞和CXCL13CD4 T细胞）在类风湿关节炎治疗中的功能作用及细胞间通讯机制 | 样本量有限，主要关注滑膜液细胞而未全面分析其他组织类型 | 研究类风湿关节炎患者滑膜液中致病细胞在TNF/JAK抑制剂治疗过程中的变化机制 | 类风湿关节炎患者的滑膜液样本和胶原诱导关节炎小鼠模型 | 单细胞组学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 类风湿关节炎患者滑膜液样本（治疗前后对比） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 664 | 2025-10-07 |
E3 ubiquitin ligase RNF128 promotes Lys63-linked polyubiquitination on SRB1 in macrophages and aggravates atherosclerosis
2025-Mar-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57404-6
PMID:40038329
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研究论文 | 本研究揭示E3泛素连接酶RNF128通过促进SRB1的Lys63多聚泛素化加重动脉粥样硬化 | 首次发现RNF128在动脉粥样硬化巨噬细胞中的特异性表达及其通过调控SRB1循环的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 探究RNF128在动脉粥样硬化发病机制中的作用 | 巨噬细胞、泡沫细胞形成过程 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、分子机制研究 | NA | 基因表达数据、分子相互作用数据 | ApoE和LDLR缺陷的雄性和雌性小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 665 | 2025-10-07 |
Investigation of cell development and tissue structure network based on natural Language processing of scRNA-seq data
2025-Mar-04, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06263-2
PMID:40038714
|
研究论文 | 提出一种基于自然语言处理的单细胞RNA测序数据分析方法，通过将基因类比为单词构建嵌入表示 | 首次将自然语言处理中的word2vec技术应用于单细胞RNA测序数据分析，将基因序列视为单词进行嵌入表示 | 未提及具体的数据集验证和性能对比分析 | 开发计算高效的单细胞多组学数据分析方法 | 单细胞RNA测序数据中的基因、细胞和组织 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | word2vec | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 666 | 2025-10-07 |
Single-cell lineage tracing techniques in hematology: unraveling the cellular narrative
2025-Mar-04, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06318-4
PMID:40038725
|
综述 | 本文综述了单细胞谱系追踪技术在血液学领域的应用进展 | 重点介绍了整合条形码、CRISPR条形码和碱基编辑器等新兴单细胞谱系追踪技术的优势 | NA | 探索单细胞谱系追踪技术在血液系统研究中的应用价值 | 血液系统中的细胞谱系，包括造血干细胞和血液系统恶性肿瘤细胞 | 单细胞生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞谱系追踪技术 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 667 | 2025-10-07 |
Histidine metabolism drives liver cancer progression via immune microenvironment modulation through metabolic reprogramming
2025-Mar-04, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06267-y
PMID:40038727
|
研究论文 | 本研究揭示了组氨酸代谢通过代谢重编程调控免疫微环境促进肝癌进展的机制 | 首次在单细胞水平系统阐明组氨酸代谢通过BUD23基因调控肿瘤免疫微环境的机制 | 机制研究仍需进一步深入，临床转化价值需要更多验证 | 探究组氨酸代谢在肝癌进展中的作用机制 | 肝细胞癌样本、免疫细胞（巨噬细胞、T细胞） | 肿瘤免疫学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、体内外实验、TCGA数据分析 | 多变量Cox回归预后模型 | 单细胞RNA测序数据、临床数据 | 肝癌样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 668 | 2025-10-07 |
Benchmarking single-cell cross-omics imputation methods for surface protein expression
2025-Mar-04, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03514-9
PMID:40038818
|
研究论文 | 对12种单细胞跨组学表面蛋白表达插补方法进行综合基准测试 | 首次对表面蛋白数据插补方法进行大规模综合基准测试，涵盖多种数据集和场景 | 仅评估了现有方法，未提出新的插补算法 | 评估单细胞RNA测序数据预测表面蛋白表达的插补方法性能 | 12种最先进的单细胞表面蛋白数据插补方法 | 单细胞组学 | NA | 单细胞多组学测序，CITE-seq，REAP-seq，scRNA-seq | 多种插补方法（包括Seurat v3/v4 PCA等） | 单细胞转录组和表面蛋白组数据 | 11个数据集 | NA | 单细胞多组学测序，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 669 | 2025-10-07 |
Cellular interactions within the immune microenvironment underpins resistance to cell cycle inhibition in breast cancers
2025-Mar-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56279-x
PMID:40032842
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了高风险ER+乳腺癌对CDK4/6抑制剂产生耐药性的免疫微环境机制 | 首次在纵向收集的乳腺癌样本中发现癌细胞通过上调细胞因子促进免疫抑制性髓系细胞分化，从而削弱CD8+T细胞功能的耐药机制 | 样本量相对有限，且主要针对高风险ER+乳腺癌患者 | 探究乳腺癌免疫微环境在CDK4/6抑制剂治疗耐药中的作用机制 | II期和III期高风险雌激素受体阳性乳腺癌患者 | 单细胞测序分析 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 纵向收集的系列活检样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 670 | 2025-10-07 |
The Hydractinia cell atlas reveals cellular and molecular principles of cnidarian coloniality
2025-Mar-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57168-z
PMID:40032860
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学构建了Hydractinia细胞图谱，揭示了刺胞动物群体性的细胞和分子机制 | 发现了与生物矿化和几丁质合成相关的特异性匍匐茎细胞类型，以及介导自我/非我识别的新细胞类型 | 研究仅针对Hydractinia symbiolongicarpus物种，可能不适用于其他群体性生物 | 探究刺胞动物群体性结构的细胞和分子基础 | Hydractinia symbiolongicarpus的约200,000个细胞，包括匍匐茎和两种水螅体类型 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 约200,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 671 | 2025-10-07 |
Topical TYK2 inhibitor ameliorates psoriasis-like dermatitis via the AKT-SP1-NGFR-AP1 pathway in keratinocytes
2025-Mar, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70256
PMID:40038877
|
研究论文 | 本研究探讨了局部应用TYK2抑制剂对银屑病的治疗效果及其通过AKT-SP1-NGFR-AP1通路调节角质形成细胞炎症反应的机制 | 首次探索TYK2抑制剂局部给药治疗银屑病的潜力，并揭示其通过AKT-SP1-NGFR-AP1通路调节角质形成细胞炎症反应的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，尚未进行人体临床试验 | 研究局部应用TYK2抑制剂治疗银屑病的疗效及其作用机制 | 咪喹莫特诱导的银屑病样皮炎小鼠模型和人类角质形成细胞 | 分子生物学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,RNA测序,双荧光素酶报告基因检测,ChIP-qPCR | NA | 基因表达数据,蛋白质相互作用数据 | 银屑病小鼠模型和人类角质形成细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 672 | 2025-10-07 |
The Hypoxia-Associated High-Risk Cell Subpopulation Distinctly Enhances the Progression of Glioma
2025-Mar-06, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202416231
PMID:40047299
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序识别出与胶质瘤进展相关的CDC20/KIF20A/PTTG1标记的高风险细胞亚群 | 首次聚焦于低级别胶质瘤起源的高风险细胞亚群，发现其通过缺氧核心激活驱动胶质瘤进展的机制 | NA | 探究低级别胶质瘤向胶质母细胞瘤转化的关键细胞亚群及其治疗策略 | 低级别胶质瘤样本和胶质瘤细胞亚群 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序,多重免疫荧光染色 | NA | 单细胞测序数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 673 | 2025-10-07 |
Novel photocrosslinking chemical probes utilized for high-resolution spatial transcriptomics
2025-Mar-05, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d4cb00262h
PMID:39845105
|
研究论文 | 开发了一种名为CrossSeq的新型空间转录组学技术，利用光交联化学探针和共聚焦显微镜在固定细胞上标记感兴趣区域 | 采用光交联荧光探针和共聚焦显微镜激活技术，能够在固定细胞上定义用户感兴趣区域进行多重空间转录组分析 | 未明确说明技术在处理更复杂组织样本时的适用性和分辨率限制 | 开发高分辨率空间转录组学技术以解决当前细胞标记方法的空间分辨率和多重分析限制 | 固定细胞和MDA-MB-231-LM2转移性癌症迁移模型 | 空间转录组学 | 转移性癌症 | 光交联技术、共聚焦显微镜、流式细胞术 | NA | 转录组数据、图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | CrossSeq技术平台，使用光交联荧光探针和共聚焦显微镜 |
| 674 | 2025-10-07 |
Single cell transcriptomic analysis reveals tumor immune infiltration by macrophage cells gene signature in lung adenocarcinoma
2025-Mar-03, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01834-7
PMID:40029500
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析识别肿瘤相关巨噬细胞基因特征，构建肺腺癌预后模型 | 首次通过单细胞RNA测序数据识别肿瘤相关巨噬细胞相关基因特征，并构建包含9个基因的预后风险评分模型 | 样本量相对有限（19例患者的29个样本），需要更多独立队列验证 | 识别肺腺癌中肿瘤相关巨噬细胞相关生物标志物及其预后意义 | 肺腺癌患者肿瘤组织中的巨噬细胞 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析 | LASSO Cox回归模型 | 单细胞RNA测序数据，基因表达数据 | 19例肺腺癌患者的29个单细胞RNA测序样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 675 | 2025-10-07 |
Blood TCTP as a potential biomarker associated with immunosuppressive features and poor clinical outcomes in metastatic gastric cancer
2025-Mar-03, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010455
PMID:40032602
|
研究论文 | 探讨血浆TCTP作为转移性胃癌免疫抑制特征和不良临床结局的潜在生物标志物 | 首次将血浆TCTP与胃癌免疫抑制性髓系细胞特征及临床预后相关联 | 样本量有限，需要更大规模研究验证 | 评估血浆TCTP在晚期胃癌中的预后价值和免疫学意义 | 接受一线化疗或三线纳武利尤单抗治疗的胃癌患者 | 数字病理 | 胃癌 | ELISA, 多重蛋白质组分析, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 血浆样本, 蛋白质表达数据, 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 308名胃癌患者（队列1:143人，队列2:165人） | Olink | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 蛋白质组分析 | NA | Olink多重蛋白质组分析平台 |
| 676 | 2025-10-07 |
The role of senescence-related genes in major depressive disorder: insights from machine learning and single cell analysis
2025-Mar-03, BMC psychiatry
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12888-025-06542-8
PMID:40033248
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研究论文 | 通过机器学习和单细胞分析探讨衰老相关基因在重度抑郁症中的作用 | 首次结合随机森林、支持向量机和单细胞RNA测序技术系统分析衰老相关基因在重度抑郁症中的表达模式和功能 | 样本量相对有限(144例MDD患者和72例对照)，数据来源于公共数据库 | 探索衰老相关基因与重度抑郁症的关联机制 | 重度抑郁症患者和健康对照人群 | 机器学习, 单细胞分析 | 重度抑郁症 | 单细胞RNA测序, 机器学习 | Random Forest, SVM-RFE, 逻辑回归 | 基因表达数据 | 144例MDD患者和72例健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 677 | 2025-10-07 |
Leveraging prior knowledge to infer gene regulatory networks from single-cell RNA-sequencing data
2025-Mar, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-025-00088-3
PMID:39939367
|
综述 | 探讨如何利用先验知识提升单细胞RNA测序数据中基因调控网络推断的可靠性 | 提出整合先验知识的方法分类体系，并建立标准化基准测试框架 | 作为综述文章，不包含原始实验数据验证 | 改进单细胞RNA测序数据中的基因调控网络推断方法 | 基因调控网络推断算法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 678 | 2025-10-07 |
The Exploration of Disturbance of Capillary and Photoreceptor Communication Networks in Diabetic Retinopathy Through Single-Cell RNA-Seq
2025-Mar, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70442
PMID:40032635
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索糖尿病视网膜病变中毛细血管与光感受器细胞通讯网络的扰动机制 | 首次在糖尿病视网膜病变中发现血管内皮细胞与光感受器细胞之间通过PTN、MK、ANGPTL和CXCL信号通路的异常通讯，并鉴定出Angptl4-Sdc4等关键配体-受体对 | 研究样本量较小（仅5只大鼠），且为动物模型研究，需要进一步在人类样本中验证 | 探究糖尿病视网膜病变中血管内皮细胞与光感受器细胞通讯网络的分子机制 | Sprague-Dawley大鼠视网膜组织 | 单细胞测序分析 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序，免疫荧光染色，qPCR，免疫组化，TUNEL，ELISA | NA | 单细胞RNA测序数据 | 5只Sprague-Dawley大鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 679 | 2025-10-07 |
Single-cell analyses reveal metastasis mechanism and microenvironment remodeling of lymph node in intrahepatic cholangiocarcinoma
2025-Mar, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2024.101275
PMID:40041119
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研究论文 | 通过单细胞和多组学分析揭示肝内胆管癌淋巴结转移的机制和微环境重塑 | 首次系统揭示iCCA淋巴结转移微环境的异质性，鉴定CD36+巨噬细胞和SAA1+肿瘤细胞在转移过程中的关键作用 | 样本量相对较小（4例单细胞测序患者），需要更大规模研究验证 | 系统探索肝内胆管癌淋巴结转移相关微环境的异质性 | 肝内胆管癌患者的原发肿瘤、癌旁肝组织和肿瘤引流淋巴结 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫组织化学, 差异基因表达分析, 功能富集分析, 单细胞拷贝数变异评估, 拟时序分析 | NA | 单细胞转录组数据, 组织切片图像 | 4例患者（单细胞测序）, 81例肿瘤和匹配淋巴结组织切片 | NA | 单细胞RNA测序, 多重免疫组织化学 | NA | NA |
| 680 | 2025-10-07 |
EPAS1 induction drives myocardial degeneration in desmoplakin-cardiomyopathy
2025-Mar-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.111895
PMID:40034852
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析发现EPAS1是致心律失常性心肌病中心肌退化的关键调控因子 | 首次在人类扩张型心肌病心脏中发现EPAS1通过调控线粒体稳态参与心肌退化过程 | 研究样本量有限，主要基于单个患者的心脏样本 | 探索桥粒斑蛋白基因突变导致心肌病的分子机制 | 携带致病性DSP基因突变的心肌细胞 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 1例患者心脏样本及多个遗传性心肌病心脏样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |