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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 641 | 2025-10-07 |
Lactylation modification in cancer: mechanisms, functions, and therapeutic strategies
2025-Mar-08, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-025-00622-x
PMID:40057816
|
综述 | 全面总结乳酸化修饰在癌症中的机制、功能及治疗策略 | 首次系统阐述组蛋白乳酸化这一新型翻译后修饰在癌症中的作用机制 | 乳酸化修饰机制研究仍存在诸多障碍和挑战 | 探索乳酸化修饰在癌症中的分子机制及治疗潜力 | 癌症细胞及肿瘤微环境 | 分子生物学 | 癌症 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 642 | 2025-10-07 |
Role of GPX3+ astrocytes in breast cancer brain metastasis activated by circulating tumor cell exosomes
2025-Mar-07, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00833-9
PMID:40055530
|
研究论文 | 本研究揭示了循环肿瘤细胞外泌体激活GPX3+星形胶质细胞驱动乳腺癌脑转移的新机制 | 首次发现CTC外泌体通过激活GPX3+星形胶质细胞促进IL-1β产生和Th17细胞分化,从而形成转移前微环境 | 使用小鼠模型,需要进一步验证人类临床样本中的相关性 | 探究乳腺癌脑转移的分子机制,特别是GPX3+星形胶质细胞在转移过程中的作用 | 乳腺癌脑转移小鼠模型中的GPX3+星形胶质细胞和循环肿瘤细胞 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,代谢组学 | 条件性基因敲除模型 | 基因表达数据,代谢物数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 643 | 2025-10-07 |
Scupa: single-cell unified polarization assessment of immune cells using the single-cell foundation model
2025-Mar-04, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf090
PMID:39999031
|
研究论文 | 开发了首个用于全面评估免疫细胞极化的计算方法Scupa | 首个利用单细胞基础模型进行免疫细胞极化评估的计算方法,整合了免疫字典数据和通用细胞嵌入 | NA | 开发系统性评估细胞因子驱动极化的计算方法 | 免疫细胞 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 基础模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 644 | 2025-10-07 |
Heat Shock Protein Family A Member 1A Attenuates Apoptosis and Oxidative Stress via ERK/JNK Pathway in Hyperplastic Prostate
2025-Mar, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70129
PMID:40066224
|
研究论文 | 本研究探讨热休克蛋白HSPA1A通过ERK/JNK信号通路抑制细胞凋亡和氧化应激在前列腺增生中的作用机制 | 首次揭示HSPA1A在良性前列腺增生中的表达上调及其通过ERK/JNK通路调控细胞凋亡和氧化应激的新机制 | 研究样本量有限,临床相关性分析仅基于单中心数据 | 探究HSPA1A在良性前列腺增生发病机制中的作用 | 前列腺增生组织样本、BPH-1和WPMY-1细胞系、睾酮诱导的大鼠BPH模型 | 分子病理学 | 前列腺增生 | RNA测序, 单细胞测序, 组织芯片分析 | NA | 基因表达数据, 组织切片, 细胞实验数据 | 139例BPH组织标本 | NA | 单细胞RNA测序, 组织芯片 | NA | NA |
| 645 | 2025-10-07 |
AcImpute: a constraint-enhancing smooth-based approach for imputing single-cell RNA sequencing data
2025-Mar-04, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae711
PMID:40037523
|
研究论文 | 提出一种基于约束增强平滑的单细胞RNA测序数据插补方法AcImpute | 通过约束不同表达水平基因在细胞间的平滑权重,有效防止过平滑现象 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中dropout事件对下游分析的影响 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 无监督学习方法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 646 | 2025-10-07 |
Complement activation in tumor microenvironment after neoadjuvant therapy and its impact on pancreatic cancer outcomes
2025-Mar-03, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00848-2
PMID:40032924
|
研究论文 | 本研究探讨新辅助治疗对胰腺癌肿瘤微环境中补体激活的影响及其与患者预后的关系 | 首次揭示新辅助治疗通过上调肿瘤微环境中补体基因表达改善胰腺癌患者预后的新机制 | 样本量有限(36例患者),需要更大规模研究验证 | 研究新辅助治疗对胰腺癌肿瘤微环境的影响及其临床意义 | 胰腺导管腺癌(PDAC)患者 | 空间转录组学 | 胰腺癌 | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 36例PDAC患者(23例接受新辅助治疗,13例未接受) | NA | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 647 | 2025-10-07 |
Inhibition of the Hippo pathway by verteporfin reduces the proliferation and stemness of rat hair follicle neural crest stem cells under hypoxia
2025-Mar, FASEB bioAdvances
IF:2.5Q3
DOI:10.1096/fba.2025-00025
PMID:40060945
|
研究论文 | 本研究探讨了Hippo信号通路在缺氧条件下调控大鼠毛囊神经嵴干细胞增殖和干性维持的作用 | 首次在缺氧环境下研究Hippo通路对毛囊神经嵴干细胞的调控作用,并利用verteporfin抑制该通路 | 研究仅使用大鼠细胞模型,缺乏人体细胞验证 | 探究Hippo信号通路在缺氧条件下对毛囊神经嵴干细胞功能的调控机制 | 大鼠毛囊神经嵴干细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序,实时定量PCR,免疫荧光,Western blotting,CCK8检测 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据,细胞图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 648 | 2025-10-07 |
Spatial-Temporal Diversity of Extrachromosomal DNA Shapes Urothelial Carcinoma Evolution and Tumor-Immune Microenvironment
2025-Mar-11, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-24-1532
PMID:40062518
|
研究论文 | 本研究通过计算分析方法探讨了染色体外DNA在膀胱尿路上皮癌中的时空多样性及其对肿瘤进化和免疫微环境的影响 | 首次系统揭示了ecDNA在膀胱癌中的时空多样性特征,阐明了ecDNA通过结构重排驱动克隆进化的机制,并发现ecDNA+恶性细胞通过下调MHC I类分子表达逃避免疫监视 | 研究主要基于计算分析,需要进一步实验验证ecDNA的功能机制;样本来源相对单一 | 探究ecDNA在膀胱尿路上皮癌进化过程中的作用及其对肿瘤免疫微环境的影响 | 595例膀胱尿路上皮癌患者 | 计算生物学 | 膀胱癌 | 全基因组测序,单细胞RNA测序 | 计算分析方法 | 基因组测序数据,单细胞转录组数据 | 595例患者,包含多区域采样 | NA | 全基因组测序,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 649 | 2025-03-11 |
Corrigendum to "ScRNA-seq reveals trained immunity-engaged Th17 cell activation against Edwardsiella piscicida-induced intestinal inflammation in teleost" [Microbiol. Res. 289 (2024) 127912]
2025-Mar-08, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2025.128137
PMID:40058996
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 650 | 2025-10-07 |
Sustained NF-κB activation allows mutant alveolar stem cells to co-opt a regeneration program for tumor initiation
2025-Mar-06, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.01.011
PMID:39978341
|
研究论文 | 本研究通过命运图谱和单细胞转录组学揭示了肺再生与肿瘤发生之间的相似性,发现持续NF-κB激活使突变肺泡干细胞劫持再生程序启动肿瘤 | 发现两个独立的AT2干细胞亚群具有不同的致瘤能力,揭示Il1r1作为AT2重编程的共同激活因子,阐明NF-κB持续激活是肿瘤发生与再生区别的关键机制 | 研究基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 探究干细胞命运调控信号破坏如何导致肿瘤发生 | 小鼠野生型和KrasG12D突变型肺泡II型干细胞 | 单细胞生物学 | 肺癌 | 命运图谱、克隆分析、单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据、谱系追踪数据 | 数千个小鼠AT2干细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 651 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA-seq reveals the immune response of Co-infection with streptococcus pneumoniae after influenza A virus by a lung-on-chip: The molecular structure and mechanism of tight junction protein ZO-1
2025-Mar-06, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.141815
PMID:40057081
|
研究论文 | 利用肺芯片模型和单细胞RNA测序技术研究甲型流感病毒与肺炎链球菌共感染对肺部免疫反应的影响,重点关注紧密连接蛋白ZO-1的分子结构和作用机制 | 首次结合肺芯片模型和单细胞RNA测序技术揭示IAV和SP共感染诱导的独特转录组变化,特别是ZO-1表达下调和定位异常的分子机制 | 研究基于体外肺芯片模型,可能与体内真实肺部环境存在差异 | 探索甲型流感病毒与肺炎链球菌共感染对肺部免疫反应的影响机制 | 人肺芯片模型、肺上皮细胞、外周血单核细胞分化的巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 肺炎 | 单细胞RNA测序、GO富集分析、多重微珠免疫分析、免疫荧光染色 | 肺芯片模型 | 单细胞转录组数据、图像数据、细胞因子数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 652 | 2025-10-07 |
Endoplasmic reticulum stress and unfolded protein response play roles in recurrent pregnancy loss: A bioinformatics study
2025-Mar, Journal of reproductive immunology
IF:2.9Q2
DOI:10.1016/j.jri.2025.104446
PMID:39923360
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研究论文 | 通过生物信息学方法探讨内质网应激和未折叠蛋白反应在复发性流产中的作用机制 | 首次整合多组学数据系统分析ERS/UPR在RPL中的作用,发现单核/巨噬细胞中相关基因表达上调 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要实验验证 | 探索ERS和UPR过程作为复发性流产预防、诊断和治疗潜在靶点的可能性 | 复发性流产患者基因表达数据 | 生物信息学 | 复发性流产 | 生物信息学分析,单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | GSE165004和GSE26787数据集 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 653 | 2025-10-07 |
Endothelial senescence induced by PAI-1 promotes endometrial fibrosis
2025-Mar-06, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02377-0
PMID:40050610
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序发现纤溶酶原激活物抑制剂-1(PAI-1)诱导的内皮细胞衰老促进子宫内膜纤维化的机制 | 首次揭示PAI-1通过uPAR受体诱导内皮细胞衰老在宫腔粘连发病机制中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 探究宫腔粘连中子宫内膜纤维化的分子机制 | 宫腔粘连患者和小鼠模型中的内皮细胞与基质细胞 | 单细胞生物学 | 妇科疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 654 | 2025-10-07 |
Targeting Caveolin-1 for enhanced rotator cuff repair: findings from single-cell RNA sequencing
2025-Mar-05, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02359-2
PMID:40044676
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析肩袖损伤组织中细胞亚群的异质性,并评估Caveolin-1对脂肪细胞浸润的调控作用 | 首次在单细胞水平揭示Cav-1表达与成脂活性的负相关性,并验证其作为治疗靶点的潜力 | NA | 探索Caveolin-1在肩袖损伤修复中的作用机制 | 肩袖损伤组织中的细胞亚群 | 单细胞测序 | 肩袖损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 655 | 2025-10-07 |
Identification of increased dedifferentiation along the Prom1+ cancer cells in Müllerian adenosarcoma with sarcomatous overgrowth
2025-Mar, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-02943-4
PMID:39920368
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析苗勒管腺肉瘤中Prom1+癌细胞谱系的异质性和去分化过程 | 首次在MASO中发现Prom1+癌细胞存在三种表型分化轨迹,并鉴定出HMGB2/3+亚型为主要的去分化样癌细胞 | 样本量较小,研究聚焦于单一癌症类型 | 探究苗勒管腺肉瘤伴肉瘤样过度生长的肿瘤发生机制 | MASO肿瘤组织及配对正常组织 | 单细胞测序 | 子宫肉瘤 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析,免疫组织化学,体外实验 | 轨迹分析 | 单细胞RNA测序数据,TCGA数据,免疫组化图像 | MASO和配对正常组织(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 656 | 2025-10-07 |
PCBP2 promotes immune evasion via cGAS-STING pathway in biochemical recurrence of prostate cancer
2025-Mar, APL bioengineering
IF:6.6Q1
DOI:10.1063/5.0250173
PMID:40051782
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研究论文 | 本研究探索前列腺癌中癌症内在免疫逃逸相关基因,并开发了预测生化复发的风险特征 | 首次发现PCBP2通过抑制cGAS-STING通路促进前列腺癌免疫逃逸,并建立了基于CIERGs的生化复发预测模型 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 探索前列腺癌免疫逃逸机制并开发生化复发预测模型 | 前列腺癌患者和癌细胞系 | 生物信息学 | 前列腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | LASSO回归, 非负矩阵分解 | 基因表达数据 | TCGA-PRAD和GSE70769队列数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 657 | 2025-10-07 |
Heterogeneities of Site-Specific N-Glycosylation in the Hippocampus of Depression-like Behavior Models in Mice Induced by Acute Stress and Chronic Stress
2025-Mar-07, Journal of proteome research
IF:3.8Q1
DOI:10.1021/acs.jproteome.4c00655
PMID:39992808
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研究论文 | 通过整合N-糖蛋白组学和蛋白质组学分析,研究急性和慢性应激诱导的小鼠抑郁样行为模型中海马区糖蛋白和位点特异性糖基化的异质性 | 首次在急性和慢性应激抑郁模型中系统分析海马区位点特异性N-糖基化异质性,并发现两种应激模式对糖基化的不同影响模式 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证;样本量相对有限 | 探索应激诱导抑郁的糖基化机制 | 对照组、急性应激组和慢性温和应激组小鼠的海马组织 | 蛋白质组学 | 抑郁症 | N-糖蛋白组学、蛋白质组学、单细胞RNA测序 | tSNE | 蛋白质组数据、糖基化数据、单细胞转录组数据 | 三组小鼠海马组织(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 658 | 2025-03-08 |
Erratum for the Research Article "Highly multiplexed spatial transcriptomics in bacteria" by A. Sarfatis et al
2025-Mar-07, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adx0881
PMID:40048545
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 659 | 2024-10-04 |
Unravelling lipidomic disruptions across multiple tissues in Chd8-mutant ASD mice through integration of lipidomics and single-cell transcriptomics
2025-Mar-06, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-332972
PMID:39358004
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 660 | 2025-10-07 |
Adipose-derived stem cells attenuate rheumatoid arthritis by restoring CX3CR1+ synovial lining macrophage barrier
2025-Mar-05, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04144-5
PMID:40038808
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研究论文 | 本研究探讨了脂肪来源干细胞通过恢复CX3CR1+滑膜巨噬细胞屏障来缓解类风湿关节炎的机制 | 首次揭示ADSCs通过线粒体转移改善CX3CR1+巨噬细胞能量代谢并促进屏障修复的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化需要进一步验证 | 探究ADSCs治疗类风湿关节炎的分子机制及其与CX3CR1+巨噬细胞的相互作用 | 血清转移诱导的关节炎模型小鼠和CX3CR1+滑膜巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 线粒体移植 | NA | 基因表达数据 | 关节炎模型小鼠(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |