单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 709 篇文献，本页显示第 621 - 640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2025-10-07 |
Altered Arginine Metabolism Affects Proliferation and Radiosensitivity of Keloids
2025-Mar, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.70077
PMID:40095415
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了瘢痕疙瘩中精氨酸和脯氨酸代谢异常与细胞增殖及放射敏感性的关联 | 首次整合代谢组学、转录组学和单细胞RNA测序数据，系统揭示精氨酸代谢在瘢痕疙瘩成纤维细胞中的关键作用及治疗潜力 | 研究主要基于体外实验，需要进一步体内验证 | 探讨细胞代谢重编程与瘢痕疙瘩生物学行为的关系，寻找新的治疗策略 | 瘢痕疙瘩组织及邻近正常皮肤组织 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 代谢组学, 转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 代谢物数据, 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 瘢痕疙瘩和邻近皮肤组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 622 | 2025-10-07 |
Multi-Targeting CAR-T Cell Strategies to Overcome Immune Evasion in Lymphoid and Myeloid Malignancies
2025-Mar-14, Oncology research and treatment
IF:2.0Q3
DOI:10.1159/000543806
PMID:40090318
|
综述 | 探讨多靶向CAR-T细胞策略在克服淋巴和髓系恶性肿瘤免疫逃逸中的应用 | 提出逻辑门控CAR、适配器CAR等多靶向策略应对抗原逃逸问题 | NA | 改善CAR-T细胞疗法在血液恶性肿瘤中的治疗效果和持久性 | 淋巴和髓系恶性肿瘤患者 | NA | 淋巴瘤、多发性骨髓瘤 | 下一代测序(NGS)、直接随机光学重建显微镜(dSTORM)、多参数流式细胞术、CRISPR筛选、单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 623 | 2025-10-07 |
Mapping glioma progression: single-cell RNA sequencing illuminates cell-cell interactions and immune response variability
2025-Mar-12, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01903-x
PMID:40072722
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示胶质瘤微环境中细胞间相互作用和免疫反应异质性 | 识别了14种胶质瘤细胞亚群和4种巨噬细胞/单核细胞亚型，揭示了通过MIF和SPP1通路的关键配体-受体相互作用 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要实验验证细胞间相互作用的机制 | 探索胶质瘤恶性细胞与巨噬细胞/单核细胞的相互作用及其对肿瘤进展和治疗反应的影响 | 胶质瘤组织和其中的细胞亚群 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序，功能富集分析，发育轨迹分析，细胞通讯分析，基因调控网络分析 | 预后风险评分模型 | RNA测序数据 | 来自TCGA和CGGA数据库的胶质瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 624 | 2025-10-07 |
Transcription factor networks and novel immune biomarkers reveal key prognostic and therapeutic insights in ovarian cancer
2025-Mar-12, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01788-w
PMID:40074978
|
研究论文 | 本研究基于肿瘤微环境中的转录因子调控网络，开发了一个9基因风险模型用于卵巢癌预后预测 | 首次在卵巢癌肿瘤微环境中识别出6个免疫恶性细胞亚群，并基于转录因子调控网络构建了9基因风险预后模型 | 研究样本量有限，需要更大规模的数据验证模型的普适性 | 探索卵巢癌肿瘤微环境中的转录因子调控网络，开发预后预测模型和识别新的免疫生物标志物 | 卵巢癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, qPCR, 免疫组化, 细胞功能实验 | Lasso回归, ConsensusClusterPlus, SCENIC | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据, 临床数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 625 | 2025-10-07 |
Integrative whole slide image and spatial transcriptomics analysis with QuST and QuPath
2025-Mar-12, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00841-9
PMID:40075141
|
研究论文 | 介绍QuST这一QuPath扩展工具，用于整合全切片图像和空间转录组学数据 | 开发了能够在单细胞水平上桥接全切片图像和空间转录组学分析的工具QuST | 面临训练模式准备和分辨率差异等挑战 | 通过整合数字病理学和空间转录组学技术来增强疾病理解 | 全切片图像和空间转录组学数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学，全切片图像分析 | NA | 图像，空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | QuPath, QuST | QuPath扩展工具QuST |
| 626 | 2025-10-07 |
Fatty acid metabolism shapes immune responses in chronic lymphocytic leukemia
2025-Mar-12, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-025-00753-7
PMID:40075418
|
研究论文 | 本研究构建了基于脂肪酸代谢基因的慢性淋巴细胞白血病预后评分系统，并揭示了脂肪酸氧化在CLL免疫微环境中的调控作用 | 首次构建基于脂肪酸代谢基因的CLL预后评分系统，通过单细胞分析揭示关键FAM基因在免疫细胞亚群中的表达模式，发现脂肪酸氧化抑制可协同增强PI3K抑制剂疗效 | 研究基于RNA测序数据分析，需要进一步实验验证具体分子机制 | 阐明脂肪酸代谢在慢性淋巴细胞白血病中的特征及其在疾病发展中的调控作用 | 慢性淋巴细胞白血病患者和健康对照 | 生物信息学 | 慢性淋巴细胞白血病 | RNA测序，单细胞RNA测序，细胞活力检测，药物敏感性检测，氧消耗测定 | Cox-LASSO回归 | RNA测序数据 | CLL患者和健康对照的RNA测序数据 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 627 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics of clinical grade adipose-derived regenerative cells reveals consistency between donors independent of gender and BMI
2025-Mar-05, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04234-4
PMID:40038777
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析临床级脂肪来源再生细胞，发现供体间一致性不受性别和BMI影响 | 首次在临床级ADRCs中系统评估供体特征对细胞组成的影响，发现供体间异质性极小 | 仅基于两项细胞试验干预研究，样本量有限 | 评估供体特征（性别、BMI）对脂肪来源再生细胞组成和质量的影响 | 临床级脂肪来源再生细胞（ADRCs） | 单细胞组学 | 再生医学 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 两项细胞试验干预研究中的多个供体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 628 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals an Atlas of Meihua Pig Testis Cells
2025-Mar-05, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani15050752
PMID:40076035
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建梅花猪睾丸细胞图谱，揭示精子发生过程中的转录组特征 | 首次在梅花猪中应用单细胞RNA测序技术构建睾丸细胞发育图谱，鉴定出生殖细胞和体细胞的标记基因 | 研究仅针对梅花猪特定发育阶段，样本来源和数量有限 | 表征猪精子发生的转录组景观并鉴定精原细胞的潜在标记基因 | 新生和性成熟六个月大梅花猪的睾丸细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 13,839个梅花猪睾丸细胞 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 629 | 2025-10-07 |
MLLT3 Regulates Melanoma Stemness and Progression by Inhibiting HMGB1 Nuclear Entry and MAGEA1 M5C Modification
2025-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202408529
PMID:39716999
|
研究论文 | 本研究揭示了转录因子MLLT3通过调控HMGB1核转位和MAGEA1 m5C修饰来抑制黑色素瘤干细胞特性与进展的机制 | 首次发现MLLT3通过双重机制调控黑色素瘤干细胞特性：与HMGB1互作抑制其核转位，与YBX1互作抑制MAGEA1的m5C修饰读取 | 未明确MLLT3与miR-542-3p/miR-3922-3p相互作用的具体分子机制 | 探索MLLT3在黑色素瘤干细胞特性和疾病进展中的调控作用 | 黑色素瘤干细胞和黑色素瘤细胞 | 癌症生物学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序，基因敲除 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 630 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome-wide Mendelian randomization and colocalization reveals immune-mediated regulatory mechanisms and drug targets for COVID-19
2025-Mar, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2025.105596
PMID:39933264
|
研究论文 | 通过单细胞转录组孟德尔随机化和共定位分析，揭示COVID-19的免疫介导调控机制和潜在药物靶点 | 首次在14种外周血免疫细胞中系统开展单细胞表达数量性状位点(sc-eQTL)的孟德尔随机化分析，发现58个先前未报道的COVID-19相关基因，并建立分级系统优先确定37个药物靶点 | 基于遗传数据的推断需要进一步实验验证，样本来源限于外周血免疫细胞 | 识别COVID-19的免疫介导调控机制和潜在药物靶点 | 14种外周血免疫细胞中的16,597个基因 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞转录组测序, 孟德尔随机化分析, 共定位分析, 深度学习模型 | 深度学习 | 单细胞基因表达数据, 遗传数据 | 26,597个单细胞表达数量性状位点(sc-eQTL) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 631 | 2025-10-07 |
Biases in machine-learning models of human single-cell data
2025-Mar, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-025-01619-8
PMID:39972066
|
综述 | 本文讨论机器学习在人类单细胞数据分析中存在的各种偏见问题 | 系统性地识别和分类单细胞数据分析全流程中出现的多种偏见类型 | 主要进行理论讨论，缺乏实证数据验证 | 分析机器学习模型在人类单细胞数据中存在的偏见问题 | 人类单细胞数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 弱监督或无监督机器学习模型 | 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 632 | 2025-10-07 |
Intratumour oxidative hotspots provide a niche for cancer cell dissemination
2025-Mar, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-025-01617-w
PMID:39984655
|
研究论文 | 本研究开发了T-AP1探针可视化肿瘤内氧化应激微环境，揭示了中性粒细胞建立的HO热点区域促进癌细胞播散的新机制 | 首次开发肿瘤靶向HO探针T-AP1，发现肿瘤内HO热点区域作为癌细胞播散的生态位，揭示p38-MYC轴介导的部分上皮间质转化机制 | 未明确NRF2高活化肿瘤中p38反应被抑制的具体分子机制，缺乏在体功能验证实验 | 探究肿瘤微环境中氧化应激异质性对癌细胞播散的影响 | 肿瘤细胞、中性粒细胞、正常上皮细胞 | 肿瘤生物学 | 癌症 | 分子探针成像、单细胞分析 | NA | 分子成像数据、细胞表型数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 633 | 2025-10-07 |
TCL1A in naïve B cells as a therapeutic target for type 1 diabetes
2025-Mar, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2025.105593
PMID:39946833
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现T1D早期阶段幼稚B细胞中TCL1A表达上调，并开发靶向Tcl1a mRNA的siRNA纳米药物治疗T1D | 首次发现幼稚B细胞中TCL1A在T1D早期阶段的关键作用，并开发了靶向TCL1A的siRNA纳米药物新疗法 | 研究样本量未明确说明，临床转化潜力需进一步验证 | 探索T1D发病机制并开发新的治疗方法 | 新诊断T1D患者、对照人群和NOD小鼠模型 | 免疫学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 磷酸化蛋白微阵列, siRNA纳米技术 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质磷酸化数据, 功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 634 | 2025-10-07 |
Spatial Transcriptomics Reveals Novel Mechanisms Involved in Perineural Invasion in Pancreatic Ductal Adenocarcinomas
2025-Mar-01, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17050852
PMID:40075699
|
研究论文 | 利用空间转录组学技术研究胰腺导管腺癌神经侵袭的新机制 | 首次使用空间转录组学揭示神经侵袭病灶对肿瘤微环境免疫景观的影响，并发现内源性大麻素和多胺代谢在神经侵袭中的作用 | 样本量较小（13例患者），需要更大规模研究验证发现 | 探索胰腺导管腺癌中神经侵袭的分子机制 | 胰腺导管腺癌患者的神经侵袭和非神经侵袭病灶 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学，全转录组分析 | NA | 空间转录组数据 | 13例PDAC患者 | Nanostring | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler | GeoMx数字空间分析系统 |
| 635 | 2025-10-07 |
PLOD3 as a novel oncogene in prognostic and immune infiltration risk model based on multi-machine learning in cervical cancer
2025-Mar-11, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02031-2
PMID:40067513
|
研究论文 | 基于多机器学习方法构建宫颈癌预后和免疫浸润风险模型，并鉴定PLOD3作为新型致癌基因 | 首次将多机器学习算法与代谢相关基因结合构建宫颈癌预后模型，并发现PLOD3作为新型致癌基因 | 模型验证主要依赖公共数据库数据，需要进一步临床验证 | 提高宫颈癌预后预测准确性和开发治疗策略 | 宫颈癌患者和细胞 | 机器学习 | 宫颈癌 | 基因组学、转录组学、空间转录组学、单细胞分析、功能实验 | 监督主成分分析、随机生存森林 | 基因组数据、转录组数据、空间数据 | 基于多个数据库的样本，识别112个关键代谢基因和337个WGCNA基因 | NA | 空间转录组学, 单细胞分析 | NA | NA |
| 636 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics reveals the cellular dynamics of hexafluoropropylene oxide dimer acid in exerting mouse male reproductive toxicity
2025-Mar-11, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-025-01177-x
PMID:40069855
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了六氟环氧丙烷二聚体酸(GenX)对小鼠雄性生殖系统的毒性作用及细胞动态变化 | 首次系统揭示了GenX暴露导致的睾丸细胞动态变化和转录组改变，包括精原干细胞平衡失调和体细胞-生殖细胞相互作用的紊乱 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类或其他物种中验证 | 探索GenX暴露引起的雄性生殖毒性及其潜在的细胞和分子调控机制 | 正常发育的小鼠睾丸组织 | 单细胞生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | GenX暴露的小鼠睾丸组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 637 | 2025-10-07 |
PbImpute: Precise Zero Discrimination and Balanced Imputation in Single-Cell RNA Sequencing Data
2025-Mar-10, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.4c02125
PMID:39957720
|
研究论文 | 提出一种精确平衡的单细胞RNA测序数据插补方法PbImpute，通过多阶段处理实现技术性丢失零与生物零的精确区分和平衡插补 | 独特地将零膨胀负二项分布建模与静态和动态修复机制相结合，在过度插补和不足插补之间实现最佳平衡 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中零计数（dropout zeros）对下游分析的挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 零膨胀负二项分布模型, 图嵌入神经网络 | 基因表达数据 | 模拟和真实单细胞RNA测序数据集（包括PBMC数据） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 638 | 2025-10-07 |
Distinct cellular mechanisms underlie chemotherapies and PD-L1 blockade combinations in triple-negative breast cancer
2025-Mar-10, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.01.007
PMID:39919737
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据，揭示了不同化疗药物与PD-L1阻断剂联合治疗三阴性乳腺癌的细胞机制差异 | 发现纳布紫杉醇与紫杉醇在联合PD-L1阻断时对T细胞和髓系细胞的不同调控作用，并首次揭示肥大细胞在协调抗肿瘤免疫反应中的关键作用 | 机制研究仍需进一步验证，临床样本量有限 | 探究三阴性乳腺癌中化疗与免疫检查点阻断联合治疗的细胞机制 | 三阴性乳腺癌患者和小鼠模型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 已发表和新产生的三阴性乳腺癌患者scRNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 639 | 2025-10-07 |
Microglial reprogramming enhances antitumor immunity and immunotherapy response in melanoma brain metastases
2025-Mar-10, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.01.008
PMID:39919736
|
研究论文 | 本研究通过激活小胶质细胞中的Rela/NF-κB通路促进黑色素瘤脑转移，并发现靶向该通路可增强抗肿瘤免疫和免疫检查点抑制剂疗效 | 首次揭示小胶质细胞中Rela/NF-κB通路在黑色素瘤脑转移中的作用机制，并提出通过小胶质细胞重编程增强抗肿瘤免疫的新策略 | 主要基于临床前模型研究，人体验证数据有限 | 探索黑色素瘤脑转移的生物学机制及脑免疫微环境在治疗反应中的作用 | 黑色素瘤脑转移模型和小胶质细胞 | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 640 | 2025-10-07 |
ZNF385A was identified as a novel colorectal cancer-related functional gene by analysis of the interaction and immune characteristics of oxidative stress and the inflammatory response
2025-Mar-10, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02024-1
PMID:40064736
|
研究论文 | 本研究通过分析氧化应激与炎症反应的相互作用及免疫特征，鉴定ZNF385A为结直肠癌相关新功能基因 | 首次发现ZNF385A作为结直肠癌新型致癌基因，并构建了包含7个特征的预后风险模型 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证仅限于SW620细胞系和异种移植模型 | 探索氧化应激和炎症反应与结直肠癌的关系，寻找新的预后标志物和治疗靶点 | 结直肠癌组织和细胞系 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，qPCR，免疫组化，EDU检测，集落形成实验，ROS检测，transwell实验，异种移植模型 | LASSO-Cox风险模型 | 单细胞RNA测序数据，基因表达数据 | 结直肠癌单细胞RNA测序数据，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |