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当前共找到 726 篇文献，本页显示第 601 - 620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 601 | 2025-10-07 |
Artificial intelligence-driven integration of single-cell RNA sequencing and transcriptome analysis to decipher APOE's role in gastric cancer prognosis and therapy
2025-Mar-13, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02100-6
PMID:40082390
|
研究论文 | 本研究通过人工智能整合单细胞RNA测序和转录组分析，探索APOE在胃癌预后和治疗中的作用 | 首次将AI驱动的分析方法与单细胞RNA测序和转录组数据相结合，系统揭示APOE通过M2巨噬细胞极化诱导免疫抑制的新机制 | 研究样本量有限，需要更大规模的验证研究来确认APOE作为预后标志物的临床价值 | 探索胃癌肿瘤微环境的复杂性，识别新的预后标志物和治疗靶点 | 胃癌患者样本和胃癌细胞系 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 生物信息学分析 | AI增强分析方法, 免疫相关生存模型 | 单细胞RNA测序数据, 转录组数据 | 胃癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 602 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomic analyses reveal heterogeneity and key subsets associated with survival and response to PD-1 blockade in cervical squamous cell carcinoma
2025-Mar-13, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03725-x
PMID:40082876
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示宫颈鳞状细胞癌肿瘤微环境异质性及其与PD-1阻断治疗反应的关键细胞亚群 | 首次在宫颈鳞癌中系统鉴定PCLAF+肿瘤相关上皮细胞亚群，并证实其通过抑制CD8+ T细胞功能影响免疫治疗疗效 | 样本量相对有限，需要更大规模队列验证发现 | 解析宫颈鳞癌肿瘤微环境异质性及其与免疫治疗反应的关系 | 宫颈鳞状细胞癌患者肿瘤组织 | 单细胞组学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据，bulk转录组数据 | 50,649个细胞，整合TCGA数据库和临床样本数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 603 | 2025-10-07 |
Blocking MIF secretion enhances CAR T-cell efficacy against neuroblastoma
2025-Mar-11, European journal of cancer (Oxford, England : 1990)
DOI:10.1016/j.ejca.2025.115263
PMID:39908652
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研究论文 | 本研究通过阻断巨噬细胞迁移抑制因子(MIF)的分泌来增强CAR T细胞治疗神经母细胞瘤的疗效 | 首次发现MIF是神经母细胞瘤免疫抑制微环境中的关键因子，并应用PROTAC技术靶向MIF以增强CAR T细胞活性 | 研究主要聚焦于神经母细胞瘤，对其他实体瘤的适用性需要进一步验证 | 改善CAR T细胞在神经母细胞瘤免疫抑制微环境中的治疗效果 | 神经母细胞瘤肿瘤微环境中的免疫抑制因子 | 肿瘤免疫治疗 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 多组学分析, 质谱分析, PROTAC技术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据, 质谱数据 | 24个神经母细胞瘤肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 604 | 2025-10-07 |
Dynamic responses to rejection in the transplanted human heart revealed through spatial transcriptomics
2025-Mar-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.28.640852
PMID:40093136
|
研究论文 | 利用空间转录组学技术分析人类心脏移植排斥反应的动态分子特征 | 首次在亚细胞分辨率下使用图像引导的空间转录组学技术，纵向分析人类心脏移植活检样本中的转录异质性 | 样本量相对有限（62例患者），且主要依赖组织学诊断作为参考标准 | 表征心脏移植排斥反应期间的分子表型和免疫-心脏相互作用 | 62例成人和儿童心脏移植受者的纵向心脏活检样本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据、组织图像 | 62例心脏移植患者 | NA | 空间转录组学 | NA | 亚细胞分辨率的图像引导空间转录组学 |
| 605 | 2025-10-07 |
MulNet: a scalable framework for reconstructing intra- and intercellular signaling networks from bulk and single-cell RNA-seq data
2025-Mar-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf081
PMID:40095604
|
研究论文 | 提出了一个可扩展的多层网络框架MulNet，用于从bulk和单细胞RNA-seq数据重建细胞内和细胞间信号网络 | 能够整合多种分子相互作用构建可扩展的多层网络，在识别生物学相关模块方面优于现有方法 | NA | 重建细胞内和细胞间信号网络以更好地理解基因调控 | 结肠癌和头颈癌的RNA-seq数据 | 生物信息学 | 癌症 | RNA-seq | 多层网络框架 | 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 606 | 2025-10-07 |
Altered Arginine Metabolism Affects Proliferation and Radiosensitivity of Keloids
2025-Mar, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.70077
PMID:40095415
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了瘢痕疙瘩中精氨酸和脯氨酸代谢异常与细胞增殖及放射敏感性的关联 | 首次整合代谢组学、转录组学和单细胞RNA测序数据，系统揭示精氨酸代谢在瘢痕疙瘩成纤维细胞中的关键作用及治疗潜力 | 研究主要基于体外实验，需要进一步体内验证 | 探讨细胞代谢重编程与瘢痕疙瘩生物学行为的关系，寻找新的治疗策略 | 瘢痕疙瘩组织及邻近正常皮肤组织 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 代谢组学, 转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 代谢物数据, 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 瘢痕疙瘩和邻近皮肤组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 607 | 2025-10-07 |
Identification of DIO2 as a Molecular Therapeutic Target for Depression in Chronic Rhinosinusitis: A Comprehensive Bioinformatics and Experimental Study
2025-Mar-16, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-025-11085-4
PMID:40089956
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，鉴定DIO2作为慢性鼻窦炎合并抑郁症的分子治疗靶点 | 首次发现DIO2基因在慢性鼻窦炎和抑郁症共病中的关键作用，并通过单细胞RNA测序和动物实验验证其治疗潜力 | 研究主要基于公共数据库和动物模型，需要在人类临床样本中进一步验证 | 识别慢性鼻窦炎与抑郁症之间的分子联系和潜在治疗靶点 | 慢性鼻窦炎患者和抑郁症患者的基因表达数据，以及CRS小鼠模型 | 生物信息学 | 慢性鼻窦炎,抑郁症 | 单细胞RNA测序,差异表达基因分析,加权基因共表达网络分析,机器学习算法 | 随机森林,LASSO回归 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的多个基因表达数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 608 | 2025-10-07 |
Multi-Targeting CAR-T Cell Strategies to Overcome Immune Evasion in Lymphoid and Myeloid Malignancies
2025-Mar-14, Oncology research and treatment
IF:2.0Q3
DOI:10.1159/000543806
PMID:40090318
|
综述 | 探讨多靶向CAR-T细胞策略在克服淋巴和髓系恶性肿瘤免疫逃逸中的应用 | 提出逻辑门控CAR、适配器CAR等多靶向策略应对抗原逃逸问题 | NA | 改善CAR-T细胞疗法在血液恶性肿瘤中的治疗效果和持久性 | 淋巴和髓系恶性肿瘤患者 | NA | 淋巴瘤、多发性骨髓瘤 | 下一代测序(NGS)、直接随机光学重建显微镜(dSTORM)、多参数流式细胞术、CRISPR筛选、单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 609 | 2025-10-07 |
Smoothie: Efficient Inference of Spatial Co-expression Networks from Denoised Spatial Transcriptomics Data
2025-Mar-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.26.640406
PMID:40060619
|
研究论文 | 提出一种名为Smoothie的方法，通过高斯平滑去噪空间转录组数据并构建全基因组共表达网络 | 结合隐式和显式并行化技术，能够处理超过1亿个空间分辨点的数据集，具有快速运行和低内存使用的优势 | NA | 从空间转录组数据中提取深度生物学见解 | 空间基因表达数据和共表达网络 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，高斯平滑 | NA | 空间转录组数据 | 超过1亿个空间分辨点 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 610 | 2025-10-07 |
Mapping glioma progression: single-cell RNA sequencing illuminates cell-cell interactions and immune response variability
2025-Mar-12, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01903-x
PMID:40072722
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示胶质瘤微环境中细胞间相互作用和免疫反应异质性 | 识别了14种胶质瘤细胞亚群和4种巨噬细胞/单核细胞亚型，揭示了通过MIF和SPP1通路的关键配体-受体相互作用 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要实验验证细胞间相互作用的机制 | 探索胶质瘤恶性细胞与巨噬细胞/单核细胞的相互作用及其对肿瘤进展和治疗反应的影响 | 胶质瘤组织和其中的细胞亚群 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序，功能富集分析，发育轨迹分析，细胞通讯分析，基因调控网络分析 | 预后风险评分模型 | RNA测序数据 | 来自TCGA和CGGA数据库的胶质瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 611 | 2025-10-07 |
Transcription factor networks and novel immune biomarkers reveal key prognostic and therapeutic insights in ovarian cancer
2025-Mar-12, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01788-w
PMID:40074978
|
研究论文 | 本研究基于肿瘤微环境中的转录因子调控网络，开发了一个9基因风险模型用于卵巢癌预后预测 | 首次在卵巢癌肿瘤微环境中识别出6个免疫恶性细胞亚群，并基于转录因子调控网络构建了9基因风险预后模型 | 研究样本量有限，需要更大规模的数据验证模型的普适性 | 探索卵巢癌肿瘤微环境中的转录因子调控网络，开发预后预测模型和识别新的免疫生物标志物 | 卵巢癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, qPCR, 免疫组化, 细胞功能实验 | Lasso回归, ConsensusClusterPlus, SCENIC | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据, 临床数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 612 | 2025-10-07 |
Integrative whole slide image and spatial transcriptomics analysis with QuST and QuPath
2025-Mar-12, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00841-9
PMID:40075141
|
研究论文 | 介绍QuST这一QuPath扩展工具，用于整合全切片图像和空间转录组学数据 | 开发了能够在单细胞水平上桥接全切片图像和空间转录组学分析的工具QuST | 面临训练模式准备和分辨率差异等挑战 | 通过整合数字病理学和空间转录组学技术来增强疾病理解 | 全切片图像和空间转录组学数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学，全切片图像分析 | NA | 图像，空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | QuPath, QuST | QuPath扩展工具QuST |
| 613 | 2025-10-07 |
Fatty acid metabolism shapes immune responses in chronic lymphocytic leukemia
2025-Mar-12, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-025-00753-7
PMID:40075418
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研究论文 | 本研究构建了基于脂肪酸代谢基因的慢性淋巴细胞白血病预后评分系统，并揭示了脂肪酸氧化在CLL免疫微环境中的调控作用 | 首次构建基于脂肪酸代谢基因的CLL预后评分系统，通过单细胞分析揭示关键FAM基因在免疫细胞亚群中的表达模式，发现脂肪酸氧化抑制可协同增强PI3K抑制剂疗效 | 研究基于RNA测序数据分析，需要进一步实验验证具体分子机制 | 阐明脂肪酸代谢在慢性淋巴细胞白血病中的特征及其在疾病发展中的调控作用 | 慢性淋巴细胞白血病患者和健康对照 | 生物信息学 | 慢性淋巴细胞白血病 | RNA测序，单细胞RNA测序，细胞活力检测，药物敏感性检测，氧消耗测定 | Cox-LASSO回归 | RNA测序数据 | CLL患者和健康对照的RNA测序数据 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 614 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics of clinical grade adipose-derived regenerative cells reveals consistency between donors independent of gender and BMI
2025-Mar-05, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04234-4
PMID:40038777
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析临床级脂肪来源再生细胞，发现供体间一致性不受性别和BMI影响 | 首次在临床级ADRCs中系统评估供体特征对细胞组成的影响，发现供体间异质性极小 | 仅基于两项细胞试验干预研究，样本量有限 | 评估供体特征（性别、BMI）对脂肪来源再生细胞组成和质量的影响 | 临床级脂肪来源再生细胞（ADRCs） | 单细胞组学 | 再生医学 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 两项细胞试验干预研究中的多个供体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 615 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals an Atlas of Meihua Pig Testis Cells
2025-Mar-05, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani15050752
PMID:40076035
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建梅花猪睾丸细胞图谱，揭示精子发生过程中的转录组特征 | 首次在梅花猪中应用单细胞RNA测序技术构建睾丸细胞发育图谱，鉴定出生殖细胞和体细胞的标记基因 | 研究仅针对梅花猪特定发育阶段，样本来源和数量有限 | 表征猪精子发生的转录组景观并鉴定精原细胞的潜在标记基因 | 新生和性成熟六个月大梅花猪的睾丸细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 13,839个梅花猪睾丸细胞 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 616 | 2025-10-07 |
MLLT3 Regulates Melanoma Stemness and Progression by Inhibiting HMGB1 Nuclear Entry and MAGEA1 M5C Modification
2025-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202408529
PMID:39716999
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研究论文 | 本研究揭示了转录因子MLLT3通过调控HMGB1核转位和MAGEA1 m5C修饰来抑制黑色素瘤干细胞特性与进展的机制 | 首次发现MLLT3通过双重机制调控黑色素瘤干细胞特性：与HMGB1互作抑制其核转位，与YBX1互作抑制MAGEA1的m5C修饰读取 | 未明确MLLT3与miR-542-3p/miR-3922-3p相互作用的具体分子机制 | 探索MLLT3在黑色素瘤干细胞特性和疾病进展中的调控作用 | 黑色素瘤干细胞和黑色素瘤细胞 | 癌症生物学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序，基因敲除 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 617 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome-wide Mendelian randomization and colocalization reveals immune-mediated regulatory mechanisms and drug targets for COVID-19
2025-Mar, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2025.105596
PMID:39933264
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研究论文 | 通过单细胞转录组孟德尔随机化和共定位分析，揭示COVID-19的免疫介导调控机制和潜在药物靶点 | 首次在14种外周血免疫细胞中系统开展单细胞表达数量性状位点(sc-eQTL)的孟德尔随机化分析，发现58个先前未报道的COVID-19相关基因，并建立分级系统优先确定37个药物靶点 | 基于遗传数据的推断需要进一步实验验证，样本来源限于外周血免疫细胞 | 识别COVID-19的免疫介导调控机制和潜在药物靶点 | 14种外周血免疫细胞中的16,597个基因 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞转录组测序, 孟德尔随机化分析, 共定位分析, 深度学习模型 | 深度学习 | 单细胞基因表达数据, 遗传数据 | 26,597个单细胞表达数量性状位点(sc-eQTL) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 618 | 2025-10-07 |
Biases in machine-learning models of human single-cell data
2025-Mar, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-025-01619-8
PMID:39972066
|
综述 | 本文讨论机器学习在人类单细胞数据分析中存在的各种偏见问题 | 系统性地识别和分类单细胞数据分析全流程中出现的多种偏见类型 | 主要进行理论讨论，缺乏实证数据验证 | 分析机器学习模型在人类单细胞数据中存在的偏见问题 | 人类单细胞数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 弱监督或无监督机器学习模型 | 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 619 | 2025-10-07 |
Intratumour oxidative hotspots provide a niche for cancer cell dissemination
2025-Mar, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-025-01617-w
PMID:39984655
|
研究论文 | 本研究开发了T-AP1探针可视化肿瘤内氧化应激微环境，揭示了中性粒细胞建立的HO热点区域促进癌细胞播散的新机制 | 首次开发肿瘤靶向HO探针T-AP1，发现肿瘤内HO热点区域作为癌细胞播散的生态位，揭示p38-MYC轴介导的部分上皮间质转化机制 | 未明确NRF2高活化肿瘤中p38反应被抑制的具体分子机制，缺乏在体功能验证实验 | 探究肿瘤微环境中氧化应激异质性对癌细胞播散的影响 | 肿瘤细胞、中性粒细胞、正常上皮细胞 | 肿瘤生物学 | 癌症 | 分子探针成像、单细胞分析 | NA | 分子成像数据、细胞表型数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 620 | 2025-10-07 |
TCL1A in naïve B cells as a therapeutic target for type 1 diabetes
2025-Mar, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2025.105593
PMID:39946833
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现T1D早期阶段幼稚B细胞中TCL1A表达上调，并开发靶向Tcl1a mRNA的siRNA纳米药物治疗T1D | 首次发现幼稚B细胞中TCL1A在T1D早期阶段的关键作用，并开发了靶向TCL1A的siRNA纳米药物新疗法 | 研究样本量未明确说明，临床转化潜力需进一步验证 | 探索T1D发病机制并开发新的治疗方法 | 新诊断T1D患者、对照人群和NOD小鼠模型 | 免疫学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 磷酸化蛋白微阵列, siRNA纳米技术 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质磷酸化数据, 功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |