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当前共找到 709 篇文献，本页显示第 581 - 600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 581 | 2025-10-07 |
AttentionGRN: a functional and directed graph transformer for gene regulatory network reconstruction from scRNA-seq data
2025-Mar-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf118
PMID:40116659
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研究论文 | 提出基于图变换器的AttentionGRN模型，用于从单细胞RNA测序数据重建基因调控网络 | 采用软编码增强模型表达能力，设计面向GRN的消息聚合策略，结合定向结构编码和功能基因采样 | NA | 从单细胞RNA测序数据重建细胞类型特异性基因调控网络 | 基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图变换器 | 单细胞RNA测序数据 | 88个数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 582 | 2025-10-07 |
Machine Learning-Based Glycolipid Metabolism Gene Signature Predicts Prognosis and Immune Landscape in Oesophageal Squamous Cell Carcinoma
2025-Mar, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70434
PMID:40119618
|
研究论文 | 开发并验证基于糖脂代谢相关基因的食管鳞癌预后模型 | 首次建立基于机器学习的15基因糖脂代谢特征模型，揭示其与免疫浸润模式的关联 | NA | 预测食管鳞癌预后并探索糖脂代谢与肿瘤免疫的关系 | 食管鳞癌患者 | 机器学习 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | TCGA和GEO数据库中的食管鳞癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 583 | 2025-10-07 |
Cancer‑associated fibroblasts: a pivotal regulator of tumor microenvironment in the context of radiotherapy
2025-Mar-20, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02138-7
PMID:40114180
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综述 | 本文综述了癌症相关成纤维细胞在放疗背景下对肿瘤微环境的调控作用 | 系统阐述了放疗对CAFs表型和功能的影响及其与肿瘤细胞、免疫细胞的相互作用机制 | 放疗对CAFs的影响以及受辐射CAFs对肿瘤进展和TME的作用尚未完全明确 | 探讨CAFs在放疗背景下的调控作用及其作为治疗靶点的潜力 | 癌症相关成纤维细胞(CAFs) | 肿瘤微环境研究 | 癌症 | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 584 | 2025-10-07 |
Insights into the single-cell transcriptome characteristics of porcine endometrium with embryo loss
2025-Mar-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202402212RR
PMID:40105155
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了猪胚胎丢失子宫内膜的分子特征和细胞异质性 | 首次构建了猪围植入期胚胎丢失与成功妊娠子宫内膜的单细胞转录组图谱，识别了22种细胞亚群并揭示了细胞通讯差异 | 样本数量有限，研究仅关注围植入期，未涵盖整个妊娠过程 | 探究胚胎丢失过程中子宫内膜微环境的分子机制 | 猪子宫内膜组织 | 单细胞组学 | 生殖障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 胚胎丢失和成功妊娠的子宫内膜组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 585 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing of the holothurian regenerating intestine reveals the pluripotency of the coelomic epithelium
2025-Mar-20, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.100796
PMID:40111904
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究海参肠道再生过程中体腔上皮细胞的多能性 | 首次在棘皮动物再生研究中应用单细胞RNA测序技术，识别出再生原基中的13个不同细胞群，并发现体腔上皮具有多能性 | 研究仅限于海参这一特定物种，且对某些细胞群体的功能验证仍需进一步实验 | 探究海参肠道再生过程中细胞分子特征和再生机制 | 海参再生肠道组织中的细胞群体 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序，杂交链式反应荧光原位杂交 | NA | 单细胞转录组数据，荧光成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 586 | 2025-10-07 |
Bioinformatic analysis of serpina1 expression in papillary thyroid carcinoma and its potential association with Hashimoto's thyroiditis
2025-Mar-19, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02079-0
PMID:40106166
|
研究论文 | 通过生物信息学分析探讨SERPINA1在甲状腺乳头状癌中的表达及其与桥本甲状腺炎的潜在关联 | 首次在单细胞水平系统揭示SERPINA1在甲状腺乳头状癌不同细胞亚群中的表达特征及其与桥本甲状腺炎的相互作用机制 | 研究结果基于生物信息学分析，需要进一步的实验验证 | 探索SERPINA1基因在甲状腺乳头状癌中的作用及其与桥本甲状腺炎的关系 | 甲状腺乳头状癌患者组织样本 | 生物信息学 | 甲状腺癌 | 转录组分析, 单细胞转录组分析, 基因集变异分析 | Wilcoxon检验, CIBERSORT, CellChat | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | TCGA和GEO数据库中的甲状腺乳头状癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 587 | 2025-10-07 |
CHI3L1: a key driver in gastritis-to-cancer transformation
2025-Mar-19, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06352-2
PMID:40108688
|
研究论文 | 本研究通过机器学习方法识别了胃炎向胃癌转化过程中的关键驱动基因CHI3L1，并验证了其通过激活CD44-β-catenin通路促进恶性转化的机制 | 首次系统识别胃炎向胃癌转化过程中的12个驱动基因，并确定CHI3L1为核心驱动因子，阐明其通过CD44-β-catenin通路促进恶性转化的新机制 | 研究主要基于已有数据集和实验模型，需要进一步临床验证 | 阐明胃癌发生发展的分子机制并寻找早期诊断生物标志物 | 胃癌及其前驱病变胃炎 | 机器学习 | 胃癌 | 机器学习，单细胞RNA测序，多重免疫组织化学 | 早期诊断模型 | 基因表达数据，组织微阵列，细胞和类器官模型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 588 | 2025-10-07 |
Screening and analysis of programmed cell death related genes and targeted drugs in sepsis
2025-Mar-19, Hereditas
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s41065-025-00403-w
PMID:40108736
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学方法识别脓毒症中程序性细胞死亡相关基因并探索潜在治疗药物 | 首次整合WGCNA、LASSO、随机森林和孟德尔随机化方法系统分析脓毒症中PCD相关基因，并构建TF-miRNA-枢纽基因网络 | 研究主要基于生物信息学分析，需要后续实验验证 | 识别脓毒症诊断相关的程序性细胞死亡基因并探索潜在治疗药物 | 脓毒症患者的基因表达数据和血液细胞 | 生物信息学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序，WGCNA，LASSO，随机森林，CIBERSORT，孟德尔随机化 | NA | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据，GWAS数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 589 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals CD8 + T cell heterogeneity and identifies a prognostic signature in cervical cancer
2025-Mar-18, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-13901-x
PMID:40102789
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示宫颈癌中CD8+T细胞的异质性并构建预后风险模型 | 首次系统描绘宫颈癌中CD8+T细胞的异质性、发育轨迹和调控网络，并建立基于CD8+T细胞特征的预后模型 | NA | 表征宫颈鳞癌中CD8+T细胞的异质性、发育轨迹、调控网络和细胞间通讯，构建基于CD8+T细胞转录组特征的预后风险模型 | 宫颈癌肿瘤样本中的CD8+T细胞 | 生物信息学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序，机器学习 | 预后风险模型 | 单细胞RNA测序数据，批量转录组数据 | 整合TCGA和GEO数据库的宫颈癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 590 | 2025-10-07 |
Increased melanin induces aberrant keratinocyte - melanocyte - basal - fibroblast cell communication and fibrogenesis by inducing iron overload and ferroptosis resistance in keloids
2025-Mar-18, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02116-z
PMID:40102920
|
研究论文 | 本研究探讨黑色素通过诱导铁过载和抗铁死亡能力促进瘢痕疙瘩中成纤维细胞纤维化的机制 | 首次揭示黑色素通过诱导铁过载和抗铁死亡促进瘢痕疙瘩纤维化的新机制，并发现MITF抑制剂ML329的治疗潜力 | 研究主要基于细胞和小鼠模型，在人体中的治疗效果需要进一步验证 | 研究黑色素在促进瘢痕疙瘩成纤维细胞纤维化中的作用机制，并评估干预黑色素的治疗潜力 | 瘢痕疙瘩患者的皮肤组织、黑色素细胞、角质形成细胞、成纤维细胞以及瘢痕疙瘩裸鼠模型 | 细胞生物学 | 皮肤纤维化疾病 | 单细胞RNA测序, Masson-Fontana染色, 批量测序, Perl's染色, 细胞活力检测, 脂质ROS检测, 丙二醛检测 | NA | 基因表达数据, 组织染色图像, 细胞功能检测数据 | 瘢痕疙瘩患者组织和细胞, 瘢痕疙瘩裸鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 591 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics reveal the heterogeneity and intercellular communication of cancer-associated fibroblasts in gastric cancer
2025-Mar-18, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06376-8
PMID:40102930
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示胃癌中癌症相关成纤维细胞的异质性及细胞间通讯 | 首次在胃癌中整合单细胞测序与空间转录组数据，系统鉴定六种CAF亚群并揭示其与恶性上皮细胞的空间互作关系 | 样本量有限（24例），缺乏功能性实验验证 | 解析胃癌肿瘤微环境中癌症相关成纤维细胞的异质性及细胞间通讯网络 | 胃癌患者肿瘤组织中的癌症相关成纤维细胞和恶性上皮细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫组化 | Seurat, CellChat | 单细胞测序数据, 空间转录组数据, 免疫组化图像 | 24例胃癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 592 | 2025-10-07 |
Single-Cell Landscape of Bronchoalveolar Lavage Fluid Identifies Specific Neutrophils during Septic Immunosuppression
2025-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202406218
PMID:39887584
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析脓毒症患者支气管肺泡灌洗液，揭示了中性粒细胞驱动的肺部免疫抑制程序 | 首次在脓毒症免疫抑制期发现CXCR2和CD274IL1RN中性粒细胞亚群的显著增加及其发育轨迹 | 研究样本量有限，主要关注肺部免疫细胞，未涉及其他器官的免疫抑制机制 | 探索脓毒症免疫抑制期间肺部免疫细胞的分子特征和机制 | 脓毒症患者的支气管肺泡灌洗液样本 | 单细胞组学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 脓毒症患者BALF样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 593 | 2025-10-07 |
Aberrant Hematopoiesis and CD8+ T-Cell Activation in Thymoma-Associated Pure Red Cell Aplasia
2025-Mar, Thoracic cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/1759-7714.70046
PMID:40109027
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析胸腺瘤相关纯红细胞再生障碍的免疫机制 | 首次在单细胞水平揭示胸腺瘤-PRCA患者骨髓中CD8+T细胞异常激活导致红细胞生成障碍的机制 | 样本量较小且为观察性研究，需进一步验证因果关系 | 阐明胸腺瘤相关纯红细胞再生障碍的免疫发病机制 | 胸腺瘤-PRCA患者和健康对照者的骨髓细胞及外周血CD8+T细胞 | 单细胞组学 | 纯红细胞再生障碍 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 流式细胞术, 细胞因子分析 | NA | 单细胞转录组数据, bulk转录组数据, 流式细胞数据, 细胞因子数据 | 胸腺瘤-PRCA患者和健康对照者（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 594 | 2025-10-07 |
Downregulated STAT3 and STAT5B are prognostic biomarkers for colorectal cancer and are associated with immune infiltration
2025-Mar-18, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02085-2
PMID:40100436
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研究论文 | 本研究通过多组学分析发现STAT3和STAT5B在结直肠癌中表达下调，并验证其作为预后生物标志物和免疫治疗靶点的潜力 | 首次系统评估STAT家族在结直肠癌中的表达、预后价值及免疫功能，并利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术深入分析 | 样本量有限，临床样本仅30例，且主要依赖公共数据库数据 | 探究STAT家族在结直肠癌中的表达特征、预后价值及与免疫浸润的关系 | 结直肠癌患者样本（包括TCGA数据库644例、GTEx数据库308例和临床样本30例） | 生物信息学 | 结直肠癌 | 多组学分析，单细胞RNA测序，空间转录组学，DNA甲基化分析 | 列线图预测模型 | 基因表达数据，临床数据，单细胞测序数据，空间转录组数据 | 总计982个样本（TCGA 644例，GTEx 308例，临床样本30例） | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 595 | 2025-03-21 |
Marrying mechanics with spatial transcriptomics
2025-Mar-19, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02491-4
PMID:40108447
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 596 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomics in the adult Drosophila brain and body
2025-Mar-18, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.92618
PMID:40100257
|
研究论文 | 本研究应用空间转录组学技术定位成年果蝇大脑和身体中150种mRNA的空间位置 | 首次将空间转录组学应用于成年果蝇大脑和身体，开发了整合空间转录组学和单细胞数据集的计算工具 | 概念验证研究，仅使用选定基因面板（150种mRNA物种） | 解决单核测序中细胞空间位置信息丢失的问题，定位果蝇细胞图谱中未知细胞簇的空间位置 | 成年果蝇大脑和身体组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，单核RNA测序 | NA | 空间转录组数据，单细胞数据 | 整个果蝇头部和身体，包括所有主要器官 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 597 | 2025-10-07 |
Targeting HIF-2α in glioblastoma reshapes the immune infiltrate and enhances response to immune checkpoint blockade
2025-Mar-17, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-025-05642-8
PMID:40095115
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研究论文 | 本研究探索靶向HIF-2α在胶质母细胞瘤中重塑免疫浸润并增强免疫检查点阻断疗效的作用机制 | 首次揭示HIF-2α在胶质母细胞瘤免疫抑制中的关键作用，并证明HIF-2α抑制剂PT2385与免疫检查点阻断疗法的协同效应 | 研究基于小鼠GL261胶质母细胞瘤模型，临床转化效果需进一步验证 | 探究靶向HIF-2α对胶质母细胞瘤免疫微环境的调控作用及其与免疫治疗的协同机制 | GL261小鼠胶质母细胞瘤模型、肿瘤相关小胶质细胞/巨噬细胞、调节性T细胞 | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、体外细胞培养 | 动物疾病模型 | 基因表达数据、细胞表型数据 | GL261小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 598 | 2025-10-07 |
Transcriptional heterogeneity shapes stress-adaptive responses in yeast
2025-Mar-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57911-6
PMID:40097446
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探索酵母在渗透胁迫适应过程中的转录异质性及其对细胞适应性决策的影响 | 首次系统性地揭示了酵母渗透胁迫响应程序的转录异质性模式，并建立了转录异质性与细胞适应性之间的直接联系 | 研究仅针对酵母模型，结果在其他生物系统中的普适性需要进一步验证 | 阐明转录异质性在酵母应激适应性响应中的分子机制和功能意义 | 酵母细胞及其300多个RNA条形码缺失突变体 | 单细胞生物学 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 300多个RNA条形码缺失突变体 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 599 | 2025-10-07 |
Unraveling shared diagnostic genes and cellular microenvironmental changes in endometriosis and recurrent implantation failure through multi-omics analysis
2025-Mar-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-93146-7
PMID:40097519
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研究论文 | 通过多组学分析揭示子宫内膜异位症和复发性种植失败的共享诊断基因及细胞微环境变化 | 首次整合转录组和单细胞测序数据系统分析EMs和RIF的共享分子机制，并利用机器学习筛选出PDIA4和PGBD5作为新型共享诊断生物标志物 | 研究结果仍需在更大规模队列中验证，治疗潜力有待进一步探索 | 探索子宫内膜异位症和复发性种植失败的共同病理机制和诊断标志物 | 子宫内膜异位症和复发性种植失败患者 | 生物信息学 | 子宫内膜异位症,复发性种植失败 | 转录组测序,单细胞测序,机器学习,基因集富集分析,ceRNA网络分析 | 随机森林,XGBoost | 基因表达数据,单细胞数据 | GEO数据库中的转录组和单细胞测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq,转录组测序 | NA | NA |
| 600 | 2025-10-07 |
Exploring mitochondrial and ferroptotic mechanisms for systemic lupus erythematosus biomarker identification and therapy
2025-Mar-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-93872-y
PMID:40097571
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析探索系统性红斑狼疮中线粒体和铁死亡相关机制，建立诊断预测模型并筛选潜在治疗药物 | 首次结合线粒体相关基因和铁死亡相关基因评分，通过单细胞多组学分析揭示SLE细胞异质性，并开发高精度诊断预测模型 | 研究基于公共数据库数据，缺乏实验验证；样本来源和数量未明确说明 | 探索系统性红斑狼疮的分子机制并开发诊断生物标志物和治疗方法 | 系统性红斑狼疮患者基因表达数据 | 生物信息学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序, 微阵列分析, 分子对接 | 机器学习算法, 高维加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 微阵列 | NA | NA |