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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 581 | 2025-10-07 |
Downregulated STAT3 and STAT5B are prognostic biomarkers for colorectal cancer and are associated with immune infiltration
2025-Mar-18, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02085-2
PMID:40100436
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析发现STAT3和STAT5B在结直肠癌中表达下调,并验证其作为预后生物标志物和免疫治疗靶点的潜力 | 首次系统评估STAT家族在结直肠癌中的表达、预后价值及免疫功能,并利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术深入分析 | 样本量有限,临床样本仅30例,且主要依赖公共数据库数据 | 探究STAT家族在结直肠癌中的表达特征、预后价值及与免疫浸润的关系 | 结直肠癌患者样本(包括TCGA数据库644例、GTEx数据库308例和临床样本30例) | 生物信息学 | 结直肠癌 | 多组学分析,单细胞RNA测序,空间转录组学,DNA甲基化分析 | 列线图预测模型 | 基因表达数据,临床数据,单细胞测序数据,空间转录组数据 | 总计982个样本(TCGA 644例,GTEx 308例,临床样本30例) | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 582 | 2025-03-21 |
Marrying mechanics with spatial transcriptomics
2025-Mar-19, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02491-4
PMID:40108447
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 583 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomics in the adult Drosophila brain and body
2025-Mar-18, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.92618
PMID:40100257
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研究论文 | 本研究应用空间转录组学技术定位成年果蝇大脑和身体中150种mRNA的空间位置 | 首次将空间转录组学应用于成年果蝇大脑和身体,开发了整合空间转录组学和单细胞数据集的计算工具 | 概念验证研究,仅使用选定基因面板(150种mRNA物种) | 解决单核测序中细胞空间位置信息丢失的问题,定位果蝇细胞图谱中未知细胞簇的空间位置 | 成年果蝇大脑和身体组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,单核RNA测序 | NA | 空间转录组数据,单细胞数据 | 整个果蝇头部和身体,包括所有主要器官 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 584 | 2025-10-07 |
Targeting HIF-2α in glioblastoma reshapes the immune infiltrate and enhances response to immune checkpoint blockade
2025-Mar-17, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-025-05642-8
PMID:40095115
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研究论文 | 本研究探索靶向HIF-2α在胶质母细胞瘤中重塑免疫浸润并增强免疫检查点阻断疗效的作用机制 | 首次揭示HIF-2α在胶质母细胞瘤免疫抑制中的关键作用,并证明HIF-2α抑制剂PT2385与免疫检查点阻断疗法的协同效应 | 研究基于小鼠GL261胶质母细胞瘤模型,临床转化效果需进一步验证 | 探究靶向HIF-2α对胶质母细胞瘤免疫微环境的调控作用及其与免疫治疗的协同机制 | GL261小鼠胶质母细胞瘤模型、肿瘤相关小胶质细胞/巨噬细胞、调节性T细胞 | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、体外细胞培养 | 动物疾病模型 | 基因表达数据、细胞表型数据 | GL261小鼠模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 585 | 2025-10-07 |
Transcriptional heterogeneity shapes stress-adaptive responses in yeast
2025-Mar-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57911-6
PMID:40097446
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探索酵母在渗透胁迫适应过程中的转录异质性及其对细胞适应性决策的影响 | 首次系统性地揭示了酵母渗透胁迫响应程序的转录异质性模式,并建立了转录异质性与细胞适应性之间的直接联系 | 研究仅针对酵母模型,结果在其他生物系统中的普适性需要进一步验证 | 阐明转录异质性在酵母应激适应性响应中的分子机制和功能意义 | 酵母细胞及其300多个RNA条形码缺失突变体 | 单细胞生物学 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 300多个RNA条形码缺失突变体 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 586 | 2025-10-07 |
Unraveling shared diagnostic genes and cellular microenvironmental changes in endometriosis and recurrent implantation failure through multi-omics analysis
2025-Mar-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-93146-7
PMID:40097519
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示子宫内膜异位症和复发性种植失败的共享诊断基因及细胞微环境变化 | 首次整合转录组和单细胞测序数据系统分析EMs和RIF的共享分子机制,并利用机器学习筛选出PDIA4和PGBD5作为新型共享诊断生物标志物 | 研究结果仍需在更大规模队列中验证,治疗潜力有待进一步探索 | 探索子宫内膜异位症和复发性种植失败的共同病理机制和诊断标志物 | 子宫内膜异位症和复发性种植失败患者 | 生物信息学 | 子宫内膜异位症,复发性种植失败 | 转录组测序,单细胞测序,机器学习,基因集富集分析,ceRNA网络分析 | 随机森林,XGBoost | 基因表达数据,单细胞数据 | GEO数据库中的转录组和单细胞测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq,转录组测序 | NA | NA |
| 587 | 2025-10-07 |
Exploring mitochondrial and ferroptotic mechanisms for systemic lupus erythematosus biomarker identification and therapy
2025-Mar-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-93872-y
PMID:40097571
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析探索系统性红斑狼疮中线粒体和铁死亡相关机制,建立诊断预测模型并筛选潜在治疗药物 | 首次结合线粒体相关基因和铁死亡相关基因评分,通过单细胞多组学分析揭示SLE细胞异质性,并开发高精度诊断预测模型 | 研究基于公共数据库数据,缺乏实验验证;样本来源和数量未明确说明 | 探索系统性红斑狼疮的分子机制并开发诊断生物标志物和治疗方法 | 系统性红斑狼疮患者基因表达数据 | 生物信息学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序, 微阵列分析, 分子对接 | 机器学习算法, 高维加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 微阵列 | NA | NA |
| 588 | 2025-10-07 |
Neutrophil extracellular trap-derived double-stranded RNA aggravates PANoptosis in renal ischemia reperfusion injury
2025-Mar-17, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02145-8
PMID:40098148
|
研究论文 | 本研究揭示了中性粒细胞胞外诱捕网来源的双链RNA通过TLR3信号通路加剧肾缺血再灌注损伤中近端肾小管上皮细胞的PANoptosis | 首次发现NETs来源的dsRNA通过TLR3信号通路促进肾IRI中的PANoptosis,并鉴定RIPK1-PANoptosomes在此过程中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究中性粒细胞胞外诱捕网在肾缺血再灌注损伤中促进PANoptosis的具体机制 | 小鼠肾缺血再灌注损伤模型中的近端肾小管上皮细胞 | 分子生物学 | 肾缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序,基因敲除,化学抑制剂 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 589 | 2025-10-07 |
Independent signaling pathways provide a fail-safe mechanism to prevent tumorigenesis
2025-Mar-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.28.640798
PMID:40093137
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析揭示EGFR-Ras和Hh信号通路在防止肿瘤发生中的独立作用机制 | 发现非相互作用的信号通路在转录水平上汇聚以防止恶性细胞行为的新机制 | 研究局限于果蝇滤泡细胞谱系,未在哺乳动物系统中验证 | 探究促增殖信号对上皮稳态的影响及其在肿瘤发生中的作用 | 果蝇滤泡细胞谱系 | 单细胞转录组学 | 肿瘤发生 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 590 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing of peripheral blood mononuclear cells from bronchopulmonary dysplasia
2025-Mar, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70276
PMID:40097329
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析支气管肺发育不良患者外周血单个核细胞的免疫特征 | 首次整合单细胞RNA测序与T/B细胞受体分析揭示BPD免疫机制,发现BTLA-TNFRSF14信号轴的关键作用 | 样本量有限,主要发现需在动物模型中验证 | 阐明支气管肺发育不良的免疫学机制 | 早产儿外周血单个核细胞及小鼠BPD模型 | 单细胞组学 | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序,T/B细胞受体分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 早产儿BPD患者和健康对照的外周血单个核细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 591 | 2025-10-07 |
Intratumoral Heterogeneity and Immune Microenvironment in Hepatoblastoma Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2025-Mar, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70482
PMID:40099956
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示肝母细胞瘤的瘤内异质性和免疫微环境特征 | 首次提供肝母细胞瘤的全面单细胞图谱,发现不同肿瘤区域具有不同的细胞组成和恶性程度,识别HMGB2作为潜在预后标志物 | 仅基于单个患者的样本,样本量有限,需要更大规模研究验证 | 探索肝母细胞瘤的瘤内异质性和肿瘤免疫微环境特征 | 肝母细胞瘤患者三个肿瘤区域和邻近正常组织的细胞 | 数字病理学 | 肝母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 43,592个细胞来自一个患者的三个肿瘤区域和邻近正常组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 592 | 2025-03-20 |
Targeting the histone reader ZMYND8 inhibits antiandrogen-induced neuroendocrine tumor transdifferentiation of prostate cancer
2025-Mar-18, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-025-00928-z
PMID:40102673
|
研究论文 | 本文通过CRISPR‒Cas9筛选与单细胞RNA测序追踪肿瘤转变,揭示了抗雄激素治疗诱导的ZMYND8依赖的表观遗传编程在前列腺癌神经内分泌肿瘤转分化中的关键作用 | 揭示了ZMYND8依赖的表观遗传编程在前列腺癌神经内分泌肿瘤转分化中的关键作用,并开发了iZMYND8-34小分子抑制剂以阻断这一过程 | NA | 研究抗雄激素治疗诱导的前列腺癌神经内分泌肿瘤转分化的分子机制 | 前列腺癌神经内分泌肿瘤 | 表观遗传学 | 前列腺癌 | CRISPR‒Cas9筛选, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 593 | 2025-10-07 |
IQGAP2 regulates blood-brain barrier immune dynamics
2025-Mar-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.111994
PMID:40071147
|
研究论文 | 本研究揭示了IQGAP2蛋白在调控血脑屏障免疫特权和免疫细胞进入中枢神经系统中的关键作用 | 首次发现IQGAP2作为支架蛋白在维持血脑屏障免疫稳态中的核心调控功能,并证实其在阿尔茨海默病患者海马体中表达降低 | 研究主要基于动物模型,人类组织分析样本量有限,具体分子机制仍需进一步阐明 | 探究IQGAP2如何调控免疫细胞跨越血脑屏障的浸润过程 | 小鼠、斑马鱼模型以及人类脑组织 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学 | NA | 基因表达数据,组织图像数据 | 多种动物模型和人类组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 594 | 2025-03-19 |
A graph neural network that combines scRNA-seq and protein-protein interaction data
2025-Mar-18, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02628-z
PMID:40097813
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 595 | 2025-10-07 |
Pan-cancer analysis and experimental verification of cytochrome B561 as a prognostic and therapeutic biomarker in breast cancer
2025-Mar-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02094-1
PMID:40091073
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研究论文 | 通过泛癌分析和实验验证研究细胞色素B561在乳腺癌中的预后和治疗生物标志物作用 | 首次系统分析CYB561在泛癌中的表达模式及其与免疫浸润的关系,并通过实验验证其在乳腺癌中的功能作用 | 研究主要基于TCGA数据库,需要更多独立队列验证;实验验证仅限于细胞水平 | 探讨CYB561在泛癌中的表达特征及其在乳腺癌中的预后和治疗价值 | 癌症患者组织样本和乳腺癌细胞系 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,基因敲除,生物信息学分析 | 逻辑回归,Cox回归,Kaplan-Meier,Nomogram | 基因表达数据,临床病理数据 | TCGA数据库中的泛癌样本和乳腺癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 596 | 2025-10-07 |
A Gremlin 1-expressing splenic niche cell population restrains chronic myeloid leukemia by antagonizing the BMP pathway
2025-Mar-17, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-025-00933-2
PMID:40097655
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研究论文 | 本研究揭示脾脏中表达Gremlin 1的基质细胞群通过拮抗BMP通路抑制慢性髓系白血病进展的新机制 | 首次发现脾脏中特定Gremlin 1+基质细胞群构成防御性微环境,通过拮抗BMP通路诱导白血病干细胞凋亡 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证仍需进一步深入 | 探究脾脏微环境在慢性髓系白血病进展中的调控机制 | 小鼠慢性髓系白血病模型及人类脾脏样本 | 单细胞生物学 | 慢性髓系白血病 | 单细胞RNA测序,基因敲除,酪氨酸激酶抑制剂治疗 | 小鼠疾病模型 | 单细胞转录组数据,实验验证数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 597 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing revealed cell landscape of tongue dorsal mucosa in rats with gastric intestinal metaplasia
2025-Mar-16, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02386-z
PMID:40090940
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示胃肠化生大鼠舌背黏膜的细胞景观变化 | 首次在胃肠化生大鼠模型中应用单细胞RNA测序技术系统分析舌背黏膜的细胞组成和基因表达变化 | 研究仅使用大鼠模型,未在人类样本中验证;样本量未明确说明 | 探究胃肠化生与舌背黏膜细胞景观变化的关系 | 胃肠化生大鼠模型的舌背黏膜细胞 | 单细胞测序 | 胃肠化生 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 598 | 2025-10-07 |
Genetic insights into idiopathic pulmonary fibrosis: a multi-omics approach to identify potential therapeutic targets
2025-Mar-16, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06368-8
PMID:40091050
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研究论文 | 通过多组学方法识别特发性肺纤维化的潜在治疗靶点 | 整合基因组和转录组数据,结合TWAS、孟德尔随机化和分子对接等多种分析方法 | 未明确说明样本量的具体数值和研究人群的详细特征 | 识别特发性肺纤维化的潜在治疗靶点并评估其安全性 | 特发性肺纤维化相关基因和药物靶点 | 生物信息学 | 特发性肺纤维化 | 转录组范围关联研究(TWAS), 孟德尔随机化(MR), RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 分子对接 | OTTERS框架, 基于汇总数据的MR(SMR) | 基因组数据, 转录组数据, GWAS汇总统计数据 | 使用Global Biobank和Finngen数据库的GWAS数据,UK Biobank中679种疾病的GWAS数据 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 599 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals dynamic changes in the liver microenvironment during colorectal cancer metastatic progression
2025-Mar-16, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06351-3
PMID:40091048
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示结直肠癌肝转移过程中肝脏微环境的动态变化 | 首次在转移前和转移期肝脏中鉴定出高表达Prok2的中性粒细胞亚群,并揭示其通过抑制巨噬细胞吞噬和促进T细胞耗竭驱动免疫抑制的新机制 | 研究基于小鼠原位模型,需要在人类样本中进一步验证 | 探究结直肠癌肝转移过程中肝脏微环境的动态变化 | 小鼠原位结直肠癌模型的转移前和转移期肝脏组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠原位模型肝脏组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 600 | 2025-10-07 |
CCL20/CXCL5 Drives Crosstalk Between Anaplastic Thyroid Cancer Stem Cells and Tumor-Associated Macrophages to Promote Tumor Progression
2025-Mar-16, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202405399
PMID:40091357
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研究论文 | 本研究揭示了间变性甲状腺癌干细胞与肿瘤相关巨噬细胞通过CCL20/CXCL5轴相互作用的机制 | 首次发现CCL20/CXCL5轴在TAMs与ATCSCs相互作用中的关键作用,并阐明其通过IRAK-1/NF-κB1/2信号通路调控肿瘤干细胞特性 | 研究主要基于体外实验和异种移植模型,需要进一步临床验证 | 探索肿瘤相关巨噬细胞与间变性甲状腺癌干细胞之间的相互作用机制及其在肿瘤进展中的作用 | 间变性甲状腺癌干细胞(ATCSCs)和肿瘤相关巨噬细胞(TAMs) | 肿瘤生物学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序,细胞因子/趋化因子阵列,蛋白质组学,mRNA表达分析 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |