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当前共找到 714 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-03-18 |
Systematic evaluation of single-cell multimodal data integration for comprehensive human reference atlas
2025-Mar-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.06.637075
PMID:40093094
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研究论文 | 本研究系统评估了单细胞多模态数据整合方法在构建人类肾脏皮质参考图谱中的应用 | 开发了可解释的机器学习工具scOMM，并首次系统评估了水平整合（scRNA与snRNA-seq）和垂直整合（snRNA-seq与snATAC-seq）策略在复杂组织中的效果 | 研究仅针对肾脏皮质组织，未验证在其他复杂组织中的普适性 | 评估多模态单细胞数据整合策略对构建全面人类参考图谱的影响 | 人类肾脏皮质组织 | 单细胞组学 | NA | scRNA-seq, snRNA-seq, snATAC-seq | 机器学习（scOMM工具） | 单细胞多模态组学数据 | 19名捐赠者的119,744个高质量细胞核/细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 42 | 2026-03-18 |
Mixed exposure to PFOA and PFOS induces oocyte apoptosis and subfertility in mice by activating the Hippo signaling pathway
2025-03, Reproductive toxicology (Elmsford, N.Y.)
DOI:10.1016/j.reprotox.2024.108829
PMID:39746460
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研究论文 | 本研究探讨了PFOA和PFOS混合物暴露通过激活Hippo信号通路诱导小鼠卵母细胞凋亡并导致生育力下降的机制 | 首次揭示了PFOA和PFOS混合物通过激活Hippo信号通路损害卵母细胞质量和生育能力的分子机制，并利用单细胞转录组分析证实了其对能量代谢和凋亡的影响 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证；混合物暴露的具体剂量和比例对结果的普适性有待进一步研究 | 探究PFOA和PFOS混合物暴露对卵母细胞质量和雌性生育能力的影响及其分子机制 | 雌性小鼠的卵母细胞 | 生殖毒理学 | 生殖系统疾病 | 单细胞转录组分析 | 动物模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 43 | 2026-03-16 |
Investigating pulmonary neutrophil responses to inflammation in mice via flow cytometry
2025-Mar-14, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiae189
PMID:39212489
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研究论文 | 本文介绍了一种通过流式细胞术评估小鼠肺部中性粒细胞表型的详细实验方案 | 提供了一种针对真菌细胞壁颗粒zymosan诱导的肺部无菌炎症模型，结合细胞表面和细胞内标记的全面染色技术，适用于下游单细胞测序等应用 | NA | 探索肺部中性粒细胞在生理和病理条件下的复杂功能 | 小鼠肺部组织及气腔中的中性粒细胞 | 数字病理学 | 肺部炎症 | 流式细胞术 | NA | 细胞表型数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 44 | 2026-03-15 |
An accelerated human in-vitro aging model mimicsin-vivo aging and facilitates dynamic testing of anti-aging compounds
2025-Mar-28, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6173768/v1
PMID:40195985
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研究论文 | 本研究开发了一种加速的人类体外衰老模型，模拟体内衰老过程，并用于动态测试抗衰老化合物 | 通过长期有丝分裂后培养人类成纤维细胞，真实再现并加速了体内衰老特征，结合单细胞转录组学揭示了衰老异质性，并利用该平台评估了抗衰老化合物的疗效 | 模型基于成纤维细胞，可能无法完全代表所有细胞类型的衰老过程，且体外环境与体内存在差异 | 研究人类特异性衰老动力学，开发实验平台以预测抗衰老治疗效果 | 人类成纤维细胞及其衍生的神经元 | 生物医学研究 | 衰老相关疾病 | 转录组学、表观遗传学分析、单细胞转录组学 | 体外衰老模型 | 转录组数据、表观遗传数据 | 未明确指定样本数量，但涉及成纤维细胞的长期培养和单细胞分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 45 | 2026-03-14 |
Kölliker's Organ Functions as a Developmental Hub in Mouse Cochlea Regulating Spiral Limbus and Tectorial Membrane Development
2025-03-26, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.0721-24.2025
PMID:39909560
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研究论文 | 本研究通过基因敲除小鼠模型，揭示了Kölliker's器官作为发育枢纽，调控小鼠耳蜗螺旋缘和盖膜发育的关键作用 | 首次发现Kölliker's器官通过上皮-间质信号通路（涉及CTGF因子）非自主性调控螺旋缘间质基质发育，并确认其为新的耳聋基因 | 研究局限于小鼠模型，尚未在人类或其他物种中验证；单细胞测序样本量有限 | 探究Kölliker's器官在耳蜗发育中的功能及其对听力形成的影响 | 基因敲除小鼠的耳蜗组织（Kölliker's器官、螺旋缘、盖膜） | 发育生物学 | 听力障碍 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、条件性基因敲除、听觉脑干反应测试 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据、组织形态学数据、生理功能数据 | 未明确样本数量的小鼠耳蜗组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 46 | 2026-03-14 |
High-throughput single cell -omics using semi-permeable capsules
2025-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.14.642805
PMID:40166174
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研究论文 | 本文介绍了一种基于半透性胶囊（SPCs）的高通量单细胞组学技术，用于多种核酸分析，包括数字PCR、基因组测序和单细胞RNA测序 | 开发了基于半透性胶囊的通用技术，克服了液滴微流体系统长期培养和克隆扩增的限制，提供了更高的转录本捕获效率 | 未明确说明技术在大规模应用中的成本、通量上限或与其他单细胞平台的直接比较数据 | 开发一种高效、可定制的单细胞组学技术，用于解析生物系统的复杂性和异质性 | 造血系统疾病患者的白细胞，特别是急性髓系白血病样本中的成熟粒细胞和单核细胞 | 单细胞组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、数字PCR、基因组测序、FACS分选 | NA | 单细胞转录组数据 | 造血系统疾病患者的白细胞样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | CapSeq（胶囊测序） | 基于半透性胶囊（SPCs）的单细胞测序技术，支持长期细胞培养和克隆扩增 |
| 47 | 2026-03-13 |
Splenic TNF-α signaling potentiates the innate-to-adaptive transition of antiviral NK cells
2025-Mar-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.02.012
PMID:40023159
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了脾脏TNF-α信号在巨细胞病毒感染期间促进NK细胞从先天免疫向适应性免疫转变的关键机制 | 首次发现脾脏微环境中TNF-α/TNFR2信号通过激活经典和非经典NF-κB通路，分别调控NK细胞的先天效应功能和适应性前体细胞分化 | 研究主要聚焦于巨细胞病毒感染模型，在其他病毒感染或肿瘤微环境中的普适性有待验证 | 探究病毒感染过程中NK细胞在不同组织中的活化机制及其向适应性免疫细胞转变的调控通路 | 巨细胞病毒感染模型中的自然杀伤细胞 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序，纵向追踪 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 48 | 2026-03-06 |
The tectum transversum(TTR) maintains patency of the developing coronal suture
2025-Mar-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.30.646197
PMID:40236170
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研究论文 | 本研究探讨了小鼠模型中短暂软骨结构TTR在冠状缝发育中的作用，发现其通过抑制BMP信号通路维持冠状缝开放，为冠状缝早闭的病因提供了新见解 | 首次通过基因消融实验证明TTR在维持冠状缝开放中的关键作用，并利用空间转录组学数据揭示其作为BMP信号屏障的潜在机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性尚需进一步验证；BMP信号调控机制的具体分子通路有待深入探索 | 探究冠状缝发育的调控机制及冠状缝早闭的病因 | 小鼠模型中的冠状缝、TTR软骨及相关组织（颅骨、硬脑膜） | 发育生物学 | 颅缝早闭 | 空间转录组学、基因消融 | NA | 空间转录组数据、组织学图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 49 | 2026-03-06 |
Histidine metabolism drives liver cancer progression via immune microenvironment modulation through metabolic reprogramming
2025-Mar-04, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06267-y
PMID:40038727
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研究论文 | 本研究探讨了组氨酸代谢如何通过代谢重编程和免疫微环境调控驱动肝细胞癌进展 | 揭示了组氨酸代谢通过下调关键细胞通讯通路（如MIF、CLEC、MHC II）和促进BUD23基因表达来重塑免疫抑制微环境的新机制 | 具体组氨酸代谢产物如何直接调控BUD23的分子机制尚未完全阐明，且临床样本量有限 | 探究组氨酸代谢在肝细胞癌进展中的作用及其对肿瘤免疫微环境的调控机制 | 肝细胞癌样本中的不同细胞类型，包括实质细胞、巨噬细胞和T细胞 | 肿瘤代谢与免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、体内外实验、TCGA数据库分析、多变量Cox回归模型 | 预后模型（基于多变量Cox回归） | 单细胞RNA测序数据、TCGA数据库的转录组数据 | 未明确指定样本数量，但使用了HCC样本和TCGA数据库 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 50 | 2026-03-04 |
Epigenomic subtypes of late-onset Alzheimer's disease reveal distinct microglial signatures
2025-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.15.643144
PMID:40166175
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研究论文 | 本研究通过分析三个独立尸检脑队列的全基因组DNA甲基化数据，识别了晚发性阿尔茨海默病的两种表观基因组亚型，并揭示了它们与特定小胶质细胞状态的关联 | 首次在晚发性阿尔茨海默病中基于全基因组DNA甲基化模式识别出两种可重复的表观基因组亚型，并揭示了它们与特定小胶质细胞炎症状态的关联 | 研究基于尸检脑组织样本，可能无法完全反映疾病早期或活体状态；样本量相对有限（n=831），且为回顾性设计 | 识别晚发性阿尔茨海默病的表观基因组亚型，并探索其细胞类型特异性和功能影响 | 晚发性阿尔茨海默病患者的尸检脑组织样本 | 表观基因组学 | 阿尔茨海默病 | 全基因组DNA甲基化分析、单细胞RNA测序、转录组分析 | 无监督聚类方法 | DNA甲基化数据、转录组数据 | 831例尸检脑组织样本（来自三个独立队列） | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 | NA | NA |
| 51 | 2026-03-04 |
Seq-Scope: repurposing Illumina sequencing flow cells for high-resolution spatial transcriptomics
2025-03, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01065-0
PMID:39482362
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研究论文 | 本研究开发了一种名为Seq-Scope的高分辨率空间转录组学技术，通过改造Illumina测序流动池实现低成本、高效率的空间转录组分析 | 将Illumina测序平台重新用于高分辨率空间转录组分析，实现了亚微米级分辨率、高捕获效率和低成本，克服了现有商业技术分辨率低、流程复杂、成本高的限制 | 需要研究人员具备分子生物学、组织学和基本Unix技能，且组织处理、文库制备和计算流程仍需3天完成 | 开发一种高分辨率、低成本的空间转录组学技术 | 新鲜冷冻组织切片 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据、组织图像数据 | 可在7 mm × 7 mm或更大区域内分析多个组织切片 | Illumina | 空间转录组学 | Illumina NovaSeq 6000 | Illumina NovaSeq 6000测序流动池 |
| 52 | 2024-10-04 |
A Single-Cell RNA Sequencing Atlas of the Chronic Obstructive Pulmonary Disease Distal Lung to Predict Cell-Cell Communication
2025-Mar, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0232LE
PMID:39356793
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 53 | 2026-03-03 |
Glial 'omics in ischemia: Acute stroke and chronic cerebral small vessel disease
2025-Mar, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24634
PMID:39463002
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综述 | 本文综述了在急性缺血性中风和慢性脑小血管病中，胶质细胞（特别是小胶质细胞）在神经免疫反应中的作用，以及转录组学、单细胞RNA测序和空间转录组学等技术在揭示胶质细胞亚群和功能中的应用 | 整合了多种组学方法（如单细胞RNA测序、空间转录组学和核糖体标记策略）来阐明胶质细胞在缺血性疾病中的动态响应，并强调了这些技术在识别新型细胞亚型和生成新假设方面的潜力 | NA | 阐明胶质细胞在急性缺血性中风和慢性脑小血管病中的神经免疫反应，并探索多组学方法在进一步解析这些反应中的应用 | 胶质细胞，包括小胶质细胞和星形胶质细胞，在缺血性中风和脑小血管病中的响应 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 核糖体标记策略, 转录组分析 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 54 | 2026-03-03 |
All the single cells: Single-cell transcriptomics/epigenomics experimental design and analysis considerations for glial biologists
2025-Mar, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24633
PMID:39558887
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综述 | 本文为胶质细胞生物学家提供单细胞RNA-seq实验设计与分析的入门指南 | 针对胶质细胞研究领域，系统梳理单细胞组学实验设计与分析的关键决策点 | 作为入门指南，未涉及具体算法或工具的深入技术细节 | 提升胶质生物学家对单细胞组学数据的分析、解释与批判能力 | 胶质细胞及其在神经疾病中的亚型与功能 | 单细胞组学 | 神经疾病 | 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 55 | 2026-03-03 |
Analysis of human neutrophils from nasal polyps by single-cell RNA sequencing reveals roles of neutrophils in chronic rhinosinusitis
2025-Mar, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.10.032
PMID:39522652
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析鼻息肉组织中的中性粒细胞，揭示了其在慢性鼻窦炎伴鼻息肉发病机制中的潜在作用及异质性 | 首次利用基于微孔的单细胞RNA测序技术，对鼻息肉组织中的中性粒细胞进行高分辨率分析，揭示了其基因表达谱的改变和亚群异质性 | 样本量较小（5例对照、5例鼻息肉组织），且仅分析了粒细胞富集样本，可能未完全捕获所有细胞类型 | 揭示中性粒细胞在慢性鼻窦炎伴鼻息肉发病机制中的作用和异质性 | 鼻息肉组织、对照鼻窦组织及患者匹配的外周血样本中的中性粒细胞 | 单细胞组学 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 单细胞RNA测序 | Benjamini-Hochberg算法、通路富集分析、基因本体富集分析 | 单细胞转录组数据 | 5例对照鼻窦组织、5例鼻息肉组织及匹配外周血样本 | 未明确 | 单细胞RNA-seq | 微孔基单细胞RNA测序检测方法 | 新型基于微孔的单细胞RNA测序检测方法，使用粒细胞富集样本 |
| 56 | 2026-03-03 |
Microglial Responses to Alzheimer's Disease Pathology: Insights From "Omics" Studies
2025-Mar, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24666
PMID:39760224
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综述 | 本文综述了利用多种组学技术研究阿尔茨海默病小鼠模型中小胶质细胞反应的文献，旨在阐明小胶质细胞在AD病理中的作用机制 | 整合了多种组学技术（如单细胞转录组学、空间转录组学、蛋白质组学等）来系统分析AD小鼠模型中小胶质细胞的异质性和分子模式变化 | 主要基于小鼠模型研究，可能无法完全反映人类AD的复杂性；且为综述性文章，未提供原始实验数据 | 阐明小胶质细胞在阿尔茨海默病病理中的驱动和贡献机制 | 阿尔茨海默病小鼠模型中的小胶质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 转录组学、表观基因组学、空间转录组学、蛋白质组学、脂质组学、代谢组学 | NA | 组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 57 | 2026-03-03 |
Techniques and analytic workflow for spatial transcriptomics and its application to allergy and inflammation
2025-Mar, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.01.009
PMID:39837466
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综述 | 本文综述了空间转录组学技术及其在过敏和炎症研究中的应用，重点关注数据处理和分析方法 | 通过整合单细胞基因表达数据与细胞定位，在完整空间背景下提供前所未有的生物学见解，为数据解释增加新维度 | NA | 总结空间转录组学领域的最新进展及其在过敏和炎症研究中的应用 | 过敏和炎症疾病，如特应性皮炎和慢性阻塞性肺疾病 | 数字病理学 | 过敏和炎症疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 58 | 2026-03-03 |
Deciphering key roles of B cells in prognostication and tailored therapeutic strategies for lung adenocarcinoma: a multi-omics and machine learning approach towards predictive, preventive, and personalized treatment strategies
2025-Mar, The EPMA journal
DOI:10.1007/s13167-024-00390-4
PMID:39991096
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研究论文 | 本研究通过多组学和机器学习方法，揭示了B细胞在肺腺癌预后中的关键作用，并开发了SRBS评分以支持预测性、预防性和个性化治疗策略 | 整合了多组学数据（包括bulk RNA、ATAC-seq、单细胞RNA和空间转录组测序）和机器学习算法，首次构建了与B细胞相关的SRBS评分，用于肺腺癌的预后预测和个性化治疗指导 | 未明确说明样本量大小，且实验验证部分可能有限，需要进一步临床验证 | 探索B细胞在肺腺癌预后中的作用，并开发个性化治疗策略以改善患者结局 | 肺腺癌患者及其相关的多组学数据 | 机器学习 | 肺癌 | 多组学整合分析，包括bulk RNA-seq、ATAC-seq、单细胞RNA-seq、空间转录组测序 | 多种机器学习算法整合 | 多组学数据（RNA、ATAC、单细胞、空间转录组） | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq, bulk ATAC-seq | NA | NA |
| 59 | 2026-03-02 |
A Single-Cell Transcriptome Atlas of Epithelial Subpopulations in HPV-Positive and HPV-Negative Head and Neck Cancers
2025-03-24, Viruses
DOI:10.3390/v17040461
PMID:40284904
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研究论文 | 本文通过分析已发表的单细胞RNA测序数据，揭示了HPV阳性和阴性头颈癌中上皮细胞亚群的转录组特征，旨在为优化治疗策略提供新见解 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统比较HPV阳性和阴性头颈癌中的上皮细胞亚群，识别了共享或富集的转录组特征和候选生物标志物 | 研究基于已发表数据，可能受样本来源和技术异质性限制，且未进行实验验证 | 区分HPV阳性和阴性头颈癌中的上皮肿瘤细胞亚群，以识别新的生物标志物和治疗靶点 | HPV阳性和阴性头颈鳞状细胞癌（HNSCC）中的上皮细胞 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 60 | 2026-03-02 |
Deep learning in single-cell and spatial transcriptomics data analysis: advances and challenges from a data science perspective
2025-Mar-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf136
PMID:40185158
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综述 | 本文从数据科学角度系统回顾了深度学习在单细胞和空间转录组学数据分析中的进展与挑战 | 通过整理来自九个基准测试的21个数据集，评估了58种计算方法的性能，揭示了模型性能在不同基准数据集和评估指标间的显著差异 | 高质量标注数据集仍然有限，且生物组织的复杂相关性使得准确重建细胞状态和空间背景具有挑战性 | 探讨深度学习如何有效应用于生物、医学和临床环境中的转录组学数据分析 | 单细胞和空间转录组学数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序，空间转录组学 | 深度学习 | 基因表达，表观遗传修饰，代谢物水平，空间位置等多模态数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |