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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 561 | 2025-10-07 |
SAMD4A inhibits abdominal aortic aneurysm development and VSMC phenotypic transformation through targeting KDM2B
2025-Mar-11, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.03.018
PMID:40081568
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研究论文 | 本研究揭示了RNA结合蛋白SAMD4A通过靶向KDM2B抑制腹主动脉瘤发展和血管平滑肌细胞表型转化的机制 | 首次发现SAMD4A在腹主动脉瘤中的保护作用及其通过调控KDM2B影响血管平滑肌细胞表型转化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中验证;机制研究仍需进一步深入 | 探究SAMD4A是否抑制血管平滑肌细胞表型转化并抑制腹主动脉瘤形成 | 血管平滑肌细胞和腹主动脉瘤小鼠模型 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,RNA免疫沉淀测序,染色质免疫沉淀-qPCR | NA | 单细胞RNA测序数据,RNA-seq数据,ChIP-qPCR数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 562 | 2025-10-07 |
Single-Cell Landscape of Bronchoalveolar Lavage Fluid Identifies Specific Neutrophils during Septic Immunosuppression
2025-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202406218
PMID:39887584
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析脓毒症患者支气管肺泡灌洗液,揭示了中性粒细胞驱动的肺部免疫抑制程序 | 首次在脓毒症免疫抑制期发现CXCR2和CD274IL1RN中性粒细胞亚群的显著增加及其发育轨迹 | 研究样本量有限,主要关注肺部免疫细胞,未涉及其他器官的免疫抑制机制 | 探索脓毒症免疫抑制期间肺部免疫细胞的分子特征和机制 | 脓毒症患者的支气管肺泡灌洗液样本 | 单细胞组学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 脓毒症患者BALF样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 563 | 2025-10-07 |
Lepidopteran scale cells derive from sensory organ precursors through a canonical lineage
2025-Mar-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204501
PMID:40052482
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研究论文 | 本研究通过发育生物学和转录组学证据证明鳞翅目昆虫的鳞片细胞来源于感觉器官前体细胞 | 首次通过活体成像和单细胞转录组测序证明鳞翅目鳞片与果蝇机械感刚毛的同源发育路径,并发现新的转录因子pdm3参与鳞片分化 | 研究主要聚焦早期蛹期翅膀发育,未涵盖所有鳞片类型和发育阶段 | 探究鳞翅目昆虫鳞片细胞的发育起源和分子机制 | 鳞翅目昆虫(蝴蝶和蛾类)的翅膀鳞片细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞核RNA测序, 活体成像 | NA | 基因表达数据, 影像数据 | 早期蛹期翅膀组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 564 | 2025-10-07 |
Aberrant Hematopoiesis and CD8+ T-Cell Activation in Thymoma-Associated Pure Red Cell Aplasia
2025-Mar, Thoracic cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/1759-7714.70046
PMID:40109027
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析胸腺瘤相关纯红细胞再生障碍的免疫机制 | 首次在单细胞水平揭示胸腺瘤-PRCA患者骨髓中CD8+T细胞异常激活导致红细胞生成障碍的机制 | 样本量较小且为观察性研究,需进一步验证因果关系 | 阐明胸腺瘤相关纯红细胞再生障碍的免疫发病机制 | 胸腺瘤-PRCA患者和健康对照者的骨髓细胞及外周血CD8+T细胞 | 单细胞组学 | 纯红细胞再生障碍 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 流式细胞术, 细胞因子分析 | NA | 单细胞转录组数据, bulk转录组数据, 流式细胞数据, 细胞因子数据 | 胸腺瘤-PRCA患者和健康对照者(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 565 | 2025-10-07 |
Screening Therapeutic Core Genes in Sepsis Using Network Pharmacology and Single-Cell RNA Sequencing
2025-Mar-20, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-025-11075-6
PMID:40113718
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研究论文 | 本研究结合网络药理学和单细胞RNA测序技术筛选脓毒症治疗核心基因 | 首次将网络药理学与单细胞RNA测序相结合,在细胞水平定位金银花治疗脓毒症的潜在靶点基因 | 需要进一步的实验验证网络药理学预测结果 | 阐明金银花治疗脓毒症的分子机制并筛选核心治疗靶点 | 脓毒症患者血液样本和金银花活性成分 | 生物信息学 | 脓毒症 | RNA测序,单细胞RNA测序,网络药理学,meta分析 | NA | 基因表达数据 | 22例脓毒症患者和10例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | NA |
| 566 | 2025-10-07 |
The Role of Coagulation-Related Genes in Glioblastoma: A Comprehensive Analysis of the Tumor Microenvironment, Prognosis, and Treatment
2025-Mar-20, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-025-11086-3
PMID:40113719
|
研究论文 | 本研究全面分析了凝血相关基因在胶质母细胞瘤肿瘤微环境、预后和治疗中的作用 | 首次通过单细胞分析揭示凝血通路在胶质母细胞瘤内皮细胞中的显著激活,并构建了基于五个凝血相关基因的风险特征模型 | 研究主要基于公共数据库数据,需要更多实验验证和临床样本确认 | 探索凝血相关基因在胶质母细胞瘤中的作用机制及其临床意义 | 胶质母细胞瘤患者和肿瘤细胞 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, SNP分析, 拷贝数变异分析, 免疫组织化学, CCK8实验, 伤口愈合实验 | LASSO回归, 随机生存森林分析, 无监督聚类 | 基因组数据, 单细胞RNA测序数据, 临床数据 | TCGA队列461例GBM患者,CGGA693队列,IMvigor210队列 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 567 | 2025-10-07 |
SPARROW reveals microenvironment-zone-specific cell states in healthy and diseased tissues
2025-Mar-19, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101235
PMID:40112778
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研究论文 | SPARROW是一种计算框架,通过联合学习细胞类型和细胞组织的潜在嵌入和软聚类,实现健康与疾病组织中微环境区域特异性细胞状态的发现 | 将细胞类型推断和细胞邻域识别整合为联合学习过程,在共享潜在空间中整合空间转录组和单细胞RNA测序数据 | 未在摘要中明确说明方法的具体限制 | 开发能够跨尺度、样本和条件全面表征组织特征的计算方法 | 人类和小鼠组织样本,特别是人类扁桃体组织 | 空间转录组学 | NA | 空间分辨转录组学,单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 潜在嵌入学习,软聚类 | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间分辨转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 568 | 2025-10-07 |
Downregulated STAT3 and STAT5B are prognostic biomarkers for colorectal cancer and are associated with immune infiltration
2025-Mar-18, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02085-2
PMID:40100436
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析发现STAT3和STAT5B在结直肠癌中表达下调,并验证其作为预后生物标志物和免疫治疗靶点的潜力 | 首次系统评估STAT家族在结直肠癌中的表达、预后价值及免疫功能,并利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术深入分析 | 样本量有限,临床样本仅30例,且主要依赖公共数据库数据 | 探究STAT家族在结直肠癌中的表达特征、预后价值及与免疫浸润的关系 | 结直肠癌患者样本(包括TCGA数据库644例、GTEx数据库308例和临床样本30例) | 生物信息学 | 结直肠癌 | 多组学分析,单细胞RNA测序,空间转录组学,DNA甲基化分析 | 列线图预测模型 | 基因表达数据,临床数据,单细胞测序数据,空间转录组数据 | 总计982个样本(TCGA 644例,GTEx 308例,临床样本30例) | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 569 | 2025-03-22 |
Spatial transcriptomics reveals differential inflammatory pathways in discoid lupus erythematosus and lichen planus
2025-Mar-18, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.02.148
PMID:40113031
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 570 | 2025-03-21 |
Marrying mechanics with spatial transcriptomics
2025-Mar-19, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02491-4
PMID:40108447
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 571 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics reveals a compartmentalized antiviral interferon response in the nasal epithelium of mice
2025-Mar-18, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01413-24
PMID:39902863
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学分析揭示了小鼠鼻上皮中抗病毒干扰素反应的区室化特征 | 首次发现嗅觉上皮细胞和呼吸上皮细胞对I型和III型干扰素的反应存在明显区室化差异 | 研究仅限于小鼠模型,人类中的情况仍需验证 | 探究上呼吸道不同上皮细胞亚型对I型和III型干扰素的抗病毒反应差异 | 小鼠鼻上皮细胞 | 单细胞生物学 | 呼吸道病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 572 | 2025-10-07 |
Conventional and antibody-enhanced DENV infection of human macrophages induces differential immunotranscriptomic profiles
2025-Mar-18, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01962-24
PMID:39902963
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较抗体依赖性增强感染与传统感染方式下登革病毒感染人类巨噬细胞的免疫转录组差异 | 首次在单细胞水平揭示ADE感染与传统感染在转录组层面的差异,发现ADE感染导致干扰素信号抑制和炎症趋化因子转录下调 | 研究仅针对DENV-2血清型,未涵盖所有登革病毒血清型;使用单核细胞来源的巨噬细胞可能不能完全代表体内情况 | 阐明抗体依赖性增强感染在登革病毒致病机制中的细胞内在调控机制 | 人类单核细胞来源的巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | 登革热 | 单细胞RNA测序 | 无监督分析 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 573 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomics in the adult Drosophila brain and body
2025-Mar-18, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.92618
PMID:40100257
|
研究论文 | 本研究应用空间转录组学技术定位成年果蝇大脑和身体中150种mRNA的空间位置 | 首次将空间转录组学应用于成年果蝇大脑和身体,开发了整合空间转录组学和单细胞数据集的计算工具 | 概念验证研究,仅使用选定基因面板(150种mRNA物种) | 解决单核测序中细胞空间位置信息丢失的问题,定位果蝇细胞图谱中未知细胞簇的空间位置 | 成年果蝇大脑和身体组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,单核RNA测序 | NA | 空间转录组数据,单细胞数据 | 整个果蝇头部和身体,包括所有主要器官 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 574 | 2025-10-07 |
Targeting HIF-2α in glioblastoma reshapes the immune infiltrate and enhances response to immune checkpoint blockade
2025-Mar-17, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-025-05642-8
PMID:40095115
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研究论文 | 本研究探索靶向HIF-2α在胶质母细胞瘤中重塑免疫浸润并增强免疫检查点阻断疗效的作用机制 | 首次揭示HIF-2α在胶质母细胞瘤免疫抑制中的关键作用,并证明HIF-2α抑制剂PT2385与免疫检查点阻断疗法的协同效应 | 研究基于小鼠GL261胶质母细胞瘤模型,临床转化效果需进一步验证 | 探究靶向HIF-2α对胶质母细胞瘤免疫微环境的调控作用及其与免疫治疗的协同机制 | GL261小鼠胶质母细胞瘤模型、肿瘤相关小胶质细胞/巨噬细胞、调节性T细胞 | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、体外细胞培养 | 动物疾病模型 | 基因表达数据、细胞表型数据 | GL261小鼠模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 575 | 2025-10-07 |
Transcriptional heterogeneity shapes stress-adaptive responses in yeast
2025-Mar-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57911-6
PMID:40097446
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探索酵母在渗透胁迫适应过程中的转录异质性及其对细胞适应性决策的影响 | 首次系统性地揭示了酵母渗透胁迫响应程序的转录异质性模式,并建立了转录异质性与细胞适应性之间的直接联系 | 研究仅针对酵母模型,结果在其他生物系统中的普适性需要进一步验证 | 阐明转录异质性在酵母应激适应性响应中的分子机制和功能意义 | 酵母细胞及其300多个RNA条形码缺失突变体 | 单细胞生物学 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 300多个RNA条形码缺失突变体 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 576 | 2025-10-07 |
Unraveling shared diagnostic genes and cellular microenvironmental changes in endometriosis and recurrent implantation failure through multi-omics analysis
2025-Mar-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-93146-7
PMID:40097519
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研究论文 | 通过多组学分析揭示子宫内膜异位症和复发性种植失败的共享诊断基因及细胞微环境变化 | 首次整合转录组和单细胞测序数据系统分析EMs和RIF的共享分子机制,并利用机器学习筛选出PDIA4和PGBD5作为新型共享诊断生物标志物 | 研究结果仍需在更大规模队列中验证,治疗潜力有待进一步探索 | 探索子宫内膜异位症和复发性种植失败的共同病理机制和诊断标志物 | 子宫内膜异位症和复发性种植失败患者 | 生物信息学 | 子宫内膜异位症,复发性种植失败 | 转录组测序,单细胞测序,机器学习,基因集富集分析,ceRNA网络分析 | 随机森林,XGBoost | 基因表达数据,单细胞数据 | GEO数据库中的转录组和单细胞测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq,转录组测序 | NA | NA |
| 577 | 2025-10-07 |
Exploring mitochondrial and ferroptotic mechanisms for systemic lupus erythematosus biomarker identification and therapy
2025-Mar-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-93872-y
PMID:40097571
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析探索系统性红斑狼疮中线粒体和铁死亡相关机制,建立诊断预测模型并筛选潜在治疗药物 | 首次结合线粒体相关基因和铁死亡相关基因评分,通过单细胞多组学分析揭示SLE细胞异质性,并开发高精度诊断预测模型 | 研究基于公共数据库数据,缺乏实验验证;样本来源和数量未明确说明 | 探索系统性红斑狼疮的分子机制并开发诊断生物标志物和治疗方法 | 系统性红斑狼疮患者基因表达数据 | 生物信息学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序, 微阵列分析, 分子对接 | 机器学习算法, 高维加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 微阵列 | NA | NA |
| 578 | 2025-10-07 |
Neutrophil extracellular trap-derived double-stranded RNA aggravates PANoptosis in renal ischemia reperfusion injury
2025-Mar-17, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02145-8
PMID:40098148
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研究论文 | 本研究揭示了中性粒细胞胞外诱捕网来源的双链RNA通过TLR3信号通路加剧肾缺血再灌注损伤中近端肾小管上皮细胞的PANoptosis | 首次发现NETs来源的dsRNA通过TLR3信号通路促进肾IRI中的PANoptosis,并鉴定RIPK1-PANoptosomes在此过程中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究中性粒细胞胞外诱捕网在肾缺血再灌注损伤中促进PANoptosis的具体机制 | 小鼠肾缺血再灌注损伤模型中的近端肾小管上皮细胞 | 分子生物学 | 肾缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序,基因敲除,化学抑制剂 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 579 | 2025-10-07 |
Metabolic state uncovers prognosis insights of esophageal squamous cell carcinoma patients
2025-Mar-17, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06087-0
PMID:40098145
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研究论文 | 本研究通过整合代谢物-蛋白质相互作用网络和多尺度转录组学数据,首次全面绘制了食管鳞状细胞癌微环境的代谢图谱 | 首次在ESCC微环境中全面绘制代谢图谱,识别了16种代谢状态和4种预后亚型,揭示了细胞解毒过程失活与不良预后的关联 | 研究基于转录组数据推断代谢状态,需要实验验证代谢功能的实际变化 | 探索食管鳞状细胞癌微环境中代谢状态与预后的关系 | 食管鳞状细胞癌患者和肿瘤微环境中的细胞 | 生物信息学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,转录组分析 | 聚类分析 | 单细胞转录组数据,批量样本转录组数据 | 64个ESCC样本中的208,659个细胞,两个独立队列(n=79和119) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 580 | 2025-10-07 |
Independent signaling pathways provide a fail-safe mechanism to prevent tumorigenesis
2025-Mar-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.28.640798
PMID:40093137
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析揭示EGFR-Ras和Hh信号通路在防止肿瘤发生中的独立作用机制 | 发现非相互作用的信号通路在转录水平上汇聚以防止恶性细胞行为的新机制 | 研究局限于果蝇滤泡细胞谱系,未在哺乳动物系统中验证 | 探究促增殖信号对上皮稳态的影响及其在肿瘤发生中的作用 | 果蝇滤泡细胞谱系 | 单细胞转录组学 | 肿瘤发生 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |