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当前共找到 726 篇文献，本页显示第 541 - 560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 541 | 2025-10-07 |
Influence of experimental variables on spheroid attributes
2025-Mar-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-92037-1
PMID:40118968
|
研究论文 | 通过分析32,000个球体图像系统研究实验参数对三维细胞培养模型可靠性的影响 | 首次大规模系统分析氧浓度、培养基成分和血清水平对球体属性的综合影响，并整合单细胞RNA测序与自动图像分析技术 | 研究主要关注球体模型，可能不适用于其他类型的三维培养系统 | 识别影响三维细胞培养模型可靠性的关键参数，建立标准化培养方案 | 三维细胞培养球体 | 生物医学工程 | 肿瘤生物学 | 单细胞RNA测序, 自动图像分析 | 三维细胞培养模型 | 图像, 基因表达数据 | 32,000个球体图像 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 542 | 2025-10-07 |
Runx2 drives Schwann cells repair phenotype switch through chromatin remodeling and Sox2 activation after nerve injury
2025-Mar-21, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-025-01142-4
PMID:40119274
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研究论文 | 本研究探讨Runx2通过染色质重塑和Sox2激活调控雪旺细胞修复表型转换的机制 | 首次揭示Runx2通过染色质可及性和组蛋白修饰调控Sox2表达，促进雪旺细胞表型转换的表观遗传机制 | 研究主要基于大鼠模型和体外细胞实验，临床转化价值需进一步验证 | 阐明Runx2在神经损伤后调控雪旺细胞修复表型转换的表观遗传机制 | 雪旺细胞、Sprague-Dawley大鼠坐骨神经损伤模型 | 表观遗传学 | 神经损伤 | qPCR, ATAC-seq, CUT&Tag, 单细胞RNA测序, 双荧光素酶报告基因检测 | NA | 转录组数据, 表观基因组数据, 单细胞RNA测序数据 | 健康成年SD大鼠(100-150g)，损伤后4天和7天取样 | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, CUT&Tag | NA | NA |
| 543 | 2025-10-07 |
Exploring cell-to-cell variability and functional insights through differentially variable gene analysis
2025-Mar-20, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-025-00507-z
PMID:40113778
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研究论文 | 提出了一种用于单细胞RNA测序数据的差异变异性分析统计框架spline-DV | 开发了首个专注于分析单细胞基因表达变异性的统计方法，而不仅仅是平均表达水平 | 方法主要针对两种实验条件间的比较，未涉及更复杂的实验设计 | 开发能够分析单细胞基因表达变异性的计算方法 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达变异性 | 生物信息学 | 肥胖、纤维化、癌症 | 单细胞RNA测序 | spline-DV统计框架 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 544 | 2025-10-07 |
RNA m7G methylation regulators and targets significantly contribute to chronic obstructive pulmonary disease
2025-Mar-20, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-93901-w
PMID:40113900
|
研究论文 | 本研究首次通过整合生物信息学方法探讨m7G RNA甲基化调控因子在慢性阻塞性肺疾病中的作用 | 首次系统研究m7G甲基化调控因子在COPD中的联合作用，发现METTL1-CAT轴在疾病中的关键作用 | 仅通过细胞早衰模型进行初步验证，需要更多实验验证 | 探讨m7G RNA甲基化调控因子在慢性阻塞性肺疾病发病机制中的作用 | 慢性阻塞性肺疾病患者和细胞早衰模型 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 机器学习算法，单细胞测序，qRT-PCR，GSEA分析 | 机器学习算法，共识聚类 | 基因表达数据，单细胞测序数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 545 | 2025-10-07 |
Intratumoral microbiota-aided fusion radiomics model for predicting tumor response to neoadjuvant chemoimmunotherapy in triple-negative breast cancer
2025-Mar-20, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06369-7
PMID:40114207
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研究论文 | 开发了一种基于瘤内微生物组辅助的融合影像组学模型，用于预测三阴性乳腺癌患者对新辅助化疗免疫治疗的病理完全缓解 | 首次将瘤内微生物组特征与多时间点MRI影像组学特征融合构建预测模型 | 样本量相对有限（124例患者），需要更大规模的外部验证 | 预测三阴性乳腺癌患者对新辅助化疗免疫治疗的治疗反应 | 早期三阴性乳腺癌患者 | 数字病理 | 乳腺癌 | 16S rDNA测序, 单细胞RNA测序, 影像组学分析 | 融合影像组学模型 | 影像, 基因组数据 | 124例患者（训练集88例，验证集36例） | NA | 单细胞RNA测序, 16S rDNA测序 | NA | NA |
| 546 | 2025-10-07 |
SENSITIVITY BASED MODEL AGNOSTIC SCALABLE EXPLANATIONS OF DEEP LEARNING
2025-Mar-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.21.639516
PMID:40093081
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研究论文 | 提出了一种模型无关的可解释AI框架SensX，用于解释深度学习模型的预测机制 | 开发了SensX框架，在准确性和计算效率上显著优于现有最先进的可解释AI方法，并能扩展到具有超过15万个特征的视觉Transformer模型 | 未提及具体的数据集规模限制或模型类型的适用性限制 | 解决深度学习模型的黑箱问题，提供可解释的AI解决方案 | 深度神经网络和视觉Transformer模型 | 机器学习 | NA | 可解释AI，单细胞RNA测序 | 深度神经网络，视觉Transformer | 单细胞RNA-seq数据，面部图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 547 | 2025-10-07 |
Analysis of Head and Neck Cancer scRNA-seq Data Identified PRDM6 Promotes Tumor Progression by Modulating Immune Gene Expression
2025-Mar-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.04.641548
PMID:40093183
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研究论文 | 通过分析头颈癌单细胞RNA测序数据，发现PRDM6通过调控免疫基因表达促进肿瘤进展 | 首次发现PRDM6在头颈癌中通过诱导免疫应答基因表达促进肿瘤细胞增殖的新功能，并揭示HPV病毒癌蛋白与PRDM6表达的关联 | NA | 探索头颈鳞状细胞癌中免疫应答基因的调控机制及其在肿瘤进展中的作用 | 头颈鳞状细胞癌患者样本 | 生物信息学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序 | IRIS3 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 548 | 2025-10-07 |
Asymmetric Histone Inheritance Regulates Differential Transcription Re-initiation and Cell Fate Decisions in Mouse Olfactory Horizontal Basal Cells
2025-Mar-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.02.641101
PMID:40093102
|
研究论文 | 本研究通过小鼠嗅觉上皮损伤再生模型，揭示了水平基底细胞中组蛋白不对称遗传调控转录再起始和细胞命运决定的机制 | 首次在哺乳动物成体干细胞谱系中发现组蛋白H4、H3和H3.3的不对称遗传现象，并阐明其与细胞命运决定和组织再生的关系 | 未研究H2A-H2B组蛋白的不对称遗传机制，且研究仅限于小鼠嗅觉上皮系统 | 探究哺乳动物中表观遗传继承的机制及其在细胞命运决定中的作用 | 小鼠嗅觉上皮中的水平基底细胞（HBCs） | 表观遗传学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 配对子代细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 549 | 2025-10-07 |
MOSim: bulk and single-cell multilayer regulatory network simulator
2025-Mar-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf110
PMID:40116657
|
研究论文 | 介绍MOSim——一个能够模拟bulk和单细胞多层调控网络数据的R包 | 开发了首个同时支持bulk和单细胞多组学数据模拟的工具，能够模拟多种调控组学层与基因表达之间的调控关系 | NA | 开发多组学数据模拟工具，用于方法测试和基准测试 | 多组学数据模拟 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, ATAC-seq, miRNA-seq, ChIP-seq, Methyl-seq, scRNA-seq, scATAC-seq | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, bulk RNA-seq, bulk ATAC-seq | NA | NA |
| 550 | 2025-10-07 |
AttentionGRN: a functional and directed graph transformer for gene regulatory network reconstruction from scRNA-seq data
2025-Mar-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf118
PMID:40116659
|
研究论文 | 提出基于图变换器的AttentionGRN模型，用于从单细胞RNA测序数据重建基因调控网络 | 采用软编码增强模型表达能力，设计面向GRN的消息聚合策略，结合定向结构编码和功能基因采样 | NA | 从单细胞RNA测序数据重建细胞类型特异性基因调控网络 | 基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图变换器 | 单细胞RNA测序数据 | 88个数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 551 | 2025-10-07 |
Machine Learning-Based Glycolipid Metabolism Gene Signature Predicts Prognosis and Immune Landscape in Oesophageal Squamous Cell Carcinoma
2025-Mar, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70434
PMID:40119618
|
研究论文 | 开发并验证基于糖脂代谢相关基因的食管鳞癌预后模型 | 首次建立基于机器学习的15基因糖脂代谢特征模型，揭示其与免疫浸润模式的关联 | NA | 预测食管鳞癌预后并探索糖脂代谢与肿瘤免疫的关系 | 食管鳞癌患者 | 机器学习 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | TCGA和GEO数据库中的食管鳞癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 552 | 2025-10-07 |
Cancer‑associated fibroblasts: a pivotal regulator of tumor microenvironment in the context of radiotherapy
2025-Mar-20, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02138-7
PMID:40114180
|
综述 | 本文综述了癌症相关成纤维细胞在放疗背景下对肿瘤微环境的调控作用 | 系统阐述了放疗对CAFs表型和功能的影响及其与肿瘤细胞、免疫细胞的相互作用机制 | 放疗对CAFs的影响以及受辐射CAFs对肿瘤进展和TME的作用尚未完全明确 | 探讨CAFs在放疗背景下的调控作用及其作为治疗靶点的潜力 | 癌症相关成纤维细胞(CAFs) | 肿瘤微环境研究 | 癌症 | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 553 | 2025-10-07 |
Insights into the single-cell transcriptome characteristics of porcine endometrium with embryo loss
2025-Mar-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202402212RR
PMID:40105155
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了猪胚胎丢失子宫内膜的分子特征和细胞异质性 | 首次构建了猪围植入期胚胎丢失与成功妊娠子宫内膜的单细胞转录组图谱，识别了22种细胞亚群并揭示了细胞通讯差异 | 样本数量有限，研究仅关注围植入期，未涵盖整个妊娠过程 | 探究胚胎丢失过程中子宫内膜微环境的分子机制 | 猪子宫内膜组织 | 单细胞组学 | 生殖障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 胚胎丢失和成功妊娠的子宫内膜组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 554 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing of the holothurian regenerating intestine reveals the pluripotency of the coelomic epithelium
2025-Mar-20, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.100796
PMID:40111904
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究海参肠道再生过程中体腔上皮细胞的多能性 | 首次在棘皮动物再生研究中应用单细胞RNA测序技术，识别出再生原基中的13个不同细胞群，并发现体腔上皮具有多能性 | 研究仅限于海参这一特定物种，且对某些细胞群体的功能验证仍需进一步实验 | 探究海参肠道再生过程中细胞分子特征和再生机制 | 海参再生肠道组织中的细胞群体 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序，杂交链式反应荧光原位杂交 | NA | 单细胞转录组数据，荧光成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 555 | 2025-10-07 |
Bioinformatic analysis of serpina1 expression in papillary thyroid carcinoma and its potential association with Hashimoto's thyroiditis
2025-Mar-19, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02079-0
PMID:40106166
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研究论文 | 通过生物信息学分析探讨SERPINA1在甲状腺乳头状癌中的表达及其与桥本甲状腺炎的潜在关联 | 首次在单细胞水平系统揭示SERPINA1在甲状腺乳头状癌不同细胞亚群中的表达特征及其与桥本甲状腺炎的相互作用机制 | 研究结果基于生物信息学分析，需要进一步的实验验证 | 探索SERPINA1基因在甲状腺乳头状癌中的作用及其与桥本甲状腺炎的关系 | 甲状腺乳头状癌患者组织样本 | 生物信息学 | 甲状腺癌 | 转录组分析, 单细胞转录组分析, 基因集变异分析 | Wilcoxon检验, CIBERSORT, CellChat | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | TCGA和GEO数据库中的甲状腺乳头状癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 556 | 2025-10-07 |
CHI3L1: a key driver in gastritis-to-cancer transformation
2025-Mar-19, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06352-2
PMID:40108688
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研究论文 | 本研究通过机器学习方法识别了胃炎向胃癌转化过程中的关键驱动基因CHI3L1，并验证了其通过激活CD44-β-catenin通路促进恶性转化的机制 | 首次系统识别胃炎向胃癌转化过程中的12个驱动基因，并确定CHI3L1为核心驱动因子，阐明其通过CD44-β-catenin通路促进恶性转化的新机制 | 研究主要基于已有数据集和实验模型，需要进一步临床验证 | 阐明胃癌发生发展的分子机制并寻找早期诊断生物标志物 | 胃癌及其前驱病变胃炎 | 机器学习 | 胃癌 | 机器学习，单细胞RNA测序，多重免疫组织化学 | 早期诊断模型 | 基因表达数据，组织微阵列，细胞和类器官模型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 557 | 2025-10-07 |
Screening and analysis of programmed cell death related genes and targeted drugs in sepsis
2025-Mar-19, Hereditas
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s41065-025-00403-w
PMID:40108736
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研究论文 | 本研究通过生物信息学方法识别脓毒症中程序性细胞死亡相关基因并探索潜在治疗药物 | 首次整合WGCNA、LASSO、随机森林和孟德尔随机化方法系统分析脓毒症中PCD相关基因，并构建TF-miRNA-枢纽基因网络 | 研究主要基于生物信息学分析，需要后续实验验证 | 识别脓毒症诊断相关的程序性细胞死亡基因并探索潜在治疗药物 | 脓毒症患者的基因表达数据和血液细胞 | 生物信息学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序，WGCNA，LASSO，随机森林，CIBERSORT，孟德尔随机化 | NA | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据，GWAS数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 558 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals CD8 + T cell heterogeneity and identifies a prognostic signature in cervical cancer
2025-Mar-18, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-13901-x
PMID:40102789
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示宫颈癌中CD8+T细胞的异质性并构建预后风险模型 | 首次系统描绘宫颈癌中CD8+T细胞的异质性、发育轨迹和调控网络，并建立基于CD8+T细胞特征的预后模型 | NA | 表征宫颈鳞癌中CD8+T细胞的异质性、发育轨迹、调控网络和细胞间通讯，构建基于CD8+T细胞转录组特征的预后风险模型 | 宫颈癌肿瘤样本中的CD8+T细胞 | 生物信息学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序，机器学习 | 预后风险模型 | 单细胞RNA测序数据，批量转录组数据 | 整合TCGA和GEO数据库的宫颈癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 559 | 2025-10-07 |
Increased melanin induces aberrant keratinocyte - melanocyte - basal - fibroblast cell communication and fibrogenesis by inducing iron overload and ferroptosis resistance in keloids
2025-Mar-18, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02116-z
PMID:40102920
|
研究论文 | 本研究探讨黑色素通过诱导铁过载和抗铁死亡能力促进瘢痕疙瘩中成纤维细胞纤维化的机制 | 首次揭示黑色素通过诱导铁过载和抗铁死亡促进瘢痕疙瘩纤维化的新机制，并发现MITF抑制剂ML329的治疗潜力 | 研究主要基于细胞和小鼠模型，在人体中的治疗效果需要进一步验证 | 研究黑色素在促进瘢痕疙瘩成纤维细胞纤维化中的作用机制，并评估干预黑色素的治疗潜力 | 瘢痕疙瘩患者的皮肤组织、黑色素细胞、角质形成细胞、成纤维细胞以及瘢痕疙瘩裸鼠模型 | 细胞生物学 | 皮肤纤维化疾病 | 单细胞RNA测序, Masson-Fontana染色, 批量测序, Perl's染色, 细胞活力检测, 脂质ROS检测, 丙二醛检测 | NA | 基因表达数据, 组织染色图像, 细胞功能检测数据 | 瘢痕疙瘩患者组织和细胞, 瘢痕疙瘩裸鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 560 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics reveal the heterogeneity and intercellular communication of cancer-associated fibroblasts in gastric cancer
2025-Mar-18, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06376-8
PMID:40102930
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示胃癌中癌症相关成纤维细胞的异质性及细胞间通讯 | 首次在胃癌中整合单细胞测序与空间转录组数据，系统鉴定六种CAF亚群并揭示其与恶性上皮细胞的空间互作关系 | 样本量有限（24例），缺乏功能性实验验证 | 解析胃癌肿瘤微环境中癌症相关成纤维细胞的异质性及细胞间通讯网络 | 胃癌患者肿瘤组织中的癌症相关成纤维细胞和恶性上皮细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫组化 | Seurat, CellChat | 单细胞测序数据, 空间转录组数据, 免疫组化图像 | 24例胃癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |