单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 714 篇文献，本页显示第 521 - 540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2025-10-07 |
Cardiomyocyte Foxp1-Specific Deletion Promotes Post-injury Heart Regeneration via Targeting Usp20-HIF1ɑ-Hand1 Signaling Pathway
2025-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202412124
PMID:39899693
|
研究论文 | 本研究揭示Foxp1通过调控Usp20-HIF1ɑ-Hand1信号通路影响心肌细胞增殖和心脏再生能力 | 首次发现Foxp1在损伤后心脏再生中的关键作用，并阐明其通过Usp20-HIF1ɑ-Hand1信号通路调控心肌细胞代谢转换的新机制 | 研究主要基于动物模型，临床转化价值仍需进一步验证 | 探究Foxp1在心肌细胞增殖和心脏再生中的作用机制 | 心肌细胞和心脏组织 | 心血管生物学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组分析、基因功能获得和缺失实验、腺相关病毒转染 | NA | 基因表达数据、细胞增殖数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 522 | 2025-10-07 |
Longitudinal MRI-Driven Multi-Modality Approach for Predicting Pathological Complete Response and B Cell Infiltration in Breast Cancer
2025-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202413702
PMID:39921294
|
研究论文 | 开发一种整合纵向MRI空间生境放射组学、转录组学和单细胞RNA测序的多模态模型，用于预测乳腺癌新辅助治疗后的病理完全缓解 | 首次将纵向MRI空间生境放射组学与转录组学、单细胞RNA测序相结合，能够捕捉新辅助治疗期间肿瘤异质性的动态变化 | 模型需要在不同患者群体和临床环境中进行前瞻性验证以确认其普适性 | 预测乳腺癌患者对新辅助治疗的病理完全缓解 | 乳腺癌患者 | 医学影像分析 | 乳腺癌 | 磁共振成像, 放射组学, 转录组学, 单细胞RNA测序 | 多模态模型 | 医学影像, 基因表达数据 | 2279名患者来自12个中心 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 523 | 2025-10-07 |
Endothelial PPARδ Ablation Exacerbates Vascular Hyperpermeability via STAT1/CXCL10 Signaling in Acute Lung Injury
2025-Mar-28, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.325855
PMID:39996324
|
研究论文 | 本研究揭示了内皮细胞PPARδ通过STAT1/CXCL10信号通路调控急性肺损伤中血管高通透性的新机制 | 首次发现内皮细胞PPARδ缺失通过激活STAT1/CXCL10信号通路加剧血管高通透性，并阐明CXCL10通过泛素-蛋白酶体系统降解紧密连接蛋白的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化价值需进一步验证；机制研究集中在STAT1/CXCL10通路，可能存在其他调控途径 | 探究PPARδ在内皮屏障功能中的作用及其在急性肺损伤中的调控机制 | 内皮细胞特异性PPARδ基因敲除小鼠和同窝对照小鼠 | 分子生物学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序，基因敲除技术，免疫学方法 | NA | 基因表达数据，蛋白质数据，病理学数据 | 使用基因工程小鼠模型进行实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 524 | 2025-10-07 |
Stressed hepatocyte sustains alcohol-associated hepatitis progression by producing leukocyte cell-derived chemotaxin 2
2025-Mar-26, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-334318
PMID:40139745
|
研究论文 | 本研究揭示了LECT2-PHB2相互作用在酒精性肝炎中促进中性粒细胞活化和肝损伤的新机制 | 首次发现LECT2通过结合PHB2破坏PHB1/PHB2异源二聚体结构，导致ROS积累和中性粒细胞活化，形成肝细胞与中性粒细胞之间的恶性循环 | NA | 研究LECT2在肝细胞-中性粒细胞相互作用中的调控作用及其对酒精性肝炎进展的影响 | 酒精性肝炎患者样本、基因修饰小鼠、体外细胞实验 | 分子生物学 | 酒精性肝炎 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 基因敲除, 过表达 | NA | RNA测序数据, 血清和肝脏样本数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 525 | 2025-10-07 |
Applying integrated transcriptome and single-cell sequencing analysis to develop a prognostic signature based on M2-like tumor-associated macrophages for breast cancer
2025-Mar-25, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02161-7
PMID:40131644
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组和单细胞测序分析，开发了基于M2样肿瘤相关巨噬细胞的乳腺癌预后特征模型 | 首次结合转录组和单细胞测序数据，识别M2样TAM相关基因并构建乳腺癌预后特征 | 研究基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 开发基于M2样肿瘤相关巨噬细胞的乳腺癌预后特征模型 | 乳腺癌患者和细胞系 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, qRT-PCR | WGCNA, Cox回归, LASSO回归, 风险评分模型 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | TCGA-BRCA, GSE20685, GSE176078数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 526 | 2025-10-07 |
Integrated single-cell transcriptome and comparative genome analysis reveals the origin of intermuscular bones in zebrafish
2025-Mar-22, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.142397
PMID:40127795
|
研究论文 | 通过整合单细胞转录组和比较基因组分析揭示斑马鱼肌间骨的起源 | 首次结合比较基因组学和单细胞转录组学技术研究肌间骨的进化发育机制，成功构建了间充质干细胞向成骨细胞的分化轨迹并鉴定出关键调控基因 | 研究仅针对斑马鱼模型，未在其他鱼类中进行验证 | 探究鱼类肌间骨发育的分子调控机制和进化过程 | 斑马鱼肌间骨组织及15种有/无肌间骨的鱼类基因组 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 比较基因组分析, RNA速率分析, 伪时间分析, 基因敲除 | NA | 单细胞转录组数据, 基因组数据 | 15种鱼类（4种有肌间骨，11种无肌间骨）及斑马鱼肌间骨组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 527 | 2025-10-07 |
Hepatic Growth Factor as a Potential Biomarker for Lung Adenocarcinoma: A Multimodal Study
2025-Mar-19, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb47030208
PMID:40136462
|
研究论文 | 本研究通过多模态方法探索炎症细胞因子与肺腺癌之间的因果关系，并识别肝细胞生长因子作为潜在生物标志物 | 首次整合孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序和转录组测序数据，系统揭示炎症细胞因子与肺腺癌的因果机制 | 研究主要基于遗传数据和测序分析，需要进一步实验验证具体的分子机制 | 探索炎症细胞因子与肺腺癌之间的因果关系及潜在分子机制 | 肺腺癌患者及相关炎症细胞因子 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 孟德尔随机化分析, 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 528 | 2025-10-07 |
Multi-Omics Profiling Reveals Glycerolipid Metabolism-Associated Molecular Subtypes and Identifies ALDH2 as a Prognostic Biomarker in Pancreatic Cancer
2025-Mar-18, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo15030207
PMID:40137171
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了胰腺癌中甘油脂代谢相关的分子亚型，并确定ALDH2作为预后生物标志物 | 首次在胰腺癌中系统表征甘油脂代谢异质性，发现新的分子亚型和预后生物标志物ALDH2 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证相对有限 | 探究甘油脂代谢在胰腺癌中的作用机制和临床意义 | 胰腺癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,脂质组学,随机森林算法,PCR,免疫组化 | 随机森林 | 基因组数据,转录组数据,脂质组数据,单细胞数据,空间转录组数据 | 930例胰腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,脂质组学,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 529 | 2025-10-07 |
K-Volume Clustering Algorithms for scRNA-Seq Data Analysis
2025-Mar-11, Biology
DOI:10.3390/biology14030283
PMID:40136539
|
研究论文 | 提出了一种基于凸体积的新型聚类算法用于单细胞RNA测序数据分析 | 使用簇内点定义的总凸体积作为生物学相关且几何可解释的聚类标准，通过非线性优化同时优化层次结构和每层簇数量 | NA | 开发适用于高维结构化数据的聚类算法 | 单细胞和多组学数据集 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | K-体积聚类算法 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 530 | 2025-10-07 |
Burn-Related Glycocalyx Derangement and the Emerging Role of MMP8 in Syndecan Shedding
2025-Mar-06, Biology
DOI:10.3390/biology14030269
PMID:40136525
|
研究论文 | 本研究通过分析烧伤患者血清和单细胞RNA测序，揭示了MMP8在烧伤后糖萼破坏和肺损伤中的新作用机制 | 首次发现MMP8在烧伤后糖萼脱落中的关键作用，并验证其在肺泡上皮细胞中的直接效应 | 样本量较小（28例患者），且主要为观察性研究 | 探究烧伤后糖萼紊乱的分子机制及其与肺损伤的关系 | 烧伤患者血清样本和体外肺组织模型 | 分子生物学 | 烧伤 | 单细胞RNA测序, 微阵列转录组分析 | 体外肺组织模型 | RNA测序数据, 微阵列数据, 血清分析数据 | 28例烧伤患者 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组分析 | NA | NA |
| 531 | 2025-10-07 |
mastR: an R package for automated identification of tissue-specific gene signatures in multi-group differential expression analysis
2025-Mar-04, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf114
PMID:40098239
|
研究论文 | 开发了一个用于批量RNA-seq数据自动识别组织特异性基因标记的R软件包 | 首个专门为标记的批量RNA-seq数据设计的自动化标记识别方法，明确考虑背景表达并使用信噪比方法最小化背景信号 | 主要针对批量RNA-seq数据，对单细胞数据的适用性需要进一步验证 | 开发自动化基因标记识别工具，用于疾病生物标志物发现 | 转录组数据中的组织特异性基因标记 | 生物信息学 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | edgeR, limma, 基于秩积的置换检验 | 转录组数据 | NA | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 532 | 2025-10-07 |
Single-Cell Transcriptomics Identified Fibrosis-Activated Valve Interstitial Cells Involved in Functional Tricuspid Regurgitation
2025-Mar, JACC. Asia
DOI:10.1016/j.jacasi.2025.01.013
PMID:40148022
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序分析功能性三尖瓣反流患者的瓣膜细胞组成和基因表达变化 | 首次构建人类三尖瓣单细胞图谱，识别出纤维化激活的瓣膜间质细胞亚群及其在功能性三尖瓣反流中的作用 | 样本量较小（仅10例患者），需要更大规模研究验证发现 | 研究功能性三尖瓣反流的发病机制和潜在治疗靶点 | 人类三尖瓣组织 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，多重荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据，空间分布图像数据 | 10例患者（5例中度至重度功能性三尖瓣反流患者，5例非疾病对照） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 533 | 2025-10-07 |
MrgD as a Novel Modeling and Treatment Target for Pulmonary Hypertension
2025-Mar-27, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.322337
PMID:40143817
|
研究论文 | 本研究探讨了MrgD受体在肺动脉高压中的作用机制及治疗潜力 | 首次揭示MrgD在肺动脉高压中的保护作用及其通过PIM1/AKT/MAZ信号通路调控血管重塑的新机制 | 研究主要基于动物模型，临床转化价值需进一步验证 | 探究MrgD在肺动脉高压发病机制中的作用及治疗靶点价值 | 肺动脉高压动物模型（Sugen5416+缺氧、野百合碱诱导）、基因敲除小鼠、人肺动脉平滑肌细胞 | 分子病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞测序、RNA测序、基因敲除、分子生物学实验 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | 多种肺动脉高压动物模型及人肺动脉平滑肌细胞 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 534 | 2025-10-07 |
Phosphodiesterase 5 inactivation in vascular smooth muscle cells aggravates aortic aneurysm and dissection
2025-Mar-27, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6411
PMID:40145405
|
研究论文 | 本研究探讨血管平滑肌细胞中PDE5A失活对主动脉瘤和夹层的影响机制 | 首次揭示血管平滑肌细胞特异性PDE5A缺失通过cGMP/PKG信号通路加剧主动脉瘤和夹层的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 阐明血管平滑肌细胞中PDE5A在主动脉瘤和夹层发病机制中的具体作用 | 人类和小鼠主动脉组织、血管平滑肌细胞 | 病理生理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, western blotting, 免疫荧光, 免疫组织化学染色 | 基因敲除小鼠模型, 基因过表达小鼠模型 | 基因表达数据, 组织病理学图像, 蛋白质印迹数据 | 人类和小鼠主动脉组织样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 535 | 2025-10-07 |
EGFR-mediated local invasiveness and response to Cetuximab in head and neck cancer
2025-Mar-22, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02290-1
PMID:40121428
|
研究论文 | 本研究通过功能基因图谱分析揭示了头颈癌中EGFR介导的局部侵袭基因调控网络及其与西妥昔单抗疗效的关系 | 首次构建了头颈癌局部侵袭基因调控网络(invGRN)，发现INHBA和SNAI2作为核心枢纽，并证实SPHK1共抑制可增强西妥昔单抗的侵袭阻断效果 | 研究基于细胞3D模型和公共数据库，需要进一步临床验证 | 探索EGFR驱动头颈癌进展的分子网络机制，寻找联合治疗靶点和预测标志物 | 头颈鳞状细胞癌(HNSCC)细胞系、患者来源异种移植模型(PDX)和R/M-HNSCC患者 | 癌症生物学 | 头颈癌 | RNA测序(RNA-seq), 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 光转换示踪技术 | 3D细胞模型 | 基因表达数据 | 未明确具体样本数量，包含细胞模型、PDX模型和患者数据 | NA | RNA-seq, scRNA-seq | NA | NA |
| 536 | 2025-10-07 |
Sox9 and nuclear factor I transcription factors regulate the timing of neurogenesis and ependymal maturation in dopamine progenitors
2025-Mar-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204421
PMID:39995267
|
研究论文 | 本研究探讨Sox9和核因子I转录因子在中脑多巴胺神经元前体细胞周期停滞和室管膜细胞成熟过程中的调控作用 | 首次揭示Sox9和核因子I转录因子在调控中脑多巴胺神经元前体细胞向G0期退出和室管膜细胞成熟时序中的关键作用 | 研究主要聚焦于胚胎发育阶段，对成年后这些细胞的长期功能需要进一步验证 | 阐明中脑多巴胺神经元前体细胞发育过程中细胞周期退出和分化的分子调控机制 | 中脑多巴胺神经元前体细胞和室管膜细胞 | 发育神经生物学 | 神经系统发育疾病 | 单细胞RNA测序,组织学分析,条件性基因敲除 | NA | 基因表达数据,组织图像 | 不同胚胎发育阶段的中脑组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 537 | 2025-10-07 |
Inhibition of stromal MAOA leading activation of WNT5A enhance prostate cancer immunotherapy by involving the transition of cancer-associated fibroblasts
2025-Mar-22, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010555
PMID:40121032
|
研究论文 | 本研究揭示了基质细胞中MAOA通过WNT5A调控前列腺癌免疫微环境的新机制 | 首次发现抑制基质MAOA可通过WNT5A激活CD8+ T细胞，并与免疫检查点抑制剂产生协同抗肿瘤效应 | MAOA与肿瘤免疫微环境相互作用的详细机制尚未完全阐明 | 探究基质MAOA在前列腺癌免疫治疗中的作用机制 | 前列腺癌基质细胞、CD8+ T细胞、小鼠肿瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 前列腺癌 | 单细胞测序、体外共培养、小鼠移植瘤模型 | NA | 单细胞测序数据、体外实验数据、体内实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 538 | 2025-10-07 |
Mapping Gene Expression in Whole Larval Brains of Bicyclus anynana Butterflies
2025-Mar-13, Methods and protocols
IF:2.3Q3
DOI:10.3390/mps8020031
PMID:40126249
|
研究论文 | 本研究优化了HCR v3.0方案，实现了非洲蝴蝶幼虫全脑组织中十个基因表达域的单细胞分辨率空间定位 | 首次在蝴蝶幼虫全脑组织中应用HCR v3.0技术，实现了多基因表达的空间可视化 | 仅针对固定脑组织进行基因表达定位，未涉及动态行为过程中的实时变化 | 探索蝴蝶幼虫大脑在分子水平上的基因表达空间分布模式 | 非洲蝴蝶（Bicyclus anynana）幼虫的完整脑组织 | 空间转录组学 | NA | 杂交链式反应3.0（HCR v3.0） | NA | RNA分子空间表达图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 优化了聚丙烯酰胺凝胶包埋、固定和样品透化步骤的HCR v3.0方案 |
| 539 | 2025-10-07 |
Single-Cell Transcriptomic Approaches for Decoding Non-Coding RNA Mechanisms in Colorectal Cancer
2025-Mar-10, Non-coding RNA
IF:3.6Q2
DOI:10.3390/ncrna11020024
PMID:40126348
|
综述 | 本文综述了单细胞转录组学方法在结直肠癌非编码RNA研究中的应用与进展 | 聚焦单细胞水平揭示非编码RNA异质性，整合生物信息学方法与实验验证 | 作为综述文章，不包含原始实验数据验证 | 探讨单细胞生物信息学方法在结直肠癌非编码RNA研究中的应用 | 结直肠癌中的非编码RNA | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | scRNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 540 | 2025-10-07 |
Identifying gene expression and cellular pathways involved in glomerular AL-amyloidosis and correlation with experimental data: seeking novel therapeutic interventions
2025-Mar-04, Ultrastructural pathology
IF:1.1Q4
DOI:10.1080/01913123.2025.2468708
PMID:39985165
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析肾小球淀粉样变性中系膜细胞的基因表达和细胞通路变化 | 首次在人类肾小球中揭示淀粉样轻链与系膜细胞相互作用过程中的基因表达谱和激活的细胞通路 | 样本量较小（仅5例肾活检样本），需要更大规模研究验证 | 寻找肾小球AL-淀粉样变性的新型治疗干预靶点 | 肾小球淀粉样变性患者的肾活检组织中的系膜细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 5例不同阶段肾小球淀粉样变性活检样本与正常对照 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |