单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 714 篇文献，本页显示第 501 - 520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 501 | 2025-10-07 |
CD248-targeted BBIR-T cell therapy against late-activated fibroblasts in cardiac repair after myocardial infarction
2025-Mar-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56703-2
PMID:40148319
|
研究论文 | 开发靶向CD248的工程化T细胞疗法，特异性清除心肌梗死后晚期活化成纤维细胞以改善心脏修复 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定出心脏晚期活化成纤维细胞亚群F-Act及其特征抗原CD248，并开发了针对该靶点的工程化T细胞疗法 | NA | 治疗心肌梗死后心脏纤维化并改善心脏功能 | 小鼠心脏间质细胞及人类心脏组织 | 单细胞测序 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 工程化T细胞疗法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 502 | 2025-10-07 |
Molecular mechanisms and therapeutic targets in glioblastoma multiforme: network and single-cell analyses
2025-Mar-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-92867-z
PMID:40148380
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研究论文 | 通过整合网络分析和单细胞测序技术探索胶质母细胞瘤的分子机制及治疗靶点 | 结合加权基因共表达网络分析与单细胞RNA测序揭示细胞外基质和突触重塑在GBM中的关键作用 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要实验验证 | 探索胶质母细胞瘤肿瘤微环境的分子机制并识别新的治疗靶点 | 胶质母细胞瘤患者样本中的周细胞、内皮细胞和胶质瘤细胞 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 微阵列分析, Cox回归, LASSO分析 | 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的胶质瘤相关数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 微阵列 | NA | 使用Seurat软件包处理单细胞RNA测序数据 |
| 503 | 2025-10-07 |
scMalignantFinder distinguishes malignant cells in single-cell and spatial transcriptomics by leveraging cancer signatures
2025-Mar-27, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-07942-y
PMID:40148533
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研究论文 | 开发了一种名为scMalignantFinder的机器学习工具，用于在单细胞和空间转录组学中准确识别恶性细胞 | 采用数据和知识双驱动策略，通过整合九个泛癌基因特征来校准恶性细胞注释，能够捕捉肿瘤进展中的动态特征 | NA | 解决单细胞RNA测序中恶性细胞准确识别的挑战 | 肿瘤细胞和正常细胞 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 机器学习 | 单细胞转录组数据，空间转录组数据 | 超过400,000个单细胞转录组 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 504 | 2025-10-07 |
SCITUNA: single-cell data integration tool using network alignment
2025-Mar-27, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06087-3
PMID:40148808
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研究论文 | 开发了一种名为SCITUNA的单细胞数据整合工具，通过网络对齐方法有效校正批次效应 | 提出基于网络对齐的新型批次效应校正方法，在保留生物信号方面优于现有方法 | 在肺数据集的多批次整合中性能略低于现有方法（差异为0.004） | 开发单细胞数据整合工具以解决批次效应问题 | 单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 网络对齐 | 单细胞基因组数据 | 来自4个真实数据集和1个模拟数据集的39个独立批次 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 505 | 2025-10-07 |
Single-cell network biology enabling cell-type-resolved disease genetics
2025-Mar-27, Genomics & informatics
DOI:10.1186/s44342-025-00042-7
PMID:40148916
|
综述 | 介绍基于单细胞RNA测序数据构建细胞类型特异性基因网络的方法及其在疾病遗传学中的应用 | 提出单细胞网络生物学作为解析基因-细胞-疾病轴的关键方法，开发了基于参考和从头推断的基因功能互作网络 | NA | 建立细胞类型解析的疾病遗传学研究方法 | 单细胞RNA测序数据、基因功能互作网络、疾病遗传机制 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 基因网络模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 506 | 2025-10-07 |
Integrated single-cell and bulk transcriptomic analysis identifies a novel macrophage subtype associated with poor prognosis in breast cancer
2025-Mar-27, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03750-w
PMID:40148933
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量转录组分析识别出与乳腺癌不良预后相关的新型巨噬细胞亚型 | 发现了一个新型巨噬细胞亚型M_Macrophage-SPP1-C1Q，其特征是高表达SPP1和C1QA，代表具有独特增殖和致癌特性的中间分化状态 | 未明确说明样本量的具体数值和研究队列的局限性 | 全面表征乳腺癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性及其临床意义 | 乳腺癌患者的肿瘤相关巨噬细胞 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | 随机森林 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 507 | 2025-10-07 |
Loss of OBSCN expression promotes bladder cancer progression but enhances the efficacy of PD-L1 inhibitors
2025-Mar-27, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-025-01379-w
PMID:40149008
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研究论文 | 本研究探讨OBSCN基因表达缺失在膀胱癌进展中的作用及其对PD-L1抑制剂疗效的影响 | 首次报道OBSCN在膀胱癌中的功能，发现其表达缺失促进肿瘤进展但增强免疫检查点抑制剂疗效 | 研究主要基于公共数据库和体外实验，缺乏体内实验验证 | 探索膀胱癌免疫逃逸机制并寻找预测生物标志物 | 膀胱癌患者组织和细胞系 | 癌症生物学 | 膀胱癌 | RNA测序, 免疫组织化学, Western blot, 单细胞测序分析 | COX回归分析, Kaplan-Meier生存分析, 基因集富集分析 | 基因表达数据, 临床数据, 蛋白质表达数据 | 80例膀胱癌患者组织芯片 | NA | RNA测序, 单细胞测序 | NA | NA |
| 508 | 2025-10-07 |
IGF1 Signaling Regulates Neuropeptide Expression in Hypothalamic Neurons Under Physiological and Pathological Conditions
2025-Mar-24, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqaf051
PMID:40105689
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研究论文 | 本研究探讨IGF1信号在下丘脑神经元中对神经肽表达的调控作用及其在生理和病理条件下的变化机制 | 首次揭示高胰岛素血症通过PI3K-FOXO1信号通路过度激活诱导IGF1抵抗的新机制 | 研究主要基于小鼠和人类模型，需要进一步验证在更复杂生理环境中的作用 | 阐明IGF1信号在下丘脑神经元中的调控机制及其在代谢调节中的作用 | 下丘脑NPY/AgRP和POMC神经元 | 神经科学 | 代谢疾病 | RT-qPCR, single-cell RNA sequencing | NA | 基因表达数据 | 小鼠和人类模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 509 | 2025-10-07 |
Single-cell multiome and spatial profiling reveals pancreas cell type-specific gene regulatory programs driving type 1 diabetes progression
2025-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.13.637721
PMID:40027657
|
研究论文 | 通过单细胞多组学和空间转录组学分析揭示胰腺细胞类型特异性基因调控程序驱动1型糖尿病进展 | 首次结合单细胞多组学和空间转录组学技术，系统揭示1型糖尿病进展中胰腺细胞类型特异性调控程序 | 样本数量相对有限（最多32名供者），且为观察性研究 | 揭示1型糖尿病在胰腺中的细胞类型特异性调控机制 | 非糖尿病、自身抗体阳性和1型糖尿病患者的胰腺组织 | 单细胞组学 | 1型糖尿病 | 单细胞多组学，空间转录组学 | NA | 单细胞多组学数据，空间转录组数据 | 32名供者（包括非糖尿病、自身抗体阳性和1型糖尿病），853,005个细胞 | NA | 单细胞多组学，空间转录组学 | NA | NA |
| 510 | 2025-10-07 |
Current Applications of Single-Cell RNA Sequencing in Glioblastoma: A Scoping Review
2025-Mar-14, Brain sciences
IF:2.7Q3
DOI:10.3390/brainsci15030309
PMID:40149830
|
综述 | 本文通过范围综述方法探讨了单细胞RNA测序技术在胶质母细胞瘤中的临床应用 | 系统梳理了2009-2024年间scRNA-seq在GBM研究中的应用现状，重点关注该技术在解析肿瘤复杂性和治疗耐药性方面的潜力 | 仅纳入英文和西班牙语文献，可能存在语言偏倚；研究时间跨度较长，技术发展可能影响结果可比性 | 评估单细胞RNA测序技术在胶质母细胞瘤诊断、预后、治疗和癌症生物学理解中的应用价值 | 胶质母细胞瘤患者样本和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 24项研究（来自453篇文献筛选） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 511 | 2025-10-07 |
Multi-Omics Analysis of the Anoikis Gene CASP8 in Prostate Cancer and Biochemical Recurrence (BCR)
2025-Mar-07, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13030661
PMID:40149637
|
研究论文 | 通过多组学分析探讨anoikis基因CASP8在前列腺癌和生化复发中的作用机制 | 首次通过单细胞和空间转录组分析探索anoikis基因在前列腺癌中的表达模式，定义了新型T细胞类型，并构建了4基因预后模型 | NA | 研究CASP8基因在前列腺癌发生发展和生化复发中的作用机制 | 前列腺癌细胞和生化复发患者 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组测序,空间转录组测序,多组学分析,孟德尔随机化分析 | 预后预测模型 | 基因表达数据,临床数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 512 | 2025-10-07 |
Editorial for Brain Sciences Special Issue "Advances in Restorative Neurotherapeutic Technologies"
2025-Mar-05, Brain sciences
IF:2.7Q3
DOI:10.3390/brainsci15030273
PMID:40149794
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评论 | 本编辑文章介绍了《脑科学》特刊“神经修复治疗技术的进展”，概述了推动神经科学发展的技术革新 | 强调了从组织学技术到单细胞RNA测序等创新技术在神经修复治疗领域的应用进展 | NA | 探讨神经修复治疗技术的最新进展 | 神经科学领域的技术发展 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 513 | 2025-10-07 |
Ginsenoside Rb1 and berberine synergistically protect against type 2 diabetes mellitus via GDF15/HAMP pathway throughout the liver lobules: Insights from spatial transcriptomics analysis
2025-Mar-25, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2025.107711
PMID:40147680
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析揭示人参皂苷Rb1和黄连素通过GDF15/HAMP通路协同防治2型糖尿病的作用机制 | 首次发现Rb1和BBR联合治疗能全面调控整个肝小叶代谢，而二甲双胍仅改善门静脉周围区域功能 | 研究基于db/db小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证 | 探究人参皂苷Rb1和黄连素联合治疗对2型糖尿病的协同保护作用及分子机制 | 瘦素受体缺陷(db/db)糖尿病小鼠模型 | 空间转录组学 | 2型糖尿病 | 空间转录组学分析 | NA | 空间转录组数据 | db/db小鼠模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 514 | 2025-10-07 |
Interferon Regulatory Factor 1 Promotes Diabetic Vasculopathy by Mediating Endothelial Cell Pyroptosis
2025-Mar-12, Annals of vascular surgery
IF:1.4Q3
DOI:10.1016/j.avsg.2025.02.018
PMID:40086624
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研究论文 | 本研究揭示了干扰素调节因子1通过介导内皮细胞焦亡促进糖尿病血管病变的机制 | 首次发现IRF-1是内皮细胞焦亡的关键调控因子，并通过单细胞RNA测序技术鉴定了糖尿病血管病变中的EP1细胞亚群 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证 | 探索糖尿病血管病变的分子机制，特别关注内皮细胞焦亡的作用 | 糖尿病模型小鼠BKS-db/db和GSE169332数据集中的单细胞RNA测序数据 | 生物医学研究 | 糖尿病血管病变 | 单细胞RNA测序，免疫荧光，免疫组织化学，HE染色，Masson染色 | NA | 单细胞RNA测序数据，组织图像数据 | GSE169332数据集（包含非糖尿病动脉粥样硬化和糖尿病动脉粥样硬化两组），BKS-db/db糖尿病模型小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 515 | 2025-10-07 |
Cardiac Fibrosis in the Multi-Omics Era: Implications for Heart Failure
2025-Mar-28, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.325402
PMID:40146800
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综述 | 本文全面分析了多组学技术如何增进对心脏纤维化的理解及其对心力衰竭治疗的意义 | 整合基因组学、表观基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学数据，揭示心脏纤维化的新致病机制和潜在治疗靶点 | NA | 探讨多组学时代对心脏纤维化研究的进展及其对心力衰竭治疗的影响 | 心脏纤维化的分子机制和病理过程 | 多组学整合分析 | 心血管疾病 | 基因组学, 表观基因组学, 转录组学, 蛋白质组学, 代谢组学, 单细胞转录组学 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 多组学整合分析 | NA | NA |
| 516 | 2025-10-07 |
Unraveling anoikis in glioblastoma: insights from single-cell sequencing and prognostic modeling
2025-Mar-26, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03752-8
PMID:40140848
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和生物信息学分析揭示失巢凋亡在胶质母细胞瘤中的分子机制，并构建预后模型 | 首次在单细胞水平系统分析胶质母细胞瘤中失巢凋亡相关基因的异质性表达，并利用101种机器学习算法构建预后模型 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 探究失巢凋亡在胶质母细胞瘤进展和预后中的作用机制 | 胶质母细胞瘤患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞测序, bulk转录组测序, 生物信息学分析 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 来自TCGA、GEO和CGGA数据库的多队列样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 517 | 2025-10-07 |
Identification of CACNB1 protein as an actionable therapeutic target for hepatocellular carcinoma via metabolic dysfunction analysis in liver diseases: An integrated bioinformatics and machine learning approach for precise therapy
2025-Mar-25, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.142315
PMID:40139615
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研究论文 | 通过整合生物信息学和机器学习方法，识别CACNB1蛋白作为肝细胞癌的可操作治疗靶点 | 首次将代谢功能障碍分析与机器学习相结合，识别出HCC的精准治疗靶点CACNB1 | 研究依赖于公共数据库数据，需要实验验证 | 开发肝病代谢功能障碍的精准分型和治疗策略 | 非酒精性脂肪肝病和肝细胞癌患者 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析 | 高斯混合模型, 机器学习算法 | 基因表达数据 | 806个NAFLD样本和267个正常肝样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 518 | 2025-10-07 |
Identification of intratumoral microbiome-driven immune modulation and therapeutic implications in diffuse large B-cell lymphoma
2025-Mar-03, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-03972-x
PMID:40029433
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研究论文 | 本研究通过分析弥漫大B细胞淋巴瘤中的瘤内微生物组，识别了两种不同的微生物相关亚型，并评估了它们对预后、免疫浸润和治疗反应的影响 | 首次在弥漫大B细胞淋巴瘤中鉴定微生物组驱动亚型，揭示瘤内微生物组通过影响B细胞分化和免疫调节通路来调控肿瘤微环境 | 样本量相对较小（48例患者），主要依赖公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 探索瘤内微生物组在弥漫大B细胞淋巴瘤中的免疫调节作用及治疗意义 | 弥漫大B细胞淋巴瘤患者和细胞系 | 生物信息学 | 淋巴瘤 | 转录组测序，单细胞RNA测序，微生物组分析 | 共识聚类，功能富集分析，细胞间通讯分析 | 转录组数据，微生物组数据，单细胞RNA测序数据 | 48例DLBCL患者 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 519 | 2025-10-07 |
Targeting Mesothelin Enhances Personalized Neoantigen Vaccine Induced Antitumor Immune Response in Orthotopic Pancreatic Cancer Mouse Models
2025-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202407976
PMID:39887656
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研究论文 | 本研究证明靶向间皮素可增强个性化新抗原疫苗在胰腺癌小鼠模型中的抗肿瘤免疫反应 | 首次揭示间皮素表达与细胞毒性T细胞负相关，并证明抗MSLN抗体联合新抗原疫苗可显著改善肿瘤免疫微环境 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床应用效果仍需进一步验证 | 探索增强胰腺癌免疫治疗效果的新策略 | 胰腺癌小鼠模型和人类胰腺癌组织 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组分析,多重免疫荧光染色,组织芯片 | NA | 基因表达数据,免疫荧光图像,单细胞RNA测序数据 | 三个数据集和组织芯片的胰腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录omics | NA | NA |
| 520 | 2025-10-07 |
NGR-Modified CAF-Derived exos Targeting Tumor Vasculature to Induce Ferroptosis and Overcome Chemoresistance in Osteosarcoma
2025-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202410918
PMID:39889249
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研究论文 | 本研究开发了NGR修饰的CAF来源外泌体靶向肿瘤血管系统，通过诱导铁死亡逆转骨肉瘤化疗耐药 | 首次利用NGR修饰的CAF来源外泌体递送circ_0004872编码小肽，通过促进自噬依赖性铁死亡逆转骨肉瘤化疗耐药 | NA | 克服骨肉瘤化疗耐药性 | 骨肉瘤细胞 | NA | 骨肉瘤 | 单细胞转录组分析，高通量测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |