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当前共找到 726 篇文献，本页显示第 461 - 480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 461 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing uncovers a high ESM1-expression endothelial cell subpopulation associated with bladder cancer progression and the immunosuppressive microenvironment
2025-Mar-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-95731-2
PMID:40159545
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研究论文 | 通过单细胞测序发现膀胱癌中高表达ESM1的内皮细胞亚群与疾病进展和免疫抑制微环境相关 | 首次在膀胱癌中鉴定出高表达ESM1的内皮细胞亚群，揭示其与肿瘤进展和免疫抑制微环境的关联 | 样本量相对有限，需要更大规模研究验证 | 探究膀胱癌中肿瘤内皮细胞的异质性及其在疾病进展中的作用 | 膀胱癌组织中的CD45阴性单细胞 | 单细胞测序分析 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | 层次聚类分析，pySCENIC算法 | 单细胞转录组数据 | 7,519个CD45阴性单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 462 | 2025-10-07 |
SERPINA3 predicts long-term neurological outcomes and mortality in patients with intracerebral hemorrhage
2025-Mar-29, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07551-x
PMID:40157917
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析发现SERPINA3可作为脑出血患者长期神经功能预后和死亡率的预测生物标志物 | 首次在脑出血研究中结合空间转录组学、病理验证和临床队列分析，系统揭示SERPINA3的预后预测价值 | 需要更大规模的前瞻性队列验证，样本量相对有限 | 探索脑出血患者长期神经功能预后的可靠生物标志物 | 脑出血患者和健康对照人群 | 空间转录组学 | 脑出血 | 空间转录组学, 病理学研究, 血浆分析 | NA | 转录组数据, 病理图像, 临床数据 | 500人（250例脑出血患者和250例健康对照） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 463 | 2025-04-04 |
Determining composition and distribution of nicotinic acetylcholine receptors in mouse ventral tegmental area brain region with single-cell sequencing approach
2025-Mar-28, Nicotine & tobacco research : official journal of the Society for Research on Nicotine and Tobacco
IF:3.0Q2
DOI:10.1093/ntr/ntaf075
PMID:40177951
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序方法确定了小鼠腹侧被盖区（VTA）脑区中尼古丁乙酰胆碱受体（nAChRs）的组成和分布 | 首次在单细胞水平上揭示了VTA区nAChR亚基的组成和分布，并预测了不同神经元中nAChR亚基的潜在组合 | 研究仅基于小鼠模型，结果是否适用于人类尚需验证 | 探究尼古丁乙酰胆碱受体在腹侧被盖区单细胞水平的分布和组成 | C57BL/6小鼠的腹侧被盖区细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞核测序, scFEA, hdWGCNA | NA | 单细胞测序数据 | 6只小鼠的53,855个VTA细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 464 | 2025-10-07 |
Revealing a coherent cell state landscape across single cell datasets with CONCORD
2025-Mar-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.13.643146
PMID:40161827
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研究论文 | 提出CONCORD自监督对比学习框架，用于单细胞RNA测序数据的稳健降维和整合 | 采用概率性、数据集和邻域感知的采样策略，同时提高细胞状态分辨率和减少批次效应 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中细胞状态景观解析的挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 对比学习框架 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 465 | 2025-10-07 |
Deciphering shared molecular dysregulation across Parkinson's disease variants using a multi-modal network-based data integration and analysis
2025-Mar-31, NPJ Parkinson's disease
DOI:10.1038/s41531-025-00914-3
PMID:40164620
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研究论文 | 通过构建知识图谱整合多组学数据，探索不同帕金森病变异型之间的共同分子失调机制 | 首次将患者特异性中脑类器官的多模态数据与公共生物数据整合构建知识图谱，并在单细胞水平分析特发性帕金森病与单基因型帕金森病的共同转录组失调 | 研究样本量有限，仅包含特定基因突变类型，需要进一步验证 | 探索不同帕金森病变异型之间共享的分子失调机制 | 帕金森病患者特异性中脑类器官（含LRRK2-G2019S、SNCA三倍体、GBA-N370S、MIRO1-R272Q突变）及特发性帕金森病患者 | 系统生物医学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序，高通量成像，知识图谱构建 | 知识图谱，网络分析 | 图像数据，RNA测序数据，单细胞RNA测序数据 | 包含多种基因突变的帕金森病患者特异性中脑类器官及特发性帕金森病患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq，RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 466 | 2025-10-07 |
Identification of druggable targets in acute kidney injury by proteome- and transcriptome-wide Mendelian randomization and bioinformatics analysis
2025-Mar-27, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-025-00631-0
PMID:40148878
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研究论文 | 通过蛋白质组和转录组范围的孟德尔随机化及生物信息学分析识别急性肾损伤的可成药靶点 | 首次整合多组学孟德尔随机化方法系统识别急性肾损伤的潜在治疗靶点，并验证其因果关系的稳健性 | 研究主要基于遗传数据推断，需要后续实验验证靶点的生物学功能 | 识别急性肾损伤的潜在治疗靶点和药物重定位机会 | 急性肾损伤患者和正常组织的遗传及转录组数据 | 生物信息学 | 急性肾损伤 | 全基因组关联研究(GWAS), 孟德尔随机化(MR), 单细胞转录组测序, 批量转录组测序 | 孟德尔随机化模型 | 遗传数据, 蛋白质组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 467 | 2025-10-07 |
Transcriptomic and genetic analysis suggests a role for mitochondrial dysregulation in schizophrenia
2025-Mar-15, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.03.14.25323827
PMID:40162239
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研究论文 | 本研究通过整合遗传分析和单核RNA测序技术，揭示了精神分裂症中线粒体功能紊乱的细胞类型特异性分子机制 | 首次在单细胞分辨率上系统揭示了精神分裂症中不同神经元亚型、星形胶质细胞和少突胶质细胞中线粒体功能紊乱等分子通路的共同扰动 | 样本量相对有限（85例），仅分析了背侧前额叶皮层特定区域 | 探索精神分裂症的细胞类型特异性病因机制 | 43例精神分裂症患者和42例正常对照的死后脑组织样本 | 生物信息学 | 精神分裂症 | 单核RNA-seq，遗传分析，表达数量性状位点分析，转录组关联分析 | 共调控网络分析 | 单细胞转录组数据，遗传数据 | 536,618个细胞核，来自85例人脑样本 | NA | 单核RNA-seq | NA | NA |
| 468 | 2025-10-07 |
Myeloid-derived suppressor cell inhibits T-cell-based defense against Klebsiella pneumoniae infection via IDO1 production
2025-Mar, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1012979
PMID:40096073
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了高毒力肺炎克雷伯菌感染中髓源性抑制细胞通过IDO1酶抑制T细胞免疫应答的机制 | 首次发现hvKp感染通过诱导色氨酸代谢增强MDSCs的免疫抑制活性，并证实IDO1在抑制T细胞抗细菌免疫中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证；IDO1抑制剂在临床应用中的效果需进一步评估 | 探究高毒力肺炎克雷伯菌逃避宿主免疫防御的机制，为开发新的免疫治疗策略提供理论依据 | 高毒力肺炎克雷伯菌感染的小鼠模型及相关的免疫细胞 | 免疫学 | 细菌感染 | 单细胞RNA测序，基因敲除，体外抑制实验 | NA | 基因表达数据 | 小鼠感染模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 469 | 2025-10-07 |
Inhibition of ERK1/2 mediated activation of Drp1 alleviates intervertebral disc degeneration via suppressing pyroptosis and apoptosis in nucleus pulposus cells
2025-Mar, Journal of orthopaedic translation
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.jot.2025.01.013
PMID:40160807
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研究论文 | 本研究探讨了Drp1在椎间盘退变中的作用机制，并验证了Drp1抑制剂Mdivi-1通过抑制细胞焦亡和凋亡缓解退变的治疗效果 | 首次揭示ERK1/2通过调控Drp1磷酸化介导的线粒体分裂在椎间盘退变中的作用机制，并证实Mdivi-1的治疗潜力 | 研究主要基于大鼠模型和体外细胞实验，尚未进行临床验证 | 阐明Drp1在椎间盘退变中的分子机制并评估其抑制剂Mdivi-1的治疗效果 | 大鼠椎间盘退变模型和髓核细胞 | 分子生物学 | 椎间盘退变 | 单细胞测序分析、Western blot、流式细胞术、免疫荧光染色、X射线、MRI | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、影像数据 | 8周龄大鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 470 | 2025-10-07 |
Cell Function Graphics: TOGGLE delineates fate and function within individual cell types via single-cell transcriptomics
2025-Mar-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.01.631041
PMID:40060433
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研究论文 | 开发了TOGGLE方法和图扩散功能图谱，用于在单细胞水平识别同一细胞类型内的功能异质性和细胞命运轨迹 | 利用高分辨率分析方法揭示细胞水平的功能多样性，开发创新的图扩散功能图谱能显著降低噪音并捕捉高维数据中更细微的功能差异 | NA | 克服同一细胞类型内因基因表达相似性而难以区分功能状态和细胞命运轨迹的挑战 | 单细胞类型内的功能RNA和细胞命运 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组测序 | 图扩散功能图谱 | 单细胞RNA表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 471 | 2025-10-07 |
Different fibroblast subtypes propel spatially defined ileal inflammation through TNFR1 signalling in murine ileitis
2025-Mar-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57570-7
PMID:40155385
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示成纤维细胞亚型通过TNFR1信号通路在小鼠回肠炎中驱动空间特异性炎症的机制 | 首次发现不同成纤维细胞亚型在回肠炎不同解剖部位（固有层和粘膜下层）分别调控炎症起始和进展的空间分工机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类患者中验证 | 探究成纤维细胞亚型在克罗恩病样回肠炎发病机制中的空间特异性作用 | TNF过表达小鼠模型的回肠组织细胞 | 单细胞生物学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠回肠组织细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 472 | 2025-10-07 |
Defining gastric cancer ecology: the crucial roles of TREM2+ macrophages and fibroblasts in tumor microenvironments
2025-Mar-28, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-07512-2
PMID:40155473
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示胃癌微环境中TREM2+巨噬细胞与癌症相关成纤维细胞通过CXCL12-CXCR4信号轴的相互作用机制 | 首次阐明CAFs通过CXCL12-CXCR4信号轴增强TREM2脂质相关巨噬细胞免疫抑制功能的具体机制 | NA | 解析胃癌微环境中细胞间相互作用机制及其对肿瘤进展的影响 | 胃癌微环境中的TREM2脂质相关巨噬细胞和癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA分析, 体外实验 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 473 | 2025-10-07 |
Cytolytic γδ T-cells and IFNγ-producing CD4-lymphocytes characterise the early response to MTBVAC tuberculosis vaccine
2025-Mar-28, NPJ vaccines
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41541-025-01110-3
PMID:40155627
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析MTBVAC结核病候选疫苗的早期免疫反应特征 | 首次发现MTBVAC疫苗能特异性激活具有细胞毒性的γδ T细胞和产生IFNγ的CD4淋巴细胞，这些细胞表型与结核感染控制者中的效应细胞相似 | 研究仅关注早期免疫反应，未评估长期保护效果；体外实验可能无法完全反映体内免疫应答 | 评估MTBVAC结核病候选疫苗的早期免疫应答特征 | MTBVAC疫苗激发的免疫细胞反应 | 免疫学 | 结核病 | scRNA-seq, 流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 474 | 2025-10-07 |
DNA methylation memory of pancreatic acinar-ductal metaplasia transition state altering Kras-downstream PI3K and Rho GTPase signaling in the absence of Kras mutation
2025-Mar-28, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-025-01452-6
PMID:40156071
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研究论文 | 本研究探讨了胰腺腺泡-导管化生(ADM)过渡状态中DNA甲基化记忆的形成及其在KRAS下游信号通路中的作用 | 首次发现在无致癌突变情况下，ADM过渡状态会形成持久的DNA甲基化记忆，影响PI3K和Rho GTPase信号通路 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探究ADM过渡状态中表观遗传记忆的获得和保留机制 | 转基因小鼠KLF4诱导的ADM模型和人类胰腺上皮内瘤变(PanIN)样本 | 表观遗传学 | 胰腺癌 | DNA甲基化组测序，转录组测序，单细胞空间转录组学 | NA | DNA甲基化数据，基因表达数据 | 转基因小鼠模型和人类PanIN样本 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 475 | 2025-10-07 |
TNFR1-mediated senescence and lack of TNFR2-signaling limit human intervertebral disc cell repair potential in degenerative conditions
2025-Mar-24, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2025.02.791
PMID:40139648
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研究论文 | 本研究探讨了TNFR1介导的衰老和TNFR2信号缺失如何限制人椎间盘细胞在退变条件下的修复潜力 | 首次通过单细胞RNA测序揭示椎间盘退变中TNFR1和TNFR2的表达模式，并证明TNFR1主导的代谢损伤和衰老反应 | TNFR2在天然椎间盘细胞膜上表达有限，其调节对细胞无影响，可能限制了治疗策略的开发 | 识别疼痛性椎间盘退变进展的机制和治疗靶点，重点关注促炎性TNFR1和促修复性TNFR2信号 | 椎间盘退变患者和尸检对象的椎间盘组织和细胞，特别是人纤维环细胞 | 单细胞生物学 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序, 多重蛋白阵列, 批量RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据, 基因表达数据 | 椎间盘退变和尸检对象的组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 476 | 2025-10-07 |
Spatial Transcriptomics Identifies Immune-Stromal Niches Associated with Cancer in Adult Dermatomyositis
2025-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.19.644147
PMID:40166232
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研究论文 | 通过空间转录组学和单细胞转录组学分析，揭示了成人皮肌炎中与癌症相关的独特免疫-基质微环境特征 | 首次提供了成人皮肌炎中免疫和基质细胞的空间定位图谱，发现了与癌症相关和无关的DM皮肤病变中不同的免疫细胞浸润模式 | NA | 研究成人皮肌炎中免疫-基质微环境特征及其与癌症的关联 | 成人皮肌炎患者皮肤组织 | 数字病理学 | 皮肌炎 | 空间转录组学,单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 477 | 2025-10-07 |
A tissue-scale strategy for sensing threats in barrier organs
2025-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.19.644134
PMID:40166266
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研究论文 | 本研究通过分析流感感染肺部，揭示了屏障器官采用空间分层策略来感知威胁并调整免疫反应 | 发现屏障器官采用组织尺度的分层威胁感知策略，通过空间梯度模式识别受体表达实现细胞类型特异性威胁检测概率 | 研究主要聚焦于肺部流感感染模型，可能不适用于所有屏障器官或感染类型 | 探索屏障器官如何评估威胁并平衡宿主保护与组织损伤 | 流感感染的小鼠肺部组织 | 空间转录组学 | 流感感染 | 单分子成像, 空间转录组学 | NA | 图像, 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 478 | 2025-10-07 |
Single-cell multiomics reveals disrupted glial gene regulatory programs in Alzheimer's disease via interpretable machine learning
2025-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.14.643349
PMID:40166228
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研究论文 | 通过可解释机器学习分析单细胞多组学数据，揭示阿尔茨海默病中胶质细胞基因调控程序的紊乱 | 开发了多组学整合分析流程，首次在细胞亚群分辨率上系统揭示AD中胶质细胞特异性调控程序紊乱，发现SLC家族基因在多种胶质细胞类型中的深度参与 | 样本量相对有限（26个人脑样本），研究聚焦于胶质细胞而未全面涵盖所有脑细胞类型 | 研究阿尔茨海默病的细胞和分子机制，特别关注胶质细胞的基因调控程序 | 人类脑组织样本中的胶质细胞亚群 | 生物信息学, 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 多组学整合分析 | 可解释机器学习 | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 26个人脑样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 479 | 2025-10-07 |
Integrative single-cell and spatial transcriptome analysis reveals heterogeneity of human liver progenitor cells
2025-Mar-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000662
PMID:40008906
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研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组分析揭示人类肝脏祖细胞的异质性 | 首次在人类肝脏中系统揭示LPC的异质性，发现3个LPC亚群和4个细胞模块，并比较了与小鼠的标记表达差异 | LPC在合并上皮细胞中占比较低(2.95±1.91%)，未来需要更多关注空间基因表达动态 | 研究人类肝脏祖细胞的异质性和功能状态 | 人类肝脏祖细胞(LPCs) | 空间转录组学 | 肝病 | 单细胞测序, 空间转录组测序 | 细胞模块分析, 分化轨迹分析, 基因共表达网络分析 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 259,400个单细胞，涵盖胎儿、健康、肝硬化和肝癌4种肝脏状态 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 480 | 2025-10-07 |
Polygenic enrichment analysis in multi-omics levels identifies cell/tissue specific associations with schizophrenia based on single-cell RNA sequencing data
2025-Mar, Schizophrenia research
IF:3.6Q1
DOI:10.1016/j.schres.2025.02.008
PMID:40036903
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研究论文 | 本研究通过单细胞疾病相关评分算法，在多组学水平上识别了精神分裂症的细胞/组织特异性关联 | 首次在多组学尺度上应用单细胞疾病相关评分算法，识别出精神分裂症相关的特定脑细胞亚群和组织异质性 | 样本量相对较小（SCUBE3阳性细胞59个，FN1阳性细胞21个），部分关联仅为提示性水平 | 探索精神分裂症的细胞起源和组织异质性，为疾病病因学研究提供新见解 | 人脑单细胞RNA测序数据及多组学面板（ATAC-seq、RNA-seq、TWAS、GWAS） | 生物信息学 | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序，多组学整合分析，scDRS算法 | scDRS（单细胞疾病相关评分算法） | 单细胞RNA测序数据，多组学数据 | 鉴定出SCUBE3阳性细胞59个（7.0%），FN1阳性细胞21个（2.5%） | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, RNA-seq | NA | NA |