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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2025-10-07 |
Disulfiram ameliorates bone loss in ovariectomized mice by suppressing osteoclastogenesis
2025-Mar, Journal of bone and mineral metabolism
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s00774-024-01555-x
PMID:39373772
|
研究论文 | 本研究探讨了双硫仑在卵巢切除小鼠模型中改善骨质疏松的作用机制 | 首次在体内证实双硫仑通过抑制破骨细胞生成早期阶段的Tnfrsf11a表达来改善骨丢失 | 研究仅使用小鼠模型,未涉及人类临床试验 | 研究双硫仑在骨质疏松小鼠模型中对破骨细胞生成的影响 | 卵巢切除小鼠模型和原代破骨细胞培养 | 骨代谢研究 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,微计算机断层扫描,骨形态计量分析 | NA | 基因表达数据,影像数据,细胞计数数据 | 卵巢切除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 442 | 2025-10-07 |
Single-Cell Profiling of Tubular Epithelial Cells in Adaptive State in the Urine Sediment of Patients With Early and Advanced Diabetic Kidney Disease
2025-Mar, Kidney international reports
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.ekir.2024.11.002
PMID:40225386
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析糖尿病肾病患者尿沉渣中的适应性状态肾小管上皮细胞 | 首次在糖尿病肾病患者尿液中鉴定出适应性状态肾小管上皮细胞,并发现其不同状态比例具有诊断价值 | 样本量有限,仅针对糖尿病肾病患者进行研究 | 探究糖尿病肾病患者尿液中适应性状态肾小管上皮细胞的存在及其临床意义 | 糖尿病肾病患者的尿液样本 | 单细胞组学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 空间单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 轨迹推断分析 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 443 | 2025-10-07 |
Unraveling tumoral heterogeneity and angiogenesis-associated mechanisms of PD-1 and LAG-3 dual inhibition in lung cancers by single-cell RNA sequencing
2025-Mar, Chinese medical journal pulmonary and critical care medicine
DOI:10.1016/j.pccm.2025.02.004
PMID:40226601
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示PD-1和LAG-3双重抑制在肺癌中的抗肿瘤机制 | 首次在肺鳞癌PDX模型中证实PD-1和LAG-3双重抑制的协同抗肿瘤效果,并发现其与肿瘤异质性评分低、MHC I类通路上调和肿瘤血管正常化相关 | 研究仅使用PDX模型,未涉及人体临床试验;对腺癌和小细胞肺癌模型无效 | 阐明PD-1和LAG-3双重抑制在肺癌中的协同抗肿瘤机制 | 肺癌患者来源异种移植模型 | 单细胞测序分析 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 轨迹分析、差异表达基因分析 | 单细胞转录组数据 | 8127个细胞(2699个基底细胞、4109个恶性细胞、1319个上皮细胞) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 444 | 2025-10-07 |
Genome-wide association meta-analysis identifies 126 novel loci for diverticular disease and implicates connective tissue and colonic motility
2025-Mar-28, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.03.27.25324777
PMID:40196262
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研究论文 | 本研究通过全基因组关联分析荟萃分析发现了126个新的憩室病相关基因位点,并揭示了该疾病与结缔组织和结肠运动功能的关联 | 发现了126个新的憩室病相关基因位点,首次通过多种分析策略系统性地将憩室病与结缔组织生物学和结肠运动功能联系起来 | NA | 识别憩室病的遗传风险因素并阐明其生物学机制 | 憩室病患者群体 | 基因组学 | 憩室病 | 全基因组关联分析, 单细胞RNA测序, 组织富集分析, 统计精细定位, 等位基因特异性表达, 蛋白数量性状位点分析 | NA | 基因组数据, 单细胞RNA测序数据, 手术标本数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 全基因组关联分析 | NA | NA |
| 445 | 2025-10-07 |
Multi-Manifolds fusing hyperbolic graph network balanced by pareto optimization for identifying spatial domains of spatial transcriptomics
2025-Mar-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf162
PMID:40220278
|
研究论文 | 提出一种融合双曲图网络的多流形方法,通过帕累托优化平衡,用于识别空间转录组学中的空间域 | 首次在空间转录组学分析中引入双曲流形,开发多流形编码器和基于注意力机制的融合方法,使用帕累托优化平衡多重重建损失 | 未在摘要中明确说明 | 识别空间转录组学中的空间域,以深入了解基因表达的发病机制 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 图神经网络,双曲神经网络,注意力机制,帕累托优化 | 双曲图网络,多流形编码器 | 空间转录组数据 | 常用基准数据集(未指定具体数量) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 446 | 2025-10-07 |
Role of TGF-β/SMAD/YAP/TAZ signaling in skeletal muscle fibrosis
2025-Mar-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00541.2024
PMID:39925133
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研究论文 | 本研究揭示了TGF-β通过SMAD/YAP/TAZ信号通路调控骨骼肌纤维化的分子机制 | 首次阐明TGF-β通过机械敏感性转录调节因子YAP/TAZ决定FAPs向肌成纤维细胞分化的新机制 | 对FAPs分化的核因子调控机制研究尚处于早期阶段 | 探究TGF-β/SMAD/YAP/TAZ信号通路在骨骼肌纤维化中的作用机制 | 骨骼肌纤维化、纤维/脂肪生成祖细胞(FAPs)、肌成纤维细胞 | 分子生物学 | 肌肉萎缩症 | 空间转录组学分析、原代细胞培养 | NA | 基因表达数据、蛋白质活性数据 | 小鼠模型和原代FAPs细胞 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 447 | 2025-10-07 |
scMEDAL for the interpretable analysis of single-cell transcriptomics data with batch effect visualization using a deep mixed effects autoencoder
2025-Mar-19, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6081478/v1
PMID:40166015
|
研究论文 | 提出scMEDAL框架,使用深度混合效应自编码器分析单细胞转录组数据并可视化批次效应 | 通过两个互补的自编码器网络分别建模批次不变和批次特异性效应,支持回顾性分析并能在细胞水平预测不同批次下的基因表达 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中技术和生物批次效应的混淆问题 | 单细胞转录组数据 | 单细胞分析 | 自闭症,白血病,心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 深度混合效应自编码器,对抗学习,贝叶斯自编码器 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 448 | 2025-10-07 |
Inhibition of astrocyte signaling leads to sex-specific changes in microglia phenotypes in a diet-based model of small cerebral vessel disease
2025-Mar-17, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6198453/v1
PMID:40166012
|
研究论文 | 本研究通过饮食诱导的高同型半胱氨酸血症模型,探讨星形胶质细胞信号对小鼠小胶质细胞表型的性别特异性影响 | 首次揭示星形胶质细胞信号通过CN/NFAT通路对小胶质细胞表型调控存在性别二态性 | 研究仅使用C57BL/6J小鼠品系,样本量相对有限 | 探究星形胶质细胞信号在小脑血管疾病模型中对小胶质细胞表型的调控机制 | 7-8周龄雄性和雌性C57BL/6J小鼠 | 神经科学 | 小脑血管疾病 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,腺相关病毒介导的基因表达 | NA | 基因表达数据,免疫染色图像 | 雄性和雌性C57BL/6J小鼠,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 449 | 2025-10-07 |
Prognostic and Immunotherapeutic Value of Regulatory T Cell Marker Gene Signature in Melanoma
2025-Mar-10, Iranian journal of allergy, asthma, and immunology
DOI:10.18502/ijaai.v24i2.18150
PMID:40211502
|
研究论文 | 本研究通过分析黑色素瘤中调节性T细胞相关基因特征,开发了一个预后模型并评估其在免疫治疗中的价值 | 首次构建了包含CHD3、FOSB、SEMA4D、PSME1、FYN、PRKACB和ARID5A的Treg相关基因特征(TRGS),并证明其作为独立预后指标的价值 | 研究依赖于公共数据库数据,缺乏前瞻性临床验证 | 阐明调节性T细胞相关基因在黑色素瘤抗肿瘤免疫反应中的作用 | 黑色素瘤患者样本和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、加权基因共表达网络分析(WGCNA)、Cox回归分析、LASSO回归 | 预后风险评分模型 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 从GEO和TCGA数据库获取的黑色素瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 450 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics of melanoma sentinel lymph nodes identifies immune cell signatures associated with metastasis
2025-Mar-06, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.183080
PMID:40048259
|
研究论文 | 通过单细胞转录组技术分析黑色素瘤前哨淋巴结中的免疫细胞特征及其与转移的关系 | 首次使用单细胞转录组测序技术系统描绘黑色素瘤前哨淋巴结中T细胞、B细胞和髓系细胞亚型的转录程序,并发现基于细胞类型比例的“高活化”特征评分可预测免疫治疗反应 | 研究样本量相对有限(97,777个细胞),且为观察性研究,需要进一步功能验证 | 解析黑色素瘤前哨淋巴结中免疫浸润的动态变化及其临床意义 | 黑色素瘤患者的前哨淋巴结组织细胞 | 单细胞组学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组测序,细胞索引转录组和表位测序技术 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 97,777个细胞,来自I/II期和III期皮肤黑色素瘤患者的前哨淋巴结组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 细胞索引转录组和表位测序技术 |
| 451 | 2025-10-07 |
Mechanosensitive ion channel-related genes in hepatocellular carcinoma: Unraveling prognostic genes and their roles in drug resistance and immune modulation
2025-Mar, Liver research (Beijing, China)
DOI:10.1016/j.livres.2025.01.002
PMID:40206431
|
研究论文 | 本研究探讨机械敏感性离子通道相关基因在肝细胞癌中的预后价值及其在耐药性和免疫调节中的作用 | 首次系统分析机械敏感性离子通道相关基因在肝细胞癌中的表达特征,发现PIEZO1基因与索拉非尼耐药性相关 | 需要在更大患者队列中验证研究结果,并进一步在临床前模型中探索靶向PIEZO1的功能意义 | 研究机械敏感性离子通道相关基因在肝细胞癌中的预后价值及其在免疫调节和耐药性中的作用 | 肝细胞癌患者数据及肝癌细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 深度学习神经网络分析, 基因敲低实验, 细胞活力检测, 细胞凋亡检测 | 深度学习神经网络 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 癌症基因组图谱数据库中的肝细胞癌患者数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 452 | 2025-10-07 |
Propionate alleviates diabetes-induced cardiac fibrosis in mice via regulating Serpinf1
2025-Mar-25, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151641
PMID:40203653
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研究论文 | 本研究探讨丙酸盐通过调控Serpinf1基因改善糖尿病小鼠心脏纤维化的治疗效果及机制 | 首次发现丙酸盐通过上调Serpinf1基因抑制Wnt信号通路异常激活,从而改善糖尿病心脏纤维化 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类临床验证 | 研究丙酸盐对糖尿病心脏纤维化的治疗作用及分子机制 | 链脲佐菌素诱导的糖尿病小鼠模型和原代小鼠心脏成纤维细胞 | 心血管疾病研究 | 糖尿病心肌病 | 单细胞RNA测序,shRNA敲低实验,组织学分析,生化检测 | 动物疾病模型 | 基因表达数据,组织学图像,生化指标 | 糖尿病小鼠模型及原代细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 453 | 2025-10-07 |
Epigenomic subtypes of late-onset Alzheimer's disease reveal distinct microglial signatures
2025-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.15.643144
PMID:40166175
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研究论文 | 通过分析死后脑组织DNA甲基化数据识别晚发性阿尔茨海默病的两种表观基因组亚型 | 首次在全基因组尺度识别晚发性阿尔茨海默病的表观遗传亚型,并揭示其与特定小胶质细胞状态的关联 | 研究基于死后脑组织样本,无法反映疾病早期阶段的表观遗传变化 | 探索晚发性阿尔茨海默病的表观遗传异质性及其分子机制 | 831例死后脑组织样本(来自三个独立队列) | 表观基因组学 | 阿尔茨海默病 | DNA甲基化分析,单细胞RNA测序,批量RNA测序 | 无监督聚类 | 表观基因组数据,转录组数据 | 831例死后脑组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq,DNA甲基化分析 | NA | NA |
| 454 | 2025-10-07 |
Astrocyte heterogeneity reveals region-specific astrogenesis in the white matter
2025-Mar, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-025-01878-6
PMID:39994409
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学比较灰质和白质星形胶质细胞的异质性 | 揭示了白质星形胶质细胞具有区域特异性的分子特征,发现胼胝体白质中存在持续的星形胶质细胞生成 | 研究仅针对小鼠前脑和小脑,人类样本验证有限 | 探究白质和灰质星形胶质细胞的分子差异及区域特异性 | 小鼠前脑灰质、白质/胼胝体和小脑白质区域的星形胶质细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 小鼠前脑和小脑星形胶质细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 455 | 2025-10-07 |
A Krüppel-like factor establishes cellular heterogeneity during schistosome tegumental maintenance
2025-Mar, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013002
PMID:40153400
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和RNA干扰技术揭示了KLF4转录因子在血吸虫皮层细胞异质性建立中的关键作用 | 首次发现KLF4转录因子对血吸虫皮层相关谱系(TRL)的维持至关重要,并证明其调控皮层细胞亚群的分子身份 | 研究仅聚焦于KLF4因子,其他可能参与皮层细胞特化的分子程序尚未完全阐明 | 探究血吸虫皮层细胞特化的分子调控机制 | 曼氏血吸虫及其皮层细胞 | 分子生物学 | 血吸虫病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, RNA干扰 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 456 | 2025-10-07 |
Modulation of cell fate by shock wave therapy in ischaemic heart disease
2025-Mar, European heart journal open
DOI:10.1093/ehjopen/oeaf011
PMID:40201592
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研究论文 | 研究冲击波疗法通过激活TLR3受体促进心脏成纤维细胞向内皮细胞转分化,改善缺血性心肌病的心功能 | 首次揭示冲击波疗法通过机械刺激激活TLR3信号通路,诱导染色质重塑和成纤维细胞转分化为内皮细胞的机制 | 研究主要基于细胞和小鼠模型,尚未在大型动物或临床人群中验证 | 探索冲击波疗法改善缺血性心肌病心功能的分子机制 | 人心脏成纤维细胞和Fsp1-Cre/LacZ转基因小鼠模型 | 心血管疾病研究 | 缺血性心脏病 | 单细胞RNA测序,ATAC-seq,Western blot,谱系追踪 | NA | 基因表达数据,染色质可及性数据,蛋白质数据 | 人心脏成纤维细胞和转基因小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,ATAC-seq | NA | NA |
| 457 | 2025-10-07 |
In Situ Graphene-Seq: Spatial Transcriptomics and Chronic Electrophysiological Characterization of Tissue Microenvironments
2025-Mar-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.25.645278
PMID:40196689
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研究论文 | 开发了一种集成慢性电生理记录和空间分辨3D转录组学的原位石墨烯测序平台 | 首次将可拉伸网状纳米电子学与透明石墨烯电极结合,实现长期单细胞水平的多模态分析 | NA | 研究细胞功能与分子身份之间的复杂相互作用 | 人诱导多能干细胞衍生的心肌细胞和内皮细胞共培养体系 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 原位测序, 电生理记录, 光学成像 | NA | 电生理信号, 基因表达数据, 空间图像 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞电生理记录, 3D成像 | 原位石墨烯测序平台 | 集成可拉伸网状纳米电子学和透明石墨烯/PEDOT:PSS电极的多模态分析系统 |
| 458 | 2025-10-07 |
Lignature: A Comprehensive Database of Ligand Signatures to Predict Cell-Cell Communication
2025-Mar-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.22.644770
PMID:40196598
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研究论文 | 开发了一个名为Lignature的配体特征数据库,用于预测细胞间通讯 | 构建了包含362种人类配体的细胞内转录组特征数据库,显著扩展了可用配体响应特征库,在基因和通路水平上优于现有方法 | NA | 预测配体-受体相互作用和细胞间通讯 | 人类配体及其诱导的转录组特征 | 生物信息学 | NA | 转录组分析,单细胞测序 | NA | 转录组数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 459 | 2025-10-07 |
Thor: a platform for cell-level investigation of spatial transcriptomics and histology
2025-Mar-10, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4909620/v1
PMID:40162205
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研究论文 | 介绍Thor平台,一个用于空间转录组学和组织学图像多模态分析的计算平台 | 开发了抗收缩马尔可夫扩散方法从spot级数据推断单细胞空间转录组,实现细胞形态与空间转录组学的有效整合 | NA | 解决基因组分析与图像分析之间的整合空白,提供全面的细胞和分子分析工具 | 空间转录组学数据和组织学图像 | 空间转录组学 | 心力衰竭、乳腺癌、膀胱癌 | 空间转录组学、免疫荧光染色、ISH、MERFISH、Xenium、Stereo-seq | 抗收缩马尔可夫扩散方法 | 空间转录组数据、组织图像 | 内部心力衰竭患者样本、小鼠嗅球样本、乳腺癌样本、膀胱癌样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium HD | 10x Visium HD空间转录组测序平台 |
| 460 | 2025-10-07 |
Lineage Tracing Reveals Clone-Specific Responses to Doxorubicin in Triple-Negative Breast Cancer
2025-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.18.643980
PMID:40166195
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研究论文 | 使用谱系追踪系统研究三阴性乳腺癌对阿霉素治疗的克隆特异性反应 | 开发结合遗传克隆标识与单细胞RNA测序的谱系追踪系统ClonMapper,揭示治疗反应与克隆身份无关的 divergent phenotypes | 研究基于单一TNBC模型,未验证其他癌症类型或治疗药物 | 阐明三阴性乳腺癌对阿霉素治疗的克隆特异性反应机制 | 三阴性乳腺癌模型中的肿瘤克隆 | 单细胞生物学 | 三阴性乳腺癌 | 谱系追踪,单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |