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当前共找到 726 篇文献,本页显示第 441 - 460 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
441 2025-10-07
Prognostic and Immunotherapeutic Value of Regulatory T Cell Marker Gene Signature in Melanoma
2025-Mar-10, Iranian journal of allergy, asthma, and immunology
研究论文 本研究通过分析黑色素瘤中调节性T细胞相关基因特征,开发了一个预后模型并评估其在免疫治疗中的价值 首次构建了包含CHD3、FOSB、SEMA4D、PSME1、FYN、PRKACB和ARID5A的Treg相关基因特征(TRGS),并证明其作为独立预后指标的价值 研究依赖于公共数据库数据,缺乏前瞻性临床验证 阐明调节性T细胞相关基因在黑色素瘤抗肿瘤免疫反应中的作用 黑色素瘤患者样本和单细胞RNA测序数据 生物信息学 黑色素瘤 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、加权基因共表达网络分析(WGCNA)、Cox回归分析、LASSO回归 预后风险评分模型 转录组数据、单细胞RNA测序数据 从GEO和TCGA数据库获取的黑色素瘤样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
442 2025-10-07
Single-cell transcriptomics of melanoma sentinel lymph nodes identifies immune cell signatures associated with metastasis
2025-Mar-06, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 通过单细胞转录组技术分析黑色素瘤前哨淋巴结中的免疫细胞特征及其与转移的关系 首次使用单细胞转录组测序技术系统描绘黑色素瘤前哨淋巴结中T细胞、B细胞和髓系细胞亚型的转录程序,并发现基于细胞类型比例的“高活化”特征评分可预测免疫治疗反应 研究样本量相对有限(97,777个细胞),且为观察性研究,需要进一步功能验证 解析黑色素瘤前哨淋巴结中免疫浸润的动态变化及其临床意义 黑色素瘤患者的前哨淋巴结组织细胞 单细胞组学 黑色素瘤 单细胞转录组测序,细胞索引转录组和表位测序技术 NA 单细胞RNA测序数据 97,777个细胞,来自I/II期和III期皮肤黑色素瘤患者的前哨淋巴结组织 NA 单细胞RNA-seq NA 细胞索引转录组和表位测序技术
443 2025-10-07
Mechanosensitive ion channel-related genes in hepatocellular carcinoma: Unraveling prognostic genes and their roles in drug resistance and immune modulation
2025-Mar, Liver research (Beijing, China)
研究论文 本研究探讨机械敏感性离子通道相关基因在肝细胞癌中的预后价值及其在耐药性和免疫调节中的作用 首次系统分析机械敏感性离子通道相关基因在肝细胞癌中的表达特征,发现PIEZO1基因与索拉非尼耐药性相关 需要在更大患者队列中验证研究结果,并进一步在临床前模型中探索靶向PIEZO1的功能意义 研究机械敏感性离子通道相关基因在肝细胞癌中的预后价值及其在免疫调节和耐药性中的作用 肝细胞癌患者数据及肝癌细胞系 生物信息学 肝细胞癌 单细胞RNA测序, 深度学习神经网络分析, 基因敲低实验, 细胞活力检测, 细胞凋亡检测 深度学习神经网络 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 癌症基因组图谱数据库中的肝细胞癌患者数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
444 2025-10-07
Propionate alleviates diabetes-induced cardiac fibrosis in mice via regulating Serpinf1
2025-Mar-25, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 本研究探讨丙酸盐通过调控Serpinf1基因改善糖尿病小鼠心脏纤维化的治疗效果及机制 首次发现丙酸盐通过上调Serpinf1基因抑制Wnt信号通路异常激活,从而改善糖尿病心脏纤维化 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类临床验证 研究丙酸盐对糖尿病心脏纤维化的治疗作用及分子机制 链脲佐菌素诱导的糖尿病小鼠模型和原代小鼠心脏成纤维细胞 心血管疾病研究 糖尿病心肌病 单细胞RNA测序,shRNA敲低实验,组织学分析,生化检测 动物疾病模型 基因表达数据,组织学图像,生化指标 糖尿病小鼠模型及原代细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
445 2025-10-07
Epigenomic subtypes of late-onset Alzheimer's disease reveal distinct microglial signatures
2025-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过分析死后脑组织DNA甲基化数据识别晚发性阿尔茨海默病的两种表观基因组亚型 首次在全基因组尺度识别晚发性阿尔茨海默病的表观遗传亚型,并揭示其与特定小胶质细胞状态的关联 研究基于死后脑组织样本,无法反映疾病早期阶段的表观遗传变化 探索晚发性阿尔茨海默病的表观遗传异质性及其分子机制 831例死后脑组织样本(来自三个独立队列) 表观基因组学 阿尔茨海默病 DNA甲基化分析,单细胞RNA测序,批量RNA测序 无监督聚类 表观基因组数据,转录组数据 831例死后脑组织样本 NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq,DNA甲基化分析 NA NA
446 2025-10-07
Astrocyte heterogeneity reveals region-specific astrogenesis in the white matter
2025-Mar, Nature neuroscience IF:21.2Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序和空间转录组学比较灰质和白质星形胶质细胞的异质性 揭示了白质星形胶质细胞具有区域特异性的分子特征,发现胼胝体白质中存在持续的星形胶质细胞生成 研究仅针对小鼠前脑和小脑,人类样本验证有限 探究白质和灰质星形胶质细胞的分子差异及区域特异性 小鼠前脑灰质、白质/胼胝体和小脑白质区域的星形胶质细胞 单细胞生物学 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 基因表达数据, 空间定位数据 小鼠前脑和小脑星形胶质细胞 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
447 2025-10-07
A Krüppel-like factor establishes cellular heterogeneity during schistosome tegumental maintenance
2025-Mar, PLoS pathogens IF:5.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和RNA干扰技术揭示了KLF4转录因子在血吸虫皮层细胞异质性建立中的关键作用 首次发现KLF4转录因子对血吸虫皮层相关谱系(TRL)的维持至关重要,并证明其调控皮层细胞亚群的分子身份 研究仅聚焦于KLF4因子,其他可能参与皮层细胞特化的分子程序尚未完全阐明 探究血吸虫皮层细胞特化的分子调控机制 曼氏血吸虫及其皮层细胞 分子生物学 血吸虫病 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, RNA干扰 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
448 2025-10-07
Modulation of cell fate by shock wave therapy in ischaemic heart disease
2025-Mar, European heart journal open
研究论文 研究冲击波疗法通过激活TLR3受体促进心脏成纤维细胞向内皮细胞转分化,改善缺血性心肌病的心功能 首次揭示冲击波疗法通过机械刺激激活TLR3信号通路,诱导染色质重塑和成纤维细胞转分化为内皮细胞的机制 研究主要基于细胞和小鼠模型,尚未在大型动物或临床人群中验证 探索冲击波疗法改善缺血性心肌病心功能的分子机制 人心脏成纤维细胞和Fsp1-Cre/LacZ转基因小鼠模型 心血管疾病研究 缺血性心脏病 单细胞RNA测序,ATAC-seq,Western blot,谱系追踪 NA 基因表达数据,染色质可及性数据,蛋白质数据 人心脏成纤维细胞和转基因小鼠模型 NA 单细胞RNA测序,ATAC-seq NA NA
449 2025-10-07
In Situ Graphene-Seq: Spatial Transcriptomics and Chronic Electrophysiological Characterization of Tissue Microenvironments
2025-Mar-28, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 开发了一种集成慢性电生理记录和空间分辨3D转录组学的原位石墨烯测序平台 首次将可拉伸网状纳米电子学与透明石墨烯电极结合,实现长期单细胞水平的多模态分析 NA 研究细胞功能与分子身份之间的复杂相互作用 人诱导多能干细胞衍生的心肌细胞和内皮细胞共培养体系 空间转录组学 心血管疾病 原位测序, 电生理记录, 光学成像 NA 电生理信号, 基因表达数据, 空间图像 NA NA 空间转录组学, 单细胞电生理记录, 3D成像 原位石墨烯测序平台 集成可拉伸网状纳米电子学和透明石墨烯/PEDOT:PSS电极的多模态分析系统
450 2025-10-07
Lignature: A Comprehensive Database of Ligand Signatures to Predict Cell-Cell Communication
2025-Mar-25, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 开发了一个名为Lignature的配体特征数据库,用于预测细胞间通讯 构建了包含362种人类配体的细胞内转录组特征数据库,显著扩展了可用配体响应特征库,在基因和通路水平上优于现有方法 NA 预测配体-受体相互作用和细胞间通讯 人类配体及其诱导的转录组特征 生物信息学 NA 转录组分析,单细胞测序 NA 转录组数据,单细胞测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
451 2025-10-07
Thor: a platform for cell-level investigation of spatial transcriptomics and histology
2025-Mar-10, Research square
研究论文 介绍Thor平台,一个用于空间转录组学和组织学图像多模态分析的计算平台 开发了抗收缩马尔可夫扩散方法从spot级数据推断单细胞空间转录组,实现细胞形态与空间转录组学的有效整合 NA 解决基因组分析与图像分析之间的整合空白,提供全面的细胞和分子分析工具 空间转录组学数据和组织学图像 空间转录组学 心力衰竭、乳腺癌、膀胱癌 空间转录组学、免疫荧光染色、ISH、MERFISH、Xenium、Stereo-seq 抗收缩马尔可夫扩散方法 空间转录组数据、组织图像 内部心力衰竭患者样本、小鼠嗅球样本、乳腺癌样本、膀胱癌样本 10x Genomics 空间转录组学 Visium HD 10x Visium HD空间转录组测序平台
452 2025-10-07
Lineage Tracing Reveals Clone-Specific Responses to Doxorubicin in Triple-Negative Breast Cancer
2025-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 使用谱系追踪系统研究三阴性乳腺癌对阿霉素治疗的克隆特异性反应 开发结合遗传克隆标识与单细胞RNA测序的谱系追踪系统ClonMapper,揭示治疗反应与克隆身份无关的 divergent phenotypes 研究基于单一TNBC模型,未验证其他癌症类型或治疗药物 阐明三阴性乳腺癌对阿霉素治疗的克隆特异性反应机制 三阴性乳腺癌模型中的肿瘤克隆 单细胞生物学 三阴性乳腺癌 谱系追踪,单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
453 2025-10-07
BET inhibitor in combination with BCG vaccine enhances antitumor efficacy and orchestrates T cell reprogramming for melanoma
2025-Mar-18, Cell reports. Medicine
研究论文 本研究证明BET抑制剂NHWD-870与BCG疫苗联合治疗可通过重编程T细胞增强黑色素瘤抗肿瘤疗效 首次发现BET抑制剂与BCG疫苗联合治疗可重编程T细胞至免疫激活状态,并鉴定MT1为BRD4直接下游靶点 NA 开发增强黑色素瘤免疫治疗效果的新型联合疗法 黑色素瘤模型和T细胞 NA 黑色素瘤 单细胞转录组分析,人源化PDX模型 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
454 2025-10-07
Intrinsic OASL expression licenses interferon induction during influenza A virus infection
2025-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了宿主因子OASL在流感病毒感染期间调控干扰素诱导的关键作用 首次发现干扰素非依赖性的OASL本征表达是决定细胞间干扰素诱导异质性的关键因素 研究主要聚焦于甲型流感病毒感染,未验证其他病毒类型中的普适性 识别决定细胞在病毒感染期间产生干扰素反应能力的关键宿主因子 甲型流感病毒感染的细胞 自然语言处理 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
455 2025-10-07
High-throughput single cell -omics using semi-permeable capsules
2025-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种基于半透性胶囊的高通量单细胞多组学技术 开发了半透性胶囊技术,克服了液滴微流控系统长期培养的限制,支持单细胞克隆扩增并提供优异的转录本捕获能力 NA 开发适用于多种高通量核酸分析的单细胞多组学技术 造血系统疾病患者的白细胞,特别是急性髓系白血病样本 单细胞多组学 急性髓系白血病 单细胞RNA测序,数字PCR,基因组测序,FACS分选 NA 单细胞转录组数据 造血系统疾病患者的白细胞样本 NA 单细胞RNA-seq CapSeq(胶囊测序) 基于半透性胶囊的单细胞测序技术
456 2025-10-07
Mouse-Geneformer: A deep learning model for mouse single-cell transcriptome and its cross-species utility
2025-Mar, PLoS genetics IF:4.0Q1
研究论文 开发了针对小鼠单细胞转录组的深度学习模型mouse-Geneformer,并验证其跨物种应用潜力 构建了首个基于2100万小鼠单细胞转录组数据预训练的Geneformer模型,并首次系统评估了该模型在跨物种分析中的效用 在人类COVID-19模型中的预测结果与人类专用Geneformer仅部分一致,表明物种特异性模型对某些疾病机制捕获存在局限 开发适用于小鼠单细胞转录组分析的深度学习模型,并探索其跨物种应用能力 小鼠和人类的单细胞转录组数据 自然语言处理, 机器学习 心肌梗死, COVID-19 单细胞RNA测序 Transformer Encoder 单细胞转录组数据 2100万个小鼠单细胞转录组图谱 NA 单细胞RNA-seq NA NA
457 2025-10-07
Chemokine Ligands and Receptors Regulate Macrophage Polarization in Atherosclerosis: A Comprehensive Database Mining Study
2025-Mar, CJC open IF:2.5Q2
研究论文 通过生物信息学方法研究趋化因子配体和受体在动脉粥样硬化中调控巨噬细胞极化的作用机制 首次通过公共数据库挖掘和单细胞RNA测序数据系统分析趋化因子在动脉粥样硬化中调控巨噬细胞极化的网络机制 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证 研究趋化因子在动脉粥样硬化发生发展中的作用机制 巨噬细胞极化过程及相关趋化因子 生物信息学 心血管疾病 单细胞RNA测序, 数据库挖掘, 信号通路富集分析 NA 基因表达数据, 单细胞测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
458 2025-10-07
An atlas of early human mandibular endochondral and osteogenic paracrine signaling regions of Meckel's cartilage
2025-Mar-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析构建了人类胎儿Meckel软骨的时空图谱,揭示其在下颌骨骨化中的关键作用 首次发现Meckel软骨的两个不同区域通过不同机制参与下颌骨骨化过程 研究仅涵盖7-15周孕期的胎儿样本,需要进一步验证机制 探究Meckel软骨在下颌骨骨化过程中的作用机制 人类胎儿Meckel软骨组织 空间转录组学 口腔颅面疾病 单细胞RNA测序, 单细胞空间转录组学分析, 体内谱系追踪 小鼠模型 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 7-15周孕期人类胎儿样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
459 2025-10-07
Construction of a Single-cell Atlas of Thyroid Cancer
2025-Mar-10, Endocrine, metabolic & immune disorders drug targets
研究论文 通过单细胞RNA测序技术构建甲状腺癌的单细胞图谱,揭示肿瘤异质性并探索分子特征 首次构建甲状腺癌全景单细胞图谱,发现lncRNA XIST在未分化甲状腺癌中的高表达及其m6A修饰调控机制 样本量有限(20例患者),数据来源于公共数据库 探索甲状腺癌的肿瘤异质性及其分子特征,为临床分期和治疗策略提供新见解 甲状腺癌患者的肿瘤组织、癌旁组织、转移淋巴结和远处转移灶 单细胞测序分析 甲状腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 生物信息学分析 单细胞转录组数据 20例患者的27个组织样本(11个原发肿瘤、6个癌旁组织、8个转移淋巴结、2个远处转移) NA 单细胞RNA测序 NA NA
460 2025-10-07
Reference-informed evaluation of batch correction for single-cell omics data with overcorrection awareness
2025-Mar-30, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 提出一种参考信息指导的统计框架RBET,用于评估单细胞组学数据批次效应校正性能并识别过校正问题 首次提出能够敏感检测数据过校正的批次效应校正评估方法,解决了传统方法无法识别真实生物变异被误删的问题 方法在极端批次效应情况下的性能需要进一步验证,且仅针对单细胞RNA-seq和ATAC-seq数据进行了测试 开发一个能够公平评估单细胞组学数据批次效应校正性能的统计框架 单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据集 生物信息学 NA 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 统计框架 单细胞组学数据 六个真实数据集,包含不同批次数量、批次效应大小和细胞类型数量的样本 NA single-cell RNA-seq, single-cell ATAC-seq NA NA
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