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当前共找到 722 篇文献，本页显示第 421 - 440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2025-10-07 |
Deciphering programmed cell death mechanisms in osteosarcoma for prognostic modeling
2025-Mar, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24269
PMID:38622876
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学方法探索程序性细胞死亡基因在骨肉瘤中的作用并建立预后模型 | 首次结合单细胞测序和批量测序数据系统分析骨肉瘤中程序性细胞死亡机制，并开发基于五个关键基因的预后模型 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，需要进一步实验验证 | 解析程序性细胞死亡在骨肉瘤中的机制并建立预后预测模型 | 骨肉瘤患者样本 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 单细胞测序, 批量测序, 生物信息学分析 | LASSO算法, Kaplan-Meier生存分析 | 基因表达数据 | 来自GEO和TARGET数据库的骨肉瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 422 | 2025-10-07 |
Bidirectional epigenetic editing reveals hierarchies in gene regulation
2025-Mar, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-024-02213-3
PMID:38760566
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研究论文 | 开发了双向表观遗传编辑系统CRISPRai，用于同时研究两个基因位点的激活和抑制效应 | 首次实现同一细胞内两个位点的同时激活和抑制扰动，结合单细胞RNA测序技术 | 未明确说明技术应用的细胞类型限制和实验规模限制 | 研究基因调控层次结构和非编码元件的功能 | 造血谱系转录因子SPI1和GATA1，IL2基因在Jurkat T细胞、原代T细胞和CAR-T细胞中的调控 | 基因编辑与功能基因组学 | NA | CRISPRa/CRISPRi双向表观遗传编辑，单细胞RNA测序 | CRISPRai系统 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | CRISPRai Perturb-seq（结合双扰动gRNA检测与单细胞RNA测序） |
| 423 | 2025-10-07 |
Integrative analysis of the bladder cancer from a cell cycle NCAM1 perspective at both single cell and bulk resolution
2025-Mar, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24260
PMID:38581187
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量测序数据，从细胞周期角度分析膀胱癌，识别关键基因并验证NCAM1的抑癌作用 | 首次从细胞周期NCAM1视角整合单细胞和批量测序分析膀胱癌，发现NCAM1作为新型细胞增殖抑制因子 | 临床预后评估有限，需要进一步临床验证 | 探索膀胱癌中细胞周期相关基因作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力 | 膀胱癌患者转录组数据、单细胞测序数据和膀胱癌细胞系 | 生物信息学 | 膀胱癌 | scRNA-seq, 转录组分析, RT-qPCR, CCK-8细胞活力检测, 分子对接 | 列线图预测模型 | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | TCGA-BLCA队列和GSE190888队列数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 424 | 2025-10-07 |
Kurarinone regulates Th17/Treg balance and ameliorates autoimmune uveitis via Rac1 inhibition
2025-Mar, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.03.013
PMID:38522752
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研究论文 | 本研究探讨苦参酮通过抑制Rac1调节Th17/Treg平衡改善自身免疫性葡萄膜炎的作用机制 | 首次利用单细胞RNA测序构建苦参酮治疗实验性自身免疫性葡萄膜炎的高分辨率免疫调控图谱，揭示其通过Rac1和Id2/Pim1轴调节Th17/Treg平衡的新机制 | 研究主要基于动物模型，人体验证仅使用外周血单个核细胞，缺乏更广泛的人体临床试验数据 | 研究苦参酮对自身免疫性葡萄膜炎的治疗效果及其免疫调节机制 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠模型和葡萄膜炎患者的外周血单个核细胞 | 免疫学 | 自身免疫性葡萄膜炎 | 单细胞RNA测序, siRNA干扰, 选择性抑制剂 | 动物疾病模型 | 单细胞转录组数据, 基因表达数据 | EAU小鼠模型和葡萄膜炎患者PBMCs | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 425 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomic sequencing identifies subcutaneous patient-derived xenograft recapitulated medulloblastoma
2025-Mar, Animal models and experimental medicine
IF:3.8Q2
DOI:10.1002/ame2.12399
PMID:38477441
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序比较了三种髓母细胞瘤模型的再现能力 | 首次在单细胞水平系统比较髓母细胞瘤实验模型的差异 | 样本量有限（仅6例患者），仅分析了SHH和G3亚型 | 比较不同髓母细胞瘤模型在单细胞水平对原始肿瘤的再现能力 | 髓母细胞瘤患者样本、皮下和颅内人源肿瘤异种移植模型、基因工程小鼠模型 | 数字病理学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq反卷积分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 6例患者样本，各建立2个sPDX和iPDX模型，3个GEMM模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 426 | 2025-10-07 |
SCANER: robust and sensitive identification of malignant cells from the scRNA-seq profiled tumor ecosystem
2025-Mar-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf175
PMID:40253692
|
研究论文 | 开发了一种基于种子聚类的无标记方法SCANER，用于从单细胞RNA测序数据中准确识别恶性肿瘤细胞 | 提出无需先验标记知识的计算方法，基于基因组不稳定性导致的基因表达变异来识别恶性细胞 | NA | 开发能够准确识别肿瘤生态系统中恶性细胞的计算方法 | 多种癌症类型的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 多种实体癌 | 单细胞RNA测序，全外显子组测序 | 种子聚类算法 | 单细胞RNA测序数据 | 多种癌症类型样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 427 | 2025-10-07 |
ANKRD11 as a potential biomarker for brain metastasis from lung adenocarcinoma via cerebrospinal fluid liquid biopsy
2025-Mar-31, Translational lung cancer research
IF:4.0Q1
DOI:10.21037/tlcr-24-800
PMID:40248734
|
研究论文 | 本研究通过脑脊液液体活检识别ANKRD11作为肺腺癌脑转移的潜在生物标志物 | 首次通过脑脊液ctDNA测序结合单细胞RNA测序分析发现ANKRD11在肺腺癌脑转移中的表达逐渐降低及其抑癌功能 | 样本量较小（仅7例患者），需要更大规模研究验证 | 探索肺腺癌脑转移的新型生物标志物 | 肺腺癌脑转移患者、细胞系、裸鼠模型 | 数字病理学 | 肺癌 | ctDNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 7例BM-LUAD患者脑脊液样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 液体活检 | NA | NA |
| 428 | 2025-10-07 |
Single cell RNA-seq and bulk RNA-seq analysis identifies MUC1 as a key gene for lung adenocarcinoma to neuroendocrine transformation
2025-Mar-31, Translational lung cancer research
IF:4.0Q1
DOI:10.21037/tlcr-24-806
PMID:40248742
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序分析，揭示了MUC1基因在肺腺癌向神经内分泌癌转化过程中的关键作用 | 首次结合孟德尔随机化分析和单细胞RNA测序技术系统研究肺腺癌向神经内分泌癌转化的分子机制，并识别MUC1作为关键调控基因 | 样本量相对有限（6个组织活检样本），需要在更大规模队列中验证研究结果 | 探索肺腺癌向神经内分泌癌转化过程中的遗传和免疫特征 | 肺腺癌和神经内分泌癌组织样本 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 孟德尔随机化分析, WGCNA, CIBERSORT | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 16,765个细胞，来自6个组织活检样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 429 | 2025-10-07 |
A factor-based analysis of individual human microglia uncovers regulators of an Alzheimer-related transcriptional signature
2025-Mar-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.27.641500
PMID:40196633
|
研究论文 | 通过单细胞分析人类小胶质细胞异质性，发现阿尔茨海默病相关转录特征的新型调控因子 | 开发了基于单细胞层次泊松因子分解的分析框架，识别了23个连续基因表达特征因子，并发现了AD相关DAM2特征的四个新调控因子 | 研究主要基于死后组织样本和神经外科手术样本，可能受到取样时间和技术限制的影响 | 解析人类小胶质细胞异质性及其在神经退行性疾病中的作用机制 | 441,088个活体小胶质细胞，来自161名捐赠者的不同脑区样本 | 单细胞转录组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学，MERFISH | 单细胞层次泊松因子分解（scHPF） | 单细胞基因表达数据，空间转录组数据 | 441,088个小胶质细胞，来自161名捐赠者 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 430 | 2025-10-07 |
Male-Dominant Spinal Microglia Contribute to Neuropathic Pain by Producing CC-Chemokine Ligand 4 Following Peripheral Nerve Injury
2025-03-23, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14070484
PMID:40214438
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研究论文 | 本研究揭示了雄性小鼠脊髓小胶质细胞通过产生CCL4促进神经病理性疼痛的性别特异性机制 | 首次发现雄性小鼠脊髓小胶质细胞中CCL4表达显著增加，并证实其通过CCL4-CCR5信号通路特异性加剧雄性小鼠的神经病理性疼痛 | 研究主要基于小鼠模型，人类相关性尚需验证；机制研究尚未完全阐明CCL4作用的下游通路 | 探究外周神经损伤后脊髓小胶质细胞在神经病理性疼痛中的性别特异性作用机制 | 雄性小鼠脊髓小胶质细胞 | 神经科学 | 神经病理性疼痛 | 单细胞RNA测序，行为学测试，药理学干预 | NA | 基因表达数据，行为学数据 | 小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 431 | 2025-10-07 |
HISSTA: a human in situ single-cell transcriptome atlas
2025-Mar-29, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf142
PMID:40163697
|
研究论文 | 介绍HISSTA数据库，该数据库用于存储和分析人类组织原位单细胞分辨率转录组数据 | 首个专门用于管理原位单细胞分辨率转录组数据的综合性数据库，整合了多种空间转录组技术数据 | NA | 构建一个用户友好的空间转录组数据存储和分析平台 | 人类多种组织的空间转录组数据 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 112个样本，2800万个细胞，涵盖16种组织类型，来自63项研究 | 10x Genomics, NanoString, Vizgen | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | Xenium, CosMx SMI, MERFISH | MERFISH, CosMx SMI, Xenium空间转录组技术 |
| 432 | 2025-10-07 |
uHAF: a unified hierarchical annotation framework for cell type standardization and harmonization
2025-Mar-29, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf149
PMID:40172934
|
研究论文 | 开发了一个统一的层次注释框架uHAF，用于单细胞转录组学中的细胞类型标准化和协调 | 提出了包含器官特异性层次细胞类型树和基于大语言模型的映射工具的统一框架，首次系统解决了单细胞注释中的命名不一致和粒度差异问题 | NA | 解决单细胞转录组学中细胞类型注释不一致的问题，促进数据整合和机器学习应用 | 38个器官的细胞类型注释 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学，大语言模型 | GPT-4 | 文本注释数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 433 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing analysis reveals the essential role of the m 6A reader YTHDF1 in retinal visual function by regulating TULP1 and DHX38 translation
2025-Mar-18, Zoological research
IF:4.0Q1
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析揭示m6A阅读器YTHDF1通过调控TULP1和DHX38翻译在视网膜视觉功能中的关键作用 | 首次发现YTHDF1在成熟视网膜功能维持中的新作用，揭示其通过识别m6A修饰直接调控视网膜变性相关基因TULP1和DHX38翻译的新机制 | 研究主要基于基因敲除模型，在人类视网膜疾病中的直接应用仍需进一步验证 | 探究m6A阅读器YTHDF1在视网膜功能维持中的分子机制 | 小鼠视网膜组织及视网膜细胞 | 单细胞生物学 | 视网膜变性疾病 | 单细胞RNA测序, MeRIP测序, RIP测序 | 基因敲除模型 | 单细胞转录组数据, 表观转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 甲基化RNA免疫沉淀测序 | NA | NA |
| 434 | 2025-10-07 |
Integrated single-cell transcriptomic map of pig kidney cells across various periods and anatomical sites
2025-Mar-18, Zoological research
IF:4.0Q1
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建了猪肾脏在不同时期和不同解剖部位的单细胞转录组图谱 | 首次系统构建了猪肾脏跨胚胎期、育肥期和妊娠期的单细胞转录组图谱，发现了近端小管细胞代谢相关转录因子的表达特征，并揭示了厚壁升支细胞亚群和肾脏驻留巨噬细胞的功能异质性 | 研究样本数量有限（12个样本），且仅针对猪模型，人类肾脏验证数据相对较少 | 构建猪肾脏单细胞转录组图谱，研究肾脏细胞在不同生理时期和不同解剖部位的功能异质性 | 猪肾脏细胞 | 单细胞组学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序，荧光同源双标记 | NA | 单细胞转录组数据，组织切片图像 | 138,469个细胞，来自12个猪肾脏样本（涵盖胚胎期、育肥期和妊娠期） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 435 | 2025-10-07 |
An accelerated human in-vitro aging model mimics in-vivo aging and facilitates dynamic testing of anti-aging compounds
2025-Mar-28, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6173768/v1
PMID:40195985
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研究论文 | 开发了一种加速的人类体外衰老模型，可模拟体内衰老并用于抗衰老化合物的动态测试 | 建立了长期有丝分裂后人类成纤维细胞培养系统，能真实重现并加速体内衰老特征，首次实现了神经元衰老的伪纵向建模 | 研究主要基于成纤维细胞模型，可能无法完全代表其他细胞类型的衰老过程 | 开发人类特异性衰老研究平台并评估抗衰老化合物的疗效 | 人类成纤维细胞及其神经元转化细胞 | 细胞生物学 | 衰老相关疾病 | 单细胞转录组学，表观遗传时钟分析，纵向配对转录组-表观遗传分析 | 体外衰老模型 | 转录组数据，表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 436 | 2025-10-07 |
The tectum transversum(TTR) maintains patency of the developing coronal suture
2025-Mar-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.30.646197
PMID:40236170
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型探究了横梁软骨在冠状缝发育中的作用机制 | 首次通过遗传消融实验证明横梁软骨对维持冠状缝开放性的关键作用，并发现其可能作为BMP信号通路的屏障 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 探究横梁软骨在冠状缝发育过程中的功能机制 | 小鼠模型的冠状缝发育过程及相关组织 | 发育生物学 | 颅缝早闭 | 遗传消融技术，空间转录组学 | 小鼠模型 | 基因表达数据，组织形态数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 437 | 2025-10-07 |
Androgen Deprivation-Induced TET2 Activation Fuels Prostate Cancer Progression via Epigenetic Priming and Slow-Cycling Cancer Cells
2025-Mar-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.26.645495
PMID:40196510
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研究论文 | 本研究揭示了雄激素剥夺通过激活TET2驱动前列腺癌进展的表观遗传机制 | 首次提供了前列腺癌中5hmC动态的单核苷酸分辨率图谱，发现TET2是调控慢循环细胞的关键因子 | NA | 探索雄激素剥夺治疗诱导的前列腺癌进展机制 | 前列腺癌细胞和模型 | 表观遗传学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 四环素诱导型H2BeGFP报告系统, 全基因组5-羟甲基胞嘧啶分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 438 | 2025-10-07 |
Extracellular vesicle-packaged GBP2 from macrophages aggravates sepsis-induced acute lung injury by promoting ferroptosis in pulmonary vascular endothelial cells
2025-Mar-25, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2025.103614
PMID:40156957
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研究论文 | 本研究揭示了巨噬细胞来源的细胞外囊泡通过GBP2-OTUD5-GPX4轴促进肺血管内皮细胞铁死亡，从而加剧脓毒症诱导的急性肺损伤 | 首次发现巨噬细胞来源的细胞外囊泡中GBP2蛋白通过直接结合OTUD5促进GPX4泛素化，驱动内皮细胞铁死亡的新机制 | 研究主要基于细胞和小鼠模型，在人体中的临床验证仍需进一步研究 | 探究巨噬细胞来源的细胞外囊泡在脓毒症诱导的急性肺损伤中的作用机制 | 肺血管内皮细胞、巨噬细胞、脓毒症患者外周血样本、THP-1和RAW264.7细胞、CLP小鼠模型 | 分子生物学 | 脓毒症诱导的急性肺损伤 | 蛋白质组测序、转录组测序、单细胞测序、RNA干扰、腺相关病毒转染、分子对接、分子动力学模拟、细胞热位移分析 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据、单细胞测序数据 | 脓毒症患者外周血样本、细胞系(THP-1、RAW264.7)、CLP小鼠模型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 439 | 2025-10-07 |
Asthma-derived genetic signature predicts lung cancer prognosis: a multi-scale omics investigation
2025-Mar-31, Journal of thoracic disease
IF:2.1Q3
DOI:10.21037/jtd-24-1697
PMID:40223964
|
研究论文 | 通过多组学方法研究哮喘与肺癌的关联，并开发基于哮喘相关基因的肺癌预后模型 | 首次将哮喘相关基因特征应用于肺癌预后预测，结合流行病学、孟德尔随机化和单细胞测序进行多尺度验证 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 探索哮喘与肺癌的关联并开发预后预测模型 | 哮喘和肺癌患者 | 生物信息学 | 肺癌 | 全基因组关联研究, 孟德尔随机化, RNA测序, 单细胞RNA测序 | 预后预测模型 | 基因组数据, 转录组数据, 流行病学数据 | 1990-2019年全球疾病负担数据及公共数据库样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 440 | 2025-10-07 |
An Efficient Method for Extracting Human Fallopian Tube Epithelia for Single-cell Analyses
2025-Mar-28, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/67753
PMID:40228013
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研究论文 | 本文介绍了一种从新鲜输卵管中高效分离上皮细胞用于单细胞分析的方法 | 开发了一种能够在4-6小时内从新鲜输卵管中分离上皮细胞的方法，具有最小的基质细胞污染 | NA | 建立输卵管上皮细胞的有效分离方法 | 人类输卵管上皮细胞 | 单细胞分析 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 单细胞悬浮液 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |