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当前共找到 709 篇文献，本页显示第 421 - 440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2025-10-07 |
Migrasome-Related Genes as Potential Prognosis and Immunotherapy Response Predictors for Colorectal Cancer
2025-Mar-26, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13040799
PMID:40299331
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研究论文 | 通过生物信息学分析迁移体相关基因在结直肠癌预后和免疫治疗反应中的潜在作用 | 首次系统研究迁移体相关基因在结直肠癌预后和免疫治疗反应中的预测价值 | 基于公共数据库的回顾性分析，缺乏实验验证 | 探索迁移体相关基因作为结直肠癌预后和免疫治疗反应预测标志物的潜力 | 结直肠癌患者和相关的基因表达数据 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，加权基因共表达网络分析，差异表达基因分析 | 风险预测模型 | 基因表达数据 | TCGA-CRC数据集和GSE231559单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 422 | 2025-10-07 |
Migrasome Marker Epidermal Growth Factor Domain-Specific O-GlcNAc Transferase: Pan-Cancer Angiogenesis Biomarker and the Potential Role of circ_0058189/miR-130a-3p/EOGT Axis in Hepatocellular Carcinoma Progression and Sorafenib Resistance
2025-Mar-22, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13040773
PMID:40299340
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研究论文 | 本研究系统分析了迁移体标志物EOGT在泛癌中的致癌机制，特别聚焦于其在肝细胞癌进展和索拉非尼耐药中的作用 | 首次确立EOGT作为泛癌血管生成生物标志物，并发现外泌体circ_0058189/miR-130a-3p/EOGT轴在肝细胞癌治疗耐药中的调控机制 | EOGT在泛癌中的功能和治疗意义仍需进一步探索 | 系统表征EOGT在恶性肿瘤中的致癌机制，特别关注肝细胞癌进展和索拉非尼耐药 | 33种癌症类型的TCGA/GTEx数据、10个肝细胞癌队列、Huh7细胞模型 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | 多组学分析、空间/单细胞转录组学、RNA测序、ceRNA网络构建 | NA | 基因组数据、转录组数据、单细胞数据、空间转录组数据 | 33种癌症类型的TCGA/GTEx数据、10个肝细胞癌队列 | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | NA |
| 423 | 2025-10-07 |
Protocol for transcriptomic and epigenomic analyses of tip-like endothelial cells using scRNA-seq and ChIP-seq
2025-Mar-21, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103326
PMID:39799578
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研究论文 | 本文提出了一种用于分析尖端样内皮细胞转录组和表观基因组的实验方案 | 开发了结合单细胞RNA测序和染色质免疫沉淀测序的综合分析方案，适用于多种组学研究 | NA | 建立尖端样内皮细胞的转录组和表观基因组分析流程 | 人脐静脉内皮细胞（HUVECs） | 表观基因组学 | NA | scRNA-seq, ChIP-seq | NA | 转录组数据, 表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 染色质免疫沉淀测序 | NA | NA |
| 424 | 2025-10-07 |
Developing and experimental validating a T cell senescence-related gene signature to predict prognosis and immunotherapeutic sensitivity in non-small cell lung cancer
2025-Mar-15, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149233
PMID:39800199
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研究论文 | 开发并实验验证了一个T细胞衰老相关基因特征，用于预测非小细胞肺癌的预后和免疫治疗敏感性 | 首次构建了基于T细胞衰老相关基因的风险模型，并通过多组学数据和实验验证其在NSCLC预后和免疫治疗预测中的价值 | 研究样本量相对有限，需要更大规模的前瞻性研究验证 | 预测非小细胞肺癌患者的预后和免疫治疗敏感性 | 非小细胞肺癌患者组织和T细胞 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 机器学习, 多变量Cox回归, 细胞共培养实验 | 多变量Cox回归模型, 机器学习算法 | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据, 临床数据 | TCGA-NSCLC数据集训练，8个GEO独立队列验证，10对癌旁和癌组织 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 425 | 2025-10-07 |
An augmented GSNMF model for complete deconvolution of bulk RNA-seq data
2025-Mar-14, Mathematical biosciences and engineering : MBE
DOI:10.3934/mbe.2025036
PMID:40296800
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研究论文 | 提出一种增强的GSNMF模型用于批量RNA-seq数据的完全解卷积分析 | 开发了伪批量组织数据增强的几何结构引导NMF模型(GSNMF+)，通过统计分布模拟伪细胞组成和单细胞RNA-seq数据生成伪批量组织数据，并利用估计的重缩放矩阵调整NMF最小值 | 在奇异细胞组成场景中表现较好，但未明确说明在其他复杂场景中的适用性限制 | 解决批量RNA-seq数据完全解卷积分析的数学不适定问题，提高细胞类型特异性基因表达谱和相对细胞丰度估计的准确性 | 批量RNA-seq数据和单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, scRNA-seq | NMF, GSNMF | 基因表达数据 | 多个真实批量组织数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 426 | 2025-10-07 |
Exosome-Mediated Lectin Pathway and Resistin-MIF-AA Metabolism Axis Drive Immune Dysfunction in Immune Thrombocytopenia
2025-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202412378
PMID:39792656
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了外泌体介导的凝集素补体途径和抵抗素-MIF-AA代谢轴在免疫性血小板减少症发病机制中的作用 | 首次发现外泌体介导的凝集素补体途径参与ITP发病，并阐明抵抗素和MIF通过促炎信号通路导致免疫细胞过度活化和AA代谢紊乱 | 样本量有限，需要更大规模研究验证发现 | 探索免疫性血小板减少症的发病机制和潜在治疗靶点 | 免疫性血小板减少症患者样本 | 免疫学 | 免疫性血小板减少症 | 流式细胞术,蛋白质组学,单细胞RNA测序 | NA | 流式细胞数据,蛋白质组数据,单细胞转录组数据 | ITP患者样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序,蛋白质组学 | NA | NA |
| 427 | 2025-10-07 |
Cell-Type Specific miRNA Regulatory Network Responses to ABA Stress Revealed by Time Series Transcriptional Atlases in Arabidopsis
2025-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202415083
PMID:39792694
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研究论文 | 本研究通过拟南芥ABA胁迫下的单细胞转录组时序图谱，揭示了细胞类型特异的miRNA调控网络响应机制 | 首次在单细胞水平构建ABA胁迫下的时序转录图谱，发现miRNA在调控网络中的枢纽作用及细胞类型特异性响应模式 | 研究仅针对拟南芥ABA胁迫响应，未验证其他植物或胁迫条件 | 揭示植物在ABA胁迫下细胞类型特异的miRNA调控网络动态响应机制 | 拟南芥在不同ABA处理时间点的单细胞转录组 | 单细胞转录组学 | 植物胁迫响应 | 单细胞RNA测序 | 调控网络分析 | 单细胞转录组数据 | 拟南芥不同时间点（早期、中期、晚期）ABA处理的单细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 428 | 2025-10-07 |
Scale-Up of Human Amniotic Epithelial Cells Through Regulation of Epithelial-Mesenchymal Plasticity Under Defined Conditions
2025-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202408581
PMID:39804851
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研究论文 | 通过调控上皮-间质可塑性在限定条件下实现人羊膜上皮细胞的规模化扩增 | 首次通过单细胞RNA测序揭示hAECs增殖与上皮-间质可塑性的关联，并开发出使细胞扩增50倍同时保持增殖能力的培养方法 | 未明确说明研究涉及的样本数量及具体疾病治疗应用场景 | 阐明人羊膜上皮细胞的增殖机制并优化其体外培养体系 | 不同孕周和传代次数的人羊膜上皮细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 429 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics reveals intratumor heterogeneity and the potential roles of cancer stem cells and myCAFs in colorectal cancer liver metastasis and recurrence
2025-Mar-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217452
PMID:39805388
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示结直肠癌肝转移和复发中的肿瘤内异质性，以及癌症干细胞和myCAFs的潜在作用 | 在单细胞分辨率下发现癌症干细胞样细胞亚群与myCAFs之间的新型细胞通讯机制，并构建了可用于评估复发风险的基因特征 | NA | 研究结直肠癌肝转移和复发的分子机制 | 结直肠癌原发灶和肝转移灶 | 单细胞生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 430 | 2025-10-07 |
Mannose Promotes β-Amyloid Pathology by Regulating BACE1 Glycosylation in Alzheimer's Disease
2025-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202409105
PMID:39807036
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研究论文 | 本研究揭示了甘露糖通过调节BACE1糖基化促进阿尔茨海默病β-淀粉样蛋白病理的机制 | 首次发现甘露糖通过调节BACE1和Nicastrin的N-糖基化增强其蛋白稳定性，从而促进Aβ产生 | 研究主要基于AD小鼠模型，人类临床验证仍需进一步研究 | 探究甘露糖在阿尔茨海默病病理进展中的作用机制 | AD小鼠模型和AD患者血清样本 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,代谢组学 | NA | 基因表达数据,代谢物数据 | AD小鼠和AD患者血清样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 431 | 2025-10-07 |
Benchmarking algorithms for spatially variable gene identification in spatial transcriptomics
2025-Mar-29, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf131
PMID:40139667
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研究论文 | 提出一个用于评估空间转录组学中空间可变基因识别算法的基准框架 | 首次构建了包含30个合成数据集和74个真实数据集的综合基准框架，用于系统评估空间可变基因识别算法 | NA | 评估空间可变基因识别算法的性能并确定最佳算法及其适用场景 | 空间转录组学数据分析算法 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学数据分析 | NA | 空间转录组数据 | 30个合成数据集和74个真实数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 432 | 2025-10-07 |
adverSCarial: assessing the vulnerability of single-cell RNA-sequencing classifiers to adversarial attacks
2025-Mar-29, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf168
PMID:40234247
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研究论文 | 开发了一个名为adverSCarial的R软件包，用于评估单细胞RNA测序分类器对对抗性攻击的脆弱性 | 首次提供了专门针对单细胞转录组数据的对抗性攻击模拟工具，支持从轻微到激进的不同攻击模式 | 仅评估了五种机器学习分类器，在四个数据集上进行测试，样本范围有限 | 评估单细胞RNA测序分类器对对抗性攻击的脆弱性，提高模型可靠性 | 单细胞RNA测序分类器和对抗性攻击方法 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 多种机器学习分类器 | 基因表达数据 | 四个不同数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 433 | 2025-10-07 |
Single-cell atlas of the pregnant equine endometrium before and after implantation†
2025-Mar-16, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioaf004
PMID:39756438
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建妊娠母马子宫内膜在胚胎植入前后的细胞图谱 | 首次在母马中发现常驻先天淋巴细胞和黏膜相关恒定T细胞等新型免疫细胞亚群，并揭示子宫内膜自然杀伤细胞是植入期间最丰富的白细胞群体 | 仅分析了两个时间点（妊娠第33天和第42天）的样本，样本时间点有限 | 确定和比较马胚胎植入前后子宫内膜细胞的转录组和细胞亚群 | 母马子宫内膜细胞 | 单细胞组学 | 生殖生物学 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约97,000个子宫内膜细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 434 | 2025-10-07 |
A3AR antagonism mitigates metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease by exploiting monocyte-derived Kupffer cell necroptosis and inflammation resolution
2025-Mar, Metabolism: clinical and experimental
DOI:10.1016/j.metabol.2024.156114
PMID:39732364
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研究论文 | 本研究探讨了选择性A3AR拮抗剂通过诱导单核细胞来源库普弗细胞坏死性凋亡来改善代谢功能障碍相关脂肪肝病的作用机制 | 首次揭示A3AR拮抗通过β-arrestin2介导的受体降解导致线粒体功能障碍，进而诱导促炎性MoKCs坏死性凋亡的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化效果需进一步验证 | 研究A3AR拮抗对代谢功能障碍相关脂肪肝病的治疗作用及机制 | MASLD患者和快餐饮食喂养的小鼠 | 肝脏疾病研究 | 代谢功能障碍相关脂肪肝病 | 空间转录组学，基因敲除，体内药物治疗 | A3AR基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据，组织病理学数据 | MASLD患者和FFD喂养的小鼠样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 435 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA-seq offer new insights into the cell fate decision of the primordial germ cells
2025-Mar, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.139136
PMID:39740725
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示原始生殖细胞命运决定的新机制 | 首次通过单细胞RNA测序发现细胞周期驱动细胞异质性，识别了参与PGC自我更新的活跃群体和衰老细胞命运特征 | 未明确说明样本来源物种和具体实验室间重复性问题的量化数据 | 研究培养原始生殖细胞系网络建立的分子动力学机制 | 原始生殖细胞(PGCs) | 单细胞生物学 | 生殖生物学 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 436 | 2025-10-07 |
The relationship between a high-fat diet, gut microbiome, and systemic chronic inflammation: insights from integrated multiomics analysis
2025-Mar, The American journal of clinical nutrition
DOI:10.1016/j.ajcnut.2024.12.026
PMID:39746397
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研究论文 | 通过整合多组学分析探讨高脂饮食、肠道微生物组与系统性慢性炎症之间的因果关系 | 首次采用孟德尔随机化方法结合单细胞测序和转录组学分析，揭示特定肠道菌群在高脂饮食诱导炎症中的介导作用 | 研究数据主要来源于欧洲人群，可能限制结果在其他人群的普适性 | 探究高脂饮食通过肠道微生物组影响系统性慢性炎症的机制 | 人类遗传数据、肠道微生物组、炎症细胞因子、免疫细胞特征、血清代谢物和小鼠结肠组织 | 多组学整合分析 | 代谢性疾病 | 孟德尔随机化, 全基因组关联分析, 转录组测序, 单细胞测序, 代谢组学 | 孟德尔随机化模型, 中介分析 | 遗传数据, 微生物组数据, 转录组数据, 单细胞数据, 代谢组数据 | 欧洲人群GWAS数据和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 437 | 2025-10-07 |
Lymphocytes-Associated Extracellular Vesicles Activate Natural Killer Cells in HNSCC
2025-Mar, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.16440
PMID:39749376
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析头颈鳞状细胞癌中小细胞外囊泡的异质性及其对自然杀伤细胞的激活作用 | 首次在液滴水平分析HNSCC中sEVs的异质性，发现T细胞是sEVs主要分泌源，并揭示其通过sEVs间接激活NK细胞的抗肿瘤机制 | 研究主要基于计算算法SEVtras的分析结果，需要进一步实验验证 | 探究头颈鳞状细胞癌中小细胞外囊泡的异质性及其在肿瘤免疫中的作用机制 | 头颈鳞状细胞癌患者样本中的小细胞外囊泡、T细胞和自然杀伤细胞 | 生物信息学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | SEVtras算法 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 438 | 2025-10-07 |
Longitudinal single-cell RNA sequencing reveals a heterogeneous response of plasma cells to colonic inflammation
2025-Mar, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.139307
PMID:39753172
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研究论文 | 通过纵向单细胞RNA测序揭示浆细胞在结肠炎症中的异质性反应 | 首次在DSS诱导的小鼠结肠炎模型中系统分析浆细胞在不同炎症阶段的动态变化，发现Ube2c+浆细胞亚群的关键作用及Chchd10-C1qbp相互作用的保护机制 | 研究仅使用DSS诱导的小鼠结肠炎模型，结果在人类疾病中的适用性需要进一步验证 | 探究浆细胞在结肠炎症过程中的动态变化和分子机制 | DSS诱导的结肠炎小鼠模型中的浆细胞 | 单细胞组学 | 结肠炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6周龄雄性C57BL/6小鼠结肠组织（炎症高峰期、恢复期和恢复结束期） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 439 | 2025-10-07 |
Analysis of multi-condition single-cell data with latent embedding multivariate regression
2025-Mar, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01996-0
PMID:39753773
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研究论文 | 提出一种名为LEMUR的潜在嵌入多元回归模型，用于分析多条件单细胞RNA测序数据 | 无需预先进行离散分类即可整合多条件数据并预测基因表达变化 | NA | 识别异质组织中跨条件的基因表达差异 | 癌症、斑马鱼发育和阿尔茨海默病空间梯度中的单细胞数据 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 潜在嵌入多元回归(LEMUR) | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 440 | 2025-10-07 |
LncRNA-MEG3/miR-93-5p/SMAD7 axis mediates proliferative and inflammatory phenotypes of fibroblast-like synoviocytes in rheumatoid arthritis
2025-Mar, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.139390
PMID:39755314
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据，揭示了MEG3/miR-93-5p/SMAD7轴在类风湿关节炎滑膜成纤维细胞增殖和炎症表型中的调控机制 | 首次发现MEG3通过竞争性吸附miR-93-5p促进SMAD7表达，从而缓解RA滑膜成纤维细胞的增殖和炎症表型 | RA的细胞、分子和免疫学机制仍不完全清楚 | 阐明类风湿关节炎滑膜的细胞景观、分化轨迹、转录组特征和免疫浸润特征 | 类风湿关节炎滑膜组织和滑膜成纤维细胞 | 单细胞转录组学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |