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当前共找到 712 篇文献，本页显示第 401 - 420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2025-10-07 |
adverSCarial: assessing the vulnerability of single-cell RNA-sequencing classifiers to adversarial attacks
2025-Mar-29, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf168
PMID:40234247
|
研究论文 | 开发了一个名为adverSCarial的R软件包，用于评估单细胞RNA测序分类器对对抗性攻击的脆弱性 | 首次提供了专门针对单细胞转录组数据的对抗性攻击模拟工具，支持从轻微到激进的不同攻击模式 | 仅评估了五种机器学习分类器，在四个数据集上进行测试，样本范围有限 | 评估单细胞RNA测序分类器对对抗性攻击的脆弱性，提高模型可靠性 | 单细胞RNA测序分类器和对抗性攻击方法 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 多种机器学习分类器 | 基因表达数据 | 四个不同数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 402 | 2025-10-07 |
Protocol for investigating intracellular microbial diversity using single-cell RNA-seq in immune cells of SARS-CoV-2-positive and recovered patients
2025-Mar-21, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103546
PMID:39786999
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研究方案 | 本文提出了一种利用单细胞RNA测序检测SARS-CoV-2阳性及康复患者免疫细胞中胞内微生物多样性的实验方案 | 开发了针对非可培养状态胞内微生物的单细胞RNA测序检测流程，专门应用于新冠病毒感染研究 | NA | 建立检测免疫细胞中胞内微生物多样性的标准化实验流程 | SARS-CoV-2阳性患者和康复患者的免疫细胞 | 单细胞测序 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 403 | 2025-10-07 |
Single-cell atlas of the pregnant equine endometrium before and after implantation†
2025-Mar-16, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioaf004
PMID:39756438
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建妊娠母马子宫内膜在胚胎植入前后的细胞图谱 | 首次在母马中发现常驻先天淋巴细胞和黏膜相关恒定T细胞等新型免疫细胞亚群，并揭示子宫内膜自然杀伤细胞是植入期间最丰富的白细胞群体 | 仅分析了两个时间点（妊娠第33天和第42天）的样本，样本时间点有限 | 确定和比较马胚胎植入前后子宫内膜细胞的转录组和细胞亚群 | 母马子宫内膜细胞 | 单细胞组学 | 生殖生物学 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约97,000个子宫内膜细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 404 | 2025-10-07 |
Spatial Organization of Macrophages in CTL-Rich Hepatocellular Carcinoma Influences CTL Antitumor Activity
2025-Mar-04, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-0589
PMID:39745778
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间分析揭示了巨噬细胞空间聚集在CTL富集型肝细胞癌中的免疫抑制作用和预后价值 | 首次发现巨噬细胞空间聚集是CTL富集型肝癌的独特空间模式，揭示了空间分布对巨噬细胞重编程和CTL耗竭的影响 | 样本量相对有限，需要更大规模验证 | 探究CTL富集型肝细胞癌中空间免疫变异对临床结局的影响机制 | 肝细胞癌患者肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 多重原位染色，单细胞转录组测序，空间转录组测序 | 随机森林，Cox回归 | 图像，转录组数据 | 20例CTL富集型HCC用于深度分析，386例患者队列用于验证 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 405 | 2025-10-07 |
A3AR antagonism mitigates metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease by exploiting monocyte-derived Kupffer cell necroptosis and inflammation resolution
2025-Mar, Metabolism: clinical and experimental
DOI:10.1016/j.metabol.2024.156114
PMID:39732364
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研究论文 | 本研究探讨了选择性A3AR拮抗剂通过诱导单核细胞来源库普弗细胞坏死性凋亡来改善代谢功能障碍相关脂肪肝病的作用机制 | 首次揭示A3AR拮抗通过β-arrestin2介导的受体降解导致线粒体功能障碍，进而诱导促炎性MoKCs坏死性凋亡的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化效果需进一步验证 | 研究A3AR拮抗对代谢功能障碍相关脂肪肝病的治疗作用及机制 | MASLD患者和快餐饮食喂养的小鼠 | 肝脏疾病研究 | 代谢功能障碍相关脂肪肝病 | 空间转录组学，基因敲除，体内药物治疗 | A3AR基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据，组织病理学数据 | MASLD患者和FFD喂养的小鼠样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 406 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA-seq offer new insights into the cell fate decision of the primordial germ cells
2025-Mar, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.139136
PMID:39740725
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示原始生殖细胞命运决定的新机制 | 首次通过单细胞RNA测序发现细胞周期驱动细胞异质性，识别了参与PGC自我更新的活跃群体和衰老细胞命运特征 | 未明确说明样本来源物种和具体实验室间重复性问题的量化数据 | 研究培养原始生殖细胞系网络建立的分子动力学机制 | 原始生殖细胞(PGCs) | 单细胞生物学 | 生殖生物学 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 407 | 2025-10-07 |
The relationship between a high-fat diet, gut microbiome, and systemic chronic inflammation: insights from integrated multiomics analysis
2025-Mar, The American journal of clinical nutrition
DOI:10.1016/j.ajcnut.2024.12.026
PMID:39746397
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研究论文 | 通过整合多组学分析探讨高脂饮食、肠道微生物组与系统性慢性炎症之间的因果关系 | 首次采用孟德尔随机化方法结合单细胞测序和转录组学分析，揭示特定肠道菌群在高脂饮食诱导炎症中的介导作用 | 研究数据主要来源于欧洲人群，可能限制结果在其他人群的普适性 | 探究高脂饮食通过肠道微生物组影响系统性慢性炎症的机制 | 人类遗传数据、肠道微生物组、炎症细胞因子、免疫细胞特征、血清代谢物和小鼠结肠组织 | 多组学整合分析 | 代谢性疾病 | 孟德尔随机化, 全基因组关联分析, 转录组测序, 单细胞测序, 代谢组学 | 孟德尔随机化模型, 中介分析 | 遗传数据, 微生物组数据, 转录组数据, 单细胞数据, 代谢组数据 | 欧洲人群GWAS数据和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 408 | 2025-10-07 |
Lymphocytes-Associated Extracellular Vesicles Activate Natural Killer Cells in HNSCC
2025-Mar, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.16440
PMID:39749376
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析头颈鳞状细胞癌中小细胞外囊泡的异质性及其对自然杀伤细胞的激活作用 | 首次在液滴水平分析HNSCC中sEVs的异质性，发现T细胞是sEVs主要分泌源，并揭示其通过sEVs间接激活NK细胞的抗肿瘤机制 | 研究主要基于计算算法SEVtras的分析结果，需要进一步实验验证 | 探究头颈鳞状细胞癌中小细胞外囊泡的异质性及其在肿瘤免疫中的作用机制 | 头颈鳞状细胞癌患者样本中的小细胞外囊泡、T细胞和自然杀伤细胞 | 生物信息学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | SEVtras算法 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 409 | 2025-10-07 |
Persistent pre-exhausted CD8+ T cells shape the tumor immune microenvironment in anaplastic thyroid cancer
2025-Mar-01, Endocrine-related cancer
IF:4.1Q2
DOI:10.1530/ERC-24-0169
PMID:39752183
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析未分化甲状腺癌和乳头状甲状腺癌的肿瘤免疫微环境，重点关注预耗竭CD8+ T细胞的特征及其生物标志物 | 首次在未分化甲状腺癌中发现普遍存在的预耗竭CD8+ T细胞，并通过实验验证GNLY作为其潜在生物标志物 | 需要进一步研究GNLY及其他已识别生物标志物在甲状腺癌免疫应答调控中的功能意义 | 解析未分化甲状腺癌肿瘤免疫微环境的细胞和基因表达动态，为靶向免疫治疗提供依据 | 未分化甲状腺癌和乳头状甲状腺癌患者样本 | 单细胞转录组学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序，免疫荧光染色，共培养实验 | 计算分析流程 | 单细胞转录组数据 | 多个独立的ATC和PTC单细胞转录组数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 410 | 2025-10-07 |
Longitudinal single-cell RNA sequencing reveals a heterogeneous response of plasma cells to colonic inflammation
2025-Mar, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.139307
PMID:39753172
|
研究论文 | 通过纵向单细胞RNA测序揭示浆细胞在结肠炎症中的异质性反应 | 首次在DSS诱导的小鼠结肠炎模型中系统分析浆细胞在不同炎症阶段的动态变化，发现Ube2c+浆细胞亚群的关键作用及Chchd10-C1qbp相互作用的保护机制 | 研究仅使用DSS诱导的小鼠结肠炎模型，结果在人类疾病中的适用性需要进一步验证 | 探究浆细胞在结肠炎症过程中的动态变化和分子机制 | DSS诱导的结肠炎小鼠模型中的浆细胞 | 单细胞组学 | 结肠炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6周龄雄性C57BL/6小鼠结肠组织（炎症高峰期、恢复期和恢复结束期） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 411 | 2025-10-07 |
Analysis of multi-condition single-cell data with latent embedding multivariate regression
2025-Mar, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01996-0
PMID:39753773
|
研究论文 | 提出一种名为LEMUR的潜在嵌入多元回归模型，用于分析多条件单细胞RNA测序数据 | 无需预先进行离散分类即可整合多条件数据并预测基因表达变化 | NA | 识别异质组织中跨条件的基因表达差异 | 癌症、斑马鱼发育和阿尔茨海默病空间梯度中的单细胞数据 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 潜在嵌入多元回归(LEMUR) | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 412 | 2025-10-07 |
LncRNA-MEG3/miR-93-5p/SMAD7 axis mediates proliferative and inflammatory phenotypes of fibroblast-like synoviocytes in rheumatoid arthritis
2025-Mar, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.139390
PMID:39755314
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据，揭示了MEG3/miR-93-5p/SMAD7轴在类风湿关节炎滑膜成纤维细胞增殖和炎症表型中的调控机制 | 首次发现MEG3通过竞争性吸附miR-93-5p促进SMAD7表达，从而缓解RA滑膜成纤维细胞的增殖和炎症表型 | RA的细胞、分子和免疫学机制仍不完全清楚 | 阐明类风湿关节炎滑膜的细胞景观、分化轨迹、转录组特征和免疫浸润特征 | 类风湿关节炎滑膜组织和滑膜成纤维细胞 | 单细胞转录组学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 413 | 2025-10-07 |
Modeling GATA2 deficiency in mice: the R396Q mutation disrupts normal hematopoiesis
2025-Mar, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-024-02508-z
PMID:39774796
|
研究论文 | 本研究通过建立携带R396Q突变的Gata2小鼠模型，揭示了GATA2缺陷对造血系统的早期影响及其与白血病转化的潜在关联 | 首次建立了与白血病进展相关的Gata2 R396Q突变小鼠模型，揭示了不同于以往GATA2缺失模型的特定干细胞亚群偏向性 | 研究仅限于小鼠模型，人类疾病机制的完全重现可能存在物种差异 | 研究GATA2缺陷中R396Q突变对造血系统的影响及白血病转化机制 | 携带Gata2 R396Q突变的转基因小鼠 | 血液病研究 | GATA2缺陷症 | 单细胞RNA测序 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确说明 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 414 | 2025-10-07 |
Targeting Hepatic Stellate Cells for the Prevention and Treatment of Liver Cirrhosis and Hepatocellular Carcinoma: Strategies and Clinical Translation
2025-Mar-31, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ph18040507
PMID:40283943
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综述 | 本文探讨了靶向肝星状细胞预防和治疗肝纤维化/肝硬化及肝细胞癌的策略与临床转化前景 | 提出利用HSC特异性表面标志物和受体实现药物、寡核苷酸和治疗肽的靶向递送，结合单细胞测序和空间转录组学等新技术发现新靶点 | NA | 研究靶向肝星状细胞在肝纤维化和肝细胞癌防治中的策略及临床转化潜力 | 肝星状细胞(HSC)、肌成纤维细胞(MFB)、癌症相关成纤维细胞(CAF) | NA | 肝细胞癌、肝硬化 | 单细胞测序、空间转录组学、组学技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 415 | 2025-10-07 |
scPANDA: PAN-Blood Data Annotator with a 10-Million Single-Cell Atlas
2025-Mar-31, Chinese medical sciences journal = Chung-kuo i hsueh k'o hsueh tsa chih
DOI:10.24920/004472
PMID:40164519
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研究论文 | 开发了一个基于千万级单细胞图谱的泛血液单细胞数据注释工具scPANDA | 利用包含1000万单细胞的大型图谱和三层推理方法，从广泛区室逐步细化到特定细胞簇 | NA | 提高血液系统单细胞RNA测序数据中细胞类型注释的准确性 | 血液系统中的免疫细胞 | 生物信息学 | 血液疾病 | 单细胞RNA测序 | 三层推理方法 | 单细胞RNA测序数据 | 来自16项研究的1000万单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 416 | 2025-10-07 |
Protocol for high-resolution 3D spatial transcriptomics using Open-ST
2025-Mar-21, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103521
PMID:39708325
|
研究论文 | 介绍使用Open-ST进行高效高分辨率2D/3D空间转录组学的实验方案 | 将Illumina流动池重新利用为空间条形码捕获区域，生成与组织学数据对齐的2D/3D分子图谱 | NA | 开发高分辨率空间转录组学方法 | 任何组织样本，包括临床样本 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间分子数据，组织学图像 | NA | Illumina | 空间转录组学 | Illumina流动池 | 重新利用的Illumina流动池作为空间条形码捕获区域 |
| 417 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing reveals tumor microenvironment features associated with the response to neoadjuvant immunochemotherapy in oral squamous cell carcinoma
2025-Mar-19, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04014-2
PMID:40105941
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析新辅助免疫化疗对口腔鳞癌肿瘤微环境的影响 | 首次在口腔鳞癌中通过单细胞测序揭示新辅助免疫化疗响应的肿瘤微环境特征，发现CCL19+成纤维网状细胞亚群与治疗疗效的关联 | 样本量较小（仅4例患者），需要更大规模研究验证 | 优化口腔鳞癌新辅助免疫化疗治疗策略 | 口腔鳞癌患者肿瘤组织、转移淋巴结和正常淋巴结样本 | 数字病理学 | 口腔鳞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 4例口腔鳞癌患者的活检、原发肿瘤、匹配转移淋巴结和正常淋巴结样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 418 | 2025-10-07 |
Hypoxia-Induced Senescent Fibroblasts Secrete IGF1 to Promote Cancer Stemness in Esophageal Squamous Cell Carcinoma
2025-Mar-14, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-1185
PMID:39661488
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现缺氧诱导的衰老成纤维细胞通过分泌IGF1促进食管鳞状细胞癌的肿瘤干细胞特性 | 首次鉴定出缺氧诱导的衰老成纤维细胞亚群，并阐明其通过IGF1-AMPK信号通路促进肿瘤干细胞特性的机制 | 研究主要基于食管鳞状细胞癌模型，在其他癌症类型中的普适性需要进一步验证 | 阐明癌症相关成纤维细胞亚群在促进肿瘤干细胞特性和化疗耐药中的作用机制 | 食管鳞状细胞癌患者样本和癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 食管鳞状细胞癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 419 | 2025-10-07 |
spatialGE Is a User-Friendly Web Application That Facilitates Spatial Transcriptomics Data Analysis
2025-Mar-03, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-2346
PMID:39636739
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研究论文 | 开发了一个名为spatialGE的用户友好型网络应用程序，用于简化空间转录组学数据分析 | 开发了首个无需编程专业知识即可进行空间转录组数据分析的交互式网络应用程序 | 未提及具体的技术限制或性能评估指标 | 降低空间转录组数据分析的技术门槛，使更广泛的研究人员能够利用该技术 | 空间转录组数据分析工具的开发与应用 | 空间转录组学 | 黑色素瘤转移，默克尔细胞癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 两个数据集：黑色素瘤转移队列和默克尔细胞癌样本队列 | 10x Genomics, NanoString | 空间转录组学 | 10x Visium, NanoString CosMx | 10x Visium样本和NanoString CosMx视野 |
| 420 | 2025-10-07 |
Fibroblast Activation Protein-α Expression in Cancer-Associated Fibroblasts Shows the Poor Survival of Colorectal Cancer via Immune-Mediated Pathways : Implications of FAP in Cancer-Associated Fibroblasts Link Immune Dysregulation to Adverse Survival in Colorectal Cancer
2025-Mar, Annals of surgical oncology
IF:3.4Q1
DOI:10.1245/s10434-024-16593-y
PMID:39623187
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研究论文 | 本研究探讨了癌症相关成纤维细胞中FAP-α表达通过免疫介导途径影响结直肠癌患者生存的机制 | 首次通过免疫组化和单细胞RNA测序相结合的方法，系统揭示FAP表达与肿瘤免疫微环境及患者生存的关联 | 样本量相对有限，且为单中心回顾性研究 | 阐明FAP在结直肠癌肿瘤微环境中的作用及其对患者生存的影响 | 结直肠癌患者肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 免疫组化染色, 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 基因表达数据 | 178例患者共180个病理切片，另加10例未治疗患者的单细胞测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |