单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 714 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-04-20 |
Modulation of cell fate by shock wave therapy in ischaemic heart disease
2025-Mar, European heart journal open
DOI:10.1093/ehjopen/oeaf011
PMID:40201592
|
研究论文 | 本研究探讨了心脏冲击波疗法通过激活TLR3受体，促进心脏成纤维细胞向内皮细胞转分化，从而改善缺血性心肌病的心肌灌注和功能 | 首次揭示了冲击波疗法通过机械刺激激活TLR3信号通路，诱导染色质重塑和表观遗传可塑性，从而促进成纤维细胞向内皮细胞转分化的新机制 | 研究主要基于体外细胞实验和转基因小鼠模型，尚未在大型动物或临床患者中进行验证 | 探究冲击波疗法改善缺血性心肌病心脏功能的细胞和分子机制 | 人类心脏成纤维细胞、Fsp1-Cre/LacZ转基因小鼠模型 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、ATAC-seq、RNA轨迹分析 | NA | 单细胞转录组数据、染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 22 | 2026-04-18 |
Tumor infiltration of inactive CD8 + T cells was associated with poor prognosis in Gastric Cancer
2025-03, Gastric cancer : official journal of the International Gastric Cancer Association and the Japanese Gastric Cancer Association
IF:6.0Q1
DOI:10.1007/s10120-024-01577-4
PMID:39722065
|
研究论文 | 本研究探讨了胃癌组织中CD8⁺ T细胞浸润的异质性及其与患者预后的关系，并通过单细胞RNA测序揭示了高浸润组中CD8⁺ T细胞功能失活和肿瘤免疫微环境的特征 | 首次结合免疫组化与单细胞RNA测序，将胃癌患者按CD8⁺ T细胞浸润程度分组，并系统揭示了高浸润组中CD8⁺ T细胞功能失活、低克隆性及免疫抑制微环境的具体机制 | 样本量相对有限（34例进行scRNA-seq），且为单中心研究；未深入探究导致CD8⁺ T细胞失活的具体上游信号通路 | 探究胃癌复杂肿瘤免疫微环境中不同免疫细胞的功能，特别是CD8⁺ T细胞浸润状态与患者预后的关联 | 胃癌患者组织样本（包括肿瘤和正常组织） | 数字病理学 | 胃癌 | 免疫组织化学，单细胞RNA测序 | NA | 图像，单细胞转录组数据 | 157例胃癌患者（免疫组化），其中34例进行了单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 23 | 2026-04-14 |
Tissue-resident memory CD8 T cell diversity is spatiotemporally imprinted
2025-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08466-x
PMID:39843748
|
研究论文 | 本研究探讨了小肠中组织驻留记忆CD8 T细胞多样性的空间和时间印记机制 | 利用空间转录组学、小鼠模型和新型光学编码基因扰动策略，揭示了肠道结构区域化信号支持两种不同T细胞状态，并开发了计算方法来可视化细胞类型和基因表达的空间时间分布 | NA | 研究组织驻留记忆CD8 T细胞多样性的起源和机制 | 人类样本和小鼠模型中的病原体特异性CD8 T细胞 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学, 单转录本分辨率分析 | NA | 转录组数据, 空间位置数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 24 | 2026-04-12 |
Metabolic stress and age drive inflammation and cognitive decline in mice and humans
2025-Mar, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.70060
PMID:40110679
|
研究论文 | 本研究探讨代谢应激和年龄如何驱动小鼠和人类的炎症及认知衰退 | 结合小鼠高脂饮食模型和人类死后脑组织分析，揭示了代谢应激通过微胶质细胞介导的炎症机制（特别是SPP1基因）促进认知衰退，并首次在小鼠和人类中展示空间转录组学数据的一致性 | 研究主要基于动物模型和死后组织，可能无法完全反映活体动态过程；样本量有限，且人类数据来自死后组织，存在潜在偏差 | 探究代谢应激（如肥胖、糖尿病）与认知障碍（包括阿尔茨海默病）之间的机制联系 | 高脂饮食喂养的小鼠模型，以及阿尔茨海默病和2型糖尿病患者的死后脑组织与对照 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据，认知评估数据 | 小鼠模型和人类死后组织样本（具体数量未在摘要中明确） | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 25 | 2026-04-09 |
An Efficient Method for Extracting Human Fallopian Tube Epithelia for Single-cell Analyses
2025-03-28, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/67753
PMID:40228013
|
研究论文 | 本文介绍了一种高效分离人输卵管上皮细胞用于单细胞分析的方法 | 开发了一种能在4-6小时内从新鲜输卵管中分离出高纯度上皮细胞单细胞悬液的新方法，减少了基质细胞污染 | 未明确说明该方法在疾病研究中的具体应用效果或长期培养的稳定性 | 建立一种高效分离人输卵管上皮细胞的方法，以支持单细胞分析等下游研究 | 人输卵管上皮细胞 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 单细胞悬液 | 未指定具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 26 | 2026-04-06 |
Creatine promotes endometriosis progression by inducing M2 polarization of peritoneal macrophages
2025-03-01, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1530/REP-24-0278
PMID:39679878
|
研究论文 | 本研究揭示了肌酸通过诱导腹膜巨噬细胞M2极化，促进子宫内膜异位症的血管生成、纤维化和病变进展 | 首次发现肌酸在子宫内膜异位症中通过重编程巨噬细胞M2极化发挥关键免疫调节作用 | 研究主要基于体外实验和单细胞测序数据分析，缺乏体内模型的直接验证 | 探讨肌酸在子宫内膜异位症发病机制中的作用 | 子宫内膜异位症患者的腹膜巨噬细胞、子宫内膜基质细胞和HUVECs | 单细胞测序 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序, RNA测序 | NA | 单细胞测序数据, RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 27 | 2026-04-03 |
Co-regulator activity of Mediator of DNA Damage Checkpoint 1 (MDC1) is associated with DNA repair dysfunction and PARP inhibitor sensitivity in lobular carcinoma of the breast
2025-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.29.564555
PMID:39677775
|
研究论文 | 本研究探讨了乳腺浸润性小叶癌中MDC1作为ER共调节因子的新功能，及其与DNA修复功能障碍和PARP抑制剂敏感性的关联 | 发现MDC1在ILC细胞中作为ER共调节因子的新活性，这种活性与典型的DNA修复功能失调相关，但缺乏传统DNA修复缺陷特征，并揭示了ILC中一种独特的HR功能障碍形式 | 研究主要基于细胞系和异种移植模型，临床样本验证有限，且未详细探讨MDC1-ER相互作用的分子机制 | 探究MDC1在乳腺浸润性小叶癌中的双重功能及其与DNA修复和PARP抑制剂敏感性的关系 | 乳腺浸润性小叶癌细胞及肿瘤组织 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组分析、DNA修复活性分析、蛋白质相互作用组分析 | NA | 转录组数据、蛋白质相互作用数据、功能实验数据 | 多个ILC异种移植模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 28 | 2026-04-03 |
TEAD3 and TEAD4 play overlapping role in bovine preimplantation development
2025-03-01, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1530/REP-24-0307
PMID:39679917
|
研究论文 | 本研究揭示了在牛胚胎植入前发育过程中，TEAD3和TEAD4转录因子在滋养外胚层命运决定中发挥重要且重叠的功能 | 首次在牛中发现TEAD3特异性表达于滋养外胚层细胞，并证明TEAD3与TEAD4在牛胚胎植入前发育中具有冗余作用，这与小鼠中TEAD4的直接调控作用不同 | 研究主要聚焦于牛胚胎植入前发育阶段，未探讨TEAD3和TEAD4在其他发育阶段或物种中的功能 | 确定TEAD3在牛胚胎植入前发育中的功能角色 | 牛胚胎植入前发育过程中的胚胎细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，RNA干扰，碱基编辑技术，RNA测序分析，免疫荧光分析 | NA | RNA测序数据，免疫荧光图像数据 | 未明确指定样本数量，但涉及牛胚胎植入前发育阶段的胚胎 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 29 | 2026-04-03 |
Key glycometabolism during oocyte maturation and early embryonic development
2025-03-01, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1530/REP-24-0275
PMID:39846956
|
综述 | 本综述探讨了葡萄糖代谢在卵母细胞成熟和早期胚胎发育中的核心作用，及其对能量产生、发育决策和表观遗传调控的影响 | 揭示了葡萄糖、脂肪酸、氨基酸和核苷酸之间的复杂相互作用，并探索了非侵入性代谢监测如何革新胚胎选择和个性化辅助生殖技术 | NA | 推进生殖医学和胚胎学，通过研究代谢过程改善生育治疗结果 | 哺乳动物配子和早期胚胎 | 生殖医学 | 生育障碍 | 单细胞测序、代谢组学、生物信息学 | NA | 代谢数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 30 | 2026-04-01 |
Comparative analysis of nuclei isolation methods for brain single-nucleus RNA sequencing
2025-Mar-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.25.645306
PMID:40196571
|
研究论文 | 本文比较了三种不同的细胞核分离方法对脑组织单核RNA测序数据质量的影响 | 首次系统评估了不同细胞核分离方法对核完整性和后续snRNA-seq数据质量的影响，揭示了方法依赖性差异 | 研究仅针对脑组织，未涵盖其他组织类型；样本量可能有限 | 评估不同细胞核分离方法对单核RNA测序数据质量的影响 | 脑组织 | 单细胞测序 | NA | 单核RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未明确指定样本数量，但涉及脑组织 | NA | 单核RNA-seq | NA | NA |
| 31 | 2026-04-01 |
Smoothie: Efficient Inference of Spatial Co-expression Networks from Denoised Spatial Transcriptomics Data
2025-Mar-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.26.640406
PMID:40060619
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Smoothie的方法，用于从去噪的空间转录组数据中高效推断空间共表达网络 | Smoothie通过高斯平滑去噪空间转录组数据，并构建和整合全基因组共表达网络，利用隐式和显式并行化实现可扩展性，能处理超过1亿个空间解析点 | NA | 从高分辨率空间转录组数据中提取深度生物学见解，包括基因模块检测、功能注释、基因表达与基因组结构关联以及多样本比较 | 空间转录组数据中的基因表达相关性 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 高斯平滑 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 32 | 2026-03-28 |
Novel Meningoencephalomyelitis Associated With Vimentin IgG Autoantibodies
2025-Mar-01, JAMA neurology
IF:20.4Q1
DOI:10.1001/jamaneurol.2024.4763
PMID:39836414
|
研究论文 | 本研究识别了一种与波形蛋白IgG自身抗体相关的新型脑膜脑脊髓炎综合征 | 首次发现并描述了针对星形胶质细胞中间丝蛋白波形蛋白的自身抗体与一种独特的脑膜脑脊髓炎综合征的关联 | 研究为回顾性病例系列，样本量较小（14例患者），且随访时间有限（中位23个月） | 表征一种与未知星形胶质细胞自身抗体相关的脑膜脑脊髓炎综合征 | 患有未明确中枢神经系统自身免疫性疾病且具有相似临床和影像学特征的患者 | 数字病理学 | 神经系统自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、基于细胞的测定、基于组织的测定 | NA | 单细胞RNA测序数据、临床数据、影像学数据 | 14例患者（10例女性，中位年龄33岁），其中2例索引患者的脑脊液细胞进行了scRNA-seq | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 33 | 2026-03-25 |
Integrated single-cell and spatial analysis identifies context-dependent myeloid-T cell interactions in head and neck cancer immune checkpoint blockade response
2025-Mar-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.24.644582
PMID:40196610
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间分析，揭示了头颈癌免疫检查点阻断治疗中髓系细胞与T细胞相互作用的上下文依赖性 | 结合10X Visium和Nanostring CosMx空间组学技术，首次系统性地描述了头颈癌免疫检查点阻断治疗中免疫细胞的空间特征和细胞间相互作用 | 研究样本量相对有限，且主要依赖生物信息学分析，需要进一步的实验验证和临床前动物模型研究 | 探究头颈癌免疫检查点阻断治疗中免疫细胞的空间相互作用及其与治疗反应的关系 | 头颈鳞状细胞癌患者，包括对免疫检查点阻断治疗有反应和无反应的患者 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组学数据, 空间蛋白质组学数据 | 26名患者的522,399个单细胞，以及8名接受免疫检查点阻断治疗患者的空间RNA测序数据 | 10x Genomics, Nanostring | 空间转录组学, 单细胞空间组学 | 10x Visium, Nanostring CosMx | 10X Visium基于点的空间转录组学，Nanostring CosMx单细胞空间组学（包含435个配体和受体的RNA基因面板） |
| 34 | 2026-03-25 |
Single-cell transcriptomics reveals a compartmentalized antiviral interferon response in the nasal epithelium of mice
2025-03-18, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01413-24
PMID:39902863
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了小鼠鼻上皮中抗病毒干扰素反应的细胞类型特异性分区 | 首次在单细胞水平上展示了上呼吸道上皮细胞中I型和III型干扰素抗病毒反应的细胞类型异质性和分区现象 | 研究仅基于小鼠模型，人类鼻上皮中的干扰素反应可能有所不同 | 探究上呼吸道不同上皮细胞亚型对I型和III型干扰素的抗病毒反应差异 | 小鼠鼻上皮细胞，包括嗅觉上皮和呼吸上皮的多种细胞类型 | 单细胞转录组学 | 呼吸道病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量，但分析了小鼠鼻上皮的多种细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 35 | 2026-03-25 |
Conventional and antibody-enhanced DENV infection of human macrophages induces differential immunotranscriptomic profiles
2025-03-18, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01962-24
PMID:39902963
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，比较了人类巨噬细胞在抗体依赖性增强（ADE）和常规感染条件下感染登革病毒后的转录组差异 | 首次在单细胞分辨率下揭示了ADE感染与常规感染登革病毒后，宿主细胞转录组反应的质性差异，并发现这些变化与细胞内病毒RNA载量无关 | 研究仅针对DENV-2血清型和人单核来源巨噬细胞，未涵盖其他血清型或体内其他靶细胞类型 | 阐明抗体依赖性增强（ADE）感染登革病毒的细胞内在分子机制及其在疾病发病中的作用 | 人类单核细胞来源的巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | 登革热 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量，但涉及感染和未感染的异质性细胞培养物 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 36 | 2026-03-21 |
Integrated Single-Cell Transcriptome and eQTL Analyses Reveal the Role of PZP in Aging and Chronic Kidney Disease
2025-03, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.70015
PMID:40058366
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组和eQTL分析，揭示了PZP蛋白在衰老和慢性肾病（CKD）相互作用中的关键作用 | 首次整合单细胞RNA测序、eQTL和孟德尔随机化分析，系统揭示了CD8+中央记忆T细胞及其关键基因PZP在连接衰老与CKD中的遗传和免疫机制 | 样本来源仅限于外周血，未直接分析肾脏组织；样本量相对有限；机制验证主要在关联分析层面，需要进一步的功能实验证实 | 探索衰老与慢性肾病（CKD）相互作用的遗传和免疫机制，并寻找潜在生物标志物和治疗靶点 | 年轻对照个体、老年个体以及慢性肾病（CKD）患者的外周血样本 | 数字病理学 | 慢性肾病 | 单细胞RNA测序, eQTL分析, 孟德尔随机化分析 | NA | 单细胞转录组数据, 基因组数据, 临床指标数据 | 年轻对照、老年个体和CKD患者的外周血样本（具体数量未在摘要中明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 37 | 2026-03-20 |
EGR1 regulates oxidative stress and aldosterone production in adrenal cells and aldosterone-producing adenomas
2025-03, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2025.103498
PMID:39826326
|
研究论文 | 本研究揭示了早期生长反应蛋白1（EGR1）在肾上腺细胞中调控氧化应激和醛固酮生产的双重作用，并探讨了其在醛固酮产生腺瘤（APAs）发病机制中的潜在意义 | 首次发现EGR1在肾上腺细胞中同时调控氧化应激和醛固酮生产，并利用空间转录组学技术揭示了其在APAs中的表达下调与氧化应激标志物减少相关 | 研究主要基于体外细胞实验和动物模型，人类样本分析有限，且EGR1表达与氧化应激之间的具体分子机制尚未完全阐明 | 探究EGR1在肾上腺细胞氧化应激和醛固酮生产调控中的作用，及其在醛固酮产生腺瘤发病机制中的潜在角色 | 人类肾上腺细胞、醛固酮产生腺瘤患者肾上腺组织、猪的肾上腺皮质 | 数字病理学 | 肾上腺肿瘤 | RNA测序、空间转录组学、免疫染色 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、免疫组织化学图像 | 人类肾上腺细胞、APA患者肾上腺组织、猪肾上腺组织 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 38 | 2026-03-20 |
Desflurane attenuates renal ischemia-reperfusion injury by modulating ITGB1/CD9 and reducing oxidative stress in tubular epithelial cells
2025-03, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2025.103490
PMID:39854938
|
研究论文 | 本研究探讨了地氟醚通过调节ITGB1/CD9信号通路和减轻氧化损伤，在肾脏缺血再灌注损伤中的保护作用 | 首次揭示了地氟醚通过调控ITGB1/CD9轴减轻肾脏缺血再灌注损伤的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，尚未在人体中进行验证 | 探究地氟醚对肾脏缺血再灌注损伤的保护作用及其分子机制 | 肾小管上皮细胞和小鼠肾脏缺血再灌注模型 | 单细胞组学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, RT-qPCR, Western blot, TUNEL检测 | 小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据, 转录组数据, 蛋白质表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 39 | 2026-03-20 |
GAMG alleviates liver fibrosis through inducing ferroptosis in inflammatory macrophages via the IRF1/SLC7A11 signaling pathway
2025-03, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2025.103509
PMID:39904190
|
研究论文 | 本研究探讨了天然化合物GAMG通过IRF1/SLC7A11信号通路诱导炎症巨噬细胞铁死亡，从而缓解肝纤维化的作用机制 | 首次揭示了GAMG通过激活IRF1/SLC7A11轴诱导炎症巨噬细胞铁死亡来治疗肝纤维化的新机制 | NA | 探究GAMG对肝纤维化的治疗作用及其分子机制 | 肝纤维化小鼠模型及炎症巨噬细胞 | NA | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序, 质谱代谢组学分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 40 | 2026-03-20 |
Inhibition of glutathione peroxidase 4 suppresses gastric cancer peritoneal metastasis via regulation of RCC2 homeostasis
2025-03, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2025.103519
PMID:39908861
|
研究论文 | 本研究揭示了谷胱甘肽过氧化物酶4（GPx4）通过调节RCC2的稳态来驱动胃癌腹膜转移的分子机制 | 首次阐明了GPx4通过ROS积累激活Aurora A磷酸化，进而导致RCC2在K377位点泛素化降解，从而抑制胃癌腹膜转移的具体信号通路 | 研究主要基于体外和体内实验模型，临床样本验证的规模可能有限，且具体治疗策略的转化潜力有待进一步评估 | 探究GPx4在胃癌进展和转移中的作用机制，并寻找新的治疗靶点 | 胃癌细胞及临床样本 | 肿瘤生物学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），蛋白质组学分析 | NA | 基因表达数据，蛋白质数据 | 回顾性临床样本及实验模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |