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当前共找到 726 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-05 |
Single-cell-guided identification of logic-gated antigen combinations for designing effective and safe CAR therapy
2025-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.19.644074
PMID:40568068
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研究论文 | 开发了一种基于单细胞转录组数据的计算方法，用于识别逻辑门控抗原组合以设计更安全有效的CAR疗法 | 首次利用单细胞转录组数据系统性地识别具有逻辑门控（AND、OR、NOT）的癌症特异性抗原回路，可扩展至五基因组合 | 即使优化的共享回路对某些患者仍然不足，需要个性化设计 | 克服CAR-T细胞疗法在实体瘤治疗中的局限性，提高靶向效果和安全性 | 乳腺癌患者肿瘤细胞和正常细胞 | 计算生物学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序 | 计算方法 | 单细胞转录组数据 | 342例临床患者样本，约200万个细胞（包含>62万个肿瘤细胞） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 22 | 2025-10-05 |
Simultaneous inference for generalized linear models with unmeasured confounders
2025-Mar-15, ArXiv
PMID:37744467
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研究论文 | 提出一种在存在未测量混杂因素情况下进行广义线性模型大规模假设检验的统一框架 | 利用正交结构和线性投影，通过三阶段方法在任意混杂机制下解耦边际和无关混杂效应 | 需要样本量和响应尺寸趋于无穷大才能保证渐近z检验的有效性 | 解决基因组研究中存在未测量混杂因素时的大规模假设检验问题 | 广义线性模型中的多元假设检验 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 广义线性模型, Lasso | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 23 | 2025-10-05 |
Scaling up spatial transcriptomics for large-sized tissues: uncovering cellular-level tissue architecture beyond conventional platforms with iSCALE
2025-Mar-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.25.640190
PMID:40060412
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研究论文 | 开发了一种名为iSCALE的空间转录组学方法，用于分析超出标准平台捕获区域的大尺寸组织 | 能够预测超分辨率基因表达并自动注释大尺寸组织的细胞级组织结构，突破了现有空间转录组学平台的组织捕获区域限制 | NA | 解决现有空间转录组学技术在大尺寸组织分析中的限制 | 多发性硬化症人脑样本 | 空间转录组学 | 多发性硬化症 | 空间转录组学，免疫组织化学染色 | NA | 基因表达数据，空间位置数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 24 | 2025-10-05 |
Dnmt3a-mediated hypermethylation of FoxO3 promotes redox imbalance during osteoclastogenesis
2025-Mar-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2418023122
PMID:40106360
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研究论文 | 本研究揭示了Dnmt3a介导的FoxO3启动子高甲基化通过促进氧化还原失衡影响破骨细胞生成的新机制 | 首次发现Dnmt3a通过调控FoxO3启动子甲基化影响破骨细胞生成，而非通过RANK-TRAF6解离途径 | NA | 探究FoxO3在破骨细胞生成和骨质疏松中的作用机制 | 人股骨头组织、Lysm-Cre;FoxO3 OVX小鼠模型 | 表观遗传学 | 骨质疏松 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 25 | 2025-10-05 |
Intercellular signaling reinforces single-cell level phenotypic transitions and facilitates robust re-equilibrium of heterogeneous cancer cell populations
2025-Mar-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.03.631250
PMID:39803530
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序数据和数学模型研究细胞间信号传导如何影响癌细胞表型可塑性和肿瘤内异质性 | 开发了基于多尺度推断的方法，首次系统揭示细胞间信号传导在小细胞肺癌中强化表型转换并维持群体水平异质性的机制 | 研究方法主要基于计算推断和数学模型，需要进一步实验验证 | 探索细胞间通讯在癌症表型可塑性和肿瘤内异质性中的作用机制 | 小细胞肺癌和其他多种癌症类型的癌细胞 | 计算生物学 | 小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序 | 多尺度推断模型、动力系统模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 26 | 2025-10-05 |
Expansion and pathogenic activation of skeletal muscle-resident macrophages in mdx5cv/Ccr2-/- mice
2025-Mar-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2410095122
PMID:40067893
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了CCR2缺陷型DMD小鼠模型中骨骼肌驻留巨噬细胞的扩增和致病激活机制 | 首次证明在抑制炎性巨噬细胞浸润条件下，骨骼肌驻留巨噬细胞通过增殖发生扩增并获得致病性激活 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类DMD患者中验证 | 探究Duchenne肌营养不良症中巨噬细胞亚群的动态变化及其致病机制 | mdx5cv/Ccr2-/- DMD模型小鼠的骨骼肌组织 | 单细胞生物学 | Duchenne肌营养不良症 | 单细胞RNA测序，基于Cre-loxP的谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据 | 多种基因型小鼠的骨骼肌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 27 | 2025-10-05 |
Integrated 'omics analysis reveals human milk oligosaccharide biosynthesis programs in human lactocytes
2025-Mar-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.17.643803
PMID:40166160
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序数据和HMO浓度测量，揭示人类乳腺细胞中母乳寡糖的生物合成程序 | 首次在单细胞水平识别HMO合成基因的表达模式，发现新的候选基因和转录因子，并揭示HMO合成与乳脂合成基因共表达有限 | 母乳寡糖生物合成途径在哺乳期乳腺中的复杂机制仍未被完全阐明 | 解析人类母乳寡糖在乳腺细胞中的生物合成机制 | 人类乳腺上皮细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据，浓度测量数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 28 | 2025-10-05 |
Response to anti-angiogenic therapy is affected by AIMP protein family activity in glioblastoma and lower-grade gliomas
2025-Mar-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.13.643116
PMID:40161601
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研究论文 | 本研究探讨AIMP蛋白家族在胶质瘤血管生成中的作用及其作为抗血管生成治疗反应预测生物标志物的价值 | 首次揭示AIMP蛋白家族与胶质瘤血管生成的关联，发现AIMP2可作为抗血管生成治疗反应的预测生物标志物 | 回顾性研究设计，需要前瞻性验证 | 研究AIMP蛋白家族在胶质瘤血管生成中的作用及其治疗预测价值 | 胶质母细胞瘤和低级别胶质瘤患者样本 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 单细胞转录组测序，多组学分析，甲基化分析 | Cox比例风险模型，Kaplan-Meier分析 | 转录组数据，表观遗传数据，蛋白质组数据 | 多个队列的胶质瘤样本（TCGA、CGGA、Rembrandt、Gravendeel、BELOB和REGOMA试验） | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 29 | 2025-10-05 |
Ocular immune privilege in action: the living eye imposes unique regulatory and anergic gene signatures on uveitogenic T cells
2025-Mar-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.01.640701
PMID:40297507
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了眼睛对葡萄膜炎原性T细胞的独特调控机制 | 首次在分子水平揭示了眼内T细胞分化为调节性T细胞和无能细胞的平行分化路径 | 研究基于体内免疫特权模型，临床转化需要进一步验证 | 探究眼内免疫特权对T细胞命运的调控机制 | 视网膜特异性T细胞 | 免疫学 | 自身免疫性葡萄膜炎 | 单细胞转录组测序 | 轨迹分析 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 30 | 2025-10-05 |
Decoding neuronal wiring by joint inference of cell identity and synaptic connectivity
2025-Mar-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.04.640006
PMID:40093165
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据和电子显微镜连接组数据，开发了ConnectionMiner计算工具来解析果蝇腿部运动神经回路发育机制 | 开发了ConnectionMiner工具，首次将scRNAseq数据与电子显微镜连接组数据整合，通过概率方法优化细胞类型注释并识别与突触连接强度相关的基因表达特征 | 研究仅聚焦于果蝇腿部运动神经系统，尚未验证其他神经系统的普适性 | 解析运动神经回路在发育过程中的建立机制 | 果蝇腿部运动神经元和前置运动神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 电子显微镜 | 概率模型 | 基因表达数据, 连接组数据 | 多个时间点的腿部运动神经元单细胞数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 31 | 2025-10-05 |
Chronic hyperactivation of midbrain dopamine neurons causes preferential dopamine neuron degeneration
2025-Mar-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.05.588321
PMID:38645054
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研究论文 | 本研究通过化学遗传学方法慢性激活中脑多巴胺神经元，揭示了帕金森病中多巴胺神经元退化的新机制 | 首次建立了慢性激活多巴胺神经元的化学遗传学小鼠模型，证明了神经活动增强会导致黑质多巴胺神经元优先退化 | 动物模型研究，需要进一步验证在人类中的适用性 | 探究慢性神经活动改变在多巴胺神经元退化中的作用机制 | 中脑多巴胺神经元，特别是黑质致密部多巴胺神经元 | 神经科学 | 帕金森病 | 化学遗传学(DREADD)，电生理记录，空间转录组学 | DREADD小鼠模型 | 电生理数据，行为数据，钙成像数据，转录组数据 | DREADD转基因小鼠模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 32 | 2025-10-05 |
Comparative single cell analysis of transcriptional bursting reveals the role of genome organization on de novo transcript origination
2025-Mar-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.29.591771
PMID:38746255
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研究论文 | 通过比较单细胞分析研究转录爆发在精子发生过程中对新转录本起源的作用 | 开发新的统计程序识别198个核心基因，揭示基因组组织对转录爆发和新基因起源的影响机制 | 仅在三密切相关的物种中进行研究，时间跨度2500-3000万年 | 研究转录爆发在精子发生过程中对新转录本起源的调控机制 | 三种密切相关的物种的生殖细胞 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序, RNA荧光原位杂交 | 统计模型 | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 三种物种的生殖细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 33 | 2025-10-05 |
NAD+ prevents chronic kidney disease by activating renal tubular metabolism
2025-Mar-10, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.181443
PMID:40059824
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研究论文 | 本研究揭示了NAD+补充通过激活肾小管代谢预防慢性肾脏病的机制 | 首次在Alport综合征小鼠模型中应用单核RNA测序和空间转录组学技术，并首次报道该模型中转录水平的性别差异 | 研究仅限于Alport综合征小鼠模型，人类临床相关性尚需验证 | 探究NAD+补充保护慢性肾脏病的分子机制和涉及的细胞类型 | Alport综合征小鼠模型和肾近端小管细胞 | 肾脏病学 | 慢性肾脏病 | RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学, 正交成像技术, 生化分析 | 小鼠疾病模型 | 转录组数据, 图像数据, 生化数据 | Alport综合征小鼠模型 | NA | bulk RNA-seq, 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 34 | 2025-10-05 |
Metabolic stress and age drive inflammation and cognitive decline in mice and humans
2025-Mar, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.70060
PMID:40110679
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研究论文 | 本研究探讨代谢应激和年龄如何通过炎症机制导致小鼠和人类认知功能下降 | 首次结合小鼠高脂饮食模型与人类死后脑组织分析，揭示代谢应激通过小胶质细胞介导的炎症机制导致认知障碍，并识别SPP1作为潜在治疗靶点 | 研究主要基于动物模型和死后组织，难以完全模拟人类疾病进程；样本量有限 | 阐明代谢应激因素通过免疫系统失调和炎症机制导致认知障碍的病理机制 | 高脂饮食喂养的小鼠模型；阿尔茨海默病和2型糖尿病患者的死后脑组织与对照组 | 神经科学 | 阿尔茨海默病, 2型糖尿病 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 认知行为数据, 代谢数据 | 小鼠模型和人类死后脑组织样本（具体数量未明确说明） | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 35 | 2025-10-05 |
Genome-wide prediction of dominant and recessive neurodevelopmental disorder-associated genes
2025-Mar-06, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2025.02.001
PMID:40015282
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研究论文 | 提出一种利用机器学习加速神经发育障碍风险基因识别的计算方法 | 首次证明仅使用单细胞RNA测序数据训练的模型能稳健预测NDD风险基因，并发现单等位基因和双等位基因遗传模式在发育中人皮层中的表达差异 | 未明确说明样本规模和具体数据来源的局限性 | 加速神经发育障碍风险基因的发现和识别 | 自闭症谱系障碍、发育性和癫痫性脑病、发育迟缓相关的风险基因 | 机器学习 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序, 机器学习 | 半监督机器学习框架(mantis-ml) | 基因表达数据, 蛋白互作数据, 遗传耐受度指标 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 36 | 2025-10-06 |
A Phase I Clinical Trial Adding OX40 Agonism to In Situ Therapeutic Cancer Vaccination in Patients with Low-Grade B-cell Lymphoma Highlights Challenges in Translation from Mouse to Human Studies
2025-Mar-03, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-2770
PMID:39745391
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研究论文 | 评估OX40激动剂联合原位癌症疫苗治疗低级别B细胞淋巴瘤的I期临床试验 | 首次在人体中测试OX40激动剂BMS986178联合TLR9激动剂SD101和低剂量放疗的协同治疗效果 | 样本量较小（14例患者），临床结果不如临床前小鼠模型理想，存在种属差异和T细胞亚群复杂性等转化障碍 | 评估T细胞共刺激受体激动剂在癌症免疫治疗中的安全性和有效性 | 低级别B细胞淋巴瘤患者 | 癌症免疫治疗 | B细胞淋巴瘤 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 临床数据，分子生物学数据 | 14例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 37 | 2025-10-06 |
Spatiotemporal Profiling Defines Persistence and Resistance Dynamics during Targeted Treatment of Melanoma
2025-Mar-03, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-0690
PMID:39700408
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学分析黑色素瘤靶向治疗过程中的克隆谱系演化，揭示了耐药性的时空动态机制 | 首次结合空间转录组学和深度学习分析，在患者来源异种移植模型中实时追踪治疗过程中的克隆进化，识别了持久性细胞状态的关键特征和潜在治疗脆弱性窗口 | 研究基于患者来源异种移植模型，可能与人类体内真实情况存在差异；样本规模相对有限 | 阐明BRAF突变黑色素瘤靶向治疗中耐药性产生的时空动态机制 | BRAF突变黑色素瘤患者来源异种移植模型 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学，深度学习，系统发育追踪 | 深度学习模型 | 空间转录组数据，组织病理切片图像 | 患者来源异种移植模型样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 38 | 2025-10-06 |
Systematic reconstruction of molecular pathway signatures using scalable single-cell perturbation screens
2025-Mar, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-025-01622-z
PMID:40011560
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研究论文 | 本研究利用单细胞扰动测序技术系统重建分子通路特征 | 开发了改进的计算框架Mixscale处理扰动效率的细胞变异，并优化了差异表达基因列表和保守分子特征的学习方法 | NA | 系统识别信号调节因子在不同生物环境中的靶标 | 六种细胞系和五种生物信号环境中的1500多个扰动 | 功能基因组学 | NA | Perturb-seq, 组合索引, 下一代测序 | Mixscale计算框架 | 单细胞测序数据 | 超过1500个扰动，涉及六种细胞系 | NA | 单细胞测序, 扰动测序 | NA | NA |
| 39 | 2025-10-06 |
Segger: Fast and accurate cell segmentation of imaging-based spatial transcriptomics data
2025-Mar-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.14.643160
PMID:40161614
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研究论文 | 开发了一种基于图神经网络的新型细胞分割方法segger，用于成像空间转录组学数据 | 将细胞分割构建为转录本到细胞的链接预测任务，能够利用单细胞RNA-seq信息改进转录本分配 | NA | 解决成像空间转录组学中转录本准确分配到原始细胞的技术挑战 | 成像空间转录组学数据中的细胞和转录本 | 空间转录组学 | NA | 成像空间转录组学，单细胞RNA-seq | 图神经网络(GNN) | 空间转录组学图像数据 | 多个Xenium数据集基准测试 | 10x Genomics | 成像空间转录组学 | Xenium | 10x Genomics Xenium空间转录组学平台 |
| 40 | 2025-10-06 |
Erythroid progenitor cell-mediated spleen-tumor interaction deteriorates cancer immunity
2025-Mar-04, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2417473122
PMID:40014568
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研究论文 | 本研究揭示了红细胞祖细胞介导的脾脏-肿瘤相互作用如何通过免疫抑制机制恶化癌症免疫 | 首次发现红细胞祖细胞在脾脏与肿瘤之间建立免疫抑制桥梁的新机制 | 研究主要聚焦头颈鳞状细胞癌，在其他癌症类型中的普适性需进一步验证 | 探索肿瘤发展过程中系统性免疫的动态变化及其对免疫治疗的影响 | 红细胞祖细胞、脾脏-肿瘤相互作用、癌症免疫微环境 | 免疫学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |