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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-01-17 |
LSD1 inhibition corrects dysregulated MHC-I and dendritic cells activation through IFNγ-CXCL9-CXCR3 axis to promote antitumor immunity in HNSCC
2025-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.17.643710
PMID:40166238
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研究论文 | 本研究阐明了LSD1抑制通过IFNγ-CXCL9-CXCR3轴调控MHC-I和树突状细胞激活,从而增强头颈鳞状细胞癌抗肿瘤免疫的机制 | 首次揭示了LSD1抑制通过激活H3K4me2并直接与MHC-I相互作用来诱导抗肿瘤免疫的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外共培养实验,在人体内的直接验证尚不充分 | 阐明LSD1在头颈鳞状细胞癌抗肿瘤免疫中的作用机制 | 头颈鳞状细胞癌小鼠模型、人类头颈鳞状细胞癌细胞、外周血单个核细胞 | 肿瘤免疫学 | 头颈鳞状细胞癌 | 流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | 小鼠模型、人类细胞系、TCGA数据库数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 22 | 2026-01-14 |
A Latent Activated Olfactory Stem Cell State Revealed by Single-Cell Transcriptomic and Epigenomic Profiling
2025-Mar-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.26.564041
PMID:37961539
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和表观基因组分析,揭示了嗅觉上皮干细胞在损伤诱导再生过程中的潜在激活状态 | 结合单细胞基因表达和可及染色质谱,识别了激活干细胞在命运决定阶段的转录异质性,并发现了一类静息细胞在损伤前已表观遗传学上准备好激活 | NA | 研究嗅觉上皮干细胞在损伤诱导再生过程中的分子机制 | 嗅觉上皮干细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据,可及染色质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 23 | 2026-01-10 |
Molecular evidence for pre-chordate origins of ovarian cell types and neuroendocrine control of reproduction
2025-Mar-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.24.644836
PMID:40196654
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研究论文 | 本研究利用海星作为非脊索动物代表,通过单细胞RNA测序和高分辨率3D成像技术,揭示了卵巢细胞类型及其空间组织,为卵巢细胞类型的保守性起源和神经内分泌控制提供了分子证据 | 首次在非脊索动物(海星)中定义了卵巢细胞类型工具包,并发现卵巢内存在与哺乳动物相似的颗粒细胞样和膜细胞样细胞,以及一个与脊椎动物下丘脑-垂体-性腺轴相似的神经内分泌信号系统 | 研究基于海星这一特定物种,可能无法完全代表所有非脊索动物或脊索动物的卵巢进化过程,且未进行功能验证实验 | 从生物医学和进化角度理解卵子发生的机制,探索卵巢细胞类型及其信号相互作用的进化起源 | 海星(作为非脊索动物后口动物代表)的卵巢组织 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),高分辨率3D成像 | NA | 单细胞转录组数据,3D图像数据 | 未明确指定样本数量,但基于海星卵巢组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 24 | 2026-01-07 |
Intrinsic OASL expression licenses interferon induction during influenza A virus infection
2025-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.14.643375
PMID:40166309
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研究论文 | 本文通过分析流感A病毒感染细胞的单细胞RNA测序数据,揭示了宿主因子OASL的内在表达对IFNL诱导的关键作用 | 开发了一种分析时间序列单细胞RNA测序数据的方法,以识别调控细胞间干扰素诱导异质性的宿主因子,并首次发现干扰素刺激基因OASL的内在表达是流感A病毒感染中IFNL稳健诱导所必需的 | 未明确说明样本量或实验设计的详细限制,可能局限于流感A病毒感染的特定模型 | 识别在病毒感染中调控细胞间干扰素诱导异质性的宿主因子 | 流感A病毒感染的细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 25 | 2026-01-02 |
Mediation of macrophage M1 polarization dynamics change by ubiquitin-autophagy-pathway regulated NLRP3 inflammasomes in PD-1 inhibitor-related myocardial inflammatory injury
2025-Mar-18, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-024-01979-1
PMID:40097836
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研究论文 | 本研究探讨了PD-1抑制剂相关心肌炎中,泛素-自噬通路调控的NLRP3炎症小体介导巨噬细胞M1极化动态变化的机制 | 揭示了PD-1抑制剂通过激活STAT1/NF-κB/NLRP3信号通路驱动巨噬细胞向M1表型极化,并首次阐明泛素-自噬通路通过降解NLRP3炎症小体促进炎症消退和巨噬细胞向M2表型转换的动态过程 | 研究主要基于动物和细胞模型,临床样本量有限,需要更大规模的前瞻性临床研究验证 | 阐明免疫检查点抑制剂(ICIs)诱导心肌炎的发病机制,探索潜在治疗靶点 | 肺癌患者(发生ICIs诱导心肌炎者)、动物模型、细胞模型 | NA | 肺癌、心肌炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 临床数据、单细胞测序数据 | 未明确具体样本数量,涉及本机构肺癌患者队列、动物模型和细胞模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 26 | 2026-01-01 |
Disturbed Flow Induces Reprogramming of Endothelial Cells to Immune-like and Foam Cells under Hypercholesterolemia during Atherogenesis
2025-Mar-07, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4397799/v1
PMID:40092444
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研究论文 | 本研究验证了“双重打击”假说,即紊乱血流是内皮细胞部分重编程的初始诱因,但需要高胆固醇血症才能诱导完全的内皮重编程和动脉粥样硬化斑块形成 | 首次在遗传谱系示踪模型中验证了血流诱导的内皮细胞重编程假说,并发现了内皮细胞向免疫样细胞和泡沫细胞转变的新现象 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据的验证仍需进一步深入 | 探究紊乱血流和高胆固醇血症在动脉粥样硬化发生过程中对内皮细胞重编程的协同作用 | 小鼠动脉内皮细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学染色,谱系示踪 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | 来自95只小鼠的98,553个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 27 | 2026-01-01 |
Disturbed Flow Induces Reprogramming of Endothelial Cells to Immune-like and Foam Cells under Hypercholesterolemia during Atherogenesis
2025-Mar-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.06.641843
PMID:40093090
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和谱系追踪技术,验证了在动脉粥样硬化形成过程中,紊乱血流与高胆固醇血症共同诱导内皮细胞向免疫样细胞和泡沫细胞重编程的机制 | 首次提出并验证了“两阶段假说”,即紊乱血流是内皮细胞部分重编程的初始诱因,但需要高胆固醇血症才能诱导完全重编程和动脉粥样硬化斑块发展,并发现了内皮细胞向泡沫细胞转化的新现象 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据的验证依赖于公开数据集,且实验时间点仅限于2周和4周,可能未覆盖长期动态变化 | 探究紊乱血流和高胆固醇血症在动脉粥样硬化形成中对内皮细胞重编程的协同作用机制 | 小鼠动脉内皮细胞,特别是暴露于紊乱血流的左颈总动脉区域 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学染色,谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | 95只小鼠,共98,553个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 28 | 2025-12-26 |
The peripheral Atf3 + neuronal population is responsible for nerve regeneration at the early stage of nerve injury revealed by single-cell RNA sequencing
2025-03-25, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2024169
PMID:39539109
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠背根神经节在神经损伤早期出现的一个表达Atf3的新神经元亚群,该亚群与神经再生密切相关 | 首次在单细胞分辨率下鉴定出CCI诱导的Atf3高表达神经元亚群,并揭示其作为促再生群体的转录特征及与卫星胶质细胞的细胞间通讯网络 | 研究仅聚焦于损伤后第3天的早期阶段,未涵盖完整的再生过程动态变化 | 探究周围神经损伤后感觉神经元再生状态的转录组变化机制 | 小鼠背根神经节细胞 | 单细胞组学 | 周围神经损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 29 | 2025-12-26 |
High throughput identification of genetic regulators of microglial inflammatory processes in Alzheimer's disease
2025-Mar-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.09.642133
PMID:40161839
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研究论文 | 本研究通过CRISPRi筛选和单细胞RNA测序,系统探究了阿尔茨海默病GWAS变异如何调控人源诱导多能干细胞衍生小胶质细胞的炎症反应 | 首次将CRISPRi筛选与单细胞RNA测序(CROP-seq)结合,系统鉴定AD遗传风险因子对小胶质细胞炎症状态的调控功能 | 研究主要基于体外诱导的小胶质细胞模型,可能无法完全模拟体内复杂微环境 | 阐明阿尔茨海默病遗传风险因子对小胶质细胞炎症反应的调控机制 | 人源诱导多能干细胞衍生的小胶质细胞 | 单细胞组学 | 阿尔茨海默病 | CRISPR抑制筛选, 单细胞RNA测序, CROP-seq | CRISPRi筛选模型 | 单细胞转录组数据 | 针对119个AD GWAS位点进行筛选 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 30 | 2025-12-24 |
High-throughput single cell -omics using semi-permeable capsules
2025-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.14.642805
PMID:40166174
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研究论文 | 本文介绍了一种基于半透性胶囊(SPCs)的通用技术,用于多种高通量单细胞组学分析,包括数字PCR、基因组测序、单细胞RNA测序以及基于核酸标记的FACS分选 | 开发了基于半透性胶囊(SPCs)的通用技术,克服了液滴微流控系统在长期单细胞培养和克隆扩增方面的根本限制,并展示了其在单细胞RNA测序(CapSeq)中具有优异的转录本捕获能力 | 未在摘要中明确说明 | 开发一种通用、可定制、高灵敏度且广泛适用的高通量单细胞组学技术平台 | 造血系统疾病患者的白细胞,特别是急性髓系白血病(AML)样本中的成熟粒细胞和单核细胞 | 单细胞组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq),数字PCR,基因组测序,FACS | NA | 核酸序列数据,转录组数据 | 未在摘要中明确说明具体数量,但涉及患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 基于半透性胶囊(SPCs)的胶囊测序方法(CapSeq) |
| 31 | 2025-12-21 |
Androgen Signaling in Type 2 Innate Lymphoid Cells Drives Sex Differences in Helicobacter -Induced Gastric Inflammation and Atrophy
2025-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.14.643321
PMID:40166158
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研究论文 | 本研究揭示了雄激素通过调节2型先天淋巴细胞(ILC2s)的活化来抑制幽门螺杆菌诱导的胃部炎症,从而解释了男性胃癌发病率高于女性的机制 | 首次发现雄激素通过调控ILC2s来影响幽门螺杆菌感染后的胃部炎症反应,并揭示了性别差异在胃癌发病中的分子机制 | 研究基于小鼠模型,结果在人类中的适用性需进一步验证 | 探究雄激素如何影响幽门螺杆菌感染后的胃部炎症反应,并解释性别差异在胃癌发病中的作用 | C57BL/6小鼠的胃部组织及免疫细胞 | 免疫学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 雄性及雌性C57BL/6小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 32 | 2025-12-20 |
Constructing a disease-specific ceRNA coregulatory network for keratoconus diagnosis and landscape of the immune environment
2025-Mar-22, International ophthalmology
IF:1.4Q3
DOI:10.1007/s10792-025-03488-4
PMID:40119981
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研究论文 | 本研究通过构建疾病特异性ceRNA共调控网络和免疫环境分析,为圆锥角膜的早期诊断提供了新的生物标志物和分子机制见解 | 首次整合疾病特异性PPI和ceRNA网络,结合ElasticNet算法开发诊断模型和诺模图,并应用多种反卷积方法解码圆锥角膜的免疫微环境 | 研究基于公共数据库的转录组数据,缺乏独立验证队列和实验验证 | 确定圆锥角膜的潜在疾病特异性基因生物标志物并描绘其免疫环境 | 圆锥角膜患者与对照组的转录组数据 | 生物信息学 | 圆锥角膜 | 转录组数据分析 | ElasticNet算法 | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 33 | 2025-12-05 |
Splenic TNF-α signaling potentiates the innate-to-adaptive transition of antiviral NK cells
2025-Mar-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.02.012
PMID:40023159
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了巨细胞病毒感染期间,脾脏TNF-α信号通路如何通过调控NF-κB信号促进NK细胞从固有免疫向适应性免疫的转变 | 首次发现脾脏微环境中TNF-α/TNFR2信号通过激活经典和非经典NF-κB通路,分别调控NK细胞的效应功能和适应性前体细胞分化,阐明了组织特异性信号在NK细胞免疫记忆形成中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人体内的验证尚需进一步研究;对TNF-α信号与其他细胞因子网络的相互作用探讨有限 | 探究病毒感染过程中NK细胞在脾脏微环境获得适应性免疫特征的分子机制 | 巨细胞病毒感染模型中的自然杀伤细胞 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序,纵向追踪 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 34 | 2025-11-29 |
Sequencing-free whole genome spatial transcriptomics at molecular resolution in intact tissue
2025-Mar-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.06.641951
PMID:40161724
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研究论文 | 开发了一种名为RAEFISH的新型空间转录组技术,可在完整组织中实现全基因组覆盖和单分子空间分辨率 | 首次实现无需测序的全基因组空间转录组分析,同时保持单分子空间分辨率 | 技术尚未在更广泛的生物医学应用中验证 | 开发高覆盖度高分辨率的空间转录组技术 | 人类和小鼠的完整组织切片及培养细胞 | 空间转录组学 | NA | RAEFISH(反向挂锁扩增子编码荧光原位杂交) | NA | 图像数据 | NA | NA | 空间转录组学,图像分析 | RAEFISH | 反向挂锁扩增子编码荧光原位杂交技术,可检测23,000种人类转录本或22,000种小鼠转录本 |
| 35 | 2025-11-29 |
New Multiomic Studies Shed Light on Cellular Diversity and Neuronal Susceptibility in Parkinson's Disease
2025-Mar, Movement disorders : official journal of the Movement Disorder Society
IF:7.4Q1
DOI:10.1002/mds.30097
PMID:39812497
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综述 | 本文综述了多组学技术在帕金森病细胞多样性和神经元易感性研究中的最新进展 | 整合空间转录组学、表观基因组学和蛋白质组学等多组学方法研究帕金森病 | NA | 揭示帕金森病中神经元易感性网络和疾病修饰因子 | 帕金森病患者和啮齿类动物模型中的神经元和胶质细胞 | 生物信息学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,表观基因组学,蛋白质组学 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 36 | 2025-11-24 |
Investigating pulmonary neutrophil responses to inflammation in mice via flow cytometry
2025-Mar-14, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiae189
PMID:39212489
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研究论文 | 本文详细描述了通过流式细胞术评估小鼠肺部中性粒细胞表型的实验方案 | 提供了从肺组织和气道分离单细胞并进行全面染色的详细步骤方案,适用于中性粒细胞异质性分析 | NA | 探索肺部中性粒细胞在生理和病理条件下的复杂功能 | 小鼠肺部中性粒细胞 | NA | 肺部炎症 | 流式细胞术 | NA | 流式细胞数据 | NA | NA | 流式细胞术 | NA | NA |
| 37 | 2025-11-21 |
Diversity and heterogeneity in human pancreaticobiliary maljunction revealed by single-cell RNA sequencing
2025-Mar-21, Pediatric surgery international
IF:1.5Q3
DOI:10.1007/s00383-025-05997-w
PMID:40116982
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示人类胰胆管合流异常的细胞多样性和异质性 | 首次在单细胞水平系统描绘胰胆管合流异常的细胞图谱,发现成纤维细胞亚型的主导作用及WNT/TWEAK信号通路异常激活 | 样本量较小(仅6例患者),需更大规模研究验证 | 阐明胰胆管合流异常的病因和发病机制 | 胰胆管合流异常患者和非患者的胆管组织 | 单细胞组学 | 胰胆管合流异常 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6例患者(3例PBM,3例非PBM) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 38 | 2025-11-14 |
Efficient count-based models improve power and robustness for large-scale single-cell eQTL mapping
2025-Mar-05, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.01.18.25320755
PMID:40093202
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研究论文 | 提出了一种基于计数模型的高效单细胞eQTL定位框架jaxQTL,用于大规模单细胞转录组数据分析 | 开发了首个专门针对单细胞RNA-seq稀疏计数数据的高效eQTL定位框架,能够识别低表达eGenes和远端eQTLs | NA | 提高大规模单细胞eQTL定位的效率和准确性 | 单细胞转录组数据中的表达数量性状位点 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | 负二项模型 | 单细胞转录组计数数据 | 982个样本(OneK1K数据集) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 39 | 2025-11-05 |
Integrated Spheroid-to-Population Framework for Evaluating PFHpA-Associated Metabolic Dysfunction and Steatotic Liver Disease
2025-Mar-04, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5960979/v1
PMID:40092438
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研究论文 | 本研究通过整合3D肝球体模型和人群队列数据,评估PFHpA暴露与代谢功能障碍相关脂肪性肝病的关系 | 开发了从球体到人群的整合框架,结合单细胞转录组学和多组学数据揭示PFHpA诱导MASLD的分子机制 | 研究主要基于肥胖青少年队列,结果可能不适用于其他人群 | 阐明短链PFAS同系物PFHpA在MASLD发病机制中的作用 | 肥胖青少年队列和3D人肝球体模型 | 生物医学研究 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 单细胞转录组学, 多组学分析, 3D球体培养 | LUCID模型 | 转录组数据, 蛋白质组数据, 代谢组数据, 临床数据 | Teen-LABS队列中接受减肥手术的肥胖青少年 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 40 | 2025-10-29 |
Whole-Genome Sequencing Reveals Individual and Cohort Level Insights into Chromosome 9p Syndromes
2025-Mar-30, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.03.28.25324850
PMID:40196253
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研究论文 | 通过全基因组测序对100名9p相关综合征患者进行基因组分析,揭示了染色体9p综合征的个体和队列水平特征 | 首个大规模全基因组测序研究9p相关综合征,识别了两个新的晚复制区域,建立了基于机器学习的9p缺失综合征预测模型 | 样本量相对有限,需要进一步扩大研究队列 | 深入理解染色体9p缺失和重复综合征的基因组结构和发病机制 | 100名来自9p相关综合征家庭的个体,包括85名无关先证者 | 基因组学 | 染色体异常综合征 | 全基因组测序,空间转录组学,机器学习 | 机器学习模型 | 基因组序列数据,基因表达数据 | 100名个体(85名无关先证者) | NA | 全基因组测序,空间转录组学 | NA | NA |