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当前共找到 722 篇文献，本页显示第 321 - 340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2025-10-07 |
CD271high cancer stem cells regulate macrophage polarization in head and neck squamous cell carcinoma
2025-Mar, Oral oncology
IF:4.0Q2
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现CD271高表达的头颈鳞状细胞癌干细胞具有调控巨噬细胞极化的功能 | 首次揭示CD271作为头颈鳞癌干细胞标志物通过调控巨噬细胞极化影响肿瘤免疫微环境的新机制 | 研究样本量有限，主要聚焦于下咽鳞状细胞癌，需要更多临床样本验证 | 探究CD271高表达癌干细胞的干性特征及其与肿瘤免疫微环境的相互作用 | 头颈鳞状细胞癌组织和细胞，C57BL/6小鼠模型 | 单细胞测序分析 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，qPCR，免疫染色，体内有限稀释实验 | NA | 单细胞RNA测序数据，基因表达数据，流式细胞数据 | 头颈鳞癌组织样本和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 322 | 2025-10-07 |
Desflurane attenuates renal ischemia-reperfusion injury by modulating ITGB1/CD9 and reducing oxidative stress in tubular epithelial cells
2025-Mar, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2025.103490
PMID:39854938
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研究论文 | 本研究探讨地氟醚通过调节ITGB1/CD9信号通路减轻肾缺血再灌注损伤的作用机制 | 首次揭示地氟醚通过调控ITGB1/CD9轴减轻肾小管上皮细胞氧化应激和凋亡的保护机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，需要进一步临床验证 | 探究地氟醚对肾缺血再灌注损伤的保护作用及分子机制 | 肾小管上皮细胞和肾缺血再灌注损伤小鼠模型 | 生物医学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, Western blot, TUNEL检测 | 小鼠肾缺血再灌注模型 | 基因表达数据, 蛋白质数据, 生化指标 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 323 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome reveals three types of adipocytes associated with intramuscular fat content in pigs
2025-Mar, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.110998
PMID:39855485
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示了猪肌肉组织中三种与肌内脂肪含量相关的脂肪细胞类型 | 首次在猪肌肉组织中鉴定出三种先前未表征的脂肪细胞类型，并发现这些细胞比例与肌内脂肪含量密切相关 | 研究仅针对成年猪的肌肉组织，未涉及其他发育阶段或组织类型 | 探究猪肌内脂肪形成的细胞类型组成和基因调控机制 | 猪肌肉组织中的细胞类型 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据 | 成年猪肌肉组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 324 | 2025-10-07 |
Protocol for mitochondrial variant enrichment from single-cell RNA sequencing using MAESTER
2025-Mar-21, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103564
PMID:39817913
|
研究论文 | 介绍一种从单细胞RNA测序数据中富集线粒体DNA变异以同时研究细胞状态和克隆结构的实验方案 | 开发了从3'端条形码全长cDNA中富集mtDNA变异的protocol，可同时获取细胞状态和克隆信息 | NA | 建立同时分析细胞状态和组织克隆结构的实验方法 | 人类原代组织 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序, mtDNA变异富集, 双端测序 | maegatk | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 3'端条形码全长cDNA |
| 325 | 2025-10-07 |
The Microscope and Beyond: Current Trends in the Characterization of Kidney Allograft Rejection From Tissue Samples
2025-03-01, Transplantation
IF:5.3Q1
DOI:10.1097/TP.0000000000005153
PMID:39436268
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综述 | 本文综述了当前用于增强肾脏移植排斥反应特征描述的新兴技术工具 | 整合了数字病理学、深度学习、多重免疫组化、转录组学和空间转录组学等创新工具，有望解决Banff分类系统的局限性 | Banff分类系统主要依赖活检组织，缺乏可重复性和精细度，组织病理学损伤和批量组织转录组学分析在准确推断排斥反应发病机制方面存在疑问 | 增强从组织样本中表征肾脏移植排斥反应的能力 | 肾脏移植排斥反应的组织样本 | 数字病理学 | 肾脏移植排斥反应 | 深度学习, 多重免疫组化, 转录组学, 单细胞转录组学, 空间转录组学 | 深度学习 | 组织切片图像, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 326 | 2025-10-07 |
Biological and clinical significance of tumour-infiltrating lymphocytes in the era of immunotherapy: a multidimensional approach
2025-Mar, Nature reviews. Clinical oncology
DOI:10.1038/s41571-024-00984-x
PMID:39820025
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综述 | 本文探讨肿瘤浸润淋巴细胞在免疫治疗时代的生物学和临床意义，并提出系统性研究框架 | 提出多维度的TIL研究概念框架，整合单细胞技术、空间平台和计算模型的最新进展 | 缺乏标准化的TIL量化策略，对不同TIL亚群功能特征和空间分布的研究不足 | 系统评估肿瘤浸润淋巴细胞的生物学特性和作为免疫检查点抑制剂生物标志物的潜力 | 肿瘤浸润淋巴细胞及其亚群 | 肿瘤免疫学 | 实体肿瘤 | 单细胞转录组学、蛋白质组学、空间组学 | 计算模型 | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 327 | 2025-10-07 |
Intratumoral Collagen Deposition Supports Angiogenesis Suggesting Anti-angiogenic Therapy in Armored and Cold Tumors
2025-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202409147
PMID:39823457
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研究论文 | 本研究系统分析了胶原沉积与肿瘤血管生成的关系，发现装甲冷肿瘤具有最高血管生成活性并验证了抗血管生成治疗的疗效 | 首次系统揭示胶原沉积通过SOX18上调驱动肿瘤血管生成的机制，并提出装甲冷肿瘤作为抗血管生成治疗的新型生物标志物 | 研究主要聚焦肺腺癌，在其他癌症类型中的普适性需要进一步验证 | 探究胶原沉积对肿瘤血管生成的影响及治疗意义 | 实体肿瘤（重点关注肺腺癌）、成纤维细胞、内皮细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组测序,空间转录组学,体外实验 | NA | 基因表达数据,空间分布数据 | 多个晚期肺腺癌队列 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 328 | 2025-10-07 |
YTHDF2-mediated m6A modification of ONECUT2 promotes stemness and oxaliplatin resistance in gastric cancer through transcriptionally activating TFPI
2025-Mar, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2024.101200
PMID:39823826
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研究论文 | 本研究揭示了YTHDF2介导的ONECUT2 m6A修饰通过转录激活TFPI促进胃癌干细胞特性和奥沙利铂耐药性的分子机制 | 首次发现ONECUT2+TFPI+胃癌细胞亚群在奥沙利铂耐药肿瘤微环境中的作用，并阐明YTHDF2-m6A-ONECUT2-TFPI信号轴 | 研究主要基于细胞和小鼠模型，需要进一步临床验证 | 鉴定胃癌奥沙利铂耐药相关的细胞亚群并解析其分子机制 | 胃癌细胞、小鼠模型、肿瘤微环境 | 癌症生物学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序，m6A修饰分析 | 细胞模型，小鼠模型 | 基因表达数据，测序数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 329 | 2025-10-07 |
Investigating subpopulation dynamics in clonal CHO-K1 cells with single-cell RNA sequencing
2025-Mar, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2025.01.010
PMID:39824362
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序研究克隆CHO-K1细胞中亚群动态变化 | 首次在单细胞水平揭示克隆CHO细胞中低产亚群的存在及其与基因表达不稳定性的关联 | 需要进一步的多组学研究来更好表征这种异质性 | 研究克隆CHO细胞中亚群动态与稳定性表型的关系 | 两个具有不同稳定性表型的克隆CHO-K1细胞群体 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 两个克隆CHO-K1细胞群体在90天培养期内的样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 330 | 2025-10-07 |
scRNA-seq reveals involvement of monocytes in immune response in SLE patients
2025-Mar, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.110994
PMID:39818255
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示系统性红斑狼疮患者单核细胞参与免疫反应的机制 | 首次通过scRNA-seq技术系统性分析SLE患者循环免疫细胞中单核细胞的炎症上调现象，并发现IRF1在单核细胞中的高表达 | 样本量有限，需要更大规模研究验证；机制研究不够深入 | 探索系统性红斑狼疮患者单核细胞的炎症因子特征和免疫反应机制 | 系统性红斑狼疮患者和健康志愿者的循环免疫细胞 | 单细胞组学 | 系统性红斑狼疮 | scRNA-seq, 流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据 | SLE患者和健康志愿者（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 331 | 2025-10-07 |
Unveiling the role of MDH1 in breast cancer drug resistance through single-cell sequencing and schottenol intervention
2025-Mar, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.111608
PMID:39818404
|
研究论文 | 通过单细胞测序揭示MDH1在乳腺癌耐药中的作用，并发现植物甾醇Schottenol通过下调MDH1增强紫杉醇敏感性 | 首次发现MDH1在乳腺癌耐药中的关键调控作用，并验证植物甾醇Schottenol通过靶向MDH1增强化疗敏感性 | NA | 研究MDH1在乳腺癌耐药中的作用机制及潜在治疗策略 | 乳腺癌细胞、正常上皮细胞、髓系细胞、肿瘤浸润淋巴细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 332 | 2025-10-07 |
Investigating the Prognostic Role of Telomerase-Related Cellular Senescence Gene Signatures in Breast Cancer Using Machine Learning
2025-Mar-30, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13040826
PMID:40299459
|
研究论文 | 本研究通过整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，建立了与端粒维持和细胞衰老相关的基因特征，用于乳腺癌预后预测 | 开发了包含19个关键端粒和衰老相关基因的新型预后特征，并采用包含101种算法组合的机器学习框架进行模型构建 | NA | 研究端粒酶相关细胞衰老基因特征在乳腺癌中的预后作用 | 乳腺癌患者 | 机器学习 | 乳腺癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学 | 随机生存森林, 岭回归 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 来自TCGA和GEO数据库的多个独立队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 333 | 2025-10-07 |
A multi-view graph convolutional network framework based on adaptive adjacency matrix and multi-strategy fusion mechanism for identifying spatial domains
2025-Mar-29, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf172
PMID:40233119
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研究论文 | 提出了一种基于自适应邻接矩阵和多策略融合机制的多视图图卷积网络框架STMGAMF，用于识别空间转录组数据中的空间域 | 采用自适应邻接矩阵动态调整边权重以捕捉复杂空间结构，并通过多策略融合机制优化嵌入特征 | NA | 解决空间转录组数据中空间域识别的挑战 | 空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 多视图图卷积网络 | 基因表达数据和空间位置信息 | 多个空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 334 | 2025-10-07 |
Migrasome-Related Genes as Potential Prognosis and Immunotherapy Response Predictors for Colorectal Cancer
2025-Mar-26, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13040799
PMID:40299331
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研究论文 | 通过生物信息学分析迁移体相关基因在结直肠癌预后和免疫治疗反应中的潜在作用 | 首次系统研究迁移体相关基因在结直肠癌预后和免疫治疗反应中的预测价值 | 基于公共数据库的回顾性分析，缺乏实验验证 | 探索迁移体相关基因作为结直肠癌预后和免疫治疗反应预测标志物的潜力 | 结直肠癌患者和相关的基因表达数据 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，加权基因共表达网络分析，差异表达基因分析 | 风险预测模型 | 基因表达数据 | TCGA-CRC数据集和GSE231559单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 335 | 2025-10-07 |
Migrasome Marker Epidermal Growth Factor Domain-Specific O-GlcNAc Transferase: Pan-Cancer Angiogenesis Biomarker and the Potential Role of circ_0058189/miR-130a-3p/EOGT Axis in Hepatocellular Carcinoma Progression and Sorafenib Resistance
2025-Mar-22, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13040773
PMID:40299340
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研究论文 | 本研究系统分析了迁移体标志物EOGT在泛癌中的致癌机制，特别聚焦于其在肝细胞癌进展和索拉非尼耐药中的作用 | 首次确立EOGT作为泛癌血管生成生物标志物，并发现外泌体circ_0058189/miR-130a-3p/EOGT轴在肝细胞癌治疗耐药中的调控机制 | EOGT在泛癌中的功能和治疗意义仍需进一步探索 | 系统表征EOGT在恶性肿瘤中的致癌机制，特别关注肝细胞癌进展和索拉非尼耐药 | 33种癌症类型的TCGA/GTEx数据、10个肝细胞癌队列、Huh7细胞模型 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | 多组学分析、空间/单细胞转录组学、RNA测序、ceRNA网络构建 | NA | 基因组数据、转录组数据、单细胞数据、空间转录组数据 | 33种癌症类型的TCGA/GTEx数据、10个肝细胞癌队列 | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | NA |
| 336 | 2025-10-07 |
Protocol for transcriptomic and epigenomic analyses of tip-like endothelial cells using scRNA-seq and ChIP-seq
2025-Mar-21, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103326
PMID:39799578
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研究论文 | 本文提出了一种用于分析尖端样内皮细胞转录组和表观基因组的实验方案 | 开发了结合单细胞RNA测序和染色质免疫沉淀测序的综合分析方案，适用于多种组学研究 | NA | 建立尖端样内皮细胞的转录组和表观基因组分析流程 | 人脐静脉内皮细胞（HUVECs） | 表观基因组学 | NA | scRNA-seq, ChIP-seq | NA | 转录组数据, 表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 染色质免疫沉淀测序 | NA | NA |
| 337 | 2025-10-07 |
Protocol for the isolation of silk glands from silkworms for snRNA-seq and spatial transcriptomics
2025-Mar-21, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103581
PMID:39804771
|
研究论文 | 本文提供了一个从蚕中分离丝腺并进行单核RNA测序和空间转录组学分析的实验方案 | 开发了专门针对蚕丝腺的核分离和高质量组织切片制备方法，首次实现了丝腺细胞在单细胞分辨率下的空间分布研究 | 该方案主要针对蚕丝腺组织，可能不适用于其他昆虫组织，且需要专门的实验设备和技术 | 建立蚕丝腺单核RNA测序和空间转录组学分析的标准实验流程 | 蚕的丝腺组织 | 空间转录组学 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学, 冷冻切片, RNA捕获测序 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 338 | 2025-10-07 |
Developing and experimental validating a T cell senescence-related gene signature to predict prognosis and immunotherapeutic sensitivity in non-small cell lung cancer
2025-Mar-15, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149233
PMID:39800199
|
研究论文 | 开发并实验验证了一个T细胞衰老相关基因特征，用于预测非小细胞肺癌的预后和免疫治疗敏感性 | 首次构建了基于T细胞衰老相关基因的风险模型，并通过多组学数据和实验验证其在NSCLC预后和免疫治疗预测中的价值 | 研究样本量相对有限，需要更大规模的前瞻性研究验证 | 预测非小细胞肺癌患者的预后和免疫治疗敏感性 | 非小细胞肺癌患者组织和T细胞 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 机器学习, 多变量Cox回归, 细胞共培养实验 | 多变量Cox回归模型, 机器学习算法 | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据, 临床数据 | TCGA-NSCLC数据集训练，8个GEO独立队列验证，10对癌旁和癌组织 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 339 | 2025-10-07 |
Comparative Single-Cell Transcriptomics of Human Neuroblastoma and Preclinical Models Reveals Conservation of an Adrenergic Cell State
2025-Mar-14, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-1507
PMID:39808065
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研究论文 | 通过单细胞转录组学比较人类神经母细胞瘤与临床前模型的细胞状态保守性 | 首次通过单细胞RNA测序系统比较TH-MYCN转基因小鼠模型、体外肿瘤球与人类神经母细胞瘤的转录景观，发现肾上腺素能细胞状态的保守性 | 研究主要基于TH-MYCN转基因小鼠模型，其他神经母细胞瘤模型的适用性仍需验证 | 验证临床前模型对人类神经母细胞瘤细胞身份的再现程度 | 人类神经母细胞瘤患者样本、TH-MYCN转基因小鼠肿瘤、体外肿瘤球培养物 | 单细胞转录组学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类神经母细胞瘤患者样本、TH-MYCN小鼠肿瘤样本、体外肿瘤球培养物 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 340 | 2025-10-07 |
An augmented GSNMF model for complete deconvolution of bulk RNA-seq data
2025-Mar-14, Mathematical biosciences and engineering : MBE
DOI:10.3934/mbe.2025036
PMID:40296800
|
研究论文 | 提出一种增强的GSNMF模型用于批量RNA-seq数据的完全解卷积分析 | 开发了伪批量组织数据增强的几何结构引导NMF模型(GSNMF+)，通过统计分布模拟伪细胞组成和单细胞RNA-seq数据生成伪批量组织数据，并利用估计的重缩放矩阵调整NMF最小值 | 在奇异细胞组成场景中表现较好，但未明确说明在其他复杂场景中的适用性限制 | 解决批量RNA-seq数据完全解卷积分析的数学不适定问题，提高细胞类型特异性基因表达谱和相对细胞丰度估计的准确性 | 批量RNA-seq数据和单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, scRNA-seq | NMF, GSNMF | 基因表达数据 | 多个真实批量组织数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |