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当前共找到 709 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2025-10-06 |
Targeting of arachidonic acid-modulated autophagy to enhance the sensitivity of ROS1 + or ALK + non-small cell lung cancer to crizotinib therapy
2025-Mar-31, Translational lung cancer research
IF:4.0Q1
DOI:10.21037/tlcr-2025-105
PMID:40248722
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研究论文 | 本研究揭示了花生四烯酸通过调节自噬流促进ROS1+或ALK+非小细胞肺癌对克唑替尼耐药的机制 | 首次发现STAT3磷酸化失活和PTGS2下调导致花生四烯酸积累，进而通过促进自噬流驱动克唑替尼耐药的新机制 | 研究主要基于细胞系模型，尚未进行体内动物实验验证 | 阐明克唑替尼耐药机制并寻找克服耐药的新治疗策略 | ROS1+或ALK+非小细胞肺癌细胞系(HCC78和H3122) | 癌症生物学 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序,代谢组学分析 | 细胞耐药模型 | 基因表达数据,代谢物数据 | 2种细胞系,3个类器官样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 222 | 2025-10-06 |
Integrative spatial omics reveals distinct tumor-promoting multicellular niches and immunosuppressive mechanisms in Black American and White American patients with TNBC
2025-Mar-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.17.585428
PMID:38562769
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研究论文 | 本研究通过整合空间多组学分析揭示了三阴性乳腺癌中黑人与白人患者肿瘤微环境的种族差异 | 首次结合成像质谱流式技术和空间转录组学系统比较不同种族TNBC患者的肿瘤微环境特征 | 样本量有限，研究结果需要在更大队列中验证 | 探究三阴性乳腺癌临床结局种族差异的生物学机制 | 自我认同为黑人和白人的三阴性乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 成像质谱流式技术,空间转录组学 | NA | 图像,空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 223 | 2025-10-06 |
When is prostate cancer really cancer?
2025-Mar-01, Journal of the National Cancer Institute
DOI:10.1093/jnci/djae200
PMID:39350309
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综述 | 探讨前列腺癌分级组1是否应被归类为癌症的国际研讨会观点总结 | 提出基于空间转录组学证据重新定义前列腺癌诊断标准，挑战传统病理学分类 | 患者在没有癌症诊断情况下是否愿意接受持续监测尚不明确 | 降低前列腺癌死亡率同时减少过度诊断和过度治疗带来的危害 | 前列腺癌分级组1的诊断标准和临床意义 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 空间转录组学 | NA | 组织切片 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 224 | 2025-10-06 |
Tissue nanotransfection-based endothelial PLCγ2-targeted epigenetic gene editing rescues perfusion and diabetic ischemic wound healing
2025-Mar-05, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.01.034
PMID:39863930
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研究论文 | 本研究通过组织纳米转染技术靶向内皮细胞PLCγ2基因的表观遗传编辑，改善糖尿病缺血性伤口的灌注和愈合 | 首次结合单细胞RNA测序指导的CRISPR-dCas9去甲基化技术与组织纳米转染技术，靶向改善糖尿病伤口内皮细胞功能 | 研究主要关注PLCγ2基因，未探讨其他可能影响糖尿病伤口愈合的基因或通路 | 改善糖尿病缺血性伤口的血管化和愈合效果 | 糖尿病缺血性伤口的内皮细胞 | 基因编辑与再生医学 | 糖尿病并发症 | 单细胞RNA测序, CRISPR-dCas9表观遗传编辑, 组织纳米转染 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据 | 人类伤口边缘样本（五个内皮细胞亚群）和鼠类糖尿病缺血伤口模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 225 | 2025-10-06 |
Graph neural networks for single-cell omics data: a review of approaches and applications
2025-Mar-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf109
PMID:40091193
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综述 | 系统回顾图神经网络在单细胞组学数据分析中的应用方法和研究成果 | 首次系统综述了107个图神经网络及其六种变体在单细胞组学中的成功应用，并总结了77个常用公开数据集 | 当前研究存在潜在不足，未来需要进一步探索改进方向 | 探讨图神经网络在单细胞组学数据分析中的应用现状和发展前景 | 单细胞组学数据及其分析任务 | 机器学习 | NA | 单细胞测序技术 | 图神经网络(GNN)及其六种变体 | 单细胞组学数据 | 77个公开数据集 | NA | 单细胞表观基因组学, 单细胞转录组学, 空间转录组学, 蛋白质组学, 多组学 | NA | NA |
| 226 | 2025-10-06 |
Multimodal single-cell analyses reveal molecular markers of neuronal senescence in human drug-resistant epilepsy
2025-Mar-03, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI188942
PMID:40026248
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研究论文 | 通过整合全细胞膜片钳记录和单细胞RNA测序方法，揭示耐药性癫痫中神经元衰老的分子标记 | 首次在耐药性癫痫患者脑组织中鉴定出具有衰老特征的皮质锥体神经元亚群，并发现其表达特定的衰老标记基因 | 研究样本量有限，且主要关注皮质锥体神经元，未全面评估其他神经元类型 | 探索耐药性癫痫患者脑组织中神经元的分子特征和病理机制 | 耐药性癫痫患者脑组织中的皮质锥体神经元和小鼠癫痫模型 | 神经科学 | 耐药性癫痫 | 全细胞膜片钳记录, 单细胞RNA测序 | NA | 电生理记录数据, 基因表达数据 | 耐药性癫痫患者脑组织样本和小鼠癫痫模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 227 | 2025-10-06 |
Individualized therapy guided by single-cell sequencing in anti-GABAAR encephalitis
2025-Mar-08, Translational psychiatry
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41398-025-03300-y
PMID:40057475
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研究论文 | 通过单细胞测序指导抗GABAAR脑炎的个体化治疗 | 首次在抗GABAAR脑炎中发现单克隆CD8 T细胞群和异常JAK-STAT信号通路，并鉴定出LMO5蛋白作为交叉反应抗原 | 仅基于单个病例研究，样本量有限 | 探索抗GABAAR脑炎的发病机制并指导个体化治疗 | 一名难治性抗GABAAR脑炎患者和四名健康志愿者的PBMCs及脑脊液细胞 | 单细胞测序 | 自身免疫性脑炎 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1名患者和4名健康志愿者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 228 | 2025-10-06 |
Islet single-cell transcriptomic profiling during obesity-induced beta cell expansion in female mice
2025-Mar-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112031
PMID:40104055
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组技术揭示了肥胖雌性小鼠中胰岛β细胞增殖的协调转录机制 | 首次在肥胖雌性小鼠模型中通过单细胞转录组学识别出经历未折叠蛋白反应、应激解决和细胞周期进程的不同β细胞群体，并发现Xbp1和Myc在缓解UPR和刺激β细胞增殖中的协调作用 | 研究仅针对雌性小鼠模型，结果可能不适用于雄性或其他物种 | 探索肥胖诱导的β细胞增殖的分子机制 | 雌性基因敲除小鼠的胰岛β细胞 | 单细胞生物学 | 糖尿病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 雌性基因敲除小鼠胰岛 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 229 | 2025-10-06 |
Alevin-fry-atac enables rapid and memory frugal mapping of single-cell ATAC-seq data using virtual colors for accurate genomic pseudoalignment
2025-Mar-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.27.625771
PMID:39677745
|
研究论文 | 本文介绍了一种用于单细胞ATAC-seq数据快速映射的新工具alevin-fry-atac，采用虚拟颜色增强的伪对齐方案 | 提出了一种改进的伪对齐方案，通过将参考基因组划分为'虚拟颜色'（重叠的固定最大范围区域），解决了大基因组参考映射的挑战 | NA | 开发快速、内存高效且准确的单细胞ATAC-seq数据处理方法 | 单细胞ATAC-seq数据的映射和处理 | 生物信息学 | NA | 单细胞ATAC-seq | 伪对齐算法 | 基因组测序数据 | NA | NA | 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 230 | 2025-10-06 |
Radiation-induced cellular plasticity primes glioblastoma for forskolin-mediated differentiation
2025-Mar-04, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2415557122
PMID:40009641
|
研究论文 | 本研究利用辐射诱导的细胞可塑性状态，联合毛喉素促进胶质母细胞瘤细胞分化 | 发现辐射可诱导胶质瘤细胞进入多能状态，为毛喉素介导的分化治疗创造机会 | NA | 探索辐射联合毛喉素对胶质母细胞瘤分化治疗的效果 | 胶质母细胞瘤细胞系、胶质瘤干细胞、小鼠模型 | 肿瘤学 | 胶质母细胞瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 极限稀释实验 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 231 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics identifies molecular niche dysregulation associated with distal lung remodeling in pulmonary fibrosis
2025-Mar, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02080-x
PMID:39901013
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术揭示了肺纤维化中远端肺重塑相关的分子生态位失调 | 开发了基于图像的空间转录组学方法，结合细胞基础和细胞不可知分析，首次在肺纤维化中识别出分子定义的多样化空间生态位 | 研究样本数量相对有限（35个肺组织），且主要关注肺纤维化特定病理阶段 | 解析肺纤维化疾病发病机制中的空间背景和分子变化 | 人类肺组织样本，包括对照和肺纤维化患者的远端肺组织 | 空间转录组学 | 肺纤维化 | 空间转录组学，机器学习，轨迹分析 | 机器学习模型 | 空间基因表达数据，图像数据 | 35个独特肺组织的160万个细胞 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 232 | 2025-10-06 |
Exploring and mitigating shortcomings in single-cell differential expression analysis with a new statistical paradigm
2025-Mar-17, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03525-6
PMID:40098192
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研究论文 | 提出GLIMES统计框架以解决单细胞差异表达分析中的关键挑战 | 开发了基于广义泊松/二项混合效应模型的新统计范式，直接利用UMI计数和零比例而非相对丰度 | 方法验证主要基于模拟数据和三个案例研究，需要更广泛的实验验证 | 改进单细胞转录组学中的差异表达分析方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 广义泊松/二项混合效应模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 233 | 2025-10-06 |
Heterozygous GAA knockout is nonconsequential on metabolism and the spatial liver transcriptome in high-fat diet-induced obese and prediabetic mice
2025-Mar, Physiological reports
IF:2.2Q3
DOI:10.14814/phy2.70276
PMID:40108792
|
研究论文 | 本研究探讨杂合GAA基因敲除对高脂饮食诱导肥胖小鼠肝脏代谢和空间转录组的影响 | 首次使用空间转录组学技术分析高脂饮食对门静脉周围和肝静脉周围肝细胞转录组的差异影响 | 研究仅使用小鼠模型，结果可能不直接适用于人类 | 评估GAA基因杂合敲除对肝脏代谢和代谢健康的影响 | 高脂饮食诱导的肥胖和糖尿病前期小鼠模型 | 空间转录组学 | 代谢疾病 | 空间转录组学分析 | 基因敲除小鼠模型 | 空间转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 234 | 2025-10-06 |
Crafted experiments to evaluate feature selection methods for single-cell RNA-seq data
2025-Mar, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf023
PMID:40109353
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研究论文 | 提出了一种基于真实数据集信号扰动的实验构建方法，用于评估单细胞RNA测序数据的特征选择方法 | 开发了基于真实数据集信号扰动的实验构建新方法，解决了单细胞RNA测序数据分析方法评估中缺乏真实基准数据集的挑战 | 未提及具体的数据集规模或实验验证的局限性 | 评估单细胞RNA测序数据的特征选择方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | GOF（基于单变量分布的特征选择方法套件） | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 235 | 2025-10-06 |
SUV39H1 maintains cancer stem cell chromatin state and properties in glioblastoma
2025-Mar-10, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.186344
PMID:40059829
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研究论文 | 本研究揭示了组蛋白甲基转移酶SUV39H1在胶质母细胞瘤干细胞维持中的关键作用及其作为治疗靶点的潜力 | 首次发现SUV39H1通过超级增强子介导的激活在胶质母细胞瘤干细胞中特异性高表达，并证明其通过调控染色质可及性维持肿瘤干细胞特性 | NA | 探究SUV39H1在胶质母细胞瘤干细胞维持中的作用机制及治疗潜力 | 胶质母细胞瘤干细胞 | 肿瘤生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,全细胞RNA测序,ATAC测序 | NA | 基因表达数据,染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,ATAC-seq | NA | NA |
| 236 | 2025-10-06 |
An international perspective on the future of systemic sclerosis research
2025-Mar, Nature reviews. Rheumatology
DOI:10.1038/s41584-024-01217-2
PMID:39953141
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综述 | 本文从国际视角探讨系统性硬化症研究的未来发展方向 | 整合单细胞RNA测序、空间生物学、人工智能等前沿技术，提出全球合作研究框架 | 未提供具体研究数据，主要基于现有研究进展的展望性分析 | 推动系统性硬化症的机制理解和个性化治疗发展 | 系统性硬化症患者群体 | 自然语言处理 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序、新一代测序、空间生物学、转录组学、基因组学、蛋白质组学、代谢组学、微生物组分析、人工智能 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 237 | 2025-10-06 |
CRISPRi-based screens in iAssembloids to elucidate neuron-glia interactions
2025-Mar-05, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2024.12.016
PMID:39814010
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研究论文 | 开发了一种基于CRISPRi筛选的iAssembloids系统，用于研究神经元与胶质细胞相互作用的分子机制 | 首次将CRISPRi筛选技术应用于3D共培养的iPSC衍生神经元和胶质细胞系统，建立了可扩展的因果分子机制研究平台 | 基于体外培养系统，可能无法完全模拟体内大脑环境的复杂性 | 阐明神经元与胶质细胞相互作用的分子机制，特别是对神经元存活和死亡的控制 | iPSC衍生的神经元和胶质细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | CRISPRi筛选，单细胞转录组学 | iAssembloids 3D共培养系统 | 基因表达数据，功能筛选数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 238 | 2025-10-06 |
A single-cell sequencing-based analysis of a 13-year-old with maxillary sinus NUT carcinoma
2025-Mar, Oral oncology
IF:4.0Q2
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析13岁上颌窦NUT癌患者的肿瘤异质性和免疫微环境特征 | 首次在NUT癌中应用单细胞测序技术揭示肿瘤上皮细胞的异质性和免疫微环境特征 | 仅分析单例患者样本，样本量有限 | 探索NUT癌的肿瘤生物学特性和潜在治疗靶点 | 13岁上颌窦NUT癌患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | NUT癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例患者肿瘤组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 239 | 2025-10-06 |
[Research Advances in the Replication of Animal Models for Periodontal Diseases]
2025-Mar-20, Sichuan da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Sichuan University. Medical science edition
DOI:10.12182/20250360103
PMID:40599292
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综述 | 本文综述了近年来牙周病动物模型建模方法与特点，并提出整合空间转录组学等技术的多模态评估框架 | 提出整合空间转录组学、单细胞测序和荧光成像技术的多模态评估框架以解决现有模型局限 | 现有牙周炎动物模型难以同时捕捉疾病复杂性、追踪动态修复过程并满足转化需求 | 研究牙周病动物模型的建模方法与评估体系 | 啮齿类动物牙周病模型 | NA | 牙周病 | 空间转录组学, 单细胞测序, 荧光成像 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞测序 | NA | NA |
| 240 | 2025-10-06 |
Human Neonatal MR1T Cells Have Diverse TCR Usage, are Less Cytotoxic and are Unable to Respond to Many Common Childhood Pathogens
2025-Mar-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.17.643805
PMID:40166301
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析新生儿和成人MR1T细胞的差异，发现新生儿MR1T细胞具有更丰富的TCR多样性、较低的细胞毒性和对常见儿童病原体反应能力不足的特点 | 首次系统比较新生儿与成人MR1T细胞的TCR多样性、功能表型和病原体识别能力差异，并通过结构生物学揭示新生儿MAIT TCR与抗原结合亲和力降低的分子机制 | 样本量较小（新生儿和成人各5例），且仅研究了脐带血来源的细胞 | 探究新生儿MR1T细胞的免疫特性及其与新生儿感染易感性的关系 | 新生儿脐带血和成人外周血中的MR1T细胞 | 免疫学 | 新生儿败血症 | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序, 结构生物学分析 | NA | 单细胞转录组数据, TCR序列数据, 结构生物学数据 | 5例新生儿脐带血样本和5例成人外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序 | NA | NA |