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当前共找到 712 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2025-10-06 |
Identification of Causal Plasma Proteins in Hepatocellular Carcinoma via Two-Sample Mendelian Randomization and Integrative Transcriptomic‒Proteomic Analysis
2025-03-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0553
PMID:39991825
|
研究论文 | 通过两样本孟德尔随机化和整合转录组-蛋白质组分析鉴定肝细胞癌中的因果血浆蛋白 | 首次结合大规模血浆蛋白质组数据和孟德尔随机化方法鉴定肝细胞癌的因果血浆蛋白，并通过单细胞RNA测序数据和分子对接验证 | 研究依赖于UK Biobank Pharma Proteomics Project的数据，样本来源相对单一 | 鉴定肝细胞癌的早期诊断和治疗靶点 | 肝细胞癌患者和相关的血浆蛋白质 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 两样本孟德尔随机化，单细胞RNA测序，分子对接 | 孟德尔随机化模型 | 蛋白质组数据，基因组数据，单细胞RNA测序数据 | UK Biobank Pharma Proteomics Project的大规模样本 | NA | 蛋白质组学，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 202 | 2025-10-06 |
BubR1 Controls Heart Development by Promoting Expression of Cardiogenesis Regulators
2025-Mar-18, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.124.038286
PMID:40055864
|
研究论文 | 本研究通过心脏特异性敲除BubR1基因，揭示了其在心脏发育中的关键调控作用 | 首次发现BubR1通过调控关键心脏发育基因表达和Wnt信号通路来确保心脏形态发生的正常时序 | 研究仅限于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 探究BubR1基因突变导致先天性心脏缺陷的分子机制 | 小鼠胚胎心脏发育过程 | 发育生物学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序，轨迹分析，CellChat信号通路分析 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 条件性基因敲除小鼠胚胎 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 203 | 2025-10-06 |
Proximal tubule cells contribute to the thin descending limb of the loop of Henle during mouse kidney development
2025-Mar-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.14.633065
PMID:39868227
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研究论文 | 本研究通过整合小鼠肾脏单细胞RNA测序数据和谱系追踪实验，揭示了近端小管细胞在肾脏发育过程中对髓袢降支细段形成的贡献 | 首次发现近端小管细胞可分化形成髓袢降支细段细胞，并证实转录因子Hnf4a在此过程中的关键调控作用 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类或其他物种中验证 | 探究肾脏发育过程中髓袢降支细段细胞的起源和形成机制 | 发育中的小鼠肾脏细胞 | 发育生物学 | 肾脏发育疾病 | 单细胞RNA测序，谱系追踪，基因敲除 | NA | 单细胞基因表达数据 | 整合多个非突变发育小鼠肾脏数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 204 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome analysis reveals atypical monocytes circulating ahead of acute graft-versus-host disease clinical onset
2025-Mar-14, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiae229
PMID:39432735
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析发现急性移植物抗宿主病临床发病前循环中的非典型单核细胞 | 首次在aGVHD临床发病前长达18天的血液样本中发现特定单核细胞和细胞毒性T细胞亚群，并鉴定出CD163/SIGLEC1共表达单核细胞作为早期生物标志物 | 样本量较小（3例患者+1例对照），需要更大规模研究验证 | 探索急性移植物抗宿主病的早期诊断生物标志物 | 异基因造血干细胞移植患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据 | 3例aGVHD患者+4例对照患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 205 | 2025-10-06 |
CoupleVAE: coupled variational autoencoders for predicting perturbational single-cell RNA sequencing data
2025-Mar-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf126
PMID:40178283
|
研究论文 | 提出一种名为CoupleVAE的耦合变分自编码器方法，用于预测扰动后的单细胞RNA测序数据 | 通过两个耦合的VAE和连接器实现潜在空间中更复杂的单细胞状态转换，在三个真实数据集上验证了其优越性能 | NA | 预测单细胞扰动响应，解决计算生物学领域的关键挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器(VAE) | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 206 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic analysis and luteolin treatment reveal three adipogenic genes, including Aspn, Htra1 and Efemp1
2025-03, Biochimica et biophysica acta. Molecular and cell biology of lipids
DOI:10.1016/j.bbalip.2024.159585
PMID:39662603
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析发现Aspn、Htra1和Efemp1是木犀草素可上调的脂肪生成抑制基因 | 首次通过比较肥胖与瘦小鼠脂肪干祖细胞的单细胞转录组数据，鉴定出三个新的脂肪生成抑制基因，并发现木犀草素能逆转这些基因的表达下调 | 研究主要基于小鼠模型和3T3-L1细胞系，尚未在人类样本中验证 | 鉴定新的脂肪生成相关基因并探索木犀草素的调控作用 | 小鼠皮下脂肪组织中的脂肪干祖细胞和3T3-L1前脂肪细胞系 | 单细胞组学 | 肥胖 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三个独立单细胞RNA测序数据集 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 207 | 2025-10-06 |
20 years of stemness: From stem cells to hypertranscription and back
2025-03-11, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102406
PMID:39919752
|
综述 | 回顾干细胞转录组学20年发展历程，探讨干细胞超转录状态的发现与意义 | 发现2002年干细胞特征基因签名实际上是干细胞超转录状态的标志，这一发现早于超转录概念的确立 | NA | 回顾干细胞转录组学研究进展，探讨干细胞超转录状态的特征与意义 | 胚胎干细胞和成体干细胞 | 转录组学 | NA | 微阵列，单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 208 | 2025-10-06 |
Profiling immune cell tissue niches in the spatial -omics era
2025-Mar, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.11.001
PMID:39522655
|
综述 | 本文综述了空间组学技术在免疫细胞组织生态位研究中的最新进展，并提出了定义免疫生态位的三步框架 | 提出了定义和表征免疫生态位的三步框架，整合了空间多参数分析的最新方法学进展 | 免疫生态位的定义标准在文献中存在不一致性，且空间分析方法仍在发展中 | 探讨空间组学技术如何促进对组织免疫景观的深入理解 | 免疫细胞及其组织环境 | 空间组学 | 免疫相关疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间多组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 209 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing and machine learning provide candidate drugs against drug-tolerant persister cells in colorectal cancer
2025-03, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2025.167693
PMID:39870146
|
研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和机器学习方法，在结直肠癌患者来源类器官中识别药物耐受持久性细胞并筛选候选药物 | 首次在家族性腺瘤性息肉病相关类器官中应用单细胞RNA测序和机器学习识别DTP细胞，并发现YM-155和THZ2与曲美替尼的协同作用 | 研究仅基于三个患者来源类器官样本，样本量有限 | 开发针对结直肠癌中药物耐受持久性细胞的靶向治疗策略 | 家族性腺瘤性息肉病患者来源的类器官（良性肿瘤、恶性肿瘤和正常类器官） | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据 | 3个患者来源类器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 210 | 2025-10-06 |
Integrated analyses uncover new features of atypical memory B cells and novel targets for intervention
2025-03, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2025.152877
PMID:39938454
|
研究论文 | 本研究通过整合分析揭示了非典型记忆B细胞的新特征及其在系统性风湿性疾病中的致病作用 | 首次系统鉴定非典型记忆B细胞的转录组特征、免疫表型和信号通路，并证实其在系统性风湿性疾病中的扩增现象 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证功能机制 | 表征非典型记忆B细胞的免疫特征及其在系统性风湿性疾病中的致病机制 | B细胞亚群，特别是非典型记忆B细胞 | 免疫学 | 系统性风湿性疾病 | 单细胞RNA测序，质谱流式细胞术，生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据，蛋白质表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 211 | 2025-10-06 |
Follicular cytotoxic T cells is dysfunctional in chronic hepatitis B patients with non-alcoholic fatty liver disease
2025-03, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2024.167646
PMID:39743024
|
研究论文 | 本研究探讨了慢性乙型肝炎合并非酒精性脂肪肝病患者中滤泡细胞毒性T细胞的异质性和功能状态 | 首次揭示CHB合并NAFLD患者中Tfc细胞的记忆特性和功能受损机制，发现氧化还原平衡调节可部分恢复效应记忆表型 | 样本量相对有限（87例），且为单中心研究 | 探索慢性乙型肝炎合并非酒精性脂肪肝病患者中滤泡细胞毒性T细胞的异质性和功能状态 | 32名健康对照、36名初治CHB患者、19名初治CHB+NAFLD患者 | 免疫学 | 慢性乙型肝炎, 非酒精性脂肪肝病 | 多色流式细胞术, 单细胞RNA测序, 细胞共培养 | NA | 流式细胞数据, 单细胞转录组数据 | 87例（32健康对照+36 CHB患者+19 CHB+NAFLD患者） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 212 | 2025-10-06 |
LINC02363: a potential biomarker for early diagnosis and treatment of sepsis
2025-Mar-15, BMC immunology
IF:2.9Q3
DOI:10.1186/s12865-025-00702-x
PMID:40089725
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研究论文 | 通过生物信息学分析鉴定LINC02363作为脓毒症早期诊断和治疗的潜在生物标志物 | 首次发现LINC02363在脓毒症中显著上调，并通过多组学分析验证其作为新型生物标志物的潜力 | 样本来源单一，需要更大规模的多中心研究验证 | 识别在脓毒症中起关键作用的lncRNAs，为脓毒症诊断和治疗提供潜在生物标志物 | 脓毒症患者转录组数据 | 生物信息学 | 脓毒症 | 转录组测序, 单细胞测序, qPCR, WGCNA, GSEA | NA | 基因表达数据 | 从中国国家基因库获取的脓毒症患者转录组数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 213 | 2025-10-06 |
Integrating Metabolic RNA Labeling-Based Time-Resolved Single-Cell RNA Sequencing with Spatial Transcriptomics for Spatiotemporal Transcriptomic Analysis
2025-03, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202401297
PMID:39390840
|
研究论文 | 本研究通过整合代谢RNA标记的时间分辨单细胞RNA测序与空间转录组学，实现了胶质母细胞瘤的时空转录组分析 | 首次将时间分辨单细胞RNA测序与空间转录组学整合，提出时空分析新范式，揭示了胶质母细胞瘤中EZH2介导间质转化的新机制 | 技术整合复杂度较高，可能受限于两种技术的分辨率和灵敏度差异 | 开发时空转录组分析方法，解析胶质母细胞瘤中基因调控网络和细胞间通讯机制 | 胶质母细胞瘤细胞和肿瘤微环境中的细胞群体 | 空间转录组学 | 胶质母细胞瘤 | 代谢RNA标记时间分辨单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | Well-TEMP-seq | 代谢RNA标记时间分辨Well-TEMP-seq |
| 214 | 2025-10-06 |
scMEDAL for the interpretable analysis of single-cell transcriptomics data with batch effect visualization using a deep mixed effects autoencoder
2025-Mar-13, ArXiv
PMID:39606715
|
研究论文 | 提出scMEDAL框架，使用深度混合效应自编码器进行单细胞转录组数据的可解释分析及批次效应可视化 | 通过两个互补的自编码器网络分别建模批次不变和批次特异性效应，支持回顾性分析和在不同批次下的细胞表达预测 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中技术和生物批次效应的混淆问题 | 单细胞转录组数据 | 单细胞分析 | 自闭症、白血病、心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 深度混合效应自编码器、对抗学习、贝叶斯自编码器 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 215 | 2025-10-06 |
Recent Innovations and Technical Advances in High-Throughput Parallel Single-Cell Whole-Genome Sequencing Methods
2025-03, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202400789
PMID:38979872
|
综述 | 本文综述了高通量平行单细胞全基因组测序方法的技术进展与创新 | 重点介绍了高通量scWGS在策略设计、数据效率、平行处理平台及其在人类基因组应用方面的最新技术进展 | 存在总成本限制的挑战 | 总结和讨论高通量单细胞全基因组测序方法的技术进步 | 单细胞全基因组测序技术方法 | 基因组学 | 癌症 | 单细胞全基因组测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 单细胞全基因组测序 | NA | NA |
| 216 | 2025-10-06 |
A best practices framework for spatial biology studies in drug discovery and development: enabling successful cohort studies using digital spatial profiling
2025-Mar, Journal of histotechnology
IF:0.6Q4
DOI:10.1080/01478885.2024.2391683
PMID:39225147
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指南框架 | 提出用于药物研发中空间生物学研究的最佳实践框架，通过数字空间分析技术促进成功的队列研究 | 首次为空间生物学研究建立标准化实践指南，利用数字空间分析技术实现可扩展的全转录组和超多重蛋白分析 | 数字空间分析方法不提供单细胞分辨率 | 改进药物研发中的组织分析，促进生物标志物发现 | 固体组织样本 | 空间生物学 | NA | 数字空间分析 | NA | 空间转录组数据、蛋白质数据 | NA | NA | 空间转录组学、数字空间分析 | NA | NA |
| 217 | 2025-10-06 |
Comprehensive Analysis of Uric Acid and Myasthenia Gravis: IGF1R as a Protective Factor and Potential Therapeutic Target
2025-Mar, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.70361
PMID:40152081
|
研究论文 | 本研究通过综合分析揭示了尿酸与重症肌无力之间的关联，并确定IGF1R作为保护因子和潜在治疗靶点 | 首次通过孟德尔随机化和生物信息学分析确定IGF1R在尿酸与重症肌无力关系中的关键作用，并筛选出靶向IGF1R的潜在治疗药物 | 研究主要基于公共数据库和单中心患者数据，需要进一步实验验证 | 探讨尿酸与重症肌无力的关系及其分子机制，寻找潜在治疗靶点 | 重症肌无力患者、公共数据库(TCGA、GEO)数据、临床中心患者数据 | 生物信息学 | 重症肌无力 | meta分析、孟德尔随机化、生物信息学分析、虚拟筛选、分子对接、单细胞RNA-seq | NA | 基因组数据、表达数据、临床数据 | 公共数据库数据和临床中心患者数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 218 | 2025-10-06 |
Role of Galactosylceramide Metabolism in Satellite Glial Cell Dysfunction and Neuron-Glia Interactions in Painful Diabetic Peripheral Neuropathy
2025-03-07, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14060393
PMID:40136642
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研究论文 | 本研究探讨了半乳糖神经酰胺代谢在痛性糖尿病周围神经病变中卫星胶质细胞功能障碍和神经元-胶质细胞相互作用中的作用 | 首次揭示半乳糖神经酰胺耗竭是痛性糖尿病周围神经病变中卫星胶质细胞功能障碍的核心介质，并识别出易受影响的卫星胶质细胞亚群 | 研究仅使用大鼠模型，需要进一步在人类样本中验证 | 研究半乳糖神经酰胺在糖尿病周围神经病变进展过程中对卫星胶质细胞功能和神经元-胶质细胞相互作用的影响 | 痛性糖尿病周围神经病变大鼠模型的背根神经节卫星胶质细胞和神经元 | 神经科学 | 糖尿病周围神经病变 | 单细胞RNA测序、靶向质谱分析、免疫荧光分析 | NA | 基因表达数据、质谱数据、图像数据 | 痛性糖尿病周围神经病变大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 219 | 2025-10-06 |
GALNT5 promotes migration and invasion of pancreatic ductal adenocarcinoma cells by activating Erk signaling pathway
2025-03, Biochimica et biophysica acta. General subjects
DOI:10.1016/j.bbagen.2025.130769
PMID:39870120
|
研究论文 | 本研究揭示了GALNT5通过激活Erk信号通路促进胰腺导管腺癌细胞的迁移和侵袭 | 首次通过TCGA和GTEx数据鉴定GALNT5为PDAC中最显著上调的糖基化相关基因，并阐明其通过Erk信号通路促进肿瘤进展的机制 | 研究主要基于细胞系实验，缺乏体内动物模型验证 | 探究GALNT5在胰腺导管腺癌进展中的作用机制 | 胰腺导管腺癌细胞系（PANC-1、MIAPaCa-2、AsPC-1） | 癌症生物学 | 胰腺癌 | RNA-seq，单细胞测序 | NA | 基因表达数据，单细胞测序数据 | TCGA和GTEx数据库的RNA-seq数据，公开可用的单细胞测序数据 | NA | RNA-seq，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 220 | 2025-10-06 |
Immune-featured stromal niches associate with response to neoadjuvant immunotherapy in oral squamous cell carcinoma
2025-Mar-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102024
PMID:40107247
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和空间转录组学分析口腔鳞状细胞癌患者对免疫治疗的应答机制 | 首次在口腔鳞癌中揭示免疫特征性基质微环境与免疫治疗应答的关联，发现SELP高内皮微静脉和APOD肌成纤维细胞在免疫化疗应答者中特异性上调 | 样本量较小（22例患者），且为单中心研究 | 探究肿瘤基质细胞在口腔鳞癌免疫治疗应答中的作用机制 | 22例口腔鳞状细胞癌患者的配对肿瘤标本 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 22例患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |