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当前共找到 712 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-07-10 |
CellBouncer, A Unified Toolkit for Single-Cell Demultiplexing and Ambient RNA Analysis, Reveals Hominid Mitochondrial Incompatibilities
2025-Mar-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.23.644821
PMID:40166335
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研究论文 | 提出CellBouncer工具包用于单细胞测序中的多路分解和背景RNA分析，并揭示人科线粒体不相容性 | 首次统一处理单细胞测序数据中的多路分解与背景RNA分析，并发现跨物种线粒体不相容性 | 可能受限于特定实验设计和细胞融合模型，通用性需进一步验证 | 开发并验证用于合并实验单细胞测序数据的计算工具 | 细胞混合物（多物种、多个体）、线粒体单倍型、脂质偶联条形码、CRISPR sgRNA和四倍体复合细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞测序 | NA | 图像 | 10个细胞融合系的细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2026-07-10 |
Immune mechanisms in multiple sclerosis: CD3 levels on CD28+ CD4+ T cells link antibody responses to human herpesvirus 6
2025-03, Cytokine
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.cyto.2025.156866
PMID:39884183
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研究论文 | 通过孟德尔随机化分析和单细胞测序，研究抗体介导的免疫反应与多发性硬化症之间的关系，揭示CD3水平在CD28+ CD4+ T细胞上通过改变人疱疹病毒6型抗体比例影响MS进展 | 首次通过孟德尔随机化结合单细胞测序，发现CD3在特定T细胞上的水平通过调节HHV-6抗体反应影响MS进展的因果关系 | 未明确提及研究局限性，可能包括样本量有限或因果推断的假设限制 | 探究抗体介导的免疫反应与多发性硬化症之间的因果关系，并识别潜在的感染病原体 | MS患者与对照组的免疫细胞浸润及抗体反应关联 | 机器学习 | 多发性硬化症 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2026-07-05 |
Protocol for directly selecting cell type marker genes for single-cell clustering analyses by Festem
2025-Mar-21, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103514
PMID:39700012
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研究论文 | 提出Festem协议，直接从单细胞RNA测序数据中选择细胞类型标记基因，以优化下游聚类分析 | 利用期望最大化检验（Festem）直接选择细胞类型标记基因，无需预先聚类即可识别关键基因，提高单细胞数据分析的效率和可解释性 | 未提及具体局限，但依赖单细胞RNA测序数据质量和参数设置可能影响结果 | 开发一种直接选择细胞类型标记基因的方法，以简化单细胞聚类分析流程 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型标记基因 | 机器学习 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 基因表达数据 | 不适用 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 4 | 2026-07-03 |
The trabecular and compact myocardium of adult vertebrate ventricles are transcriptionally similar despite morphological differences
2025-03, Annals of the New York Academy of Sciences
IF:4.1Q1
DOI:10.1111/nyas.15296
PMID:39934982
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研究论文 | 揭示了成年脊椎动物心室中致密心肌和小梁心肌在转录组水平上的相似性，尽管形态存在差异 | 通过空间转录组学和多物种转录组比较，首次系统证明成年心脏中致密层与小梁层心肌的转录组高度相似，挑战了传统认为致密心肌具有内在独特性的观点 | 未明确说明，但可能包括样本量有限、无法完全排除细微差异以及功能验证不足 | 研究脊椎动物心室致密心肌与小梁心肌在转录水平上是否存在根本差异 | 成年小鼠、人类胚胎、成年斑胸草雀、斑马鱼和金枪鱼的心脏组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学、单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠胚胎和成年心脏样本，人类胚胎心脏数据，以及成年斑胸草雀、斑马鱼和金枪鱼的心脏样本 | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | 10x Visium | 10x Visium空间转录组技术用于小鼠胚胎心脏；单细胞转录组数据来自人类胚胎 |
| 5 | 2026-07-01 |
Spatial Transcriptomics Identifies Immune-Stromal Niches Associated with Cancer in Adult Dermatomyositis
2025-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.19.644147
PMID:40166232
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研究论文 | 通过空间和单细胞转录组学分析，揭示了成人皮肌炎中与癌症相关的免疫-基质微环境 | 首次对成人皮肌炎进行了全面的空间和单细胞转录组学分析，揭示了与癌症相关的免疫和基质细胞微环境，并发现了与癌症相关的DM皮肤病变中的分散免疫浸润特征 | NA | 研究成人皮肌炎中与癌症相关的免疫和基质微环境 | 成人皮肌炎患者皮肤病变组织 | 数字病理学 | 成人皮肌炎 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics, 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 10x Visium, 10x Chromium | 10x Visium 空间转录组学, 10x Chromium 单细胞3'测序 |
| 6 | 2026-07-01 |
A high-resolution view of the immune and stromal cell response to Haemophilus ducreyi infection in human volunteers
2025-03-12, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03885-24
PMID:39882906
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序和空间转录组学，高分辨率解析人类志愿者感染杜克雷嗜血杆菌后的免疫与基质细胞反应 | 首次在单细胞水平上定义人类皮肤对细胞外细菌病原体感染的免疫浸润特征，揭示了脓疱形成过程中的细胞类型和空间定位 | NA | 表征人类皮肤感染杜克雷嗜血杆菌后的细胞免疫反应，确定差异表达转录本的细胞来源 | 五名人类志愿者的皮肤活检样本（脓疱和模拟感染伤口） | 数字病理学 | 软下疳（生殖器溃疡疾病） | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | RNA序列数据、空间转录组数据 | 5名志愿者（scRNA-seq），其中4名同时用于空间转录组分析 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序和10x Visium空间转录组学 |
| 7 | 2026-07-01 |
Single-Cell RNA Sequencing to Guide Autologous Preterm Cord Mesenchymal Stromal Cell Therapy
2025-03, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202403-0569OC
PMID:39586004
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析早产脐带间充质干细胞转录组，指导自体细胞治疗支气管肺发育不良 | 首次利用单细胞RNA测序比较足月与早产脐带间充质干细胞的转录组差异，并关联妊娠并发症对治疗潜力的影响，发现NEGR和NRNX信号通路在治疗性干细胞中的独特作用 | 未明确提及样本量较小对结果普适性的限制，以及体内实验仅使用大鼠模型可能无法完全模拟人类BPD病理 | 探究妊娠相关并发症（先兆子痫和绒毛膜羊膜炎）是否改变脐带间充质干细胞的治疗潜力 | 足月与早产脐带间充质干细胞，以及人新生儿真皮成纤维细胞 | 单细胞转录组学 | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 5名足月供体、16名早产供体的脐带间充质干细胞，以及人新生儿真皮成纤维细胞 | NA | 单细胞RNA测序、单核RNA测序 | NA | 使用公开新生儿肺单核RNA测序数据 |
| 8 | 2026-06-19 |
Single-cell transcriptome analysis reveals cellular heterogeneity in the aortas of Takayasu arteritis
2025-03-10, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-025-03523-w
PMID:40065428
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示大动脉炎患者主动脉的细胞异质性 | 首次在单细胞水平上描绘了大动脉炎患者主动脉的细胞图谱，发现多种免疫和结构细胞的亚型特异性基因表达特征以及补体信号通路在外周血T细胞中的上调 | 样本量较小（仅3例患者主动脉样本和8例外周血样本），对照组数据来自公开数据库可能存在批次效应 | 探究大动脉炎主动脉组织的细胞异质性并发现潜在治疗靶点 | 大动脉炎患者的主动脉组织及外周血CD4+和CD8+ T细胞 | 机器学习和生物信息学 | 大动脉炎 | 单细胞转录组测序和批量RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据和批量RNA测序数据 | 3例患者主动脉样本和8例患者及8例健康志愿者的外周血T细胞 | Illumina | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | Illumina NovaSeq | 单细胞转录组分析和批量RNA测序 |
| 9 | 2026-06-17 |
Role of TGF-β/SMAD/YAP/TAZ signaling in skeletal muscle fibrosis
2025-03-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00541.2024
PMID:39925133
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research paper | 本研究探讨了TGF-β/SMAD/YAP/TAZ信号通路在骨骼肌纤维化中的作用机制 | 首次阐明YAP/TAZ作为机械敏感转录调控因子在TGF-β诱导的肌肉纤维化中决定纤维/脂肪祖细胞向肌成纤维细胞分化的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞培养，其结论在人类肌肉纤维化疾病中的适用性尚需进一步验证 | 探究YAP/TAZ在TGF-β介导的骨骼肌纤维化中的作用及其作为治疗靶点的可能性 | 骨骼肌纤维/脂肪祖细胞、小鼠模型 | machine learning | 肌肉纤维化 | 空间转录组学分析 | NA | 空间转录组数据 | 小鼠模型样本 | NA | spatial transcriptomics | NA | NA |
| 10 | 2026-06-17 |
Endogenously generated Dutch-type Aβ nonfibrillar aggregates dysregulate presynaptic neurotransmission in the absence of detectable inflammation
2025-Mar-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.25.639746
PMID:40060689
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研究论文 | 研究内源性生成的荷兰型Aβ非纤维聚集体在无检测到炎症情况下对突触前神经传递的失调作用 | 首次揭示荷兰型Aβ非纤维聚集体在无炎症条件下直接导致突触前神经传递异常和线粒体功能障碍 | 未明确非纤维聚集体如何具体引发突触功能异常的分子机制，且仅关注单一小鼠模型 | 探究荷兰型Aβ非纤维聚集体对突触前神经传递和线粒体功能的影响及其与炎症的关系 | 表达荷兰型Aβ突变的小鼠模型（Dutch mice） | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 电子传递链催化测量, 免疫组织化学, 荧光显微镜 | NA | 基因表达数据, 电生理数据, 代谢数据 | 多个时间点的小鼠脑组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于分析兴奋性神经元转录组 |
| 11 | 2026-06-07 |
Splenic TNF-α signaling potentiates the innate-to-adaptive transition of antiviral NK cells
2025-03-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.02.012
PMID:40023159
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研究论文 | 研究脾脏TNF-α信号在病毒感染期间促进NK细胞从先天到适应性转变的机制 | 首次揭示脾脏微环境通过TNF-α/TNFR2信号轴和NF-κB双通路调控NK细胞适应性分化，为生成适应性NK细胞免疫提供新见解 | 未涉及其他组织器官中NK细胞适应性转变的比较，以及长期记忆反应维持机制尚未阐明 | 探究病毒感染期间脾脏TNF-α信号如何调控NK细胞从先天免疫向适应性免疫的转变 | 小鼠脾脏NK细胞及髓系细胞 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 巨细胞病毒感染后小鼠脾脏NK细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'端测序 |
| 12 | 2026-06-07 |
A creatine efflux transporter in oligodendrocytes
2025-03, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.17382
PMID:39792585
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研究论文 | 本研究揭示了少突胶质细胞中肌酸外排转运蛋白SLC22A15的功能，填补了脑肌酸代谢关键环节 | 首次鉴定SLC22A15为少突胶质细胞中受控肌酸释放的关键转运蛋白，并发现其通过一对一交换机制实现肌酸释放，区别于其他永久性外排转运蛋白 | 研究主要基于体外293细胞和mRNA表达谱分析，缺乏体内功能验证和动物模型数据 | 探究少突胶质细胞中肌酸从产生细胞释放的分子机制 | 人源和大鼠SLC22A15转运蛋白及其在293细胞中的异源表达 | 分子生物学、神经科学 | 神经发育障碍（肌酸缺乏相关） | 质谱分析、单细胞RNA测序 | NA | 质谱数据、单细胞RNA测序数据、mRNA表达谱 | 人类和小鼠组织样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 13 | 2026-06-02 |
Correlative analysis of metallomic gene expression and metal ion content within the mouse hippocampus
2025-03-28, Metallomics : integrated biometal science
IF:2.9Q3
DOI:10.1093/mtomcs/mfaf009
PMID:40175292
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研究论文 | 通过X射线荧光显微镜和空间转录组学相结合的多模态方法，研究小鼠海马体中金属组基因表达与金属离子含量的相关性 | 首次将元素图谱与空间转录组学结合，揭示海马体关键亚区金属异质性的分子基础 | 文中未提及具体局限 | 揭示海马体神经金属组图谱的分子基础及其区域异质性机制 | 小鼠海马体及其亚区 | 空间转录组学 | 神经系统疾病 | X射线荧光显微镜, 空间转录组学 | NA | 图像, 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 14 | 2026-05-30 |
Single-cell transcriptomic sequencing identifies subcutaneous patient-derived xenograft recapitulated medulloblastoma
2025-03, Animal models and experimental medicine
IF:3.8Q2
DOI:10.1002/ame2.12399
PMID:38477441
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序比较皮下患者来源异种移植模型、颅内患者来源异种移植模型和基因工程小鼠模型对髓母细胞瘤的再现程度 | 首次在单细胞水平上比较了三种髓母细胞瘤实验模型（sPDX、iPDX和GEMM）的转录组再现性 | 未明确提及 | 在单细胞水平比较皮下患者来源异种移植、颅内患者来源异种移植和基因工程小鼠模型对髓母细胞瘤的再现能力 | 来自6名患者的原发性SHH和G3亚型髓母细胞瘤样本，以及相应的sPDX、iPDX模型和Patch+/- GEMM模型 | 数字病理学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 6名患者的髓母细胞瘤样本，3个GEMM模型 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2026-05-28 |
Single-cell transcriptomics reveals inter-ethnic variation in immune response to Falciparum malaria
2025-03-06, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2025.01.020
PMID:39970911
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示富拉尼族与莫西族儿童对恶性疟原虫免疫应答的种族差异 | 首次从单细胞层面系统解析非洲不同种族对疟疾免疫保护的细胞和分子基础，并鉴定出种族特异性的单细胞表达数量性状位点 | 研究中未提及针对机制验证的进一步实验，单细胞数据规模可能未完全覆盖免疫系统的全部异质性 | 探究不同种族人群对恶性疟原虫免疫应答差异的分子和细胞机制 | 布基纳法索农村126名感染和未感染恶性疟原虫的富拉尼族和莫西族儿童的外周血单核细胞 | 机器学习 | 疟疾 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 126名儿童（感染和未感染的富拉尼族与莫西族）及超过7万个单细胞，涵盖30种亚型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台对PBMC进行转录组分析 |
| 16 | 2026-05-28 |
Genome-wide prediction of dominant and recessive neurodevelopmental disorder-associated genes
2025-03-06, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2025.02.001
PMID:40015282
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研究论文 | 该研究开发了一种基于机器学习的计算方法（mantis-ml），利用单细胞RNA测序数据与三百种正交特征，预测与神经发育障碍相关的显性和隐性风险基因 | 首次基于单细胞RNA测序数据训练模型，并整合300种正交特征，区分单等位和双等位遗传模式预测神经发育障碍风险基因 | 仅基于计算预测，尚未进行实验验证；模型准确性受限于训练数据的质量和规模 | 加速神经发育障碍风险基因的识别，并强调考虑遗传模式的重要性 | 神经发育障碍，包括自闭症谱系障碍、发育性和癫痫性脑病、发育迟缓 | 机器学习 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序、机器学习 | 半监督机器学习模型（mantis-ml） | 单细胞RNA测序数据、基因不耐受指标、蛋白质相互作用数据等 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2026-05-27 |
Dynamic single-cell transcriptomic reveals the cellular heterogeneity and a novel fibroblast subpopulation in laryngotracheal stenosis
2025-03-31, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-025-00639-6
PMID:40165307
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研究论文 | 通过对喉气管狭窄大鼠模型进行动态单细胞转录组分析，揭示了细胞异质性和一种新的成纤维细胞亚群 | 首次对喉气管狭窄进行动态单细胞RNA测序，发现了新的软骨细胞损伤相关成纤维细胞亚群（CIRF），并揭示了其潜在起源和转化机制 | 研究基于大鼠模型，结果需在人类样本中验证；未深入探讨CIRF的功能机制 | 阐明喉气管狭窄发展过程中的细胞异质性和分子机制 | 喉气管狭窄大鼠模型在不同时间点的喉气管组织 | 数字病理学 | 喉气管狭窄 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个时间点的喉气管组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 动态单细胞RNA测序 |
| 18 | 2026-05-27 |
Exploring the mechanisms of PANoptosis in osteoarthritis and the therapeutic potential of andrographolide through bioinformatics and single-cell analysis
2025-03-31, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-025-00629-8
PMID:40165317
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研究论文 | 通过生物信息学和单细胞分析探索骨关节炎中PANoptosis的机制及穿心莲内酯的治疗潜力 | 首次结合单细胞RNA测序分析骨关节炎中PANoptosis相关基因的表达，并预测穿心莲内酯作为潜在治疗药物 | 仍缺乏对PANoptosis基因的详细分析及治疗药物的探索 | 探索骨关节炎中PANoptosis的机制及穿心莲内酯的治疗潜力 | 骨关节炎软骨中的PANoptosis相关基因及关键细胞群 | 生物信息学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 19 | 2026-05-27 |
Identification of druggable targets in acute kidney injury by proteome- and transcriptome-wide Mendelian randomization and bioinformatics analysis
2025-03-27, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-025-00631-0
PMID:40148878
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研究论文 | 通过蛋白质组和转录组孟德尔随机化及生物信息学分析，确定急性肾损伤的可药物靶点 | 整合多组学孟德尔随机化方法，结合批量转录组和单细胞转录组数据，系统性识别急性肾损伤的潜在治疗靶点并探索药物再利用机会 | 未在更大队列或不同种族中验证，且药物再利用分析需进一步实验验证 | 利用遗传数据和多组学分析，寻找急性肾损伤的可药物靶点及药物再利用潜力 | 急性肾损伤患者相关蛋白质和基因表达数据 | 生物信息学 | 急性肾损伤 | 孟德尔随机化、全转录组关联分析、单细胞转录组学 | NA | 遗传数据、转录组数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20 | 2026-05-27 |
Developmental molecular signatures define de novo cortico-brainstem circuit for skilled forelimb movement
2025-Mar-26, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6150344/v1
PMID:40196004
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研究论文 | 本研究识别出一种先前未被发现的直接皮层-脑干回路，该回路在发育早期形成并持续至成年，通过单细胞RNA测序和功能沉默实验证实其在前肢精细运动中的关键作用 | 首次发现并定义了发育中通过神经肽Y（Npy）标记的皮层-脑干神经元（CBN），揭示了其不延伸至脊髓而直接投射至脑干的独特发育特征 | 未提及具体局限性 | 探究皮层向脑干投射在精细运动控制中的功能及发育分子机制 | 小鼠皮层-脑干神经元（CBN），特别是表达Npy的神经元亚群 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、荧光激活细胞分选（FACS）、功能沉默（化学遗传学） | NA | 转录组数据 | NA（未具体说明样本量） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |