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当前共找到 714 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-16 |
Identifying novel therapeutic targets in cystic fibrosis through advanced single-cell transcriptomics analysis
2025-Mar, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.109748
PMID:39921941
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研究论文 | 通过先进的单细胞转录组学分析技术，本研究揭示了囊性纤维化气道上皮中的新型基因和调控网络，为开发靶向治疗策略提供了新靶点 | 本研究采用改进的分析方法，整合多源数据并利用全面的肺部参考面板进行标准化和映射，发现了此前未与囊性纤维化气道疾病关联的新型基因和调控网络 | NA | 通过增强的单细胞转录组学分析阐明囊性纤维化相关的分子机制，并识别新的治疗靶点 | 囊性纤维化患者和健康对照的肺组织样本 | 机器学习 | 囊性纤维化 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2026-05-15 |
Cancer associated fibroblasts in cancer development and therapy
2025-03-28, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-025-01688-0
PMID:40156055
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综述 | 综述了癌症相关成纤维细胞在肿瘤发展和治疗中的多方面作用及其作为治疗靶点的潜力 | 基于单细胞RNA测序研究，强调了CAF的异质性和可塑性，并提出包括ECM调节、直接消除、中断CAF-TME串扰和CAF正常化等多种靶向策略 | 未提及具体局限性 | 总结CAF在癌症发展中的基础知识和新进展，探讨其作为治疗靶点的潜力 | 癌症相关成纤维细胞（CAF） | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2026-05-15 |
Asymmetric Histone Inheritance Regulates Differential Transcription Re-initiation and Cell Fate Decisions in Mouse Olfactory Horizontal Basal Cells
2025-Mar-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.02.641101
PMID:40093102
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research paper | 通过损伤诱导再生模型研究小鼠嗅觉上皮中水平基底细胞的不对称组蛋白遗传及其对细胞命运决定的影响 | 首次在哺乳动物成体干细胞中揭示不对称组蛋白遗传模式，并发现其调控干细胞转录因子p63差异富集和异步转录重新起始 | 研究主要基于小鼠模型，人类嗅觉上皮中是否存类似机制尚需验证；未深入探讨组蛋白不对称遗传的分子机制 | 阐明哺乳动物体细胞分裂中表观遗传物质的分配模式及其对组织再生和行为的影响 | 小鼠嗅觉上皮水平基底细胞（HBCs） | machine learning, digital pathology | NA | 单细胞RNA测序、免疫荧光、组蛋白标记 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠嗅觉上皮组织及配对子代细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 4 | 2026-05-15 |
Cancer-Associated Fibroblasts in Intrahepatic Cholangiocarcinoma: Insights into Origins, Heterogeneity, Lymphangiogenesis, and Peritoneal Metastasis
2025-03, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2024.07.009
PMID:39117110
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综述 | 系统总结了肝内胆管癌中癌症相关成纤维细胞的起源、异质性、淋巴管生成和腹膜转移机制 | 整合了最新的细胞谱系追踪、单细胞RNA测序和生物标志物分析成果，揭示了CAFs的多亚型复杂性及其潜在的抑癌与促转移双重作用 | 未涉及CAFs在免疫治疗中的具体作用机制及临床转化策略的详细讨论 | 评估肝内胆管癌中CAFs的起源、表型和功能复杂性，并阐明其在淋巴管生成和腹膜转移中的作用 | 肝内胆管癌中的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 胆管癌 | 单细胞RNA测序，细胞谱系追踪 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2026-05-12 |
CSsingle: A Unified Tool for Robust Decomposition of Bulk and Spatial Transcriptomic Data Across Diverse Single-Cell References
2025-Mar-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.07.588458
PMID:38645128
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research paper | 介绍CSsingle，一种通过解决细胞异质性关键挑战来增强bulk和空间转录组数据分解的统一工具 | CSsingle利用ERCC spike-in对照进行细胞大小校正，能准确考虑不同细胞类型间RNA含量差异，实现精确的bulk数据反卷积，并在空间转录组数据中实现精细尺度分析 | 未明确提及局限性 | 开发一种统一工具，用于将bulk和空间转录组数据与单细胞RNA-seq数据整合，推进复杂生物系统和疾病过程的研究 | bulk和空间转录组数据，以及单细胞RNA-seq参考数据 | machine learning | 食管腺癌，巴雷特食管，食管鳞状细胞癌 | RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 超过700个正常和患病样本（来自胃食管组织） | NA | bulk RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2025-10-07 |
A Unique Signature for Cancer-Associated Fibroblasts in Melanoma Metastases
2025-03, Pigment cell & melanoma research
IF:3.9Q2
DOI:10.1111/pcmr.70002
PMID:39924882
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析黑色素瘤原发灶和肺转移灶中的癌症相关成纤维细胞，揭示了转移灶特异性CAF的独特特征 | 首次系统比较黑色素瘤原发灶和转移灶中CAF的转录特征，发现转移灶特异性CAF亚群及其与中性粒细胞的肿瘤依赖性串扰机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探索黑色素瘤转移过程中癌症相关成纤维细胞的异质性和功能特征 | 小鼠黑色素瘤原发灶和肺转移灶中的癌症相关成纤维细胞，以及人类黑色素瘤转移样本 | 单细胞生物学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约8400个CAF和正常成纤维细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2026-05-08 |
Spatiotemporal Profiling Defines Persistence and Resistance Dynamics during Targeted Treatment of Melanoma
2025-Mar-03, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-0690
PMID:39700408
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研究论文 | 利用空间转录组学和深度学习分析黑色素瘤靶向治疗过程中的持久性和耐药性动态变化 | 首次通过空间转录组学在患者来源的异种移植模型中捕获克隆谱系进化，并结合深度学习分析组织病理学切片，揭示与特定细胞状态相关的形态特征 | 未明确说明 | 阐明黑色素瘤靶向治疗中持久态的动态变化及耐药机制，以制定预防治疗失败的策略 | BRAF突变黑色素瘤的细胞持久态及治疗过程中克隆进化 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学 | 深度学习 | 空间转录组数据，组织病理学图像 | 患者来源的异种移植模型样本 | 10x Genomics, Illumina | 空间转录组学 | 10x Visium, Illumina NovaSeq | 10x Visium空间基因表达分析，Illumina NovaSeq测序 |
| 8 | 2026-05-08 |
Identification of novel biomarkers for atherosclerosis using single-cell RNA sequencing and machine learning
2025-03, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-024-10077-w
PMID:39400603
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序和机器学习方法鉴定动脉粥样硬化的新型生物标志物 | 整合单细胞RNA测序、WGCNA和多种机器学习技术（LASSO和SVM-RFE）来筛选并验证动脉粥样硬化生物标志物，并通过免疫浸润分析和多水平实验验证 | 未提及具体局限性 | 开发可靠的动脉粥样硬化相关生物标志物，为诊断和治疗提供新视角 | 动脉粥样硬化患者样本和正常对照样本，以及小鼠和人类样本 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、WGCNA、LASSO、SVM-RFE、CIBERSORT | LASSO、SVM-RFE | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本量（涉及GEO数据集及小鼠/人类样本） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9 | 2026-05-08 |
Integrative approaches to m6A and m5C RNA modifications in autism spectrum disorder revealing potential causal variants
2025-03, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-024-10095-8
PMID:39738578
|
研究论文 | 整合m6A和m5C RNA修饰分析，识别自闭症谱系障碍的潜在因果变异 | 首次整合m6A和m5C RNA修饰变异与自闭症谱系障碍的基因组关联分析，发现关键因果变异并验证其功能 | 基于公共数据集的分析，缺乏实验验证；仅关注常见变异，未涵盖罕见变异 | 通过整合基因组学和RNA修饰分析，识别自闭症谱系障碍的因果变异及其调控机制 | 自闭症谱系障碍相关的m6A和m5C变异 | 基因组学 | 自闭症谱系障碍 | NA | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10 | 2026-05-08 |
Immune Cell Biology in Peripheral Nervous System Injury
2025-03, Neurorehabilitation and neural repair
IF:3.7Q1
DOI:10.1177/15459683241304325
PMID:39744962
|
综述 | 本文总结了外周神经系统损伤后免疫细胞在损伤与修复过程中的关键作用 | 通过单细胞测序分析为巨噬细胞表型争议提供新见解 | 未提及具体研究方法或数据分析的局限性 | 总结免疫细胞在外周神经系统损伤与修复中的作用机制 | 外周神经系统损伤中的免疫细胞（巨噬细胞、中性粒细胞、淋巴细胞等） | 机器学习和数字病理学（基于单细胞测序分析的应用） | 外周神经系统损伤 | 单细胞测序 | NA | 文本和测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2026-05-03 |
DNTT-mediated DNA damage response drives inotuzumab ozogamicin resistance in B-cell acute lymphoblastic leukemia
2025-Mar-13, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024026085
PMID:39791601
|
研究论文 | 通过全基因组CRISPR筛选发现DNTT缺失是B细胞急性淋巴细胞白血病对Inotuzumab ozogamicin耐药的主要驱动因素 | 首次揭示DNTT通过调控DNA损伤反应介导InO耐药机制，并利用单细胞RNA测序验证了白血病内异质性 | 未在更大临床样本中验证DNTT作为生物标志物的预测效能，且未探讨其他潜在耐药机制 | 阐明B细胞急性淋巴细胞白血病对Inotuzumab ozogamicin耐药的遗传基础 | B细胞急性淋巴细胞白血病细胞系、患者样本及异种移植模型 | 机器学习 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | CRISPR筛选 | NA | 基因表达数据 | 儿童肿瘤组AALL1621试验中的B-ALL患者样本及患者来源异种移植模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 12 | 2026-05-03 |
Novel biallelic MCMDC2 variants were associated with meiotic arrest and nonobstructive azoospermia
2025-03-01, Asian journal of andrology
IF:3.0Q1
DOI:10.4103/aja202495
PMID:39789727
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研究论文 | 通过全外显子组测序发现MCMDC2基因双等位基因变异与减数分裂停滞和非梗阻性无精症相关 | 首次在非梗阻性无精症患者中鉴定了MCMDC2基因的四种双等位基因有害变异，并揭示其导致减数分裂停滞和精子发生障碍 | 研究样本量有限（768名患者），仅发现0.5%的变异频率，且未在其他人群中进行验证 | 探索非梗阻性无精症的遗传病因，鉴定MCMDC2基因变异与男性不育的关联 | 非梗阻性无精症患者 | 机器学习 | 男性不育 | 全外显子组测序, 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色, 苏木精-伊红染色 | NA | 基因序列数据, 单细胞转录组数据, 组织切片图像 | 768名非梗阻性无精症患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 13 | 2026-05-02 |
Impdh1 was identified as a key protein promotes diabetic vasculopathy by intervention of vascular endothelial cell pyroptosis
2025-03-13, BMC cardiovascular disorders
IF:2.0Q3
DOI:10.1186/s12872-025-04604-z
PMID:40082765
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研究论文 | 通过scRNA-seq和bulk RNA-seq分析，鉴定Impdh1为关键蛋白，通过干预血管内皮细胞焦亡促进糖尿病血管病变 | 首次通过单细胞RNA测序和批量RNA测序联合分析，鉴定Impdh1为与糖尿病血管病变相关的焦亡关键分子，并验证其在血管内皮细胞焦亡中的保护作用 | 未明确提及临床验证，且样本来源于小鼠模型和公共数据集，可能不完全代表人体病理过程 | 探索糖尿病血管病变中血管内皮细胞焦亡的分子机制及关键蛋白Impdh1的作用 | 糖尿病小鼠模型及GSE169332数据集中的血管内皮细胞 | 数字病理学 | 糖尿病血管病变 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 实时定量逆转录PCR, 免疫组织化学, 免疫荧光 | NA | 基因表达数据 | GSE169332数据集（scRNA-seq数据）及糖尿病小鼠主动脉组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2026-04-30 |
Molecular and cellular neurocardiology in heart disease
2025-03, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP284739
PMID:38778747
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综述 | 本文更新并扩展了关于心脏病分子和细胞神经生物学的基础，重点讨论了心脏自主神经发育、新型细胞内通路和神经可塑性的最新发现 | 利用患者特异性干细胞研究交感神经损伤，通过空间转录组学和新型成像技术发现治疗心脏自主神经功能障碍的分子靶点 | 文中强调了尚未解答的问题和存在争议的领域 | 探讨心脏病的分子和细胞神经心脏学机制及治疗潜力 | 心脏自主神经系统、神经化学通路、患者特异性干细胞 | 机器学习, 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 15 | 2026-04-30 |
Biophysical modelling of intrinsic cardiac nervous system neuronal electrophysiology based on single-cell transcriptomics
2025-03, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP287595
PMID:40077928
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研究论文 | 基于单细胞转录组数据开发心脏内在神经系统神经元电生理模型的计算库 | 首次利用单神经元转录组数据构建心脏内在神经系统神经元电生理模型计算库，通过循环阈值选择离子通道组合，结合被动电学特性约束模型参数，成功预测了与实验观察一致的神经元相位和强直反应分布 | 未明确提及 | 构建心脏内在神经系统神经元电生理多尺度计算模型，研究其在心脏调节和病理中的功能作用 | 心脏内在神经系统（ICNS）神经元 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 单细胞转录组数据中的ICNS神经元 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 16 | 2026-04-25 |
A single-cell atlas of circulating immune cells over the first 2 months of age in extremely premature infants
2025-Mar-05, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adr0942
PMID:40043141
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研究论文 | 对极早产儿出生后2个月内循环免疫细胞进行纵向多组学单细胞图谱分析 | 首次利用微量全血（250微升）对极早产儿进行纵向多组学分析，揭示其外周免疫发育轨迹与足月儿的差异，并发现早期持续激活的免疫特征 | 样本量较小（10名极早产儿），且未明确说明样本选择偏差或结果普适性 | 描述极早产儿出生后2个月内外周免疫细胞的发育轨迹 | 10名极早产儿（孕周小于30周）的外周血免疫细胞，以及健康成人和早产/足月脐带血样本 | 数字病理学 | 早产儿相关疾病 | 单细胞RNA测序、T细胞和B细胞受体测序、磷蛋白质谱流式细胞术 | NA | 单细胞转录组、免疫受体序列、蛋白质组学数据 | 10名极早产儿（1周、1个月、2个月共30个时间点样本），健康成人和早产/足月脐带血样本若干 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞免疫受体测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'转录组和免疫受体测序，磷蛋白质谱流式细胞术 |
| 17 | 2026-04-25 |
Integrating spatial transcriptomics and single-nucleus RNA-seq revealed the specific inhibitory effects of TGF-β on intramuscular fat deposition
2025-03, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2696-5
PMID:39422812
|
研究论文 | 通过整合空间转录组和单核RNA测序，揭示TGF-β对肌内脂肪沉积的特异性抑制作用 | 首次结合空间转录组与单核RNA-seq技术，揭示TGF-β信号通路在不同脂肪含量猪肌内脂肪中的空间异质性及其对脂肪沉积的抑制作用，并发现肥胖小鼠中TGF-β抑制可加速肌肉修复 | 体外实验仅使用猪内皮细胞模拟高脂环境，且体内实验局限于小鼠模型，需进一步验证在人类中的适用性 | 研究TGF-β信号通路对肌内脂肪沉积的调控机制，探索其对肌肉萎缩和修复的潜在治疗靶点 | 猪背最长肌组织（不同肌内脂肪含量）、肥胖小鼠肌肉损伤模型 | 数字病理学 | 肌营养不良、肥胖相关肌肉萎缩 | 空间转录组学、单核RNA测序 | NA | 空间转录组数据、单核RNA-seq数据 | 不同肌内脂肪含量的猪背最长肌样本（具体数量未说明）、肥胖小鼠样本（具体数量未说明） | NA | 空间转录组学、单核RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2026-04-23 |
Mathematical Modeling Predicts Optimal Immune Checkpoint Inhibitor and Radiotherapy Combinations and Timing of Administration
2025-Mar-04, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-0610
PMID:39666379
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析，结合数学模型，预测了放疗联合免疫检查点抑制剂的最佳组合与给药时机 | 首次通过单细胞和空间转录组技术动态解析食管癌患者放疗期间淋巴细胞介导的分子相互作用变化，并构建数学模型预测五种ICI在四个不同时间点给药的效果 | 研究基于食管癌患者样本，模型预测结果需在临床试验中进一步验证 | 探索放疗联合免疫检查点抑制剂的最佳治疗方案与给药时机 | 食管癌患者的组织样本 | 计算生物学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 数学建模 | 数学模型 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 食管癌患者组织样本（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 19 | 2026-04-22 |
Accurate trajectory inference in time-series spatial transcriptomics with structurally-constrained optimal transport
2025-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.19.644194
PMID:40166168
|
研究论文 | 本文提出了一种基于最优传输的轨迹推断方法SOCS，用于时间序列空间转录组学数据，以保持生物结构单元的完整性 | SOCS方法在时间序列空间转录组学中引入结构约束，确保生物结构单元在时间上的空间连贯性，这是现有方法所缺乏的 | NA | 开发一种能够准确推断时间序列空间转录组学数据中发育轨迹的方法 | 时间序列空间转录组学数据，特别是卵巢滤泡和肾小管等空间连续区域 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 最优传输 | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 20 | 2026-04-20 |
A comprehensive spatio-cellular map of the human hypothalamus
2025-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08504-8
PMID:39910307
|
研究论文 | 本研究通过整合433,369个人类下丘脑细胞的单核测序与空间转录组学数据，构建了首个全面的人类下丘脑空间-细胞转录图谱（HYPOMAP） | 首次创建了人类下丘脑的高分辨率空间-细胞转录图谱，揭示了人类与小鼠在特定神经元类型（如POMC神经元）和GPCR表达水平上的关键差异，并发现了与BMI相关的新基因（CORO1A） | 研究主要基于转录组数据，功能验证和神经环路层面的分析仍需进一步探索 | 构建人类下丘脑的细胞组成与空间分布图谱，为代谢、生殖和昼夜节律等疾病的治疗靶点发现提供资源 | 人类下丘脑组织 | 空间转录组学 | 代谢性疾病 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间基因表达数据 | 433,369个下丘脑细胞 | NA | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |