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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-03-28 |
Novel Meningoencephalomyelitis Associated With Vimentin IgG Autoantibodies
2025-Mar-01, JAMA neurology
IF:20.4Q1
DOI:10.1001/jamaneurol.2024.4763
PMID:39836414
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研究论文 | 本研究识别了一种与波形蛋白IgG自身抗体相关的新型脑膜脑脊髓炎综合征 | 首次发现并描述了针对星形胶质细胞中间丝蛋白波形蛋白的自身抗体与一种独特的脑膜脑脊髓炎综合征的关联 | 研究为回顾性病例系列,样本量较小(14例患者),且随访时间有限(中位23个月) | 表征一种与未知星形胶质细胞自身抗体相关的脑膜脑脊髓炎综合征 | 患有未明确中枢神经系统自身免疫性疾病且具有相似临床和影像学特征的患者 | 数字病理学 | 神经系统自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、基于细胞的测定、基于组织的测定 | NA | 单细胞RNA测序数据、临床数据、影像学数据 | 14例患者(10例女性,中位年龄33岁),其中2例索引患者的脑脊液细胞进行了scRNA-seq | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2026-03-25 |
Integrated single-cell and spatial analysis identifies context-dependent myeloid-T cell interactions in head and neck cancer immune checkpoint blockade response
2025-Mar-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.24.644582
PMID:40196610
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间分析,揭示了头颈癌免疫检查点阻断治疗中髓系细胞与T细胞相互作用的上下文依赖性 | 结合10X Visium和Nanostring CosMx空间组学技术,首次系统性地描述了头颈癌免疫检查点阻断治疗中免疫细胞的空间特征和细胞间相互作用 | 研究样本量相对有限,且主要依赖生物信息学分析,需要进一步的实验验证和临床前动物模型研究 | 探究头颈癌免疫检查点阻断治疗中免疫细胞的空间相互作用及其与治疗反应的关系 | 头颈鳞状细胞癌患者,包括对免疫检查点阻断治疗有反应和无反应的患者 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组学数据, 空间蛋白质组学数据 | 26名患者的522,399个单细胞,以及8名接受免疫检查点阻断治疗患者的空间RNA测序数据 | 10x Genomics, Nanostring | 空间转录组学, 单细胞空间组学 | 10x Visium, Nanostring CosMx | 10X Visium基于点的空间转录组学,Nanostring CosMx单细胞空间组学(包含435个配体和受体的RNA基因面板) |
| 3 | 2026-03-25 |
Single-cell transcriptomics reveals a compartmentalized antiviral interferon response in the nasal epithelium of mice
2025-03-18, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01413-24
PMID:39902863
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析,揭示了小鼠鼻上皮中抗病毒干扰素反应的细胞类型特异性分区 | 首次在单细胞水平上展示了上呼吸道上皮细胞中I型和III型干扰素抗病毒反应的细胞类型异质性和分区现象 | 研究仅基于小鼠模型,人类鼻上皮中的干扰素反应可能有所不同 | 探究上呼吸道不同上皮细胞亚型对I型和III型干扰素的抗病毒反应差异 | 小鼠鼻上皮细胞,包括嗅觉上皮和呼吸上皮的多种细胞类型 | 单细胞转录组学 | 呼吸道病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量,但分析了小鼠鼻上皮的多种细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-03-25 |
Conventional and antibody-enhanced DENV infection of human macrophages induces differential immunotranscriptomic profiles
2025-03-18, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01962-24
PMID:39902963
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,比较了人类巨噬细胞在抗体依赖性增强(ADE)和常规感染条件下感染登革病毒后的转录组差异 | 首次在单细胞分辨率下揭示了ADE感染与常规感染登革病毒后,宿主细胞转录组反应的质性差异,并发现这些变化与细胞内病毒RNA载量无关 | 研究仅针对DENV-2血清型和人单核来源巨噬细胞,未涵盖其他血清型或体内其他靶细胞类型 | 阐明抗体依赖性增强(ADE)感染登革病毒的细胞内在分子机制及其在疾病发病中的作用 | 人类单核细胞来源的巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | 登革热 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量,但涉及感染和未感染的异质性细胞培养物 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2026-03-21 |
Integrated Single-Cell Transcriptome and eQTL Analyses Reveal the Role of PZP in Aging and Chronic Kidney Disease
2025-03, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.70015
PMID:40058366
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组和eQTL分析,揭示了PZP蛋白在衰老和慢性肾病(CKD)相互作用中的关键作用 | 首次整合单细胞RNA测序、eQTL和孟德尔随机化分析,系统揭示了CD8+中央记忆T细胞及其关键基因PZP在连接衰老与CKD中的遗传和免疫机制 | 样本来源仅限于外周血,未直接分析肾脏组织;样本量相对有限;机制验证主要在关联分析层面,需要进一步的功能实验证实 | 探索衰老与慢性肾病(CKD)相互作用的遗传和免疫机制,并寻找潜在生物标志物和治疗靶点 | 年轻对照个体、老年个体以及慢性肾病(CKD)患者的外周血样本 | 数字病理学 | 慢性肾病 | 单细胞RNA测序, eQTL分析, 孟德尔随机化分析 | NA | 单细胞转录组数据, 基因组数据, 临床指标数据 | 年轻对照、老年个体和CKD患者的外周血样本(具体数量未在摘要中明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2026-03-20 |
EGR1 regulates oxidative stress and aldosterone production in adrenal cells and aldosterone-producing adenomas
2025-03, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2025.103498
PMID:39826326
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研究论文 | 本研究揭示了早期生长反应蛋白1(EGR1)在肾上腺细胞中调控氧化应激和醛固酮生产的双重作用,并探讨了其在醛固酮产生腺瘤(APAs)发病机制中的潜在意义 | 首次发现EGR1在肾上腺细胞中同时调控氧化应激和醛固酮生产,并利用空间转录组学技术揭示了其在APAs中的表达下调与氧化应激标志物减少相关 | 研究主要基于体外细胞实验和动物模型,人类样本分析有限,且EGR1表达与氧化应激之间的具体分子机制尚未完全阐明 | 探究EGR1在肾上腺细胞氧化应激和醛固酮生产调控中的作用,及其在醛固酮产生腺瘤发病机制中的潜在角色 | 人类肾上腺细胞、醛固酮产生腺瘤患者肾上腺组织、猪的肾上腺皮质 | 数字病理学 | 肾上腺肿瘤 | RNA测序、空间转录组学、免疫染色 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、免疫组织化学图像 | 人类肾上腺细胞、APA患者肾上腺组织、猪肾上腺组织 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 7 | 2026-03-20 |
Desflurane attenuates renal ischemia-reperfusion injury by modulating ITGB1/CD9 and reducing oxidative stress in tubular epithelial cells
2025-03, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2025.103490
PMID:39854938
|
研究论文 | 本研究探讨了地氟醚通过调节ITGB1/CD9信号通路和减轻氧化损伤,在肾脏缺血再灌注损伤中的保护作用 | 首次揭示了地氟醚通过调控ITGB1/CD9轴减轻肾脏缺血再灌注损伤的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,尚未在人体中进行验证 | 探究地氟醚对肾脏缺血再灌注损伤的保护作用及其分子机制 | 肾小管上皮细胞和小鼠肾脏缺血再灌注模型 | 单细胞组学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, RT-qPCR, Western blot, TUNEL检测 | 小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据, 转录组数据, 蛋白质表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2026-03-20 |
GAMG alleviates liver fibrosis through inducing ferroptosis in inflammatory macrophages via the IRF1/SLC7A11 signaling pathway
2025-03, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2025.103509
PMID:39904190
|
研究论文 | 本研究探讨了天然化合物GAMG通过IRF1/SLC7A11信号通路诱导炎症巨噬细胞铁死亡,从而缓解肝纤维化的作用机制 | 首次揭示了GAMG通过激活IRF1/SLC7A11轴诱导炎症巨噬细胞铁死亡来治疗肝纤维化的新机制 | NA | 探究GAMG对肝纤维化的治疗作用及其分子机制 | 肝纤维化小鼠模型及炎症巨噬细胞 | NA | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序, 质谱代谢组学分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2026-03-20 |
Inhibition of glutathione peroxidase 4 suppresses gastric cancer peritoneal metastasis via regulation of RCC2 homeostasis
2025-03, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2025.103519
PMID:39908861
|
研究论文 | 本研究揭示了谷胱甘肽过氧化物酶4(GPx4)通过调节RCC2的稳态来驱动胃癌腹膜转移的分子机制 | 首次阐明了GPx4通过ROS积累激活Aurora A磷酸化,进而导致RCC2在K377位点泛素化降解,从而抑制胃癌腹膜转移的具体信号通路 | 研究主要基于体外和体内实验模型,临床样本验证的规模可能有限,且具体治疗策略的转化潜力有待进一步评估 | 探究GPx4在胃癌进展和转移中的作用机制,并寻找新的治疗靶点 | 胃癌细胞及临床样本 | 肿瘤生物学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),蛋白质组学分析 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据 | 回顾性临床样本及实验模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2026-03-18 |
Systematic evaluation of single-cell multimodal data integration for comprehensive human reference atlas
2025-Mar-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.06.637075
PMID:40093094
|
研究论文 | 本研究系统评估了单细胞多模态数据整合方法在构建人类肾脏皮质参考图谱中的应用 | 开发了可解释的机器学习工具scOMM,并首次系统评估了水平整合(scRNA与snRNA-seq)和垂直整合(snRNA-seq与snATAC-seq)策略在复杂组织中的效果 | 研究仅针对肾脏皮质组织,未验证在其他复杂组织中的普适性 | 评估多模态单细胞数据整合策略对构建全面人类参考图谱的影响 | 人类肾脏皮质组织 | 单细胞组学 | NA | scRNA-seq, snRNA-seq, snATAC-seq | 机器学习(scOMM工具) | 单细胞多模态组学数据 | 19名捐赠者的119,744个高质量细胞核/细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-03-18 |
Mixed exposure to PFOA and PFOS induces oocyte apoptosis and subfertility in mice by activating the Hippo signaling pathway
2025-03, Reproductive toxicology (Elmsford, N.Y.)
DOI:10.1016/j.reprotox.2024.108829
PMID:39746460
|
研究论文 | 本研究探讨了PFOA和PFOS混合物暴露通过激活Hippo信号通路诱导小鼠卵母细胞凋亡并导致生育力下降的机制 | 首次揭示了PFOA和PFOS混合物通过激活Hippo信号通路损害卵母细胞质量和生育能力的分子机制,并利用单细胞转录组分析证实了其对能量代谢和凋亡的影响 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类中验证;混合物暴露的具体剂量和比例对结果的普适性有待进一步研究 | 探究PFOA和PFOS混合物暴露对卵母细胞质量和雌性生育能力的影响及其分子机制 | 雌性小鼠的卵母细胞 | 生殖毒理学 | 生殖系统疾病 | 单细胞转录组分析 | 动物模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2026-03-16 |
Investigating pulmonary neutrophil responses to inflammation in mice via flow cytometry
2025-Mar-14, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiae189
PMID:39212489
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研究论文 | 本文介绍了一种通过流式细胞术评估小鼠肺部中性粒细胞表型的详细实验方案 | 提供了一种针对真菌细胞壁颗粒zymosan诱导的肺部无菌炎症模型,结合细胞表面和细胞内标记的全面染色技术,适用于下游单细胞测序等应用 | NA | 探索肺部中性粒细胞在生理和病理条件下的复杂功能 | 小鼠肺部组织及气腔中的中性粒细胞 | 数字病理学 | 肺部炎症 | 流式细胞术 | NA | 细胞表型数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 13 | 2026-03-15 |
An accelerated human in-vitro aging model mimicsin-vivo aging and facilitates dynamic testing of anti-aging compounds
2025-Mar-28, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6173768/v1
PMID:40195985
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研究论文 | 本研究开发了一种加速的人类体外衰老模型,模拟体内衰老过程,并用于动态测试抗衰老化合物 | 通过长期有丝分裂后培养人类成纤维细胞,真实再现并加速了体内衰老特征,结合单细胞转录组学揭示了衰老异质性,并利用该平台评估了抗衰老化合物的疗效 | 模型基于成纤维细胞,可能无法完全代表所有细胞类型的衰老过程,且体外环境与体内存在差异 | 研究人类特异性衰老动力学,开发实验平台以预测抗衰老治疗效果 | 人类成纤维细胞及其衍生的神经元 | 生物医学研究 | 衰老相关疾病 | 转录组学、表观遗传学分析、单细胞转录组学 | 体外衰老模型 | 转录组数据、表观遗传数据 | 未明确指定样本数量,但涉及成纤维细胞的长期培养和单细胞分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2026-03-15 |
DNTT-mediated DNA damage response drives inotuzumab ozogamicin resistance in B-cell acute lymphoblastic leukemia
2025-Mar-13, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024026085
PMID:39791601
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研究论文 | 本文通过全基因组CRISPR筛选发现DNTT缺失是B细胞急性淋巴细胞白血病对伊珠单抗奥佐米星耐药的主要驱动因素 | 首次揭示DNTT在调节伊珠单抗奥佐米星诱导的DNA损伤反应和白血病耐药中的关键作用,并利用单细胞RNA测序展示了白血病内异质性 | 研究主要基于体外和动物模型,临床验证样本有限,耐药机制可能涉及其他因素 | 探究B细胞急性淋巴细胞白血病对伊珠单抗奥佐米星耐药的遗传基础 | B细胞急性淋巴细胞白血病细胞 | NA | B细胞急性淋巴细胞白血病 | 全基因组CRISPR筛选,单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据,RNA测序数据 | 儿童肿瘤学组试验AALL1621中的B-ALL患者样本及患者来源异种移植模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2026-03-14 |
Kölliker's Organ Functions as a Developmental Hub in Mouse Cochlea Regulating Spiral Limbus and Tectorial Membrane Development
2025-03-26, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.0721-24.2025
PMID:39909560
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研究论文 | 本研究通过基因敲除小鼠模型,揭示了Kölliker's器官作为发育枢纽,调控小鼠耳蜗螺旋缘和盖膜发育的关键作用 | 首次发现Kölliker's器官通过上皮-间质信号通路(涉及CTGF因子)非自主性调控螺旋缘间质基质发育,并确认其为新的耳聋基因 | 研究局限于小鼠模型,尚未在人类或其他物种中验证;单细胞测序样本量有限 | 探究Kölliker's器官在耳蜗发育中的功能及其对听力形成的影响 | 基因敲除小鼠的耳蜗组织(Kölliker's器官、螺旋缘、盖膜) | 发育生物学 | 听力障碍 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、条件性基因敲除、听觉脑干反应测试 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据、组织形态学数据、生理功能数据 | 未明确样本数量的小鼠耳蜗组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2026-03-14 |
High-throughput single cell -omics using semi-permeable capsules
2025-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.14.642805
PMID:40166174
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研究论文 | 本文介绍了一种基于半透性胶囊(SPCs)的高通量单细胞组学技术,用于多种核酸分析,包括数字PCR、基因组测序和单细胞RNA测序 | 开发了基于半透性胶囊的通用技术,克服了液滴微流体系统长期培养和克隆扩增的限制,提供了更高的转录本捕获效率 | 未明确说明技术在大规模应用中的成本、通量上限或与其他单细胞平台的直接比较数据 | 开发一种高效、可定制的单细胞组学技术,用于解析生物系统的复杂性和异质性 | 造血系统疾病患者的白细胞,特别是急性髓系白血病样本中的成熟粒细胞和单核细胞 | 单细胞组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq)、数字PCR、基因组测序、FACS分选 | NA | 单细胞转录组数据 | 造血系统疾病患者的白细胞样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | CapSeq(胶囊测序) | 基于半透性胶囊(SPCs)的单细胞测序技术,支持长期细胞培养和克隆扩增 |
| 17 | 2026-03-13 |
Splenic TNF-α signaling potentiates the innate-to-adaptive transition of antiviral NK cells
2025-Mar-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.02.012
PMID:40023159
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了脾脏TNF-α信号在巨细胞病毒感染期间促进NK细胞从先天免疫向适应性免疫转变的关键机制 | 首次发现脾脏微环境中TNF-α/TNFR2信号通过激活经典和非经典NF-κB通路,分别调控NK细胞的先天效应功能和适应性前体细胞分化 | 研究主要聚焦于巨细胞病毒感染模型,在其他病毒感染或肿瘤微环境中的普适性有待验证 | 探究病毒感染过程中NK细胞在不同组织中的活化机制及其向适应性免疫细胞转变的调控通路 | 巨细胞病毒感染模型中的自然杀伤细胞 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序,纵向追踪 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2026-03-06 |
The tectum transversum(TTR) maintains patency of the developing coronal suture
2025-Mar-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.30.646197
PMID:40236170
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研究论文 | 本研究探讨了小鼠模型中短暂软骨结构TTR在冠状缝发育中的作用,发现其通过抑制BMP信号通路维持冠状缝开放,为冠状缝早闭的病因提供了新见解 | 首次通过基因消融实验证明TTR在维持冠状缝开放中的关键作用,并利用空间转录组学数据揭示其作为BMP信号屏障的潜在机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性尚需进一步验证;BMP信号调控机制的具体分子通路有待深入探索 | 探究冠状缝发育的调控机制及冠状缝早闭的病因 | 小鼠模型中的冠状缝、TTR软骨及相关组织(颅骨、硬脑膜) | 发育生物学 | 颅缝早闭 | 空间转录组学、基因消融 | NA | 空间转录组数据、组织学图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 19 | 2026-03-06 |
Histidine metabolism drives liver cancer progression via immune microenvironment modulation through metabolic reprogramming
2025-Mar-04, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06267-y
PMID:40038727
|
研究论文 | 本研究探讨了组氨酸代谢如何通过代谢重编程和免疫微环境调控驱动肝细胞癌进展 | 揭示了组氨酸代谢通过下调关键细胞通讯通路(如MIF、CLEC、MHC II)和促进BUD23基因表达来重塑免疫抑制微环境的新机制 | 具体组氨酸代谢产物如何直接调控BUD23的分子机制尚未完全阐明,且临床样本量有限 | 探究组氨酸代谢在肝细胞癌进展中的作用及其对肿瘤免疫微环境的调控机制 | 肝细胞癌样本中的不同细胞类型,包括实质细胞、巨噬细胞和T细胞 | 肿瘤代谢与免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、体内外实验、TCGA数据库分析、多变量Cox回归模型 | 预后模型(基于多变量Cox回归) | 单细胞RNA测序数据、TCGA数据库的转录组数据 | 未明确指定样本数量,但使用了HCC样本和TCGA数据库 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 20 | 2026-03-06 |
Smoothie: Efficient Inference of Spatial Co-expression Networks from Denoised Spatial Transcriptomics Data
2025-Mar-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.26.640406
PMID:40060619
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Smoothie的方法,用于从去噪的空间转录组数据中高效推断空间共表达网络 | Smoothie通过高斯平滑去噪空间转录组数据,并构建和整合全基因组共表达网络,利用隐式和显式并行化技术,可扩展到超过1亿个空间解析点,具有快速运行时间和低内存使用 | NA | 从高分辨率空间转录组数据中提取深层生物学见解,包括基因模块检测、功能注释、基因表达与基因组结构关联以及多样本比较 | 空间转录组数据中的基因表达相关性 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 高斯平滑 | 空间转录组数据 | 超过1亿个空间解析点 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |