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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2025-10-06 |
Comparison of differences in transcriptional and genetic profiles between intra-central nervous system and extra-central nervous system large B-cell lymphoma
2025-02, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2024.101119
PMID:39733690
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研究论文 | 通过多组学测序比较中枢神经系统内和中枢神经系统外大B细胞淋巴瘤的转录和遗传特征差异 | 首次通过单细胞RNA测序和全外显子测序系统揭示PCNS-DLBCL特有的B细胞亚群、免疫抑制微环境和BCR-NFkB/TLR通路突变特征 | 样本量相对有限(93例患者),且为观察性研究 | 探索PCNS-DLBCL的特定发病机制和治疗靶点 | PCNS-DLBCL、继发性CNS-DLBCL和颅外DLBCL患者的肿瘤样本 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序, 全外显子测序, 多组学测序 | NA | 转录组数据, 基因组数据 | 93例患者肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 全外显子组测序 | NA | NA |
| 162 | 2025-10-06 |
β-Catenin mediated TAM phenotype promotes pancreatic cancer metastasis via the OSM/STAT3/LOXL2 axis
2025-02, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2024.101096
PMID:39740539
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研究论文 | 本研究揭示了β-连环蛋白通过调控肿瘤相关巨噬细胞表型促进胰腺癌转移的新机制 | 首次发现β-连环蛋白信号在TAM中特异性激活,并鉴定出β-连环蛋白/OSM-STAT3/LOXL2信号轴在TAM诱导的胰腺癌进展中的关键作用 | 研究主要基于细胞系和动物模型,需要进一步在临床样本中验证 | 探究肿瘤相关巨噬细胞促进胰腺导管腺癌进展的分子机制 | 胰腺导管腺癌细胞、THP-1来源的巨噬细胞、Panc02肺转移模型 | 肿瘤生物学 | 胰腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 体外共培养, 体内转移模型 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 163 | 2025-10-06 |
Osteocyte connexin hemichannels and prostaglandin E2 release dictate bone marrow mesenchymal stromal cell commitment
2025-Feb-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2412144122
PMID:39937859
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研究论文 | 本研究揭示了骨细胞连接蛋白43半通道通过释放前列腺素E2调控骨髓间充质干细胞谱系分化的关键机制 | 首次发现骨细胞Cx43半通道通过PGE2释放调控BM-MSPC命运决定,揭示了骨细胞与间充质干细胞间的新型通讯机制 | 研究主要基于转基因小鼠模型,人类组织验证尚不充分 | 探究骨细胞如何通过Cx43半通道调控骨髓间充质干细胞的谱系定向分化 | 转基因小鼠模型的骨髓间充质干细胞和祖细胞 | 细胞生物学 | 骨骼疾病 | 流式细胞术,单细胞RNA测序 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据,细胞表型数据 | 两种Cx43突变转基因小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 164 | 2025-10-06 |
Shared Lineage, Distinct Outcomes: Yap and Taz Loss Differentially Impact Schwann and Olfactory Ensheathing Cell Development Without Disrupting GnRH-1 Migration
2025-Feb-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.13.638196
PMID:40027653
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了嗅鞘细胞和雪旺细胞的共同起源及遗传差异,并探讨了Yap和Taz缺失对这两种细胞发育的不同影响 | 首次发现Yap和Taz缺失对嗅鞘细胞和雪旺细胞发育产生不同影响,同时证明GnRH-1神经元迁移不受这些变化影响 | 研究仅限于小鼠胚胎模型,尚未在人类或其他物种中验证 | 探究Hippo通路在嗅鞘细胞发育中的作用及其对GnRH-1神经元迁移的影响 | 小鼠胚胎鼻组织中的嗅鞘细胞、雪旺细胞、黑色素细胞和GnRH-1神经元 | 发育生物学 | 神经系统发育疾病 | 单细胞RNA测序,条件性基因敲除 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据,组织学图像 | 小鼠胚胎鼻组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 165 | 2025-10-06 |
Comparison of CD30L and OX40L Reveals CD30L as a Promising Therapeutic Target in Atopic Dermatitis
2025-Feb, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.16412
PMID:39589186
|
研究论文 | 比较CD30L和OX40L在特应性皮炎中的作用,发现CD30L是一个有前景的治疗靶点 | 首次系统比较CD30L和OX40L在特应性皮炎中的作用,证明CD30L阻断具有与IL-13和OX40L阻断相似的治疗效果 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床效果需要进一步验证 | 评估CD30L作为特应性皮炎治疗靶点的潜力 | 人类AD皮肤病变样本和小鼠AD模型 | 免疫学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个AD患者皮肤病变的scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 166 | 2025-10-06 |
STANCE: a unified statistical model to detect cell-type-specific spatially variable genes in spatial transcriptomics
2025-Feb-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57117-w
PMID:39979358
|
研究论文 | 提出一种统一统计模型STANCE,用于检测空间转录组学中的空间变异基因和细胞类型特异性空间变异基因 | 在线性混合效应模型框架下整合基因表达、空间位置和细胞类型组成信息,确保组织空间旋转不变性的结果 | 未在论文摘要中明确说明 | 开发能够准确检测空间变异基因和细胞类型特异性空间变异基因的统计方法 | 空间转录组学数据中的基因表达模式 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学分析 | 线性混合效应模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 167 | 2025-10-06 |
The use of deidentified organ donor testes for research
2025-Feb-06, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.70008
PMID:39912553
|
综述 | 探讨使用去标识化器官捐赠者睾丸组织进行人类睾丸发育与功能研究的价值与应用 | 系统阐述利用遗体捐赠者完整睾丸组织作为研究资源的独特价值,弥补活检样本的局限性 | 未涉及具体实验数据,主要基于现有研究进行综述分析 | 推动人类睾丸发育与功能的基础科学研究 | 去标识化人类捐赠者睾丸组织 | 生殖医学 | 不育症 | 单细胞转录组分析、表观基因组分析、细胞技术开发 | 体外模型 | 分子数据、细胞学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、表观基因组学 | NA | NA |
| 168 | 2025-10-06 |
A unified framework for cell-type-specific eQTL prioritization by integrating bulk and scRNA-seq data
2025-Feb-06, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2024.12.018
PMID:39824189
|
研究论文 | 提出一种整合bulk RNA-seq和scRNA-seq数据的统计框架IBSEP,用于增强细胞类型特异性eQTL的优先排序 | 开发了首个整合bulk和单细胞RNA-seq数据的统一框架,通过分层线性模型结合两种数据类型的优势 | 样本量相对较小,存在技术限制 | 提高细胞类型特异性eQTL的识别精度,揭示复杂疾病的遗传基础 | 外周血单核细胞和大脑皮层数据集 | 生物信息学 | 复杂疾病 | RNA-seq | 分层线性模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 169 | 2025-10-06 |
Epitope Tagging with Genome Editing in Mice Reveals That the Proton Channel OTOP1 Is Apically Localized and Not Restricted to Type III "Sour" Taste Receptor Cells
2025-Feb-05, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.1560-24.2024
PMID:39592233
|
研究论文 | 通过基因编辑在小鼠中标记OTOP1蛋白,揭示其在味觉细胞中的顶端定位和细胞类型分布 | 首次通过内源性蛋白标记技术证明OTOP1质子通道严格定位于味觉细胞顶端,且不局限于III型味觉受体细胞 | 研究仅限于小鼠模型,人类中的定位可能有所不同 | 探究OTOP1质子通道在味觉系统中的细胞和亚细胞定位 | HA-OTOP1基因编辑小鼠的味觉细胞 | 神经科学 | NA | 基因组编辑、高分辨率成像、免疫组织化学、单细胞RNA测序 | NA | 图像、基因表达数据 | 雄性和雌性HA-OTOP1小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 170 | 2025-10-06 |
Targeting FGFR4 Abrogates HNF1A-driven Metastasis in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2025-Feb-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.06.636643
PMID:39974881
|
研究论文 | 本研究揭示了HNF1A通过上调FGFR4驱动胰腺导管腺癌转移的机制,并证明FGFR4抑制剂可有效阻断该转移过程 | 首次发现HNF1A通过调控FGFR4促进PDAC转移,并验证FGFR4抑制剂对转移的阻断作用 | 研究主要基于细胞系和动物模型,临床转化效果需进一步验证 | 探究HNF1A在PDAC转移中的作用机制并寻找靶向治疗策略 | 胰腺导管腺癌细胞系、患者来源PDAC细胞、小鼠移植瘤模型 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 组织芯片分析, UMAP空间分析, RNA干扰 | NA | 基因表达数据, 组织染色图像, 细胞迁移和侵袭数据 | ATCC细胞系、患者来源细胞及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组分析 | NA | NA |
| 171 | 2025-10-06 |
Characteristics of a CCL21 Gene-Modified Dendritic Cell Vaccine Utilized for a Clinical Trial in Non-Small Cell Lung Cancer
2025-Feb-04, Molecular cancer therapeutics
IF:5.3Q1
DOI:10.1158/1535-7163.MCT-24-0435
PMID:39559833
|
研究论文 | 本研究对CCL21基因修饰的树突状细胞疫苗进行了全面表征,并探讨了制造过程中多种因素对疫苗特性的影响 | 首次在非小细胞肺癌临床试验中采用CCL21基因修饰的树突状细胞疫苗,并通过单细胞RNA测序揭示了疫苗细胞的异质性特征 | 研究样本量有限,仅为I期临床试验结果,且使用健康供者血液可能影响疫苗特性的准确性 | 开发能够克服免疫治疗耐药性的新型树突状细胞疫苗 | 非小细胞肺癌患者 | 免疫治疗 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,腺病毒载体转导 | NA | 基因表达数据 | I期临床试验样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 172 | 2025-10-06 |
Identification of Nfel1a and Nfel3 as novel regulators for zebrafish thrombopoiesis
2025-02, Blood cells, molecules & diseases
DOI:10.1016/j.bcmd.2024.102897
PMID:39413675
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序发现斑马鱼血栓细胞与哺乳动物巨核细胞在基因表达上的相似性,并鉴定出Nfe2l1a和Nfe2l3作为调控血栓形成的新转录因子 | 首次在斑马鱼中鉴定出Nfe2l1a和Nfe2l3作为血栓形成的新型正调控转录因子 | 研究仅针对斑马鱼模型,未在哺乳动物中验证相关机制 | 探究Nfe2相关因子在斑马鱼血栓形成过程中的调控作用 | 斑马鱼血栓细胞 | 发育生物学 | 血液疾病 | 单细胞测序,基因敲低 | 斑马鱼模型 | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 173 | 2025-10-06 |
Chronic alcohol consumption enhances the differentiation capacity of hematopoietic stem and progenitor cells into osteoclast precursors
2025-Feb-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.05.636743
PMID:39975302
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研究论文 | 本研究通过食蟹猴模型揭示慢性酒精摄入增强造血干细胞和祖细胞向破骨细胞前体分化的能力 | 首次在灵长类动物模型中证实慢性酒精摄入通过改变造血干细胞和祖细胞的转录组和表观基因组,增强其向破骨细胞前体分化的能力 | 研究仅使用食蟹猴模型,尚未在人类中验证;样本规模有限 | 探究慢性酒精摄入如何影响造血干细胞和祖细胞向破骨细胞的分化能力 | 食蟹猴的造血干细胞和祖细胞及其分化的破骨细胞前体 | 单细胞组学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序,光谱流式细胞术,TRAP染色 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | 食蟹猴模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 174 | 2025-10-06 |
Retinoic acid antagonizes estrogen signaling to maintain adult uterine cell fate
2025-Feb-04, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2416089122
PMID:39874292
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研究论文 | 本研究揭示了视黄酸通过拮抗雌激素信号维持成年小鼠子宫上皮细胞命运的重要机制 | 首次发现视黄酸与雌激素信号通路在维持成年子宫上皮细胞命运中的拮抗平衡机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类子宫中的类似机制需要进一步验证 | 探究成年子宫上皮细胞命运维持的分子机制 | 小鼠子宫上皮细胞 | 发育生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序,基因敲除模型 | 遗传学小鼠模型 | 基因表达数据,组织学图像 | 三种相关基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 175 | 2025-10-06 |
TAp63γ is the primary isoform of TP63 for tumor suppression but not development
2025-Feb-06, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02326-x
PMID:39915463
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研究论文 | 本研究通过基因编辑小鼠模型揭示TP63γ亚型在肿瘤抑制中的关键作用 | 首次证明TP63γ而非TAp63α是TP63介导肿瘤抑制的主要亚型,并阐明其通过调节炎症反应和脂质代谢发挥功能 | 研究仅基于小鼠模型,人类中的功能需要进一步验证 | 探究p63γ亚型的生物学功能及其在肿瘤抑制中的作用机制 | p63γ基因敲除小鼠模型 | 分子生物学 | 肿瘤 | CRISPR-cas9基因编辑, 单细胞RNA测序 | 基因敲除动物模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 176 | 2025-10-06 |
Transcript-specific enrichment enables profiling of rare cell states via single-cell RNA sequencing
2025-Feb, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-02036-7
PMID:39779958
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研究论文 | 开发了一种名为PERFF-seq的可扩展单细胞RNA测序方法,能够通过特定RNA转录本丰度分析稀有细胞亚群 | 提出了基于RNA流式细胞术的程序化分选方法,克服了传统基于细胞表面蛋白标记分选的局限性 | NA | 开发能够分析稀有细胞状态的新型单细胞RNA测序技术 | 免疫细胞群体和脑组织细胞 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序,RNA流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 184,126个细胞(免疫群体)和33,145个细胞核(脑组织) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 177 | 2025-10-06 |
Development of Monoclonal Antibodies for Identifying Plant-Parasitic Nematodes
2025-Feb, Journal of nematology
IF:1.4Q2
DOI:10.2478/jofnem-2025-0024
PMID:40687771
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研究论文 | 本研究开发了用于植物寄生线虫鉴定的单克隆抗体技术 | 首次利用单细胞RNA测序技术从免疫小鼠的成熟B细胞中生成数万种单克隆抗体的核苷酸序列信息用于鉴定目的 | 目前仅通过体外合成两种单克隆抗体进行了概念验证,尚未大规模应用 | 开发更精确的植物寄生线虫鉴定方法以区分致病性或毒力变异 | 植物寄生线虫及其抗原分子 | 生物技术 | 植物寄生虫病 | 单细胞RNA-seq, ELISA | NA | RNA序列数据, 免疫测定数据 | 免疫小鼠的成熟B细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 178 | 2025-10-06 |
NKG2D blockade impairs tissue-resident memory T cell accumulation and reduces chronic lung allograft dysfunction
2025-Feb-24, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.184048
PMID:39989456
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序发现NKG2D阻断可抑制组织驻留记忆T细胞积累并减轻慢性肺移植功能障碍 | 首次揭示CLAD中细胞毒性CD8+ TRM通过NKG2D介导的克隆扩增机制及其在慢性排斥中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证NKG2D阻断的治疗效果 | 探索慢性肺移植功能障碍的发病机制并寻找潜在治疗靶点 | 肺移植患者的CLAD肺组织、肺引流淋巴结及小鼠原位肺移植模型 | 单细胞生物学 | 肺移植相关疾病 | 单细胞RNA测序, TCR测序 | NA | 单细胞转录组数据, TCR序列数据 | CLAD肺组织、肺引流淋巴结及对照组组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 179 | 2025-10-06 |
Defining the regulatory logic of breast cancer using single-cell epigenetic and transcriptome profiling
2025-Feb-12, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100765
PMID:39914387
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研究论文 | 通过单细胞表观遗传和转录组分析揭示乳腺癌的调控逻辑 | 首次在人类乳腺癌组织中实现匹配的单细胞染色质可及性与转录组分析,识别亚型特异性肿瘤的细胞起源并发现致癌基因上调的调控机制 | 样本量有限,仅包含手术切除后立即处理的乳腺组织 | 解析乳腺癌细胞中导致转录失调的顺式调控元件 | 人类乳腺肿瘤组织、健康乳腺组织和乳腺癌细胞系 | 单细胞多组学 | 乳腺癌 | scATAC-seq, scRNA-seq, 线性混合效应模型 | 线性混合效应模型 | 单细胞表观遗传数据, 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量的人类乳腺肿瘤和健康组织 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 180 | 2025-10-06 |
Gene trajectory inference for single-cell data by optimal transport metrics
2025-Feb, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-024-02186-3
PMID:38580861
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研究论文 | 提出了一种名为GeneTrajectory的新方法,通过最优传输度量从单细胞数据中推断基因轨迹而非细胞轨迹 | 首次将最优传输距离应用于基因分布间的计算,直接从细胞-细胞图中提取基因程序并定义基因伪时序顺序 | 未明确说明方法对技术噪声和并发基因过程的处理效果的具体量化评估 | 开发能够准确推断单细胞数据中基因时序动态的新计算方法 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达模式 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 最优传输模型 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |