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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2025-10-07 |
Engineered Extracellular Vesicles Modified by Angiopep-2 Peptide Promote Targeted Repair of Spinal Cord Injury and Brain Inflammation
2025-02-04, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.4c14675
PMID:39853366
|
研究论文 | 本研究开发了Angiopep-2肽修饰的工程化细胞外囊泡,用于促进脊髓损伤的靶向修复和减轻脑部炎症 | 首次将Angiopep-2肽应用于脊髓损伤治疗,通过褪黑素预处理增强工程化细胞外囊泡的功能,实现同时对脊髓损伤部位和脑部的靶向治疗 | NA | 开发能够靶向脊髓损伤部位并具有抗炎修复功能的工程化细胞外囊泡 | 小鼠脊髓损伤模型、M2小胶质细胞、神经元和少突胶质前体细胞 | 生物医学工程 | 脊髓损伤 | 单细胞测序, 单核测序, 免疫荧光, miRNA测序 | NA | 测序数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 162 | 2025-10-07 |
scHNTL: single-cell RNA-seq data clustering augmented by high-order neighbors and triplet loss
2025-Feb-04, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf044
PMID:39878904
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研究论文 | 提出了一种名为scHNTL的新型单细胞RNA测序数据聚类算法,通过高阶邻居和三重损失增强聚类性能 | 结合图注意力自编码器、高阶邻居结构探索和对比学习三重损失,在保持相似数据接近的同时分离不相似数据对 | NA | 改进单细胞RNA测序数据的聚类分析性能 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图注意力自编码器, 三重损失对比学习 | 基因表达数据 | 16个真实世界数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 163 | 2025-10-07 |
Mouse gut blueprint: regionality and resilience
2025-Feb, Trends in immunology
IF:13.1Q1
DOI:10.1016/j.it.2025.01.004
PMID:39880712
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研究论文 | 利用空间转录组学构建小鼠肠道全面图谱,研究其在扰动条件下的适应性与恢复能力 | 首次通过空间转录组学揭示小鼠肠道区域化结构的适应能力及其协调响应机制 | NA | 探索小鼠肠道在扰动条件下的适应性与恢复机制 | 小鼠肠道组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 164 | 2025-10-07 |
Spatially resolved transcriptomics and graph-based deep learning improve accuracy of routine CNS tumor diagnostics
2025-Feb, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-024-00904-z
PMID:39880907
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研究论文 | 开发结合空间转录组学和图神经网络的神经病理学空间转录组分析方法,用于中枢神经系统肿瘤的精确诊断 | 提出NePSTA方法,能够从单个5微米组织切片同时进行形态学和分子神经病理学诊断,克服了传统分子诊断对DNA质量和数量的限制 | 需要在四个医疗中心的130名参与者中进行进一步验证,方法对组织样本处理可能有特殊要求 | 提高中枢神经系统肿瘤常规诊断的准确性 | 中枢神经系统恶性肿瘤患者和健康捐赠者的组织样本 | 数字病理学 | 中枢神经系统肿瘤 | 空间转录组学,DNA甲基化分析,下一代测序 | 图神经网络 | 空间转录组数据,组织图像数据 | 130名参与者(包括CNS恶性肿瘤患者和健康捐赠者) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 165 | 2025-10-07 |
Automated Laser-Assisted Single-Cell Sorting for Cell Functional and RNA Sequencing
2025-Feb-28, ACS sensors
IF:8.2Q1
DOI:10.1021/acssensors.4c02417
PMID:39843241
|
研究论文 | 开发了一种自动化激光辅助单细胞分选系统,用于细胞功能研究和RNA测序 | 将激光诱导正向转移技术与高通量皮升微孔阵列相结合,实现高效自动化的单细胞分选 | NA | 开发高效准确单细胞分选技术用于下游分析 | 单细胞,特别是稀有转染PC-9细胞 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序,激光诱导正向转移 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 166 | 2025-10-07 |
NFE2-driven neutrophil polarization promotes pancreatic cancer liver metastasis progression
2025-02-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.115226
PMID:39827463
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和空间转录组学揭示了胰腺癌肝转移中NFE2驱动的中性粒细胞极化促进转移进展的机制 | 首次发现NFE2是调控中性粒细胞表型极化的关键转录因子,并阐明其在胰腺癌肝转移前沿通过诱导中性粒细胞胞外陷阱形成的具体机制 | NA | 探究胰腺癌肝转移过程中中性粒细胞的免疫重塑作用及其分子机制 | 胰腺癌肝转移组织中的中性粒细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间分布数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 167 | 2025-10-07 |
Single-cell analysis of neoplastic plasma cells identifies myeloma pathobiology mediators and potential targets
2025-Feb-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101925
PMID:39855192
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和B细胞受体测序分析肿瘤性浆细胞,识别骨髓瘤病理生物学介质和潜在治疗靶点 | 首次结合单细胞RNA测序和B细胞受体测序区分单克隆/肿瘤性与多克隆/正常浆细胞,发现比批量分析更多的失调基因 | 研究主要基于临床前模型,需要进一步临床验证 | 探索骨髓瘤病理生物学机制并识别潜在治疗靶点 | 肿瘤性浆细胞和正常浆细胞 | 单细胞测序分析 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序, 单细胞B细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞BCR-seq | NA | NA |
| 168 | 2025-10-07 |
Combining T cell receptor sequencing and transcriptomics to characterize tissue-resident T cells from human gut biopsies
2025-Feb-16, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151353
PMID:39837221
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研究论文 | 本研究首次结合流式细胞术、T细胞受体测序和转录组学技术分析人类胃肠道活检组织中的组织驻留T细胞 | 首次将流式细胞术、TCR测序和转录组学技术相结合,从批量分选的T细胞和单细胞水平分析T细胞受体库 | 概念验证研究,样本量有限,多种技术整合仍处于发展初期 | 表征人类胃肠道活检组织中组织驻留T细胞的特性 | 胃和结肠活检样本及血液样本,来自伴有或不伴有糜烂性胃炎相关炎症的患者 | 免疫学 | 胃肠道疾病 | T细胞受体测序,转录组学,流式细胞术,单细胞测序 | NA | 基因表达数据,TCR序列数据 | 胃、结肠活检样本和血液样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞测序,下一代测序 | NA | NA |
| 169 | 2025-10-07 |
Single-cell and Spatial Transcriptomics Illuminate Bat Immunity and Barrier Tissue Evolution
2025-Feb-03, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msaf017
PMID:39836373
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学技术研究埃及果蝠免疫系统及屏障组织进化特征 | 首次在蝙蝠中揭示补体系统基因在肺和肠道上皮关键区域的独特高表达模式,并与快速进化的编码序列相关联 | 研究主要聚焦于埃及果蝠,其他蝙蝠物种的免疫特征仍需进一步验证 | 探究蝙蝠对病原体抵抗力的分子机制 | 埃及果蝠的肠道、肺部和血细胞,并与小鼠和人类进行比较 | 单细胞生物学 | 传染病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 埃及果蝠、小鼠和人类的多种组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 170 | 2025-10-07 |
Cotton2035: From genomics research to optimized breeding
2025-Feb-03, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2025.01.010
PMID:39844464
|
综述 | 本文回顾棉花基因组学研究进展并展望从基因组学到育种应用的发展路径 | 提出棉花ENCODE项目构想,倡导整合单细胞测序、时空组学与人工智能技术推动棉花育种 | 未涉及具体实验数据验证,主要基于现有研究进展提出前瞻性观点 | 实现从棉花基因组学研究到优化育种的转化应用 | 棉花(Gossypium)野生与栽培物种 | 植物基因组学 | NA | 单细胞测序、时空组学、基因组编辑、人工智能 | NA | 基因组组装、重测序数据、多组学数据 | 多种棉花种群 | NA | 单细胞测序、时空组学 | NA | NA |
| 171 | 2025-10-07 |
Development of BACE2-IN-1/tranylcypromine-based compounds to induce steroidogenesis-dependent neuroprotection
2025-Feb, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2025.117851
PMID:39837213
|
研究论文 | 本研究开发了基于BACE2-IN-1/反苯环丙胺的化合物,通过诱导类固醇生成实现神经保护作用 | 将LSD1抑制剂反苯环丙胺整合到BACE2抑制模板中,并对其进行结构修饰以增强对创伤性脑损伤的治疗效果 | NA | 开发新型神经保护剂以解决创伤性脑损伤未满足的临床需求 | Neuro-2a细胞系和小鼠模型 | 神经科学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序,药物化学设计,行为学测试 | NA | 基因表达数据,行为学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 172 | 2025-10-07 |
Attractor Landscape Analysis Reveals a Reversion Switch in the Transition of Colorectal Tumorigenesis
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202412503
PMID:39840939
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研究论文 | 开发了一个名为REVERT的系统框架,通过单细胞转录组数据分析结直肠肿瘤发生过程中的细胞命运转变机制 | 提出了能够重建核心分子调控网络模型并识别逆转开关的系统框架REVERT | NA | 研究结直肠肿瘤发生过程中的细胞命运转变机制 | 患者来源的结肠癌和正常结肠匹配类器官 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序 | 分子调控网络模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 173 | 2025-10-07 |
IFN-γ reprograms cardiac microvascular endothelial cells to mediate doxorubicin transport and influences the sensitivity of mice to doxorubicin-induced cardiotoxicity
2025-Feb, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-024-01389-7
PMID:39843977
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研究论文 | 本研究揭示了IFN-γ通过重编程心脏微血管内皮细胞调节多柔比星转运,影响小鼠对多柔比星诱导心脏毒性的敏感性 | 首次发现IFN-γ信号通路在调节多柔比星心脏毒性敏感性中的关键作用,并阐明其通过上调P-糖蛋白表达促进多柔比星外排的机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究多柔比星诱导心脏毒性敏感性差异的分子机制 | 小鼠模型和心脏微血管内皮细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 表面增强拉曼光谱,单细胞RNA测序 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据,光谱数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 174 | 2025-10-07 |
Integrative proteogenomic analysis identifies COL6A3-derived endotrophin as a mediator of the effect of obesity on coronary artery disease
2025-Feb, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-02052-7
PMID:39856218
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研究论文 | 通过整合蛋白质组学和基因组学分析,发现COL6A3衍生的内脂素是肥胖影响冠状动脉疾病的中介因子 | 首次通过多组学整合分析确定COL6A3衍生的内脂素作为肥胖与冠状动脉疾病关联的关键介质 | 研究主要基于遗传学证据,需要进一步实验验证机制 | 探究肥胖导致心血管代谢疾病的蛋白质中介机制 | 循环蛋白质、冠状动脉疾病、中风和2型糖尿病 | 生物信息学 | 冠状动脉疾病 | 蛋白质组范围孟德尔随机化、共定位分析、表观基因组学、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、蛋白质组数据、表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 175 | 2025-10-07 |
Spatiotemporal and genetic cell lineage tracing of endodermal organogenesis at single-cell resolution
2025-Feb-06, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.12.012
PMID:39824184
|
研究论文 | 本研究通过创新性遗传追踪技术和单细胞RNA测序,揭示了内胚层器官发生的时空和遗传谱系分化过程 | 开发了针对14个不同内胚层区域的创新遗传追踪编码系统,并在单细胞分辨率上发现了早期内胚层区域具有意外多能性 | NA | 探索早期哺乳动物发育过程中内胚层器官发生的细胞谱系分化机制 | 小鼠内胚层细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 遗传追踪, 成像技术 | NA | 单细胞转录组数据, 成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 176 | 2025-10-07 |
Regulation of fibroblast phenotype in osteoarthritis using CDKN1A-loaded copper sulfide nanoparticles delivered by mesenchymal stem cells
2025-Feb-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00573.2024
PMID:39819042
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研究论文 | 本研究开发了一种负载CDKN1A的硫化铜纳米颗粒通过间充质干细胞递送的系统,用于调控骨关节炎中成纤维细胞表型并促进软骨修复 | 首次构建了MSCs@CuS@CDKN1A纳米工程化平台,通过调控CDKN1A表达同时增强软骨修复和减轻成纤维细胞驱动的炎症 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中进行验证;长期安全性和治疗效果需要进一步评估 | 研究骨关节炎中成纤维细胞表型调控及软骨修复机制 | 成纤维细胞、间充质干细胞、软骨细胞、骨关节炎小鼠模型 | 生物医学工程 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序、伪时序分析、GO/KEGG富集分析、WGCNA、免疫荧光、组织染色 | NA | 单细胞RNA测序数据、转录组数据、影像数据、组织学数据 | 骨关节炎小鼠模型,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 177 | 2025-10-07 |
Progressive natural killer cell dysfunction in advanced-stage clear-cell renal cell carcinoma and association with clinical outcomes
2025-Feb, ESMO open
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.esmoop.2024.104105
PMID:39813824
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了透明细胞肾细胞癌中自然杀伤细胞的进行性功能障碍及其与临床预后的关联 | 首次在ccRCC中系统描述了NK细胞的表型异质性,发现了一种与疾病进展相关的功能失调NK细胞亚群,并建立了与患者生存相关的基因表达特征 | 样本量相对有限(13例患者),需要更大规模的研究验证发现 | 探究透明细胞肾细胞癌中自然杀伤细胞的表型、功能及其与临床结局的关系 | 透明细胞肾细胞癌患者及其配对的正常肾脏组织 | 单细胞转录组学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,基因表达分析 | 聚类分析,差异基因表达分析 | 单细胞转录组数据,流式细胞数据,临床数据 | 13例ccRCC患者的21,139个NK细胞(包括13个原发肿瘤、1个局部肿瘤扩展、1个转移灶及配对的正常肾脏组织) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 178 | 2025-10-07 |
Anxiety-like behavior and altered hippocampal activity in a transgenic mouse model of Fabry disease
2025-Feb, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2025.106797
PMID:39788162
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研究论文 | 本研究通过转基因法布里病小鼠模型探索焦虑样行为与海马体功能改变之间的关联 | 首次在法布里病模型中结合行为学、转录组学、功能和形态学评估,揭示海马体细胞群中Gb3沉积与基因表达异常的关系 | 研究仅使用雄性小鼠模型,未涵盖性别差异;结果主要基于动物模型,人类直接适用性需进一步验证 | 探究法布里病神经精神症状的病理机制,特别是焦虑行为与海马体功能异常的关系 | 转基因法布里病小鼠模型 | 神经科学 | 法布里病 | 单细胞测序, 行为学测试, 电生理记录 | 转基因小鼠模型 | 行为数据, 转录组数据, 电生理数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 179 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing of the spleen reveals differences in Salmonella typhimurium infection mechanisms between different chicken breeds
2025-Feb, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2024.104669
PMID:39793244
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较不同鸡品种脾脏对鼠伤寒沙门氏菌感染的免疫应答差异 | 首次对鸡脾脏进行单细胞转录组分析,揭示不同品种鸡在细菌感染中的免疫调节机制差异 | 研究仅关注脾脏免疫细胞,未涉及其他免疫器官;样本量相对有限 | 探究不同鸡品种对鼠伤寒沙门氏菌感染的免疫应答机制差异 | 北京油鸡和科宝肉鸡的脾脏CD45+免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 细菌感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 54,487个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 180 | 2025-10-07 |
Combined analysis of bulk, single-cell RNA sequencing, and spatial transcriptomics reveals the expression patterns of lipid metabolism and ferroptosis in the immune microenvironment of metabolic-associated fatty liver disease
2025-Feb-01, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2025.123377
PMID:39793853
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研究论文 | 通过整合分析bulk RNA测序、单细胞RNA测序和空间转录组学数据,揭示脂质代谢和铁死亡在代谢相关脂肪肝病免疫微环境中的表达模式 | 首次将单细胞RNA测序、bulk RNA测序和空间转录组学数据整合分析,构建了MAFLD风险评估系统和预测模型,并发现11个与铁死亡和脂质代谢相关的关键基因 | NA | 识别与铁死亡和脂质代谢相关的关键生物标志物,研究它们在MAFLD进展中的作用及其与免疫浸润环境的相互作用 | 代谢相关脂肪肝病(MAFLD)患者的肝脏样本 | 生物信息学 | 代谢相关脂肪肝病 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,空间转录组学,WGCNA | 风险评估系统,预测模型 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |