单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 652 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2025-10-06 |
Bioinformatics analysis of shared biomarkers and immune pathways of preeclampsia and periodontitis
2025-Feb-27, BMC pregnancy and childbirth
IF:2.8Q1
DOI:10.1186/s12884-025-07277-w
PMID:40016711
|
研究论文 | 通过生物信息学分析发现先兆子痫和牙周炎共享的生物标志物和免疫通路 | 首次系统识别先兆子痫和牙周炎的共享枢纽基因和免疫通路，并构建诊断模型 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要实验验证 | 探索先兆子痫和牙周炎的共同发病机制 | 牙周组织和胎盘组织的基因表达数据 | 生物信息学 | 先兆子痫和牙周炎 | 转录组分析，单细胞RNA测序 | XG-Boost，机器学习 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的多个转录组数据集 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 142 | 2025-10-06 |
Integration and functionality of human iPSC-derived microglia in a chimeric mouse retinal model
2025-Feb-27, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03393-8
PMID:40016767
|
研究论文 | 本研究开发了一种包含人iPSC来源小胶质细胞的嵌合体小鼠视网膜模型，用于研究人类小胶质细胞在视网膜环境中的功能 | 创建了首个包含异种移植人类小胶质细胞的离体嵌合体视网膜模型，实现了超过86%的人类小胶质细胞整合率 | 研究仅进行了14天的培养观察，长期功能维持和安全性尚未评估 | 开发能够准确模拟人类小胶质细胞功能的视网膜疾病研究模型 | 人类诱导多能干细胞来源的小胶质细胞和小鼠视网膜组织 | 神经科学 | 视网膜退行性疾病 | 单细胞RNA测序，免疫染色，抗体中和实验 | 嵌合体小鼠视网膜模型 | 基因表达数据，图像数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 143 | 2025-10-06 |
A novel stemness-related lncRNA signature predicts prognosis, immune infiltration and drug sensitivity of clear cell renal cell carcinoma
2025-Feb-27, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06251-6
PMID:40016772
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于干性相关长链非编码RNA的预后特征模型，用于预测透明细胞肾细胞癌的预后、免疫浸润和药物敏感性 | 首次将RNA干性评分与WGCNA分析相结合识别SRlncRNAs，并构建了包含6个SRlncRNAs的预后特征模型，同时开发了基于网络的临床应用计算器 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，需要更多前瞻性研究验证模型的临床实用性 | 探索干性相关长链非编码RNA在透明细胞肾细胞癌预后预测中的作用并开发风险分层模型 | 透明细胞肾细胞癌患者 | 生物信息学 | 肾癌 | RNA-seq, scRNA-seq, RT-qPCR, WGCNA, LASSO回归, Cox回归 | 机器学习算法, 预后特征模型 | 基因表达数据, 临床数据 | TCGA-KIRC和GSE29609队列样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 144 | 2025-10-06 |
Anti-inflammatory actions of ripasudil ameliorate experimental autoimmune uveoretinitis in the acute phase
2025-Feb-27, BMJ open ophthalmology
IF:2.0Q2
DOI:10.1136/bmjophth-2024-001981
PMID:40021201
|
研究论文 | 研究Rho激酶抑制剂ripasudil在实验性自身免疫性葡萄膜视网膜炎急性期的抗炎作用机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示ripasudil通过抑制ROCK信号通路相关基因高表达的T细胞分化来缓解葡萄膜视网膜炎 | 研究仅使用小鼠模型，未在人类患者中验证；药物干预时间点固定（免疫后8天开始） | 评估ripasudil对实验性自身免疫性葡萄膜视网膜炎的抑制作用并阐明其机制 | C57BL/6小鼠的脾脏T细胞 | 免疫学 | 葡萄膜炎 | 单细胞RNA测序, 临床和组织病理学检查, T细胞活化状态分析 | 实验性自身免疫性葡萄膜视网膜炎动物模型 | 基因表达数据, 病理图像数据 | 野生型C57BL/6小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 145 | 2025-10-06 |
Application of scRNA-seq in Dental Research: Seeking Regenerative Clues From the Structure of Tooth and Periodontium in Physical or Pathological States
2025-Feb-21, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/FBL26200
PMID:40018926
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在牙齿和牙周组织研究中的应用，揭示了组织细胞组成并识别了新细胞类型 | 通过单细胞测序首次系统揭示牙齿和牙周组织的细胞组成变化及细胞间通讯模式在病理状态下的改变 | NA | 探索牙齿和牙周组织在生理和病理状态下的再生机制 | 牙齿和牙周组织 | 单细胞生物学 | 牙科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 146 | 2025-05-11 |
Eliminating the persistent HIV reservoir based on biomarker expression - How do we get there?
2025-02, Virology
IF:2.8Q3
DOI:10.1016/j.virol.2024.110368
PMID:39721194
|
review | 本文讨论了消除HIV持久性储存库的挑战，以及基于生物标志物表达的策略 | 探讨了识别定义所有HIV储存库细胞亚群的最小细胞表面蛋白集的需求，并提出了未来研究方向 | 目前缺乏定义HIV潜伏感染细胞的特定分子标志物或生物标志物，且生物标志物存在异质性 | 研究如何通过生物标志物表达来消除HIV持久性储存库，实现HIV治愈 | HIV持久性储存库及其生物标志物 | 传染病学 | HIV/AIDS | 空间转录组学和蛋白质组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 147 | 2025-05-10 |
Single-cell RNA-seq and pathological phenotype reveal the functional atlas and precise roles of Sox30 in testicular cell development and differentiation
2025-Feb-19, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07442-1
PMID:39971903
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和病理表型分析，揭示了Sox30在睾丸细胞发育和分化中的功能图谱和精确作用 | 首次详细描述了Sox30在睾丸细胞中的具体功能，特别是在初级精母细胞分化中的作用，并揭示了Sox30缺失对细胞间通讯和转录因子网络的影响 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需验证 | 阐明Sox30在睾丸细胞发育和分化中的精确作用机制 | 小鼠睾丸细胞 | 单细胞测序 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量，但涉及野生型和Sox30缺失型小鼠的睾丸细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 148 | 2025-05-10 |
Unravelling genotype-phenotype correlations in Stargardt disease using patient-derived retinal organoids
2025-Feb-19, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07420-7
PMID:39971915
|
研究论文 | 利用患者来源的视网膜类器官研究Stargardt病的基因型-表型相关性 | 首次使用患者来源的iPSCs生成视网膜类器官，成功模拟了STGD1的病理特征并揭示了基因型与表型之间的相关性 | 研究仅涉及两名单等位基因未解决的STGD1患者和一名双等位基因受影响对照，样本量较小 | 探究STGD1的细胞和分子特征及其基因型-表型相关性 | STGD1患者和对照的iPSCs来源的视网膜类器官 | 遗传性视网膜疾病研究 | Stargardt病 | iPSC技术、视网膜类器官培养、scRNA-Seq、全基因组测序、长读长RNA测序 | 视网膜类器官模型 | 基因测序数据、单细胞RNA测序数据、RNA-seq数据 | 两名单等位基因未解决的STGD1患者和一名双等位基因受影响对照 | NA | NA | NA | NA |
| 149 | 2025-05-10 |
Polycystic ovary syndrome and epithelial-mesenchymal transition: Mendelian randomization and single-cell analysis insights
2025-Feb-19, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-025-01617-2
PMID:39972362
|
研究论文 | 本研究通过转录组学和单细胞RNA测序结合孟德尔随机化分析，探索了与多囊卵巢综合征(PCOS)中上皮-间质转化(EMT)相关的关键基因及其分子调控机制 | 首次从转录组学和单细胞RNA测序角度结合孟德尔随机化分析，鉴定出与PCOS风险降低相关的三个EMT相关基因(NUCB2、PGF、CRIM1)，并发现成纤维细胞是PCOS病理中的关键细胞群 | 研究仅基于公共数据库数据，缺乏实验验证 | 探索PCOS中EMT相关关键基因及其分子调控机制 | 多囊卵巢综合征(PCOS)患者样本 | 生物信息学 | 多囊卵巢综合征 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、孟德尔随机化(MR)分析 | NA | 转录组数据 | 公共数据库中的PCOS样本数据 | NA | NA | NA | NA |
| 150 | 2025-05-10 |
Precise gene expression deconvolution in spatial transcriptomics with STged
2025-Feb-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf087
PMID:39970279
|
研究论文 | 提出了一种名为STged的新型计算框架，用于从空间转录组学数据中精确解卷积细胞类型特异性基因表达谱 | STged通过整合基于图的空间相关性和参考基因特征，超越了传统的细胞类型解卷积方法，能够重建混合点中的细胞类型特异性基因表达谱 | NA | 解决空间转录组学中细胞类型特异性基因表达模式被掩盖的问题 | 人类胰腺导管腺癌、人类鳞状细胞癌数据集以及小鼠肾脏组织 | 数字病理学 | 胰腺癌、鳞状细胞癌 | 空间转录组学 | 非负最小二乘回归框架 | 基因表达数据 | 人类和小鼠组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 151 | 2025-05-07 |
scRecover: Discriminating True and False Zeros in Single-Cell RNA-Seq Data for Imputation
2025-Feb-28, Statistics in medicine
IF:1.8Q1
DOI:10.1002/sim.10334
PMID:39912305
|
研究论文 | 介绍了一种名为scRecover的新工具，用于区分单细胞RNA-seq数据中的真实零值和假零值，并进行有效的插补 | 提出了一种统计框架，能有效区分真实零值（基因未表达）和假零值（信号丢失），并开发了新的插补工具scRecover | 需要与其他插补方法（如scImpute、SAVER和MAGIC）结合使用 | 提高单细胞RNA-seq数据中零值插补的准确性 | 单细胞RNA-seq数据中的零值 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq | 零膨胀负二项模型，Good和Toulmin模型的改进版 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 152 | 2025-05-07 |
Immune microenvironment spatial landscapes of tertiary lymphoid structures in gastric cancer
2025-Feb-04, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-025-03889-3
PMID:39901202
|
research paper | 该研究探讨了胃癌中三级淋巴结构（TLS）对免疫微环境空间景观的影响及其预后价值 | 首次全面分析了胃癌中TLS的免疫微环境空间特征，并开发了基于免疫细胞密度和空间特征的风险评分模型 | 样本量相对较小（单细胞测序仅12例，空间转录组仅2例） | 阐明TLS在胃癌免疫微环境中的作用机制及其预后意义 | 胃癌患者的肿瘤组织和免疫微环境 | digital pathology | gastric cancer | multispectral fluorescence imaging, single-cell RNA sequencing, spatial transcriptomics | Density and Spatial Score risk model | image, transcriptomic data | 59例接受免疫治疗的GC患者（预后分析），110例GC患者（免疫细胞分析），12例单细胞测序样本（4例TLS阳性，8例阴性），2例空间转录组样本 | NA | NA | NA | NA |
| 153 | 2025-05-07 |
O-GlcNAcylation attenuates ischemia-reperfusion-induced pulmonary epithelial cell ferroptosis via the Nrf2/G6PDH pathway
2025-Feb-04, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-025-02126-w
PMID:39901237
|
research paper | 该研究探讨了O-GlcNAcylation通过Nrf2/G6PDH通路减轻缺血再灌注诱导的肺上皮细胞铁死亡的作用 | 首次揭示了O-GlcNAcylation通过Nrf2/G6PDH通路在肺缺血再灌注损伤中的保护机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞实验，尚未在人体中进行验证 | 探究O-GlcNAcylation对肺缺血再灌注损伤中铁死亡的影响 | 肺上皮细胞和TC-1细胞 | 分子生物学 | 急性肺损伤/急性呼吸窘迫综合征(ALI/ARDS) | 单细胞测序、蛋白质组学分析、染色质免疫沉淀(ChIP)实验、双荧光素酶报告基因检测 | Ogt1条件性敲除小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | 未明确说明样本数量，但使用了小鼠模型和TC-1细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 154 | 2025-05-07 |
Single-cell sequencing provides clues about the developmental genetic basis of evolutionary adaptations in syngnathid fishes
2025-Feb-03, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.97764
PMID:39898521
|
research paper | 该研究通过单细胞RNA测序技术探索了海龙科鱼类进化适应的发育遗传基础 | 首次构建了海湾管鱼胚胎的单细胞RNA测序图谱，揭示了其特殊性状（如雄性怀孕、无齿等）的发育遗传机制 | 研究仅针对单一物种（海湾管鱼）的胚胎阶段，未来需要跨物种和多发育阶段的比较研究 | 探究海龙科鱼类特殊性状的发育遗传基础 | 海湾管鱼胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 海湾管鱼胚胎样本（具体数量未明确说明） | NA | NA | NA | NA |
| 155 | 2025-05-07 |
Single-cell RNA sequencing of neonatal cortical astrocytes reveals versatile cell clusters during astrocyte-neuron conversion
2025-Feb-03, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-025-10309-5
PMID:39899158
|
research paper | 通过单细胞RNA测序技术研究新生鼠皮质星形胶质细胞在向神经元转化过程中的异质性及其转化潜力 | 揭示了星形胶质细胞在神经元转化过程中的异质性，并识别出具有更高转化潜力的Astrocyte 3亚群 | 研究仅基于体外实验，未验证体内环境下的转化效果 | 探究星形胶质细胞向神经元转化的异质性及其分子机制 | 新生鼠皮质星形胶质细胞 | 生物医学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 体外培养的星形胶质细胞在Day 1和Day 9两个时间点的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 156 | 2025-05-07 |
Optimized gene transduction in human lung organoids: A high-efficiency method for advanced research applications
2025-Feb-03, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-07461-w
PMID:39900972
|
研究论文 | 本文优化了一种提高慢病毒载体在人iPSC来源肺类器官中转导效率的方法 | 通过物理破坏类器官增加表面积并结合旋转接种法，显著提高了转导效率 | 方法可能不适用于其他类型的类器官或细胞模型 | 提高基因转导效率以促进肺研究和疾病模型研究 | 人iPSC来源的肺类器官 | 生物医学工程 | 肺疾病 | 慢病毒载体转导、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 157 | 2025-05-07 |
Monocyte-macrophage dynamics as key in disparate lung and peripheral immune responses in severe anti-melanoma differentiation-associated gene 5-positive dermatomyositis-related interstitial lung disease
2025-Feb, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70226
PMID:39902678
|
research paper | 该研究通过单细胞RNA测序技术，探索了抗MDA5阳性皮肌炎相关间质性肺病中单核-巨噬细胞动态在免疫失调中的关键作用 | 揭示了外周与肺部免疫景观的显著对比，以及单核-巨噬细胞系在免疫失调中的核心作用 | 样本量较小，仅涉及五名患者 | 深入了解严重抗MDA5阳性皮肌炎相关间质性肺病中外周和肺部免疫失调的机制，并探索潜在的治疗靶点 | 抗MDA5阳性皮肌炎相关间质性肺病患者的外周血单核细胞和支气管肺泡灌洗液 | 免疫学 | 间质性肺病 | 单细胞RNA测序、Luminex检测、流式细胞术 | NA | RNA序列数据 | 5名患者的支气管肺泡灌洗液和配对的外周血单核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 158 | 2025-05-07 |
IgG Signalling Involves in Skin Inflammation of Atopic Dermatitis
2025-Feb, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.70058
PMID:39912287
|
研究论文 | 本研究探讨了IgE产生B细胞及其他免疫球蛋白同种型（特别是IgG）在特应性皮炎（AD）皮肤病变中的作用 | 揭示了IgG在AD皮肤炎症中的潜在作用及其通过巨噬细胞促进Th2炎症的机制 | 未明确IgG具体通过何种机制激活巨噬细胞及促进炎症 | 研究IgE产生B细胞及其他免疫球蛋白同种型在AD皮肤病变中的作用 | 特应性皮炎患者及非过敏性健康受试者的皮肤病变和PBMCs | 免疫学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序、BCR库分析 | NA | mRNA数据、单细胞RNA测序数据 | AD患者及健康受试者的皮肤病变和PBMCs样本 | NA | NA | NA | NA |
| 159 | 2025-10-07 |
PFKFB3 decreases α-ketoglutarate production while partial PFKFB3 knockdown in macrophages ameliorates arthritis in tumor necrosis factor-transgenic mice
2025-Feb-20, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114102
PMID:39870011
|
研究论文 | 本研究探讨PFKFB3在类风湿关节炎巨噬细胞中的作用机制及其对疾病发展的影响 | 首次揭示PFKFB3通过调控谷氨酸脱氢酶活性和α-酮戊二酸产生来调节巨噬细胞极化状态 | 研究主要基于细胞和小鼠模型，人类样本验证仍需进一步扩展 | 探究PFKFB3在类风湿关节炎巨噬细胞活化中的作用及其分子机制 | RA患者PBMCs、THP-1细胞、条件性PFKFB3敲除小鼠的骨髓源性巨噬细胞 | 免疫学 | 类风湿关节炎 | 单细胞测序、免疫共沉淀、基因敲除、细胞培养 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据、细胞表型数据 | RA患者和健康志愿者的PBMCs、THP-1细胞系、基因工程小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 160 | 2025-10-07 |
Targeted FTO knockout in endothelial cells Boosts adhesion and lowers inflammatory infiltration to alleviate pulmonary arterial hypertension
2025-Feb-16, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151339
PMID:39869947
|
研究论文 | 本研究探讨了内皮细胞特异性FTO敲除对肺动脉高压发展的影响 | 首次揭示内皮细胞FTO在肺动脉高压中的作用机制，发现其通过调节内皮细胞粘附和炎症细胞浸润影响疾病发展 | 研究主要聚焦于内皮细胞，未涉及其他细胞类型在肺动脉高压中的潜在作用 | 探究FTO蛋白在肺动脉高压发病机制中的作用 | 内皮细胞和肺动脉高压小鼠模型 | 单细胞生物学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序，基因敲除 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |