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当前共找到 646 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2025-10-06 |
Pro-Fibrotic Macrophage Subtypes: SPP1+ Macrophages as a Key Player and Therapeutic Target in Cardiac Fibrosis?
2025-02-27, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14050345
PMID:40072075
|
综述 | 本文探讨SPP1+巨噬细胞在心脏纤维化中的关键作用及作为治疗靶点的潜力 | 首次系统阐述SPP1+巨噬细胞作为心脏纤维化关键介质和治疗靶点的作用机制 | 主要基于临床前研究数据，尚未在人体临床试验中得到验证 | 研究心脏纤维化的发病机制和潜在治疗策略 | SPP1+巨噬细胞及其与成纤维细胞、肌成纤维细胞的相互作用 | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 142 | 2025-10-06 |
TcEVdb: a database for T-cell-derived small extracellular vesicles from single-cell transcriptomes
2025-Feb-28, Database : the journal of biological databases and curation
DOI:10.1093/database/baaf012
PMID:40402791
|
研究论文 | 构建了一个名为TcEVdb的综合性数据库，用于探索T细胞来源的小细胞外囊泡的表达和聚类 | 首次通过SEVtras方法从T细胞单细胞RNA测序数据构建了全面的TcEV数据库，揭示了TcEV的异质性 | 基于计算推断而非直接实验验证的EV数据，可能存在技术局限性 | 探索T细胞来源的细胞外囊泡的转录组特征和功能 | T细胞来源的小细胞外囊泡 | 生物信息学 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | SEVtras方法 | 单细胞转录组数据 | 277,265个EV液滴，来自21个项目中的221个样本，涵盖51种T细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 143 | 2025-10-06 |
CAF-macrophage crosstalk in tumour microenvironments governs the response to immune checkpoint blockade in gastric cancer peritoneal metastases
2025-Feb-06, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-333617
PMID:39537239
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了胃癌腹膜转移中基质-髓系生态位通过C3-C3AR1轴介导免疫检查点抑制剂耐药的机制 | 首次发现胃癌腹膜转移中THBS2+基质癌相关成纤维细胞通过C3-C3AR1轴招募并转化巨噬细胞形成免疫抑制微环境 | 样本量有限，需更大规模研究验证 | 阐明胃癌腹膜转移对免疫检查点抑制剂耐药的机制 | 胃癌腹膜转移患者样本（原发肿瘤、腹膜转移灶和外周血） | 单细胞生物学 | 胃癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | II期临床试验患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 144 | 2025-10-06 |
Association of 5α-reductase inhibitor prescription with immunotherapy efficacy in metastatic renal cell carcinoma: a multicenter retrospective analysis
2025-Feb-25, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-011154
PMID:40010773
|
研究论文 | 本研究探讨5α-还原酶抑制剂使用史对转移性肾细胞癌患者免疫检查点抑制剂疗效的影响 | 首次在临床回顾性研究中证实5α-还原酶抑制剂可通过调节CD8+ T细胞功能增强免疫治疗效果 | 回顾性研究设计存在选择偏倚，样本量相对有限（185例患者） | 评估5α-还原酶抑制剂使用史对转移性肾细胞癌免疫治疗疗效的影响 | 185例接受免疫检查点抑制剂治疗的转移性肾细胞癌患者 | 肿瘤免疫学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序，Cox比例风险模型 | Cox回归模型 | 临床回顾性数据，单细胞RNA测序数据 | 185例转移性肾细胞癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 145 | 2025-10-06 |
Brain-wide cell-type-specific transcriptomic signatures of healthy ageing in mice
2025-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08350-8
PMID:39743592
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序系统描绘小鼠大脑在健康衰老过程中细胞类型特异性转录组变化 | 提供了首个涵盖全脑区域、包含约120万个高质量单细胞转录组的衰老数据集，识别了847个细胞簇和14个年龄偏向性胶质细胞簇 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及人类样本；主要关注转录组水平变化，缺乏功能验证 | 系统解析健康衰老过程中大脑细胞类型特异性转录组变化 | 年轻和年老雌雄小鼠的大脑细胞，涵盖前脑、中脑和后脑区域 | 单细胞转录组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约120万个高质量单细胞转录组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 146 | 2025-10-06 |
An analysis of single-cell data reveals therapeutic effects of AMG487 in experimental autoimmune uveitis
2025-02, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2024.116671
PMID:39615601
|
研究论文 | 通过单细胞测序分析揭示AMG487在实验性自身免疫性葡萄膜炎中的治疗作用机制 | 首次在单细胞水平系统分析CXCR3拮抗剂AMG487对葡萄膜炎免疫细胞的调控机制 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化需要进一步验证 | 探究AMG487在自身免疫性葡萄膜炎中的治疗作用和分子机制 | Vogt-小柳-原田综合征患者外周血和实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠淋巴结免疫细胞 | 单细胞组学 | 自身免疫性葡萄膜炎 | 单细胞ATAC测序, 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | NA | NA | single-cell ATAC-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 147 | 2025-10-06 |
CMAP prediction and experimental validation of Forskolin as a podocyte protective and anti-proteinuric drug for nephrotoxic serum-treated mice
2025-02, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2024.116727
PMID:39716644
|
研究论文 | 通过结合肾脏单细胞RNA测序数据库和CMAP数据库预测并验证毛喉素对肾毒性血清诱导的足细胞损伤的保护作用 | 首次将肾脏单细胞RNA测序与CMAP数据库结合预测足细胞损伤治疗药物 | 研究主要聚焦于肾毒性血清诱导的足细胞损伤模型 | 开发针对特定足细胞损伤机制的治疗策略 | 小鼠足细胞和肾毒性血清处理的小鼠模型 | 生物信息学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, GO和KEGG富集分析, CMAP分析 | NA | 基因表达数据 | 肾毒性血清处理和对照组小鼠的肾小球单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 148 | 2025-10-06 |
Divergence in cellular markers observed in single-cell transcriptomics datasets between cultured primary trabecular meshwork cells and tissues
2025-Feb-14, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-025-04528-5
PMID:39952952
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序比较体外培养的原代人小梁网细胞与组织样本，揭示细胞标记物的差异 | 首次报道比较原代hTM细胞培养物与hTM组织的单细胞转录组数据集 | 样本量相对有限，仅包含14个体外样本 | 研究小梁网细胞在体外培养与组织原位状态下的基因表达差异 | 原代人小梁网细胞和组织的单细胞转录组 | 单细胞转录组学 | 青光眼 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 14个原代hTM体外样本（包含4个青光眼患者样本），传代1-4代 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 149 | 2025-10-06 |
Disruption of GPSM1/CSF1 signaling reprograms tumor-associated macrophages to overcome anti-PD-1 resistance in colorectal cancer
2025-Feb-25, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010826
PMID:40010765
|
研究论文 | 本研究揭示了GPSM1通过调控肿瘤相关巨噬细胞极化介导结直肠癌抗PD-1耐药的新机制 | 首次发现GPSM1/USP9X/MEIS3信号轴通过驱动巨噬细胞M2极化导致抗PD-1耐药，并鉴定出鲁索替尼作为潜在治疗候选药物 | 研究主要基于临床样本和动物模型，尚未进行大规模临床试验验证 | 探索GPSM1在结直肠癌抗PD-1耐药中的作用机制及潜在治疗策略 | 结直肠癌患者肿瘤样本、C57BL/6小鼠异种移植模型 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,多重免疫荧光,质谱流式,流式细胞术,ChIP-PCR,质谱分析,免疫共沉淀 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,图像数据 | 抗PD-1耐药结直肠癌患者肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 150 | 2025-10-06 |
CHOIR improves significance-based detection of cell types and states from single-cell data
2025-Feb-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.18.576317
PMID:38328105
|
研究论文 | 介绍了一种名为CHOIR的聚类方法，通过随机森林和置换测试优化单细胞数据中的细胞类型识别 | 提出了一种基于随机森林分类器和置换测试的层次聚类优化框架，能够统计确定不同细胞群体 | NA | 解决单细胞数据聚类中过度聚类或不足聚类的问题，提高细胞类型识别的准确性 | 单细胞数据中的细胞类型和状态 | 生物信息学 | NA | 随机森林, 置换测试, 层次聚类 | 随机森林 | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, 空间转录组, 多组学数据 | 100个模拟数据集和4个真实数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 151 | 2025-10-06 |
InfoScan: A New Transcript Identification Tool Based on scRNA-Seq and Its Application in Glioblastoma
2025-Feb-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26052208
PMID:40076844
|
研究论文 | 开发了一种基于单细胞RNA测序的转录本识别工具InfoScan，并应用于胶质母细胞瘤研究 | 开发了新型生物信息学工具InfoScan，能够识别未注释转录本和罕见细胞群体，并在胶质母细胞瘤中发现具有癌症干细胞特征的'肿瘤干细胞样'亚群 | NA | 开发单细胞RNA测序数据分析工具并探索胶质母细胞瘤的转录组特征 | 胶质母细胞瘤组织和其中的细胞亚群 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 152 | 2025-10-06 |
stAI: a deep learning-based model for missing gene imputation and cell-type annotation of spatial transcriptomics
2025-Feb-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf158
PMID:40057378
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研究论文 | 提出一种基于深度学习的模型stAI，用于空间转录组数据的缺失基因插补和细胞类型注释 | 首次提出同时解决空间转录组数据中缺失基因插补和细胞类型注释的深度学习模型，采用联合嵌入和双编码器-解码器模块 | NA | 解决单细胞空间转录组技术中全转录组水平表征和细胞类型全面注释的挑战 | 单细胞空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 深度学习，编码器-解码器 | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 153 | 2025-10-06 |
Single-Cell Sequencing: Genomic and Transcriptomic Approaches in Cancer Cell Biology
2025-Feb-27, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26052074
PMID:40076700
|
综述 | 本文综述单细胞测序技术在癌症生物学研究中的基因组和转录组学方法及其影响 | 整合单细胞测序与多组学数据提供癌症细胞状态和调控机制的多维视角，结合人工智能和机器学习解析海量数据 | NA | 探讨单细胞测序技术对癌症生物学研究的推动作用 | 癌症细胞生物学 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞测序，空间转录组学，原位测序 | 机器学习，人工智能 | 基因组数据，转录组数据，表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，单细胞多组学，空间转录组学 | NA | NA |
| 154 | 2025-10-06 |
Comprehensive SHAP Values and Single-Cell Sequencing Technology Reveal Key Cell Clusters in Bovine Skeletal Muscle
2025-Feb-26, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26052054
PMID:40076676
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研究论文 | 通过SHAP值和单细胞测序技术揭示牛骨骼肌中关键细胞群及其基因调控机制 | 首次结合SHAP值分析和单细胞测序构建476个关键基因的交互网络，成功绘制骨骼肌单细胞图谱并识别肌纤维细胞的核心地位 | 研究仅聚焦牛和猪的跨物种比较，未涵盖更多物种；样本规模未明确说明 | 解析牛骨骼肌中不同细胞群的重要性排序及其在肌肉发育中的调控机制 | 牛骨骼肌组织中的细胞群体（特别是肌纤维细胞和中性粒细胞） | 单细胞生物学 | NA | 单细胞测序，SHAP值分析，蛋白质语言模型 | 机器学习模型（具体类型未明确），蛋白质语言模型 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 155 | 2025-10-06 |
Identification of Prognostic Genes Related to Cell Senescence and Lipid Metabolism in Glioblastoma Based on Transcriptome and Single-Cell RNA-Seq Data
2025-Feb-21, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26051875
PMID:40076502
|
研究论文 | 本研究通过转录组和单细胞RNA测序数据识别与细胞衰老和脂质代谢相关的胶质母细胞瘤预后基因 | 首次整合细胞衰老和脂质代谢相关基因构建胶质母细胞瘤预后模型，并通过单细胞分辨率分析基因表达动态 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 改善胶质母细胞瘤的预后预测和治疗策略 | 胶质母细胞瘤患者 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, WGCNA, Cox回归分析 | 风险模型, 列线图 | 基因表达数据, 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 156 | 2025-10-06 |
Spatial Transcriptomic Analysis of Surgical Resection Specimens of Primary Head and Neck Squamous Cell Carcinoma Treated with Afatinib in a Window-of-Opportunity Study (EORTC90111-24111)
2025-Feb-20, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26051830
PMID:40076457
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析阿法替尼治疗的头颈部鳞状细胞癌手术标本，探索抗HER治疗下的肿瘤演变和组成 | 首次在窗口期临床试验中结合空间转录组学和RNA测序分析阿法替尼诱导的头颈部鳞癌肿瘤微环境变化 | 样本量较小，仅分析了三个患者的标本 | 探索抗HER治疗下头颈部鳞状细胞癌的肿瘤演变和微环境组成变化 | 头颈部鳞状细胞癌患者的手术标本和肿瘤活检组织 | 空间转录组学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 空间转录组学, RNA测序 | NA | 空间转录组数据, RNA测序数据 | 3例患者手术标本（ID08, ID15, ID30） | NA | 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 157 | 2025-10-06 |
The establishment of the anther somatic niche with single-cell sequencing
2025-02, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2024.11.004
PMID:39547468
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术研究玉米花药体细胞微环境的发育过程 | 首次建立玉米花药体细胞微环境的单细胞RNA测序数据集，揭示了体细胞类型从减数分裂前到减数分裂后的发育轨迹 | 研究聚焦于玉米特定物种，结果在其他植物中的普适性需要进一步验证 | 解析开花植物花药体细胞微环境的发育机制和细胞类型特异性基因表达 | 玉米(Zea mays)花药的体细胞微环境 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 158 | 2025-10-06 |
Structure and Function Relationships of Mucociliary Clearance in Human and Rat Airways
2025-Feb-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.24.572054
PMID:38187619
|
研究论文 | 本研究通过比较人类和雌性大鼠气道结构与功能差异，揭示了人类气道黏液纤毛清除效率更高的机制 | 首次系统比较人类与雌性大鼠气道细胞分布和纤毛运动的物种特异性差异，建立了评估人类气道功能的通用基准 | 研究主要基于雌性大鼠与人类比较，缺乏其他动物模型的对照数据 | 探究气道结构对黏液纤毛清除功能的影响机制 | 人类和雌性大鼠的气道组织 | 呼吸系统研究 | 慢性阻塞性肺疾病, 哮喘 | 单细胞转录组学, 物理建模 | 物理模型 | 实验数据, 模型数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 159 | 2025-10-06 |
[Characterization of protective effects of Jianpi Tongluo Formula on cartilage in knee osteoarthritis from a single cell-spatial heterogeneity perspective]
2025-Feb, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
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研究论文 | 本研究整合单细胞转录组学和空间转录组学技术，系统表征健脾通络方对膝骨关节炎软骨的保护作用及分子机制 | 首次从单细胞-空间异质性角度揭示膝骨关节炎软骨组织的异质特征和动态变化，发现NCOA4和HMGB1在调节软骨细胞自噬和炎症反应中的关键作用 | 研究主要基于动物模型验证，临床转化仍需进一步验证 | 阐明健脾通络方对膝骨关节炎软骨保护作用的分子机制 | 膝骨关节炎患者的软骨组织和KOA大鼠模型 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 实时定量PCR, Western blot, 免疫组织化学染色 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 使用公共数据集GSE254844和GSE255460，建立KOA大鼠模型进行验证 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 160 | 2025-10-06 |
Immunogenic cell death signature predicts survival and reveals the role of VEGFA + Mast cells in lung adenocarcinoma
2025-Feb-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-91401-5
PMID:40021802
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研究论文 | 本研究通过构建免疫原性细胞死亡特征评分系统，揭示了肥大细胞在肺腺癌肿瘤微环境中的作用机制 | 首次开发了免疫原性细胞死亡特征评分(IRS)，并在7个独立数据集中验证其预后价值；通过单细胞RNA测序揭示了VEGFA+肥大细胞在肿瘤微环境中的促癌作用机制 | 研究主要基于回顾性数据分析，需要进一步实验验证；免疫原性细胞死亡相关基因列表可能不完整 | 探索免疫原性细胞死亡在肺腺癌中的预后价值及其与免疫治疗反应的关系 | 肺腺癌患者和肿瘤微环境中的免疫细胞 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析 | 特征评分模型 | 基因表达数据，单细胞测序数据 | 7个独立数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |