单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 644 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2025-10-06 |
The Society for Immunotherapy of Cancer Perspective on Tissue-Based Technologies for Immuno-Oncology Biomarker Discovery and Application
2025-Feb-03, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-2469
PMID:39625818
|
综述 | 癌症免疫治疗学会对组织基技术在免疫肿瘤生物标志物发现与应用中的观点总结 | 整合多重免疫组化、单细胞转录组与空间蛋白质组学等前沿技术，提出生物标志物技术评估框架 | 未涉及具体临床验证数据，主要基于技术原理和现有研究进行展望 | 指导免疫肿瘤生物标志物技术发展方向和临床转化 | 组织基生物标志物检测技术 | 数字病理 | 多种癌症 | 多重免疫组化、免疫荧光、单细胞转录组学、质谱蛋白质组学 | NA | 多组学数据、空间蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学、蛋白质组学成像 | NA | NA |
| 142 | 2025-10-06 |
Unraveling the tumor microenvironment of esophageal squamous cell carcinoma through single-cell sequencing: A comprehensive review
2025-02, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2025.189264
PMID:39805342
|
综述 | 通过单细胞测序技术系统综述食管鳞癌肿瘤微环境的研究进展 | 首次在单细胞水平系统整合食管鳞癌肿瘤微环境中各类细胞的异质性特征及相互作用网络 | NA | 阐明食管鳞癌肿瘤微环境的细胞组成与分子特征 | 食管鳞癌肿瘤微环境中的肿瘤细胞、免疫细胞、内皮细胞及成纤维细胞等 | 数字病理学 | 食管鳞癌 | 单细胞多组学技术 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,单细胞多组学 | NA | NA |
| 143 | 2025-10-06 |
Functional analysis of yak alveolar type II epithelial cells at high and low altitudes based on single-cell sequencing
2025-02, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
DOI:10.1016/j.bbamcr.2024.119889
PMID:39681250
|
研究论文 | 基于单细胞测序技术研究高海拔和低海拔牦牛肺泡II型上皮细胞的功能差异 | 首次构建牦牛肺组织单细胞图谱，揭示AEC II在高海拔环境下的免疫调节、粘附和代谢活性增强机制 | 样本量有限，仅比较了两个海拔高度（4000米和2600米）的牦牛 | 探究牦牛肺泡II型上皮细胞对高海拔低氧环境的适应机制 | 高海拔（4000米）和低海拔（2600米）牦牛的肺泡II型上皮细胞 | 单细胞生物学 | 高原适应 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 两个海拔高度的牦牛肺组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x单细胞RNA测序技术 |
| 144 | 2025-10-06 |
transCAE: Enhancing Cell Type Annotation in Single-cell RNA-seq Data with Transfer Learning and Convolutional Autoencoder
2025-Feb-15, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.168936
PMID:39798891
|
研究论文 | 开发了一种基于迁移学习和卷积自编码器的单细胞RNA测序数据细胞类型注释方法transCAE | 将无监督降维与有监督细胞类型分类相结合，充分利用参考数据集和查询数据集信息，有效缓解批次效应 | 方法性能仍可能受到源数据质量的影响 | 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型注释的准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 卷积自编码器, 迁移学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 145 | 2025-10-06 |
Chronic intermittent fasting impairs β cell maturation and function in adolescent mice
2025-02-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.115225
PMID:39827461
|
研究论文 | 本研究探讨了间歇性禁食对不同年龄小鼠β细胞功能的影响，发现长期禁食会损害年轻小鼠的β细胞成熟与功能 | 首次通过单细胞RNA测序揭示长期间歇性禁食对年轻个体β细胞成熟和功能的不利影响，并发现与1型糖尿病的相似模式 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据有限，需要更多临床研究验证 | 探究间歇性禁食对不同年龄个体代谢和β细胞功能的影响 | 老年、中年和年轻小鼠，以及人类胰岛 | 代谢研究 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 多年龄段小鼠群体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 146 | 2025-10-06 |
Early precursor-derived pituitary gland tissue-resident macrophages play a pivotal role in modulating hormonal balance
2025-02-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.115227
PMID:39841599
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学等技术揭示了垂体驻留巨噬细胞的异质性及其通过细胞外ATP介导的信号调节激素平衡的机制 | 首次系统表征垂体驻留巨噬细胞的异质性和空间特异性，发现其全部起源于早期卵黄囊祖细胞并通过自我更新维持 | 未明确巨噬细胞调节激素平衡的具体分子通路细节 | 探究垂体驻留巨噬细胞的特征及其在调节激素平衡中的作用 | 小鼠垂体驻留巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 内分泌系统疾病 | 单细胞转录组学, 命运图谱, 成像技术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 147 | 2025-10-06 |
The spatial landscape of cancer hallmarks reveals patterns of tumor ecological dynamics and drug sensitivity
2025-02-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.115229
PMID:39864059
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析63个原发未治疗肿瘤，揭示了癌症标志物在肿瘤生态系统中的空间分布模式及其与治疗敏感性的关系 | 首次系统性地描绘了癌症标志物在肿瘤空间中的分布格局，发现了肿瘤亚克隆间基因组距离与标志物活性的相关性，以及克隆-标志物特化现象 | 样本量相对有限（63个肿瘤），仅涵盖10种癌症类型，空间分辨率可能受技术限制 | 探索肿瘤生态系统中癌症标志物的空间分布规律及其与治疗敏感性的关联 | 63个原发未治疗肿瘤样本（来自10种癌症类型）和33名膀胱癌患者（来自DUTRENEO试验） | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 63个原发肿瘤样本（10种癌症类型）+33名膀胱癌患者 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 148 | 2025-10-06 |
A single-cell and spatial wheat root atlas with cross-species annotations delineates conserved tissue-specific marker genes and regulators
2025-02-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115240
PMID:39893633
|
研究论文 | 本研究构建了小麦根尖分生组织的单细胞和空间转录组图谱，通过跨物种注释方法识别了保守的组织特异性标记基因和调控因子 | 开发了基于同源性的跨物种注释方法，结合单细胞RNA测序和空间转录组学验证，解决了非模式植物物种细胞类型注释的难题 | 主要依赖公开数据集进行跨物种注释，可能受到物种间基因表达差异的影响 | 建立小麦根尖分生组织的细胞类型注释系统，识别保守的组织特异性标记基因和调控网络 | 土壤生长的小麦根系，以及小麦、水稻、玉米和拟南芥的公开数据集 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 149 | 2025-10-06 |
Cxcl9 modulates aging associated microvascular metabolic and angiogenic dysfunctions in subcutaneous adipose tissue
2025-Feb-11, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-025-09970-y
PMID:39934436
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现Cxcl9是调控衰老相关微血管代谢和血管生成功能障碍的关键因子 | 首次揭示Cxcl9通过抑制G蛋白偶联受体信号通路导致衰老内皮细胞能量代谢受损和血管生成减少的机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究衰老对微血管内皮细胞的影响及其分子机制 | 小鼠皮下脂肪组织中的微血管内皮细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 光片免疫荧光显微镜, 代谢通量平衡分析 | NA | 基因表达数据, 影像数据 | 老年小鼠皮下脂肪组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 150 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics analysis reveals dynamic changes and prognostic signature in tumor microenvironment of PDAC
2025-Feb-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-86950-8
PMID:39894886
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示胰腺导管腺癌肿瘤微环境的动态变化并建立预后模型 | 定义了新的Treg和耗竭T细胞标志基因TNFRSF4，建立了基于14个基因的预后模型，并鉴定了三种潜在治疗药物 | 使用已发表数据集，样本量相对有限（31个样本） | 阐明PDAC进展过程中肿瘤微环境的动态变化并开发预后模型 | 胰腺导管腺癌患者肿瘤微环境中的细胞 | 单细胞分析 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | 预后风险模型 | 单细胞转录组数据 | 31个PDAC样本（8个I期，9个II期，6个III期，8个IV期） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 151 | 2025-10-06 |
Gene module reconstruction identifies cellular differentiation processes and the regulatory logic of specialized secretion in zebrafish
2025-02-24, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.10.015
PMID:39591963
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序重建斑马鱼细胞分化过程，揭示分泌组织分化的调控机制 | 开发了多源整合模块识别方法MIMIR，首次系统识别了斑马鱼分泌组织分化过程中的基因模块及其动态变化 | 研究局限于斑马鱼的两种分泌组织，尚未验证在其他物种或组织中的普适性 | 重建细胞分化过程并解析分泌功能特化的调控逻辑 | 斑马鱼脊索和孵化腺两种分泌组织 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | MIMIR（多源整合模块识别方法） | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼胚胎（功能缺失和功能获得突变体） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 152 | 2025-10-06 |
Everything everywhere all at once: Unraveling the waves of aging
2025-Feb-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.01.015
PMID:39938481
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学分析13个器官中多种细胞群体在衰老过程中的动态变化，识别出四个不同的动态波，其中免疫细胞是受影响最显著的群体 | 首次在多个器官中系统性地识别出衰老过程中的四个不同动态波，并发现免疫细胞是衰老过程中变化最显著的细胞群体 | NA | 解析衰老过程中多个器官内细胞群体的动态变化规律 | 13个器官中的多种细胞群体 | 单细胞生物学 | 衰老相关疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 153 | 2025-10-06 |
Dynamic analysis of intrahepatic T cells reveals a unique group of restorative Cxcr3+ tissue-resident CD4 T cells in acute liver injury
2025-02, Toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.tox.2025.154058
PMID:39828240
|
研究论文 | 本研究通过整合流式细胞术和单细胞RNA测序数据，揭示了急性肝损伤中CXCR3+组织驻留CD4 T细胞的修复功能 | 发现了一群独特的修复性Cxcr3+组织驻留CD4 T细胞，并证实CXCR3在缓解对乙酰氨基酚诱导的急性肝损伤中具有保护作用 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中得到验证 | 探究对乙酰氨基酚诱导的急性肝损伤中肝内T细胞的动态变化及其调控机制 | 小鼠肝组织中的T细胞群体 | 免疫学 | 急性肝损伤 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 流式细胞数据, 单细胞RNA测序数据 | 多个时间点的小鼠肝组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 154 | 2025-10-06 |
Interaction of the endogenous antibody response with activating FcγRs enhance control of Mayaro virus through monocytes
2025-Feb, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1012944
PMID:39993025
|
研究论文 | 本研究揭示了激活型Fcγ受体通过调控单核细胞在抗马亚罗病毒感染中的保护作用机制 | 首次证明在自然感染过程中Fc-FcγR相互作用对控制病毒的关键作用，发现单核细胞在缺乏该相互作用时会转变为促病毒表型 | 研究仅在鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 探究Fcγ受体在马亚罗病毒感染免疫保护中的作用机制 | 马亚罗病毒(MAYV)感染的小鼠模型 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序，细胞转移实验 | 基因敲除小鼠模型(FcRγ-/-) | 基因表达数据，病毒载量数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 155 | 2025-10-06 |
The covariance environment defines cellular niches for spatial inference
2025-Feb, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-024-02193-4
PMID:38565973
|
研究论文 | 提出了一种利用基因-基因协变结构表示细胞邻域特征的空间分析方法 | 引入了协变环境(COVET)表示法和基于最优传输的距离度量，开发了环境变分推断(ENVI)模型 | NA | 解决高分辨率空间分析技术中细胞邻域特征表示的关键挑战 | 细胞邻域或生态位 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序,单细胞RNA测序 | 条件变分自编码器 | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 数百万细胞 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 156 | 2025-10-06 |
Inhibition of CDH11 Activates cGAS-STING by Stimulating Branched Chain Amino Acid Catabolism and Mitigates Lung Metastasis of Adenoid Cystic Carcinoma
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202408751
PMID:39739317
|
研究论文 | 本研究揭示CDH11通过调控支链氨基酸代谢促进腺样囊性癌肺转移的机制，并发现塞来昔布可通过抑制CDH11激活cGAS-STING通路抑制转移 | 首次发现CDH11作为混合EMT细胞标志物通过BCAA代谢调控cGAS-STING通路的新机制，并验证塞来昔布的治疗潜力 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化仍需进一步验证 | 探索腺样囊性癌肺转移的分子机制并寻找治疗靶点 | 唾液腺腺样囊性癌及其肺转移灶 | 癌症生物学 | 腺样囊性癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NOD-SCID小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 157 | 2025-10-06 |
Pro-Fibrotic Macrophage Subtypes: SPP1+ Macrophages as a Key Player and Therapeutic Target in Cardiac Fibrosis?
2025-02-27, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14050345
PMID:40072075
|
综述 | 本文探讨SPP1+巨噬细胞在心脏纤维化中的关键作用及作为治疗靶点的潜力 | 首次系统阐述SPP1+巨噬细胞作为心脏纤维化关键介质和治疗靶点的作用机制 | 主要基于临床前研究数据，尚未在人体临床试验中得到验证 | 研究心脏纤维化的发病机制和潜在治疗策略 | SPP1+巨噬细胞及其与成纤维细胞、肌成纤维细胞的相互作用 | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 158 | 2025-10-06 |
TcEVdb: a database for T-cell-derived small extracellular vesicles from single-cell transcriptomes
2025-Feb-28, Database : the journal of biological databases and curation
DOI:10.1093/database/baaf012
PMID:40402791
|
研究论文 | 构建了一个名为TcEVdb的综合性数据库，用于探索T细胞来源的小细胞外囊泡的表达和聚类 | 首次通过SEVtras方法从T细胞单细胞RNA测序数据构建了全面的TcEV数据库，揭示了TcEV的异质性 | 基于计算推断而非直接实验验证的EV数据，可能存在技术局限性 | 探索T细胞来源的细胞外囊泡的转录组特征和功能 | T细胞来源的小细胞外囊泡 | 生物信息学 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | SEVtras方法 | 单细胞转录组数据 | 277,265个EV液滴，来自21个项目中的221个样本，涵盖51种T细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 159 | 2025-10-06 |
CAF-macrophage crosstalk in tumour microenvironments governs the response to immune checkpoint blockade in gastric cancer peritoneal metastases
2025-Feb-06, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-333617
PMID:39537239
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了胃癌腹膜转移中基质-髓系生态位通过C3-C3AR1轴介导免疫检查点抑制剂耐药的机制 | 首次发现胃癌腹膜转移中THBS2+基质癌相关成纤维细胞通过C3-C3AR1轴招募并转化巨噬细胞形成免疫抑制微环境 | 样本量有限，需更大规模研究验证 | 阐明胃癌腹膜转移对免疫检查点抑制剂耐药的机制 | 胃癌腹膜转移患者样本（原发肿瘤、腹膜转移灶和外周血） | 单细胞生物学 | 胃癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | II期临床试验患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 160 | 2025-10-06 |
Association of 5α-reductase inhibitor prescription with immunotherapy efficacy in metastatic renal cell carcinoma: a multicenter retrospective analysis
2025-Feb-25, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-011154
PMID:40010773
|
研究论文 | 本研究探讨5α-还原酶抑制剂使用史对转移性肾细胞癌患者免疫检查点抑制剂疗效的影响 | 首次在临床回顾性研究中证实5α-还原酶抑制剂可通过调节CD8+ T细胞功能增强免疫治疗效果 | 回顾性研究设计存在选择偏倚，样本量相对有限（185例患者） | 评估5α-还原酶抑制剂使用史对转移性肾细胞癌免疫治疗疗效的影响 | 185例接受免疫检查点抑制剂治疗的转移性肾细胞癌患者 | 肿瘤免疫学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序，Cox比例风险模型 | Cox回归模型 | 临床回顾性数据，单细胞RNA测序数据 | 185例转移性肾细胞癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |