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当前共找到 652 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2025-10-06 |
CMAP prediction and experimental validation of Forskolin as a podocyte protective and anti-proteinuric drug for nephrotoxic serum-treated mice
2025-02, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2024.116727
PMID:39716644
|
研究论文 | 通过结合肾脏单细胞RNA测序数据库和CMAP数据库预测并验证毛喉素对肾毒性血清诱导的足细胞损伤的保护作用 | 首次将肾脏单细胞RNA测序与CMAP数据库结合预测足细胞损伤治疗药物 | 研究主要聚焦于肾毒性血清诱导的足细胞损伤模型 | 开发针对特定足细胞损伤机制的治疗策略 | 小鼠足细胞和肾毒性血清处理的小鼠模型 | 生物信息学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, GO和KEGG富集分析, CMAP分析 | NA | 基因表达数据 | 肾毒性血清处理和对照组小鼠的肾小球单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 122 | 2025-10-06 |
Divergence in cellular markers observed in single-cell transcriptomics datasets between cultured primary trabecular meshwork cells and tissues
2025-Feb-14, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-025-04528-5
PMID:39952952
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序比较体外培养的原代人小梁网细胞与组织样本，揭示细胞标记物的差异 | 首次报道比较原代hTM细胞培养物与hTM组织的单细胞转录组数据集 | 样本量相对有限，仅包含14个体外样本 | 研究小梁网细胞在体外培养与组织原位状态下的基因表达差异 | 原代人小梁网细胞和组织的单细胞转录组 | 单细胞转录组学 | 青光眼 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 14个原代hTM体外样本（包含4个青光眼患者样本），传代1-4代 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 123 | 2025-10-06 |
Disruption of GPSM1/CSF1 signaling reprograms tumor-associated macrophages to overcome anti-PD-1 resistance in colorectal cancer
2025-Feb-25, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010826
PMID:40010765
|
研究论文 | 本研究揭示了GPSM1通过调控肿瘤相关巨噬细胞极化介导结直肠癌抗PD-1耐药的新机制 | 首次发现GPSM1/USP9X/MEIS3信号轴通过驱动巨噬细胞M2极化导致抗PD-1耐药，并鉴定出鲁索替尼作为潜在治疗候选药物 | 研究主要基于临床样本和动物模型，尚未进行大规模临床试验验证 | 探索GPSM1在结直肠癌抗PD-1耐药中的作用机制及潜在治疗策略 | 结直肠癌患者肿瘤样本、C57BL/6小鼠异种移植模型 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,多重免疫荧光,质谱流式,流式细胞术,ChIP-PCR,质谱分析,免疫共沉淀 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,图像数据 | 抗PD-1耐药结直肠癌患者肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 124 | 2025-10-06 |
CHOIR improves significance-based detection of cell types and states from single-cell data
2025-Feb-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.18.576317
PMID:38328105
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研究论文 | 介绍了一种名为CHOIR的聚类方法，通过随机森林和置换测试优化单细胞数据中的细胞类型识别 | 提出了一种基于随机森林分类器和置换测试的层次聚类优化框架，能够统计确定不同细胞群体 | NA | 解决单细胞数据聚类中过度聚类或不足聚类的问题，提高细胞类型识别的准确性 | 单细胞数据中的细胞类型和状态 | 生物信息学 | NA | 随机森林, 置换测试, 层次聚类 | 随机森林 | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, 空间转录组, 多组学数据 | 100个模拟数据集和4个真实数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 125 | 2025-10-06 |
InfoScan: A New Transcript Identification Tool Based on scRNA-Seq and Its Application in Glioblastoma
2025-Feb-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26052208
PMID:40076844
|
研究论文 | 开发了一种基于单细胞RNA测序的转录本识别工具InfoScan，并应用于胶质母细胞瘤研究 | 开发了新型生物信息学工具InfoScan，能够识别未注释转录本和罕见细胞群体，并在胶质母细胞瘤中发现具有癌症干细胞特征的'肿瘤干细胞样'亚群 | NA | 开发单细胞RNA测序数据分析工具并探索胶质母细胞瘤的转录组特征 | 胶质母细胞瘤组织和其中的细胞亚群 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 126 | 2025-10-06 |
stAI: a deep learning-based model for missing gene imputation and cell-type annotation of spatial transcriptomics
2025-Feb-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf158
PMID:40057378
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研究论文 | 提出一种基于深度学习的模型stAI，用于空间转录组数据的缺失基因插补和细胞类型注释 | 首次提出同时解决空间转录组数据中缺失基因插补和细胞类型注释的深度学习模型，采用联合嵌入和双编码器-解码器模块 | NA | 解决单细胞空间转录组技术中全转录组水平表征和细胞类型全面注释的挑战 | 单细胞空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 深度学习，编码器-解码器 | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 127 | 2025-10-06 |
Single-Cell Sequencing: Genomic and Transcriptomic Approaches in Cancer Cell Biology
2025-Feb-27, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26052074
PMID:40076700
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综述 | 本文综述单细胞测序技术在癌症生物学研究中的基因组和转录组学方法及其影响 | 整合单细胞测序与多组学数据提供癌症细胞状态和调控机制的多维视角，结合人工智能和机器学习解析海量数据 | NA | 探讨单细胞测序技术对癌症生物学研究的推动作用 | 癌症细胞生物学 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞测序，空间转录组学，原位测序 | 机器学习，人工智能 | 基因组数据，转录组数据，表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，单细胞多组学，空间转录组学 | NA | NA |
| 128 | 2025-10-06 |
Comprehensive SHAP Values and Single-Cell Sequencing Technology Reveal Key Cell Clusters in Bovine Skeletal Muscle
2025-Feb-26, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26052054
PMID:40076676
|
研究论文 | 通过SHAP值和单细胞测序技术揭示牛骨骼肌中关键细胞群及其基因调控机制 | 首次结合SHAP值分析和单细胞测序构建476个关键基因的交互网络，成功绘制骨骼肌单细胞图谱并识别肌纤维细胞的核心地位 | 研究仅聚焦牛和猪的跨物种比较，未涵盖更多物种；样本规模未明确说明 | 解析牛骨骼肌中不同细胞群的重要性排序及其在肌肉发育中的调控机制 | 牛骨骼肌组织中的细胞群体（特别是肌纤维细胞和中性粒细胞） | 单细胞生物学 | NA | 单细胞测序，SHAP值分析，蛋白质语言模型 | 机器学习模型（具体类型未明确），蛋白质语言模型 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 129 | 2025-10-06 |
Identification of Prognostic Genes Related to Cell Senescence and Lipid Metabolism in Glioblastoma Based on Transcriptome and Single-Cell RNA-Seq Data
2025-Feb-21, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26051875
PMID:40076502
|
研究论文 | 本研究通过转录组和单细胞RNA测序数据识别与细胞衰老和脂质代谢相关的胶质母细胞瘤预后基因 | 首次整合细胞衰老和脂质代谢相关基因构建胶质母细胞瘤预后模型，并通过单细胞分辨率分析基因表达动态 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 改善胶质母细胞瘤的预后预测和治疗策略 | 胶质母细胞瘤患者 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, WGCNA, Cox回归分析 | 风险模型, 列线图 | 基因表达数据, 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 130 | 2025-10-06 |
Spatial Transcriptomic Analysis of Surgical Resection Specimens of Primary Head and Neck Squamous Cell Carcinoma Treated with Afatinib in a Window-of-Opportunity Study (EORTC90111-24111)
2025-Feb-20, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26051830
PMID:40076457
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析阿法替尼治疗的头颈部鳞状细胞癌手术标本，探索抗HER治疗下的肿瘤演变和组成 | 首次在窗口期临床试验中结合空间转录组学和RNA测序分析阿法替尼诱导的头颈部鳞癌肿瘤微环境变化 | 样本量较小，仅分析了三个患者的标本 | 探索抗HER治疗下头颈部鳞状细胞癌的肿瘤演变和微环境组成变化 | 头颈部鳞状细胞癌患者的手术标本和肿瘤活检组织 | 空间转录组学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 空间转录组学, RNA测序 | NA | 空间转录组数据, RNA测序数据 | 3例患者手术标本（ID08, ID15, ID30） | NA | 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 131 | 2025-10-06 |
The establishment of the anther somatic niche with single-cell sequencing
2025-02, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2024.11.004
PMID:39547468
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术研究玉米花药体细胞微环境的发育过程 | 首次建立玉米花药体细胞微环境的单细胞RNA测序数据集，揭示了体细胞类型从减数分裂前到减数分裂后的发育轨迹 | 研究聚焦于玉米特定物种，结果在其他植物中的普适性需要进一步验证 | 解析开花植物花药体细胞微环境的发育机制和细胞类型特异性基因表达 | 玉米(Zea mays)花药的体细胞微环境 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 132 | 2025-10-06 |
Structure and Function Relationships of Mucociliary Clearance in Human and Rat Airways
2025-Feb-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.24.572054
PMID:38187619
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研究论文 | 本研究通过比较人类和雌性大鼠气道结构与功能差异，揭示了人类气道黏液纤毛清除效率更高的机制 | 首次系统比较人类与雌性大鼠气道细胞分布和纤毛运动的物种特异性差异，建立了评估人类气道功能的通用基准 | 研究主要基于雌性大鼠与人类比较，缺乏其他动物模型的对照数据 | 探究气道结构对黏液纤毛清除功能的影响机制 | 人类和雌性大鼠的气道组织 | 呼吸系统研究 | 慢性阻塞性肺疾病, 哮喘 | 单细胞转录组学, 物理建模 | 物理模型 | 实验数据, 模型数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 133 | 2025-10-06 |
[Research progress on the mechanistic role and constituents of hepatic macrophages during the occurrence and development of hepatic fibrosis]
2025-Feb-20, Zhonghua gan zang bing za zhi = Zhonghua ganzangbing zazhi = Chinese journal of hepatology
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综述 | 本文综述了肝巨噬细胞在肝纤维化发生发展中的机制作用和组成成分 | 通过单细胞测序技术揭示了肝纤维化过程中巨噬细胞的新亚型和作用模式 | 传统抗纤维化治疗的局限性 | 探讨肝巨噬细胞在肝纤维化中的作用机制和治疗靶点 | 肝巨噬细胞 | 病理学 | 肝纤维化 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 134 | 2025-10-06 |
[Characterization of protective effects of Jianpi Tongluo Formula on cartilage in knee osteoarthritis from a single cell-spatial heterogeneity perspective]
2025-Feb, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
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研究论文 | 本研究整合单细胞转录组学和空间转录组学技术，系统表征健脾通络方对膝骨关节炎软骨的保护作用及分子机制 | 首次从单细胞-空间异质性角度揭示膝骨关节炎软骨组织的异质特征和动态变化，发现NCOA4和HMGB1在调节软骨细胞自噬和炎症反应中的关键作用 | 研究主要基于动物模型验证，临床转化仍需进一步验证 | 阐明健脾通络方对膝骨关节炎软骨保护作用的分子机制 | 膝骨关节炎患者的软骨组织和KOA大鼠模型 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 实时定量PCR, Western blot, 免疫组织化学染色 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 使用公共数据集GSE254844和GSE255460，建立KOA大鼠模型进行验证 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 135 | 2025-10-06 |
Immunomodulatory effects of traditional chinese medicine on cancer: insights from network pharmacology and single-cell RNA sequencing data on the treatment of lung adenocarcinoma with shenling baizhu powder
2025-Feb-28, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01550-z
PMID:40019596
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研究论文 | 通过网络药理学和单细胞RNA测序技术探讨参苓白术散对肺腺癌的免疫调节作用机制 | 首次整合网络药理学与单细胞RNA测序数据揭示中药复方通过调节巨噬细胞相关基因影响肿瘤免疫微环境 | 机制研究尚未经过临床实验验证，具体作用通路需要进一步实验证实 | 探究参苓白术散治疗肺腺癌的免疫调节机制 | 肺腺癌患者免疫细胞及巨噬细胞相关基因 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 网络药理学, 机器学习, 分子对接 | 机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 136 | 2025-10-06 |
Immunogenic cell death signature predicts survival and reveals the role of VEGFA + Mast cells in lung adenocarcinoma
2025-Feb-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-91401-5
PMID:40021802
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研究论文 | 本研究通过构建免疫原性细胞死亡特征评分系统，揭示了肥大细胞在肺腺癌肿瘤微环境中的作用机制 | 首次开发了免疫原性细胞死亡特征评分(IRS)，并在7个独立数据集中验证其预后价值；通过单细胞RNA测序揭示了VEGFA+肥大细胞在肿瘤微环境中的促癌作用机制 | 研究主要基于回顾性数据分析，需要进一步实验验证；免疫原性细胞死亡相关基因列表可能不完整 | 探索免疫原性细胞死亡在肺腺癌中的预后价值及其与免疫治疗反应的关系 | 肺腺癌患者和肿瘤微环境中的免疫细胞 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析 | 特征评分模型 | 基因表达数据，单细胞测序数据 | 7个独立数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 137 | 2025-10-06 |
Complex regulation of cardiac fibrosis: insights from immune cells and signaling pathways
2025-Feb-28, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06260-5
PMID:40022104
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综述 | 本文综述了免疫细胞在心脏纤维化中的复杂调控作用及其相关信号通路 | 聚焦免疫细胞在心脏纤维化中的可塑性和异质性，探讨不同免疫细胞亚群的特异性作用及相互通讯 | 免疫细胞的具体调控机制尚不明确，不同亚群在纤维化中的具体作用仍需进一步研究 | 阐明免疫细胞在心脏纤维化中的作用机制，为抗纤维化治疗策略提供见解 | 心脏纤维化过程中的免疫细胞和成纤维细胞 | 病理生理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序, 多组学分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 138 | 2025-10-06 |
Reawakening inflammation in the chronically injured spinal cord using lipopolysaccharide induces diverse microglial states
2025-Feb-28, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03379-6
PMID:40022205
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析急性和慢性脊髓损伤中微胶质细胞对脂多糖注射的反应 | 首次揭示慢性脊髓损伤中LPS诱导的微胶质细胞状态多样性及其与神经可塑性的潜在关联 | 微胶质细胞状态在慢性损伤中的炎症刺激仅部分重现急性损伤环境 | 探究微胶质细胞和LPS诱导的神经炎症在脊髓损伤后神经可塑性中的作用机制 | 脊髓损伤模型中的微胶质细胞 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 139 | 2025-10-06 |
LETSmix: a spatially informed and learning-based domain adaptation method for cell-type deconvolution in spatial transcriptomics
2025-Feb-28, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-025-01442-8
PMID:40022231
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研究论文 | 提出一种名为LETSmix的空间感知学习方法，用于空间转录组学中的细胞类型反卷积 | 结合定制的LETS滤波器整合空间相关性，并采用混合增强的域适应策略解决ST与单细胞RNA测序数据间的差异 | NA | 解决空间转录组技术中因分辨率限制导致的细胞混合问题 | 空间转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 域适应方法 | 基因表达数据，空间坐标数据，图像纹理特征 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 140 | 2025-10-06 |
LOX+ iCAFs in HNSCC have the potential to predict prognosis and immunotherapy responses revealed by single cell RNA sequencing analysis
2025-Feb-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-91036-6
PMID:40016474
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析发现LOX+ iCAFs在头颈鳞状细胞癌中具有预测预后和免疫治疗反应的潜力 | 首次通过单细胞RNA测序识别LOX+ iCAFs亚型，并建立其与HNSCC预后和免疫治疗反应的关联 | 研究样本量有限，验证队列仅包含102名患者 | 探索头颈鳞状细胞癌中癌相关成纤维细胞的功能作用及其临床意义 | 头颈鳞状细胞癌患者样本和CAL-27、UM-SCC-1细胞系 | 单细胞分析 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | Seurat聚类分析 | 单细胞RNA测序数据，bulk RNA测序数据 | GSE103322数据集和102名HNSCC患者验证队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |