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当前共找到 652 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-10-06 |
The impact of ambient contamination on demultiplexing methods for single-nucleus multiome experiments
2025-Feb-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.06.636969
PMID:39975005
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研究论文 | 本研究评估了基因分型解复用方法在单核多组学实验中对环境RNA/DNA污染的敏感性 | 开发了ambisim基因分型感知读取水平模拟器，可灵活控制环境分子比例并生成真实的联合snRNA/snATAC数据 | 方法在不同数据集和模式间的一致性存在差异，需要改进对环境材料的建模 | 评估基因分型解复用方法在单核多组学实验中的性能表现 | 单核RNA-seq和ATAC-seq数据 | 单细胞测序分析 | NA | 单核多组学测序，基因分型解复用 | ambisim模拟器 | 单核RNA-seq和ATAC-seq测序数据 | 两个联合snRNA/snATAC数据集 | NA | 单核多组学测序 | NA | NA |
| 82 | 2025-10-06 |
IL-4 induces CD22 expression to restrain the effector program of virtual memory T cells
2025-02-07, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adk4841
PMID:39919198
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现CD22作为IL-4诱导的虚拟记忆CD8 T细胞表面标志物，并揭示其抑制T细胞效应程序的作用机制 | 首次发现CD22可作为IL-4诱导的虚拟记忆CD8 T细胞选择性表面标志物，并揭示CD22对T细胞效应程序的固有调控功能 | 寄生虫感染模型中IL-4依赖性T细胞激活和扩张的具体调控机制仍需进一步阐明 | 探究IL-4依赖性虚拟记忆CD8 T细胞激活和扩张的调控机制 | 虚拟记忆CD8 T细胞 | 免疫学 | 寄生虫感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 83 | 2025-10-06 |
Fucosylated haptoglobin promotes inflammation via Mincle in sepsis: an observational study
2025-Feb-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56524-3
PMID:39904983
|
观察性研究 | 本研究揭示了败血症患者血浆中岩藻糖基化结合珠蛋白通过Mincle受体促进炎症反应的作用机制 | 首次发现败血症患者血浆中Hp在Asn207和Asn211位点的末端岩藻糖基化水平升高，并阐明其通过Mincle受体激活炎症反应的分子机制 | 观察性研究设计，无法确定因果关系；样本量未明确说明；动物模型结果需要进一步验证 | 探究岩藻糖基化结合珠蛋白在败血症炎症反应中的作用机制 | 败血症患者血浆样本、小鼠模型、巨噬样细胞群体 | 分子生物学 | 败血症 | 单细胞RNA测序，蛋白质纯化，细胞因子检测 | NA | 基因表达数据，蛋白质数据，临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 84 | 2025-10-06 |
Current molecular understanding of central nervous system schwannomas
2025-02-05, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-025-01937-w
PMID:39910685
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综述 | 本文全面概述了中枢神经系统神经鞘瘤的分子生物学研究现状 | 总结了新型遗传改变如SH3PXD2A::HTRA1融合基因、VGLL融合和SOX10突变，以及单细胞测序和多组学分析等先进技术的应用 | 对神经鞘瘤分子生物学的理解仍不完整，存在现有争议需要解决 | 阐明神经鞘瘤发生和进展的分子机制，指导新治疗靶点开发 | 中枢神经系统神经鞘瘤 | 神经肿瘤学 | 神经鞘瘤 | 单细胞测序, 多组学分析, 基因表达分析, 表观遗传调控分析 | NA | 基因组数据, 表观遗传数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学分析 | NA | NA |
| 85 | 2025-10-06 |
CRISPR-Cas9 screening identifies the role of FER as a tumor suppressor
2025-02, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6374
PMID:39648412
|
研究论文 | 通过CRISPR-Cas9筛选发现FER作为肿瘤抑制基因在肿瘤发生发展中的关键作用 | 首次通过体内全基因组CRISPR-Cas9筛选鉴定FER为肿瘤抑制基因，并系统揭示其在肿瘤起始和进展中的功能机制 | 未明确FER在具体肿瘤类型中的作用机制，缺乏临床样本验证 | 系统性识别肿瘤抑制基因以理解肿瘤发生机制并开发早期诊断策略 | FER基因及其在肿瘤发生发展中的功能 | 功能基因组学 | 肿瘤 | CRISPR-Cas9筛选，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 86 | 2025-10-06 |
A tumor cornification and immune-infiltration-based scheme for anti-PD-1 plus chemotherapy response in advanced squamous cell lung carcinoma
2025-Feb-14, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2024.09.005
PMID:39395411
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研究论文 | 本研究基于肿瘤角质化和免疫浸润特征建立了一个预测晚期肺鳞癌患者抗PD-1联合化疗疗效的新方案 | 首次提出基于肺鳞癌免疫浸润和角质化特征分类(LICC)的方案，并发现SPRR3+肿瘤细胞通过CD24-SIGLEC10轴介导免疫逃逸的新机制 | 研究样本量相对有限，需要更大规模的前瞻性研究验证LICC方案的临床适用性 | 探索预测肺鳞癌患者抗PD-1免疫治疗联合化疗疗效的生物标志物 | 晚期肺鳞癌患者 | 肿瘤免疫学 | 肺鳞癌 | RNA测序,流式细胞术,多重免疫组织化学,单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据,流式细胞数据,免疫组化数据 | 349例来自ORIENT-12临床试验的肺鳞癌样本，外加其他临床队列验证 | NA | RNA-seq,单细胞RNA-seq,流式细胞术,多重免疫组织化学 | NA | NA |
| 87 | 2025-10-06 |
Early downmodulation of tumor glycolysis predicts response to fasting-mimicking diet in triple-negative breast cancer patients
2025-Feb-04, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2024.11.004
PMID:39694040
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研究论文 | 本研究探讨模拟禁食饮食联合化疗对三阴性乳腺癌患者的治疗效果及机制 | 首次发现高糖酵解癌细胞在治疗早期出现糖酵解通路下调可预测三阴性乳腺癌患者对模拟禁食饮食的治疗反应 | 样本量较小（30例患者），需更大规模临床试验验证 | 评估周期性模拟禁食饮食联合术前化疗对早期三阴性乳腺癌患者的疗效 | 30例早期三阴性乳腺癌患者 | 肿瘤代谢研究 | 三阴性乳腺癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 30例早期三阴性乳腺癌患者 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 88 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Profiling of Ocular Adnexal Sebaceous Carcinoma Reveals a Complex Tumor Microenvironment and Identifies New Biomarkers
2025-Feb, American journal of ophthalmology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.ajo.2024.10.001
PMID:39393421
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析眼附件皮脂腺癌的肿瘤微环境并鉴定新的生物标志物 | 首次在单细胞分辨率下对眼附件皮脂腺癌进行深入转录组分析，揭示了复杂的肿瘤微环境组成 | 样本量较小（仅6例患者标本），属于回顾性观察研究 | 探索眼附件皮脂腺癌的肿瘤组成和转录特征，为开发保留眼球的免疫疗法和靶向治疗提供依据 | 眼附件皮脂腺癌患者肿瘤组织（包括原发性肿瘤和Paget样扩散肿瘤）及正常组织 | 数字病理学 | 眼附件皮脂腺癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据, 组织切片图像 | 6例患者标本（3例原发性肿瘤，2例Paget样扩散肿瘤，1例正常组织），另加28例OaSC存档病例进行验证 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 89 | 2025-10-06 |
Cross-cellular analysis of chromatin accessibility markers H3K4me3 and DNase in the context of detecting cell-identity genes: An "all-or-nothing" approach
2025-02, Journal of bioinformatics and computational biology
IF:0.9Q4
DOI:10.1142/S0219720025400025
PMID:40169369
|
研究论文 | 通过分析染色质可及性标记H3K4me3和DNase，提出跨细胞染色质开放度(CCO)水平来预测细胞特异性基因 | 首次提出跨细胞染色质开放度(CCO)概念，并证明其与基因必需性状态的相关性 | 仅使用两种分化实验进行验证，数据来源可能有限 | 研究染色质可及性标记与细胞特异性基因检测的关联 | 不同细胞系中的染色质可及性标记(H3K4me3和DNase) | 表观遗传学 | NA | 染色质可及性分析，scRNA-Seq，bulk RNA-Seq | NA | 表观基因组数据，基因表达数据 | 多个细胞系 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序，染色质可及性分析 | NA | NA |
| 90 | 2025-10-06 |
Single-cell and spatial characterization of plasmablast-like lymphoma cells in primary central nervous system lymphoma
2025-Feb, Blood neoplasia
DOI:10.1016/j.bneo.2024.100058
PMID:40454408
|
研究论文 | 通过单细胞和空间多组学分析揭示了原发性中枢神经系统淋巴瘤中浆母细胞样淋巴瘤细胞的异质性和微环境特征 | 首次在PCNSL中鉴定出具有浆母细胞特征的淋巴瘤亚群，并揭示了其空间分布异质性和与微环境的独特相互作用 | 样本量相对有限，需要更大规模的研究验证发现 | 阐明PCNSL的细胞和空间异质性及微环境特征 | 原发性中枢神经系统淋巴瘤患者样本 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞测序, 空间多组学分析, B细胞受体分析, 免疫组织化学染色 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 蛋白质表达数据 | PCNSL患者队列（扩展研究中约40%患者具有PBL特征亚群） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间多组学 | NA | NA |
| 91 | 2025-10-06 |
Recent advancement in the spatial immuno-oncology
2025-02, Seminars in cell & developmental biology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.semcdb.2024.12.003
PMID:39705969
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综述 | 总结空间转录组学和空间蛋白质组学在免疫肿瘤学领域的最新进展及其对肿瘤微环境研究的贡献 | 整合空间多组学技术解析肿瘤微环境的高阶结构和细胞间相互作用 | NA | 综述空间组学技术在免疫肿瘤学领域的应用进展 | 肿瘤微环境中的细胞类型和细胞状态 | 空间生物学 | 肿瘤 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | 空间组学数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 92 | 2025-10-06 |
Spatially resolved transcriptomics reveal the determinants of primary resistance to immunotherapy in NSCLC with mature tertiary lymphoid structures
2025-Feb-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.101934
PMID:39909044
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析揭示了非小细胞肺癌中成熟三级淋巴结构患者对免疫检查点抑制剂产生原发性耐药的关键决定因素 | 首次发现两种不同的癌症相关成纤维细胞亚型在mTLS阳性NSCLC中介导ICI原发性耐药，揭示了免疫抑制微环境的新机制 | 样本来源单一（仅来自BIP研究），需要更多独立队列验证研究结果 | 探究mTLS阳性非小细胞肺癌患者对免疫检查点抑制剂产生原发性耐药的决定因素 | 接受ICI治疗的509例非小细胞肺癌患者 | 空间转录组学 | 肺癌 | 空间转录组学，多重免疫荧光 | NA | 空间转录组数据，免疫荧光图像 | 509例非小细胞肺癌患者 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 93 | 2025-10-06 |
scFTAT: a novel cell annotation method integrating FFT and transformer
2025-Feb-25, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06061-z
PMID:39994539
|
研究论文 | 提出了一种整合快速傅里叶变换和增强Transformer的新型单细胞注释方法scFTAT | 首次将FFT与增强Transformer结合用于单细胞注释，通过LDA降维、核近似、位置编码增强和注意力增强模块提升模型性能 | 仅在六种典型数据集上验证，未在其他组织或物种数据上进行广泛测试 | 开发自动单细胞注释方法以解决数据高稀疏性和大规模手动注释的挑战 | 人类和小鼠组织的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | Transformer, FFT, LDA | 单细胞RNA测序数据 | 六个典型数据集（包括人类肾脏数据） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 94 | 2025-10-06 |
An abnormal increase in CD26(-)CD28(-) cytotoxic effector CD4 and CD8 T cell populations in patients with systemic lupus erythematosus
2025-02-04, International immunology
IF:4.8Q2
DOI:10.1093/intimm/dxae062
PMID:39383111
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研究论文 | 本研究通过分析系统性红斑狼疮患者外周血中CD26(-)CD28(-)细胞毒性T细胞亚群的异常扩增及其特征 | 首次发现SLE患者中CD26(-)CD28(-)细胞毒性CD4和CD8 T细胞亚群的异常扩增，并通过单细胞RNA测序揭示其与自然杀伤T细胞相似的特征 | 样本量相对有限(57例患者和31例健康志愿者)，CD26 T细胞表面表达减少在SLE病理中的作用机制尚未完全阐明 | 探究系统性红斑狼疮患者中CD26(-)T细胞亚群的组成特征及其临床意义 | 57例系统性红斑狼疮患者和31例健康成年志愿者的外周血单个核细胞 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 57例SLE患者和31例健康志愿者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 95 | 2025-10-06 |
A comparative study of statistical methods for identifying differentially expressed genes in spatial transcriptomics
2025-Feb-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.17.638726
PMID:40027680
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研究论文 | 本文提出了一种用于空间转录组数据差异表达分析的新统计方法GST，并与现有方法进行了比较 | 在广义估计方程框架中提出广义得分检验(GST)，有效整合空间相关性以提高差异表达分析的准确性 | 方法验证主要基于模拟数据和特定癌症类型，在其他组织和疾病中的适用性需要进一步验证 | 开发更稳健的统计方法来识别空间转录组数据中的差异表达基因 | 空间转录组数据中的基因表达模式 | 空间转录组学 | 乳腺癌,前列腺癌 | 空间转录组学 | 广义估计方程(GEEs),广义得分检验(GST),Wilcoxon秩和检验 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 96 | 2025-10-06 |
The Society for Immunotherapy of Cancer Perspective on Tissue-Based Technologies for Immuno-Oncology Biomarker Discovery and Application
2025-Feb-03, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-2469
PMID:39625818
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综述 | 癌症免疫治疗学会对组织基技术在免疫肿瘤生物标志物发现与应用中的观点总结 | 整合多重免疫组化、单细胞转录组与空间蛋白质组学等前沿技术，提出生物标志物技术评估框架 | 未涉及具体临床验证数据，主要基于技术原理和现有研究进行展望 | 指导免疫肿瘤生物标志物技术发展方向和临床转化 | 组织基生物标志物检测技术 | 数字病理 | 多种癌症 | 多重免疫组化、免疫荧光、单细胞转录组学、质谱蛋白质组学 | NA | 多组学数据、空间蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学、蛋白质组学成像 | NA | NA |
| 97 | 2025-10-06 |
Unraveling the tumor microenvironment of esophageal squamous cell carcinoma through single-cell sequencing: A comprehensive review
2025-02, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2025.189264
PMID:39805342
|
综述 | 通过单细胞测序技术系统综述食管鳞癌肿瘤微环境的研究进展 | 首次在单细胞水平系统整合食管鳞癌肿瘤微环境中各类细胞的异质性特征及相互作用网络 | NA | 阐明食管鳞癌肿瘤微环境的细胞组成与分子特征 | 食管鳞癌肿瘤微环境中的肿瘤细胞、免疫细胞、内皮细胞及成纤维细胞等 | 数字病理学 | 食管鳞癌 | 单细胞多组学技术 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,单细胞多组学 | NA | NA |
| 98 | 2025-10-06 |
Functional analysis of yak alveolar type II epithelial cells at high and low altitudes based on single-cell sequencing
2025-02, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
DOI:10.1016/j.bbamcr.2024.119889
PMID:39681250
|
研究论文 | 基于单细胞测序技术研究高海拔和低海拔牦牛肺泡II型上皮细胞的功能差异 | 首次构建牦牛肺组织单细胞图谱，揭示AEC II在高海拔环境下的免疫调节、粘附和代谢活性增强机制 | 样本量有限，仅比较了两个海拔高度（4000米和2600米）的牦牛 | 探究牦牛肺泡II型上皮细胞对高海拔低氧环境的适应机制 | 高海拔（4000米）和低海拔（2600米）牦牛的肺泡II型上皮细胞 | 单细胞生物学 | 高原适应 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 两个海拔高度的牦牛肺组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x单细胞RNA测序技术 |
| 99 | 2025-10-06 |
transCAE: Enhancing Cell Type Annotation in Single-cell RNA-seq Data with Transfer Learning and Convolutional Autoencoder
2025-Feb-15, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.168936
PMID:39798891
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研究论文 | 开发了一种基于迁移学习和卷积自编码器的单细胞RNA测序数据细胞类型注释方法transCAE | 将无监督降维与有监督细胞类型分类相结合，充分利用参考数据集和查询数据集信息，有效缓解批次效应 | 方法性能仍可能受到源数据质量的影响 | 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型注释的准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 卷积自编码器, 迁移学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 100 | 2025-10-06 |
Chronic intermittent fasting impairs β cell maturation and function in adolescent mice
2025-02-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.115225
PMID:39827461
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研究论文 | 本研究探讨了间歇性禁食对不同年龄小鼠β细胞功能的影响，发现长期禁食会损害年轻小鼠的β细胞成熟与功能 | 首次通过单细胞RNA测序揭示长期间歇性禁食对年轻个体β细胞成熟和功能的不利影响，并发现与1型糖尿病的相似模式 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据有限，需要更多临床研究验证 | 探究间歇性禁食对不同年龄个体代谢和β细胞功能的影响 | 老年、中年和年轻小鼠，以及人类胰岛 | 代谢研究 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 多年龄段小鼠群体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |