单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
761	2025-01-15	CD137 Protein Expression Pattern Determines the Functional Role of Galectin-9 in Colorectal Cancer 2025-Feb, Molecular carcinogenesis IF:3.0Q2 DOI:10.1002/mc.23838 PMID:39503215	研究论文	本研究通过分析结直肠癌单细胞测序数据，开发了一种新的临床预后工具，并探索了LGALS9基因作为潜在治疗靶点的可能性	利用Scissor算法创建了基于13个关键基因的结直肠癌预后评分系统（SDRS），并揭示了LGALS9及其蛋白Galectin-9在CD137表达改变的结直肠癌小鼠模型中的功能作用	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证	开发结直肠癌的临床预后工具并探索潜在治疗靶点	结直肠癌患者和小鼠模型	数字病理学	结直肠癌	单细胞测序	Scissor算法	单细胞测序数据	结直肠癌患者和小鼠模型
762	2025-01-14	Breaking new ground: Unraveling the USP1/ID3/E12/P21 axis in vascular calcification 2025-Feb, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine IF:6.4Q1 DOI:10.1016/j.trsl.2024.09.002 PMID:39326697	研究论文	本研究通过单细胞转录组测序技术，揭示了血管钙化过程中的细胞动态变化，并发现了USP1/ID3/E12/P21轴在其中的关键作用	首次揭示了USP1/ID3/E12/P21轴在血管钙化中的调控机制，为治疗提供了新的潜在靶点	研究主要基于体外实验和动物模型，尚未在人体中进行验证	探索血管钙化的细胞机制和潜在治疗靶点	血管平滑肌细胞（VSMCs）	生物医学	心血管疾病	单细胞转录组测序	NA	基因表达数据	NA
763	2025-01-14	Dissecting the cellular reprogramming and tumor microenvironment in left- and right-sided Colorectal Cancer by single cell RNA sequencing 2025-Feb, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine IF:6.4Q1 DOI:10.1016/j.trsl.2024.12.002 PMID:39675521	研究论文	通过单细胞RNA测序技术，研究左右侧结直肠癌的细胞重编程和肿瘤微环境差异	首次通过单细胞RNA测序技术全面分析左右侧结直肠癌的细胞组成、转录特征及功能差异，揭示了右侧结直肠癌中更复杂的细胞间相互作用和免疫抑制模式	研究依赖于公开数据库中的单细胞RNA测序数据，可能存在数据偏差或样本选择限制	探究左右侧结直肠癌在细胞组成、转录特征及肿瘤微环境中的差异，以优化个性化治疗方案	55个结直肠癌样本中的126,279个细胞	数字病理学	结直肠癌	单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA测序数据	55个结直肠癌样本中的126,279个细胞
764	2025-01-14	Recent advancement in the spatial immuno-oncology 2025-Feb, Seminars in cell & developmental biology IF:6.2Q1 DOI:10.1016/j.semcdb.2024.12.003 PMID:39705969	综述	本文总结了空间转录组学和空间蛋白质组学在免疫肿瘤学领域的最新进展，包括单细胞或多细胞类型及细胞状态的高通量分析及其在肿瘤微环境中的应用	总结了空间组学数据的概念框架，并强调了空间免疫肿瘤学的最新知识	NA	总结和更新空间组学在免疫肿瘤学领域的应用和知识	肿瘤微环境中的单细胞或多细胞类型及细胞状态	数字病理学	癌症	空间转录组学, 空间蛋白质组学	NA	空间组学数据	NA
765	2025-01-14	Left superior cervical ganglia lymph node mimicry and its role in rat ventricular arrhythmias following myocardial infarction 2025-Feb, Acta physiologica (Oxford, England) DOI:10.1111/apha.14279 PMID:39803764	研究论文	本研究探讨了心肌梗死（MI）后大鼠上颈交感神经节（SCG）在神经-心脏通讯中的特征和功能意义	揭示了SCG在MI后心律失常和心脏炎症/功能中的作用，以及神经生长因子（NGF）在神经-免疫交互中的桥梁作用	研究仅限于大鼠模型，未涉及人类或其他动物模型	研究MI后SCG在神经-心脏通讯中的特征和功能意义	心肌梗死大鼠模型	心血管疾病	心血管疾病	RNA-seq, 空间转录组学, 定量PCR, 蛋白质印迹	NA	基因表达数据, 蛋白质数据	心肌梗死大鼠模型
766	2025-01-13	Functional analysis of yak alveolar type II epithelial cells at high and low altitudes based on single-cell sequencing 2025-Feb, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research DOI:10.1016/j.bbamcr.2024.119889 PMID:39681250	研究论文	本研究通过单细胞测序技术分析了高海拔和低海拔环境下牦牛肺泡II型上皮细胞的功能差异	首次构建了牦牛肺组织的单细胞图谱，揭示了高海拔环境下AEC II的免疫调节、粘附和代谢活动的增强	研究仅针对牦牛，未涉及其他高原动物或人类的适应性机制	探讨牦牛肺泡II型上皮细胞在高海拔和低海拔环境下的适应性差异	牦牛肺泡II型上皮细胞	单细胞测序	NA	10×单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	单细胞RNA测序数据	高海拔（4000米）和低海拔（2600米）的牦牛肺组织样本
767	2025-01-07	Integrative transcriptome analysis reveals Serpine2 promotes glomerular mesangial cell proliferation and extracellular matrix accumulation via activating ERK1/2 signalling pathway in diabetic nephropathy 2025-Feb, Diabetes, obesity & metabolism DOI:10.1111/dom.16069 PMID:39557806	研究论文	本文通过整合转录组分析揭示了Serpine2通过激活ERK1/2信号通路促进糖尿病肾病中肾小球系膜细胞增殖和细胞外基质积累的机制	首次通过整合批量数据集和单细胞转录组数据集，发现Serpine2在糖尿病肾病中的关键作用，并揭示了其通过ERK1/2信号通路调控的分子机制	研究主要基于动物模型和细胞模型，尚未在人类患者中进行验证	探索糖尿病肾病的发病机制，特别是Serpine2在其中的作用	糖尿病肾病模型中的肾小球系膜细胞和细胞外基质	生物信息学	糖尿病肾病	转录组分析、Western blotting、免疫荧光染色	db/db小鼠模型、肾小球系膜细胞模型	转录组数据、蛋白质表达数据	db/db小鼠和肾小球系膜细胞
768	2024-12-20	VNN2 regulates hepatic steroid synthesis in response to dietary changes 2025-Feb-10, Gene IF:2.6Q2 DOI:10.1016/j.gene.2024.149128 PMID:39613052	研究论文	研究探讨了VNN2在鸡肝脏中对脂质代谢和类固醇合成的调控作用	首次揭示了VNN2通过上调MSMO1和FDPS促进类固醇合成的机制	研究仅在鸡肝脏中进行，未涉及其他物种或组织	研究VNN2在肝脏脂质代谢和类固醇合成中的具体功能	鸡肝脏中的VNN2表达及其对脂质代谢和类固醇合成的影响	NA	NA	RNA测序、qPCR、甘油三酯和总胆固醇检测	NA	RNA测序数据	使用了多个数据集，包括GSM5764402、GSM5764403、GSE128340、GSE129840和PRJEB44038
769	2024-12-14	scSFCL:Deep clustering of scRNA-seq data with subspace feature confidence learning 2025-Feb, Computational biology and chemistry IF:2.6Q2 DOI:10.1016/j.compbiolchem.2024.108292 PMID:39591807	研究论文	提出了一种基于子空间特征置信度学习的深度聚类方法scSFCL，用于单细胞RNA测序数据的聚类分析	通过子空间特征置信度学习结合图卷积网络和加权方法，筛选出判别性特征子集，并利用相互监督的聚类方法融合通用结构信息和特异性信息	未提及具体限制	提高单细胞RNA测序数据的深度聚类性能	单细胞RNA测序数据	生物信息学	NA	单细胞RNA测序	图卷积网络	基因表达数据	多个单细胞RNA测序数据集
770	2024-12-06	Subtype-specific transcription factors affect polyamine metabolism and the tumor microenvironment in breast cancer 2025-Feb, Cancer innovation DOI:10.1002/cai2.138 PMID:39629335	研究论文	研究了转录因子对乳腺癌亚型中多胺代谢和肿瘤微环境的影响	首次确定了三个亚型特异性转录因子，它们调控高风险乳腺癌亚型中的三个多胺代谢基因，并影响肿瘤微环境	研究仅限于乳腺癌亚型，未涵盖其他癌症类型	探讨转录因子对乳腺癌亚型中多胺代谢基因的调控及其对肿瘤微环境的影响	乳腺癌亚型中的多胺代谢基因及其转录因子	数字病理学	乳腺癌	RNA测序	NA	RNA	涉及四种乳腺癌亚型的RNA-seq数据和单细胞RNA-seq数据
771	2024-11-26	Identification of Nfel1a and Nfel3 as novel regulators for zebrafish thrombopoiesis 2025-Feb, Blood cells, molecules & diseases DOI:10.1016/j.bcmd.2024.102897 PMID:39413675	研究论文	研究揭示了Nfe2I1a和Nfe2l3作为斑马鱼血栓生成的新调控因子	发现Nfe2I1a和Nfe2l3是斑马鱼血栓生成的新型转录因子，并证明了它们在血栓生成中的正调控作用	NA	探讨斑马鱼血栓生成过程中Nfe2相关基因的作用	斑马鱼的血栓生成和Nfe2相关基因	NA	NA	单细胞测序	NA	基因表达数据	NA