单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
741	2025-01-27	DEHP-mediated oxidative stress leads to impaired testosterone synthesis in Leydig cells through the cAMP/PKA/SF-1/StAR pathway 2025-Feb-01, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987) DOI:10.1016/j.envpol.2024.125503 PMID:39657860	研究论文	本研究探讨了环境中的增塑剂DEHP如何通过氧化应激影响Leydig细胞（LCs）的睾酮合成，揭示了cAMP/PKA/SF-1/StAR通路在其中的作用	首次结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析与体内外实验，揭示了DEHP通过氧化应激抑制cAMP/PKA/SF-1/StAR通路，从而损害LCs睾酮合成的机制	研究主要聚焦于DEHP对LCs的影响，未涉及其他环境污染物或细胞类型的潜在作用	探究DEHP对Leydig细胞损伤的分子机制，特别是其对睾酮合成的影响	Leydig细胞（LCs）	生物医学	男性生殖系统疾病	scRNA-seq分析、体内外实验	NA	单细胞RNA测序数据、生化指标数据	未明确说明样本数量，但涉及体内外实验
742	2025-01-27	Single-cell transcriptome sequencing analysis of physiological and immune profiling of crucian carp (Carassius auratus) gills 2025-Feb, Fish & shellfish immunology IF:4.1Q1 DOI:10.1016/j.fsi.2024.110087 PMID:39662647	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）和组织学分析，首次在单细胞水平上注释并分析了鲫鱼鳃的细胞类型及其功能异质性	首次在单细胞水平上注释并分析了鲫鱼鳃的细胞类型及其功能异质性，揭示了ILCM的代谢活跃状态和免疫调节的主要途径	研究局限于鲫鱼鳃的细胞类型和功能分析，未涉及其他鱼类或器官	探索鲫鱼鳃的生理和免疫功能，特别是在单细胞水平上的功能异质性	鲫鱼（Carassius auratus）的鳃	单细胞转录组学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq），加权基因共表达网络分析（WGCNA）	NA	单细胞RNA测序数据	鲫鱼鳃的19种细胞类型
743	2025-01-27	Anxiety-like behavior and altered hippocampal activity in a transgenic mouse model of Fabry disease 2025-Feb, Neurobiology of disease IF:5.1Q1 DOI:10.1016/j.nbd.2025.106797 PMID:39788162	研究论文	本研究通过转基因法布里病小鼠模型，探讨了法布里病与焦虑样行为及海马体功能改变之间的关系	首次结合行为学、转录组学、功能和形态学评估，揭示了法布里病小鼠海马体中神经元和非神经元细胞群的转录和功能改变	研究仅使用雄性小鼠，未涉及雌性小鼠或其他动物模型	探讨法布里病与神经精神症状（如焦虑）之间的潜在机制	转基因法布里病小鼠模型	神经科学	法布里病	单细胞测序、行为学测试、电生理记录	转基因小鼠模型	行为数据、转录组数据、电生理数据	雄性法布里病小鼠
744	2025-01-25	TRAIL induces podocyte PANoptosis via death receptor 5 in diabetic kidney disease 2025-Feb, Kidney international IF:14.8Q1 DOI:10.1016/j.kint.2024.10.026 PMID:39571905	研究论文	本文探讨了TRAIL通过死亡受体5（DR5）在糖尿病肾病（DKD）中诱导足细胞PANoptosis（凋亡、焦亡和坏死性凋亡）的机制	首次揭示了TRAIL/DR5在DKD中通过激活PANoptosis诱导足细胞损伤的关键自分泌作用	研究主要基于体外实验和动物模型，尚未在人类临床试验中验证	研究TRAIL/DR5在糖尿病肾病中诱导足细胞损伤的机制	足细胞和糖尿病肾病模型	生物医学	糖尿病肾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	3个正常人类肾脏样本和3个DKD人类肾脏样本
745	2025-01-25	Zinc ions facilitate metabolic bioenergetic recovery post spinal cord injury by activating microglial mitophagy through the STAT3-FOXO3a-SOD2 pathway 2025-Feb-01, Free radical biology & medicine DOI:10.1016/j.freeradbiomed.2024.11.045 PMID:39613048	研究论文	本研究探讨了锌离子通过激活小胶质细胞线粒体自噬，促进脊髓损伤后代谢能量恢复的机制	揭示了锌离子通过STAT3-FOXO3a-SOD2轴调控线粒体基因表达，改善小胶质细胞能量稳态的新机制	研究主要基于单细胞RNA测序数据，缺乏体内实验验证	探索锌离子在脊髓损伤后小胶质细胞代谢恢复中的作用	脊髓损伤后的小胶质细胞	神经科学	脊髓损伤	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
746	2025-01-25	Single-cell analysis of human peripheral blood reveals high immune response activity in successful ageing individuals 2025-Feb, Mechanisms of ageing and development IF:5.3Q1 DOI:10.1016/j.mad.2024.112011 PMID:39622417	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术研究了成功老龄化个体（百岁老人和超级百岁老人）外周血的免疫系统动态调控及其分子机制	揭示了成功老龄化个体中CD8效应记忆T细胞和终末分化B细胞的富集，以及CD56 NK细胞中Fc-γ受体信号通路的激活，这些发现可能作为健康老龄化的生物标志物	样本量相对较小，仅包括7名超级百岁老人、3名百岁老人和4名老年对照	研究老龄化过程中免疫系统的动态调控及其分子机制	成功老龄化个体（百岁老人和超级百岁老人）的外周血单核细胞	生物信息学	老年病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	单细胞转录组数据	87,215个外周血单核细胞，来自7名超级百岁老人、3名百岁老人和4名老年对照
747	2025-01-25	Cellular heterogeneity and cytokine signatures in acute myeloid leukemia: A novel prognostic model 2025-Feb, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2024.102194 PMID:39689517	研究论文	本研究利用高分辨率单细胞RNA测序技术，解析了急性髓性白血病（AML）的复杂细胞景观，并构建了一个基于七种关键细胞因子相关基因的预后风险评分模型	通过单细胞RNA测序揭示了AML的细胞异质性，并首次构建了一个基于细胞因子相关基因的预后风险评分模型，该模型在多个独立AML患者队列中验证了其强大的预后能力	研究依赖于公开数据集，可能受到数据质量和样本选择的限制	解析AML的细胞异质性并开发一个临床适用的预后风险评分模型	AML患者的骨髓样本	数字病理学	急性髓性白血病	单细胞RNA测序	预后风险评分模型	RNA测序数据	多个独立AML患者队列
748	2025-01-25	Heterogeneity of cancer-associated fibroblast subpopulations in prostate cancer: Implications for prognosis and immunotherapy 2025-Feb, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2024.102255 PMID:39721245	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了前列腺癌中癌症相关成纤维细胞（CAF）亚群的多样性及其对疾病预后和免疫治疗策略的影响	首次系统性地描述了前列腺癌中CAF的四个主要亚群，并构建了反映这些亚群临床相关性的预后模型	研究主要基于体外实验和单细胞RNA测序数据，缺乏体内实验验证和更大规模的临床样本验证	阐明癌症相关成纤维细胞在前列腺癌肿瘤微环境中的多重作用，特别是其对疾病预后和免疫治疗策略的影响	前列腺癌样本中的癌症相关成纤维细胞（CAF）亚群	数字病理学	前列腺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	前列腺癌样本
749	2025-01-25	mTOR signaling regulates multiple metabolic pathways in human lung fibroblasts after TGF-β and in pulmonary fibrosis 2025-Feb-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology DOI:10.1152/ajplung.00189.2024 PMID:39745695	研究论文	本文研究了mTOR信号在TGF-β处理后的人类肺成纤维细胞中调节多种代谢途径的作用，并探讨了其在肺纤维化中的影响	揭示了mTOR和ATF4在肺成纤维细胞中调节氨基酸稳态、糖酵解和TCA循环代谢物的新机制，并提供了单细胞RNA-seq数据集的证据	研究主要基于体外实验和公开的单细胞RNA-seq数据，缺乏体内实验验证	探讨mTOR和ATF4在肺成纤维细胞代谢重编程中的作用及其在肺纤维化中的潜在治疗靶点	人类肺成纤维细胞	生物医学	肺纤维化	RNA测序、代谢组学分析	NA	RNA-seq数据、代谢物数据	人类肺成纤维细胞样本及公开的单细胞RNA-seq数据集
750	2025-01-25	Unraveling the tumor microenvironment of esophageal squamous cell carcinoma through single-cell sequencing: A comprehensive review 2025-Feb, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer DOI:10.1016/j.bbcan.2025.189264 PMID:39805342	综述	本文综述了单细胞测序技术在食管鳞状细胞癌（ESCC）肿瘤微环境（TME）研究中的应用，旨在阐明TME中细胞间的相互作用对ESCC进展的影响	利用单细胞多组学技术，特别是单细胞转录组测序，揭示了ESCC肿瘤微环境中不同细胞群的分子特征和表达谱，为个性化治疗策略提供了潜在的治疗靶点和生物标志物	NA	通过单细胞测序技术深入理解ESCC肿瘤微环境的异质性及其对疾病进展的影响，以促进ESCC的诊断和治疗	食管鳞状细胞癌（ESCC）的肿瘤微环境（TME），包括肿瘤细胞、免疫细胞、内皮细胞、成纤维细胞等	数字病理学	食管癌	单细胞测序，单细胞转录组测序	NA	单细胞测序数据	NA
751	2025-01-24	Single-cell spatial transcriptomics reveals distinct patterns of dysregulation in non-neuronal and neuronal cells induced by the Trem2R47H Alzheimer's risk gene mutation 2025-Feb, Molecular psychiatry IF:9.6Q1 DOI:10.1038/s41380-024-02651-0 PMID:39103533	研究论文	本研究通过单细胞空间转录组学技术，揭示了Trem2R47H阿尔茨海默病风险基因突变对非神经元和神经元细胞的不同影响	使用MERFISH空间转录组学技术，首次在亚细胞水平上分析了Trem2突变对特定脑区细胞类型的影响，并揭示了与淀粉样病理无关的神经元转录组变化	研究仅限于小鼠模型，未涉及人类样本	探讨Trem2R47H突变对阿尔茨海默病相关细胞类型的影响	野生型、Trem2突变、5xFAD和Trem2; 5xFAD基因型的小鼠脑切片	数字病理	阿尔茨海默病	MERFISH空间转录组学	NA	空间基因表达数据	19个小鼠脑切片
752	2025-01-23	Progress in toxicogenomics to protect human health 2025-Feb, Nature reviews. Genetics DOI:10.1038/s41576-024-00767-1 PMID:39223311	综述	本文回顾了毒理基因组学在应用转录组学进行毒理学测试方面的进展，并强调了正在改变风险评估的进展	介绍了高通量剂量反应建模、单细胞转录组学和多组学等新兴方法，这些方法为毒理学机制提供了详细的见解	未提及具体的研究局限性	探讨毒理基因组学在理解和预测环境和药物暴露的毒理学效应方面的应用	分子特征，如转录本、蛋白质、代谢物和表观基因组修饰	毒理学	NA	转录组学、高通量剂量反应建模、单细胞转录组学、多组学	NA	分子特征数据	NA
753	2025-01-23	In silico integrative scRNA analysis of human colonic epithelium indicates four tuft cell subtypes 2025-Feb-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology DOI:10.1152/ajpgi.00182.2024 PMID:39589317	研究论文	本研究整合并分析了来自四个公开可用数据集的人类单细胞RNA测序数据，揭示了人类结肠中tuft细胞异质性的复杂景观	发现了四种tuft细胞亚型（TC1-TC4），并揭示了它们在健康个体和炎症性肠病（IBD）患者之间的差异	研究主要依赖于公开数据集，可能缺乏实验验证	探索人类结肠tuft细胞的异质性及其在健康和疾病中的潜在功能	人类结肠tuft细胞	生物信息学	炎症性肠病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	四个公开数据集中的样本
754	2025-01-23	Application of Single-Cell Genomics to Animal Models of Periodontitis and Peri-Implantitis 2025-Feb, Journal of clinical periodontology IF:5.8Q1 DOI:10.1111/jcpe.14093 PMID:39695834	综述	本文综述了单细胞基因组学技术在牙周炎和种植体周围炎动物模型中的应用	结合单细胞RNA测序（scRNAseq）与动物模型，揭示牙周炎和种植体周围炎的细胞异质性和特定细胞作用，克服了批量RNA测序的局限性	NA	整合单细胞基因组学技术与牙周炎和种植体周围炎的动物模型，以促进对这些疾病发病机制的理解和精准治疗的发展	牙周炎和种植体周围炎的动物模型	基因组学	牙周炎, 种植体周围炎	单细胞RNA测序（scRNAseq）	NA	单细胞RNA测序数据	NA
755	2025-01-22	Single-cell sequencing applications in acute myeloid leukemia 2025-Feb, Leukemia & lymphoma IF:2.2Q3 DOI:10.1080/10428194.2024.2422833 PMID:39496597	综述	本文回顾了单细胞测序技术在急性髓性白血病（AML）中的应用，探讨了其在理解白血病内部遗传和功能异质性方面的作用	通过单细胞测序技术深入解析AML的遗传和表型异质性，特别是在白血病干细胞、克隆进化和可测量残留病（MRD）监测方面的应用	尽管单细胞测序技术提供了新的视角，但其在临床常规实践中的应用仍需进一步验证和优化	探讨单细胞测序技术在AML研究中的应用及其对患者管理的潜在改进	急性髓性白血病（AML）	数字病理学	白血病	单细胞测序	NA	单细胞数据	NA
756	2025-01-22	Central and peripheral kynurenine pathway metabolites in COVID-19: Implications for neurological and immunological responses 2025-Feb, Brain, behavior, and immunity DOI:10.1016/j.bbi.2024.11.031 PMID:39615604	研究论文	本研究探讨了COVID-19患者中中枢和外周kynurenine途径代谢物的变化及其对神经和免疫反应的影响	首次发现COVID-19患者中枢神经系统中kynurenine代谢物水平升高，并揭示了外周炎症通过单核细胞中IDO1的过表达激活kynurenine途径的机制	样本量相对较小，且仅针对瑞典患者进行研究，可能限制了结果的普遍性	研究COVID-19患者中kynurenine途径代谢物的变化及其对神经和免疫反应的影响	53名COVID-19患者和12名非炎症性神经系统疾病对照	生物医学	COVID-19	超高效液相色谱-串联质谱法（UPLC-MS/MS）和单细胞转录组学	NA	代谢物水平和基因表达数据	53名COVID-19患者和12名非炎症性神经系统疾病对照，以及130名COVID-19患者的单细胞转录组数据
757	2024-08-13	Spatial and Single-Cell Transcriptomics Reveal that Oncofetal Reprogramming of Fibroblasts Is Associated with Malignant Degeneration of Burn Scar 2025-Feb, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1 DOI:10.1016/j.jid.2024.07.022 PMID:39128494	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
758	2025-01-20	Evidence of Alveolar Macrophage Metabolic Shift Following Stereotactic Body Radiation Therapy -Induced Lung Fibrosis in Mice 2025-Feb-01, International journal of radiation oncology, biology, physics DOI:10.1016/j.ijrobp.2024.09.018 PMID:39278419	研究论文	本研究探讨了立体定向体部放射治疗后小鼠肺纤维化中肺泡巨噬细胞的代谢变化	揭示了肺泡巨噬细胞在放射诱导的肺损伤中从脂肪酸代谢向胆固醇生物合成的代谢转变，并提出了CCR2非依赖性招募和/或原位增殖可能是巨噬细胞入侵的原因	研究仅在小鼠模型中进行，未涉及人体试验，且仅照射了小鼠肺部的4%，可能无法完全模拟临床情况	研究放射诱导的肺损伤中巨噬细胞的作用及其代谢变化	小鼠模型中的肺泡巨噬细胞	放射生物学	肺纤维化	组织学、流式细胞术、单细胞RNA测序	CCR2 KO小鼠模型	组织样本、细胞数据	野生型和CCR2 KO小鼠，接受60 Gy或80 Gy的单次放射剂量
759	2025-01-20	Combined analysis of bulk, single-cell RNA sequencing, and spatial transcriptomics reveals the expression patterns of lipid metabolism and ferroptosis in the immune microenvironment of metabolic-associated fatty liver disease 2025-Feb-01, Life sciences IF:5.2Q1 DOI:10.1016/j.lfs.2025.123377 PMID:39793853	研究论文	本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和Bulk-RNA-Seq数据，揭示了代谢相关脂肪肝病（MAFLD）中脂质代谢和铁死亡在免疫微环境中的表达模式	首次整合单细胞RNA测序和WGCNA分析，识别出11个与铁死亡和脂质代谢相关的关键基因，并构建了风险评估系统和预测模型	研究主要依赖于体外和动物模型，需要进一步在人类患者中进行验证	识别与铁死亡和脂质代谢相关的关键生物标志物，并探讨它们在MAFLD进展中的作用	代谢相关脂肪肝病（MAFLD）患者的肝脏样本	生物信息学	代谢相关脂肪肝病	单细胞RNA测序、Bulk-RNA-Seq、空间转录组学	WGCNA、预测模型	RNA测序数据	MAFLD患者的肝脏样本
760	2025-01-19	Distinct immunometabolic signatures in circulating immune cells define disease outcome in acute-on-chronic liver failure 2025-Feb-01, Hepatology (Baltimore, Md.) DOI:10.1097/HEP.0000000000000907 PMID:38761406	研究论文	本研究通过单细胞转录组分析，揭示了急性慢性肝衰竭（ACLF）患者循环免疫细胞的免疫代谢特征，并探讨了这些特征与疾病恢复或非恢复的关系	首次在单细胞水平上描绘了ACLF患者的免疫代谢特征，并发现了与疾病恢复相关的特定免疫细胞状态	研究样本量有限，且未进行长期随访以验证这些免疫代谢特征对预后的影响	探讨ACLF患者循环免疫细胞的免疫代谢特征及其与疾病恢复或非恢复的关系	ACLF患者、急性失代偿性肝硬化患者和健康个体的循环免疫细胞	免疫学	肝病	单细胞转录组分析	NA	单细胞转录组数据	ACLF患者、急性失代偿性肝硬化患者和健康个体的循环免疫细胞样本