单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
701	2025-02-05	Oocyte transcriptomes and follicular fluid proteomics of ovine atretic follicles reveal the underlying mechanisms of oocyte degeneration 2025-Feb-01, BMC genomics IF:3.5Q2 DOI:10.1186/s12864-025-11291-9 PMID:39893388	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和串联质谱标签蛋白质组学技术，揭示了绵羊闭锁卵泡中卵母细胞退化的分子机制和关键蛋白标志物	首次在绵羊闭锁卵泡中系统研究了卵母细胞转录调控机制和卵泡液蛋白质组变化，发现了175个闭锁特异性基因和8个候选卵母细胞分泌因子，以及333个差异表达蛋白质	研究仅针对绵羊模型，结果是否适用于其他哺乳动物尚需进一步验证	探究卵泡闭锁过程中卵母细胞退化的分子机制和关键蛋白标志物	绵羊闭锁卵泡中的卵母细胞和卵泡液	生殖生物学	NA	单细胞RNA测序，串联质谱标签蛋白质组学	NA	转录组数据，蛋白质组数据	NA
702	2025-02-05	Molecular characterization of ovarian mesonephric-like adenocarcinoma: Insights from single-cell RNA sequencing and mitochondrial metabolism 2025-Feb, Gynecologic oncology reports IF:1.2Q3 DOI:10.1016/j.gore.2024.101670 PMID:39895896	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术对卵巢中肾样腺癌（MLA）进行了分子特征分析，并与高级别浆液性卵巢癌（HGSOC）进行了比较	首次使用单细胞RNA测序技术对卵巢MLA进行分子特征分析，揭示了其与HGSOC的差异，并提出了针对MAP激酶和PI3K/AKT/mTOR通路的联合治疗策略	需要在更大规模的队列中进行验证以支持临床应用	揭示卵巢MLA的分子特征及其与HGSOC的差异，探索潜在的治疗靶点	卵巢中肾样腺癌（MLA）和高级别浆液性卵巢癌（HGSOC）	数字病理学	卵巢癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	一个卵巢MLA样本和HGSOC的单细胞RNA测序数据集
703	2025-01-13	PTN secreted by cardiac fibroblasts promotes myocardial fibrosis and inflammation of pressure overload-induced hypertrophic cardiomyopathy through the PTN-SDC4 pathway 2025-Feb-15, Life sciences IF:5.2Q1 DOI:10.1016/j.lfs.2024.123356 PMID:39765325	研究论文	本研究探讨了心脏成纤维细胞分泌的PTN通过PTN-SDC4途径促进压力超负荷诱导的肥厚型心肌病（HCM）的心肌纤维化和炎症	揭示了心脏成纤维细胞和巨噬细胞之间的相互作用，以及PTN-SDC4途径在HCM中的潜在作用	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类患者中进行验证	探索压力超负荷诱导的HCM中心脏成纤维细胞和巨噬细胞之间的通讯网络	TAC手术诱导的HCM小鼠	生物信息学	心血管疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq），实时定量PCR（RT-qPCR），Edu染色，Transwell实验，Western blot，免疫荧光实验，CCK-8，H&E染色，超声心动图	NA	单细胞RNA测序数据	GSE137167数据集中的小鼠样本
704	2025-02-04	Characterizing the diabetes-induced pathological changes of the mouse lung by single-cell RNA sequencing 2025-Feb-15, Life sciences IF:5.2Q1 DOI:10.1016/j.lfs.2025.123408 PMID:39832739	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术，揭示了2型糖尿病对小鼠肺部病理变化的影响及其机制	首次在晚期糖尿病小鼠中揭示了肺部免疫细胞数量的显著增加，并发现这些免疫细胞主要为未成熟的多形核髓系来源的抑制细胞（PMN-MDSCs）	研究仅限于小鼠模型，未涉及人类样本	研究2型糖尿病对肺部病理变化的影响及其机制	糖尿病小鼠的肺部细胞	数字病理学	糖尿病	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	糖尿病小鼠的肺部细胞
705	2025-02-04	Mouse Bladder Smooth Muscle Lack the Functional Active NMDAR 2025-Feb, Neurourology and urodynamics IF:1.8Q3 DOI:10.1002/nau.25631 PMID:39552551	研究论文	本研究探讨了N-甲基-D-天冬氨酸受体（NMDARs）在膀胱平滑肌（BSM）功能中的作用及其作为治疗过度活跃膀胱的潜在靶点	研究发现膀胱平滑肌中缺乏功能性NMDARs，这一发现挑战了NMDARs在膀胱平滑肌中的传统认知，并提出了新的治疗靶点探索方向	研究主要基于小鼠和人类组织的实验数据，未涉及其他动物模型或临床实验，可能限制了结果的普遍性	研究目的是探讨NMDARs在膀胱平滑肌功能中的作用及其作为治疗过度活跃膀胱的潜在靶点	小鼠和人类的膀胱平滑肌	生物医学	过度活跃膀胱	肌动描记法、钙成像、单细胞RNA测序、免疫荧光染色	NA	实验数据	小鼠和人类的膀胱平滑肌组织
706	2025-02-04	Eliminating the persistent HIV reservoir based on biomarker expression - How do we get there? 2025-Feb, Virology IF:2.8Q3 DOI:10.1016/j.virol.2024.110368 PMID:39721194	研究论文	本文讨论了基于生物标志物表达消除持久性HIV病毒库的挑战和未来方向	提出了识别共同表达蛋白质以减少生物标志物面板中蛋白质数量的新策略，并强调了空间转录组学和蛋白质组学等新技术在未来的应用	目前缺乏特定的分子标志物来定义所有潜伏感染的HIV细胞，且病毒库的异质性增加了消除的难度	研究目标是识别和开发能够定义所有HIV病毒库子集的最小蛋白质集合，以实现病毒库的靶向消除	研究对象是潜伏感染的HIV细胞及其生物标志物	生物医学	HIV/AIDS	空间转录组学、蛋白质组学	NA	蛋白质表达数据、转录组数据	NA
707	2025-02-04	Dysfunctional KLRB1+CD8+ T-cell responses are generated in chronically inflamed systemic sclerosis skin 2025-Feb-01, Annals of the rheumatic diseases IF:20.3Q1 DOI:10.1016/j.ard.2025.01.022 PMID:39894688	研究论文	本研究分析了弥漫性皮肤系统性硬化症（dcSSc）皮肤病变中的CD8+ T细胞反应，揭示了两种主要的CD8+ T细胞亚群在疾病不同阶段的作用	通过单细胞转录组学和表观基因组学技术，首次鉴定了dcSSc皮肤病变中两种发育相关的CD8+ T细胞亚群，并揭示了它们在疾病不同阶段的功能差异	研究主要基于皮肤样本，未涉及其他器官或系统的免疫反应	分析dcSSc皮肤病变中的免疫机制，特别是CD8+ T细胞反应	弥漫性皮肤系统性硬化症（dcSSc）患者的皮肤样本	免疫学	系统性硬化症	单细胞转录组学、表观基因组学、多色免疫荧光显微镜	NA	单细胞RNA测序数据、表观遗传数据、图像数据	dcSSc患者皮肤样本与健康对照皮肤样本
708	2025-02-03	Combining T cell receptor sequencing and transcriptomics to characterize tissue-resident T cells from human gut biopsies 2025-Feb-16, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151353 PMID:39837221	研究论文	本研究结合T细胞受体测序和转录组学技术，对人类肠道活检组织中的组织驻留T细胞进行表征	首次将流式细胞术、TCR测序和转录组学结合，分析来自批量分选的T细胞和单细胞的T细胞库，提供了特定T细胞的特异性和功能信息	研究样本量有限，且仅针对特定炎症条件下的活检样本	研究胃肠道T细胞在黏膜免疫中的作用，特别是在炎症条件下的T细胞反应	来自胃、结肠的活检样本及血液样本，患者包括有和无与糜烂性胃炎相关的炎症	免疫学	胃肠道疾病	NGS, 流式细胞术, 单细胞测序	NA	基因表达数据, TCR序列数据	来自胃、结肠的活检样本及血液样本，具体数量未明确
709	2025-02-03	Targeted FTO knockout in endothelial cells Boosts adhesion and lowers inflammatory infiltration to alleviate pulmonary arterial hypertension 2025-Feb-16, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151339 PMID:39869947	研究论文	本研究探讨了内皮细胞特异性FTO敲除对肺动脉高压（PAH）发展的影响	首次揭示了内皮细胞中FTO的缺失通过减少内皮细胞粘附和炎症细胞浸润来缓解缺氧诱导的PAH	研究主要集中在内皮细胞，未涉及其他细胞类型或整体动物模型的长期效果	探讨FTO在内皮细胞功能和PAH中的作用	内皮细胞	生物医学	肺动脉高压	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
710	2025-02-03	Impact of mechanotransduction on gene expression changes in periodontal ligament during orthodontic tooth movement 2025-Feb-02, Journal of bone and mineral metabolism IF:2.4Q3 DOI:10.1007/s00774-025-01581-3 PMID:39893595	研究论文	本文研究了机械刺激对正畸牙齿移动过程中牙周韧带基因表达变化的影响	首次通过单细胞RNA测序技术揭示了Mkx在牙周韧带中的表达及其在机械传导中的作用	研究主要基于大鼠模型，人类样本的研究较少	探讨机械刺激对牙周韧带基因表达的影响及Mkx的作用	大鼠和人类的牙周韧带细胞	生物医学	牙周疾病	单细胞RNA测序, RT-qPCR	NA	基因表达数据	大鼠牙周韧带细胞（0天、1周、2周）和人类牙周韧带细胞
711	2025-02-02	The potential molecular markers of inflammatory response in KOA with AD based on single-cell transcriptome sequencing analysis and identification of ligands by virtual screening 2025-Feb, Molecular diversity IF:3.9Q2 DOI:10.1007/s11030-024-10854-4 PMID:38622351	研究论文	本研究通过单细胞转录组测序分析和虚拟筛选技术，探索了膝骨关节炎（KOA）与阿尔茨海默病（AD）之间的分子机制，并筛选出潜在的分子标志物和药物	首次结合单细胞转录组测序和虚拟筛选技术，识别出TXNIP、MMP3和MMP13作为KOA患者AD风险的潜在分子标志物，并发现Cobicistat、Itc和Isavuconazonium等药物可能具有治疗潜力	研究尚未通过实验验证所筛选药物的实际疗效，且样本量和具体实验细节未明确说明	探索KOA与AD之间的分子机制，筛选预测、诊断和预后AD的分子标志物及潜在药物	膝骨关节炎（KOA）和阿尔茨海默病（AD）患者	生物信息学	阿尔茨海默病, 膝骨关节炎	单细胞转录组测序, 虚拟筛选, 分子动力学模拟	NA	转录组数据	NA
712	2025-01-28	Arming AAV9 with a Single-Chain Fragment Variable Antibody Against PD-1 for Systemic Glioblastoma Therapy 2025-Feb, Molecular neurobiology IF:4.6Q1 DOI:10.1007/s12035-024-04406-y PMID:39138760	研究论文	本研究提出了一种利用AAV9病毒系统递送抗PD-1单链抗体片段（scFv-PD-1）到胶质母细胞瘤（GBM）肿瘤微环境中的靶向免疫治疗方法	首次使用AAV9病毒系统递送scFv-PD-1抗体，实现了局部表达并显著激活了肿瘤微环境中的细胞毒性T细胞	研究仅在免疫活性GBM小鼠模型中进行，尚未进行临床试验	探索针对胶质母细胞瘤的新型免疫治疗策略	胶质母细胞瘤（GBM）	免疫治疗	胶质母细胞瘤	单细胞RNA测序	免疫活性GBM小鼠模型	RNA测序数据	免疫活性GBM小鼠模型
713	2025-02-02	The role of fibroblast in chronic rhinosinusitis with nasal polyps: a key player in the inflammatory process 2025-Feb, Expert review of clinical immunology IF:3.9Q2 DOI:10.1080/1744666X.2024.2414774 PMID:39378160	综述	本文综述了鼻息肉来源的成纤维细胞在慢性鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）中的关键作用，特别是在组织重塑和炎症反应中的作用	强调了单细胞RNA测序数据在揭示成纤维细胞异质性和功能机制中的新应用，指出成纤维细胞作为治疗CRSwNP的潜在靶点	尽管有进展，针对成纤维细胞的临床治疗开发仍面临挑战	探讨成纤维细胞在CRSwNP发病机制中的具体作用，以开发靶向治疗	鼻息肉来源的成纤维细胞（NPDFs）	病理学	慢性鼻窦炎伴鼻息肉	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
714	2025-01-05	KLF2-dependent transcriptional regulation safeguards the heart against pathological hypertrophy 2025-Feb, Journal of molecular and cellular cardiology IF:4.9Q2 DOI:10.1016/j.yjmcc.2024.12.010 PMID:39733990	研究论文	本研究探讨了转录因子KLF2在心肌细胞生物学中的作用，特别是在心脏肥大中的保护机制	首次证明KLF2作为心脏肥大的负调节因子，并揭示了其通过直接调控与心脏肥大相关基因发挥保护作用的机制	研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，人类心脏中的直接证据尚需进一步研究	探讨KLF2在心脏肥大中的生物学作用及其潜在治疗策略	雄性C57BL/6J小鼠、新生大鼠心室肌细胞和人胚胎干细胞衍生的心肌细胞	分子生物学	心血管疾病	RNA-seq、CUT&Tag分析	NA	基因表达数据	NA
715	2025-02-03	The epitranscriptional factor PCIF1 orchestrates CD8+ T cell ferroptosis and activation to control antitumor immunity 2025-Feb, Nature immunology IF:27.7Q1 DOI:10.1038/s41590-024-02047-w PMID:39762445	研究论文	本文研究了RNA N 2'-O-二甲基腺苷（mA）甲基转移酶PCIF1在CD8+ T细胞铁死亡和激活中的作用，以控制抗肿瘤免疫	揭示了PCIF1通过调节mA修饰的靶基因（如Fth1、Slc3a2和Cd69）来抑制CD8+ T细胞的抗肿瘤反应，并发现PCIF1缺失可增强抗PD-1免疫疗法的效果	研究主要基于小鼠模型，临床数据有限，需进一步验证PCIF1在人类癌症中的具体作用	探索PCIF1在CD8+ T细胞抗肿瘤免疫中的调控机制	CD8+ T细胞和肿瘤模型	免疫学	癌症	单细胞RNA测序、蛋白质组学分析、mA测序	小鼠模型	RNA测序数据、蛋白质组数据	小鼠模型和临床癌症患者的T细胞样本
716	2025-02-01	Single-cell transcriptomic sequencing analysis of mechanistic insights into the IFN-γ signaling pathway in different tumor cells 2025-Feb, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12094-024-03574-6 PMID:39090422	研究论文	本研究通过单细胞转录组测序分析，探讨了不同肿瘤微环境中干扰素-γ（IFN-γ）信号通路与患者预后的关系及其在肿瘤细胞中的调控机制	揭示了IFN-γ信号通路在泛癌组织中的双重作用，即抑制肿瘤细胞增殖和增强其免疫原性，并发现HMGB2在T细胞中作为肿瘤细胞增殖的潜在关键调节因子	研究主要依赖于公共数据库的RNA-seq和scRNA-seq数据，可能受到数据质量和样本选择的限制	探讨IFN-γ信号通路在不同肿瘤微环境中的作用及其调控机制	不同肿瘤类型的肿瘤细胞及其微环境	生物信息学	癌症	RNA-seq, scRNA-seq	单变量Cox回归模型	RNA测序数据	来自TCGA和GEO数据库的RNA-seq和scRNA-seq数据
717	2025-02-01	Unraveling the metastatic niche in breast cancer bone metastasis through single-cell RNA sequencing 2025-Feb, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12094-024-03594-2 PMID:39066875	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和TCGA数据分析，全面比较了乳腺癌的原发肿瘤、淋巴结转移和骨转移，揭示了骨转移中的转移生态位特征	识别了与不良预后相关的乳腺癌骨转移细胞亚型（State 1），并揭示了肿瘤、基质和免疫细胞之间复杂的细胞通讯	NA	研究乳腺癌骨转移的转移生态位，以寻找针对这一特定转移表现的治疗干预策略	乳腺癌的原发肿瘤、淋巴结转移和骨转移	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
718	2025-01-31	The critical role of endoplasmic reticulum stress and the stimulator of interferon genes (STING) pathway in kidney fibrosis 2025-Feb, Kidney international IF:14.8Q1 DOI:10.1016/j.kint.2024.10.021 PMID:39566842	研究论文	本文探讨了内质网应激和STING通路在肾脏纤维化中的关键作用	揭示了STING作为PERK和ER应激的上游调节因子在肾小管细胞中的作用	ER应激在肾脏疾病中的确切激活机制仍不明确	研究内质网应激在肾脏疾病中的作用及其机制	慢性肾脏病患者和急性及慢性肾损伤小鼠模型	NA	肾脏疾病	转录组学分析	NA	转录组数据	慢性肾脏病患者和多种小鼠模型
719	2025-01-31	Single-cell transcriptomic profiling of maize cell heterogeneity and systemic immune responses against Puccinia polysora Underw 2025-Feb, Plant biotechnology journal IF:10.1Q1 DOI:10.1111/pbi.14519 PMID:39612313	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，解析了玉米对Puccinia polysora感染的细胞异质性及系统免疫反应	首次创建了玉米叶片在真菌攻击下的单细胞图谱，并重建了易感品系N110和抗病品系R99在感染期间的细胞轨迹，揭示了R99在不同叶片细胞类型中的多样化调控程序	NA	解析玉米对Puccinia polysora感染的细胞异质性及系统免疫反应机制	玉米叶片细胞	植物病理学	玉米锈病	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	易感品系N110和抗病品系R99的玉米叶片细胞
720	2025-01-31	Genetic associations between immune-related plasma proteins and neurodegenerative diseases 2025-Feb, Neurological research IF:1.7Q4 DOI:10.1080/01616412.2024.2448745 PMID:39743746	研究论文	本研究通过整合阿尔茨海默病、帕金森病、肌萎缩侧索硬化症和多发性硬化症的GWAS数据与血浆蛋白质组分析，探讨了免疫相关血浆蛋白与神经退行性疾病风险之间的关联	首次系统地分析了4907种免疫相关血浆蛋白与四种神经退行性疾病风险的直接关联，并通过单细胞RNA测序数据分析了蛋白质表达水平	研究主要依赖于GWAS数据，可能未完全捕捉到所有相关的遗传变异和蛋白质相互作用	探讨免疫相关血浆蛋白与神经退行性疾病风险之间的关联	阿尔茨海默病、帕金森病、肌萎缩侧索硬化症和多发性硬化症	基因组学	神经退行性疾病	GWAS, 单细胞RNA测序	NA	基因组数据, 蛋白质组数据	4907种免疫相关血浆蛋白