单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 658 篇文献，本页显示第 641 - 658 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 641 | 2024-12-09 |
NLRP3 inflammasome mediates pyroptosis of alveolar macrophages to induce radiation lung injury
2025-Feb-15, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.136740
PMID:39642726
|
研究论文 | 研究探讨了NLRP3炎症小体在辐射诱导的肺损伤中通过介导肺泡巨噬细胞的焦亡作用 | 首次揭示了NLRP3炎症小体在辐射诱导的肺损伤中通过介导肺泡巨噬细胞的焦亡作用，并提出了潜在的治疗策略 | NA | 探讨辐射诱导的肺损伤中肺泡巨噬细胞焦亡和炎症小体激活的机制 | 肺泡巨噬细胞、T细胞、B细胞和上皮细胞 | NA | 辐射诱导的肺损伤 | 多色流式细胞术、单细胞RNA测序、质谱分析、共免疫沉淀和Duolink技术 | NA | 细胞和组织微环境数据 | NA |
| 642 | 2025-01-28 |
Exosomal miRNA reprogramming in pyroptotic macrophage drives silica-induced fibroblast-to-myofibroblast transition and pulmonary fibrosis
2025-Feb-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.136629
PMID:39603130
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研究论文 | 本文研究了二氧化硅纳米颗粒（SiNPs）通过诱导巨噬细胞焦亡和释放外泌体，进而驱动成纤维细胞向肌成纤维细胞转化，促进肺纤维化的机制 | 揭示了SiNPs通过诱导巨噬细胞焦亡和外泌体释放，调控TGF-β信号通路，促进成纤维细胞向肌成纤维细胞转化的新机制 | 研究主要基于体外和动物模型，尚未在人体中进行验证 | 揭示二氧化硅诱导肺纤维化的分子机制 | 二氧化硅纳米颗粒（SiNPs）、巨噬细胞、成纤维细胞、外泌体 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、高通量miRNA测序、高光谱成像、人工智能病理识别 | NA | RNA测序数据、高光谱图像 | 体外和体内矽肺模型 |
| 643 | 2025-01-28 |
Resident synovial macrophages in synovial fluid: Implications for immunoregulation
2025-Feb, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110422
PMID:39701169
|
研究论文 | 本文探讨了常驻滑膜巨噬细胞（RSMs）在滑液中的存在及其对免疫调节的影响 | 创建了一种新型的体外模型来验证人类滑膜中的RSMs，并发现这些细胞在炎症性关节炎中上调了促纤维化和促破骨细胞途径 | 滑膜屏障破裂后，这些细胞是否持续或引发滑液中的慢性炎症仍未知 | 识别人类滑液中的RSMs作为滑膜屏障完整性的间接测量 | 人类滑液和滑膜 | 免疫学 | 关节炎 | scRNA-seq | 体外模型 | 基因表达数据 | NA |
| 644 | 2025-01-27 |
Prenatal exposure on nanoplastics: A study of spatial transcriptomics in hippocampal offspring
2025-Feb-01, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2024.125480
PMID:39644950
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，研究了母体暴露于聚苯乙烯纳米塑料（PS-NPs）对大鼠后代海马区的影响，揭示了纳米塑料对后代海马发育的神经毒性及其与学习记忆功能下降的关联 | 首次使用空间转录组学技术系统性地研究了纳米塑料对后代海马区的影响，揭示了细胞类型特异性基因表达谱的变化及其与神经发育障碍的关联 | 研究仅针对大鼠模型，尚未在人类中验证；未探讨长期暴露的累积效应 | 探究母体暴露于纳米塑料对后代海马区发育的影响及其机制 | 大鼠后代海马区 | 空间转录组学 | 神经发育障碍 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 645 | 2025-01-27 |
DEHP-mediated oxidative stress leads to impaired testosterone synthesis in Leydig cells through the cAMP/PKA/SF-1/StAR pathway
2025-Feb-01, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2024.125503
PMID:39657860
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研究论文 | 本研究探讨了环境中的增塑剂DEHP如何通过氧化应激影响Leydig细胞（LCs）的睾酮合成，揭示了cAMP/PKA/SF-1/StAR通路在其中的作用 | 首次结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析与体内外实验，揭示了DEHP通过氧化应激抑制cAMP/PKA/SF-1/StAR通路，从而损害LCs睾酮合成的机制 | 研究主要聚焦于DEHP对LCs的影响，未涉及其他环境污染物或细胞类型的潜在作用 | 探究DEHP对Leydig细胞损伤的分子机制，特别是其对睾酮合成的影响 | Leydig细胞（LCs） | 生物医学 | 男性生殖系统疾病 | scRNA-seq分析、体内外实验 | NA | 单细胞RNA测序数据、生化指标数据 | 未明确说明样本数量，但涉及体内外实验 |
| 646 | 2025-01-27 |
Single-cell transcriptome sequencing analysis of physiological and immune profiling of crucian carp (Carassius auratus) gills
2025-Feb, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2024.110087
PMID:39662647
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）和组织学分析，首次在单细胞水平上注释并分析了鲫鱼鳃的细胞类型及其功能异质性 | 首次在单细胞水平上注释并分析了鲫鱼鳃的细胞类型及其功能异质性，揭示了ILCM的代谢活跃状态和免疫调节的主要途径 | 研究局限于鲫鱼鳃的细胞类型和功能分析，未涉及其他鱼类或器官 | 探索鲫鱼鳃的生理和免疫功能，特别是在单细胞水平上的功能异质性 | 鲫鱼（Carassius auratus）的鳃 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），加权基因共表达网络分析（WGCNA） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 鲫鱼鳃的19种细胞类型 |
| 647 | 2025-01-25 |
Zinc ions facilitate metabolic bioenergetic recovery post spinal cord injury by activating microglial mitophagy through the STAT3-FOXO3a-SOD2 pathway
2025-Feb-01, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 本研究探讨了锌离子通过激活小胶质细胞线粒体自噬，促进脊髓损伤后代谢能量恢复的机制 | 揭示了锌离子通过STAT3-FOXO3a-SOD2轴调控线粒体基因表达，改善小胶质细胞能量稳态的新机制 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，缺乏体内实验验证 | 探索锌离子在脊髓损伤后小胶质细胞代谢恢复中的作用 | 脊髓损伤后的小胶质细胞 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 648 | 2025-01-25 |
Single-cell analysis of human peripheral blood reveals high immune response activity in successful ageing individuals
2025-Feb, Mechanisms of ageing and development
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.mad.2024.112011
PMID:39622417
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了成功老龄化个体（百岁老人和超级百岁老人）外周血的免疫系统动态调控及其分子机制 | 揭示了成功老龄化个体中CD8效应记忆T细胞和终末分化B细胞的富集，以及CD56 NK细胞中Fc-γ受体信号通路的激活，这些发现可能作为健康老龄化的生物标志物 | 样本量相对较小，仅包括7名超级百岁老人、3名百岁老人和4名老年对照 | 研究老龄化过程中免疫系统的动态调控及其分子机制 | 成功老龄化个体（百岁老人和超级百岁老人）的外周血单核细胞 | 生物信息学 | 老年病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 87,215个外周血单核细胞，来自7名超级百岁老人、3名百岁老人和4名老年对照 |
| 649 | 2025-01-25 |
Cellular heterogeneity and cytokine signatures in acute myeloid leukemia: A novel prognostic model
2025-Feb, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.102194
PMID:39689517
|
研究论文 | 本研究利用高分辨率单细胞RNA测序技术，解析了急性髓性白血病（AML）的复杂细胞景观，并构建了一个基于七种关键细胞因子相关基因的预后风险评分模型 | 通过单细胞RNA测序揭示了AML的细胞异质性，并首次构建了一个基于细胞因子相关基因的预后风险评分模型，该模型在多个独立AML患者队列中验证了其强大的预后能力 | 研究依赖于公开数据集，可能受到数据质量和样本选择的限制 | 解析AML的细胞异质性并开发一个临床适用的预后风险评分模型 | AML患者的骨髓样本 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | 预后风险评分模型 | RNA测序数据 | 多个独立AML患者队列 |
| 650 | 2025-01-25 |
Heterogeneity of cancer-associated fibroblast subpopulations in prostate cancer: Implications for prognosis and immunotherapy
2025-Feb, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.102255
PMID:39721245
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了前列腺癌中癌症相关成纤维细胞（CAF）亚群的多样性及其对疾病预后和免疫治疗策略的影响 | 首次系统性地描述了前列腺癌中CAF的四个主要亚群，并构建了反映这些亚群临床相关性的预后模型 | 研究主要基于体外实验和单细胞RNA测序数据，缺乏体内实验验证和更大规模的临床样本验证 | 阐明癌症相关成纤维细胞在前列腺癌肿瘤微环境中的多重作用，特别是其对疾病预后和免疫治疗策略的影响 | 前列腺癌样本中的癌症相关成纤维细胞（CAF）亚群 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 前列腺癌样本 |
| 651 | 2025-01-23 |
Application of Single-Cell Genomics to Animal Models of Periodontitis and Peri-Implantitis
2025-Feb, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.14093
PMID:39695834
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综述 | 本文综述了单细胞基因组学技术在牙周炎和种植体周围炎动物模型中的应用 | 结合单细胞RNA测序（scRNAseq）与动物模型，揭示牙周炎和种植体周围炎的细胞异质性和特定细胞作用，克服了批量RNA测序的局限性 | NA | 整合单细胞基因组学技术与牙周炎和种植体周围炎的动物模型，以促进对这些疾病发病机制的理解和精准治疗的发展 | 牙周炎和种植体周围炎的动物模型 | 基因组学 | 牙周炎, 种植体周围炎 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 652 | 2025-01-22 |
Central and peripheral kynurenine pathway metabolites in COVID-19: Implications for neurological and immunological responses
2025-Feb, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2024.11.031
PMID:39615604
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研究论文 | 本研究探讨了COVID-19患者中中枢和外周kynurenine途径代谢物的变化及其对神经和免疫反应的影响 | 首次发现COVID-19患者中枢神经系统中kynurenine代谢物水平升高，并揭示了外周炎症通过单核细胞中IDO1的过表达激活kynurenine途径的机制 | 样本量相对较小，且仅针对瑞典患者进行研究，可能限制了结果的普遍性 | 研究COVID-19患者中kynurenine途径代谢物的变化及其对神经和免疫反应的影响 | 53名COVID-19患者和12名非炎症性神经系统疾病对照 | 生物医学 | COVID-19 | 超高效液相色谱-串联质谱法（UPLC-MS/MS）和单细胞转录组学 | NA | 代谢物水平和基因表达数据 | 53名COVID-19患者和12名非炎症性神经系统疾病对照，以及130名COVID-19患者的单细胞转录组数据 |
| 653 | 2024-08-13 |
Spatial and Single-Cell Transcriptomics Reveal that Oncofetal Reprogramming of Fibroblasts Is Associated with Malignant Degeneration of Burn Scar
2025-Feb, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2024.07.022
PMID:39128494
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 654 | 2025-01-14 |
Dissecting the cellular reprogramming and tumor microenvironment in left- and right-sided Colorectal Cancer by single cell RNA sequencing
2025-Feb, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2024.12.002
PMID:39675521
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术，研究左右侧结直肠癌的细胞重编程和肿瘤微环境差异 | 首次通过单细胞RNA测序技术全面分析左右侧结直肠癌的细胞组成、转录特征及功能差异，揭示了右侧结直肠癌中更复杂的细胞间相互作用和免疫抑制模式 | 研究依赖于公开数据库中的单细胞RNA测序数据，可能存在数据偏差或样本选择限制 | 探究左右侧结直肠癌在细胞组成、转录特征及肿瘤微环境中的差异，以优化个性化治疗方案 | 55个结直肠癌样本中的126,279个细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 55个结直肠癌样本中的126,279个细胞 |
| 655 | 2025-01-07 |
Integrative transcriptome analysis reveals Serpine2 promotes glomerular mesangial cell proliferation and extracellular matrix accumulation via activating ERK1/2 signalling pathway in diabetic nephropathy
2025-Feb, Diabetes, obesity & metabolism
DOI:10.1111/dom.16069
PMID:39557806
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研究论文 | 本文通过整合转录组分析揭示了Serpine2通过激活ERK1/2信号通路促进糖尿病肾病中肾小球系膜细胞增殖和细胞外基质积累的机制 | 首次通过整合批量数据集和单细胞转录组数据集，发现Serpine2在糖尿病肾病中的关键作用，并揭示了其通过ERK1/2信号通路调控的分子机制 | 研究主要基于动物模型和细胞模型，尚未在人类患者中进行验证 | 探索糖尿病肾病的发病机制，特别是Serpine2在其中的作用 | 糖尿病肾病模型中的肾小球系膜细胞和细胞外基质 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | 转录组分析、Western blotting、免疫荧光染色 | db/db小鼠模型、肾小球系膜细胞模型 | 转录组数据、蛋白质表达数据 | db/db小鼠和肾小球系膜细胞 |
| 656 | 2024-12-20 |
VNN2 regulates hepatic steroid synthesis in response to dietary changes
2025-Feb-10, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2024.149128
PMID:39613052
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研究论文 | 研究探讨了VNN2在鸡肝脏中对脂质代谢和类固醇合成的调控作用 | 首次揭示了VNN2通过上调MSMO1和FDPS促进类固醇合成的机制 | 研究仅在鸡肝脏中进行，未涉及其他物种或组织 | 研究VNN2在肝脏脂质代谢和类固醇合成中的具体功能 | 鸡肝脏中的VNN2表达及其对脂质代谢和类固醇合成的影响 | NA | NA | RNA测序、qPCR、甘油三酯和总胆固醇检测 | NA | RNA测序数据 | 使用了多个数据集，包括GSM5764402、GSM5764403、GSE128340、GSE129840和PRJEB44038 |
| 657 | 2024-12-14 |
scSFCL:Deep clustering of scRNA-seq data with subspace feature confidence learning
2025-Feb, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 提出了一种基于子空间特征置信度学习的深度聚类方法scSFCL，用于单细胞RNA测序数据的聚类分析 | 通过子空间特征置信度学习结合图卷积网络和加权方法，筛选出判别性特征子集，并利用相互监督的聚类方法融合通用结构信息和特异性信息 | 未提及具体限制 | 提高单细胞RNA测序数据的深度聚类性能 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图卷积网络 | 基因表达数据 | 多个单细胞RNA测序数据集 |
| 658 | 2024-12-06 |
Subtype-specific transcription factors affect polyamine metabolism and the tumor microenvironment in breast cancer
2025-Feb, Cancer innovation
DOI:10.1002/cai2.138
PMID:39629335
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研究论文 | 研究了转录因子对乳腺癌亚型中多胺代谢和肿瘤微环境的影响 | 首次确定了三个亚型特异性转录因子，它们调控高风险乳腺癌亚型中的三个多胺代谢基因，并影响肿瘤微环境 | 研究仅限于乳腺癌亚型，未涵盖其他癌症类型 | 探讨转录因子对乳腺癌亚型中多胺代谢基因的调控及其对肿瘤微环境的影响 | 乳腺癌亚型中的多胺代谢基因及其转录因子 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序 | NA | RNA | 涉及四种乳腺癌亚型的RNA-seq数据和单细胞RNA-seq数据 |