单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
641	2025-02-06	Single-cell transcriptomic analysis reveals efferocytosis signature predicting immunotherapy response in hepatocellular carcinoma 2025-Feb-03, Digestive and liver disease : official journal of the Italian Society of Gastroenterology and the Italian Association for the Study of the Liver IF:4.0Q1 DOI:10.1016/j.dld.2025.01.196 PMID:39904693	研究论文	本文通过单细胞转录组分析开发了一个与efferocytosis相关的基因签名（ER.Sig），用于预测肝细胞癌（HCC）患者的预后和免疫治疗反应	开发了一个新的efferocytosis相关基因签名（ER.Sig），并利用多组学方法深入解析了HCC的预后特征	研究依赖于公共数据库的数据，可能受到数据质量和一致性的限制	预测肝细胞癌（HCC）患者的预后和免疫治疗反应	肝细胞癌（HCC）患者	数字病理学	肝细胞癌	单细胞RNA测序，批量RNA测序	随机生存森林模型	RNA测序数据	多个公共数据库中的HCC患者样本
642	2025-02-06	Single-cell RNA sequencing analysis reveals the dynamic changes in the tumor microenvironment during NMIBC recurrence 2025-Feb, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1 DOI:10.1007/s10495-024-02044-2 PMID:39633115	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了非肌层浸润性膀胱癌（NMIBC）复发过程中肿瘤微环境的动态变化	识别了与NMIBC复发相关的肿瘤相关成纤维细胞（CAF）亚型和具有显著免疫抑制特征的巨噬细胞亚型，并发现雌激素在复发性尿路上皮癌细胞中的上调	样本量较小，仅包括10个原发性和复发性NMIBC样本	深入了解尿路上皮膀胱癌（UBC）复发过程中肿瘤微环境的变化	非肌层浸润性膀胱癌（NMIBC）患者	数字病理学	膀胱癌	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	10个原发性和复发性NMIBC样本
643	2025-02-05	Dynamic evolution of TCF3-PBX1 leukemias at the single-cell level under chemotherapy pressure 2025-Feb, HemaSphere IF:7.6Q1 DOI:10.1002/hem3.70071 PMID:39901941	研究论文	本文通过建立TCF3-PBX1条件性敲入小鼠模型，研究了化疗压力下急性淋巴细胞白血病（ALL）在单细胞水平的动态演化	首次在单细胞水平上揭示了TCF3-PBX1白血病在化疗后的克隆动态演化和表型多样性，并发现了与化疗耐药相关的信号通路	研究主要基于小鼠模型，结果在人类ALL中的适用性需要进一步验证	研究TCF3-PBX1白血病在化疗压力下的动态演化和耐药机制	TCF3-PBX1条件性敲入小鼠模型和化疗后的白血病细胞	数字病理学	白血病	下一代测序技术（NGS）和质谱流式细胞术	小鼠模型	单细胞RNA测序数据和质谱流式细胞数据	TCF3-PBX1白血病小鼠模型
644	2025-02-05	Single-cell transcriptome atlas of male mouse pituitary across postnatal life highlighting its stem cell landscape 2025-Feb-21, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2024.111708 PMID:39898054	研究论文	本文构建了雄性小鼠内分泌垂体的单细胞转录组图谱，涵盖了健康与损伤状态下的重要出生后年龄段，重点研究了垂体干细胞及其复杂身份和微环境	通过单细胞转录组技术揭示了垂体干细胞的标记物和调控因子，并利用垂体干细胞类器官功能验证了转录组发现，特别是KLF5、AP-1复合物和EGF通路在垂体干细胞调控中的作用	研究主要基于小鼠模型，尽管部分发现可转化至人类，但仍需进一步验证	揭示垂体干细胞的生物学特性及其在衰老过程中的变化	雄性小鼠的垂体	单细胞转录组学	NA	单细胞转录组测序	NA	单细胞转录组数据	涵盖健康与损伤状态下的雄性小鼠垂体样本
645	2025-02-05	Fusobacterium nucleatum promotes colorectal cancer through neogenesis of tumor stem cells 2025-Feb-03, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1 DOI:10.1172/JCI181595 PMID:39656543	研究论文	本研究揭示了Fusobacterium nucleatum通过激活LY6A+复兴干细胞（RSCs）并促进其转化为肿瘤干细胞，从而加速结直肠癌（CRC）发生的机制	发现了F. nucleatum通过LY6A受体上调RPS14，驱动RSCs过度增殖和肿瘤转化的新信号轴	研究主要基于小鼠模型和临床样本分析，尚未在人体中进行干预实验验证	探讨Fusobacterium nucleatum在结直肠癌发生中的作用机制	结直肠癌患者和小鼠模型中的肠道隐窝细胞	肿瘤生物学	结直肠癌	单细胞测序分析	小鼠模型	基因表达数据	结直肠癌患者和小鼠模型
646	2025-02-04	Exploring the tumor microenvironment of colorectal cancer patients post renal transplantation by single-cell analysis 2025-Feb, Cancer science IF:4.5Q1 DOI:10.1111/cas.16409 PMID:39623744	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术，探索了肾移植后结直肠癌患者的肿瘤微环境，揭示了免疫抑制药物对肿瘤免疫微环境的影响	首次在肾移植后结直肠癌患者中应用单细胞RNA测序技术，详细比较了移植与非移植患者的肿瘤免疫微环境差异，并发现了CD8效应T细胞和CD4FOXP3调节T细胞的功能变化	样本量较小，仅包括4名肾移植后结直肠癌患者和23名非移植结直肠癌患者的数据	研究肾移植后结直肠癌患者的肿瘤免疫微环境变化及其对免疫治疗策略的影响	肾移植后结直肠癌患者的肿瘤和正常组织	数字病理学	结直肠癌	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	4名肾移植后结直肠癌患者和23名非移植结直肠癌患者
647	2025-02-05	MAZ-mediated tumor progression and immune evasion in hormone receptor-positive breast cancer: Targeting tumor microenvironment and PCLAF+ subtype-specific therapy 2025-Feb, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2025.102280 PMID:39805182	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术分析了激素受体阳性乳腺癌的肿瘤亚型，揭示了C3 PCLAF+肿瘤细胞亚型在肿瘤进展和免疫逃逸中的作用，并提出了新的预后模型	通过单细胞RNA测序技术识别了C3 PCLAF+肿瘤细胞亚型，并发现MAZ在该亚型中的关键作用，提出了基于PCLAF+/MAZ调控网络的新型预后模型	研究主要基于数据库和体外实验，缺乏临床样本的验证	揭示激素受体阳性乳腺癌的分子机制，特别是肿瘤异质性和肿瘤微环境的变化，以克服治疗耐药性并开发新的治疗靶点	激素受体阳性乳腺癌（HR+BC）	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	预后模型	RNA测序数据	NA
648	2025-02-05	Histone methyltransferase KMT2A promotes pulmonary fibrogenesis via targeting pro-fibrotic factor PU.1 in fibroblasts 2025-Feb, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1 DOI:10.1002/ctm2.70217 PMID:39888275	研究论文	本研究探讨了组蛋白甲基转移酶KMT2A在肺纤维化中的作用及其通过调控PU.1转录因子促进纤维化的机制	揭示了KMT2A通过催化PU.1基因启动子区域的H3K4me3修饰来上调PU.1表达，从而促进肺纤维化的新机制	研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人体中进行验证	探讨KMT2A在肺纤维化中的作用及其潜在的治疗靶点价值	肺纤维化患者和小鼠模型中的成纤维细胞	表观遗传学	肺纤维化	微阵列分析、单细胞测序、生物信息学分析	小鼠模型	基因表达数据、蛋白质表达数据	IPF患者和小鼠模型的肺组织样本
649	2025-02-05	Molecular characterization of ovarian mesonephric-like adenocarcinoma: Insights from single-cell RNA sequencing and mitochondrial metabolism 2025-Feb, Gynecologic oncology reports IF:1.2Q3 DOI:10.1016/j.gore.2024.101670 PMID:39895896	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术对卵巢中肾样腺癌（MLA）进行了分子特征分析，并与高级别浆液性卵巢癌（HGSOC）进行了比较	首次使用单细胞RNA测序技术对卵巢MLA进行分子特征分析，揭示了其与HGSOC的差异，并提出了针对MAP激酶和PI3K/AKT/mTOR通路的联合治疗策略	需要在更大规模的队列中进行验证以支持临床应用	揭示卵巢MLA的分子特征及其与HGSOC的差异，探索潜在的治疗靶点	卵巢中肾样腺癌（MLA）和高级别浆液性卵巢癌（HGSOC）	数字病理学	卵巢癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	一个卵巢MLA样本和HGSOC的单细胞RNA测序数据集
650	2025-02-04	Dysfunctional KLRB1+CD8+ T-cell responses are generated in chronically inflamed systemic sclerosis skin 2025-Feb-01, Annals of the rheumatic diseases IF:20.3Q1 DOI:10.1016/j.ard.2025.01.022 PMID:39894688	研究论文	本研究分析了弥漫性皮肤系统性硬化症（dcSSc）皮肤病变中的CD8+ T细胞反应，揭示了两种主要的CD8+ T细胞亚群在疾病不同阶段的作用	通过单细胞转录组学和表观基因组学技术，首次鉴定了dcSSc皮肤病变中两种发育相关的CD8+ T细胞亚群，并揭示了它们在疾病不同阶段的功能差异	研究主要基于皮肤样本，未涉及其他器官或系统的免疫反应	分析dcSSc皮肤病变中的免疫机制，特别是CD8+ T细胞反应	弥漫性皮肤系统性硬化症（dcSSc）患者的皮肤样本	免疫学	系统性硬化症	单细胞转录组学、表观基因组学、多色免疫荧光显微镜	NA	单细胞RNA测序数据、表观遗传数据、图像数据	dcSSc患者皮肤样本与健康对照皮肤样本
651	2025-01-31	Single-cell transcriptomic profiling of maize cell heterogeneity and systemic immune responses against Puccinia polysora Underw 2025-Feb, Plant biotechnology journal IF:10.1Q1 DOI:10.1111/pbi.14519 PMID:39612313	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，解析了玉米对Puccinia polysora感染的细胞异质性及系统免疫反应	首次创建了玉米叶片在真菌攻击下的单细胞图谱，并重建了易感品系N110和抗病品系R99在感染期间的细胞轨迹，揭示了R99在不同叶片细胞类型中的多样化调控程序	NA	解析玉米对Puccinia polysora感染的细胞异质性及系统免疫反应机制	玉米叶片细胞	植物病理学	玉米锈病	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	易感品系N110和抗病品系R99的玉米叶片细胞
652	2025-01-31	Airway stenosis: classification, pathogenesis, and clinical management 2025-Feb, MedComm IF:10.7Q1 DOI:10.1002/mco2.70076 PMID:39866837	综述	本文综述了气道狭窄（AS）的分类、发病机制及临床管理，并探讨了基于发病机制开发的多种治疗方法	本文综合了AS的多种发病机制，并探讨了基于这些机制的新型治疗方法，如基因治疗、干细胞治疗等	尽管提出了多种治疗方法，但许多仍处于临床前阶段，尚未广泛应用于临床	揭示AS的发病机制并加速其临床转化	气道狭窄（AS）患者	NA	气道狭窄	单细胞RNA测序、16S rRNA基因测序、shotgun宏基因组测序	NA	NA	NA
653	2025-01-31	A deep learning framework for in silico screening of anticancer drugs at the single-cell level 2025-Feb, National science review IF:16.3Q1 DOI:10.1093/nsr/nwae451 PMID:39872221	研究论文	本文介绍了一个名为Shennong的深度学习框架，用于在单细胞水平上进行抗癌药物的计算机筛选	利用泛癌和泛组织的单细胞转录组数据揭示恶性细胞、癌前细胞以及癌症相关基质和内皮细胞的异质性表达模式，并开发了Shennong框架进行药物筛选	未提及具体的数据集大小或实验验证的详细结果	提高抗癌药物的筛选准确性和效率，加速药物发现过程	恶性细胞、癌前细胞、癌症相关基质和内皮细胞	数字病理学	癌症	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	深度学习	单细胞转录组数据	NA
654	2024-12-09	NLRP3 inflammasome mediates pyroptosis of alveolar macrophages to induce radiation lung injury 2025-Feb-15, Journal of hazardous materials IF:12.2Q1 DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.136740 PMID:39642726	研究论文	研究探讨了NLRP3炎症小体在辐射诱导的肺损伤中通过介导肺泡巨噬细胞的焦亡作用	首次揭示了NLRP3炎症小体在辐射诱导的肺损伤中通过介导肺泡巨噬细胞的焦亡作用，并提出了潜在的治疗策略	NA	探讨辐射诱导的肺损伤中肺泡巨噬细胞焦亡和炎症小体激活的机制	肺泡巨噬细胞、T细胞、B细胞和上皮细胞	NA	辐射诱导的肺损伤	多色流式细胞术、单细胞RNA测序、质谱分析、共免疫沉淀和Duolink技术	NA	细胞和组织微环境数据	NA
655	2025-01-28	Exosomal miRNA reprogramming in pyroptotic macrophage drives silica-induced fibroblast-to-myofibroblast transition and pulmonary fibrosis 2025-Feb-05, Journal of hazardous materials IF:12.2Q1 DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.136629 PMID:39603130	研究论文	本文研究了二氧化硅纳米颗粒（SiNPs）通过诱导巨噬细胞焦亡和释放外泌体，进而驱动成纤维细胞向肌成纤维细胞转化，促进肺纤维化的机制	揭示了SiNPs通过诱导巨噬细胞焦亡和外泌体释放，调控TGF-β信号通路，促进成纤维细胞向肌成纤维细胞转化的新机制	研究主要基于体外和动物模型，尚未在人体中进行验证	揭示二氧化硅诱导肺纤维化的分子机制	二氧化硅纳米颗粒（SiNPs）、巨噬细胞、成纤维细胞、外泌体	数字病理学	肺纤维化	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、高通量miRNA测序、高光谱成像、人工智能病理识别	NA	RNA测序数据、高光谱图像	体外和体内矽肺模型
656	2025-01-28	Resident synovial macrophages in synovial fluid: Implications for immunoregulation 2025-Feb, Clinical immunology (Orlando, Fla.) DOI:10.1016/j.clim.2024.110422 PMID:39701169	研究论文	本文探讨了常驻滑膜巨噬细胞（RSMs）在滑液中的存在及其对免疫调节的影响	创建了一种新型的体外模型来验证人类滑膜中的RSMs，并发现这些细胞在炎症性关节炎中上调了促纤维化和促破骨细胞途径	滑膜屏障破裂后，这些细胞是否持续或引发滑液中的慢性炎症仍未知	识别人类滑液中的RSMs作为滑膜屏障完整性的间接测量	人类滑液和滑膜	免疫学	关节炎	scRNA-seq	体外模型	基因表达数据	NA
657	2025-01-27	Prenatal exposure on nanoplastics: A study of spatial transcriptomics in hippocampal offspring 2025-Feb-01, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987) DOI:10.1016/j.envpol.2024.125480 PMID:39644950	研究论文	本研究利用空间转录组学技术，研究了母体暴露于聚苯乙烯纳米塑料（PS-NPs）对大鼠后代海马区的影响，揭示了纳米塑料对后代海马发育的神经毒性及其与学习记忆功能下降的关联	首次使用空间转录组学技术系统性地研究了纳米塑料对后代海马区的影响，揭示了细胞类型特异性基因表达谱的变化及其与神经发育障碍的关联	研究仅针对大鼠模型，尚未在人类中验证；未探讨长期暴露的累积效应	探究母体暴露于纳米塑料对后代海马区发育的影响及其机制	大鼠后代海马区	空间转录组学	神经发育障碍	空间转录组学	NA	转录组数据	NA
658	2025-01-27	DEHP-mediated oxidative stress leads to impaired testosterone synthesis in Leydig cells through the cAMP/PKA/SF-1/StAR pathway 2025-Feb-01, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987) DOI:10.1016/j.envpol.2024.125503 PMID:39657860	研究论文	本研究探讨了环境中的增塑剂DEHP如何通过氧化应激影响Leydig细胞（LCs）的睾酮合成，揭示了cAMP/PKA/SF-1/StAR通路在其中的作用	首次结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析与体内外实验，揭示了DEHP通过氧化应激抑制cAMP/PKA/SF-1/StAR通路，从而损害LCs睾酮合成的机制	研究主要聚焦于DEHP对LCs的影响，未涉及其他环境污染物或细胞类型的潜在作用	探究DEHP对Leydig细胞损伤的分子机制，特别是其对睾酮合成的影响	Leydig细胞（LCs）	生物医学	男性生殖系统疾病	scRNA-seq分析、体内外实验	NA	单细胞RNA测序数据、生化指标数据	未明确说明样本数量，但涉及体内外实验
659	2025-01-27	Single-cell transcriptome sequencing analysis of physiological and immune profiling of crucian carp (Carassius auratus) gills 2025-Feb, Fish & shellfish immunology IF:4.1Q1 DOI:10.1016/j.fsi.2024.110087 PMID:39662647	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）和组织学分析，首次在单细胞水平上注释并分析了鲫鱼鳃的细胞类型及其功能异质性	首次在单细胞水平上注释并分析了鲫鱼鳃的细胞类型及其功能异质性，揭示了ILCM的代谢活跃状态和免疫调节的主要途径	研究局限于鲫鱼鳃的细胞类型和功能分析，未涉及其他鱼类或器官	探索鲫鱼鳃的生理和免疫功能，特别是在单细胞水平上的功能异质性	鲫鱼（Carassius auratus）的鳃	单细胞转录组学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq），加权基因共表达网络分析（WGCNA）	NA	单细胞RNA测序数据	鲫鱼鳃的19种细胞类型
660	2025-01-25	Zinc ions facilitate metabolic bioenergetic recovery post spinal cord injury by activating microglial mitophagy through the STAT3-FOXO3a-SOD2 pathway 2025-Feb-01, Free radical biology & medicine DOI:10.1016/j.freeradbiomed.2024.11.045 PMID:39613048	研究论文	本研究探讨了锌离子通过激活小胶质细胞线粒体自噬，促进脊髓损伤后代谢能量恢复的机制	揭示了锌离子通过STAT3-FOXO3a-SOD2轴调控线粒体基因表达，改善小胶质细胞能量稳态的新机制	研究主要基于单细胞RNA测序数据，缺乏体内实验验证	探索锌离子在脊髓损伤后小胶质细胞代谢恢复中的作用	脊髓损伤后的小胶质细胞	神经科学	脊髓损伤	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA