本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 601 | 2025-10-07 |
Mural cell dysfunction contributes to diastolic heart failure by promoting endothelial dysfunction and vessel remodelling
2025-Feb-07, Cardiovascular diabetology
IF:8.5Q1
DOI:10.1186/s12933-025-02623-w
PMID:39920783
|
研究论文 | 本研究探讨了壁细胞功能障碍通过促进内皮功能障碍和血管重塑在舒张性心力衰竭中的作用机制 | 首次探索了壁细胞在HFpEF中的作用,建立了新的糖尿病db/db小鼠高盐HFpEF模型,揭示了壁细胞通过TNFα依赖性旁分泌信号诱导内皮细胞生长停滞的新机制 | 研究仅限于小鼠模型,未在人类样本中验证 | 研究壁细胞功能障碍在心力衰竭伴保留射血分数发病机制中的作用 | 糖尿病db/db小鼠和PDGFRβtg/tg-CreERT2-EYFPtg/tg转基因小鼠 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, NichetNet分析, 组织学分析 | NA | 单细胞转录组数据, 组织学图像 | 转基因小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 602 | 2025-10-07 |
Decoding SFRP2 progenitors in sustaining tooth growth at single-cell resolution
2025-Feb-07, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04190-z
PMID:39920788
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了SFRP2hi成纤维祖细胞在维持牙齿持续生长中的关键作用 | 首次识别出小鼠切牙和人类磨牙发育牙根中特有的Sfrp2hi成纤维祖细胞群,并阐明其通过Twist1调控Wnt信号通路维持干细胞特性的分子机制 | 将小鼠牙齿研究发现应用于人类疾病的研究仍不够充分 | 构建全面的牙髓细胞图谱,阐明人类与小鼠之间的组织相似性和物种特异性差异 | 人类和小鼠的牙髓组织 | 单细胞生物学 | 牙科疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 多个单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 603 | 2025-10-07 |
Myeloma cell-derived CXCL7 facilitates proliferation of tumor cells and occurrence of osteolytic lesions through JAK/STAT3 pathway
2025-Feb-06, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07413-6
PMID:39915476
|
研究论文 | 本研究揭示了骨髓瘤细胞通过分泌CXCL7趋化因子激活JAK/STAT3通路,促进肿瘤增殖和溶骨性病变发生的分子机制 | 首次发现高表达CXCL7的骨髓瘤细胞亚群具有强增殖和破骨信号通路激活能力,并阐明CXCL7通过CXCR2-JAK/STAT3-MMP13/C-myc轴驱动溶骨性病变的新机制 | 研究主要基于细胞系和小鼠模型,临床样本验证仍需扩大;CXCL7作为治疗靶点的具体干预策略尚未完全明确 | 探究多发性骨髓瘤中溶骨性病变的分子机制及潜在治疗靶点 | 多发性骨髓瘤细胞、小鼠异种移植瘤模型 | 数字病理 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序、转录组分析、体内外功能验证 | 小鼠异种移植瘤模型 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 本中心和GEO数据库的骨髓瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 604 | 2025-10-07 |
Single-cell atlas of human pancreatic islet and acinar endothelial cells in health and diabetes
2025-Feb-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-55415-3
PMID:39915484
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了人类胰腺胰岛和腺泡内皮细胞在健康与糖尿病状态下的血管图谱 | 首次开发了富集胰岛特异性内皮细胞和腺泡特异性内皮细胞的策略,并揭示了它们在健康和糖尿病状态下的独特分子特征 | 仅分析了三个人类胰腺样本,样本量有限 | 表征胰腺内血管异质性并揭示糖尿病中的血管变化 | 人类胰腺胰岛特异性内皮细胞和腺泡特异性内皮细胞 | 单细胞生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三个人类胰腺样本加上三个已发表的胰腺数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 605 | 2025-10-07 |
MiR-18a-LncRNA NONRATG-022419 pairs targeted PRG-1 regulates diabetic induced cognitive impairment by regulating NGF\BDNF-Trkb signaling pathway
2025-Feb-06, Proteome science
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12953-025-00239-2
PMID:39915794
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和转录组分析揭示了PRG-1通过NGF/BDNF-Trkb信号通路调控糖尿病认知功能障碍的分子机制 | 首次发现miR-18a-LncRNA NONRATG-022419对靶向调控PRG-1在糖尿病认知障碍中的作用机制 | 研究主要基于体外HT22细胞模型,需要进一步在体实验验证 | 探究PRG-1在糖尿病诱导认知功能障碍中的分子机制和细胞异质性 | 海马体细胞、HT22细胞系、I型螺旋神经节神经元 | 单细胞测序分析 | 糖尿病认知功能障碍 | 单细胞RNA测序, RNA转录组分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 606 | 2025-10-07 |
Phospho-seq: integrated, multi-modal profiling of intracellular protein dynamics in single cells
2025-Feb-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56590-7
PMID:39905064
|
研究论文 | 开发了一种名为Phospho-seq的集成方法,用于在单细胞水平同时分析细胞质和核蛋白及其翻译后修饰 | 提出简化的台式抗体偶联方法创建大型定制神经聚焦抗体面板,实现蛋白质与scATAC-seq的同时分析 | NA | 开发能够量化细胞内蛋白质动态并与顺式调控元件和转录靶标连接的多模态单细胞分析技术 | 细胞系、诱导多能干细胞、数月龄视网膜和脑类器官 | 单细胞多组学 | 神经发育疾病 | 单细胞ATAC-seq, 转录组测量, 抗体偶联 | NA | 蛋白质组, 表观基因组, 转录组 | NA | NA | 单细胞ATAC-seq, 多组学分析 | NA | NA |
| 607 | 2025-10-07 |
Expression of Osteopontin in M2 and M4 Intrinsically Photosensitive Retinal Ganglion Cells in the Mouse Retina
2025-Feb-03, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.2.14
PMID:39908128
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫组织化学方法揭示了骨桥蛋白在小鼠视网膜M2和M4型内在光敏视网膜神经节细胞中的表达模式 | 首次发现骨桥蛋白不仅表达于M4-ipRGCs,还在M2-ipRGCs中表达,挑战了骨桥蛋白仅作为αRGCs特异性标志物的传统认知 | 研究仅针对C57BL/6J小鼠视网膜,尚未在其他物种或病理条件下验证 | 表征骨桥蛋白在ipRGCs各亚型中的表达模式 | 小鼠视网膜中的内在光敏视网膜神经节细胞(ipRGCs) | 神经科学 | 视神经损伤 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 神经突追踪 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | C57BL/6J小鼠视网膜样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 608 | 2025-10-07 |
Identifying novel therapeutic targets in cystic fibrosis through advanced single-cell transcriptomics analysis
2025-Feb-07, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.109748
PMID:39921941
|
研究论文 | 通过先进单细胞转录组学分析识别囊性纤维化新型治疗靶点 | 采用增强分析方法整合多源数据,发现与CF气道疾病相关的新基因和调控网络 | 未明确说明样本规模和技术平台的具体限制 | 深入理解囊性纤维化相关基因表达机制,识别新型治疗靶点 | 囊性纤维化患者和健康对照者的肺部细胞 | 单细胞转录组学 | 囊性纤维化 | 单细胞转录组测序 | 共表达网络分析 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 609 | 2025-02-09 |
Unveiling heterogeneity in rare cells by combining RNA-based sorting and scRNA-seq
2025-Feb-07, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-02073-2
PMID:39920268
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 610 | 2025-10-07 |
Single-cell analysis reveals cellular heterogeneity, gene expression profiles, and pathway dynamics in acne vulgaris
2025-Feb-07, Archives of dermatological research
IF:1.8Q3
DOI:10.1007/s00403-025-03894-9
PMID:39920471
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析痤疮皮损组织的细胞异质性、基因表达谱和通路动态 | 首次在单细胞水平揭示痤疮皮损组织的细胞异质性、异常细胞间通讯和代谢通路改变 | 样本量较小(仅6例患者),数据来源于公共数据库 | 探索痤疮发病的细胞和分子机制 | 痤疮患者的皮损和非皮损皮肤组织 | 单细胞组学 | 痤疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6例痤疮患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 611 | 2025-10-07 |
Exploring molecular disparities of H-type vasculature endothelial cells in osteonecrosis of the femoral head through single-cell analysis
2025-Feb-06, BMC musculoskeletal disorders
IF:2.2Q3
DOI:10.1186/s12891-024-08267-3
PMID:39910554
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析股骨头坏死中H型血管内皮细胞的分子差异 | 首次在单细胞水平揭示ONFH中H型血管内皮细胞的分子特征及铁死亡和parthanatos死亡模式的作用 | 样本量较小(仅9个样本),数据为公开数据的重新分析 | 探索股骨头坏死中H型血管内皮细胞的分子变化 | 股骨头样本中的H型血管内皮细胞 | 单细胞分析 | 股骨头坏死 | 单细胞RNA测序 | 细胞通讯分析 | 单细胞RNA测序数据 | 9个股骨头样本(3个HOA、3个ONFH 3A期、3个ONFH 4期) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 612 | 2025-10-07 |
Identification of mitochondrial carrier homolog 2 as an important therapeutic target of castration-resistant prostate cancer
2025-Feb-05, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07406-5
PMID:39910035
|
研究论文 | 本研究探讨线粒体载体同源物2在去势抵抗性前列腺癌中的表达及其功能作用 | 首次揭示MTCH2通过维持线粒体功能促进去势抵抗性前列腺癌进展的新机制 | 研究主要基于体外实验和动物模型,尚未在临床患者中进行验证 | 探索MTCH2作为去势抵抗性前列腺癌治疗靶点的潜力 | 去势抵抗性前列腺癌细胞系、原代CRPC细胞和裸鼠移植瘤模型 | 癌症生物学 | 前列腺癌 | 单细胞测序、shRNA基因沉默、CRISPR-sgRNA基因敲除 | NA | 基因表达数据、细胞功能数据、动物实验数据 | 多种原代人CRPC细胞系和裸鼠移植瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 613 | 2025-10-07 |
CoTF-reg reveals cooperative transcription factors in oligodendrocyte gene regulation using single-cell multi-omics
2025-Feb-05, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-07570-6
PMID:39910206
|
研究论文 | 开发了一个整合单细胞多组学数据的分析框架,用于识别少突胶质细胞中协同调控基因的转录因子对 | 提出了coTF-reg分析框架,首次整合scRNA-seq和scATAC-seq数据识别协同转录因子,并采用深度学习模型预测靶基因表达 | NA | 揭示少突胶质细胞中转录因子协同调控基因的机制 | 少突胶质细胞中的转录因子及其靶基因 | 生物信息学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, ChIP-seq, 深度学习 | 深度学习模型 | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 614 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals tumor heterogeneity in small cell neuroendocrine cervical carcinoma
2025-Feb-05, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-07605-y
PMID:39910262
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示小细胞神经内分泌宫颈癌的肿瘤异质性 | 首次绘制SCNECC的单细胞图谱,识别出四种上皮细胞亚型及其关键转录因子,发现两种不同的致癌途径 | 样本量较小(仅6个样本),需要更大规模验证 | 探索小细胞神经内分泌宫颈癌的肿瘤异质性和分子特征 | SCNECC癌灶和正常邻近宫颈组织样本 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序,western blotting,免疫组织化学染色 | NA | 单细胞RNA测序数据,蛋白质印迹数据,免疫组化数据 | 6个单细胞测序样本(68,455个高质量细胞),66例患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 615 | 2025-10-07 |
IL-23 Promotes γδT Cell Activity in Dry Eye Disease Progression
2025-Feb-03, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.2.10
PMID:39903182
|
研究论文 | 本研究探讨了IL-23通过促进γδT细胞活性在干眼病进展中的作用机制 | 首次发现结膜IL-23表达通过与其受体IL-23R相互作用调控γδT细胞增殖,从而介导干眼病炎症反应 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 阐明IL-23在干眼病发病机制中对γδT细胞的调控作用 | 小鼠结膜γδT细胞、人类γδT细胞、干眼病患者眼表细胞 | 免疫学 | 干眼病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 转录组测序 | NA | 基因表达数据, 细胞计数数据 | 野生型和γδT缺陷型小鼠模型,视觉显示终端综合征患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 616 | 2025-10-07 |
Single-Cell Sequencing Reveals Heterogeneity and Interactions Between Epithelial Cells and Fibroblasts in Post-ESD Oesophageal Stricture
2025-Feb, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70411
PMID:39910700
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析食管狭窄组织的细胞异质性和细胞间相互作用 | 首次在单细胞水平揭示食管ESD术后狭窄组织中上皮细胞与成纤维细胞的异质性及其相互作用机制 | 样本量有限,未能进行功能验证实验 | 探究食管ESD术后狭窄形成的分子机制 | 食管狭窄组织和正常对照组织 | 单细胞测序分析 | 食管狭窄 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 食管狭窄样本和正常对照样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 617 | 2025-10-07 |
Kindlin-2-mediated hematopoiesis remodeling regulates triple-negative breast cancer immune evasion
2025-Feb-07, Molecular cancer research : MCR
IF:4.1Q2
DOI:10.1158/1541-7786.MCR-24-0698
PMID:39918417
|
研究论文 | 本研究揭示Kindlin-2通过重塑造血过程和调节PD-L1表达促进三阴性乳腺癌免疫逃逸的机制 | 首次发现Kindlin-2通过系统性调控造血过程影响肿瘤免疫微环境,并证实其与PD-L1表达的相关性 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 探究Kindlin-2在三阴性乳腺癌免疫逃逸中的作用机制 | 三阴性乳腺癌肿瘤模型和小鼠造血系统 | 肿瘤免疫学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq, 免疫组织化学 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 组织切片图像 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 618 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics reveals novel chondrocyte and osteoblast subtypes and their role in knee osteoarthritis pathogenesis
2025-Feb-05, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02136-8
PMID:39904988
|
研究论文 | 通过单细胞转录组技术揭示膝骨关节炎中新型软骨细胞和成骨细胞亚型及其在疾病进展中的作用机制 | 首次鉴定出三种新型软骨细胞亚型(Smoc2血管生成软骨细胞、Angptl7血管生成软骨细胞和Col1a1成骨软骨细胞),并阐明Angptl7软骨细胞通过FGF2-FGFR2信号通路促进血管生成的机制 | 研究基于双足绝经后小鼠模型,结果向人类临床应用的转化需要进一步验证 | 探究膝骨关节炎发病机制中软骨下骨重塑与软骨退变之间的相互作用 | 膝骨关节炎小鼠模型的骨软骨复合组织 | 单细胞转录组学 | 膝骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 双足绝经后膝骨关节炎小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 619 | 2025-10-07 |
A novel protein encoded by porcine circANKRD17 activates the PPAR pathway to regulate intramuscular fat metabolism
2025-Feb-05, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-025-01153-5
PMID:39905551
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析发现circANKRD17编码的新型蛋白可通过PPAR通路调控猪肌肉脂肪代谢 | 首次发现circANKRD17具有编码能力并能产生新型571氨基酸蛋白,揭示了环状RNA通过编码蛋白调控脂质代谢的新机制 | 研究主要聚焦于circANKRD17,其他具有编码潜力的环状RNA功能尚未深入探索 | 探索环状RNA在脂质代谢中的调控机制 | 兰塘猪和长白猪的背最长肌组织及IMF细胞 | 生物信息学 | NA | circRNA-seq, Ribo-seq, 单细胞测序, 脂质组学分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据 | 未明确样本数量,涉及两个猪品种的比较研究 | NA | 环状RNA测序, 核糖体测序, 单细胞测序 | NA | NA |
| 620 | 2025-10-07 |
A model-based factorization method for scRNA data unveils bifurcating transcriptional modules underlying cell fate determination
2025-Feb-05, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.97424
PMID:39907554
|
研究论文 | 本文提出了一种基于模型的单细胞RNA数据分解方法MGPfact,能够将复杂的发育轨迹分解为基因集的独立分叉过程 | 开发了能够将复杂发育轨迹分解为独立分叉过程的模型框架,支持基于相关特征的轨迹推断 | NA | 开发单细胞RNA测序数据的流形学习框架,解析细胞命运决定的生物学过程 | 单细胞RNA测序数据,包括小胶质细胞发育和肿瘤相关CD8 T细胞 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 基于模型的流形学习框架 | 单细胞RNA测序数据 | 239个数据集 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |