单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 658 篇文献，本页显示第 601 - 620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 601 | 2025-02-12 |
Cardiac Reprogramming and Gata4 Overexpression Reduce Fibrosis and Improve Diastolic Dysfunction in Heart Failure With Preserved Ejection Fraction
2025-Feb-11, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本文研究了心脏重编程和Gata4过表达在保留射血分数心力衰竭（HFpEF）中减少纤维化和改善舒张功能的效果 | 首次在HFpEF模型中验证了心脏重编程和Gata4过表达的治疗效果，并揭示了其通过抑制心脏成纤维细胞（CFs）激活来减少纤维化的机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类CFs的效果仍需进一步验证 | 探讨心脏重编程和Gata4过表达在HFpEF中的治疗效果及其机制 | Tcf21iCre/Tomato/MGTH2A转基因小鼠和人类心脏成纤维细胞 | 心血管疾病 | 心力衰竭 | RNA测序（RNA-seq），单细胞RNA测序（scRNA-seq），空间转录组学 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据 | 转基因小鼠和人类心脏成纤维细胞 |
| 602 | 2025-02-12 |
Highly efficient combination of multiple single cells using a deterministic single-cell combinatorial reactor
2025-Feb-11, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d4lc00951g
PMID:39679936
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研究论文 | 本文介绍了一种新型微流控设备，结合多层互连Si/SiO控制电路，用于高效组合多个单细胞 | 引入了确定性单细胞组合反应器（DSCR）设备，通过局部电场实现单细胞的高效捕获和组合 | NA | 实现多个单细胞的高效组合，以促进单细胞转录组分析和细胞间相互作用的研究 | PC3细胞 | 微流控技术 | NA | 微流控技术 | NA | 细胞图像 | 三组不同荧光染料标记的PC3细胞 |
| 603 | 2025-02-12 |
Exploring Parkinson's through the Lens of Genomics and Bioinformatics
2025-Feb-10, Cold Spring Harbor perspectives in medicine
IF:7.8Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a041621
PMID:39929729
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研究论文 | 本文探讨了基因组学和生物信息学在帕金森病研究中的应用，旨在揭示该疾病的分子机制并寻找新的治疗靶点 | 应用单细胞转录组学技术揭示了帕金森病中细胞类型特异性的失调和脆弱性，超越了多巴胺能神经元的损失 | 未具体提及研究的局限性 | 通过基因组学和生物信息学技术解析帕金森病的分子机制，寻找新的治疗靶点 | 帕金森病的遗传和分子机制 | 生物信息学 | 帕金森病 | 基因分型、基因组测序、转录组学、单细胞转录组学 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 大规模人类群体或模式生物 |
| 604 | 2025-02-12 |
uN2CpolyG-mediated p65 nuclear sequestration suppresses the NF-κB-NLRP3 pathway in neuronal intranuclear inclusion disease
2025-Feb-07, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02079-1
PMID:39920690
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研究论文 | 本研究揭示了uN2CpolyG通过与p65直接相互作用并隔离p65，抑制NF-κB-NLRP3通路并损害自噬的分子机制 | 首次揭示了uN2CpolyG通过隔离p65抑制NF-κB-NLRP3通路的分子机制，为NIID提供了新的治疗靶点 | 研究主要基于细胞模型和果蝇模型，尚未在人体中进行验证 | 阐明uN2CpolyG与NF-κB-NLRP3通路之间的分子相互作用 | NIID患者的皮肤组织、HEK-293T和U87-MG细胞模型、果蝇模型 | 分子生物学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | 细胞模型、果蝇模型 | 基因表达数据 | NIID患者的皮肤组织、HEK-293T和U87-MG细胞、果蝇模型 |
| 605 | 2025-02-12 |
The Role of Jianpi Jiedu Recipe in Modulating the CRC Microenvironment
2025-Feb-07, Combinatorial chemistry & high throughput screening
IF:1.6Q3
|
研究论文 | 本研究探讨了健脾解毒方（JPJDR）在调节结直肠癌（CRC）微环境中的作用及其机制 | 首次系统性地研究了JPJDR在CRC微环境中的调节作用，并发现其通过下调HMGB1和MT2A基因表达来调节CRC微环境 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据和体外实验，缺乏体内实验验证 | 探讨JPJDR在CRC治疗中的抗肿瘤机制 | 结直肠癌（CRC）微环境中的细胞类型，包括恶性CRC细胞、免疫细胞和基质细胞 | 数字病理 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、RT-qPCR | NA | RNA测序数据 | 多个已发表研究中的单细胞RNA测序数据（PMID: 32451460, 32103181, 32561858） |
| 606 | 2025-02-12 |
Gene Expression Variations Induced by Sevoflurane in Glia and Glioma Cells and the Role of EPHA3 in Sevoflurane's Anti-Glioma Effect
2025-Feb-07, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究通过分析七氟醚处理的单细胞转录组数据，揭示了七氟醚通过免疫炎症反应、神经元分化和血脑屏障维持等信号通路产生麻醉效应，并发现EPHA3基因在七氟醚抗胶质瘤效应中的关键作用 | 首次揭示了七氟醚通过影响DAAM2和EPHA3等基因表达来影响胶质瘤患者生存率，并发现EPHA3在七氟醚抑制胶质瘤细胞侵袭和迁移中的关键作用 | 研究主要基于体外实验和生物信息学分析，缺乏临床验证 | 探讨七氟醚对神经系统疾病（如胶质瘤）影响的分子机制 | 胶质细胞和胶质瘤细胞 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 607 | 2025-02-11 |
Exploring Origin-Dependent Susceptibility of Smooth Muscle Cells to Aortic Diseases Through Intersectional Genetics
2025-Feb-10, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本文通过开发一种先进的双重组酶介导的交集遗传系统，研究不同发育起源的平滑肌细胞对主动脉疾病的易感性 | 开发了一种新的双重组酶介导的交集遗传系统，能够精确靶向不同发育起源的平滑肌细胞，并结合单细胞RNA测序技术研究TGF-β信号在不同主动脉段的影响 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 探索不同发育起源的平滑肌细胞对主动脉疾病的易感性，并研究其机制 | 小鼠的平滑肌细胞 | 遗传学 | 主动脉疾病 | 双重组酶介导的交集遗传系统，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 |
| 608 | 2025-02-11 |
Key Considerations on CITE-Seq for Single-Cell Multiomics
2025-Feb-09, Proteomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/pmic.202400011
PMID:39924789
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综述 | 本文综述了CITE-Seq技术，一种同时分析单个细胞中基因表达和蛋白质丰度的先进单细胞测序方法 | 本文详细介绍了CITE-Seq的工作流程，并提供了使用抗体衍生标签（ADTs）染色细胞的关键考虑因素 | 本文主要基于微孔单细胞分析系统，可能不涵盖所有CITE-Seq应用场景 | 探讨CITE-Seq技术在单细胞多组学分析中的应用 | 单个细胞中的基因表达和蛋白质丰度 | 单细胞测序 | NA | CITE-Seq, 单细胞mRNA测序, 抗体衍生标签（ADTs） | NA | 基因表达数据, 蛋白质丰度数据 | NA |
| 609 | 2025-02-11 |
Integration of single-cell and bulk RNA-sequencing data to construct and validate a signature based on NK cell marker genes to predict immunotherapy response and prognosis in colorectal cancer
2025-Feb-07, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01842-7
PMID:39920524
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研究论文 | 本研究旨在构建基于NK细胞标记基因的签名，以预测结直肠癌患者的免疫治疗反应和预后 | 通过整合单细胞RNA测序数据和TCGA结直肠癌样本的WGCNA分析，识别出NK细胞相关的核心基因和特征基因，并构建了一个新的预后签名 | 研究依赖于公开数据集，可能受到数据质量和样本选择的限制 | 预测结直肠癌患者的免疫治疗反应和预后 | 结直肠癌患者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），加权基因共表达网络分析（WGCNA） | LASSO回归分析 | RNA测序数据 | 587个TCGA结直肠癌样本，124和201个GEO验证样本 |
| 610 | 2025-02-11 |
MiR-18a-LncRNA NONRATG-022419 pairs targeted PRG-1 regulates diabetic induced cognitive impairment by regulating NGF\BDNF-Trkb signaling pathway
2025-Feb-06, Proteome science
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12953-025-00239-2
PMID:39915794
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研究论文 | 本研究探讨了糖尿病诱导的认知功能障碍（DCD）中PRG-1的分子机制和细胞异质性，以及其在突触可塑性调节中的作用 | 揭示了PRG-1通过NGF/BDNF-Trkb信号通路在DCD中的突触可塑性调节作用，并发现了miR-18a-LncRNA NONRATG-022419对PRG-1的靶向调控 | 研究主要基于体外高糖诱导的HT22细胞损伤模型，尚未在体内模型中验证 | 探讨糖尿病诱导的认知功能障碍（DCD）的分子机制和细胞异质性，以及PRG-1在该过程中的功能作用 | 海马细胞、HT22细胞 | 分子生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、RNA转录组分析 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 611 | 2025-02-11 |
Retinoic acid antagonizes estrogen signaling to maintain adult uterine cell fate
2025-Feb-04, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2416089122
PMID:39874292
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研究论文 | 本研究通过遗传学证据揭示了视黄酸（RA）和雌激素信号在维持成年小鼠子宫上皮细胞命运中的拮抗作用 | 首次提供了RA和雌激素信号在维持成年子宫上皮细胞命运中拮抗作用的遗传学证据，并揭示了RA信号缺失导致的细胞命运转变和免疫细胞浸润 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 探讨RA和雌激素信号在维持成年子宫上皮细胞命运中的作用 | 小鼠子宫上皮细胞 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三种相关小鼠遗传模型 |
| 612 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of human blood eosinophils reveals plasticity and absence of canonical cell subsets
2025-Feb, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.16213
PMID:38934897
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 613 | 2025-02-09 |
Massively parallel flow-cytometry-based screening of hematopoietic lineage cell populations from up to 25 donors simultaneously
2025-Feb, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2024.11.014
PMID:39608688
|
研究论文 | 本研究旨在开发一种方法，允许对造血来源细胞表面标记进行高维度和技术统一的筛选 | 该方法能够在技术上统一的方式下筛选数百万细胞上的数百个标记，从而识别和表征稀有细胞群体的变化 | 虽然该方法能够处理大量细胞，但对于极低丰度的细胞群体，仍可能遗漏某些调控异常 | 开发一种高维度且技术统一的细胞表面标记筛选方法，以识别和表征稀有细胞群体的变化 | 造血来源的细胞群体 | 生物信息学 | NA | 流式细胞术、单细胞RNA测序（RNAseq） | 机器学习算法 | 细胞表面标记数据 | 25个供体的细胞样本 |
| 614 | 2025-02-08 |
A novel protein encoded by porcine circANKRD17 activates the PPAR pathway to regulate intramuscular fat metabolism
2025-Feb-05, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-025-01153-5
PMID:39905551
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研究论文 | 本研究通过circRNA-seq和Ribo-seq数据筛选出具有编码潜力的circRNA候选物，发现circANKRD17在Lantang猪的长背肌中显著升高，并通过单细胞测序和脂质组学分析揭示了其在脂质代谢中的调控机制 | 首次发现circANKRD17具有开放阅读框并能翻译成一种新型571氨基酸蛋白质，该蛋白质通过PPAR途径调控脂质代谢 | 研究主要集中于Lantang和Landrace猪品种，未涉及其他猪品种或物种 | 探索circRNA在脂质代谢中的调控机制，特别是与肌肉内脂肪含量相关的代谢特性 | Lantang和Landrace猪的长背肌细胞 | 分子生物学 | NA | circRNA-seq, Ribo-seq, 单细胞测序, 脂质组学分析 | NA | RNA序列数据, 单细胞数据, 脂质组数据 | 18个circRNA候选物, 477个差异表达基因 |
| 615 | 2025-02-08 |
Early downmodulation of tumor glycolysis predicts response to fasting-mimicking diet in triple-negative breast cancer patients
2025-Feb-04, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2024.11.004
PMID:39694040
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研究论文 | 本研究探讨了周期性模拟禁食饮食（FMD）在三阴性乳腺癌（TNBC）患者中的抗肿瘤活性和疗效，特别是在与术前化疗结合使用时 | 首次在早期TNBC患者中展示了严重热量限制的周期性FMD与术前化疗结合使用的高病理完全缓解率（pCR）和长期临床结果 | 研究样本量较小（30名患者），需要更大规模的临床试验来验证结果 | 评估周期性FMD在早期TNBC患者中的疗效，并验证肿瘤内糖酵解的早期变化作为营养限制临床益处的预测因子 | 早期三阴性乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 30名早期TNBC患者 |
| 616 | 2025-02-08 |
CD4+ Effector Memory T Cells Related Marker Gene Signatures in Osteoporosis and Aging: Insight From Single-Cell Analysis and Mendelian Randomization
2025-Feb-04, Combinatorial chemistry & high throughput screening
IF:1.6Q3
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析和孟德尔随机化方法，探讨了骨质疏松症（OP）与衰老之间的关系及其共享的分子机制 | 首次通过单细胞数据整合和孟德尔随机化分析，识别出CD4+效应记忆T细胞（CD4+ TEM）在OP和衰老样本中的核心作用，并揭示了KLRB1、NR4A2和S100A4基因与OP的因果关系 | 研究主要基于单细胞数据和动物模型，仍需进一步临床验证 | 探讨骨质疏松症与衰老之间的关系及其分子机制 | 骨质疏松症患者、衰老个体和健康对照者的外周血单细胞数据 | 生物信息学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、孟德尔随机化（MR）、RT-qPCR | NA | 单细胞RNA测序数据 | 骨质疏松症患者、衰老个体和健康对照者的外周血样本 |
| 617 | 2025-02-07 |
Loss of 18q Alters TGFβ Signalling Affecting Anteroposterior Neuroectodermal Fate in Human Embryonic Stem Cells
2025-Feb-05, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13813
PMID:39908990
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研究论文 | 本文研究了染色体18q缺失如何影响人类胚胎干细胞（hESCs）向视网膜祖细胞分化的能力，并探讨了TGFβ信号通路在此过程中的作用 | 首次揭示了18q缺失通过影响TGFβ信号通路，导致hESCs在前后神经外胚层命运决定中的异常 | 研究仅限于实验室条件下的hESCs，未涉及体内环境或临床样本 | 探究染色体异常对hESCs分化能力的影响，特别是18q缺失对神经外胚层命运决定的作用 | 人类胚胎干细胞（hESCs） | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具有复杂核型的hESCs细胞系 |
| 618 | 2025-02-07 |
SCovid v2.0: a comprehensive resource to decipher the molecular characteristics across tissues in COVID-19 and other human coronaviruses
2025-Feb-04, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.01933-24
PMID:39714149
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研究论文 | SCovid v2.0是一个更新的数据库，旨在通过转录组测序帮助研究人员揭示2019冠状病毒病（COVID-19）在不同组织中的分子特征 | SCovid v2.0相较于其前身，增加了全面的数据、实用的功能，并重建了分析流程，包括更多的单细胞RNA测序数据和批量RNA测序数据，以及与其他人类冠状病毒的比较分析 | NA | 揭示COVID-19在不同组织中的分子特征，并进行与其他人类冠状病毒的比较分析 | COVID-19及其他人类冠状病毒的分子特征 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量RNA测序（bulk RNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 3,544,360个细胞来自45个单细胞RNA测序数据集，涵盖15个组织的789个样本；1,688个样本来自12个组织的62个COVID-19批量RNA测序数据；7个与其他人类冠状病毒相关的批量RNA测序数据集 |
| 619 | 2025-02-07 |
Development of a prognostic model based on four genes related to exhausted CD8+ T cell in triple-negative breast cancer patients: a comprehensive analysis integrating scRNA-seq and bulk RNA-seq
2025-Feb-03, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01812-z
PMID:39899181
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研究论文 | 本研究旨在开发基于与耗竭CD8+ T细胞相关的四个基因的三阴性乳腺癌（TNBC）预后模型，并探讨其临床和免疫相关性 | 通过整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（bulk RNA-seq）数据，筛选出与TNBC患者生存显著相关的四个基因，构建了一个新的预后模型 | 研究主要依赖于公开数据集，缺乏独立的外部验证队列 | 开发一个基于耗竭CD8+ T细胞相关基因的TNBC预后模型，并评估其临床和免疫相关性 | 三阴性乳腺癌（TNBC）患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（bulk RNA-seq） | 预后模型 | RNA测序数据 | TCGA队列和外部队列的TNBC患者数据 |
| 620 | 2025-02-07 |
EMT-driven plasticity prospectively increases cell-cell variability to promote therapeutic adaptation in breast cancer
2025-Feb-03, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03637-w
PMID:39901189
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研究论文 | 本文研究了上皮-间质转化（EMT）驱动的细胞可塑性在三阴性乳腺癌（TNBC）治疗适应中的作用 | 首次揭示了EMT驱动的可塑性如何增加细胞间表型多样性，并在化疗前产生罕见的预适应状态 | 研究仅基于体外模型，未涉及体内环境 | 探讨EMT驱动的可塑性在TNBC治疗适应中的作用 | 三阴性乳腺癌（TNBC）细胞 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 两个TNBC体外模型 |