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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 601 | 2025-10-07 |
MiR-18a-LncRNA NONRATG-022419 pairs targeted PRG-1 regulates diabetic induced cognitive impairment by regulating NGF\BDNF-Trkb signaling pathway
2025-Feb-06, Proteome science
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12953-025-00239-2
PMID:39915794
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和转录组分析揭示了PRG-1通过NGF/BDNF-Trkb信号通路调控糖尿病认知功能障碍的分子机制 | 首次发现miR-18a-LncRNA NONRATG-022419对靶向调控PRG-1在糖尿病认知障碍中的作用机制 | 研究主要基于体外HT22细胞模型,需要进一步在体实验验证 | 探究PRG-1在糖尿病诱导认知功能障碍中的分子机制和细胞异质性 | 海马体细胞、HT22细胞系、I型螺旋神经节神经元 | 单细胞测序分析 | 糖尿病认知功能障碍 | 单细胞RNA测序, RNA转录组分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 602 | 2025-10-07 |
Phospho-seq: integrated, multi-modal profiling of intracellular protein dynamics in single cells
2025-Feb-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56590-7
PMID:39905064
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研究论文 | 开发了一种名为Phospho-seq的集成方法,用于在单细胞水平同时分析细胞质和核蛋白及其翻译后修饰 | 提出简化的台式抗体偶联方法创建大型定制神经聚焦抗体面板,实现蛋白质与scATAC-seq的同时分析 | NA | 开发能够量化细胞内蛋白质动态并与顺式调控元件和转录靶标连接的多模态单细胞分析技术 | 细胞系、诱导多能干细胞、数月龄视网膜和脑类器官 | 单细胞多组学 | 神经发育疾病 | 单细胞ATAC-seq, 转录组测量, 抗体偶联 | NA | 蛋白质组, 表观基因组, 转录组 | NA | NA | 单细胞ATAC-seq, 多组学分析 | NA | NA |
| 603 | 2025-10-07 |
Expression of Osteopontin in M2 and M4 Intrinsically Photosensitive Retinal Ganglion Cells in the Mouse Retina
2025-Feb-03, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.2.14
PMID:39908128
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫组织化学方法揭示了骨桥蛋白在小鼠视网膜M2和M4型内在光敏视网膜神经节细胞中的表达模式 | 首次发现骨桥蛋白不仅表达于M4-ipRGCs,还在M2-ipRGCs中表达,挑战了骨桥蛋白仅作为αRGCs特异性标志物的传统认知 | 研究仅针对C57BL/6J小鼠视网膜,尚未在其他物种或病理条件下验证 | 表征骨桥蛋白在ipRGCs各亚型中的表达模式 | 小鼠视网膜中的内在光敏视网膜神经节细胞(ipRGCs) | 神经科学 | 视神经损伤 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 神经突追踪 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | C57BL/6J小鼠视网膜样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 604 | 2025-10-07 |
Identifying novel therapeutic targets in cystic fibrosis through advanced single-cell transcriptomics analysis
2025-Feb-07, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.109748
PMID:39921941
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研究论文 | 通过先进单细胞转录组学分析识别囊性纤维化新型治疗靶点 | 采用增强分析方法整合多源数据,发现与CF气道疾病相关的新基因和调控网络 | 未明确说明样本规模和技术平台的具体限制 | 深入理解囊性纤维化相关基因表达机制,识别新型治疗靶点 | 囊性纤维化患者和健康对照者的肺部细胞 | 单细胞转录组学 | 囊性纤维化 | 单细胞转录组测序 | 共表达网络分析 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 605 | 2025-02-09 |
Unveiling heterogeneity in rare cells by combining RNA-based sorting and scRNA-seq
2025-Feb-07, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-02073-2
PMID:39920268
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 606 | 2025-10-07 |
Single-cell analysis reveals cellular heterogeneity, gene expression profiles, and pathway dynamics in acne vulgaris
2025-Feb-07, Archives of dermatological research
IF:1.8Q3
DOI:10.1007/s00403-025-03894-9
PMID:39920471
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析痤疮皮损组织的细胞异质性、基因表达谱和通路动态 | 首次在单细胞水平揭示痤疮皮损组织的细胞异质性、异常细胞间通讯和代谢通路改变 | 样本量较小(仅6例患者),数据来源于公共数据库 | 探索痤疮发病的细胞和分子机制 | 痤疮患者的皮损和非皮损皮肤组织 | 单细胞组学 | 痤疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6例痤疮患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 607 | 2025-10-07 |
Exploring molecular disparities of H-type vasculature endothelial cells in osteonecrosis of the femoral head through single-cell analysis
2025-Feb-06, BMC musculoskeletal disorders
IF:2.2Q3
DOI:10.1186/s12891-024-08267-3
PMID:39910554
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析股骨头坏死中H型血管内皮细胞的分子差异 | 首次在单细胞水平揭示ONFH中H型血管内皮细胞的分子特征及铁死亡和parthanatos死亡模式的作用 | 样本量较小(仅9个样本),数据为公开数据的重新分析 | 探索股骨头坏死中H型血管内皮细胞的分子变化 | 股骨头样本中的H型血管内皮细胞 | 单细胞分析 | 股骨头坏死 | 单细胞RNA测序 | 细胞通讯分析 | 单细胞RNA测序数据 | 9个股骨头样本(3个HOA、3个ONFH 3A期、3个ONFH 4期) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 608 | 2025-10-07 |
Identification of mitochondrial carrier homolog 2 as an important therapeutic target of castration-resistant prostate cancer
2025-Feb-05, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07406-5
PMID:39910035
|
研究论文 | 本研究探讨线粒体载体同源物2在去势抵抗性前列腺癌中的表达及其功能作用 | 首次揭示MTCH2通过维持线粒体功能促进去势抵抗性前列腺癌进展的新机制 | 研究主要基于体外实验和动物模型,尚未在临床患者中进行验证 | 探索MTCH2作为去势抵抗性前列腺癌治疗靶点的潜力 | 去势抵抗性前列腺癌细胞系、原代CRPC细胞和裸鼠移植瘤模型 | 癌症生物学 | 前列腺癌 | 单细胞测序、shRNA基因沉默、CRISPR-sgRNA基因敲除 | NA | 基因表达数据、细胞功能数据、动物实验数据 | 多种原代人CRPC细胞系和裸鼠移植瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 609 | 2025-10-07 |
CoTF-reg reveals cooperative transcription factors in oligodendrocyte gene regulation using single-cell multi-omics
2025-Feb-05, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-07570-6
PMID:39910206
|
研究论文 | 开发了一个整合单细胞多组学数据的分析框架,用于识别少突胶质细胞中协同调控基因的转录因子对 | 提出了coTF-reg分析框架,首次整合scRNA-seq和scATAC-seq数据识别协同转录因子,并采用深度学习模型预测靶基因表达 | NA | 揭示少突胶质细胞中转录因子协同调控基因的机制 | 少突胶质细胞中的转录因子及其靶基因 | 生物信息学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, ChIP-seq, 深度学习 | 深度学习模型 | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 610 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals tumor heterogeneity in small cell neuroendocrine cervical carcinoma
2025-Feb-05, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-07605-y
PMID:39910262
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示小细胞神经内分泌宫颈癌的肿瘤异质性 | 首次绘制SCNECC的单细胞图谱,识别出四种上皮细胞亚型及其关键转录因子,发现两种不同的致癌途径 | 样本量较小(仅6个样本),需要更大规模验证 | 探索小细胞神经内分泌宫颈癌的肿瘤异质性和分子特征 | SCNECC癌灶和正常邻近宫颈组织样本 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序,western blotting,免疫组织化学染色 | NA | 单细胞RNA测序数据,蛋白质印迹数据,免疫组化数据 | 6个单细胞测序样本(68,455个高质量细胞),66例患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 611 | 2025-10-07 |
IL-23 Promotes γδT Cell Activity in Dry Eye Disease Progression
2025-Feb-03, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.2.10
PMID:39903182
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研究论文 | 本研究探讨了IL-23通过促进γδT细胞活性在干眼病进展中的作用机制 | 首次发现结膜IL-23表达通过与其受体IL-23R相互作用调控γδT细胞增殖,从而介导干眼病炎症反应 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 阐明IL-23在干眼病发病机制中对γδT细胞的调控作用 | 小鼠结膜γδT细胞、人类γδT细胞、干眼病患者眼表细胞 | 免疫学 | 干眼病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 转录组测序 | NA | 基因表达数据, 细胞计数数据 | 野生型和γδT缺陷型小鼠模型,视觉显示终端综合征患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 612 | 2025-10-07 |
Single-Cell Sequencing Reveals Heterogeneity and Interactions Between Epithelial Cells and Fibroblasts in Post-ESD Oesophageal Stricture
2025-Feb, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70411
PMID:39910700
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析食管狭窄组织的细胞异质性和细胞间相互作用 | 首次在单细胞水平揭示食管ESD术后狭窄组织中上皮细胞与成纤维细胞的异质性及其相互作用机制 | 样本量有限,未能进行功能验证实验 | 探究食管ESD术后狭窄形成的分子机制 | 食管狭窄组织和正常对照组织 | 单细胞测序分析 | 食管狭窄 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 食管狭窄样本和正常对照样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 613 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics reveals novel chondrocyte and osteoblast subtypes and their role in knee osteoarthritis pathogenesis
2025-Feb-05, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02136-8
PMID:39904988
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研究论文 | 通过单细胞转录组技术揭示膝骨关节炎中新型软骨细胞和成骨细胞亚型及其在疾病进展中的作用机制 | 首次鉴定出三种新型软骨细胞亚型(Smoc2血管生成软骨细胞、Angptl7血管生成软骨细胞和Col1a1成骨软骨细胞),并阐明Angptl7软骨细胞通过FGF2-FGFR2信号通路促进血管生成的机制 | 研究基于双足绝经后小鼠模型,结果向人类临床应用的转化需要进一步验证 | 探究膝骨关节炎发病机制中软骨下骨重塑与软骨退变之间的相互作用 | 膝骨关节炎小鼠模型的骨软骨复合组织 | 单细胞转录组学 | 膝骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 双足绝经后膝骨关节炎小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 614 | 2025-10-07 |
A novel protein encoded by porcine circANKRD17 activates the PPAR pathway to regulate intramuscular fat metabolism
2025-Feb-05, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-025-01153-5
PMID:39905551
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析发现circANKRD17编码的新型蛋白可通过PPAR通路调控猪肌肉脂肪代谢 | 首次发现circANKRD17具有编码能力并能产生新型571氨基酸蛋白,揭示了环状RNA通过编码蛋白调控脂质代谢的新机制 | 研究主要聚焦于circANKRD17,其他具有编码潜力的环状RNA功能尚未深入探索 | 探索环状RNA在脂质代谢中的调控机制 | 兰塘猪和长白猪的背最长肌组织及IMF细胞 | 生物信息学 | NA | circRNA-seq, Ribo-seq, 单细胞测序, 脂质组学分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据 | 未明确样本数量,涉及两个猪品种的比较研究 | NA | 环状RNA测序, 核糖体测序, 单细胞测序 | NA | NA |
| 615 | 2025-10-07 |
A model-based factorization method for scRNA data unveils bifurcating transcriptional modules underlying cell fate determination
2025-Feb-05, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.97424
PMID:39907554
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研究论文 | 本文提出了一种基于模型的单细胞RNA数据分解方法MGPfact,能够将复杂的发育轨迹分解为基因集的独立分叉过程 | 开发了能够将复杂发育轨迹分解为独立分叉过程的模型框架,支持基于相关特征的轨迹推断 | NA | 开发单细胞RNA测序数据的流形学习框架,解析细胞命运决定的生物学过程 | 单细胞RNA测序数据,包括小胶质细胞发育和肿瘤相关CD8 T细胞 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 基于模型的流形学习框架 | 单细胞RNA测序数据 | 239个数据集 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 616 | 2025-10-07 |
Deterministic genetic barcoding for multiplexed behavioral and single-cell transcriptomic studies
2025-Feb-05, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.88334
PMID:39908076
|
研究论文 | 开发了一种名为TaG-EM的遗传条形码方法,用于在单细胞转录组研究中实现细胞类型的正确定位和多路复用分析 | 通过在Gal4诱导型构建体中插入DNA条形码,实现了体内特定细胞群体的标记,并能通过单细胞测序读取条形码信息 | 方法主要应用于果蝇模型,在其他生物系统中的适用性需要进一步验证 | 开发一种能够将解剖学信息与转录组数据关联的遗传条形码技术 | 果蝇特定细胞群体 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序,下一代测序 | NA | 单细胞转录组数据,DNA条形码序列 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 617 | 2025-10-07 |
Usp11 maintained the survival of marginal zone B cells under ionizing radiation by deubiquitinating DLL1 and JAG2
2025-Feb-04, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07377-7
PMID:39904982
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研究论文 | 本研究揭示Usp11通过去泛素化DLL1和JAG2维持边缘区B细胞在电离辐射下的存活 | 首次发现Usp11通过调控Notch配体DLL1和JAG2的泛素化水平来维持辐射后边缘区B细胞存活的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中验证 | 阐明Usp11在辐射诱导损伤中的作用及相关机制 | Usp11基因敲除小鼠和野生型小鼠的边缘区B细胞 | 免疫学 | 辐射损伤 | 单细胞测序,免疫荧光,免疫组化,流式细胞术,Co-IP,泛素化实验,ELISA | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞测序数据,流式数据,组织切片图像 | 未明确样本数量的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 618 | 2025-10-07 |
Single-cell profiling reveals a reduced epithelial defense system, decreased immune responses and the immune regulatory roles of different fibroblast subpopulations in chronic atrophic gastritis
2025-Feb-04, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06150-w
PMID:39905493
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示慢性萎缩性胃炎中上皮防御系统减弱、免疫反应下降及不同成纤维细胞亚群的免疫调节作用 | 首次在单细胞水平系统揭示CAG病变中上皮细胞防御功能减弱、免疫细胞功能下降及CXCL11+APOE+成纤维细胞的免疫调节作用 | 样本量较小(仅3例CAG活检样本),需要更大样本验证发现 | 阐明慢性萎缩性胃炎发生的分子机制和细胞变化 | 慢性萎缩性胃炎患者活检组织及配对正常组织 | 单细胞转录组学 | 慢性萎缩性胃炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3例CAG活检样本及配对正常组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 619 | 2025-10-07 |
CD4+ Effector Memory T Cells Related Marker Gene Signatures in Osteoporosis and Aging: Insight From Single-Cell Analysis and Mendelian Randomization
2025-Feb-04, Combinatorial chemistry & high throughput screening
IF:1.6Q3
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研究论文 | 通过单细胞分析和孟德尔随机化研究骨质疏松与衰老的关联机制 | 首次整合单细胞数据和孟德尔随机化方法,识别CD4+效应记忆T细胞作为骨质疏松与衰老的核心细胞亚群,并发现三个关键基因的因果关联 | 样本量有限,动物模型验证仍需进一步扩展 | 探究骨质疏松与衰老之间的关联及共享分子机制 | 骨质疏松患者、衰老个体和健康对照的外周血样本,以及大鼠骨质疏松模型 | 单细胞分析 | 骨质疏松 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, RT-qPCR | NA | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据 | 骨质疏松患者、衰老个体和健康对照的外周血单细胞数据,大鼠骨质疏松模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 620 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of human blood eosinophils reveals plasticity and absence of canonical cell subsets
2025-Feb, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.16213
PMID:38934897
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |