单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 658 篇文献，本页显示第 581 - 600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 581 | 2025-02-14 |
Single-cell pseudotime and intercellular communication analysis reveals heterogeneity and immune microenvironment in oral cancer
2025-Feb-10, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01918-4
PMID:39928204
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序、伪时间分析和细胞间通讯分析，揭示了口腔癌的异质性和免疫微环境 | 首次使用单细胞分析技术揭示口腔癌肿瘤微环境中的细胞间通讯复杂性，提供了新的视角 | NA | 研究口腔癌的异质性和免疫微环境，探索其在肿瘤进展和免疫反应中的作用 | 口腔癌细胞及其微环境 | 数字病理学 | 口腔癌 | 单细胞RNA测序 | PCA, UMAP, t-SNE | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 582 | 2025-02-14 |
Neonatal sevoflurane exposures inhibits DHHC5-mediated palmitoylation of TfR1 in oligodendrocytes, leading to hypomyelination and neurological impairments
2025-Feb-08, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.02.009
PMID:39929269
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研究论文 | 本研究探讨了新生儿麻醉暴露如何通过抑制DHHC5介导的TfR1棕榈酰化，导致少突胶质细胞中的铁积累和铁死亡，进而引起髓鞘形成不足和神经功能损伤 | 首次揭示了DHHC5在少突胶质细胞中的关键作用，阐明了TfR1相关铁死亡在新生儿麻醉相关神经毒性中的核心机制，并提出了DHHC5作为潜在治疗靶点的新视角 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证 | 阐明铁稳态，特别是转铁蛋白受体1（TfR1）在新生儿麻醉易感性中的潜在作用和机制 | 少突胶质细胞和神经元 | 神经科学 | 新生儿麻醉相关神经损伤 | 共免疫沉淀实验、酰基树脂辅助捕获实验、单细胞RNA测序 | Pdgfrα-CreERT小鼠模型 | 基因表达数据、行为测试数据 | 从出生后第6天到第8天的小鼠 |
| 583 | 2025-02-14 |
Multiplexing cortical brain organoids for the longitudinal dissection of developmental traits at single-cell resolution
2025-Feb, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02555-5
PMID:39653820
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研究论文 | 本文开发并验证了多重化大脑类器官的策略，用于高分辨率解析神经发育轨迹，并链接特定个体的轨迹与遗传变异 | 开发了新的计算方法和多重化策略，包括SCanSNP和共识调用，以解决双细胞和低质量细胞识别的关键问题 | NA | 为大脑疾病和神经多样性建模提供高度可扩展的资源 | 大脑类器官 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | SCanSNP | 单细胞RNA测序数据 | 多个多能干细胞（PSC）系 |
| 584 | 2025-02-14 |
iFlpMosaics enable the multispectral barcoding and high-throughput comparative analysis of mutant and wild-type cells
2025-Feb, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02534-w
PMID:39672980
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研究论文 | 本文介绍了一种名为iFlpMosaics的工具包，用于在相同时间窗口和组织微环境中对多种荧光标记的野生型和Cre突变细胞进行重组酶依赖的比例诱导和单细胞克隆追踪 | iFlpMosaics工具包提供了新的遗传工具和小鼠品系，能够在相同时间窗口和组织微环境中对多种荧光标记的野生型和Cre突变细胞进行重组酶依赖的比例诱导和单细胞克隆追踪 | 当前技术在小鼠中诱导遗传嵌合体时缺乏准确性、通量或条形码多样性 | 研究基因功能及其在组织发育、稳态和疾病中对单个细胞生物学的影响 | 野生型和Cre突变细胞 | 生物医学 | NA | 多光谱成像、荧光激活流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 图像、RNA测序数据 | NA |
| 585 | 2025-02-09 |
Unveiling heterogeneity in rare cells by combining RNA-based sorting and scRNA-seq
2025-Feb, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-02073-2
PMID:39920268
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 586 | 2025-02-13 |
A single-cell transcriptome analysis reveals astrocyte heterogeneity and identifies CHI3L1 as a diagnostic biomarker in Parkinson's disease
2025-Feb-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2025.e42051
PMID:39931480
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了帕金森病中星形胶质细胞的异质性，并发现CHI3L1可能作为帕金森病的诊断生物标志物 | 首次在单细胞水平上揭示了帕金森病中星形胶质细胞的异质性，并识别出CHI3L1作为潜在的诊断标志物 | 研究主要基于公开的GEO数据库数据，缺乏独立验证队列 | 识别帕金森病中星形胶质细胞的异质性并研究与其分化轨迹相关的基因 | 帕金森病患者和正常样本中的星形胶质细胞 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞转录组分析, qRT-PCR, Western Blot | Monocle2, AUCell | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量，但包括帕金森病患者和正常样本 |
| 587 | 2025-02-13 |
Integrative Multi-omics Analysis and Mendelian Randomization Reveal Potential Therapeutic Targets and their Stratification in Lung Squamous Cell Carcinoma
2025-Feb-06, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析和孟德尔随机化方法，识别了肺鳞状细胞癌（LUSC）的潜在治疗靶点，并对其进行了分层 | 结合了bulk RNA测序、WGCNA、生存分析、孟德尔随机化、LASSO回归、PPI网络分析、免疫浸润评估、单细胞RNA测序和伪时间分析等多种技术手段，全面探索了LUSC的治疗靶点 | 未提及具体样本量，可能影响结果的普适性 | 识别肺鳞状细胞癌（LUSC）的新型治疗靶点，以改善其治疗策略 | 肺鳞状细胞癌（LUSC） | 数字病理 | 肺癌 | bulk RNA测序、WGCNA、孟德尔随机化、LASSO回归、PPI网络分析、单细胞RNA测序、伪时间分析 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 588 | 2025-02-13 |
Integrative mapping of human CD8+ T cells in inflammation and cancer
2025-Feb, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02530-0
PMID:39614111
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scAtlasVAE的深度学习模型，用于整合大规模单细胞RNA测序数据并进行跨图谱比较，构建了一个广泛的人类CD8 T细胞图谱 | 开发了scAtlasVAE模型，能够整合大规模单细胞RNA测序数据，构建了包含1,151,678个细胞的人类CD8 T细胞图谱，揭示了不同细胞亚型之间的联系及其表型和功能转变 | NA | 研究人类CD8 T细胞在炎症和癌症中的克隆景观和动态变化 | 人类CD8 T细胞 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | VAE（变分自编码器） | 单细胞RNA测序数据 | 1,151,678个细胞，来自961个样本，涵盖68项研究和42种疾病条件 |
| 589 | 2024-12-01 |
Human CD8+ T cell map with single-cell transcriptome and TCR information
2025-Feb, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02529-7
PMID:39614112
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 590 | 2024-12-01 |
Publisher Correction: Massively parallel single-cell sequencing of diverse microbial populations
2025-Feb, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02570-6
PMID:39614113
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 591 | 2025-02-13 |
Capture of Totipotency in Mouse Embryonic Stem Cells in the Absence of Pdzk1
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202408852
PMID:39630006
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研究论文 | 本研究通过删除单个基因Pdzk1，在胚胎干细胞（ESCs）中建立了全能性 | 首次通过删除Pdzk1基因在胚胎干细胞中实现全能性，突破了胚胎和胚胎外组织之间的屏障 | 研究仅限于小鼠胚胎干细胞，尚未在人类细胞中验证 | 探索胚胎干细胞的全能性扩展及其分化潜能 | 小鼠胚胎干细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组分析，bulk RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | NA |
| 592 | 2025-02-13 |
SYISL Knockout Promotes Embryonic Muscle Development of Offspring by Modulating Maternal Gut Microbiota and Fetal Myogenic Cell Dynamics
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202410953
PMID:39680624
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研究论文 | 本研究探讨了SYISL基因敲除如何通过调节母体肠道微生物群和胎儿肌源性细胞动态来促进胚胎肌肉发育 | 揭示了SYISL基因敲除通过改变母体肠道微生物群组成和提高胚胎血清中的丁酸水平，进而通过丁酸-HDAC-H3K9ac/H3K27ac途径调节肌肉生成的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类或其他动物模型中进行验证 | 探讨SYISL基因敲除对胚胎肌肉发育的影响及其机制 | 小鼠胚胎 | 生物医学 | 肌肉疾病 | RNA-seq, ChIP-seq, scRNA-seq | 小鼠模型 | 基因表达数据, 表观遗传数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 593 | 2025-02-13 |
Mesenchymal Stem Cells Prevent SLC39A14-Dependent Hepatocyte Ferroptosis through Exosomal miR-16-5p in Liver Graft
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202411380
PMID:39680749
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研究论文 | 本文研究了间充质干细胞通过外泌体miR-16-5p预防肝移植中SLC39A14依赖的肝细胞铁死亡 | 首次发现SLC39A14在肝移植中的促铁死亡作用，并揭示了hBMSCs通过外泌体miR-16-5p下调SLC39A14表达的治疗机制 | 未提及具体样本量及实验设计的局限性 | 探究肝移植中肝细胞损伤的机制及间充质干细胞的治疗作用 | 肝移植中的肝细胞及人骨髓来源的间充质干细胞 | 生物医学 | 肝移植相关疾病 | 单细胞RNA测序分析 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 594 | 2025-02-13 |
Aberrant Chitinase 3-Like 1 Expression in Basal Cells Contributes to Systemic Sclerosis Fibrosis
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202310169
PMID:39686726
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了系统性硬化症（SSc）中基底细胞异常表达的几丁质酶3样1（Chi3L1）在纤维化过程中的作用，并探讨了其作为潜在生物标志物和治疗靶点的可能性 | 首次在SSc患者中识别出高表达Chi3L1的基底细胞亚群，并揭示了Chi3L1通过IL-17RA介导的纤维化机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，需要进一步在人体临床试验中验证Chi3L1和IL-17RA作为治疗靶点的有效性和安全性 | 探讨系统性硬化症纤维化的分子机制，并寻找潜在的治疗靶点 | 系统性硬化症患者的皮肤细胞和小鼠模型 | 生物医学研究 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | RNA测序数据 | SSc患者和健康对照的皮肤细胞样本 |
| 595 | 2025-02-12 |
Exploring the therapeutic efficacy difference in claudin18.2-targeted cell therapy revealed by single-cell sequencing
2025-Feb-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.111768
PMID:39925434
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术探索了CLDN18.2靶向细胞疗法的疗效差异 | 首次通过单细胞测序技术分析了CLDN18.2靶向CAR T细胞疗法在胃癌患者中的疗效差异，并发现了与疗效相关的关键因素 | 样本量较小，仅涉及5名患者，且仅分析了治疗后的3天和7天的数据 | 探索CLDN18.2靶向CAR T细胞疗法在胃癌患者中的疗效差异及其相关因素 | 接受CT041 CAR T细胞治疗的CLDN18.2阳性胃癌患者 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 5名患者的外周血和腹水样本 |
| 596 | 2025-02-12 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal pre-metastatic subsets and therapeutic targets in penile carcinoma
2025-Feb-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.111765
PMID:39925432
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学技术，揭示了阴茎癌中的预转移亚群及其治疗靶点 | 发现了MMP3+SPP1+预转移亚群和CK2α过表达，并验证了Silmitasertib作为潜在治疗药物的抗肿瘤效果 | 样本量相对较小，仅包括6个原发阴茎癌和6个转移淋巴结样本 | 研究阴茎癌中的肿瘤异质性及其预转移亚群，以优化治疗方案 | 阴茎癌的原发和转移样本 | 数字病理学 | 阴茎癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、细胞实验 | NA | RNA测序数据、空间转录组数据 | 6个原发阴茎癌样本、6个转移淋巴结样本、4个晚期阴茎癌样本、98个单细胞数据集、6个空间数据集 |
| 597 | 2025-02-12 |
PFKFB3 decreases α-ketoglutarate production while partial PFKFB3 knockdown in macrophages ameliorates arthritis in tumor necrosis factor-transgenic mice
2025-Feb-20, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114102
PMID:39870011
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研究论文 | 本研究探讨了PFKFB3在类风湿性关节炎（RA）患者巨噬细胞中的病理意义及其对巨噬细胞活化的调节作用 | 揭示了PFKFB3通过调节巨噬细胞活化和α-酮戊二酸产生在RA中的新机制 | 研究主要基于细胞和小鼠模型，尚未在人类中进行大规模验证 | 探讨PFKFB3在RA患者巨噬细胞中的作用及其对疾病发展的影响 | RA患者的PBMCs、THP-1细胞、条件性PFKFB3敲除小鼠的骨髓源性巨噬细胞 | 生物医学 | 类风湿性关节炎 | 共免疫沉淀、单细胞测序 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 细胞实验数据、基因表达数据 | RA患者PBMCs、THP-1细胞、条件性PFKFB3敲除小鼠 |
| 598 | 2025-02-12 |
m6A related metabolic genes in breast cancer and their relationship with prognosis
2025-Feb-20, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114121
PMID:39889412
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研究论文 | 本研究探讨了m6A相关代谢基因在乳腺癌中的作用及其与预后的关系 | 首次通过单细胞转录组数据分析乳腺癌患者外周血中的m6A相关代谢基因，并构建了乳腺癌风险模型 | 研究主要基于转录组数据，缺乏对蛋白质水平和功能实验的深入验证 | 探讨m6A相关代谢基因在乳腺癌中的调控作用及其对预后的影响 | 乳腺癌患者的外周血单细胞转录组数据和TCGA中的乳腺癌及对照转录组数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、RNA测序（RNA-seq）、实时定量PCR（qRT-PCR）、Western blot（WB） | Lasso-Cox回归模型 | 转录组数据 | 乳腺癌患者的外周血单细胞转录组数据和TCGA中的乳腺癌及对照转录组数据 |
| 599 | 2025-02-12 |
Dapagliflozin alleviated seizures and cognition impairment in pilocarpine induced status epilepticus via suppressing microglia-mediated neuroinflammation and oxidative stress
2025-Feb-20, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114117
PMID:39889414
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研究论文 | 本研究探讨了Dapagliflozin通过抑制小胶质细胞介导的神经炎症和氧化应激，减轻癫痫持续状态（SE）引起的癫痫发作和认知障碍的效果 | 首次揭示了Dapagliflozin通过抑制SGLT2调节小胶质细胞介导的神经炎症和氧化应激，对SE及其相关认知障碍的神经保护作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，尚未在人类临床试验中验证 | 探讨Dapagliflozin对癫痫持续状态（SE）引起的癫痫发作和认知障碍的治疗效果 | 雄性C57BL/6小鼠和BV2细胞 | 神经科学 | 癫痫 | 单细胞转录组分析、免疫荧光染色、免疫组化、流式细胞术、Western blot、RT-qPCR、ELISA | NA | 基因表达数据、行为数据、生化数据 | 雄性C57BL/6小鼠和BV2细胞 |
| 600 | 2025-02-12 |
Exploring the dynamic responses of group 3 innate lymphoid cells at different times in response to LPS challenge
2025-Feb-20, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114162
PMID:39889415
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研究论文 | 本研究探讨了第3组先天性淋巴细胞（ILC3s）在不同时间对LPS挑战的动态响应 | 结合微阵列数据和单细胞RNA测序数据，分析了ILC3亚群的功能，并发现了肠道ILC3s可能迁移至肺部的证据 | 研究主要依赖于已有数据库的数据，缺乏实验验证 | 阐明ILC3s在急性炎症中对LPS挑战的动态响应 | 第3组先天性淋巴细胞（ILC3s） | 免疫学 | 肺炎 | 微阵列数据、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术、qRT-PCR | NA | 基因表达数据 | NA |