单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 641 篇文献，本页显示第 581 - 600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 581 | 2025-10-07 |
Single cell transcriptome profiling reveals pathogenesis of bullous pemphigoid
2025-Feb-08, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-07629-4
PMID:39922909
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示大疱性类天疱疮的发病机制 | 首次在BP患者中对皮损和非皮损皮肤及血液样本进行单细胞转录组分析，揭示了免疫和非免疫细胞的功能转变 | 样本量有限，机制研究仍需进一步验证 | 阐明大疱性类天疱疮的发病机制 | 大疱性类天疱疮患者的皮损和非皮损皮肤组织及血液样本 | 单细胞组学 | 大疱性类天疱疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | BP患者的皮损、非皮损皮肤和血液样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 582 | 2025-10-07 |
ANO7 expression in the prostate modulates mitochondrial function and lipid metabolism
2025-Feb-08, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02081-7
PMID:39923095
|
研究论文 | 本研究探讨了ANO7基因在前列腺中的功能，发现其通过调节线粒体功能和脂质代谢影响前列腺癌的进展 | 首次揭示了ANO7在前列腺细胞中调节代谢途径的功能，特别是对氧化磷酸化和脂质代谢的调控作用 | ANO7在前列腺中的具体作用机制仍需进一步研究 | 探究ANO7基因在前列腺细胞中的功能及其与前列腺癌的关系 | RWPE1细胞、前列腺组织单细胞RNA测序数据集、前列腺组织RNA测序数据 | 生物医学研究 | 前列腺癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 基因集富集分析, 氧化磷酸化测定, 糖酵解测定, 靶向代谢组学, 线粒体形态图像分析, 脂质组学 | NA | 基因表达数据, 代谢组学数据, 图像数据 | NA | NA | RNA-seq, scRNA-seq, 代谢组学, 脂质组学 | NA | NA |
| 583 | 2025-10-07 |
uN2CpolyG-mediated p65 nuclear sequestration suppresses the NF-κB-NLRP3 pathway in neuronal intranuclear inclusion disease
2025-Feb-07, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02079-1
PMID:39920690
|
研究论文 | 本研究揭示了神经元核内包涵体病中uN2CpolyG蛋白通过隔离p65抑制NF-κB-NLRP3通路和自噬的分子机制 | 首次发现uN2CpolyG直接与p65相互作用并将其隔离在核内包涵体中，从而抑制NF-κB-NLRP3通路 | 研究主要基于细胞模型和果蝇模型，尚未在哺乳动物体内模型中完全验证 | 阐明uN2CpolyG与NF-κB-NLRP3通路之间的分子相互作用机制 | NIID患者皮肤组织、HEK-293T和U87-MG细胞系、CGG扩展敲入果蝇模型 | 神经退行性疾病研究 | 神经元核内包涵体病 | 单细胞RNA测序, 细胞转染, 果蝇模型 | 细胞模型, 果蝇模型 | 基因表达数据, 蛋白质相互作用数据 | NIID患者皮肤组织, 两种细胞系, 果蝇模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 584 | 2025-10-07 |
The Role of Jianpi Jiedu Recipe in Modulating the CRC Microenvironment
2025-Feb-07, Combinatorial chemistry & high throughput screening
IF:1.6Q3
|
研究论文 | 本研究探讨健脾解毒方通过调节结直肠癌微环境中HMGB1和MT2A表达发挥抗肿瘤作用的机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术系统揭示健脾解毒方对结直肠癌微环境中多种细胞类型的调控作用 | 研究主要基于数据库分析和体外验证，缺乏体内实验验证 | 探究健脾解毒方调节结直肠癌肿瘤微环境的分子机制 | 结直肠癌肿瘤微环境中的恶性细胞、免疫细胞和基质细胞 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 通路富集分析 | NA | 基因表达数据 | 基于已发表研究中的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 585 | 2025-10-07 |
Gene Expression Variations Induced by Sevoflurane in Glia and Glioma Cells and the Role of EPHA3 in Sevoflurane's Anti-Glioma Effect
2025-Feb-07, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了七氟醚通过免疫炎症反应等信号通路产生麻醉作用，并发现EPHA3基因在七氟醚抑制胶质瘤细胞侵袭迁移中的关键作用 | 首次在单细胞水平系统分析七氟醚对胶质和胶质瘤细胞基因表达的影响，发现EPHA3是七氟醚抗胶质瘤作用的新靶点 | 分子机制尚未完全阐明，需要进一步实验验证 | 探究七氟醚影响神经系统疾病特别是胶质瘤的分子机制 | 胶质细胞和胶质瘤细胞 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 单细胞转录组测序，生存分析，蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 11,244个基因及其变异 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 586 | 2025-10-07 |
APMAT analysis reveals the association between CD8 T cell receptors, cognate antigen, and T cell phenotype and persistence
2025-Feb-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56659-3
PMID:39915487
|
研究论文 | 开发APMAT框架用于高通量捕获和分析CD8 T细胞，揭示抗原-TCR对的理化特征与T细胞表型及持久性的关联 | 首次提出整合实验与计算的APMAT框架，能够同时捕获抗原-TCR配对信息和单细胞转录组数据 | 研究仅针对HLA A*02:01限制性COVID-19患者，样本量相对有限 | 阐明CD8 T细胞受体与抗原配对关系及其对T细胞表型和持久性的影响 | 62名HLA A*02:01 COVID-19患者的CD8 T细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞多组学分析 | 计算分析框架 | 单细胞转录组数据、TCR序列数据、抗原特性数据 | 62名COVID-19患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 587 | 2025-10-07 |
Human Single-Cell RNA-Sequencing Data Supports the Hypothesis of X Chromosome Insensitivity but Is Ineffective in Testing the Dosage Compensation Model
2025-Feb-03, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msaf004
PMID:39932018
|
研究论文 | 本研究通过分析单细胞RNA测序数据评估X染色体与常染色体表达比率计算方法，并探讨X染色体剂量不敏感假说 | 首次系统评估scRNA-seq数据中X:AA比率计算方法的偏差，并发现X染色体表达噪声增加和剂量敏感基因显著缺失 | 研究主要基于模拟数据和Smart-seq2技术，可能需要验证其他scRNA-seq平台的结果 | 评估scRNA-seq数据在检验X染色体剂量补偿模型中的有效性和局限性 | 人类单细胞RNA测序数据 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | Smart-seq2 | Smart-seq2单细胞RNA测序技术 |
| 588 | 2024-12-01 |
Human CD8+ T cell map with single-cell transcriptome and TCR information
2025-Feb, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02529-7
PMID:39614112
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 589 | 2024-12-01 |
Publisher Correction: Massively parallel single-cell sequencing of diverse microbial populations
2025-Feb, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02570-6
PMID:39614113
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 590 | 2025-10-07 |
Mesenchymal retinoic acid signaling is required for normal diaphragm development in mice
2025-Feb-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202402182R
PMID:39921473
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和转基因技术揭示了间充质维甲酸信号在小鼠膈肌正常发育中的关键作用 | 首次在发育中膈肌进行单细胞RNA测序分析，并特异性抑制间充质维甲酸信号证明其与先天性膈疝的直接因果关系 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 更好地理解膈肌发育和先天性膈疝的病因学 | 小鼠胚胎发育中的膈肌组织 | 发育生物学 | 先天性膈疝 | 单细胞RNA测序，条件性基因敲入 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确样本数量的小鼠胚胎 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 591 | 2025-10-07 |
Exploring Origin-Dependent Susceptibility of Smooth Muscle Cells to Aortic Diseases Through Intersectional Genetics
2025-Feb-10, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究开发了一种双重组酶介导的交集遗传系统，用于精确靶向不同发育来源的平滑肌细胞，探索其在主动脉疾病中的易感性 | 开发了先进的交集遗传系统，能够精确靶向不同发育来源的平滑肌细胞亚型 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探索不同发育来源的平滑肌细胞对主动脉疾病的易感性差异 | 小鼠主动脉平滑肌细胞 | 发育生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 交集遗传学, 基因敲除 | 遗传小鼠模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 592 | 2025-10-07 |
Retrotrans-genomics identifies aberrant THE1B endogenous retrovirus fusion transcripts in the pathogenesis of sarcoidosis
2025-Feb-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56567-6
PMID:39920152
|
研究论文 | 通过逆转录基因组学方法鉴定THE1B内源性逆转录病毒融合转录本在结节病发病机制中的作用 | 首次发现19个THE1B融合转录本，其中15个为先前未注释的，并揭示其在结节病中的特异性表达模式 | 样本量相对有限，需要更大规模研究验证 | 探究THE1B内源性逆转录病毒融合转录本在结节病发病机制中的作用 | 结节病肌病患者和对照组的肌肉组织样本 | 基因组学 | 结节病 | 短读长和长读长RNA-seq，单细胞/单核RNA-seq | NA | RNA测序数据 | 16例结节病肌病患者和400例其他肌肉疾病对照 | NA | RNA-seq，单细胞RNA-seq，单核RNA-seq | NA | NA |
| 593 | 2025-10-07 |
Multiomics identify the gene expression signature of the spinal cord during aging process
2025-Feb-07, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-07475-4
PMID:39920442
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了衰老过程中脊髓的基因表达特征及其与铁死亡抵抗的关系 | 首次结合空间转录组学和批量RNA测序技术系统揭示衰老脊髓的转录组特征，发现Fth1基因在衰老混合胶质细胞铁死亡抵抗中的核心作用 | 研究主要聚焦于基因表达层面，对蛋白质水平和功能验证仍需进一步深入 | 探索衰老过程中脊髓的分子变化特征及其生物学意义 | 年轻和衰老的小鼠脊髓组织及混合胶质细胞 | 多组学分析 | 衰老相关疾病 | 批量RNA测序, 空间转录组学, 流式细胞术, CCK-8检测, siRNA, 慢病毒实验 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据, 细胞功能数据 | 年轻和衰老的脊髓组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 594 | 2025-10-07 |
Transcriptomic profiles of single-cell autophagy-related genes (ATGs) in lung diseases
2025-Feb-07, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-025-09990-w
PMID:39920481
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究自噬相关基因在肺部疾病中的转录组图谱 | 首次在单细胞水平系统揭示自噬相关基因在多种肺部疾病中的表达异质性和细胞类型特异性变化 | 研究主要关注转录组水平变化，未验证蛋白质功能；外部刺激实验仅限于细胞系模型 | 阐明自噬相关基因在肺部疾病发生发展中的作用机制 | 健康人群和肺部疾病患者的肺组织样本，包括COVID-19相关急性肺损伤、特发性肺纤维化、慢性阻塞性肺疾病、系统性硬化症和肺腺癌 | 单细胞转录组学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康受试者和多种肺部疾病患者的肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 595 | 2025-10-07 |
Integration of single-cell and bulk RNA-sequencing data to construct and validate a signature based on NK cell marker genes to predict immunotherapy response and prognosis in colorectal cancer
2025-Feb-07, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01842-7
PMID:39920524
|
研究论文 | 基于NK细胞标记基因构建并验证了预测结直肠癌免疫治疗反应和预后的特征模型 | 首次整合单细胞和bulk RNA测序数据构建基于NK细胞标记基因的预后特征，用于预测结直肠癌免疫治疗反应 | 验证队列样本量有限（共325个样本），需要更多独立队列验证 | 构建预测结直肠癌免疫治疗反应和预后的生物标志物特征 | 结直肠癌患者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, WGCNA, LASSO回归分析 | 预后特征模型 | 基因表达数据 | 训练集587个TCGA样本，验证集两个GEO队列共325个样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 596 | 2025-10-07 |
Decoding SFRP2 progenitors in sustaining tooth growth at single-cell resolution
2025-Feb-07, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04190-z
PMID:39920788
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了SFRP2hi成纤维祖细胞在维持牙齿持续生长中的关键作用 | 首次识别出小鼠切牙和人类磨牙发育牙根中特有的Sfrp2hi成纤维祖细胞群，并阐明其通过Twist1调控Wnt信号通路维持干细胞特性的分子机制 | 将小鼠牙齿研究发现应用于人类疾病的研究仍不够充分 | 构建全面的牙髓细胞图谱，阐明人类与小鼠之间的组织相似性和物种特异性差异 | 人类和小鼠的牙髓组织 | 单细胞生物学 | 牙科疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 多个单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 597 | 2025-10-07 |
Myeloma cell-derived CXCL7 facilitates proliferation of tumor cells and occurrence of osteolytic lesions through JAK/STAT3 pathway
2025-Feb-06, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07413-6
PMID:39915476
|
研究论文 | 本研究揭示了骨髓瘤细胞通过分泌CXCL7趋化因子激活JAK/STAT3通路，促进肿瘤增殖和溶骨性病变发生的分子机制 | 首次发现高表达CXCL7的骨髓瘤细胞亚群具有强增殖和破骨信号通路激活能力，并阐明CXCL7通过CXCR2-JAK/STAT3-MMP13/C-myc轴驱动溶骨性病变的新机制 | 研究主要基于细胞系和小鼠模型，临床样本验证仍需扩大；CXCL7作为治疗靶点的具体干预策略尚未完全明确 | 探究多发性骨髓瘤中溶骨性病变的分子机制及潜在治疗靶点 | 多发性骨髓瘤细胞、小鼠异种移植瘤模型 | 数字病理 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序、转录组分析、体内外功能验证 | 小鼠异种移植瘤模型 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 本中心和GEO数据库的骨髓瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 598 | 2025-10-07 |
Single-cell atlas of human pancreatic islet and acinar endothelial cells in health and diabetes
2025-Feb-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-55415-3
PMID:39915484
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了人类胰腺胰岛和腺泡内皮细胞在健康与糖尿病状态下的血管图谱 | 首次开发了富集胰岛特异性内皮细胞和腺泡特异性内皮细胞的策略，并揭示了它们在健康和糖尿病状态下的独特分子特征 | 仅分析了三个人类胰腺样本，样本量有限 | 表征胰腺内血管异质性并揭示糖尿病中的血管变化 | 人类胰腺胰岛特异性内皮细胞和腺泡特异性内皮细胞 | 单细胞生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三个人类胰腺样本加上三个已发表的胰腺数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 599 | 2025-10-07 |
MiR-18a-LncRNA NONRATG-022419 pairs targeted PRG-1 regulates diabetic induced cognitive impairment by regulating NGF\BDNF-Trkb signaling pathway
2025-Feb-06, Proteome science
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12953-025-00239-2
PMID:39915794
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和转录组分析揭示了PRG-1通过NGF/BDNF-Trkb信号通路调控糖尿病认知功能障碍的分子机制 | 首次发现miR-18a-LncRNA NONRATG-022419对靶向调控PRG-1在糖尿病认知障碍中的作用机制 | 研究主要基于体外HT22细胞模型，需要进一步在体实验验证 | 探究PRG-1在糖尿病诱导认知功能障碍中的分子机制和细胞异质性 | 海马体细胞、HT22细胞系、I型螺旋神经节神经元 | 单细胞测序分析 | 糖尿病认知功能障碍 | 单细胞RNA测序, RNA转录组分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 600 | 2025-10-07 |
Phospho-seq: integrated, multi-modal profiling of intracellular protein dynamics in single cells
2025-Feb-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56590-7
PMID:39905064
|
研究论文 | 开发了一种名为Phospho-seq的集成方法，用于在单细胞水平同时分析细胞质和核蛋白及其翻译后修饰 | 提出简化的台式抗体偶联方法创建大型定制神经聚焦抗体面板，实现蛋白质与scATAC-seq的同时分析 | NA | 开发能够量化细胞内蛋白质动态并与顺式调控元件和转录靶标连接的多模态单细胞分析技术 | 细胞系、诱导多能干细胞、数月龄视网膜和脑类器官 | 单细胞多组学 | 神经发育疾病 | 单细胞ATAC-seq, 转录组测量, 抗体偶联 | NA | 蛋白质组, 表观基因组, 转录组 | NA | NA | 单细胞ATAC-seq, 多组学分析 | NA | NA |