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当前共找到 641 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-04-28 |
Uncovering endothelial to mesenchymal transition drivers in atherosclerosis via multi-omics analysis
2025-02-17, BMC cardiovascular disorders
IF:2.0Q3
DOI:10.1186/s12872-025-04571-5
PMID:39956907
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研究论文 | 通过整合多组学数据，揭示了动脉粥样硬化中调控内皮-间充质转化的新候选因子 | 首次通过整合单细胞RNA测序、批量RNA测序和微阵列数据，系统鉴定出七个新的内皮-间充质转化候选基因（PTGS2、TPM1、SERPINE1、FN1、RASD1、SEMA3C和ESM1） | 研究主要依赖公开数据库和生物信息学分析，验证仅通过qPCR和western blotting进行，尚未在体内模型或临床样本中进行功能验证 | 识别动脉粥样硬化中调控内皮-间充质转化的新候选分子 | 动脉粥样硬化斑块中的内皮细胞及体外内皮-间充质转化模型 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、微阵列分析、qPCR、western blotting | NA | 基因表达数据 | 三个数据集：GSE159677（scRNA-seq）、GSE118446（bulk RNA-seq）和GSE56309（微阵列） | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 42 | 2026-04-25 |
Inhibiting mechanotransduction prevents scarring and yields regeneration in a large animal model
2025-Feb-19, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adt6387
PMID:39970235
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研究论文 | 通过抑制机械传导（YAP）防止大型动物模型瘢痕形成并促进伤口再生 | 首次在红杜洛克猪（最接近人类瘢痕模型）中证明单次使用YAP抑制剂维替泊芬即可防止瘢痕形成并驱动伤口再生，并结合单细胞RNA测序和空间蛋白质组学分析揭示了成纤维细胞动态变化及YAP/IL-33信号轴的作用 | 未提及具体局限性 | 阐明YAP抑制在大型动物伤口再生中的作用机制，为临床转化预防人类皮肤瘢痕提供依据 | 红杜洛克猪伤口模型及人类新生儿包皮异种移植伤口模型 | 数字病理学 | 皮肤瘢痕 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间蛋白质组学分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质空间分布数据 | 未具体说明样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间蛋白质组学 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 43 | 2026-04-24 |
Deciphering the cell type-specific and zonal distribution of drug-metabolizing enzymes, transporters, and transcription factors in livers of mice using single-cell transcriptomics
2025-Feb, Drug metabolism and disposition: the biological fate of chemicals
DOI:10.1016/j.dmd.2024.100029
PMID:39919554
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研究论文 | 利用单细胞转录组学解析小鼠肝脏中药物代谢酶、转运蛋白及转录因子的细胞类型特异性和区域分布 | 首次系统表征小鼠肝脏中药物加工基因在不同细胞类型和肝小叶区域的基线mRNA富集情况，结合单细胞和空间转录组数据实现分区解析 | NA | 表征小鼠肝脏中药物加工基因的细胞类型特异性和区域分布 | 小鼠肝脏细胞类型包括肝细胞、胆管细胞、内皮细胞、库普弗细胞、星状细胞、肌成纤维细胞及免疫细胞 | 机器学习 | 药物性肝损伤 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 来自已发表数据集的单细胞和单核转录组样本 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | Seurat V5（分析软件） | 使用Seurat V5在R中进行过滤、标准化、聚类和差异表达分析，并基于已知区域标记物及空间转录组数据验证肝细胞分区 |
| 44 | 2026-04-23 |
Cell Type-Agnostic Transcriptomic Signatures Enable Uniform Comparisons of Neurodevelopment
2025-Feb-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.24.639936
PMID:40060479
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学元分析，开发了一种细胞类型无关的转录组特征模型，用于统一比较神经发育过程 | 提出了一种细胞类型无关的模型，能够跨细胞类型、数据集和物种（如人类和小鼠）准确预测发育年龄，并成功应用于神经类器官和疾病模型 | 模型主要基于转录组数据，可能未涵盖其他生物学层面（如表观遗传或蛋白质组）的发育信息，且样本来源和预处理差异可能影响泛化能力 | 开发一个统一框架，以比较不同背景、模型系统和物种中的神经发育过程 | 人类和小鼠的发育中大脑细胞，以及人类神经类器官 | 单细胞转录组学 | 神经发育疾病 | 单细胞RNA-seq | 正则化回归模型 | 单细胞转录组数据 | 超过280万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 45 | 2026-04-22 |
The forkhead transcription factor FKH-7/FOXP acts in chemosensory neurons to regulate developmental decision-making
2025-Feb-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.17.638733
PMID:40027766
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研究论文 | 本研究揭示了叉头转录因子FKH-7/FOXP在化学感应神经元中调控发育决策的功能，并建立了连接自闭症相关基因的分子病理研究框架 | 首次发现FKH-7/FOXP在化学感应神经元中调控幼虫进入发育停滞期（dauer阶段）的决策功能，并证明人类FOXP1可在该功能上替代FKH-7 | 研究基于线虫模型，在哺乳动物系统中的直接适用性需要进一步验证 | 探究自闭症相关转录因子FOXP1及其同源物在发育决策中的分子机制 | 线虫（C. elegans）的化学感应神经元及发育决策过程 | 神经科学 | 自闭症 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 46 | 2026-04-20 |
NLRP3 inflammasome mediates pyroptosis of alveolar macrophages to induce radiation lung injury
2025-02-15, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.136740
PMID:39642726
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研究论文 | 本研究探讨了肺泡巨噬细胞焦亡在辐射性肺损伤中的作用，发现NLRP3炎症小体是介导此过程的核心机制 | 首次结合多色流式细胞术、单细胞RNA测序及质谱分析，揭示了辐射性肺损伤中肺泡巨噬细胞焦亡的早期启动作用及其作为细胞通讯关键调节者的角色 | 研究主要聚焦于肺泡巨噬细胞，其他免疫细胞类型在辐射性肺损伤中的具体作用机制尚未完全阐明 | 阐明辐射性肺损伤中肺泡巨噬细胞焦亡的分子机制及NLRP3炎症小体的激活途径 | 辐射诱导的肺损伤模型中的肺泡巨噬细胞及其他免疫细胞 | 数字病理学 | 肺损伤 | 多色流式细胞术, 单细胞RNA测序, 质谱分析, 免疫共沉淀, Duolink邻近连接技术 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质互作数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 47 | 2026-04-20 |
Exosomal miRNA reprogramming in pyroptotic macrophage drives silica-induced fibroblast-to-myofibroblast transition and pulmonary fibrosis
2025-02-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.136629
PMID:39603130
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研究论文 | 本研究揭示了二氧化硅纳米颗粒通过诱导间质巨噬细胞焦亡，改变外泌体miRNA谱，进而驱动成纤维细胞向肌成纤维细胞转分化，促进矽肺纤维化的分子机制 | 首次将巨噬细胞焦亡、外泌体miRNA重编程与成纤维细胞转分化联系起来，阐明了二氧化硅诱导肺纤维化的新机制；并应用高光谱成像和人工智能病理识别等新技术 | 研究主要基于动物模型和体外实验，尚未在人体样本中得到验证；外泌体miRNA的具体作用靶点和下游信号通路有待进一步阐明 | 揭示二氧化硅诱导肺纤维化的分子机制，为矽肺治疗提供新靶点 | 二氧化硅纳米颗粒、巨噬细胞、成纤维细胞、外泌体、小鼠矽肺模型 | 数字病理 | 肺纤维化/矽肺 | 单细胞RNA测序、高通量miRNA测序、高光谱成像 | 人工智能病理识别模型 | 单细胞转录组数据、miRNA测序数据、病理图像 | 未明确说明具体样本数量，但包含体外和体内矽肺模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 48 | 2026-04-04 |
Spatial transcriptomic clocks reveal cell proximity effects in brain ageing
2025-02, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08334-8
PMID:39695234
|
研究论文 | 本研究通过构建空间分辨单细胞转录组脑图谱，开发空间衰老时钟模型，揭示了T细胞和神经干细胞在脑衰老中对邻近细胞的促衰老和促年轻化效应 | 首次开发了基于空间转录组数据的衰老时钟模型，能够识别罕见细胞类型的空间特异性转录组指纹，并量化细胞邻近效应对组织衰老的影响 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证尚不充分；空间转录组技术分辨率有限，可能无法捕捉所有细胞间相互作用细节 | 探究脑衰老过程中细胞间相互作用机制及干预措施的影响 | 成年小鼠脑组织中的420万个细胞，涵盖20个不同年龄点及运动与部分重编程两种干预条件 | 空间转录组学 | 神经退行性疾病 | 空间分辨单细胞转录组测序 | 机器学习模型（空间衰老时钟）、深度学习 | 空间转录组数据 | 420万个细胞，覆盖20个年龄点及两种干预条件 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 49 | 2026-04-02 |
Mechanisms and strategies of immunosenescence effects on non-small cell lung cancer (NSCLC) treatment: A comprehensive analysis and future directions
2025-02, Seminars in cancer biology
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.semcancer.2025.01.001
PMID:39793777
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综述 | 本文全面分析了免疫衰老对非小细胞肺癌（NSCLC）进展及治疗影响的分子、细胞和遗传机制，并探讨了针对老年患者的未来治疗策略 | 系统性地整合了免疫衰老在NSCLC中的作用机制，并重点探讨了如何利用单细胞测序、CRISPR-Cas9等新兴技术来理解并靶向免疫衰老，以优化老年患者的免疫治疗 | 本文是一篇综述性文章，未涉及原始实验数据或具体的临床研究，主要基于现有文献进行分析和展望 | 阐明免疫衰老如何影响NSCLC的进展和治疗反应，并探索改善老年NSCLC患者治疗效果的未来方向 | 非小细胞肺癌（NSCLC），重点关注老年患者群体及其衰老的免疫系统 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞测序，CRISPR-Cas9 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 50 | 2026-04-01 |
CellGAT: A GAT-Based Method for Constructing a Cell Communication Network Integrating Multiomics Information
2025-02-27, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15030342
PMID:40149878
|
研究论文 | 提出CellGAT框架，通过整合多组学信息构建细胞通讯网络 | 首次将蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）信息整合到细胞通讯网络推断中，并利用图注意力网络（GAT）和节点嵌入算法 | 未明确提及样本量或数据集的局限性 | 推断细胞间通讯并分析其对下游通路、邻近细胞和药物干预的影响 | 多细胞生物中的细胞通讯网络 | 机器学习 | NA | scRNA-seq（单细胞RNA测序） | GAT（图注意力网络） | 基因表达数据、PPI信息、蛋白质复合物数据、通路信息 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 51 | 2026-04-01 |
VPS25 Promotes an Immunosuppressive Microenvironment in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2025-02-22, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15030323
PMID:40149859
|
研究论文 | 本研究探讨了ESCRT复合体成员VPS25在头颈部鳞状细胞癌中的表达、功能及其在免疫抑制微环境中的作用 | 首次揭示VPS25通过上调PVR表达激活PVR-TIGIT免疫抑制信号轴，促进肿瘤免疫逃逸，并作为免疫治疗反应的潜在预测生物标志物 | 研究主要基于TCGA数据集和细胞系实验，缺乏大规模前瞻性临床队列验证 | 阐明VPS25在头颈部鳞状细胞癌肿瘤进展和免疫微环境调控中的分子机制 | 头颈部鳞状细胞癌组织、CAL27细胞系、肿瘤微环境免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 头颈部鳞状细胞癌 | RNA测序、单细胞RNA测序、免疫组化、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、组织微阵列图像、单细胞转录组数据 | TCGA数据集样本、HNSCC组织微阵列、CAL27细胞系 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 52 | 2026-03-20 |
A comparative study of statistical methods for identifying differentially expressed genes in spatial transcriptomics
2025-Feb-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.17.638726
PMID:40027680
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研究论文 | 本文比较了空间转录组学中识别差异表达基因的统计方法，并提出了一种基于广义估计方程框架的广义得分检验作为稳健解决方案 | 提出了一种新的广义得分检验方法，有效整合空间相关性，以克服现有方法如Wilcoxon秩和检验在空间转录组数据分析中的局限性 | 研究主要基于模拟数据和特定癌症数据集，可能未涵盖所有空间转录组学应用场景或组织类型 | 比较并改进空间转录组学中差异表达基因识别的统计方法，以提高分析准确性 | 空间转录组学数据，特别是来自乳腺癌和前列腺癌的数据集 | 空间转录组学 | 乳腺癌, 前列腺癌 | 空间转录组学 | 广义估计方程, Wilcoxon秩和检验, 稳健Wald检验 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 53 | 2026-03-20 |
Seq-Scope-eXpanded: Spatial Omics Beyond Optical Resolution
2025-Feb-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.04.636355
PMID:39975076
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研究论文 | 本文介绍了Seq-Scope-X技术，一种结合组织膨胀的测序空间转录组学方法，实现了亚微米级分辨率，超越传统光学限制 | 通过物理组织膨胀技术，Seq-Scope-X将空间特征密度提升一个数量级，首次在肝脏组织中实现单细胞核质区室分辨，并揭示代谢角色动态转换 | 未明确说明技术在不同组织类型中的普适性验证范围及样本量细节 | 开发超高分率空间组学技术以突破测序空间转录组学的分辨率限制 | 小鼠肝脏、脑组织、结肠、脾脏及人类扁桃体组织 | 空间转录组学 | NA | 测序空间转录组学、组织膨胀技术、空间蛋白质组分析 | NA | 空间转录组数据、蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞空间转录组学、空间蛋白质组学 | Seq-Scope-X | 基于Seq-Scope的亚微米级分辨率组织膨胀改良系统 |
| 54 | 2026-03-18 |
Eliminating the persistent HIV reservoir based on biomarker expression - How do we get there?
2025-02, Virology
IF:2.8Q3
DOI:10.1016/j.virol.2024.110368
PMID:39721194
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综述 | 本文讨论了基于生物标志物表达来消除持久性HIV病毒库的挑战与前景 | 系统分析了导致HIV潜伏感染细胞生物标志物异质性的因素，并提出了通过识别共表达蛋白的最小组合来定义所有病毒库亚群的新策略 | 目前缺乏能够定义所有HIV潜伏感染细胞的单一特异性分子标志物，且对组织微环境和髓系细胞中潜伏感染细胞的表征仍不充分 | 探讨如何识别和利用生物标志物来靶向消除持久性HIV病毒库，以实现HIV治愈 | HIV潜伏感染细胞及其相关的生物标志物 | NA | HIV感染 | 空间转录组学、蛋白质组学 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 55 | 2026-03-16 |
PLXNB1 and other signaling drives a pathologic astrocyte state contributing to cognitive decline in Alzheimer's Disease
2025-Feb-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.24.639868
PMID:40060644
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研究论文 | 本文通过单核转录组学数据分析，揭示了阿尔茨海默病中Ast10星形胶质细胞亚群在认知衰退中的关键作用及其信号驱动机制 | 首次通过大规模单核转录组学元分析（869个大脑样本）识别出Ast10星形胶质细胞亚群，并利用空间转录组学验证其与配体的共定位，结合遗传学实验证实PLXNB1等信号通路的调控作用 | 研究主要基于转录组数据，功能机制验证仍需进一步实验；样本虽多样但可能存在批次效应；动物模型与人类疾病的直接对应性有限 | 探究阿尔茨海默病中病理性星形胶质细胞状态的信号驱动机制及其对认知衰退的贡献 | 阿尔茨海默病患者及衰老相关的大脑组织样本（人类和小鼠模型），重点关注星形胶质细胞和小胶质细胞亚群 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单核转录组测序（snRNAseq），空间转录组学，遗传学敲除实验 | NA | 转录组数据，空间基因表达数据 | 869个大脑样本（来自多样化捐赠者），涵盖人类和小鼠iPSC衍生细胞 | NA | 单核RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 56 | 2026-03-13 |
[Research progress on the mechanistic role and constituents of hepatic macrophages during the occurrence and development of hepatic fibrosis]
2025-Feb-20, Zhonghua gan zang bing za zhi = Zhonghua ganzangbing zazhi = Chinese journal of hepatology
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综述 | 本文综述了肝纤维化发生发展中肝巨噬细胞的机制作用、构成及其亚型，并探讨了单细胞测序技术揭示的新发现以及靶向巨噬细胞治疗的优势 | 总结了单细胞测序技术揭示的肝纤维化过程中巨噬细胞的新亚型和作用模式，并分析了靶向巨噬细胞治疗相较于传统抗纤维化疗法的优势 | NA | 阐明肝巨噬细胞在肝纤维化发生发展中的机制作用和构成，并探讨新的治疗方向 | 肝巨噬细胞 | NA | 肝纤维化 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 57 | 2026-03-11 |
Renal Cell Type and State Estimation in Brightfield Histology Images: A Pilot Study on Diabetic Nephropathy
2025-Feb, Proceedings of SPIE--the International Society for Optical Engineering
DOI:10.1117/12.3047996
PMID:41799653
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研究论文 | 本研究探索了基于机器学习的方法，利用深度学习模型从亮场组织学图像中预测细胞类型和状态，以提升糖尿病肾病的临床诊断和预后评估 | 提出了一种两阶段管道，结合图像到文本检索网络和视觉语言模型，利用CONCH模型从亮场图像中生成组织病理学文本提示，并预测细胞类型/状态比例，相比仅使用图像输入的模型有显著性能提升 | 研究为试点性质，样本量有限，仅基于印第安纳大学收集的糖尿病肾病样本，且依赖于10X Visium空间转录组学数据作为参考，可能限制了模型的泛化能力 | 开发一种从亮场组织学图像中预测细胞类型和状态的机器学习管道，以弥补传统组织病理学与分子诊断之间的差距 | 糖尿病肾病患者的肾组织样本，包括肾小球、肾小管、血管和间质等结构 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 空间转录组学，深度学习 | CONCH, ViT, ResNet | 图像，文本 | 来自印第安纳大学的糖尿病肾病样本的10X Visium FFPE全玻片图像 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10X Visium formalin-fixed paraffin-embedded whole slides images |
| 58 | 2026-03-10 |
TcEVdb: a database for T-cell-derived small extracellular vesicles from single-cell transcriptomes
2025-02-28, Database : the journal of biological databases and curation
DOI:10.1093/database/baaf012
PMID:40036846
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研究论文 | 本研究构建了TcEVdb数据库，通过SEVtras方法从T细胞单细胞RNA测序数据中探索T细胞来源的小细胞外囊泡的表达和聚类 | 首次创建了专门针对T细胞来源小细胞外囊泡的综合性数据库，整合了多项目、多组织来源的单细胞转录组数据，揭示了TcEV的异质性 | 数据库依赖于现有单细胞RNA测序数据的质量和覆盖范围，可能无法完全捕捉所有TcEV亚群 | 探索T细胞来源细胞外囊泡的转录组特征和异质性，以促进基于EV的疾病诊断和治疗研究 | T细胞来源的小细胞外囊泡 | 生物信息学 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | SEVtras方法 | 单细胞转录组数据 | 277,265个EV液滴，来自21个项目中的221个样本，涵盖51种T细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 59 | 2026-03-06 |
Transcriptomic responses of lung mesenchymal cells during pneumonia
2025-Feb-25, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.177084
PMID:39998887
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了小鼠肺炎期间肺间充质细胞的转录组响应，揭示了其多样化和特异性的免疫活动 | 首次系统性地鉴定了肺炎期间肺间充质细胞的五种亚型及其转录组动态变化，并发现了跨细胞类型的核心响应和亚型特异性响应 | 研究仅基于小鼠模型，未在人类样本中验证，且时间点有限（仅24小时和6周），可能未覆盖所有疾病阶段 | 探究肺间充质细胞在肺炎期间的转录组响应及其免疫功能 | 小鼠肺组织中的间充质细胞 | 单细胞转录组学 | 肺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自小鼠肺单细胞悬液的间充质细胞，包括初始组、肺炎组和感染恢复组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 60 | 2026-03-06 |
Ag-driven CD8 + T cell clonal expansion is a prominent feature of MASH in humans and mice
2025-Feb-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000971
PMID:39047085
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和流式细胞术，揭示了MASH（代谢功能障碍相关脂肪性肝炎）中肝脏T细胞的表型、T细胞受体多样性及抗原驱动的克隆扩增现象 | 首次在人类和小鼠模型中证实MASH诱导的肝硬化导致肝脏中T细胞发生抗原依赖性克隆扩增和功能分化，并识别了PD1、TIGIT和TOX等慢性抗原刺激标志物 | 研究未明确驱动T细胞激活的具体抗原靶点，且样本来源限于人类肝硬化和小鼠饮食诱导MASH模型，可能无法完全代表所有MASH亚型 | 旨在解析MASH进展中T细胞在肝脏积累的表型、T细胞受体多样性及其功能作用 | 人类肝硬化患者和小鼠饮食诱导MASH模型的肝脏驻留T细胞 | 免疫学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎 | 5'单细胞测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据 | 人类肝硬化患者和小鼠MASH模型的肝脏T细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |