单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 672 篇文献，本页显示第 561 - 580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 561 | 2025-02-20 |
Senescent Fibroblasts Drive FAP/OLN Imbalance Through mTOR Signaling to Exacerbate Inflammation and Bone Resorption in Periodontitis
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202409398
PMID:39716898
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研究论文 | 本研究探讨了成纤维细胞激活蛋白（FAP）在牙周炎中的作用，揭示了衰老成纤维细胞通过mTOR信号通路驱动FAP/OLN失衡，加剧炎症和骨吸收的机制 | 首次通过孟德尔随机化分析确定了FAP水平与牙周炎易感性之间的正相关关系，并揭示了衰老成纤维细胞通过mTOR信号通路驱动FAP/OLN失衡的新机制 | 研究主要基于实验性牙周炎模型，临床样本的验证仍需进一步研究 | 探讨FAP在牙周炎中的作用及其机制 | 人类和小鼠的牙周炎组织、牙龈成纤维细胞（GFs） | 生物医学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化分析 | NA | 基因表达数据、组织样本 | 人类和小鼠的牙周炎组织 |
| 562 | 2025-02-20 |
CXCL16/CXCR6/TGF-β Feedback Loop Between M-MDSCs and Treg Inhibits Anti-Bacterial Immunity During Biofilm Infection
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202409537
PMID:39716908
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研究论文 | 本研究探讨了金黄色葡萄球菌（S. aureus）引起的假体周围感染（PJI）中免疫抑制生物膜环境与感染结果之间的关系 | 揭示了M-MDSCs和Treg细胞通过CXCL16-CXCR6相互作用增强免疫抑制的机制，并提出了通过干扰这一相互作用来减轻细菌负担的治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型和患者样本，可能无法完全反映人类PJI的复杂性 | 研究金黄色葡萄球菌引起的假体周围感染（PJI）中免疫抑制生物膜环境与感染结果之间的关系 | 假体周围感染（PJI）患者的滑膜组织和PJI小鼠模型 | 免疫学 | 假体周围感染 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | Treg特异性CXCR6敲除小鼠模型 | RNA测序数据、免疫组化数据 | PJI患者的滑膜组织和PJI小鼠模型 |
| 563 | 2025-02-20 |
Aneurysm Is Restricted by CD34+ Cell-Formed Fibrous Collars Through the PDGFRb-PI3K Axis
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202408996
PMID:39731355
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研究论文 | 本研究探讨了CD34+细胞通过PDGFRb-PI3K轴在腹主动脉瘤（AAA）中形成纤维环的作用 | 揭示了非骨髓来源的CD34+细胞在AAA发展中转分化为Periostin肌成纤维细胞，并参与纤维环形成的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本的研究仍需进一步验证 | 探讨CD34+细胞在腹主动脉瘤（AAA）中的作用及其机制 | 腹主动脉瘤（AAA）患者和小鼠模型 | 生物医学 | 心血管疾病 | Cd34-CreER;Rosa26-tdTomato;(Apoe)谱系追踪、骨髓移植、单细胞测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 患者和小鼠模型的主动脉组织 |
| 564 | 2025-02-20 |
Spatial single-cell maps reveal ST6GAL1 promoting ovarian cancer metastasis
2025-Feb, Glycoconjugate journal
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s10719-025-10177-y
PMID:39883364
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研究论文 | 本研究利用空间和单细胞转录组技术探讨了ST6GAL1在卵巢癌腹膜转移中的作用 | 首次整合空间和单细胞转录组数据，揭示了ST6GAL1在卵巢癌腹膜转移中的关键作用及其与代谢活性的关联 | 研究主要基于已有数据集，缺乏实验验证 | 探讨ST6GAL1在卵巢癌腹膜转移中的作用及其临床意义 | 卵巢癌上皮细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组技术、空间转录组技术、RNA测序 | RCTD（稳健细胞类型分解） | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、RNA测序数据 | GSE130000（单细胞转录组数据集）、GSE211956（空间转录组数据集）、The Cancer Genome Atlas（RNA测序数据） |
| 565 | 2025-02-18 |
Spatial transcriptomics reveals regional characteristics of lupus nephritis in murine kidneys and immune response to prednisolone or Gancao Nourishing-Yin decoction therapies
2025-Feb, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70236
PMID:39956926
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 566 | 2025-02-19 |
SpaDCN: Deciphering Spatial Functional Landscape from Spatially Resolved Transcriptomics by Aligning Cell-Cell Communications
2025-Feb-17, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202402111
PMID:39962819
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研究论文 | 本文提出了一种名为SpaDCN的空间动态图卷积网络框架，用于从空间分辨转录组学数据中解析细胞间通信和基因表达，以揭示具有一致细胞组织的空间功能区域 | SpaDCN通过生成空间图表示的节点层和边层，并采用动态图卷积来切换节点图和边图的传播，从而有效地转移细胞间通信对表达变异的影响 | NA | 解决在组织微环境中识别病理相关空间功能景观的挑战 | 空间分辨转录组学数据 | 数字病理学 | 癌症 | 空间分辨转录组学 | 动态图卷积网络 | 基因表达数据 | NA |
| 567 | 2025-02-19 |
CCL19+ Fibroblasts Promote Tertiary Lymphoid Structure in Oral Lichen Planus: A Retrospective Study
2025-Feb-17, Oral diseases
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/odi.15266
PMID:39962879
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多重免疫荧光染色技术，探讨了口腔扁平苔藓（OLP）中诱导性三级淋巴结构（iTLSs）的作用及其与疾病严重程度的关系 | 首次揭示了CCL19+成纤维细胞在T细胞趋化及iTLSs形成中的关键作用，并发现iTLSs的存在与OLP疾病严重程度显著相关 | 研究为回顾性研究，样本量有限，且未进行长期随访以评估iTLSs对疾病预后的影响 | 阐明口腔扁平苔藓中适应性免疫的启动机制，特别是iTLSs和基质-免疫微环境的作用 | 口腔扁平苔藓患者 | 数字病理学 | 口腔疾病 | 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 回顾性收集的口腔扁平苔藓患者临床数据 |
| 568 | 2025-02-19 |
Landscape of four different stages of human gastric cancer revealed by single-cell sequencing
2025-Feb-15, World journal of gastrointestinal oncology
IF:2.5Q3
DOI:10.4251/wjgo.v17.i2.97125
PMID:39958562
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了人类胃癌四个不同阶段的细胞分布和动态变化 | 首次使用单细胞RNA测序技术全面分析胃癌不同阶段的肿瘤微环境中的细胞分布和相互作用 | 样本量较小，仅涉及四名患者的八个组织样本 | 探索胃癌肿瘤微环境中细胞群体的分布和动态变化 | 胃癌患者的癌组织和癌旁组织 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），定量实时聚合酶链反应（qRT-PCR），流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | 四名患者的八个组织样本，共73645个单细胞 |
| 569 | 2025-02-19 |
Single-cell transcriptomes reveal cell-type-specific and sample-specific gene function in human cancer
2025-Feb-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2025.e42218
PMID:39959484
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术，构建了一个基于共表达网络和邻居投票方法的评估框架，以探索其在癌症基因功能理解中的作用 | 揭示了scRNA-seq在细胞类型特异性和样本特异性基因功能发现中的独特作用，尤其是在免疫细胞中发现了癌症细胞中未发现的免疫相关功能 | 研究中使用的细胞数量较多（116,814个），但未详细讨论样本来源的多样性或潜在的批次效应问题 | 探索单细胞RNA测序在癌症基因功能注释中的作用 | 人类癌症中的细胞类型和样本 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 共表达网络和邻居投票方法 | 单细胞RNA测序数据 | 116,814个细胞 |
| 570 | 2025-02-19 |
One-carbon metabolism is distinct metabolic signature for proliferative intermediate exhausted T cells of ICB-resistant cancer patients
2025-Feb-14, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02332-z
PMID:39952933
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研究论文 | 本研究探讨了一碳代谢（1CM）在肿瘤免疫微环境（TIME）中的功能作用，特别是在免疫检查点阻断（ICB）耐药癌症患者的增殖性中间耗竭T细胞（Tex）中的作用 | 首次将1CM与增殖性中间耗竭T细胞（Tex）联系起来，并发现1CM在免疫治疗耐药患者中显著扩增，提出1CM作为增强免疫治疗疗效的新治疗靶点 | 研究主要基于RNA测序数据，缺乏直接的实验验证，且样本类型和数量有限 | 阐明1CM在肿瘤免疫微环境中的功能作用，特别是其在免疫治疗耐药中的作用 | 肺癌、胶质母细胞瘤、肾细胞癌、结直肠癌和三阴性乳腺癌患者的T细胞 | 肿瘤免疫学 | 肺癌、胶质母细胞瘤、肾细胞癌、结直肠癌、三阴性乳腺癌 | bulk-RNA测序、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 多种癌症患者的RNA测序数据，具体样本数量未明确 |
| 571 | 2025-02-19 |
CCR7 in esophageal squamous cell carcinoma: an identification from single-cell and bulk transcriptome sequencing
2025-Feb-14, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01927-3
PMID:39953263
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量转录组测序揭示了CCR7在食管鳞状细胞癌（ESCC）中的具体机制 | 首次结合单细胞RNA测序和TCGA-ESCA数据，系统分析了CCR7在ESCC中的表达及其与KRAS信号通路的关联 | 研究主要基于体外实验和生物信息学分析，缺乏体内实验验证 | 揭示CCR7在食管鳞状细胞癌中的具体机制 | 食管鳞状细胞癌（ESCC）细胞 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序，批量转录组测序 | NA | RNA测序数据 | 28,281个细胞 |
| 572 | 2025-02-19 |
A morphological cell atlas of the freshwater sponge Ephydatia muelleri with key insights from targeted single-cell transcriptomes
2025-Feb-14, EvoDevo
IF:4.1Q1
DOI:10.1186/s13227-025-00237-7
PMID:39953556
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研究论文 | 本文通过研究淡水海绵Ephydatia muelleri的形态、行为和转录组学，填补了非双侧对称动物细胞和组织形态学理解的空白 | 描述了新的细胞特征，如极化的外上皮、新的收缩筛细胞、在choanocyte室出口处的运动纤毛以及在excurrent canal和oscula细胞上的非运动纤毛 | 研究主要集中在一种淡水海绵物种，可能无法完全代表所有海绵的细胞和组织特征 | 理解动物细胞类型、组织和区域体型的起源，特别是非双侧对称动物与双侧对称动物之间的过渡 | 淡水海绵Ephydatia muelleri的细胞和组织 | 进化发育生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 三种细胞类型（cystencytes, choanocytes, archaeocytes）的活体样本 |
| 573 | 2025-02-19 |
Activation of STAT6 in Intestinal Epithelial Cells Predisposes to Gut Inflammation
2025-Feb, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202451394
PMID:39670708
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研究论文 | 本文研究了STAT6在肠道上皮细胞中的激活如何导致肠道炎症 | 首次揭示了STAT6在肠道上皮细胞中的激活与肠道炎症的关联 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨STAT6在肠道上皮细胞中的激活对肠道炎症的影响 | 小鼠模型（VillinCre_STAT6vt小鼠）和人类IBD患者单细胞RNA测序数据 | 生物医学 | 炎症性肠病（IBD） | RNA测序，单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 小鼠模型和人类IBD患者单细胞RNA测序数据集 |
| 574 | 2025-02-19 |
Single-Cell Transcriptome Decoding Umbilical Cord-Derived Mesenchymal Stem Cell Heterogeneity Reveals a Unique IL1R1HighPDGFRAHigh Ultroser-G-MSC With Osteogenesis and Chondrogenesis Signatures
2025-Feb, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.70004
PMID:39956958
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了人脐带间充质干细胞（hUC-MSCs）在不同培养系统中的异质性，并鉴定出一组具有高成骨和软骨生成潜能的Ultroser-G-MSCs亚群 | 首次创建了hUC-MSCs在不同培养系统中的单细胞转录组图谱，并鉴定出具有高成骨和软骨生成潜能的IL1R1HighPDGFRAHigh Ultroser-G-MSCs亚群 | 研究主要基于体外实验，需要进一步在体内验证这些发现的临床适用性 | 揭示hUC-MSCs在不同培养系统中的异质性，并鉴定出具有特定功能的亚群以实现精准临床应用 | 人脐带间充质干细胞（hUC-MSCs） | 单细胞转录组学 | 骨关节炎 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 575 | 2025-02-18 |
Spatial transcriptomic analysis identifies epithelium-macrophage crosstalk in endometriotic lesions
2025-Feb-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.111790
PMID:39935459
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析，识别了子宫内膜异位症病变中上皮细胞与巨噬细胞之间的相互作用 | 揭示了子宫内膜异位症病变中上皮细胞在驱动炎症信号和促进巨噬细胞修复表型中的新作用，并提出了补体3在病变病理生物学中的新角色 | 研究主要关注浅表腹膜子宫内膜异位症病变，可能不适用于其他类型的子宫内膜异位症 | 识别子宫内膜异位症病变中细胞类型特异性基因表达变化，并阐明基质、上皮细胞和巨噬细胞之间的相互作用 | 浅表腹膜子宫内膜异位症病变和患者匹配的子宫内膜组织 | 数字病理学 | 子宫内膜异位症 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 576 | 2025-02-18 |
Peptide amphiphiles alleviate myocardial endoplasmic reticulum stress to enhance cardiomyocyte-macrophage communication and promote macrophage M2 polarization
2025-Feb-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2024.12.042
PMID:39710208
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研究论文 | 本研究开发了一种级联响应药物递送系统CT-PA@Sal，用于靶向受损心肌细胞并控制ER应激抑制剂Salubrinal的释放，以改善心肌缺血再灌注损伤 | 开发了一种新型级联响应药物递送系统CT-PA@Sal，具有优越的靶向效率和增强的药物生物利用度，能够在受损心肌细胞内实现响应性释放 | 缺乏针对受损心肌细胞的有效ER应激抑制剂是机制理解转化为治疗实施的主要障碍 | 开发一种靶向药物递送系统，以治疗心肌缺血再灌注损伤 | 心肌细胞和巨噬细胞 | 生物医学工程 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序和生物信息学分析 | NA | NA | NA |
| 577 | 2025-02-18 |
Prevention of Intrauterine Adhesion with Platelet-Rich Plasma Double-Network Hydrogel
2025-Feb, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400336
PMID:39673358
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研究论文 | 本研究探讨了血小板富集血浆双网络水凝胶（DN凝胶）在预防宫腔粘连（IUA）中的应用及其效果 | 创新性地开发了一种基于海藻酸钠的血小板富集血浆双网络水凝胶，通过单细胞测序分析其促进子宫内膜再生和增强子宫内膜接受性的机制 | 研究未提及DN凝胶的长期效果和潜在副作用 | 研究目的是评估DN凝胶在预防和治疗宫腔粘连中的效果 | 研究对象为宫腔粘连患者 | 生物医学工程 | 妇科疾病 | 单细胞测序 | NA | 生物样本数据 | 未明确提及样本数量 |
| 578 | 2025-02-17 |
Developmental Origins and Oncogenesis in Medulloblastoma
2025-Feb-14, Annual review of neuroscience
IF:12.1Q1
|
研究论文 | 本文探讨了髓母细胞瘤的发育起源和致癌机制，特别是通过单细胞转录组学研究揭示了潜在的细胞谱系脆弱性和恶性转化的机制 | 通过单细胞转录组学研究揭示了髓母细胞瘤的细胞起源和恶性转化机制，强调了遗传-表观遗传改变在肿瘤形成中的作用 | 未提及具体的研究样本数量或实验设计细节 | 理解髓母细胞瘤的细胞起源和致癌机制，以预防肿瘤形成和复发 | 髓母细胞瘤的细胞起源、遗传和表观遗传改变 | 癌症研究 | 髓母细胞瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 579 | 2025-02-17 |
PD-L1 Promotes Immunological Tolerance and Enhances Visual Protection of hESC-RPE Grafts in Retinal Degeneration
2025-Feb-14, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.70007
PMID:39953740
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研究论文 | 本研究探讨了PD-L1过表达在人类胚胎干细胞衍生的视网膜色素上皮（hESC-RPE）移植中对免疫排斥的抑制作用及其对视网膜退行性疾病的视觉保护效果 | 提出了一种无需删除MHC基因的PD-L1过表达策略，保留了hESC-RPE对NK细胞的免疫抑制功能，并显著提高了移植物的存活率和视觉保护效果 | 研究主要基于动物模型，尚未在人体中进行验证 | 提高hESC-RPE移植治疗年龄相关性黄斑变性（AMD）的效率 | 人类胚胎干细胞衍生的视网膜色素上皮（hESC-RPE） | 生物医学工程 | 年龄相关性黄斑变性（AMD） | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 视网膜退行性模型中的hESC-RPE移植物 |
| 580 | 2025-02-17 |
Analysis of microarray and single-cell RNA-seq identifies gene co-expression, cell-cell communication, and tumor environment associated with metabolite interconversion enzyme in prostate cancer
2025-Feb-13, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01926-4
PMID:39946051
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研究论文 | 本研究通过基因表达微阵列数据、单细胞RNA测序、癌基因和肿瘤抑制基因，利用生物信息学技术分析了前列腺癌中与代谢物互变酶相关的差异表达基因的相互作用网络 | 这种分析在之前的研究中尚未有记录 | NA | 提供关于前列腺癌中差异表达基因的分子特性和通路的新视角，并揭示在前列腺癌发生和进展中起关键作用的潜在生物标志物 | 前列腺癌 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 基因表达微阵列、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |