单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202502-202502] [清除筛选条件]
当前共找到 639 篇文献,本页显示第 561 - 580 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
561 2025-10-07
Splicing diversity enhances the molecular classification of pituitary neuroendocrine tumors
2025-Feb-11, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过批量RNA测序和全长单细胞RNA测序分析垂体神经内分泌肿瘤的剪接多样性,揭示了剪接失调在肿瘤异质性中的重要作用 首次在垂体神经内分泌肿瘤中系统研究选择性剪接的多样性,发现剪接失调能更好描绘肿瘤异质性并识别新的肿瘤亚型 未明确说明样本数量和研究人群特征 通过分析选择性剪接多样性来改进垂体神经内分泌肿瘤的分子分类 垂体神经内分泌肿瘤(PitNETs) 生物信息学 垂体神经内分泌肿瘤 RNA测序,单细胞RNA测序 NA RNA测序数据,单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA 全长单细胞RNA测序
562 2025-10-07
Tendomodulin in pan-cancer analysis: exploring its impact on immune modulation and uncovering functional insights in colorectal cancer
2025-Feb-11, BMC cancer IF:3.4Q2
研究论文 本研究通过泛癌分析和实验验证探讨了肌腱调节素在结直肠癌中的免疫调节功能和促转移作用 首次系统揭示TNMD在泛癌中的表达特征及其在结直肠癌免疫微环境中的调节作用,特别是在MSI-H和MSS患者中的差异化免疫关联 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,需要更多体内实验和临床样本验证 探索肌腱调节素在泛癌中的表达特征及其在结直肠癌中的免疫调节功能和分子机制 结直肠癌组织和细胞系,泛癌数据库 生物信息学 结直肠癌 免疫荧光,免疫组化,实时定量PCR,Western blotting,细胞迁移实验,单细胞测序 NA 基因表达数据,临床数据,单细胞测序数据 多个公共数据库和实验验证样本 NA 单细胞测序 NA NA
563 2025-10-07
HGATLink: single-cell gene regulatory network inference via the fusion of heterogeneous graph attention networks and transformer
2025-Feb-11, BMC bioinformatics IF:2.9Q1
研究论文 提出一种名为HGATLink的单细胞基因调控网络推断框架,通过融合异构图注意力网络和transformer来提升推断准确性 结合异构图注意力网络和简化transformer,通过矩阵分解技术在低维空间中有效捕获基因间复杂相互作用,增强对复杂异构图结构的建模能力并缓解传递性相互作用 NA 开发更准确的单细胞基因调控网络推断方法 基因调控网络 机器学习 NA 单细胞RNA测序 异构图注意力网络, transformer 单细胞基因表达数据 14个scRNA-seq数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
564 2025-10-07
Carboxylesterase 1-mediated endocannabinoid metabolism in skin: role in melanoma progression in BRafV600E/Pten-/- mice
2025-Feb-11, Cancer & metabolism IF:6.0Q1
研究论文 本研究首次揭示了皮肤中羧酸酯酶1介导的内源性大麻素代谢在黑色素瘤进展中的作用 首次证明CES1在皮肤中的表达及其通过降解2-AG促进黑色素瘤进展的新机制 研究主要基于基因工程小鼠模型,人类样本验证有限 探究内源性大麻素代谢在黑色素瘤进展中的分子机制 BRafV600E/Pten-/-基因工程小鼠黑色素瘤模型 癌症生物学 黑色素瘤 靶向代谢组学、化学蛋白质组学、活性蛋白质谱分析、靶向脂质组学、放射性示踪检测、单细胞RNA测序 NA 代谢组数据、蛋白质组数据、单细胞转录组数据 基因工程小鼠黑色素瘤组织与正常皮肤组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
565 2025-10-07
Induction of the p21/CDK6 pathway and alteration of the immune microenvironment by the stem cell marker CBX3 in melanoma
2025-Feb-11, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1
研究论文 本研究探讨干细胞标志物CBX3通过激活p21/CDK6通路和改变免疫微环境促进黑色素瘤进展的机制 首次揭示CBX3在黑色素瘤中通过调控p21/CDK6通路影响细胞周期并改变肿瘤免疫微环境 机制研究仍需深入,临床转化价值有待验证 阐明CBX3在黑色素瘤发生发展中的作用及其对免疫治疗的潜在影响 黑色素瘤细胞系、动物模型和公共数据库数据 肿瘤生物学 黑色素瘤 单细胞RNA测序,流式细胞术,qPCR,Western blotting,CCK8,克隆形成,伤口愈合,Transwell NA 基因表达数据,蛋白质数据,单细胞测序数据 公共数据库和实验样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
566 2025-10-07
Hypoxia-Mimicking Microenvironment Scaffold for Enhanced Tendon Regeneration
2025-Feb-12, ACS applied materials & interfaces IF:8.3Q1
研究论文 本研究开发了一种模拟缺氧环境的PCL-DFOA支架,用于增强肌腱组织再生 首次发现缺氧在肌腱修复中的关键作用,并开发了能模拟缺氧环境的生物材料支架 NA 探索肌腱愈合的细胞机制并开发促进肌腱再生的治疗策略 肌腱组织、巨噬细胞、内皮细胞、成纤维细胞 组织工程 肌腱损伤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
567 2025-10-07
Contrasting cytotoxic and regulatory T cell responses underlying distinct clinical outcomes to anti-PD-1 plus lenvatinib therapy in cancer
2025-Feb-10, Cancer cell IF:48.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞分析揭示了抗PD-1联合乐伐替尼治疗肝癌的免疫机制,识别了与治疗响应和耐药相关的T细胞亚群 首次通过单细胞转录组和TCR克隆型分析,揭示了GZMK CD8 Teff/Tem细胞中包含未被认识的循环Tem细胞,并发现KIR CD8 T细胞和FOXP3 CD4调节性T细胞在联合治疗无应答者中特异性富集 研究仅针对肝细胞癌患者,样本量有限,且机制研究仍需进一步功能验证 探究抗PD-1联合乐伐替尼治疗癌症的免疫学机制和临床疗效差异的原因 肝细胞癌患者治疗前后的T细胞 单细胞生物学 肝癌 单细胞转录组测序, T细胞受体克隆型分析 NA 单细胞RNA测序数据, TCR序列数据 肝细胞癌患者治疗前后样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
568 2025-10-07
ITGA5+ synovial fibroblasts orchestrate proinflammatory niche formation by remodelling the local immune microenvironment in rheumatoid arthritis
2025-Feb, Annals of the rheumatic diseases IF:20.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞和空间转录组学鉴定了一个新型ITGA5+滑膜成纤维细胞亚群,揭示了其在类风湿关节炎中通过重塑免疫微环境促进疾病进展的机制 首次鉴定出具有独特转录特征的ITGA5+滑膜成纤维细胞亚群,并发现其通过分泌TGF-β1诱导外周辅助T细胞分化,从而促进炎症微环境形成 研究样本量有限,细胞间相互作用的机制验证仍需进一步深入 探究滑膜成纤维细胞的表型异质性及其在类风湿关节炎炎症反应中的作用 骨关节炎、持续缓解期和活动期类风湿关节炎患者的滑膜组织和细胞 数字病理学 类风湿关节炎 单细胞转录组学, 空间转录组学, 免疫组织化学, 多重免疫荧光, 流式细胞术, 细胞共培养, 过继转移, 批量RNA测序 反卷积方法 基因表达数据, 图像数据 来自PEAC和R4RA两个队列的患者样本,以及胶原诱导关节炎小鼠模型 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 NA NA
569 2025-10-07
Cell and transcriptomic diversity of infrapatellar fat pad during knee osteoarthritis
2025-Feb, Annals of the rheumatic diseases IF:20.3Q1
研究论文 本研究通过多组学方法揭示了膝骨关节炎患者髌下脂肪垫的细胞和转录组多样性 首次提供了人类髌下脂肪垫细胞和转录组多样性的全面图谱,确定了与膝骨关节炎疾病、性别和肥胖相关的关键细胞类型 样本量相对有限(21个样本),需要更大规模研究验证发现 鉴定髌下脂肪垫主要细胞类型及其转录组特征,确定基于膝骨关节炎、性别和肥胖状态的差异 人类髌下脂肪垫组织 单细胞组学 膝骨关节炎 单细胞核RNA测序,空间转录组学,代谢组学,生物信息学分析 NA 单细胞转录组数据,空间转录组数据,代谢组数据 21个髌下脂肪垫样本(6个健康对照,15个膝骨关节炎患者) NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
570 2025-10-07
A single-cell transcriptome analysis reveals astrocyte heterogeneity and identifies CHI3L1 as a diagnostic biomarker in Parkinson's disease
2025-Feb-15, Heliyon IF:3.4Q1
研究论文 通过单细胞转录组分析揭示了帕金森病中星形胶质细胞的异质性,并鉴定出CHI3L1作为诊断生物标志物 首次在帕金森病中识别出三种星形胶质细胞亚群,发现Astro-C0亚群处于分化中间阶段并与炎症信号通路相关,鉴定CHI3L1作为潜在诊断标志物 研究依赖于公共数据库数据,样本量有限,需要进一步实验验证 识别帕金森病中星形胶质细胞的异质性并研究其分化轨迹相关基因 帕金森病患者和正常对照的黑质区细胞 单细胞转录组学 帕金森病 单细胞RNA测序, qRT-PCR, Western Blot Monocle2, AUCell 单细胞转录组数据 从GEO数据库收集的帕金森病样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
571 2025-10-07
Single-cell pseudotime and intercellular communication analysis reveals heterogeneity and immune microenvironment in oral cancer
2025-Feb-10, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序、拟时序分析和细胞间通讯分析揭示口腔癌的异质性和免疫微环境特征 首次在口腔癌中整合单细胞RNA测序、拟时序分析和细胞间通讯网络分析,提供了关于肿瘤异质性的新视角 NA 研究口腔癌发展过程中的细胞亚型、状态转换和细胞间相互作用及其在肿瘤进展和免疫应答中的作用 口腔癌肿瘤微环境中的细胞 单细胞分析 口腔癌 单细胞RNA测序, 拟时序分析, 细胞间通讯分析, PCA, UMAP, t-SNE, GSEA NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
572 2025-10-07
The expression and functional role of proline-rich 15 in non-small cell lung cancer
2025-Feb-10, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究探讨脯氨酸丰富蛋白15在非小细胞肺癌中的表达模式、功能作用及分子机制 首次系统揭示PRR15在非小细胞肺癌中的致癌功能及其通过Akt-mTOR信号通路的作用机制 主要基于细胞系和异种移植模型,缺乏直接临床干预验证 探索PRR15在非小细胞肺癌发生发展中的生物学功能 非小细胞肺癌组织样本、原代及已建系NSCLC细胞、异种移植模型 癌症生物学 肺癌 单细胞RNA测序、shRNA干扰、CRISPR/Cas9基因敲除、慢病毒过表达 NA 基因表达数据、蛋白质印迹数据、细胞功能实验数据 NSCLC组织样本与正常肺组织对比、多种NSCLC细胞系 NA 单细胞RNA测序 NA NA
573 2025-10-07
Genome-wide characterization of circular RNAs in three rat models of pulmonary hypertension reveals distinct pathological patterns
2025-Feb-10, BMC genomics IF:3.5Q2
研究论文 通过高通量RNA测序分析三种肺动脉高压大鼠模型中环状RNA的全基因组表达模式 首次在三种肺动脉高压大鼠模型中全面揭示circRNA调控网络,发现不同模型特异的circRNA分布模式 研究仅限于大鼠模型,人类样本验证不足 探索环状RNA在肺动脉高压发病机制中的作用 三种肺动脉高压大鼠模型的肺动脉组织 生物信息学 肺动脉高压 高通量RNA测序, 单细胞RNA测序 加权基因共表达网络 RNA测序数据 三种大鼠模型(缺氧、缺氧/Sugen5416、野百合碱诱导) NA RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
574 2025-10-07
Single-cell transcriptomics reveals the alteration of immune cell profile in peripheral blood of Henoch-Schonlein purpura
2025-Feb-07, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
研究论文 通过单细胞转录组学揭示过敏性紫癜患者外周血免疫细胞谱的变化 首次结合单细胞RNA测序和多参数流式细胞术全面分析HSP患者外周血单个核细胞,发现不同临床亚型HSP的特异性免疫细胞特征 样本量相对有限,未涉及疾病不同阶段的动态追踪 探究过敏性紫癜患者外周血免疫细胞组成和状态的变化 健康供者和过敏性紫癜患者的外周血单个核细胞 单细胞组学 过敏性紫癜 单细胞RNA测序,多参数流式细胞术 NA 单细胞转录组数据,流式细胞数据 健康供者和HSP患者的外周血样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
575 2025-10-07
Dynamic Activation of NADPH Oxidases in Immune Responses Modulates Differentiation, Function, and Lifespan of Plasma Cells
2025-Feb, European journal of immunology IF:4.5Q2
研究论文 本研究通过单细胞技术揭示了NADPH氧化酶在B细胞动态表达及其对浆细胞分化、功能和寿命的调控机制 首次结合单细胞转录组学和单细胞NOX活性检测,系统揭示了NOX1和NOX2在B细胞亚群中的动态表达模式及其与代谢、功能和寿命的关联 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证;未完全阐明ROS与细胞存活之间的具体分子机制 探究NADPH氧化酶活性在B细胞免疫应答中对细胞分化、功能能力和存活的影响 小鼠B细胞(二次免疫后的B细胞应答) 免疫学 NA 单细胞转录组学,单细胞NOX活性检测 NA 单细胞基因表达数据,酶活性数据 未明确样本数量的小鼠B细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
576 2025-10-07
Exploring the therapeutic efficacy difference in claudin18.2-targeted cell therapy revealed by single-cell sequencing
2025-Feb-21, iScience IF:4.6Q1
研究论文 通过单细胞测序探索CLDN18.2靶向细胞疗法的疗效差异机制 首次在CLDN18.2阳性胃癌患者中通过单细胞测序分析CT041 CAR-T治疗的细胞特征与疗效关联 样本量较小(仅5名患者),需更大规模研究验证 探索CAR-T细胞疗法在实体瘤中的疗效差异机制 晚期CLDN18.2阳性胃癌患者 单细胞测序 胃癌 单细胞测序 NA 单细胞RNA测序数据 5名患者的外周血和腹水样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
577 2025-10-07
Single-cell and spatial transcriptomics reveal pre-metastatic subsets and therapeutic targets in penile carcinoma
2025-Feb-21, iScience IF:4.6Q1
研究论文 通过单细胞和空间转录组学技术识别阴茎癌中的前转移亚群并确定治疗靶点 首次在阴茎癌中发现MMP3+SPP1+前转移亚群和CK2α过表达,并验证Silmitasertib的抗肿瘤效果 样本量有限(6例原发癌、6例转移淋巴结、4例晚期癌的单细胞数据) 解析肿瘤异质性并识别前转移亚群及治疗靶点 阴茎癌组织样本 数字病理学 阴茎癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序, 细胞实验 NA 基因表达数据, 空间转录组数据 6例原发阴茎癌、6例转移淋巴结、4例晚期阴茎癌(单细胞数据),另含98个单细胞数据集和6个空间数据集验证 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 NA NA
578 2025-10-07
m6A related metabolic genes in breast cancer and their relationship with prognosis
2025-Feb-20, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过分析乳腺癌中m6A相关代谢基因,构建预后风险模型并验证关键基因 首次整合单细胞转录组和bulk RNA-seq数据系统分析m6A相关代谢基因在乳腺癌中的作用,并构建预后风险模型 研究样本来源有限,主要基于公共数据库数据,需要更多独立队列验证 探索m6A相关代谢基因在乳腺癌预后评估和治疗靶点开发中的价值 乳腺癌患者外周血单细胞数据和TCGA乳腺癌转录组数据 生物信息学 乳腺癌 scRNA-seq, RNA-seq, qRT-PCR, Western blot Lasso-Cox回归模型 单细胞转录组数据,bulk RNA-seq数据 TCGA乳腺癌数据集和患者外周血scRNA-seq数据 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
579 2025-10-07
Dapagliflozin alleviated seizures and cognition impairment in pilocarpine induced status epilepticus via suppressing microglia-mediated neuroinflammation and oxidative stress
2025-Feb-20, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究探讨达格列净通过抑制小胶质细胞介导的神经炎症和氧化应激减轻癫痫持续状态小鼠的癫痫发作和认知障碍 首次发现达格列净通过调节小胶质细胞表型转化和抑制SLC5A2表达发挥抗癫痫和神经保护作用 研究仅使用雄性小鼠和体外细胞模型,缺乏临床验证和性别差异分析 研究达格列净对癫痫持续状态引起的癫痫发作和认知障碍的治疗作用及机制 雄性C57BL/6小鼠、BV2小胶质细胞系、癫痫患者样本 神经科学 癫痫 单细胞转录组分析、免疫荧光染色、免疫组化、流式细胞术、Western blot、RT-qPCR、ELISA 毛果芸香碱诱导的癫痫持续状态小鼠模型、LPS诱导的神经炎症细胞模型 基因表达数据、蛋白质数据、行为学数据 动物模型和细胞实验,具体样本量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
580 2025-10-07
Exploring the dynamic responses of group 3 innate lymphoid cells at different times in response to LPS challenge
2025-Feb-20, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过整合微阵列和单细胞RNA测序数据,探索了第3组先天淋巴细胞在LPS攻击后不同时间点的动态响应 首次结合微阵列和单细胞RNA测序数据揭示肠道ILC3可能迁移至肺部的机制,并系统分析LPS攻击后不同时间点ILC3的动态变化 研究主要依赖公共数据库数据,需要进一步实验验证ILC3迁移机制 阐明ILC3在LPS诱导的急性肺部炎症中的动态响应机制 第3组先天淋巴细胞(ILC3s) 免疫学 肺部炎症 微阵列, 单细胞RNA测序, 流式细胞术, qRT-PCR NA 基因表达数据, 单细胞测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
回到顶部