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当前共找到 639 篇文献，本页显示第 541 - 560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 541 | 2025-10-07 |
Deconvolution and inference of spatial communication through optimization algorithm for spatial transcriptomics
2025-Feb-14, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-07625-8
PMID:39948133
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研究论文 | 提出一种结合单细胞RNA测序和空间信息的空间转录组解卷积方法NODE | 开发了同时整合细胞类型特异性信息和细胞间通讯的空间解卷积算法 | NA | 改进空间转录组数据的细胞类型解卷积和空间通讯推断 | 空间转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 非负最小二乘法, 优化搜索算法 | 基因表达数据, 空间位置数据 | 四个数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 542 | 2025-10-07 |
Cryoablation-induced modulation of Treg cells and the TGF-β pathway in lung adenocarcinoma: implications for increased antitumor immunity
2025-Feb-14, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-025-03926-1
PMID:39948553
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研究论文 | 本研究探讨了冷冻消融通过调节Treg细胞和TGF-β通路增强肺腺癌抗肿瘤免疫的机制 | 首次通过单细胞测序和动物模型系统揭示冷冻消融通过TGF-β通路抑制Treg细胞增强抗肿瘤免疫的新机制 | 研究样本量有限，临床观察时间较短，需要更大规模临床试验验证 | 探索冷冻消融对肺腺癌局部免疫微环境的影响及其抗肿瘤免疫机制 | 肺腺癌患者组织样本、小鼠肿瘤模型、体外细胞培养 | 肿瘤免疫学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq, 细胞冷冻消融, 小鼠皮下肿瘤移植模型 | 动物模型, 细胞模型 | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 未明确具体样本数量，包括患者组织、外周血样本和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 543 | 2025-10-07 |
Interpretable AI for inference of causal molecular relationships from omics data
2025-Feb-14, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adk0837
PMID:39951525
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研究论文 | 提出一种可解释AI方法CIMLA，用于从组学数据中推断因果分子关系 | 证明了在特定假设下，流行的特征归因模型能够估计反映变量间直接影响的因果量平均值，并基于此提出了基因调控关系的精确定义 | 需要特定假设条件才能保证因果推断的有效性 | 从高维组学数据中发现因果分子关系，识别不同生物条件下基因调控网络的差异 | 基因调控网络，阿尔茨海默病相关基因调控关系 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 特征归因模型 | 组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 544 | 2025-10-07 |
Chronic exposure to glucocorticoids amplifies inhibitory neuron cell fate during human neurodevelopment in organoids
2025-Feb-14, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adn8631
PMID:39951527
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研究论文 | 本研究利用单细胞技术探究糖皮质激素暴露对人类神经类器官发育过程中基因调控和谱系分化的影响 | 首次在人类神经类器官模型中揭示慢性糖皮质激素暴露通过特定转录因子促进抑制性神经元谱系分化的分子机制 | 研究基于非指导性神经类器官模型，可能无法完全模拟体内复杂的神经发育环境 | 探究环境因素（糖皮质激素）对人类神经发育过程中谱系分化的影响机制 | 人类神经类器官 | 发育神经生物学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞转录组测序, 染色质可及性分析 | 人类神经类器官模型 | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 545 | 2025-10-07 |
Dissecting the role of CAR signaling architectures on T cell activation and persistence using pooled screens and single-cell sequencing
2025-Feb-14, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adp4008
PMID:39951542
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研究论文 | 通过组合CAR信号域库、重复抗原刺激实验和单细胞测序，系统研究CAR信号架构对T细胞活化和持久性的影响 | 设计组合CAR信号域文库，结合体外筛选与临床结果关联，建立临床信息指导的筛选方法 | NA | 研究CAR信号架构如何影响T细胞功能和持久性 | CAR-T细胞 | 单细胞生物学 | 癌症 | 单细胞测序, 组合文库筛选, 重复抗原刺激实验 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 546 | 2025-02-17 |
Comprehensive analysis of cytokine and chemokine gene expression in IgG4-related disease by spatial transcriptomics
2025-Feb-14, Allergology international : official journal of the Japanese Society of Allergology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.alit.2024.12.010
PMID:39952877
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 547 | 2025-10-07 |
Analysis of microarray and single-cell RNA-seq identifies gene co-expression, cell-cell communication, and tumor environment associated with metabolite interconversion enzyme in prostate cancer
2025-Feb-13, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01926-4
PMID:39946051
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研究论文 | 通过微阵列和单细胞RNA测序分析前列腺癌中代谢物互变酶相关的基因共表达、细胞间通讯和肿瘤微环境 | 首次结合基因表达微阵列数据、单细胞RNA测序、癌基因和抑癌基因分析前列腺癌中代谢物互变酶相关差异表达基因的互作网络 | NA | 探索前列腺癌中分子特性和通路，发现在前列腺癌发生发展中起关键作用的潜在生物标志物 | 前列腺癌患者 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 微阵列, 单细胞RNA测序, 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 基因表达微阵列 | NA | NA |
| 548 | 2025-10-07 |
Mitochondrial carrier homolog 2 is important for mitochondrial functionality and non-small cell lung cancer cell growth
2025-Feb-13, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07419-0
PMID:39948081
|
研究论文 | 本研究探讨线粒体载体同源物2(MTCH2)在非小细胞肺癌中的表达及其通过调控线粒体功能促进肿瘤生长的作用机制 | 首次系统揭示MTCH2在非小细胞肺癌中的过表达现象及其通过维持线粒体超功能促进肿瘤生长的分子机制 | 研究主要基于细胞系和动物模型，尚未在临床患者中进行验证 | 探索MTCH2作为非小细胞肺癌新型治疗靶点的潜力 | 非小细胞肺癌细胞系、原代NSCLC细胞、裸鼠皮下移植瘤模型 | 癌症生物学 | 肺癌 | 生物信息学分析、单细胞测序、CRISPR/Cas9基因敲除、shRNA沉默、腺相关病毒载体 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据、蛋白质印迹数据 | 多种原代/已建立的NSCLC细胞系及裸鼠移植瘤模型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 549 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomic atlas of the chicken cecum reveals cellular responses and state shifts during Eimeria tenella infection
2025-Feb-13, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-11302-9
PMID:39948469
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序构建鸡盲肠细胞图谱，揭示艾美耳球虫感染期间的细胞响应和状态变化 | 首次构建鸡盲肠单细胞转录组图谱，揭示艾美耳球虫感染导致的APOB肠细胞减少和T细胞增殖等细胞组成变化 | 未明确说明样本数量和研究设计的局限性 | 研究艾美耳球虫感染对鸡盲肠细胞组成和功能的影响 | 鸡盲肠细胞 | 单细胞组学 | 寄生虫感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 7,394个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 550 | 2025-10-07 |
Unveiling the crucial role of glycosylation modification in lung adenocarcinoma metastasis through artificial neural network-based spatial multi-omics single-cell analysis and Mendelian randomization
2025-Feb-13, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-13650-x
PMID:39948531
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学方法揭示了糖基化修饰在肺腺癌转移中的关键作用 | 首次结合人工神经网络、空间多组学单细胞分析和孟德尔随机化方法系统研究肺腺癌中糖基化修饰的功能 | NA | 阐明糖基化修饰在肺腺癌中的作用并识别潜在生物靶点 | 肺腺癌组织和细胞系 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 人工神经网络, 孟德尔随机化 | 人工神经网络 | 转录组数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 551 | 2025-10-07 |
Integrative machine learning model of RNA modifications predict prognosis and treatment response in patients with breast cancer
2025-Feb-13, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03651-y
PMID:39948551
|
研究论文 | 开发基于RNA修饰的机器学习模型预测乳腺癌患者预后和治疗反应 | 整合九种RNA修饰类型构建综合机器学习特征(CMRS)，首次系统评估RNA修饰在乳腺癌预后和治疗反应中的作用 | 回顾性研究设计，需要前瞻性验证；样本来源为多个独立队列，可能存在批次效应 | 探索RNA修饰在乳腺癌预后和治疗反应中的作用，开发预测模型 | 乳腺癌患者 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学，多组学分析 | 机器学习模型 | RNA测序数据，单细胞数据，临床数据 | 15个独立乳腺癌队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 552 | 2025-10-07 |
TIGIT expression in extrahepatic cholangiocarcinoma and its impact on CD8 + T cell exhaustion: implications for immunotherapy
2025-Feb-12, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07388-4
PMID:39939322
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析肝外胆管癌中TIGIT表达对CD8+T细胞耗竭的影响 | 首次在肝外胆管癌中系统揭示TIGIT通过促进CD8+T细胞耗竭发挥免疫抑制作用 | 研究样本量有限，需要更大规模临床验证 | 探究TIGIT在肝外胆管癌免疫微环境中的作用机制 | 肝外胆管癌肿瘤浸润淋巴细胞 | 单细胞测序分析 | 肝外胆管癌 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，免疫组织化学，患者来源异种移植模型 | 患者来源异种移植模型 | 单细胞RNA测序数据，流式细胞数据，免疫组化数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 553 | 2025-10-07 |
SpaCcLink: exploring downstream signaling regulations with graph attention network for systematic inference of spatial cell-cell communication
2025-Feb-12, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-025-02141-x
PMID:39939849
|
研究论文 | 提出一种考虑细胞内下游信号调控的空间细胞通讯分析方法SpaCcLink | 首次将图注意力网络应用于系统推断空间细胞通讯中的下游信号调控网络 | 未明确说明方法在特定组织类型或疾病状态下的适用性限制 | 系统解析细胞间通讯的空间模式及下游信号网络 | 人类和小鼠的空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组技术 | 图注意力网络(GAT) | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 554 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome analysis reveals the dysregulated monocyte state associated with tuberculosis progression
2025-Feb-12, BMC infectious diseases
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12879-025-10612-3
PMID:39939918
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示结核病进展中单细胞亚群的失调状态 | 首次通过单细胞RNA测序结合生物信息学分析揭示单细胞从经典到中间再到非经典亚群的分化轨迹异常是结核病发病的关键机制 | 基于公共数据库SRP247583的二次分析，缺乏实验验证 | 研究单细胞亚群在结核病免疫应答中的作用机制 | 结核病患者单细胞 | 生物信息学 | 结核病 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析 | 伪时间分析，细胞通讯分析 | 单细胞转录组数据 | 公共数据库SRP247583中的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 555 | 2025-10-07 |
Integrating Hypoxia Signatures from scRNA-seq and Bulk Transcriptomes for Prognosis Prediction and Precision Therapy in Cervical Squamous Cell Carcinoma and Endocervical Adenocarcinoma
2025-Feb-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26031362
PMID:39941131
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据构建了宫颈鳞癌和腺癌特异性缺氧相关评分风险模型 | 首次识别了CESC特异性缺氧基因集，并构建了能够全面评估肿瘤微环境特征的CSHRS风险模型 | NA | 开发宫颈鳞癌和腺癌的预后预测模型和精准治疗方案 | 宫颈鳞状细胞癌和宫颈内膜腺癌(CESC) | 生物信息学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, WGCNA, LASSO回归, Cox回归分析 | CSHRS风险模型, 列线图模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序 | NA | NA |
| 556 | 2025-10-07 |
H4K12 Lactylation Activated-Spp1 in Reprogrammed Microglia Improves Functional Recovery After Spinal Cord Injury
2025-Feb, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.70232
PMID:39939834
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研究论文 | 本研究揭示了H4K12乳酸化激活的Spp1在重编程小胶质细胞中通过促进神经元成熟和线粒体功能改善脊髓损伤后功能恢复的新机制 | 首次发现H4K12乳酸化通过激活Spp1转录在脊髓损伤后小胶质细胞重编程中的作用机制 | NA | 探索SPP1信号通路在脊髓损伤中的功能和调控机制，及其作为治疗靶点的潜力 | 小胶质细胞/巨噬细胞、神经元、脊髓损伤模型 | 单细胞生物学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序，假时序分析，DNA-pulldown | NA | 单细胞RNA测序数据，体外和体内实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 557 | 2025-10-07 |
Cannabidiol restores hematopoietic stem cell stemness in mouse through Atf2-Lrp6 axis after acute irradiation
2025-Feb, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70092
PMID:39949985
|
研究论文 | 本研究探讨了大麻二酚通过Atf2-Lrp6轴恢复急性辐射后小鼠造血干细胞干性的机制 | 首次揭示大麻二酚通过上调Atf2转录因子恢复辐射损伤的造血干细胞功能，并发现Atf2-Lrp6轴在其中的关键作用 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未进行临床验证 | 探索大麻二酚对急性辐射诱导的造血损伤的保护作用及分子机制 | 小鼠造血干细胞和祖细胞 | 干细胞生物学 | 辐射性造血损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 558 | 2025-10-07 |
A novel gene signature for predicting outcome in colorectal cancer patients based on tumor cell-endothelial cell interaction via single-cell sequencing and machine learning
2025-Feb-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2025.e42237
PMID:39944338
|
研究论文 | 通过单细胞测序和机器学习开发基于肿瘤细胞-内皮细胞相互作用的结直肠癌预后预测模型 | 首次结合单细胞RNA测序和机器学习识别与结直肠癌预后相关的肿瘤细胞-内皮细胞相互作用特征 | 计算生物学研究，需要实验验证 | 开发结直肠癌预后预测模型 | 结直肠癌患者 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 多个数据库的结直肠癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 559 | 2025-10-07 |
Benchmarking the translational potential of spatial gene expression prediction from histology
2025-Feb-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56618-y
PMID:39934114
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研究论文 | 对11种从组织学图像预测空间基因表达的方法进行全面基准测试 | 首次对空间基因表达预测方法进行系统性基准评估，包含多种性能指标和外部验证 | 仅评估了11种方法，可能未涵盖所有现有方法 | 评估从组织学图像预测空间基因表达的翻译潜力 | 空间转录组学数据和组织学图像 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学，组织学成像 | NA | 图像，基因表达数据 | 5个空间转录组学数据集和TCGA数据 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 560 | 2025-10-07 |
Analysis of effector/memory regulatory T cells from arrhythmogenic cardiomyopathy patients identified IL-32 as a novel player in ACM pathogenesis
2025-Feb-11, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07364-y
PMID:39934117
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研究论文 | 本研究通过分析心律失常性心肌病患者的免疫细胞特征，首次发现IL-32在疾病发病机制中的新作用 | 首次对ACM患者循环免疫细胞进行完整表征，发现记忆性调节T细胞中IL-32的高表达及其在心脏纤维脂肪替代中的潜在作用 | 研究样本量有限，主要基于体外实验验证，需要进一步体内研究确认机制 | 阐明免疫细胞在心律失常性心肌病发病机制中的作用 | 心律失常性心肌病患者的外周血单核细胞和心脏间充质基质细胞 | 单细胞组学 | 心律失常性心肌病 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | ACM患者和健康对照的外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |