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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2025-10-07 |
A morphological cell atlas of the freshwater sponge Ephydatia muelleri with key insights from targeted single-cell transcriptomes
2025-Feb-14, EvoDevo
IF:4.1Q1
DOI:10.1186/s13227-025-00237-7
PMID:39953556
|
研究论文 | 本研究通过构建淡水海绵Ephydatia muelleri的形态学细胞图谱并结合靶向单细胞转录组分析,揭示了海绵细胞类型的多样性和功能复杂性 | 首次描述了海绵中多种新型细胞特征,包括极化外上皮、新型收缩筛细胞、动纤毛和非动纤毛细胞,并通过活细胞成像展示了中胶层运动细胞的独特行为特征 | 研究主要聚焦于单一海绵物种,对非两侧对称动物形态学的理解仍有限,可能无法完全代表所有海绵物种的细胞多样性 | 旨在弥合两侧对称动物与非两侧对称动物在细胞和组织层面理解的差距,探索动物细胞类型和组织结构的进化起源 | 淡水海绵Ephydatia muelleri的细胞和组织类型 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞转录组测序,活细胞成像 | NA | 转录组数据,形态学图像 | 三种细胞类型(囊细胞、领细胞和原始细胞)的活细胞样本,其中包含5个领细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 522 | 2025-10-07 |
Integrated bulk and single-cell RNA sequencing to identify potential biomarkers in intervertebral disc degeneration
2025-Feb-14, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-02346-4
PMID:39953636
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研究论文 | 通过整合bulk和单细胞RNA测序识别椎间盘退变中的潜在生物标志物 | 首次结合hdWGCNA和Monocle3伪时间序列分析,整合bulk和单细胞测序数据识别椎间盘退变关键基因 | 样本量有限,需要更大规模研究验证基因标志物的临床适用性 | 识别椎间盘退变的潜在生物标志物并阐明其发病机制 | 退变性髓核组织和正常髓核组织 | 生物信息学 | 椎间盘退变 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 机器学习, PCR, 组织染色 | SVM-RFE, 随机森林 | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 523 | 2025-10-07 |
Tissue-Resident Regulatory T Cells Expressing CD83 Maintain Local Homeostasis and Restrict Th2 Responses in Asthma
2025-Feb, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202451525
PMID:39955650
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研究论文 | 本研究首次揭示了肺组织驻留调节性T细胞表达CD83在维持局部稳态和限制哮喘中Th2反应的关键作用 | 首次阐明CD83在非淋巴组织Tregs中的生物学意义,发现CD83缺失导致Tregs分化不足但过度激活,进而加剧哮喘疾病进展 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探究肺组织驻留Tregs表达CD83在稳态和哮喘状态下的功能作用 | 肺组织驻留调节性T细胞和哮喘模型小鼠 | 免疫学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序,基因敲除模型 | CD83条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,细胞表型分析 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 524 | 2025-10-07 |
Single-Cell Transcriptome Decoding Umbilical Cord-Derived Mesenchymal Stem Cell Heterogeneity Reveals a Unique IL1R1HighPDGFRAHigh Ultroser-G-MSC With Osteogenesis and Chondrogenesis Signatures
2025-Feb, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.70004
PMID:39956958
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了人脐带间充质干细胞在不同培养系统中的异质性,并鉴定出具有高成骨和软骨形成潜能的IL1R1HighPDGFRAHigh Ultroser-G-MSC亚群 | 首次创建了hUC-MSC在不同培养系统中的单细胞转录组图谱,鉴定出具有独特IL1R1和PDGFRA高表达的Ultroser-G-MSC功能亚群,并发现Wnt5信号通路是成骨和软骨形成表型动态转化的关键通路 | 研究主要聚焦于体外培养系统,需要进一步体内实验验证其临床应用的可行性和安全性 | 阐明人脐带间充质干细胞在不同培养系统中的异质性来源,以指导hUC-MSCs的精准临床应用 | 人脐带间充质干细胞(hUC-MSCs) | 单细胞转录组学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 525 | 2025-10-07 |
Therapeutic Potential of Inhibiting Hmox1 in Sepsis-Induced Lung Injury: A Molecular Mechanism Study
2025-Feb, Journal of biochemical and molecular toxicology
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jbt.70134
PMID:39959930
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研究论文 | 本研究揭示了Hmox1抑制剂通过激活FSP1/CoQ10/NADPH通路增强自噬活性并抑制铁死亡,从而减轻脓毒症诱导的肺损伤 | 首次发现Hmox1抑制剂通过调控自噬-铁死亡通路缓解脓毒症肺损伤的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞实验,需要进一步临床验证 | 探索Hmox1抑制剂对脓毒症诱导肺损伤的治疗潜力及分子机制 | 肺泡上皮细胞和脓毒症小鼠模型 | 分子机制研究 | 脓毒症肺损伤 | RNA-seq, scRNA-seq, 透射电子显微镜 | NA | 转录组数据, 细胞实验数据, 动物实验数据 | 多个公共数据集(GSE236391, GSE263867, GSE207651)和实验模型 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 526 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomic analysis identifies epithelium-macrophage crosstalk in endometriotic lesions
2025-Feb-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.111790
PMID:39935459
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研究论文 | 通过空间转录组学分析揭示了子宫内膜异位病灶中上皮细胞与巨噬细胞之间的相互作用机制 | 首次发现浅表腹膜子宫内膜异位病灶上皮细胞通过补体3驱动炎症信号并促进巨噬细胞向促修复表型转化 | 仅关注浅表腹膜病灶,未涉及其他类型子宫内膜异位病变 | 阐明子宫内膜异位病灶中细胞类型特异性基因表达变化及细胞间通讯机制 | 子宫内膜异位病灶和患者匹配的在位子宫内膜组织 | 空间转录组学 | 子宫内膜异位症 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 患者匹配的子宫内膜异位病灶和在位子宫内膜组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 527 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome sequencing in synovial joint: insights of new progenitors and targets in joint development and disease
2025-Feb-17, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxaf008
PMID:39957282
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综述 | 本文综述了单细胞转录组测序技术在滑膜关节发育和疾病研究中的应用与进展 | 系统总结了单细胞测序技术在揭示滑膜关节细胞异质性、发育机制和疾病病理方面的新见解 | NA | 探讨单细胞转录组测序在滑膜关节发育和疾病研究中的应用价值 | 滑膜关节(包括膝关节、颞下颌关节和脊柱关节) | 单细胞组学 | 骨关节炎、类风湿关节炎、椎间盘退变 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 528 | 2025-10-07 |
Peptide amphiphiles alleviate myocardial endoplasmic reticulum stress to enhance cardiomyocyte-macrophage communication and promote macrophage M2 polarization
2025-Feb-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2024.12.042
PMID:39710208
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研究论文 | 本研究开发了一种靶向受损心肌细胞的级联响应药物递送系统CT-PA@Sal,通过缓解内质网应激改善心肌细胞-巨噬细胞通讯并促进巨噬细胞M2极化 | 首次利用肽两亲性分子构建靶向受损心肌细胞的级联响应药物递送系统,实现内质网应激抑制剂Salubrinal的特异性释放 | 未明确说明样本规模及临床前研究的具体局限性 | 开发治疗心肌缺血再灌注损伤的靶向药物递送策略 | 心肌细胞和巨噬细胞的细胞间通讯 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 529 | 2025-02-18 |
Spatial transcriptomics reveals regional characteristics of lupus nephritis in murine kidneys and immune response to prednisolone or Gancao Nourishing-Yin decoction therapies
2025-Feb, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70236
PMID:39956926
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 530 | 2025-10-07 |
Deconvolution and inference of spatial communication through optimization algorithm for spatial transcriptomics
2025-Feb-14, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-07625-8
PMID:39948133
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研究论文 | 提出一种结合单细胞RNA测序和空间信息的空间转录组解卷积方法NODE | 开发了同时整合细胞类型特异性信息和细胞间通讯的空间解卷积算法 | NA | 改进空间转录组数据的细胞类型解卷积和空间通讯推断 | 空间转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 非负最小二乘法, 优化搜索算法 | 基因表达数据, 空间位置数据 | 四个数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 531 | 2025-10-07 |
Cryoablation-induced modulation of Treg cells and the TGF-β pathway in lung adenocarcinoma: implications for increased antitumor immunity
2025-Feb-14, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-025-03926-1
PMID:39948553
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研究论文 | 本研究探讨了冷冻消融通过调节Treg细胞和TGF-β通路增强肺腺癌抗肿瘤免疫的机制 | 首次通过单细胞测序和动物模型系统揭示冷冻消融通过TGF-β通路抑制Treg细胞增强抗肿瘤免疫的新机制 | 研究样本量有限,临床观察时间较短,需要更大规模临床试验验证 | 探索冷冻消融对肺腺癌局部免疫微环境的影响及其抗肿瘤免疫机制 | 肺腺癌患者组织样本、小鼠肿瘤模型、体外细胞培养 | 肿瘤免疫学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq, 细胞冷冻消融, 小鼠皮下肿瘤移植模型 | 动物模型, 细胞模型 | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 未明确具体样本数量,包括患者组织、外周血样本和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 532 | 2025-10-07 |
Interpretable AI for inference of causal molecular relationships from omics data
2025-Feb-14, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adk0837
PMID:39951525
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研究论文 | 提出一种可解释AI方法CIMLA,用于从组学数据中推断因果分子关系 | 证明了在特定假设下,流行的特征归因模型能够估计反映变量间直接影响的因果量平均值,并基于此提出了基因调控关系的精确定义 | 需要特定假设条件才能保证因果推断的有效性 | 从高维组学数据中发现因果分子关系,识别不同生物条件下基因调控网络的差异 | 基因调控网络,阿尔茨海默病相关基因调控关系 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 特征归因模型 | 组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 533 | 2025-10-07 |
Chronic exposure to glucocorticoids amplifies inhibitory neuron cell fate during human neurodevelopment in organoids
2025-Feb-14, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adn8631
PMID:39951527
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研究论文 | 本研究利用单细胞技术探究糖皮质激素暴露对人类神经类器官发育过程中基因调控和谱系分化的影响 | 首次在人类神经类器官模型中揭示慢性糖皮质激素暴露通过特定转录因子促进抑制性神经元谱系分化的分子机制 | 研究基于非指导性神经类器官模型,可能无法完全模拟体内复杂的神经发育环境 | 探究环境因素(糖皮质激素)对人类神经发育过程中谱系分化的影响机制 | 人类神经类器官 | 发育神经生物学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞转录组测序, 染色质可及性分析 | 人类神经类器官模型 | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 534 | 2025-10-07 |
Dissecting the role of CAR signaling architectures on T cell activation and persistence using pooled screens and single-cell sequencing
2025-Feb-14, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adp4008
PMID:39951542
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研究论文 | 通过组合CAR信号域库、重复抗原刺激实验和单细胞测序,系统研究CAR信号架构对T细胞活化和持久性的影响 | 设计组合CAR信号域文库,结合体外筛选与临床结果关联,建立临床信息指导的筛选方法 | NA | 研究CAR信号架构如何影响T细胞功能和持久性 | CAR-T细胞 | 单细胞生物学 | 癌症 | 单细胞测序, 组合文库筛选, 重复抗原刺激实验 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 535 | 2025-02-17 |
Comprehensive analysis of cytokine and chemokine gene expression in IgG4-related disease by spatial transcriptomics
2025-Feb-14, Allergology international : official journal of the Japanese Society of Allergology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.alit.2024.12.010
PMID:39952877
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 536 | 2025-10-07 |
Analysis of microarray and single-cell RNA-seq identifies gene co-expression, cell-cell communication, and tumor environment associated with metabolite interconversion enzyme in prostate cancer
2025-Feb-13, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01926-4
PMID:39946051
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研究论文 | 通过微阵列和单细胞RNA测序分析前列腺癌中代谢物互变酶相关的基因共表达、细胞间通讯和肿瘤微环境 | 首次结合基因表达微阵列数据、单细胞RNA测序、癌基因和抑癌基因分析前列腺癌中代谢物互变酶相关差异表达基因的互作网络 | NA | 探索前列腺癌中分子特性和通路,发现在前列腺癌发生发展中起关键作用的潜在生物标志物 | 前列腺癌患者 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 微阵列, 单细胞RNA测序, 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 基因表达微阵列 | NA | NA |
| 537 | 2025-10-07 |
Mitochondrial carrier homolog 2 is important for mitochondrial functionality and non-small cell lung cancer cell growth
2025-Feb-13, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07419-0
PMID:39948081
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研究论文 | 本研究探讨线粒体载体同源物2(MTCH2)在非小细胞肺癌中的表达及其通过调控线粒体功能促进肿瘤生长的作用机制 | 首次系统揭示MTCH2在非小细胞肺癌中的过表达现象及其通过维持线粒体超功能促进肿瘤生长的分子机制 | 研究主要基于细胞系和动物模型,尚未在临床患者中进行验证 | 探索MTCH2作为非小细胞肺癌新型治疗靶点的潜力 | 非小细胞肺癌细胞系、原代NSCLC细胞、裸鼠皮下移植瘤模型 | 癌症生物学 | 肺癌 | 生物信息学分析、单细胞测序、CRISPR/Cas9基因敲除、shRNA沉默、腺相关病毒载体 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据、蛋白质印迹数据 | 多种原代/已建立的NSCLC细胞系及裸鼠移植瘤模型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 538 | 2025-10-07 |
LMNA R482L mutation causes impairments in C2C12 myoblasts subpopulations, alterations in metabolic reprogramming during differentiation, and oxidative stress
2025-Feb-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-88219-6
PMID:39948343
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序技术,探讨了LMNA-R482L突变对C2C12成肌细胞亚群、分化过程中的代谢重编程及氧化应激的影响 | 首次在单细胞水平揭示LMNA-R482L突变对成肌细胞亚群组成的改变,并发现该突变通过抗氧化谷胱甘肽系统调控ROS产生和清除机制 | 研究仅限于体外培养的C2C12细胞系,未涉及动物模型或人类样本验证 | 探究LMNA突变如何影响骨骼肌功能特性 | 转基因小鼠C2C12成肌细胞系 | 单细胞生物学 | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | C2C12细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 539 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomic atlas of the chicken cecum reveals cellular responses and state shifts during Eimeria tenella infection
2025-Feb-13, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-11302-9
PMID:39948469
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序构建鸡盲肠细胞图谱,揭示艾美耳球虫感染期间的细胞响应和状态变化 | 首次构建鸡盲肠单细胞转录组图谱,揭示艾美耳球虫感染导致的APOB肠细胞减少和T细胞增殖等细胞组成变化 | 未明确说明样本数量和研究设计的局限性 | 研究艾美耳球虫感染对鸡盲肠细胞组成和功能的影响 | 鸡盲肠细胞 | 单细胞组学 | 寄生虫感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 7,394个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 540 | 2025-10-07 |
Unveiling the crucial role of glycosylation modification in lung adenocarcinoma metastasis through artificial neural network-based spatial multi-omics single-cell analysis and Mendelian randomization
2025-Feb-13, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-13650-x
PMID:39948531
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研究论文 | 本研究通过整合多组学方法揭示了糖基化修饰在肺腺癌转移中的关键作用 | 首次结合人工神经网络、空间多组学单细胞分析和孟德尔随机化方法系统研究肺腺癌中糖基化修饰的功能 | NA | 阐明糖基化修饰在肺腺癌中的作用并识别潜在生物靶点 | 肺腺癌组织和细胞系 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 人工神经网络, 孟德尔随机化 | 人工神经网络 | 转录组数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |