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当前共找到 652 篇文献，本页显示第 461 - 480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 461 | 2025-10-07 |
Integrating transcriptomics and scPagwas analysis predicts naïve CD4 T cell-related gene DRAM2 as a potential biomarker and therapeutic target for colorectal cancer
2025-Feb-21, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-13731-x
PMID:39984869
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研究论文 | 本研究通过整合转录组学和scPagwas分析，预测与初始CD4 T细胞相关的基因DRAM2作为结直肠癌的潜在生物标志物和治疗靶点 | 首次结合单细胞转录组学和scPagwas算法识别CD4Tn细胞在结直肠癌中的关键作用，并发现DRAM2基因的潜在治疗价值 | 研究样本量有限，需要更大规模的临床验证 | 探索结直肠癌与初始CD4 T细胞的关系，识别生物标志物和治疗靶点 | 结直肠癌患者和结直肠癌细胞 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组学, 批量转录组学, 基因敲低实验 | scPagwas算法, 加权基因共表达网络分析, 反卷积算法, SMR算法 | 转录组数据, 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 462 | 2025-10-07 |
Analysis of thyroid carcinoma composition and spatial architecture in the progression of dedifferentiation, lymphatic metastasis, and gastric metastasis
2025-Feb-21, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06252-5
PMID:39984992
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研究论文 | 利用空间转录组学分析甲状腺癌去分化、淋巴转移和胃转移过程中的细胞组成和空间结构特征 | 首次通过空间转录组学揭示甲状腺癌去分化和转移过程中肿瘤特异性髓系细胞的空间分布特征及其与CD44+组织干细胞的共定位关系 | 胃肠道转移病例罕见，样本量有限，需要更大规模研究验证 | 探索甲状腺癌及其胃肠道转移细胞的空间分布特征和潜在机制 | 甲状腺乳头状癌(PTC)、未分化甲状腺癌(ATC)、ATC相关淋巴转移(ATC-LM)和ATC相关胃转移(ATC-GM) | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 空间转录组学，免疫荧光染色 | NA | 空间基因表达数据，图像数据 | 包含PTC、ATC、ATC-LM和ATC-GM四种病理类型的组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 463 | 2025-10-07 |
Human spindle-shaped urine-derived stem cell exosomes alleviate severe fatty liver ischemia-reperfusion injury by inhibiting ferroptosis via GPX4
2025-Feb-21, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04202-y
PMID:39985001
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序分析尿液来源干细胞亚型异质性，发现纺锤形尿液干细胞外泌体通过GPX4抑制铁死亡缓解严重脂肪肝缺血再灌注损伤 | 首次发现纺锤形尿液干细胞外泌体通过递送GPX4蛋白特异性抑制铁死亡，为严重脂肪肝缺血再灌注损伤提供了新的治疗策略 | 研究主要基于动物模型和体外实验，尚未进行临床试验验证 | 探索不同尿液来源干细胞亚型对严重脂肪肝缺血再灌注损伤的治疗效果及机制 | 大鼠脂肪肝移植模型、小鼠脂肪肝缺血再灌注模型、脂肪变性肝细胞缺氧复氧模型 | 细胞治疗 | 脂肪肝病 | scRNA-seq, Bulk RNA-seq, 质谱分析 | NA | 基因表达数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 464 | 2025-10-07 |
Clonal Heterogeneity in Human Pancreatic Ductal Adenocarcinoma and Its Impact on Tumor Progression
2025-Feb-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.11.637729
PMID:39990481
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学联合分析，揭示了人类胰腺导管腺癌中克隆异质性对肿瘤进展的影响 | 首次在人类PDAC中系统揭示多克隆共存现象，挑战了传统的基底型/经典型二元分类，提出了受克隆进化和空间组织影响的转录连续谱概念 | 样本量相对有限(n=62)，需要更大队列验证罕见克隆表型转换的普遍性 | 探究胰腺导管腺癌中克隆异质性对肿瘤生物学的贡献 | 人类原发性胰腺导管腺癌样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 系统发育分析 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 62例人类PDAC样本，包含443,451个单细胞和53,236个空间转录组位点 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 465 | 2025-10-07 |
CausalGeD: Blending Causality and Diffusion for Spatial Gene Expression Generation
2025-Feb-11, ArXiv
PMID:39990788
|
研究论文 | 提出了一种结合因果关系和扩散模型的空间基因表达生成方法CausalGeD | 将因果注意力变换器从图像生成推广到基因表达数据，无需预定义关系即可捕获调控机制 | NA | 整合单细胞RNA测序和空间转录组数据以理解空间背景下的基因表达 | 10个组织数据集的空间基因表达数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 扩散模型, 自回归过程, 因果注意力变换器 | 基因表达数据 | 10个组织数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 466 | 2025-10-07 |
Therapeutic implications of endoplasmic reticulum stress gene CCL3 in cervical squamous cell carcinoma
2025-Feb-20, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-024-09949-3
PMID:39976849
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研究论文 | 本研究通过分析内质网应激基因在宫颈鳞状细胞癌中的表达，建立分子亚型和预后模型，并验证CCL3基因在肿瘤进展中的关键作用 | 首次发现CCL3基因在CESC中的预后价值，并通过单细胞RNA测序揭示其在CD8+T细胞亚群中的表达特征 | 研究主要基于公共数据库数据，需要更多独立队列验证预后模型的普适性 | 探讨内质网应激相关基因在宫颈鳞状细胞癌中的预后价值和治疗意义 | 宫颈鳞状细胞癌患者样本、HeLa和SiHa细胞系、裸鼠模型 | 癌症生物学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, Lasso Cox回归分析, 基因敲降, 基因过表达 | 预后模型, 动物模型 | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | TCGA和GSE39001数据集，GSE168652单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 全基因组表达谱 | NA | NA |
| 467 | 2025-10-07 |
Corticosteroid premedication on anti-tumor effect of immune checkpoint blockade in murine hepatocellular carcinoma models
2025-Feb-20, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009704
PMID:39979068
|
研究论文 | 本研究评估了皮质类固醇预给药对双重免疫检查点阻断治疗小鼠肝细胞癌模型抗肿瘤效果的影响 | 首次系统评估不同剂量地塞米松预给药对双重免疫检查点阻断治疗肝细胞癌抗肿瘤效果的影响，并采用单细胞RNA测序分析肿瘤浸润T细胞的变化 | 研究基于小鼠模型，结果需在临床试验中进一步验证；样本量相对有限 | 探究皮质类固醇预给药是否会削弱双重免疫检查点阻断治疗的抗肿瘤效果 | 小鼠肝细胞癌模型（原位BNL 1MEA.7R.1和皮下Hepa1-6同基因模型） | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，细胞因子定量，细胞毒性检测 | 动物模型 | 基因表达数据，肿瘤重量数据，细胞表型数据 | 两种小鼠肝癌模型，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 468 | 2025-10-07 |
A novel HVEM-Fc recombinant protein for lung cancer immunotherapy
2025-Feb-20, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03324-8
PMID:39979981
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研究论文 | 本研究开发了一种新型HVEM-Fc重组蛋白，用于肺癌免疫治疗 | 首次开发HVEM-Fc重组融合蛋白，证明其能增强T细胞活性并与PD-1抑制剂产生协同抗肿瘤效果 | 研究主要基于小鼠模型和类器官，需要进一步临床验证 | 评估HVEM-Fc重组蛋白在肺癌免疫治疗中的疗效和机制 | C57BL/6小鼠肺癌模型、患者来源类器官、T细胞 | 免疫治疗 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、bulk RNA测序、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | 小鼠肺癌模型和患者来源类器官 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 469 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomics in autoimmune rheumatic disease: potential clinical applications and perspectives
2025-Feb-20, Inflammation and regeneration
IF:5.0Q1
DOI:10.1186/s41232-025-00369-2
PMID:39980019
|
综述 | 本文综述了空间转录组学技术在自身免疫性风湿病研究中的应用进展及临床转化前景 | 系统探讨空间转录组学在风湿病领域揭示免疫细胞空间分布和细胞间相互作用的新视角 | NA | 总结空间转录组学发展及其在自身免疫性风湿病病理机制研究中的应用 | 类风湿关节炎、系统性红斑狼疮和干燥综合征等自身免疫性风湿病 | 空间转录组学 | 自身免疫性风湿病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达空间数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 470 | 2025-10-07 |
Comprehensive analysis of long non-coding RNA and mRNA expression patterns during seminiferous tubules maturation in Guanzhong dairy goats
2025-Feb-18, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-11320-7
PMID:39966702
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研究论文 | 本研究通过转录组分析揭示了关中奶山羊生精小管成熟过程中lncRNA和mRNA的表达模式及其在精子发生中的调控作用 | 首次在关中奶山羊中系统鉴定生精小管发育不同阶段的lncRNA和mRNA表达谱，构建了lncRNA-mRNA互作网络，并利用单细胞转录组数据验证关键基因表达 | 研究仅比较了两个发育时间点（45天和240天），缺乏中间发育阶段的连续动态分析 | 探究奶山羊生精小管成熟过程中lncRNA和mRNA的表达规律及其在精子发生中的功能 | 关中奶山羊生精小管组织 | 转录组学 | 生殖系统发育 | RNA-seq, 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 两个发育阶段（45天和240天）的奶山羊生精小管样本 | NA | 转录组测序, 单细胞转录组测序 | NA | NA |
| 471 | 2025-10-07 |
Efficient Identification of Monoclonal Antibodies Against Rift Valley Fever Virus Using High-Throughput Single Lymphocyte Transcriptomics of Immunized Mice
2025-Feb-04, Antibodies (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antib14010012
PMID:39982227
|
研究论文 | 本研究利用高通量单淋巴细胞转录组学技术从免疫小鼠中高效鉴定抗裂谷热病毒的单克隆抗体 | 首次将10x Genomics高通量单细胞分析技术应用于裂谷热病毒抗体的发现，实现了对稀有且强效抗体的高效筛选 | 研究仅使用小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 开发针对裂谷热病毒的有效治疗性抗体 | 免疫小鼠的脾细胞记忆B细胞群体 | 免疫学 | 裂谷热 | 单细胞转录组测序，流式细胞分选 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 从小鼠脾细胞中分选的记忆B细胞群体 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞分析平台 |
| 472 | 2025-10-07 |
A Review and New Insights Into Spermatogenesis From Single-Cell RNA Sequencing
2025-Feb, Reproduction in domestic animals = Zuchthygiene
DOI:10.1111/rda.70019
PMID:39985199
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在精原干细胞鉴定和精子发生研究中的进展与应用 | 利用单细胞RNA测序技术揭示睾丸细胞异质性，识别细胞亚群分类和特异性表达基因 | 缺乏家畜特异性分子标记，阻碍精原干细胞的完全筛选和纯化 | 探索精原干细胞的维持、自我更新和分化机制 | 精原干细胞和睾丸细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 473 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomics-aided localization for single-cell transcriptomics with STALocator
2025-Feb-19, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101195
PMID:39904340
|
研究论文 | 开发了一种名为STALocator的空间转录组学辅助定位工具，用于将单细胞转录组数据定位到对应的空间转录组数据中 | 提出首个利用空间转录组数据辅助单细胞转录组定位的方法，能够增强基因表达模式并预测全基因组基因表达数据 | 未明确说明方法在更广泛组织类型或数据质量较差情况下的适用性 | 解决单细胞转录组数据缺乏空间信息的问题，实现单细胞在空间上的精确定位 | 单细胞转录组数据和空间转录组数据 | 空间转录组学 | 鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学，荧光原位杂交 | STALocator | 基因表达数据，空间位置数据 | 模拟数据、人脑数据和鳞状细胞癌数据 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | Slide-seqV2，Xenium | Slide-seqV2空间转录组技术，Xenium原位分析技术 |
| 474 | 2025-10-07 |
Inferring cell trajectories of spatial transcriptomics via optimal transport analysis
2025-Feb-19, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101194
PMID:39904341
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研究论文 | 本研究开发了SpaTrack方法，通过最优传输分析整合空间转录组数据中的基因表达和空间位置信息来推断细胞分化轨迹 | 首次将最优传输理论应用于空间转录组数据分析，能够同时整合基因表达和空间位置信息来重建细胞分化轨迹 | NA | 开发能够从空间转录组数据中推断细胞分化轨迹的计算方法 | 空间转录组数据中的细胞 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 最优传输模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 475 | 2025-10-07 |
Dynamic transcriptomic and regulatory networks underpinning the transition from fetal primordial germ cells to spermatogonia in mice
2025-Feb, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13755
PMID:39329203
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了小鼠雄性生殖细胞从原始生殖细胞向精原细胞转变过程中的转录动态和调控网络 | 首次系统揭示了PGC向SPG转变过程中的全局超转录特征，鉴定出315个高活性调控因子，并验证了非转录因子TAGLN2在精原干细胞维持和分化中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，在人类生殖细胞发育中的适用性需要进一步验证 | 阐明雄性生殖细胞发育过程中从原始生殖细胞向精原细胞转变的分子机制 | 小鼠雄性生殖细胞和性腺细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠雄性生殖细胞发育图谱数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 476 | 2025-10-07 |
Applications and emerging challenges of single-cell RNA sequencing technology in tumor drug discovery
2025-Feb, Drug discovery today
IF:6.5Q1
DOI:10.1016/j.drudis.2025.104290
PMID:39828052
|
综述 | 概述单细胞RNA测序技术在肿瘤药物发现中的应用及面临的挑战 | 系统总结scRNA-seq技术在肿瘤药物研发各阶段（机制阐明、靶点识别、药物筛选、药效与耐药性研究）的创新应用 | 未涉及具体实验数据验证，主要基于文献综述 | 探讨scRNA-seq技术在肿瘤药物开发中的应用前景与挑战 | 肿瘤药物研发过程 | 单细胞组学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 477 | 2025-10-07 |
Exosome-based targeted delivery of NF-κB ameliorates age-related neuroinflammation in the aged mouse brain
2025-Feb, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-024-01388-8
PMID:39833561
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研究论文 | 本研究评估了装载不可降解IκB的外泌体通过抑制NF-κB核转位来改善老年小鼠脑部神经炎症的治疗效果 | 首次利用外泌体递送不可降解IκB特异性靶向巨噬细胞和小胶质细胞，并揭示其通过调节免疫细胞互作缓解年龄相关神经炎症的新机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类临床应用中验证 | 开发针对年龄相关神经炎症的新型治疗方法 | 老年小鼠脑部组织及免疫细胞（巨噬细胞、小胶质细胞、T细胞、B细胞） | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 老年小鼠脑部样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 478 | 2025-10-07 |
Identifying patterns differing between high-dimensional datasets with generalized contrastive PCA
2025-Feb, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012747
PMID:39919147
|
研究论文 | 开发了一种无需超参数调整的广义对比主成分分析方法，用于比较高维数据集间的差异模式 | 提出了广义对比主成分分析(gcPCA)，解决了传统cPCA需要超参数调整和不对称处理条件的问题 | 未在论文摘要中明确说明具体局限性 | 开发一种灵活、无需超参数的高维数据对比分析方法 | 高维生物数据集，包括神经生理记录和单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | II型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | 广义对比主成分分析(gcPCA) | 高维数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 479 | 2025-10-07 |
[Chitinase-like protein Ym2 regulates olfactory epithelium homeostasis and olfactory behavior in mice]
2025-Feb-21, Zhonghua er bi yan hou tou jing wai ke za zhi = Chinese journal of otorhinolaryngology head and neck surgery
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研究论文 | 本研究探讨了Ym2蛋白在小鼠嗅觉上皮稳态和嗅觉行为中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了Ym2在老年小鼠嗅觉上皮中的高表达模式及其对嗅觉功能的调控机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 研究Ym2在嗅觉上皮稳态和嗅觉行为中的功能 | 年轻和老年小鼠的嗅觉上皮组织 | 分子生物学 | 嗅觉功能障碍 | 单细胞RNA测序,免疫染色,RNAscope原位杂交,埋藏食物颗粒测试 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,行为学数据,组织学数据 | 年轻和老年小鼠嗅觉上皮样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 480 | 2025-10-07 |
Impaired inflammatory resolution with severe SARS-CoV-2 infection in leptin knock out obese hamster
2025-Feb-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.111837
PMID:39981511
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研究论文 | 本研究利用基因编辑的瘦素敲除肥胖仓鼠建立严重SARS-CoV-2感染模型，通过单细胞转录组学揭示肥胖相关重症COVID-19的机制 | 首次建立瘦素敲除肥胖仓鼠的严重感染模型，发现单核细胞源性肺泡巨噬细胞在肺过度炎症中的关键作用及两个独特细胞命运分支 | 动物模型与人类疾病存在物种差异，样本规模有限 | 探究肥胖个体罹患重症COVID-19的分子机制 | 基因编辑瘦素敲除肥胖仓鼠及肺组织样本 | 单细胞转录组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序，基因编辑 | 动物疾病模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |