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当前共找到 652 篇文献，本页显示第 441 - 460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2025-10-07 |
Towards the Prediction of Responses to Cancer Immunotherapy: A Multi-Omics Review
2025-Feb-12, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life15020283
PMID:40003691
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综述 | 本文综述了利用多组学特征预测癌症免疫治疗反应的最新进展 | 系统总结了多组学特征在免疫治疗预测中的应用，包括新测量方法、研究队列和数据整合策略 | 需要更大更多样的临床数据集，多组学数据标准化不足，模型可解释性有限 | 预测癌症患者对免疫治疗的反应 | 癌症患者和肿瘤样本 | 机器学习 | 癌症 | 多组学分析，包括基因组学、转录组学、表观基因组学 | 传统机器学习和深度学习框架 | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 442 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA Sequencing in Unraveling Acquired Resistance to EGFR-TKIs in Non-Small Cell Lung Cancer: New Perspectives
2025-Feb-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26041483
PMID:40003951
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综述 | 本文探讨单细胞RNA测序技术在揭示非小细胞肺癌EGFR-TKI获得性耐药机制中的关键作用 | 首次系统阐述单细胞RNA测序技术如何通过单细胞分辨率解析EGFR-TKI耐药机制的复杂性和多样性 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据验证 | 探索非小细胞肺癌EGFR-TKI获得性耐药机制 | 非小细胞肺癌肿瘤细胞及肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 443 | 2025-10-07 |
From Local to Systemic: The Journey of Tick Bite Biomarkers in Australian Patients
2025-Feb-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26041520
PMID:40003986
|
研究论文 | 本研究通过比较蜱叮咬部位皮肤活检与外周血样本的多组学数据，探索局部组织事件在系统性循环中的生物标志物 | 首次证明蜱叮咬后皮肤中的分子事件可在血液中系统性检测，并发现ECM组织和血小板脱颗粒信号在血液中持续三个月 | 样本量有限 | 验证血液样本能否反映蜱叮咬局部组织事件的生物标志物 | 澳大利亚蜱叮咬患者 | 生物标志物研究 | 蜱媒疾病 | 多组学分析，包括转录组学、蛋白质组学、代谢组学、DNA甲基化、空间转录组学 | NA | 分子表达数据 | 有限样本量（具体数量未明确说明） | NA | 空间转录组学，细胞转录组学，细胞游离转录组学，蛋白质组学，代谢组学，DNA甲基化 | NA | NA |
| 444 | 2025-10-07 |
paraCell: a novel software tool for the interactive analysis and visualization of standard and dual host-parasite single-cell RNA-seq data
2025-Feb-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf091
PMID:39988320
|
研究论文 | 开发了一款名为paraCell的新型软件工具，用于交互式分析和可视化标准及双宿主-寄生虫单细胞RNA测序数据 | 首个专门针对寄生虫学领域的单细胞数据分析工具，无需编程技能即可进行数据可视化和重新分析 | 需要预加载单细胞数据，可能不适用于所有寄生虫物种 | 开发易于使用的软件工具，促进寄生虫学领域单细胞数据的可访问性和分析 | 寄生虫物种（疟原虫、锥虫、弓形虫、泰勒虫）及其宿主相互作用 | 生物信息学 | 寄生虫感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个已发表数据集和新生成的弓形虫-小鼠、泰勒虫-牛数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 445 | 2025-10-07 |
Single-Cell Sequencing Reveals the Role of Radiation-Induced Stemness-Responsive Cancer Cells in the Development of Radioresistance
2025-Feb-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26041433
PMID:40003899
|
研究论文 | 通过单细胞测序研究放疗过程中癌细胞干性变化及其在放射抵抗发展中的作用 | 首次发现并定义了'放射诱导干性响应癌细胞'亚群，揭示了其在放疗早期通过EGFR-Hippo信号通路驱动放射抵抗的新机制 | 研究仅基于A549细胞系模型，未在临床样本或更多细胞系中验证 | 探究放疗过程中癌细胞干性变化与放射抵抗发展的关系 | 人非小细胞肺癌A549细胞及其放射抵抗细胞(A549-RR) | 单细胞测序 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 不同时间点的A549细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 446 | 2025-10-07 |
Sources of non-uniform coverage in short-read RNA-Seq data
2025-Feb-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.30.634337
PMID:39975309
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研究论文 | 探讨短读长RNA测序数据中覆盖度不均匀的来源 | 系统评估了八个潜在的非均匀性来源，推翻了先前出版物或建议中的多个观点 | 仅针对短读长RNA测序技术进行研究，未涉及长读长测序技术 | 识别和验证RNA测序数据中覆盖度不均匀的主要来源 | RNA测序数据中的转录本覆盖度模式 | 转录组学 | NA | RNA-seq | NA | 测序数据 | 多个现有数据集和针对性实验 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | 短读长RNA测序 |
| 447 | 2025-10-07 |
Trajectory Inference with Cell-Cell Interactions (TICCI): intercellular communication improves the accuracy of trajectory inference methods
2025-02-04, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf027
PMID:39898810
|
研究论文 | 提出了一种整合细胞间通讯信息的轨迹推断新方法TICCI，提高了单细胞转录组轨迹推断的准确性 | 通过整合细胞间通讯信息来改进轨迹推断，提出单细胞分辨率的细胞-细胞相互作用概念，使用细胞邻域矩阵和scEntropy评估分化状态 | NA | 提高单细胞转录组轨迹推断的准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | Louvain分区算法, Chu-Liu算法, 扩散拟合时间算法 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 448 | 2025-10-07 |
Integrative Analysis of Cuproptosis-Related Mitochondrial Depolarisation Genes for Prognostic Prediction in Non-Small Cell Lung Cancer
2025-Feb, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70438
PMID:40008552
|
研究论文 | 本研究通过整合铜死亡相关线粒体去极化基因构建非小细胞肺癌预后预测模型 | 首次结合铜死亡相关基因与线粒体去极化基因构建预后模型，并识别出10个关键风险基因 | NA | 开发非小细胞肺癌预后预测模型并识别潜在治疗靶点 | 非小细胞肺癌患者及肺癌细胞系 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞测序, 空间转录组, 批量转录组, qPCR | Cox回归, 机器学习 | 基因表达数据, 临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 449 | 2025-10-07 |
Single-cell landscape of peripheral blood mononuclear cells in patients with Graves' disease
2025-Feb-25, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqaf038
PMID:39996309
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了格雷夫斯病患者外周血单个核细胞的单细胞景观 | 首次在格雷夫斯病患者中应用单细胞RNA测序技术全面分析外周血单个核细胞的异质性和功能变化 | 样本量相对较小（8名患者和12名健康对照），需要更大规模研究验证 | 阐明格雷夫斯病中免疫异常的具体机制 | 格雷夫斯病患者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 格雷夫斯病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 22680个外周血单个核细胞，来自8名GD患者和12名健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 450 | 2025-10-07 |
Integration of single-cell and bulk RNA sequencing to identify a distinct tumor stem cells and construct a novel prognostic signature for evaluating prognosis and immunotherapy in LUAD
2025-Feb-22, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06243-6
PMID:39987127
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据，识别肺腺癌中的肿瘤干细胞特征并构建预后标志物模型 | 首次结合单细胞和bulk RNA测序识别肺腺癌肿瘤干细胞特征，构建了包含49个基因的预后标志物模型，并发现TAF10作为潜在治疗靶点 | 研究样本量未明确说明，模型验证需要进一步前瞻性研究 | 开发肺腺癌预后评估和免疫治疗效果预测的肿瘤干细胞标志物模型 | 肺腺癌患者和细胞系 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,qRT-PCR,Western blot,免疫组化 | Lasso-Cox回归模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 451 | 2025-10-07 |
NK cell immunopotentiators-loaded nanoliposomes enhance ADCC effect for targeted therapy against HER2-positive breast cancer
2025-Feb-22, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-024-02023-9
PMID:39987140
|
研究论文 | 本研究开发了负载NK细胞免疫增强剂的HER2靶向纳米脂质体，用于增强曲妥珠单抗在HER2阳性乳腺癌治疗中的ADCC效应 | 首次将TKD和IP-10p两种免疫调节肽封装于HER2靶向pH敏感纳米脂质体中，通过增强NK细胞浸润和活性来克服曲妥珠单抗耐药性 | 研究主要基于体外实验和动物模型，尚未进行临床试验验证 | 开发新型纳米递送系统以增强曲妥珠单抗在HER2阳性乳腺癌中的治疗效果 | HER2阳性乳腺癌患者肿瘤组织及相应的疾病模型 | 肿瘤免疫治疗 | 乳腺癌 | 单细胞测序、生物信息学分析、纳米脂质体技术 | NA | 单细胞测序数据、体外实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 452 | 2025-10-07 |
Interferon-gamma receptor signaling regulates innate immunity during Staphylococcus aureus craniotomy infection
2025-Feb-22, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03376-9
PMID:39987156
|
研究论文 | 本研究探讨了干扰素-γ受体信号在金黄色葡萄球菌颅骨切开术感染中对先天免疫的调控作用 | 首次揭示了IFN-γ通过增强巨噬细胞和小胶质细胞的抗菌活性在颅骨切开术感染中的关键保护作用，并发现Th1/Th17比例失衡导致免疫功能失调 | 在粒细胞或巨噬细胞/小胶质细胞条件性敲除IFN-γR1小鼠中未观察到表型，提示存在冗余机制 | 研究IFN-γ信号在颅骨切开术生物膜感染免疫应答中的调控机制 | 金黄色葡萄球菌颅骨切开术感染小鼠模型 | 免疫学 | 细菌感染 | 单细胞转录组测序，条件性基因敲除 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据，细胞表型数据 | 野生型和Ifngr1缺陷小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 453 | 2025-10-07 |
Interpretable single-cell factor decomposition using sciRED
2025-Feb-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57157-2
PMID:39987196
|
研究论文 | 开发了一种名为sciRED的可解释单细胞因子分解方法，用于改进scRNA-seq数据分析 | 通过去除已知混杂效应、使用旋转提高因子可解释性、将因子映射到已知协变量、识别可能捕获隐藏生物现象的未解释因子 | NA | 改进单细胞RNA测序数据的因子分析可解释性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 因子分解模型 | 基因表达数据 | 多个scRNA-seq数据集（肾脏图谱、PBMC数据集、大鼠肝脏图谱、健康人类肝脏图谱） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 454 | 2025-10-07 |
Human nasal turbinate stem cells with specific gene signatures (HAS2, CXCL1, KRTAP1-5, GSTT2B, and C4B) attenuate rheumatoid arthritis
2025-Feb-22, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-90707-8
PMID:39987230
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研究论文 | 本研究探讨人鼻甲来源干细胞对类风湿性关节炎的治疗效果及其相关基因特征 | 首次发现具有特定基因特征（HAS2、CXCL1、KRTAP1-5、GSTT2B和C4B）的人鼻甲干细胞对类风湿性关节炎具有治疗潜力 | 研究基于小鼠模型，临床转化需进一步验证；样本量有限（20例健康对照） | 研究人鼻甲干细胞对类风湿性关节炎的治疗效果及机制 | 人鼻甲来源干细胞、胶原诱导性关节炎小鼠模型 | 干细胞治疗 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序、微阵列分析、RT-qPCR、流式细胞术、TRAP染色 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | 20名健康对照的鼻甲干细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 455 | 2025-10-07 |
Presence of tertiary lymphoid structures and exhausted tissue-resident T cells determines clinical response to PD-1 blockade in renal cell carcinoma
2025-Feb-24, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-24-0991
PMID:39992403
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研究论文 | 通过转录组分析确定肾细胞癌对PD-1抑制剂反应的生物标志物 | 首次整合三级淋巴结构和组织驻留耗竭T细胞作为联合生物标志物预测PD-1阻断疗效 | 样本量有限（102例患者），单中心研究 | 探索肾细胞癌对PD-1单药治疗反应的机制 | 晚期肾细胞癌患者 | 肿瘤免疫学 | 肾细胞癌 | 转录组分析, 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 102例肾细胞癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 456 | 2025-10-07 |
A Case-Driven Multi-Omics Analysis for Longitudinal Ibrutinib Response Evaluation of Patients With Chronic Lymphocytic Leukemia
2025-Feb-23, European journal of haematology
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/ejh.14397
PMID:39988467
|
研究论文 | 通过多组学方法评估慢性淋巴细胞白血病患者对伊布替尼治疗的纵向反应 | 首次结合单细胞转录组学等多组学方法分析伊布替尼治疗期间克隆惰性的分子机制 | 仅纳入两名患者样本，样本量较小 | 建立伊布替尼治疗反应评估的多组学分析框架 | 慢性淋巴细胞白血病患者 | 多组学分析 | 慢性淋巴细胞白血病 | 单细胞转录组学, DNA和RNA多组学分析 | NA | 血液样本, 分子数据 | 2名患者 | NA | 单细胞RNA测序, 多组学分析 | NA | NA |
| 457 | 2025-10-07 |
FOXO regulation of TXNIP induces ferroptosis in satellite cells by inhibiting glutathione metabolism, promoting Sarcopenia
2025-Feb-21, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-025-05592-1
PMID:39982519
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和转录组分析揭示了FOXO1调控TXNIP表达并通过抑制谷胱甘肽代谢诱导卫星细胞铁死亡导致肌肉减少症的分子机制 | 首次发现FOXO1-TXNIP轴通过抑制谷胱甘肽代谢诱导卫星细胞铁死亡在肌肉减少症发病机制中的核心作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证尚需进一步研究 | 阐明肌肉减少症的分子发病机制 | 年轻和年老小鼠的骨骼肌组织及卫星细胞 | 单细胞生物学 | 肌肉减少症 | 单细胞测序, 转录组分析, 体外实验, 体内实验 | NA | 单细胞RNA测序数据, 转录组数据 | 年轻和年老小鼠骨骼肌样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 458 | 2025-10-07 |
Systematic inference of super-resolution cell spatial profiles from histology images
2025-Feb-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57072-6
PMID:39984438
|
研究论文 | 提出一种弱监督深度学习方法HistoCell，可从组织学图像直接推断单核级别的超分辨率细胞空间特征 | 首次实现从组织学图像直接推断单核级别的超分辨率细胞空间特征，包括细胞类型、状态及其空间网络 | NA | 从组织学图像推断细胞空间特征以支持癌症诊断和治疗 | 多种癌症组织的组织学图像 | 数字病理学 | 癌症 | 深度学习 | 弱监督深度学习 | 组织学图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 459 | 2025-10-07 |
Bioinformatics analysis reveals key mechanisms of oligodendrocytes and oligodendrocyte precursor cells regulation in spinal cord Injury
2025-Feb-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-90489-z
PMID:39984610
|
研究论文 | 通过生物信息学分析揭示少突胶质细胞及其前体细胞在脊髓损伤中的调控机制 | 提出基于预后差异表达ODC/OPC分化相关基因的新型脊髓损伤分类模型 | NA | 研究脊髓损伤中少突胶质细胞及其前体细胞的调控机制 | 小鼠样本和人类临床队列中的脊髓损伤细胞 | 生物信息学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序, 微阵列分析 | 分类模型 | 单细胞测序数据, 微阵列数据, 临床评估数据 | 小鼠样本39个(59,558个细胞), 微阵列样本167个(164个SCI+3个未损伤), 临床队列58人(38例SCI患者+10例健康对照+10例创伤对照) | NA | 单细胞RNA测序, 微阵列 | NA | NA |
| 460 | 2025-10-07 |
Predicting immunotherapy prognosis and targeted therapy sensitivity of colon cancer based on a CAF-related molecular signature
2025-Feb-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-90899-z
PMID:39984646
|
研究论文 | 本研究基于癌症相关成纤维细胞(CAF)构建分子标志物CAFscore，用于预测结肠癌免疫治疗预后和靶向治疗敏感性 | 首次利用WGCNA识别CAF相关基因并构建CAFscore，揭示CAF通过NAMPT配体-受体相互作用促进免疫逃避的新机制 | 研究基于公共数据库的回顾性分析，需要前瞻性临床研究验证CAFscore的临床应用价值 | 开发预测结肠癌免疫治疗预后和靶向治疗敏感性的分子标志物 | 结肠癌患者 | 生物信息学 | 结肠癌 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA), 单因素Cox回归, LASSO回归, 单细胞RNA测序 | Cox回归模型, LASSO回归模型 | 基因表达数据, 临床数据, 单细胞RNA测序数据 | TCGA和GSE39582队列的结肠癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |