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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2025-10-07 |
Identification of splenic IRF7 as a nanotherapy target for tele-conditioning myocardial reperfusion injury
2025-Feb-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57048-6
PMID:39994192
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研究论文 | 本研究通过重定向纳米药物至脾脏,开发了一种治疗心肌再灌注损伤的远程调节新策略 | 首次发现脾脏IRF7在脾-心通讯网络中的关键作用,并开发了脾靶向纳米颗粒STEER用于时序抑制IRF7 | 研究主要使用雄性小鼠临床前模型,尚未在更广泛的动物模型或人体中进行验证 | 开发针对心肌再灌注损伤的纳米治疗新方法 | 心肌再灌注损伤的免疫调节机制 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,异位脾移植,纳米颗粒工程 | NA | 基因表达数据,功能评估数据 | 小鼠临床前模型 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 422 | 2025-10-07 |
CCN2 mediates fibroblast-macrophage interaction in knee arthrofibrosis based on single-cell RNA-seq analysis
2025-Feb-24, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-025-00400-9
PMID:39994205
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示CCN2在膝关节纤维化中介导成纤维细胞-巨噬细胞相互作用 | 首次发现CCN2通过TGF-β通路介导成纤维细胞与巨噬细胞相互作用促进纤维化 | 样本量较小(6例患者),需要更大规模研究验证 | 探究膝关节纤维化的病理机制 | 膝关节纤维化患者的滑膜组织 | 单细胞测序分析 | 膝关节纤维化 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据,流式细胞数据 | 6例膝关节纤维化患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 423 | 2025-10-07 |
Comprehensive analysis of lipid metabolic signatures identified CEBPD promotes breast cancer cell proliferation
2025-Feb-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-90869-5
PMID:39994306
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研究论文 | 通过单细胞和批量转录组数据分析脂质代谢特征,发现CEBPD基因抑制乳腺癌细胞增殖 | 首次整合单细胞和批量转录组数据构建基于脂质代谢特征的预后风险模型,并鉴定CEBPD为新的抑癌基因 | 研究样本量有限,功能验证实验需进一步扩展 | 探索脂质代谢特征在乳腺癌预后评估和治疗靶点开发中的应用价值 | 乳腺癌患者样本和乳腺癌细胞系 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, 功能验证实验 | 预后风险模型 | 基因表达数据 | 原发性乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 424 | 2025-10-07 |
POU2F2+ B cells enhance antitumor immunity and predict better survival in non small cell lung cancer
2025-Feb-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-90817-3
PMID:39994401
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研究论文 | 本研究揭示了POU2F2+ B细胞在非小细胞肺癌中的重要作用及其与患者生存和免疫细胞浸润的关系 | 首次系统阐明POU2F2+ B细胞在NSCLC免疫微环境中的空间分布特征及其对免疫细胞浸润的调控作用,提出POU2F2作为NSCLC免疫治疗新靶点 | 研究样本量有限,未进行功能性验证实验,LUAD和LUSC亚型间的机制差异需要进一步探究 | 阐明POU2F2+ B细胞在非小细胞肺癌患者生存和免疫细胞浸润中的作用机制 | 非小细胞肺癌患者组织样本和相关的单细胞及批量RNA测序数据 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 多重免疫组织化学, 伪时间分析, CIBERSORT分析 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据, 生存数据 | 两个单细胞RNA测序数据集和两个批量RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 425 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA transcriptome uncovers distinct developmental trajectories in the embryonic skeletal muscle of Daheng broiler and Tibetan chicken
2025-Feb-24, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-11363-w
PMID:39994525
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了大恒肉鸡和藏鸡胚胎骨骼肌发育的分子机制差异 | 首次构建了鸡胚胎骨骼肌单细胞图谱,揭示不同品种间肌母细胞和纤维脂肪祖细胞发育轨迹及基因表达动态差异 | 研究仅针对胚胎期三个时间点,未涵盖出生后发育阶段 | 探究不同鸡品种骨骼肌表型差异的分子机制 | 大恒肉鸡和藏鸡的胚胎腿部肌肉组织 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 伪时间轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 29,579个高质量细胞,来自两个鸡品种三个胚胎期(E10,E14,E18) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 426 | 2025-10-07 |
THBS1 in macrophage-derived exosomes exacerbates cerebral ischemia-reperfusion injury by inducing ferroptosis in endothelial cells
2025-Feb-24, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03382-x
PMID:39994679
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研究论文 | 本研究揭示巨噬细胞来源的外泌体通过THBS1-OTUD5-GPX4轴诱导内皮细胞铁死亡,加剧脑缺血再灌注损伤 | 首次发现THBS1作为外泌体关键分子通过结合OTUD5促进GPX4泛素化诱导内皮细胞铁死亡的新机制 | 研究主要基于细胞和动物模型,临床转化仍需进一步验证 | 探索巨噬细胞来源外泌体在脑缺血再灌注损伤中的作用机制 | 内皮细胞、巨噬细胞、tMCAO小鼠模型、AIS患者外周血样本 | 分子生物学 | 脑血管疾病 | 蛋白质组测序、转录组测序、单细胞测序、RNA干扰、腺相关病毒转染、高通量筛选、分子对接、分子动力学模拟、细胞热位移分析 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据、单细胞测序数据 | tMCAO小鼠模型、THP-1和RAW264.7细胞系、AIS患者外周血样本 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 427 | 2025-10-07 |
Comprehensive Analysis of TCR and BCR Repertoires: Insights into Methodologies, Challenges, and Applications
2025-Feb-24, Genomics & informatics
DOI:10.1186/s44342-024-00034-z
PMID:39994831
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综述 | 本文系统综述了T细胞受体和B细胞受体谱系分析的方法学、挑战及应用前景 | 整合免疫学、生物信息学和临床研究,系统比较了批量与单细胞测序在免疫受体分析中的技术差异 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据验证 | 探讨TCR和BCR受体谱系分析的技术方法及其在免疫功能和精准医疗中的应用 | T细胞受体和B细胞受体的序列多样性 | 生物信息学 | NA | RNA测序 | NA | 序列数据 | NA | NA | 单细胞测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 428 | 2025-10-07 |
A Temporal and Spatial Atlas of Adaptive Immune Responses in the Lymph Node Following Viral Infection
2025-Feb-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.31.635509
PMID:39975238
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研究论文 | 本研究开发了AIR-SPACE整合方法,通过结合空间转录组学和免疫受体测序,构建了病毒感染后淋巴结适应性免疫反应的时空图谱 | 开发了AIR-SPACE整合方法,首次实现了在原生空间背景下同时分析细胞转录组和适应性免疫受体库 | 研究仅针对小鼠腘窝淋巴结和痘苗病毒感染模型,尚未验证其他淋巴器官或病原体 | 解析病毒感染后淋巴结中适应性免疫反应的时空动态变化 | 小鼠腘窝淋巴结中的T细胞和B细胞 | 空间转录组学 | 病毒感染 | 空间转录组学, 长读长测序, T细胞受体测序, B细胞受体测序 | NA | 空间转录组数据, 免疫受体序列数据 | 5个不同时间点的小鼠腘窝淋巴结样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞免疫受体测序 | NA | NA |
| 429 | 2025-10-07 |
MAP3K4 signaling regulates HDAC6 and TRAF4 coexpression and stabilization in trophoblast stem cells
2025-Feb, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2024.108116
PMID:39710325
|
研究论文 | 本研究揭示了MAP3K4信号通过调控HDAC6和TRAF4共表达与稳定性在滋养层干细胞中的作用机制 | 首次发现MAP3K4激酶失活导致HDAC6和TRAF4表达增加,并揭示HDAC6与TRAF4形成蛋白复合物调控TRAF4稳定性的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类胎盘中的相关性仍需验证 | 探究MAP3K4信号在胎盘发育过程中调控HDAC6和TRAF4表达的分子机制 | 小鼠滋养层干细胞和胎盘组织 | 分子生物学 | 胎盘功能不全 | 单细胞RNA测序, shRNA敲低 | NA | 基因表达数据, 蛋白质互作数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 430 | 2025-10-07 |
Discovery of Endothelial-Monocyte Crosstalk in Ischemic-Reperfusion Injury Following Liver Transplantation Based on Integration of Single-Cell RNA and Transcriptome RNA Sequencing
2025-Feb, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70336
PMID:39993960
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和转录组RNA测序数据,揭示了肝移植后缺血再灌注损伤中肝窦内皮细胞与单核细胞之间的相互作用机制 | 首次发现ANXA1-FPR2轴在肝窦内皮细胞与单核细胞互作中的关键作用,揭示了缺血再灌注损伤中细胞通讯的新机制 | 研究样本来源于公共数据库,部分发现仅在小鼠模型中进行了初步验证,需要进一步临床验证 | 探究肝移植后缺血再灌注损伤的细胞相互作用机制和信号通路 | 肝移植患者的肝组织样本和缺血再灌注损伤小鼠模型 | 单细胞生物学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序, 转录组RNA测序, 免疫荧光, 流式细胞术, Western Blot | NA | 单细胞RNA测序数据, 转录组RNA测序数据, 实验验证数据 | 来自GEO数据库的肝移植患者样本和建立的小鼠缺血再灌注损伤模型 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组RNA测序 | NA | NA |
| 431 | 2025-10-07 |
Bulk and Single-Cell Transcriptomic Reveals Shared Key Genes and Patterns of Immune Dysregulation in Both Intestinal Inflammatory Disease and Sepsis
2025-Feb, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70415
PMID:39993996
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研究论文 | 本研究通过转录组分析揭示炎症性肠病和脓毒症在免疫失调方面的共同关键基因和分子机制 | 首次通过整合批量转录组和单细胞RNA测序技术,识别出IBD和脓毒症共有的58个差异表达基因,并发现IL1B巨噬细胞在两种疾病中的核心作用 | 研究样本量有限,动物模型验证需要进一步扩展,临床转化价值需更多验证 | 探索炎症性肠病和脓毒症之间共享的分子和病理生理机制 | 炎症性肠病和脓毒症患者数据及小鼠疾病模型 | 生物信息学 | 炎症性肠病,脓毒症 | 单细胞RNA测序,实时PCR,Western blot | 机器学习算法 | 转录组数据,单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 432 | 2025-10-07 |
Decoding Müllerian Duct Epithelial Regionalization
2025-Feb, Molecular reproduction and development
IF:2.7Q2
DOI:10.1002/mrd.70018
PMID:39994938
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综述 | 本文系统综述了苗勒氏管上皮沿头尾轴区域分化的分子机制及其在女性生殖道器官形成中的作用 | 整合了遗传小鼠模型、单细胞测序和类器官培养等多方面研究进展,全面解析苗勒氏管区域分化的关键调控因子 | 作为综述文章,未提供原始实验数据,主要基于现有研究进行总结和分析 | 阐明苗勒氏管上皮沿头尾轴区域分化的分子机制 | 苗勒氏管及其衍生的女性生殖道器官(输卵管、子宫、宫颈和上阴道) | 发育生物学 | 苗勒氏管异常和女性生殖道疾病 | 单细胞测序, 类器官培养, 遗传小鼠模型 | NA | NA | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 433 | 2025-10-07 |
Molecular profiling of skin cells identifies distinct cellular signatures in radiation-induced skin injury across various stages in the murine dataset
2025-Feb-25, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-025-00596-w
PMID:40001256
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析辐射诱导皮肤损伤中不同细胞亚群的分子特征和相互作用机制 | 首次在辐射诱导皮肤损伤中系统鉴定32个细胞亚群,揭示循环角质形成细胞通过BMP-Wnt-SMAD通路驱动伤口愈合和纤维化过程 | 研究基于小鼠模型,结果需要进一步在人类样本中验证 | 阐明辐射诱导皮肤损伤的分子机制和细胞相互作用 | C57BL/6小鼠皮肤细胞 | 单细胞基因组学 | 辐射性皮肤损伤 | 单细胞RNA测序, RT-PCR, 多重免疫荧光染色 | Seurat, Cellchat, SCP, ssGSEA | 单细胞转录组数据 | 71,412个细胞,来自辐射后7天和30天及未辐射小鼠皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 434 | 2025-10-07 |
Targeted delivery of CCL3 reprograms macrophage antigen presentation and enhances the efficacy of immune checkpoint blockade therapy in hepatocellular carcinoma
2025-Feb-23, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010947
PMID:39988347
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研究论文 | 本研究探讨CCL3通过重编程巨噬细胞抗原呈递功能增强肝细胞癌免疫检查点阻断疗法疗效的机制 | 首次揭示CCL3通过CCR5通路增强巨噬细胞代谢和抗原摄取能力,重塑肿瘤免疫微环境并提高免疫治疗敏感性 | 研究主要基于临床前模型,尚未在人体临床试验中验证 | 研究CCL3在调节肝细胞癌肿瘤免疫微环境中的作用及其对免疫治疗的增强效果 | 肝细胞癌肿瘤微环境中的巨噬细胞和T细胞 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,多重免疫荧光,共培养系统,共聚焦成像,代谢物检测 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据,影像数据 | 癌症基因组图谱数据库中的人肝细胞癌样本及临床前模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 435 | 2025-10-07 |
SREBF1-based metabolic reprogramming in prostate cancer promotes tumor ferroptosis resistance
2025-Feb-23, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02354-7
PMID:39988626
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研究论文 | 本研究探讨了前列腺癌中SREBF1介导的代谢重编程与铁死亡抵抗的关联及其治疗潜力 | 首次通过单细胞测序揭示SREBF1在前列腺癌中的高转录活性,并证明其通过代谢重编程促进铁死亡抵抗的新机制 | NA | 探究前列腺癌代谢重编程与铁死亡抵抗的关联及治疗策略 | 正常前列腺组织和不同类型前列腺癌组织 | 生物医学 | 前列腺癌 | 单细胞测序, 转录因子调控网络分析, hdWGCNA, bulk RNA分析 | NA | 单细胞测序数据, 批量RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 436 | 2025-10-07 |
Advances and Challenges in Modeling Autosomal Dominant Polycystic Kidney Disease: A Focus on Kidney Organoids
2025-Feb-19, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13020523
PMID:40002937
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综述 | 本文总结了常染色体显性多囊肾病器官模型构建的最新进展与挑战 | 重点关注iPSC衍生模型在模拟肾脏发育和病理表型方面的创新应用 | 当前技术存在血管化不足和成熟度有限等挑战 | 探索ADPKD疾病机制和促进药物发现 | 常染色体显性多囊肾病(ADPKD)器官模型 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞转录组学,微流体生物反应器培养系统 | 器官模型 | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 437 | 2025-10-07 |
The Endothelial Cell-Related Genes EIF1 and HSPA1B Contribute to the Pathogenesis of Alzheimer's Disease by Modulating Peripheral Immunoinflammatory Responses
2025-Feb-16, Brain sciences
IF:2.7Q3
DOI:10.3390/brainsci15020205
PMID:40002537
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现内皮细胞相关基因EIF1和HSPA1B通过调节外周免疫炎症反应参与阿尔茨海默病发病机制 | 首次鉴定出内皮细胞相关基因EIF1和HSPA1B作为AD关键基因,并揭示其通过调节外周免疫炎症反应参与AD发病的新机制 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步的实验验证来确认分子机制 | 探索内皮细胞通过调节外周免疫炎症反应参与阿尔茨海默病发病的分子机制 | 阿尔茨海默病患者的内皮细胞和免疫炎症反应 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, LASSO回归, 随机森林算法, GSEA, GSVA, ssGSEA | LASSO, 随机森林 | RNA测序数据 | 数据集GSE157827和队列外周血RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 438 | 2025-10-07 |
EGFR-Mutant Lung Adenocarcinoma Cell-Derived Exosomal miR-651-5p Induces CD8+ T Cell Apoptosis via Downregulating BCL2 Expression
2025-Feb-15, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13020482
PMID:40002895
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研究论文 | 本研究揭示了EGFR突变肺腺癌细胞通过外泌体miR-651-5p诱导CD8+ T细胞凋亡的机制 | 首次发现EGFR突变肺腺癌细胞通过外泌体传递miR-651-5p下调BCL2表达促进CD8+ T细胞凋亡,并提出miR-651-5p拮抗剂可增强PD-1抑制剂疗效 | NA | 探究EGFR突变非小细胞肺癌患者对PD-1/PD-L1抑制剂疗效不佳的机制 | EGFR突变肺腺癌细胞、CD8+ T细胞、人源化小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 小RNA测序, 单细胞测序, 流式细胞术, 细胞共培养 | NA | 测序数据, 流式细胞数据, 临床标本数据 | NA | NA | small RNA sequencing, single-cell sequencing | NA | NA |
| 439 | 2025-10-07 |
Assessing the Causal Relationship Between Plasma Proteins and Pulmonary Fibrosis: A Systematic Analysis Based on Mendelian Randomization
2025-Feb-14, Biology
DOI:10.3390/biology14020200
PMID:40001968
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研究论文 | 通过孟德尔随机化方法系统评估血浆蛋白与肺纤维化之间的因果关系并识别潜在药物靶点 | 首次系统应用MR方法结合多种生物信息学分析识别肺纤维化的因果蛋白靶点 | 基于欧洲人群的GWAS数据,可能限制结果在其他人群的普适性 | 识别肺纤维化的因果血浆蛋白靶点并评估其治疗潜力 | 血浆蛋白与肺纤维化患者 | 生物信息学 | 肺纤维化 | 孟德尔随机化, 富集分析, 蛋白质-蛋白质相互作用网络, 药物预测, 分子对接, 单细胞测序 | MR分析 | 基因组数据, 蛋白质组数据 | 血浆蛋白数据35,559例, PF相关数据469,126例 | NA | 全基因组关联分析, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 440 | 2025-10-07 |
The Involvement of RIPK1 in Alopecia Areata
2025-Feb-13, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26041565
PMID:40004031
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研究论文 | 本研究探讨了RIPK1在斑秃发病机制中的作用及其抑制剂对疾病发展的影响 | 首次发现RIPK1在斑秃中表达上调,并通过调节树突状细胞和CD8 T细胞参与疾病发病 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类临床中得到验证 | 研究RIPK1在斑秃发病机制中的作用 | 斑秃小鼠模型和毛囊器官培养 | 皮肤病学 | 斑秃 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据 | 斑秃小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |