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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2025-10-07 |
Analysis of toxicity and mechanisms of busulfan in non-obstructive azoospermia: A genomic and toxicological approach integrating molecular docking, single-cell sequencing, and experimentation in vivo
2025-Feb, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.117878
PMID:39933234
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研究论文 | 本研究通过整合分子对接、单细胞测序和体内实验,揭示了白消安导致非梗阻性无精子症的关键分子机制 | 首次发现POLE和LRAT蛋白是白消安诱导睾丸毒性的关键靶点,并揭示了免疫细胞浸润在疾病进程中的作用 | 研究主要聚焦于白消安的毒性机制,对其他化疗药物的适用性需要进一步验证 | 阐明白消安导致非梗阻性无精子症的分子机制和关键信号通路 | 白消安处理的睾丸组织及精原干细胞 | 生殖医学 | 男性不育症 | 分子对接, 单细胞RNA测序, 体内实验 | NA | 基因组数据, 单细胞转录组数据, 实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 402 | 2025-10-07 |
Atlas of expression of acyl CoA binding protein/diazepam binding inhibitor (ACBP/DBI) in human and mouse
2025-Feb-26, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07447-w
PMID:40011442
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研究论文 | 本研究绘制了酰基辅酶A结合蛋白/地西泮结合抑制剂(ACBP/DBI)在人类和小鼠组织中的表达图谱 | 首次系统揭示ACBP/DBI在哺乳动物特定细胞类型中的保守表达机制及其共调控网络 | 研究主要基于数据库挖掘,缺乏实验验证 | 探究ACBP/DBI在人类和小鼠不同器官中的表达模式及调控机制 | 人类和小鼠的正常组织、恶性肿瘤组织 | 生物信息学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序,转录组学,蛋白质组学,系统数据挖掘 | NA | 转录组数据,蛋白质组数据,单细胞RNA测序数据 | 人类和小鼠多种组织器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 403 | 2025-10-07 |
KRT7 promotes pancreatic cancer metastasis by remodeling the extracellular matrix niche through FGF2-fibroblast crosstalk
2025-Feb-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-84129-1
PMID:40011455
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研究论文 | 本研究揭示了KRT7通过FGF2-成纤维细胞相互作用重塑细胞外基质微环境促进胰腺癌肝转移的机制 | 首次发现KRT7通过调控FGF2分泌影响癌症相关成纤维细胞功能,重塑转移前微环境 | 样本量有限,机制研究主要基于动物模型 | 探究KRT7在胰腺癌转移中的作用机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)患者样本和肿瘤细胞 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | RNA测序,蛋白质组学,单细胞RNA测序 | 原位肿瘤模型小鼠 | 基因表达数据,蛋白质数据 | 24个PDAC样本的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 404 | 2025-10-07 |
Immunological profile of lactate metabolism-related genes in Psoriasis a comprehensive analysis based on bulk and single-cell RNA sequencing data
2025-Feb-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-91237-z
PMID:40011693
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研究论文 | 通过整合分析批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,研究银屑病中乳酸代谢相关基因的免疫学特征 | 首次结合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据系统分析银屑病中乳酸代谢相关基因的免疫学作用 | 研究基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证 | 阐明乳酸代谢在银屑病发病机制中的作用 | 银屑病患者皮肤组织 | 生物信息学 | 银屑病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个数据集(GSE13355, GSE109248)的合并样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 405 | 2025-10-07 |
Immune dysregulation in COVID-19 induced ARDS in kidney transplant recipients revealed by single-cell RNA sequencing
2025-Feb-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-91439-5
PMID:40011702
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示肾移植受者与非移植受者在COVID-19诱发ARDS中的免疫失调差异 | 首次构建肾移植受者COVID-19相关ARDS的单细胞图谱,发现S100A9+巨核细胞亚群和XAF1+效应T细胞亚群的特异性变化 | 样本来源仅限于外周血,未涉及肺部局部免疫反应;样本量相对有限 | 探索肾移植受者与非移植受者在COVID-19诱发ARDS中的免疫应答差异,寻找潜在治疗靶点 | 肾移植受者、非移植受者的COVID-19相关ARDS患者及健康对照 | 单细胞组学 | COVID-19相关急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序 | 细胞聚类分析、富集分析 | 单细胞转录组数据 | 108,320个外周血细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 406 | 2025-10-07 |
Combining single-cell ATAC and RNA sequencing for supervised cell annotation
2025-Feb-26, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06084-6
PMID:40011801
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研究论文 | 本研究探索了结合单细胞ATAC和RNA测序数据在监督式细胞注释中的效果 | 首次系统评估了结合单细胞ATAC和RNA测序数据在监督式细胞注释中的性能提升,而非仅关注无监督方法 | 在神经元细胞注释中未观察到性能提升,结果可能受细胞类型和数据集特性影响 | 评估多组学数据整合对监督式细胞类型注释性能的改善 | 人类外周血单个核细胞(PBMC)和阿尔茨海默病神经元细胞 | 单细胞多组学分析 | 阿尔茨海默病 | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | 随机森林, 支持向量机, 逻辑回归, scVI | 单细胞多组学数据 | 两个独立数据集:PBMC和神经元细胞 | 10x Genomics | 单细胞多组学 | 10x Chromium | 10x Genomics多组学平台 |
| 407 | 2025-10-07 |
Pathological and molecular insights into intravenous leiomyomatosis: an integrative multi-omics study
2025-Feb-26, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05919-9
PMID:40011937
|
研究论文 | 通过整合多组学方法研究静脉内平滑肌瘤病的病理和分子特征 | 首次对静脉内平滑肌瘤病进行综合多组学分析,揭示了染色体10q缺失与血管形态作为预测侵袭性行为的重要标志物 | 样本量有限,疾病罕见性限制了研究的规模 | 探索静脉内平滑肌瘤病的发生发展机制,为诊断和治疗提供新见解 | 静脉内平滑肌瘤组织、子宫肌瘤组织和正常子宫肌层组织 | 数字病理学 | 平滑肌瘤病 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学分析, H&E染色 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组数据, 病理图像 | 8对配对的IVL和正常子宫肌层新鲜冷冻组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 408 | 2025-10-07 |
Exploring the hepatic-ophthalmic axis through immune modulation and cellular dynamics in diabetic retinopathy and non-alcoholic fatty liver disease
2025-Feb-26, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-025-00730-z
PMID:40011971
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析探索糖尿病视网膜病变和非酒精性脂肪肝病中的免疫调节和细胞动态变化 | 首次系统揭示T细胞、巨噬细胞和内皮细胞在DR和NAFLD中的共同基因特征及CD45信号通路的关键作用 | 基于公共数据库的回顾性分析,缺乏实验验证 | 阐明糖尿病视网膜病变和非酒精性脂肪肝病之间的肝-眼轴相互作用机制 | T细胞、巨噬细胞、内皮细胞等免疫相关细胞群体 | 生物信息学 | 糖尿病视网膜病变,非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序,差异基因表达分析,伪时间分析,细胞通讯分析 | CellChat,GSEA,GSVA | 单细胞RNA测序数据 | 从GEO数据库获取的PDR和NAFLD数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 409 | 2025-10-07 |
Enhanced conversion of T cells into CAR T cells by modulation of the MAPK/ERK pathway
2025-Feb-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.101970
PMID:39938523
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研究论文 | 通过调节MAPK/ERK通路增强T细胞向CAR T细胞的转化效率 | 首次通过单细胞多组学分析揭示CAR T细胞生成过程中的分子事件,发现ERK2磷酸酶在CAR T细胞中上调 | 研究主要基于体外实验,需要进一步体内验证 | 改善CAR T细胞的生成效率 | 健康供体和患者的T细胞 | 单细胞分析 | NA | 单细胞多组学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 410 | 2025-10-07 |
Single-cell profiling and clinical characteristics analysis of lung squamous carcinoma
2025-Feb-27, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01556-7
PMID:40014154
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析肺鳞癌的肿瘤微环境特征并构建预后风险模型 | 首次在504个肺鳞癌样本中整合TCGA和GEO数据进行单细胞分析,识别出具有不同免疫特征和预后的基因簇,并建立基于CST3、TGM2和JUN的三基因风险评分模型 | 研究基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证 | 阐明肺鳞癌的肿瘤微环境特征和临床异质性 | 肺鳞癌患者样本 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, q-PCR, 免疫荧光 | 多变量COX回归模型, 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据, 临床数据 | 504个肺鳞癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 411 | 2025-10-07 |
Multi-omics analyses and machine learning prediction of oviductal responses in the presence of gametes and embryos
2025-Feb-26, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.100705
PMID:40009070
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研究论文 | 通过多组学分析和机器学习预测输卵管对配子和胚胎存在的响应机制 | 首次结合转录组学、蛋白质组学和单细胞测序技术,开发基于transformer的机器学习模型整合多组学数据预测转录因子对蛋白质表达的影响 | 小鼠模型与人类输卵管炎症反应存在差异,样本时间点有限 | 阐明输卵管与配子/胚胎之间的适应性相互作用机制 | 小鼠输卵管组织和输卵管液 | 机器学习 | 生殖系统疾病 | RNA-seq, scRNA-seq, 蛋白质组学 | transformer | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 不同交配后时间点的小鼠输卵管样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 412 | 2025-10-07 |
Denosumab Enhances antitumour Immunity by Suppressing SPP1 and Boosting Cytotoxic T Cells
2025-Feb-26, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-1094
PMID:40009710
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现地诺单抗通过抑制SPP1表达和增强细胞毒性T细胞活性来增强抗肿瘤免疫 | 首次揭示地诺单抗在抗肿瘤免疫中的新作用机制,发现其通过调节SPP1-CD8A轴增强免疫反应 | 样本量有限,仅针对骨巨细胞瘤患者,需要更多癌种验证 | 探索地诺单抗在抗肿瘤免疫中的作用机制 | 骨巨细胞瘤患者样本和34种癌症的泛癌分析 | 单细胞测序分析 | 骨巨细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 9例人骨巨细胞瘤样本(6例未治疗,3例地诺单抗治疗)和9对治疗前后配对样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 413 | 2025-10-07 |
Cancer-associated fibroblasts promote EGFR-TKI resistance via the CTHRC1/glycolysis/H3K18la positive feedback loop
2025-Feb-26, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03318-y
PMID:40011576
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现CTHRC1+癌症相关成纤维细胞通过糖代谢/组蛋白乳酸化正反馈环路促进肺癌EGFR-TKI耐药 | 首次揭示CTHRC1+CAF亚群通过CTHRC1/糖酵解/H3K18la正反馈环路驱动EGFR-TKI耐药的新机制,并发现天然化合物Gambogenic Acid可破坏该环路 | NA | 探究癌症相关成纤维细胞在EGFR-TKI耐药中的作用机制 | 肺癌患者肿瘤组织中的癌症相关成纤维细胞 | 肿瘤生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 接受EGFR-TKI治疗的肺癌患者肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 414 | 2025-02-28 |
Publisher Correction: Single-Cell RNA sequencing reveals mitochondrial dysfunction in microtia chondrocytes
2025-Feb-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-90745-2
PMID:40011623
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 415 | 2025-10-07 |
Pde4b-regulated cAMP signaling pathway in the AUDGABA-S1TrSst circuit underlies acute-stress-induced anxiety-like behavior
2025-Feb-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115253
PMID:39891910
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研究论文 | 本研究揭示了急性应激通过AUDGABA-S1TrSst神经环路中Pde4b调控的cAMP信号通路诱发焦虑样行为的机制 | 首次发现初级体感皮层S1Tr区GABA能生长抑素神经元在急性应激中的关键作用,并阐明AUD-S1Tr投射中Pde4b-cAMP信号通路的调控机制 | 研究主要聚焦于特定神经环路,其他可能参与焦虑行为的脑区未充分探索 | 探索急性应激诱发焦虑样行为的神经和分子机制 | 小鼠模型中的特定神经环路(AUDGABA-S1TrSst回路) | 神经科学 | 焦虑障碍 | 单细胞测序,空间转录组测序,蛋白敲低 | NA | 基因表达数据,神经活动数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 416 | 2025-10-07 |
Th1-poised naive CD4 T cell subpopulation reflects anti-tumor immunity and autoimmune disease
2025-Feb-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57237-3
PMID:40000667
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序鉴定出naive CD4 T细胞中存在具有Th1预备特征的亚群,该亚群表达高水平IL-7R并参与抗肿瘤免疫和自身免疫疾病 | 首次在人和小鼠naive CD4 T细胞中发现表达超高IL-7R的Th1预备亚群,并证明其与抗PD-1治疗反应和多发性硬化疾病状态相关 | NA | 探索naive CD4 T细胞的异质性及其在疾病背景和治疗反应中的作用 | 小鼠和人类的naive CD4 T细胞 | 免疫学 | 癌症, 多发性硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 417 | 2025-10-07 |
Single-cell multi-omics analysis identifies SPP1+ macrophages as key drivers of ferroptosis-mediated fibrosis in ligamentum flavum hypertrophy
2025-Feb-25, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-025-00746-6
PMID:40001138
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研究论文 | 通过单细胞多组学分析揭示了SPP1+巨噬细胞通过SPP1-CD44轴调控铁死亡促进黄韧带肥厚纤维化的机制 | 首次在单细胞水平构建黄韧带肥厚的细胞图谱,发现SPP1+巨噬细胞亚群通过调控铁死亡驱动纤维化进程 | 研究样本量有限,动物模型验证需要进一步扩展 | 探究黄韧带肥厚的细胞和分子机制 | 人类黄韧带样本和动物模型 | 数字病理学 | 脊柱疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 孟德尔随机化, 透射电子显微镜, 多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据, 组织切片图像 | 人类黄韧带样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 空间多组学 | NA | NA |
| 418 | 2025-10-07 |
Revolutionizing the treatment of intervertebral disc degeneration: an approach based on molecular typing
2025-Feb-25, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06225-8
PMID:40001145
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研究论文 | 本研究开发了一种基于软骨细胞分化相关基因的椎间盘退变分子分型系统,并验证了其临床转化价值 | 首次基于软骨细胞分化轨迹构建椎间盘退变分子分型系统,并发现吉非替尼可将低分化亚型转化为高分化亚型 | 研究样本量有限,需要更大规模临床验证 | 建立椎间盘退变的分子分型系统并探索精准治疗策略 | 椎间盘退变患者 | 生物信息学 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序, 多组学分析 | ConsensusClusterPlus, pRRophetic | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 419 | 2025-10-07 |
Targeting RECQL4 in hepatocellular carcinoma: from prognosis to therapeutic potential
2025-Feb-25, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-025-02107-6
PMID:40001159
|
研究论文 | 评估RECQL4在肝细胞癌中的预后价值和治疗潜力 | 首次系统评估RECQL4在肝细胞癌中的预后价值及其与血管生成、免疫细胞浸润和药物敏感性的关联 | 研究主要基于数据库分析和细胞实验,缺乏临床样本验证 | 评估RECQL4作为肝细胞癌预后标志物的临床效用并探索其治疗潜力 | 肝细胞癌患者数据、HCC细胞系(Hep3B、Huh7)和正常肝细胞系(MHA) | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | qPCR、Western blotting、CCK-8 assay、EdU assay、克隆形成实验、伤口愈合实验、transwell实验、单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据、临床数据、单细胞RNA-seq数据 | TCGA数据库的多种癌症类型数据、HCC细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 420 | 2025-10-07 |
Identification of Mitochondrial-related Characteristic Biomarkers in Osteosarcoma using Bioinformatics and Machine Learning
2025-Feb-25, Combinatorial chemistry & high throughput screening
IF:1.6Q3
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研究论文 | 通过生物信息学和机器学习方法识别骨肉瘤中线粒体相关特征生物标志物 | 首次结合线粒体定位基因与差异表达分析识别骨肉瘤中线粒体相关特征基因,并应用机器学习算法筛选出UCP2和PRDX4作为诊断生物标志物 | 研究基于公共数据库数据,需要进一步实验验证生物标志物的临床适用性 | 识别骨肉瘤中线粒体相关诊断生物标志物并探讨其临床意义 | 骨肉瘤组织样本和细胞系 | 生物信息学, 机器学习 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, RT-PCR, 机器学习算法 | LASSO回归, SVM-RFE | mRNA表达谱 | 来自GSE16088和GSE19276数据库的骨肉瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |