单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 652 篇文献，本页显示第 381 - 400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2025-10-07 |
ANKRD22 participates in the proinflammatory activities of macrophages in the colon cancer tumor microenvironment
2025-Feb-01, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03930-z
PMID:39891675
|
研究论文 | 本研究探讨ANKRD22在结肠癌肿瘤微环境中巨噬细胞促炎活性中的作用 | 首次揭示ANKRD22在M1型肿瘤相关巨噬细胞中的表达特征及其对巨噬细胞亚型分布的调控作用 | ANKRD22在结肠TAMs中的具体作用机制仍需进一步阐明 | 阐明ANKRD22在结肠癌肿瘤微环境中巨噬细胞功能调控中的作用 | 结肠癌肿瘤微环境中的肿瘤相关巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,皮下异种移植实验 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据 | 结肠癌患者组织样本及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 382 | 2025-10-07 |
Elevated SAMD3 expression in T cells predicts improved survival in pancreatic ductal adenocarcinoma patients
2025-Feb-01, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-03948-x
PMID:39891760
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现T细胞中SAMD3高表达与胰腺导管腺癌患者生存改善相关 | 首次发现SAMD3在细胞毒性CD8+ T细胞中的表达特征及其与T细胞功能和患者预后的关联 | 研究样本量有限，需要在更大队列中验证SAMD3的预后价值 | 探究SAMD3在PDAC肿瘤微环境中T细胞的功能作用及临床意义 | 胰腺导管腺癌患者样本和肿瘤特异性OT-I/卵清蛋白小鼠模型 | 单细胞转录组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 小鼠模型 | NA | 单细胞转录组数据, 免疫组织化学图像 | 人类PDAC样本和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 383 | 2025-10-07 |
Pre-immunotherapy alters stereotactic ablative radiotherapy-induced systemic T cell responses in early-stage NSCLC
2025-Feb-01, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03935-8
PMID:39891774
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了立体定向消融放疗（SABR）联合免疫治疗对早期非小细胞肺癌患者系统性T细胞反应的影响 | 首次在单细胞分辨率下比较了单纯SABR与联合免疫治疗对系统性T细胞反应的差异，发现两者诱导相反的T细胞反应模式 | 样本量较小（仅7例患者），需要更大规模研究验证 | 探究SABR联合免疫治疗对早期非小细胞肺癌患者系统性T细胞反应的影响机制 | 早期非小细胞肺癌患者的外周血T细胞 | 单细胞组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序, 流式细胞术, 批量RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据, 流式细胞数据 | 7例早期非小细胞肺癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, T细胞受体测序 | NA | NA |
| 384 | 2025-10-07 |
Cell autonomous TLR4 signaling modulates TGF-β induced activation of human cardiac fibroblasts
2025-Feb-28, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2025.e42452
PMID:40028530
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序发现TLR4是心脏成纤维细胞中主要表达的免疫传感器，并证明抑制TLR4信号可减轻TGF-β诱导的纤维化变化 | 首次揭示心脏成纤维细胞中自主性TLR4信号通路在调节TGF-β诱导纤维化过程中的关键作用 | 研究仅在体外实验条件下进行，缺乏体内验证 | 探究细胞自主性免疫信号在成人心脏成纤维细胞纤维化调节中的作用机制 | 小鼠和人类心力衰竭患者的心脏成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | FACS, 单细胞测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 来自Collagen1-α1GFP小鼠和人类心力衰竭患者的心脏成纤维细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 385 | 2025-10-07 |
Phylogeny and species delimitation of ciliates in the genus Spirostomum (class Heterotrichea) using single-cell transcriptomes
2025-Feb-27, BMC ecology and evolution
IF:2.3Q3
DOI:10.1186/s12862-025-02353-3
PMID:40011795
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组数据对旋口虫属纤毛虫进行系统发育分析和物种界定 | 首次在旋口虫属中应用单细胞转录组数据，结合多物种溯祖模型进行物种界定，并开发了从转录组数据重建核糖体RNA基因序列的工作流程 | 样本主要来自韩国和美国，地理覆盖范围有限，可能无法完全代表该属的全球多样性 | 阐明旋口虫属纤毛虫的系统发育关系和物种边界 | 旋口虫属纤毛虫（代表6个形态种） | 系统发育基因组学 | NA | 单细胞RNA测序，系统发育分析，物种界定分析 | 多物种溯祖模型，邻接网络分析 | 转录组数据，蛋白质编码基因序列 | 37个旋口虫标本（25个新生成转录组+12个来自GenBank） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 386 | 2025-10-07 |
Global landscape of hepatic organoid research: A bibliometric and visual study
2025-Feb-27, World journal of hepatology
IF:2.5Q2
DOI:10.4254/wjh.v17.i2.95624
PMID:40027550
|
文献计量分析 | 通过文献计量学方法分析全球肝类器官研究的发展格局和趋势 | 首次对肝类器官研究领域进行全面的文献计量学分析，识别关键研究趋势和学术合作机会 | 仅基于Web of Science数据库，可能未涵盖所有相关文献 | 分析肝类器官研究的全球科研产出并评估当前成就与未来趋势 | 肝类器官研究相关的科学文献 | 生物医学研究 | 肝病 | 文献计量分析，单细胞RNA测序 | NA | 文献数据 | 991篇文献（2010-2024年） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 387 | 2025-10-07 |
Uncovering immune cell heterogeneity in hepatocellular carcinoma by combining single-cell RNA sequencing with T-cell receptor sequencing
2025-Feb-27, World journal of hepatology
IF:2.5Q2
DOI:10.4254/wjh.v17.i2.99046
PMID:40027555
|
研究论文 | 通过结合单细胞RNA测序和T细胞受体测序技术，揭示肝细胞癌中免疫细胞的异质性 | 首次在肝细胞癌中结合单细胞RNA测序和T细胞受体测序分析免疫细胞异质性，发现两个新的T细胞亚群 | 样本量有限，研究结果需要在更大队列中验证 | 研究肝细胞癌发展过程中的关键生物标志物基因和免疫细胞亚群反应 | 肝细胞癌患者肿瘤组织和癌旁正常组织中的免疫细胞 | 单细胞组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序 | 生物信息学分析 | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据 | 肝细胞癌患者的肿瘤和癌旁组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 | NA | NA |
| 388 | 2025-10-07 |
Cross-tissue multi-omics analyses reveal the gut microbiota's absence impacts organ morphology, immune homeostasis, bile acid and lipid metabolism
2025-Feb, iMeta
IF:23.7Q1
DOI:10.1002/imt2.272
PMID:40027481
|
研究论文 | 通过跨组织多组学分析揭示肠道微生物缺失对器官形态、免疫稳态、胆汁酸和脂质代谢的影响 | 首次整合空间转录组学、单细胞RNA测序和靶向胆汁酸代谢组学系统评估无菌小鼠多器官表型 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类样本中验证 | 探究肠道微生物缺失对宿主多器官生理功能的系统性影响 | 无菌小鼠和特定病原体自由小鼠 | 多组学整合分析 | 代谢性疾病 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 靶向代谢组学 | NA | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据, 代谢组数据 | 无菌小鼠和特定病原体自由小鼠的比较研究 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 靶向代谢组学 | NA | NA |
| 389 | 2025-10-07 |
IL-1β and associated molecules as prognostic biomarkers linked with immune cell infiltration in colorectal cancer: an integrated statistical and machine learning approach
2025-Feb-28, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01989-3
PMID:40019680
|
研究论文 | 本研究通过整合生物信息学和机器学习方法，识别结直肠癌中与免疫细胞浸润相关的预后生物标志物 | 开发了结合统计分析和机器学习的综合流程，首次系统鉴定IL-1β等关键基因作为结直肠癌诊断和预后的生物标志物 | 基于公开数据集的分析，需要实验验证；样本来源和数量未明确说明 | 开发结直肠癌诊断和预后生物标志物识别方法 | 结直肠癌患者基因表达数据和临床数据 | 机器学习 | 结直肠癌 | scRNA-seq, 启动子甲基化分析, 基因表达分析 | KNN, ANN, 随机森林 | 基因表达数据, 甲基化数据, 临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 390 | 2025-10-07 |
SpaceBar enables clone tracing in spatial transcriptomic data
2025-Feb-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.10.637514
PMID:39990434
|
研究论文 | 开发了一种名为SpaceBar的空间条形码技术，能够在空间转录组数据中同时进行克隆追踪和基因表达分析 | 提出结合96种合成条形码序列与成像空间转录组技术(seqFISH)的新方法，实现克隆身份识别与空间基因表达的同时分析 | 目前仅在小鼠黑色素瘤异种移植模型中验证，尚未在其他肿瘤类型或更复杂组织中测试 | 开发能够在复杂组织环境中区分克隆动态与环境驱动转录调控的分析框架 | 黑色素瘤细胞和小鼠肿瘤异种移植模型 | 空间转录组学 | 黑色素瘤 | 成像空间转录组技术(seqFISH), 细胞条形码标记 | NA | 空间转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞分析 | NA | seqFISH (顺序荧光原位杂交) 空间转录组技术 |
| 391 | 2025-10-07 |
Spatially distinct cellular and molecular landscapes define prognosis in triple negative breast cancer
2025-Feb-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.10.637503
PMID:39990419
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析三阴性乳腺癌不同预后患者的肿瘤异质性 | 首次利用空间转录组学深入揭示三阴性乳腺癌不同预后的细胞和分子基础 | 回顾性研究，样本量有限（32例患者） | 探索三阴性乳腺癌不同预后的空间和分子异质性机制 | 三阴性乳腺癌患者的FFPE组织样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学，免疫荧光，细胞类型反卷积，空间熵分析，功能富集分析 | 卷积神经网络 | 空间转录组数据，图像数据 | 32例初治女性患者（17例良好预后，15例不良预后） | NanoString | 空间转录组学 | GeoMX Digital Spatial Profiler | GeoMx人类全转录组图谱面板 |
| 392 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics of X-ray irradiated Drosophila wing discs reveals heterogeneity related to cell-cycle status and cell location
2025-Feb-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.10.627868
PMID:39990483
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组技术分析X射线辐射对果蝇翅盘细胞的影响，揭示了与细胞周期状态和细胞位置相关的异质性 | 首次将用于研究市场集中度的赫芬达尔-赫希曼指数应用于基因表达异质性分析，并发现辐射诱导基因表达在区域间和区域内均存在显著异质性 | 研究仅限于果蝇翅盘这一相对简单的组织模型，结果可能不适用于更复杂的哺乳动物组织 | 探究X射线辐射对组织细胞异质性的影响机制 | 果蝇翅盘细胞 | 单细胞转录组学 | 辐射损伤 | 单细胞RNA测序 | 聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 393 | 2025-10-07 |
Molecularly-guided spatial proteomics captures single-cell identity and heterogeneity of the nervous system
2025-Feb-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.10.637505
PMID:39990460
|
研究论文 | 本研究利用空间单细胞蛋白质组学技术探索神经系统细胞身份和异质性 | 首次将免疫染色引导的激光捕获显微切割与LC-MS结合，应用于异质性中枢神经系统的空间单细胞蛋白质组学研究 | 研究主要聚焦于特定脑区域和损伤模型，尚未扩展到更广泛的神经系统疾病 | 开发和应用空间单细胞蛋白质组学方法以理解神经系统生物学和神经疾病分子机制 | 大脑皮层和黑质神经元群体、刺伤损伤相关的神经免疫变化、肠肌层神经节细胞与神经束 | 空间蛋白质组学 | 神经系统疾病 | 免疫染色引导激光捕获显微切割、液相色谱-质谱联用 | NA | 蛋白质组数据 | 多个脑区域和神经组织样本 | NA | 空间单细胞蛋白质组学、激光捕获显微切割 | LCM、LC-MS | 免疫染色引导激光捕获显微切割与液相色谱-质谱联用技术 |
| 394 | 2025-10-07 |
A Benchmarking Study of Random Projections and Principal Components for Dimensionality Reduction Strategies in Single Cell Analysis
2025-Feb-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.04.636499
PMID:39974925
|
研究论文 | 系统评估主成分分析和随机投影在单细胞RNA测序数据降维中的性能比较 | 首次对PCA和RP方法在单细胞分析中进行全面基准测试，包括计算效率和下游分析效果的多维度评估 | 仅评估了线性降维方法，未包含非线性降维技术的比较 | 比较不同降维策略在单细胞数据分析中的性能 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | PCA, SVD, 随机SVD, 稀疏随机投影, 高斯随机投影 | 基因表达数据 | 多个公开可用的标记和未标记单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 395 | 2025-10-07 |
Seq-Scope-eXpanded: Spatial Omics Beyond Optical Resolution
2025-Feb-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.04.636355
PMID:39975076
|
研究论文 | 提出Seq-Scope-X技术，通过组织膨胀实现亚微米级空间转录组和蛋白质组分析 | 结合组织膨胀技术与Seq-Scope方法，突破光学分辨率限制，实现亚微米级空间多组学分析 | NA | 开发超高分辨率空间多组学分析技术 | 肝脏组织、脑组织、结肠组织、小鼠脾脏、人类扁桃体 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学、空间蛋白质组学、组织膨胀技术 | NA | 空间转录组数据、空间蛋白质组数据 | NA | NA | 空间转录组学、空间蛋白质组学 | Seq-Scope-X | 结合组织膨胀的Seq-Scope改进技术，支持亚微米级分辨率的转录组和蛋白质组分析 |
| 396 | 2025-10-07 |
The profiles of immunosuppressive microenvironment in the Lauren intestinal-type gastric adenocarcinoma
2025-Feb-01, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03938-5
PMID:39891785
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术揭示了Lauren肠型胃腺癌免疫抑制微环境的细胞组成和相互作用机制 | 首次系统鉴定IGAC中HAVCR2+VCAM1+耗竭T细胞和LAYN+TNFRSF4+调节性T细胞等关键免疫抑制细胞亚群，并证实其与疾病进展的相关性 | 样本量相对有限（15例患者），且仅针对中国人群进行研究 | 探究Lauren肠型胃腺癌免疫抑制机制，为改善免疫治疗效果寻找潜在靶点 | 15例中国Lauren肠型胃腺癌患者的肿瘤组织和癌旁正常黏膜 | 数字病理 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫荧光, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据, 流式数据 | 15例IGAC患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 397 | 2025-10-07 |
Applications of Single-Cell Omics Technologies for Induced Pluripotent Stem Cell-Based Cardiovascular Research
2025-Feb-28, International journal of stem cells
IF:2.5Q3
DOI:10.15283/ijsc23183
PMID:39129179
|
综述 | 探讨单细胞组学技术与诱导多能干细胞在心血管研究中的整合应用 | 整合单细胞组学与iPSC技术，探索空间组学等新兴范式在揭示心脏组织空间结构方面的潜力 | NA | 阐明心脏健康与疾病的分子复杂性，推动心血管研究发展 | 心脏细胞、诱导多能干细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间组学 | NA | 基因组, 转录组, 蛋白质组 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 398 | 2025-10-07 |
A novel telomere-associated genes signature for the prediction of prognosis and treatment responsiveness of hepatocellular carcinoma
2025-Feb-27, Biological procedures online
IF:3.7Q1
DOI:10.1186/s12575-025-00271-8
PMID:40016654
|
研究论文 | 本研究开发了一个包含18个端粒相关基因的肝细胞癌预后预测模型 | 首次建立了基于端粒相关基因的肝细胞癌预后模型，并通过孟德尔随机化分析确认了ASF1A基因与酒精性肝细胞癌的因果关系 | 研究主要基于TCGA数据库，需要更多独立队列验证模型的普适性 | 开发肝细胞癌预后预测模型并探索端粒相关基因在肝细胞癌中的作用 | 肝细胞癌患者组织和细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组测序,空间转录组测序,Western blotting,Transwell迁移实验,伤口愈合实验,集落形成实验 | Cox回归模型,LASSO回归模型 | 基因表达数据,临床数据 | 374例肝细胞癌样本和50例正常肝组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 399 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Extensive Heterogeneity and Unique Gene Trajectories in Non-Transformed and Transformed Human Lung Epithelial Cells: Insights into the Role of LncRNAs in Tumor Heterogeneity
2025-Feb-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26041690
PMID:40004153
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示人肺上皮细胞在非转化和转化状态下的转录组异质性及lncRNA在肿瘤异质性中的作用 | 首次在单细胞水平系统比较非转化与转化肺上皮细胞的lncRNA表达轨迹，揭示lncRNA亚型对细胞异质性的贡献机制 | 研究仅使用两种细胞系（BEAS2B和H460），未涉及原代肿瘤样本或体内模型验证 | 探究肺上皮细胞在癌变过程中的转录组异质性特征及lncRNA的作用机制 | 永生化非转化肺上皮细胞系BEAS2B和转化肺上皮细胞系H460 | 单细胞转录组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 两种肺上皮细胞系（BEAS2B和H460） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 400 | 2025-10-07 |
Revealing the core suppression effects of various Di (2-ethylhexyl) phthalate exposure on early meiosis progression in postnatal male mice via single-cell RNA sequencing
2025-Feb, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.117866
PMID:39923572
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示DEHP暴露对雄性小鼠早期减数分裂进程的核心抑制作用 | 首次通过单细胞RNA测序全面证明DEHP通过Trp53介导的p38-MAPK通路抑制雄性生殖细胞早期减数分裂进程 | 研究仅限于啮齿类动物模型，未涉及人类样本验证 | 探究DEHP暴露对雄性生殖系统早期减数分裂影响的分子机制 | 出生后雄性小鼠睾丸细胞 | 单细胞转录组学 | 男性生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 42,000个细胞，3,172,754,990条reads | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |