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当前共找到 649 篇文献，本页显示第 381 - 400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2025-10-07 |
ETVs dictate hPSC differentiation by tuning biophysical properties
2025-Feb-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56591-6
PMID:40011454
|
研究论文 | 本研究揭示了ETV转录因子通过调控细胞生物物理特性决定人类多能干细胞分化的机制 | 首次确立ETV转录因子作为细胞生物物理特性和谱系分化的关键调控因子 | 研究主要基于体外模型，体内验证尚需进一步研究 | 探索转录网络如何调控细胞生物物理特性及其在干细胞分化中的作用 | 人类多能干细胞(hPSCs)、类原肠胚和胰腺分化模型 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 382 | 2025-10-07 |
Kernel-bounded clustering for spatial transcriptomics enables scalable discovery of complex spatial domains
2025-Feb-14, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.278983.124
PMID:39909714
|
研究论文 | 提出一种名为核边界聚类(KBC)的新聚类算法，用于空间转录组学数据分析 | 首次使用分布核来招募聚类成员，能够发现不同密度、大小和形状的聚类，并且是线性时间复杂度的聚类算法 | NA | 开发能够有效处理大规模空间转录组数据集的快速聚类方法 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 核边界聚类(KBC) | 基因表达谱和空间信息 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 383 | 2025-10-07 |
Single-cell delineation of the microbiota-gut-brain axis: Probiotic intervention in Chd8 haploinsufficient mice
2025-Feb-12, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100768
PMID:39914389
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研究论文 | 本研究通过构建CHD8单倍体不足小鼠模型，利用单细胞转录组技术探索了肠道微生物群-肠-脑轴在自闭症谱系障碍中的作用机制 | 首次在单细胞分辨率下构建了ASD相关神经和肠道变化的转录组图谱，并发现乳酸杆菌干预可选择性挽救社交缺陷 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探索肠道微生物群通过肠-脑轴对神经系统的影响机制 | 野生型和CHD8单倍体不足突变小鼠的脑组织和肠道组织 | 单细胞转录组学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 野生型和突变型小鼠在三个发育阶段的脑和肠道组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 384 | 2025-10-07 |
STMiner: Gene-centric spatial transcriptomics for deciphering tumor tissues
2025-Feb-12, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100771
PMID:39947134
|
研究论文 | 提出一种名为STMiner的空间转录组学分析方法，通过直接分析基因空间分布来解读肿瘤组织 | 利用2D高斯混合模型和最优传输理论直接表征基因的空间分布，而非基于细胞捕获位点的分析方法 | 未在摘要中明确说明研究局限性 | 解决肿瘤组织空间转录组数据分析中的挑战，包括区域边界不清、细胞密度不均和细胞异质性高等问题 | 肿瘤组织的空间转录组数据 | 空间转录组学 | 肿瘤 | 空间转录组学 | 2D高斯混合模型, 最优传输理论 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 385 | 2025-10-07 |
Characterization of canine tumor-infiltrating leukocyte transcriptomic signatures reveals conserved expression patterns with human osteosarcoma
2025-Feb-11, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-03950-3
PMID:39932553
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析犬类骨肉瘤中肿瘤浸润免疫细胞的转录组特征，并与人类骨肉瘤进行比较研究 | 首次在犬类骨肉瘤模型中系统分析肿瘤浸润免疫细胞的转录组特征，并揭示与人类骨肉瘤的保守表达模式 | 使用公开可用的单细胞RNA测序数据，样本来源有限；存在物种特异性差异 | 研究骨肉瘤肿瘤微环境对免疫细胞转录组特征的影响，并进行跨物种比较 | 犬类骨肉瘤肿瘤浸润免疫细胞和循环白细胞 | 单细胞转录组学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 计算分析、差异表达分析 | 单细胞转录组数据 | 公开可用的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 386 | 2025-10-07 |
Neutrophil-induced pyroptosis promotes survival in patients with hepatoblastoma
2025-Feb-11, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03922-z
PMID:39932547
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研究论文 | 本研究通过构建中性粒细胞诱导焦亡评分系统，揭示了其在肝母细胞瘤预后预测中的价值 | 首次构建基于ELANE、CASP1和NOD2基因的中性粒细胞诱导焦亡评分系统，并发现其与肝母细胞瘤良好预后正相关 | 样本量较小（仅38例患者），需要更大规模研究验证 | 探索中性粒细胞诱导焦亡与肝母细胞瘤预后的关系 | 肝母细胞瘤患者肿瘤样本 | 生物信息学 | 肝母细胞瘤 | RNA测序，单细胞RNA测序，免疫组化 | LASSO回归 | 基因表达数据，单细胞数据 | 38例肝母细胞瘤患者 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 387 | 2025-10-07 |
Identification of Wnt-5a Receptors Important in Diabetic and Non-Diabetic Corneal Epithelial Wound Healing
2025-Feb-03, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.2.64
PMID:39998459
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和DNA甲基化分析鉴定Wnt-5a在糖尿病和非糖尿病角膜上皮伤口愈合中的关键受体 | 首次在糖尿病角膜中通过单细胞RNA测序发现ROR2启动子低甲基化导致其蛋白表达增加，并证实ROR2是Wnt-5a介导伤口愈合的主要受体 | 研究样本来源于死后供体眼睛，可能无法完全反映活体情况；仅使用体外细胞模型验证功能 | 确定介导Wnt-5a刺激糖尿病角膜上皮伤口愈合的Wnt受体 | 人角膜缘上皮细胞（来自糖尿病和非糖尿病供体） | 生物医学研究 | 糖尿病角膜病变 | 单细胞RNA测序, DNA甲基化分析, qRT-PCR, western blot, 免疫染色, siRNA转染 | 体外细胞伤口愈合模型 | 基因表达数据, 甲基化数据, 蛋白质表达数据 | 来自糖尿病和非糖尿病供体的人角膜缘上皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 388 | 2025-10-07 |
ANKRD22 participates in the proinflammatory activities of macrophages in the colon cancer tumor microenvironment
2025-Feb-01, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03930-z
PMID:39891675
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研究论文 | 本研究探讨ANKRD22在结肠癌肿瘤微环境中巨噬细胞促炎活性中的作用 | 首次揭示ANKRD22在M1型肿瘤相关巨噬细胞中的表达特征及其对巨噬细胞亚型分布的调控作用 | ANKRD22在结肠TAMs中的具体作用机制仍需进一步阐明 | 阐明ANKRD22在结肠癌肿瘤微环境中巨噬细胞功能调控中的作用 | 结肠癌肿瘤微环境中的肿瘤相关巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,皮下异种移植实验 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据 | 结肠癌患者组织样本及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 389 | 2025-10-07 |
Elevated SAMD3 expression in T cells predicts improved survival in pancreatic ductal adenocarcinoma patients
2025-Feb-01, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-03948-x
PMID:39891760
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现T细胞中SAMD3高表达与胰腺导管腺癌患者生存改善相关 | 首次发现SAMD3在细胞毒性CD8+ T细胞中的表达特征及其与T细胞功能和患者预后的关联 | 研究样本量有限，需要在更大队列中验证SAMD3的预后价值 | 探究SAMD3在PDAC肿瘤微环境中T细胞的功能作用及临床意义 | 胰腺导管腺癌患者样本和肿瘤特异性OT-I/卵清蛋白小鼠模型 | 单细胞转录组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 小鼠模型 | NA | 单细胞转录组数据, 免疫组织化学图像 | 人类PDAC样本和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 390 | 2025-10-07 |
Pre-immunotherapy alters stereotactic ablative radiotherapy-induced systemic T cell responses in early-stage NSCLC
2025-Feb-01, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03935-8
PMID:39891774
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了立体定向消融放疗（SABR）联合免疫治疗对早期非小细胞肺癌患者系统性T细胞反应的影响 | 首次在单细胞分辨率下比较了单纯SABR与联合免疫治疗对系统性T细胞反应的差异，发现两者诱导相反的T细胞反应模式 | 样本量较小（仅7例患者），需要更大规模研究验证 | 探究SABR联合免疫治疗对早期非小细胞肺癌患者系统性T细胞反应的影响机制 | 早期非小细胞肺癌患者的外周血T细胞 | 单细胞组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序, 流式细胞术, 批量RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据, 流式细胞数据 | 7例早期非小细胞肺癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, T细胞受体测序 | NA | NA |
| 391 | 2025-10-07 |
Cell autonomous TLR4 signaling modulates TGF-β induced activation of human cardiac fibroblasts
2025-Feb-28, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2025.e42452
PMID:40028530
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序发现TLR4是心脏成纤维细胞中主要表达的免疫传感器，并证明抑制TLR4信号可减轻TGF-β诱导的纤维化变化 | 首次揭示心脏成纤维细胞中自主性TLR4信号通路在调节TGF-β诱导纤维化过程中的关键作用 | 研究仅在体外实验条件下进行，缺乏体内验证 | 探究细胞自主性免疫信号在成人心脏成纤维细胞纤维化调节中的作用机制 | 小鼠和人类心力衰竭患者的心脏成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | FACS, 单细胞测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 来自Collagen1-α1GFP小鼠和人类心力衰竭患者的心脏成纤维细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 392 | 2025-10-07 |
Phylogeny and species delimitation of ciliates in the genus Spirostomum (class Heterotrichea) using single-cell transcriptomes
2025-Feb-27, BMC ecology and evolution
IF:2.3Q3
DOI:10.1186/s12862-025-02353-3
PMID:40011795
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组数据对旋口虫属纤毛虫进行系统发育分析和物种界定 | 首次在旋口虫属中应用单细胞转录组数据，结合多物种溯祖模型进行物种界定，并开发了从转录组数据重建核糖体RNA基因序列的工作流程 | 样本主要来自韩国和美国，地理覆盖范围有限，可能无法完全代表该属的全球多样性 | 阐明旋口虫属纤毛虫的系统发育关系和物种边界 | 旋口虫属纤毛虫（代表6个形态种） | 系统发育基因组学 | NA | 单细胞RNA测序，系统发育分析，物种界定分析 | 多物种溯祖模型，邻接网络分析 | 转录组数据，蛋白质编码基因序列 | 37个旋口虫标本（25个新生成转录组+12个来自GenBank） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 393 | 2025-10-07 |
Global landscape of hepatic organoid research: A bibliometric and visual study
2025-Feb-27, World journal of hepatology
IF:2.5Q2
DOI:10.4254/wjh.v17.i2.95624
PMID:40027550
|
文献计量分析 | 通过文献计量学方法分析全球肝类器官研究的发展格局和趋势 | 首次对肝类器官研究领域进行全面的文献计量学分析，识别关键研究趋势和学术合作机会 | 仅基于Web of Science数据库，可能未涵盖所有相关文献 | 分析肝类器官研究的全球科研产出并评估当前成就与未来趋势 | 肝类器官研究相关的科学文献 | 生物医学研究 | 肝病 | 文献计量分析，单细胞RNA测序 | NA | 文献数据 | 991篇文献（2010-2024年） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 394 | 2025-10-07 |
Uncovering immune cell heterogeneity in hepatocellular carcinoma by combining single-cell RNA sequencing with T-cell receptor sequencing
2025-Feb-27, World journal of hepatology
IF:2.5Q2
DOI:10.4254/wjh.v17.i2.99046
PMID:40027555
|
研究论文 | 通过结合单细胞RNA测序和T细胞受体测序技术，揭示肝细胞癌中免疫细胞的异质性 | 首次在肝细胞癌中结合单细胞RNA测序和T细胞受体测序分析免疫细胞异质性，发现两个新的T细胞亚群 | 样本量有限，研究结果需要在更大队列中验证 | 研究肝细胞癌发展过程中的关键生物标志物基因和免疫细胞亚群反应 | 肝细胞癌患者肿瘤组织和癌旁正常组织中的免疫细胞 | 单细胞组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序 | 生物信息学分析 | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据 | 肝细胞癌患者的肿瘤和癌旁组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 | NA | NA |
| 395 | 2025-10-07 |
IL-1β and associated molecules as prognostic biomarkers linked with immune cell infiltration in colorectal cancer: an integrated statistical and machine learning approach
2025-Feb-28, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01989-3
PMID:40019680
|
研究论文 | 本研究通过整合生物信息学和机器学习方法，识别结直肠癌中与免疫细胞浸润相关的预后生物标志物 | 开发了结合统计分析和机器学习的综合流程，首次系统鉴定IL-1β等关键基因作为结直肠癌诊断和预后的生物标志物 | 基于公开数据集的分析，需要实验验证；样本来源和数量未明确说明 | 开发结直肠癌诊断和预后生物标志物识别方法 | 结直肠癌患者基因表达数据和临床数据 | 机器学习 | 结直肠癌 | scRNA-seq, 启动子甲基化分析, 基因表达分析 | KNN, ANN, 随机森林 | 基因表达数据, 甲基化数据, 临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 396 | 2025-10-07 |
Molecularly-guided spatial proteomics captures single-cell identity and heterogeneity of the nervous system
2025-Feb-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.10.637505
PMID:39990460
|
研究论文 | 本研究利用空间单细胞蛋白质组学技术探索神经系统细胞身份和异质性 | 首次将免疫染色引导的激光捕获显微切割与LC-MS结合，应用于异质性中枢神经系统的空间单细胞蛋白质组学研究 | 研究主要聚焦于特定脑区域和损伤模型，尚未扩展到更广泛的神经系统疾病 | 开发和应用空间单细胞蛋白质组学方法以理解神经系统生物学和神经疾病分子机制 | 大脑皮层和黑质神经元群体、刺伤损伤相关的神经免疫变化、肠肌层神经节细胞与神经束 | 空间蛋白质组学 | 神经系统疾病 | 免疫染色引导激光捕获显微切割、液相色谱-质谱联用 | NA | 蛋白质组数据 | 多个脑区域和神经组织样本 | NA | 空间单细胞蛋白质组学、激光捕获显微切割 | LCM、LC-MS | 免疫染色引导激光捕获显微切割与液相色谱-质谱联用技术 |
| 397 | 2025-10-07 |
A Benchmarking Study of Random Projections and Principal Components for Dimensionality Reduction Strategies in Single Cell Analysis
2025-Feb-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.04.636499
PMID:39974925
|
研究论文 | 系统评估主成分分析和随机投影在单细胞RNA测序数据降维中的性能比较 | 首次对PCA和RP方法在单细胞分析中进行全面基准测试，包括计算效率和下游分析效果的多维度评估 | 仅评估了线性降维方法，未包含非线性降维技术的比较 | 比较不同降维策略在单细胞数据分析中的性能 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | PCA, SVD, 随机SVD, 稀疏随机投影, 高斯随机投影 | 基因表达数据 | 多个公开可用的标记和未标记单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 398 | 2025-10-07 |
Seq-Scope-eXpanded: Spatial Omics Beyond Optical Resolution
2025-Feb-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.04.636355
PMID:39975076
|
研究论文 | 提出Seq-Scope-X技术，通过组织膨胀实现亚微米级空间转录组和蛋白质组分析 | 结合组织膨胀技术与Seq-Scope方法，突破光学分辨率限制，实现亚微米级空间多组学分析 | NA | 开发超高分辨率空间多组学分析技术 | 肝脏组织、脑组织、结肠组织、小鼠脾脏、人类扁桃体 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学、空间蛋白质组学、组织膨胀技术 | NA | 空间转录组数据、空间蛋白质组数据 | NA | NA | 空间转录组学、空间蛋白质组学 | Seq-Scope-X | 结合组织膨胀的Seq-Scope改进技术，支持亚微米级分辨率的转录组和蛋白质组分析 |
| 399 | 2025-10-07 |
The profiles of immunosuppressive microenvironment in the Lauren intestinal-type gastric adenocarcinoma
2025-Feb-01, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03938-5
PMID:39891785
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术揭示了Lauren肠型胃腺癌免疫抑制微环境的细胞组成和相互作用机制 | 首次系统鉴定IGAC中HAVCR2+VCAM1+耗竭T细胞和LAYN+TNFRSF4+调节性T细胞等关键免疫抑制细胞亚群，并证实其与疾病进展的相关性 | 样本量相对有限（15例患者），且仅针对中国人群进行研究 | 探究Lauren肠型胃腺癌免疫抑制机制，为改善免疫治疗效果寻找潜在靶点 | 15例中国Lauren肠型胃腺癌患者的肿瘤组织和癌旁正常黏膜 | 数字病理 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫荧光, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据, 流式数据 | 15例IGAC患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 400 | 2025-10-07 |
Applications of Single-Cell Omics Technologies for Induced Pluripotent Stem Cell-Based Cardiovascular Research
2025-Feb-28, International journal of stem cells
IF:2.5Q3
DOI:10.15283/ijsc23183
PMID:39129179
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综述 | 探讨单细胞组学技术与诱导多能干细胞在心血管研究中的整合应用 | 整合单细胞组学与iPSC技术，探索空间组学等新兴范式在揭示心脏组织空间结构方面的潜力 | NA | 阐明心脏健康与疾病的分子复杂性，推动心血管研究发展 | 心脏细胞、诱导多能干细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间组学 | NA | 基因组, 转录组, 蛋白质组 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |