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当前共找到 644 篇文献，本页显示第 381 - 400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2025-10-07 |
A Nerve-Fibroblast Axis in Mammalian Lung Fibrosis
2025-Feb-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.09.611003
PMID:39314391
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研究论文 | 本研究揭示了哺乳动物肺纤维化中交感神经与表达α1-肾上腺素能受体的肌成纤维细胞之间形成的新型促纤维化轴 | 首次发现并表征了跨物种保守的神经-成纤维细胞轴，揭示了神经对组织重塑的关键贡献 | 纤维化机制尚未完全阐明，需要进一步研究验证 | 探究肺纤维化中肌成纤维细胞积累的机制 | 小鼠和人类纤维化肺组织、肺成纤维细胞、支气管肺泡灌洗液 | 病理生物学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序, 光学透明化, 全肺成像, 基因删除, 共培养, 精准肺切片 | NA | 基因表达数据, 组织图像, 测序数据 | 多种肺纤维化患者的肺组织和成纤维细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 382 | 2025-10-07 |
Shiba: a versatile computational method for systematic identification of differential RNA splicing across platforms
2025-Feb-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf098
PMID:39997221
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研究论文 | 开发了Shiba计算方法用于系统识别不同平台间的差异RNA剪接 | 能够捕获注释和未注释的剪接事件，解决连接读段不平衡问题，统计框架对样本量不敏感，并扩展了单细胞RNA-seq分析功能 | NA | 开发一个跨平台的差异RNA剪接分析方法 | RNA剪接事件 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 统计框架 | RNA测序数据 | n=1 RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 383 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing defines distinct disease subtypes and reveals hypo-responsiveness to interferon in asymptomatic Waldenstrom's Macroglobulinemia
2025-Feb-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56323-w
PMID:39929803
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示无症状华氏巨球蛋白血症的疾病亚型和干扰素低反应性特征 | 首次在单细胞水平定义了华氏巨球蛋白血症的分子亚型，并发现干扰素低反应性这一治疗脆弱点 | 样本量相对有限（79例患者），需要进一步验证研究 | 解析华氏巨球蛋白血症进展的肿瘤内在和免疫机制 | 华氏巨球蛋白血症患者、冒烟型骨髓瘤患者和健康捐赠者的骨髓肿瘤和免疫细胞 | 单细胞组学 | 华氏巨球蛋白血症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 294,206个骨髓细胞，来自30例AWM/WM患者、26例冒烟型骨髓瘤患者和23例健康捐赠者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 384 | 2025-10-07 |
Deep learning-based cell-specific gene regulatory networks inferred from single-cell multiome data
2025-Feb-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf138
PMID:40037709
|
研究论文 | 开发了一种基于深度学习的框架scMultiomeGRN，用于从单细胞多组学数据推断细胞特异性基因调控网络 | 通过构建模态特异性邻居聚合器和跨模态注意力模块，独特整合单细胞RNA测序和ATAC测序数据来学习转录因子的潜在表示 | 单细胞测序数据固有的高丢失率可能影响网络推断的准确性 | 从单细胞多组学数据推断细胞特异性基因调控网络 | 转录因子调控网络，特别是阿尔茨海默病相关的SPI1和RUNX1调控网络 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 深度学习框架 | 单细胞多组学数据 | 多个基准数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 385 | 2025-10-07 |
Pluripotency factor Tex10 finetunes Wnt signaling for spermatogenesis and primordial germ cell development
2025-Feb-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57165-2
PMID:39988597
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研究论文 | 本研究揭示了多能性因子Tex10通过调控Wnt信号通路在精子发生和原始生殖细胞发育中的关键作用 | 首次发现Tex10通过结合H3K4me3标记的Psmd3和Psmd7基因启动子激活其表达，从而抑制Wnt信号通路 | 研究主要基于小鼠模型，在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究Tex10在精子发生和原始生殖细胞发育中的分子机制 | 小鼠睾丸组织、胚胎干细胞和原始生殖细胞 | 发育生物学 | 男性不育症 | 条件性基因敲除、dTAG-degron系统、bulk RNA测序、单细胞RNA测序、染色质占据研究 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、染色质结合数据 | Tex10敲除小鼠和野生型对照小鼠 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 386 | 2025-10-07 |
ELLIPSIS: robust quantification of splicing in scRNA-seq
2025-Feb-04, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf028
PMID:39936571
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研究论文 | 开发了一种名为ELLIPSIS的工具，用于在单细胞RNA测序中稳健地量化剪接事件 | 利用局部观察到的读取覆盖度、流动保守性和细胞类型内相似性特性，能够量化新型剪接事件 | NA | 开发在单细胞RNA测序中稳健量化剪接的工具 | 单细胞RNA测序数据中的剪接事件 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 387 | 2025-10-07 |
Jellyfish stings-induced cardiac failure was ameliorated through AAG-mediated glycogen-driven ATP production
2025-Feb, Exploration (Beijing, China)
DOI:10.1002/EXP.20230089
PMID:40040825
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研究论文 | 本研究揭示了水母蜇伤导致的心力衰竭通过AAG介导的糖原驱动ATP产生得到改善的机制 | 首次发现AAG通过促进糖原代谢和糖酵解/线粒体代谢转换来改善水母蜇伤引起的心力衰竭 | 具体分子机制仍需进一步阐明，临床转化潜力有待验证 | 探究AAG在改善水母蜇伤引起的心力衰竭中的作用机制 | 水母蜇伤引起的心力衰竭患者和相关的分子通路 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,空间转录组技术 | 基因敲除模型 | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 388 | 2025-10-07 |
Overexpression of ornithine decarboxylase 1 mediates the immune-deserted microenvironment and poor prognosis in diffuse large B-cell lymphoma
2025-Feb, Journal of the National Cancer Center
IF:7.6Q1
DOI:10.1016/j.jncc.2024.10.001
PMID:40040873
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研究论文 | 本研究通过机器学习识别弥漫性大B细胞淋巴瘤中具有干细胞特征的高风险亚群，并揭示ODC1过表达与免疫荒漠微环境共同导致不良预后的机制 | 首次将ODC1过表达与DLBCL免疫荒漠微环境联系起来，建立了精准风险分层模型，并证明靶向ODC1可调节免疫治疗反应 | 研究基于回顾性数据，需要前瞻性临床试验验证治疗策略 | 改善弥漫性大B细胞淋巴瘤的风险分层和治疗策略 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤患者和细胞系 | 机器学习 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 基因组分析, 体外实验 | 机器学习算法 | 转录组数据, 基因组数据, 单细胞RNA测序数据 | 2133例DLBCL样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 389 | 2025-10-07 |
ETVs dictate hPSC differentiation by tuning biophysical properties
2025-Feb-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56591-6
PMID:40011454
|
研究论文 | 本研究揭示了ETV转录因子通过调控细胞生物物理特性决定人类多能干细胞分化的机制 | 首次确立ETV转录因子作为细胞生物物理特性和谱系分化的关键调控因子 | 研究主要基于体外模型，体内验证尚需进一步研究 | 探索转录网络如何调控细胞生物物理特性及其在干细胞分化中的作用 | 人类多能干细胞(hPSCs)、类原肠胚和胰腺分化模型 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 390 | 2025-10-07 |
Single-cell delineation of the microbiota-gut-brain axis: Probiotic intervention in Chd8 haploinsufficient mice
2025-Feb-12, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100768
PMID:39914389
|
研究论文 | 本研究通过构建CHD8单倍体不足小鼠模型，利用单细胞转录组技术探索了肠道微生物群-肠-脑轴在自闭症谱系障碍中的作用机制 | 首次在单细胞分辨率下构建了ASD相关神经和肠道变化的转录组图谱，并发现乳酸杆菌干预可选择性挽救社交缺陷 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探索肠道微生物群通过肠-脑轴对神经系统的影响机制 | 野生型和CHD8单倍体不足突变小鼠的脑组织和肠道组织 | 单细胞转录组学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 野生型和突变型小鼠在三个发育阶段的脑和肠道组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 391 | 2025-10-07 |
STMiner: Gene-centric spatial transcriptomics for deciphering tumor tissues
2025-Feb-12, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100771
PMID:39947134
|
研究论文 | 提出一种名为STMiner的空间转录组学分析方法，通过直接分析基因空间分布来解读肿瘤组织 | 利用2D高斯混合模型和最优传输理论直接表征基因的空间分布，而非基于细胞捕获位点的分析方法 | 未在摘要中明确说明研究局限性 | 解决肿瘤组织空间转录组数据分析中的挑战，包括区域边界不清、细胞密度不均和细胞异质性高等问题 | 肿瘤组织的空间转录组数据 | 空间转录组学 | 肿瘤 | 空间转录组学 | 2D高斯混合模型, 最优传输理论 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 392 | 2025-10-07 |
Characterization of canine tumor-infiltrating leukocyte transcriptomic signatures reveals conserved expression patterns with human osteosarcoma
2025-Feb-11, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-03950-3
PMID:39932553
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析犬类骨肉瘤中肿瘤浸润免疫细胞的转录组特征，并与人类骨肉瘤进行比较研究 | 首次在犬类骨肉瘤模型中系统分析肿瘤浸润免疫细胞的转录组特征，并揭示与人类骨肉瘤的保守表达模式 | 使用公开可用的单细胞RNA测序数据，样本来源有限；存在物种特异性差异 | 研究骨肉瘤肿瘤微环境对免疫细胞转录组特征的影响，并进行跨物种比较 | 犬类骨肉瘤肿瘤浸润免疫细胞和循环白细胞 | 单细胞转录组学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 计算分析、差异表达分析 | 单细胞转录组数据 | 公开可用的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 393 | 2025-10-07 |
Neutrophil-induced pyroptosis promotes survival in patients with hepatoblastoma
2025-Feb-11, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03922-z
PMID:39932547
|
研究论文 | 本研究通过构建中性粒细胞诱导焦亡评分系统，揭示了其在肝母细胞瘤预后预测中的价值 | 首次构建基于ELANE、CASP1和NOD2基因的中性粒细胞诱导焦亡评分系统，并发现其与肝母细胞瘤良好预后正相关 | 样本量较小（仅38例患者），需要更大规模研究验证 | 探索中性粒细胞诱导焦亡与肝母细胞瘤预后的关系 | 肝母细胞瘤患者肿瘤样本 | 生物信息学 | 肝母细胞瘤 | RNA测序，单细胞RNA测序，免疫组化 | LASSO回归 | 基因表达数据，单细胞数据 | 38例肝母细胞瘤患者 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 394 | 2025-10-07 |
Identification of Wnt-5a Receptors Important in Diabetic and Non-Diabetic Corneal Epithelial Wound Healing
2025-Feb-03, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.2.64
PMID:39998459
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和DNA甲基化分析鉴定Wnt-5a在糖尿病和非糖尿病角膜上皮伤口愈合中的关键受体 | 首次在糖尿病角膜中通过单细胞RNA测序发现ROR2启动子低甲基化导致其蛋白表达增加，并证实ROR2是Wnt-5a介导伤口愈合的主要受体 | 研究样本来源于死后供体眼睛，可能无法完全反映活体情况；仅使用体外细胞模型验证功能 | 确定介导Wnt-5a刺激糖尿病角膜上皮伤口愈合的Wnt受体 | 人角膜缘上皮细胞（来自糖尿病和非糖尿病供体） | 生物医学研究 | 糖尿病角膜病变 | 单细胞RNA测序, DNA甲基化分析, qRT-PCR, western blot, 免疫染色, siRNA转染 | 体外细胞伤口愈合模型 | 基因表达数据, 甲基化数据, 蛋白质表达数据 | 来自糖尿病和非糖尿病供体的人角膜缘上皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 395 | 2025-10-07 |
ANKRD22 participates in the proinflammatory activities of macrophages in the colon cancer tumor microenvironment
2025-Feb-01, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03930-z
PMID:39891675
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研究论文 | 本研究探讨ANKRD22在结肠癌肿瘤微环境中巨噬细胞促炎活性中的作用 | 首次揭示ANKRD22在M1型肿瘤相关巨噬细胞中的表达特征及其对巨噬细胞亚型分布的调控作用 | ANKRD22在结肠TAMs中的具体作用机制仍需进一步阐明 | 阐明ANKRD22在结肠癌肿瘤微环境中巨噬细胞功能调控中的作用 | 结肠癌肿瘤微环境中的肿瘤相关巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,皮下异种移植实验 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据 | 结肠癌患者组织样本及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 396 | 2025-10-07 |
Elevated SAMD3 expression in T cells predicts improved survival in pancreatic ductal adenocarcinoma patients
2025-Feb-01, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-03948-x
PMID:39891760
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现T细胞中SAMD3高表达与胰腺导管腺癌患者生存改善相关 | 首次发现SAMD3在细胞毒性CD8+ T细胞中的表达特征及其与T细胞功能和患者预后的关联 | 研究样本量有限，需要在更大队列中验证SAMD3的预后价值 | 探究SAMD3在PDAC肿瘤微环境中T细胞的功能作用及临床意义 | 胰腺导管腺癌患者样本和肿瘤特异性OT-I/卵清蛋白小鼠模型 | 单细胞转录组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 小鼠模型 | NA | 单细胞转录组数据, 免疫组织化学图像 | 人类PDAC样本和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 397 | 2025-10-07 |
Pre-immunotherapy alters stereotactic ablative radiotherapy-induced systemic T cell responses in early-stage NSCLC
2025-Feb-01, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03935-8
PMID:39891774
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了立体定向消融放疗（SABR）联合免疫治疗对早期非小细胞肺癌患者系统性T细胞反应的影响 | 首次在单细胞分辨率下比较了单纯SABR与联合免疫治疗对系统性T细胞反应的差异，发现两者诱导相反的T细胞反应模式 | 样本量较小（仅7例患者），需要更大规模研究验证 | 探究SABR联合免疫治疗对早期非小细胞肺癌患者系统性T细胞反应的影响机制 | 早期非小细胞肺癌患者的外周血T细胞 | 单细胞组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序, 流式细胞术, 批量RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据, 流式细胞数据 | 7例早期非小细胞肺癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, T细胞受体测序 | NA | NA |
| 398 | 2025-10-07 |
Cell autonomous TLR4 signaling modulates TGF-β induced activation of human cardiac fibroblasts
2025-Feb-28, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2025.e42452
PMID:40028530
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序发现TLR4是心脏成纤维细胞中主要表达的免疫传感器，并证明抑制TLR4信号可减轻TGF-β诱导的纤维化变化 | 首次揭示心脏成纤维细胞中自主性TLR4信号通路在调节TGF-β诱导纤维化过程中的关键作用 | 研究仅在体外实验条件下进行，缺乏体内验证 | 探究细胞自主性免疫信号在成人心脏成纤维细胞纤维化调节中的作用机制 | 小鼠和人类心力衰竭患者的心脏成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | FACS, 单细胞测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 来自Collagen1-α1GFP小鼠和人类心力衰竭患者的心脏成纤维细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 399 | 2025-10-07 |
Phylogeny and species delimitation of ciliates in the genus Spirostomum (class Heterotrichea) using single-cell transcriptomes
2025-Feb-27, BMC ecology and evolution
IF:2.3Q3
DOI:10.1186/s12862-025-02353-3
PMID:40011795
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组数据对旋口虫属纤毛虫进行系统发育分析和物种界定 | 首次在旋口虫属中应用单细胞转录组数据，结合多物种溯祖模型进行物种界定，并开发了从转录组数据重建核糖体RNA基因序列的工作流程 | 样本主要来自韩国和美国，地理覆盖范围有限，可能无法完全代表该属的全球多样性 | 阐明旋口虫属纤毛虫的系统发育关系和物种边界 | 旋口虫属纤毛虫（代表6个形态种） | 系统发育基因组学 | NA | 单细胞RNA测序，系统发育分析，物种界定分析 | 多物种溯祖模型，邻接网络分析 | 转录组数据，蛋白质编码基因序列 | 37个旋口虫标本（25个新生成转录组+12个来自GenBank） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 400 | 2025-10-07 |
Global landscape of hepatic organoid research: A bibliometric and visual study
2025-Feb-27, World journal of hepatology
IF:2.5Q2
DOI:10.4254/wjh.v17.i2.95624
PMID:40027550
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文献计量分析 | 通过文献计量学方法分析全球肝类器官研究的发展格局和趋势 | 首次对肝类器官研究领域进行全面的文献计量学分析，识别关键研究趋势和学术合作机会 | 仅基于Web of Science数据库，可能未涵盖所有相关文献 | 分析肝类器官研究的全球科研产出并评估当前成就与未来趋势 | 肝类器官研究相关的科学文献 | 生物医学研究 | 肝病 | 文献计量分析，单细胞RNA测序 | NA | 文献数据 | 991篇文献（2010-2024年） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |