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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
21 2026-05-23
mTOR signaling regulates multiple metabolic pathways in human lung fibroblasts after TGF-β and in pulmonary fibrosis
2025-02-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
研究论文 该研究探讨了mTOR信号通路在TGF-β处理后的人肺成纤维细胞及肺纤维化中对多种代谢途径的调控作用 首次揭示了mTOR和ATF4在肺成纤维细胞中调控多种代谢途径,包括氨基酸稳态、糖酵解和三羧酸循环,并利用单细胞RNA测序数据验证了这些途径在IPF患者肺病理成纤维细胞中的上调 未明确提及实验样本量、平台具体配置及体外模型与体内临床应用的潜在差异 阐明mTOR及其下游效应因子ATF4在肺成纤维细胞代谢重编程中的调控机制,并识别可能用于抑制纤维化过程的新型代谢途径 人肺成纤维细胞(经TGF-β处理)及IPF患者肺组织 数字病理 肺纤维化 RNA测序, 代谢组学, 单细胞RNA测序 NA 转录组数据, 代谢组数据, 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
22 2026-05-22
Disruption of GPSM1/CSF1 signaling reprograms tumor-associated macrophages to overcome anti-PD-1 resistance in colorectal cancer
2025-Feb-25, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究揭示了GPSM1/CSF1信号通路在结直肠癌中调控肿瘤相关巨噬细胞以克服抗PD-1耐药性的机制 首次阐明GPSM1通过去泛素化酶USP9X稳定化并激活MEIS3核转位,促进CSF1表达,驱动巨噬细胞向免疫抑制性M2表型极化,从而导致抗PD-1耐药的新机制 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床样本量有限,且未详细探讨其他潜在耐药机制 探究GPSM1在结直肠癌肿瘤微环境中对抗PD-1耐药性的调控作用及潜在治疗策略 抗PD-1耐药的结直肠癌患者肿瘤样本和C57BL/6小鼠原位结直肠癌异种移植模型 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光, 质谱流式细胞术, 流式细胞术, ChIP-PCR, 免疫共沉淀 NA 基因表达数据, 图像数据 抗PD-1耐药结直肠癌患者肿瘤样本及C57BL/6小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
23 2026-05-22
Association of 5α-reductase inhibitor prescription with immunotherapy efficacy in metastatic renal cell carcinoma: a multicenter retrospective analysis
2025-Feb-25, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 回顾性分析显示5α-还原酶抑制剂使用史与转移性肾细胞癌免疫治疗效果呈正相关 首次在临床队列中验证5α-还原酶抑制剂通过雄激素信号通路调控CD8+ T细胞功能,增强免疫检查点抑制剂在转移性肾细胞癌中的疗效,并利用单细胞RNA测序揭示其改善免疫微环境的机制 回顾性研究设计可能存在选择偏倚;样本量较小(185例);未纳入5-ARI使用时间不足12个月的患者;缺乏前瞻性验证 评估5α-还原酶抑制剂使用史对转移性肾细胞癌免疫检查点抑制剂疗效的影响 185例接受免疫检查点抑制剂的转移性肾细胞癌患者 数字病理学 肾细胞癌 单细胞RNA测序 Cox比例风险模型 临床数据和单细胞RNA测序数据 185例转移性肾细胞癌患者 10x Genomics 单细胞RNA测序 NA NA
24 2026-05-20
Cxcl9 modulates aging associated microvascular metabolic and angiogenic dysfunctions in subcutaneous adipose tissue
2025-02-11, Angiogenesis IF:9.2Q1
研究论文 本研究揭示了Cxcl9在皮下脂肪组织微血管衰老中调节代谢和血管生成功能的作用 首次发现Cxcl9与衰老内皮细胞氧化磷酸化损伤密切相关,并识别出Aplnr信号通路受抑制是导致能量代谢和血管生成障碍的关键机制,提出Cxcl9作为微血管衰老的生物标志物 具体机制需进一步验证,动物模型向人类转化的可靠性待评估 探究衰老对微血管网络各段内皮细胞的影响及其分子机制 老龄小鼠皮下脂肪组织中的微血管内皮细胞 计算机视觉 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 图像 老龄小鼠皮下脂肪组织样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3
25 2026-05-20
Sex-dependent molecular landscape of Alzheimer's disease revealed by large-scale single-cell transcriptomics
2025-02, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
research paper 通过大规模单细胞转录组学揭示阿尔茨海默病的性别依赖性分子特征 首次利用大规模单细胞转录组图谱系统揭示阿尔茨海默病中性别特异性基因表达模式、通路改变及细胞间通讯变化,并识别出男性星形胶质细胞中RPTOR关键调控因子及女性中Wnt信号与细胞周期调节差异 研究仅关注前额叶皮层区域,未覆盖其他脑区;基于转录组层面的分析可能未完全反映蛋白质功能或表观遗传修饰的影响 探究阿尔茨海默病中性别差异的分子机制,为性别特异性治疗策略提供依据 人类前额叶皮层单细胞转录组图谱中的细胞类型(包括星形胶质细胞、兴奋性神经元等) machine learning 阿尔茨海默病 单细胞转录组测序 NA 单细胞转录组数据 大规模人类前额叶皮层组织样本(具体数量未提供) NA 单细胞RNA-seq NA NA
26 2026-05-19
In silico integrative scRNA analysis of human colonic epithelium indicates four tuft cell subtypes
2025-02-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology
研究论文 通过整合分析人类结肠上皮的单细胞RNA测序数据,揭示了四种簇细胞亚型及其在健康和炎症性肠病中的差异 首次通过整合性单细胞RNA-seq分析鉴定出人类结肠中存在四种具有独特基因表达谱的簇细胞亚型,并发现其中两种亚型在健康和炎症性肠病组织中的频率和基因表达显著差异 该研究基于公开数据集进行计算机模拟分析,尚需后续生理学实验验证这些簇细胞亚型的确切功能 通过整合单细胞RNA测序数据,解析人类结肠簇细胞的异质性和潜在生物学功能 人类结肠上皮中的簇细胞亚型 数字病理学 炎症性肠病 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 四个公开数据集的人类结肠单细胞RNA-seq数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
27 2026-05-19
Spatial transcriptomic analysis reveals significant differences in tumor microenvironment in HPV-dependent and HPV-independent vulvar squamous cell carcinoma
2025-02, Gynecologic oncology IF:4.5Q1
研究论文 利用空间转录组学分析揭示HPV依赖性和非依赖性外阴鳞状细胞癌肿瘤微环境的显著差异 首次将空间转录组学技术应用于外阴鳞状细胞癌,揭示了HPV依赖性和非依赖性亚型之间免疫细胞浸润的显著差异,特别是发现HPV非依赖性肿瘤中CD45+免疫细胞显著增多 研究样本量较小(仅4例患者),可能影响结果的普适性 探索HPV依赖性和非依赖性外阴鳞状细胞癌的肿瘤微环境基因表达差异 HPV依赖性和非依赖性外阴鳞状细胞癌组织(包括SCC区域、炎症区域、苔藓硬化区域和高级别鳞状上皮内病变区域) 空间转录组学 外阴鳞状细胞癌 空间转录组学 CIBERSORTx 基因表达数据 4例早期外阴鳞状细胞癌患者(2例HPV独立性,2例HPV依赖性) 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组平台
28 2026-05-18
Single-cell analysis of human peripheral blood reveals high immune response activity in successful ageing individuals
2025-02, Mechanisms of ageing and development IF:5.3Q1
研究论文 通过对百岁老人和超级百岁老人外周血单核细胞的单细胞RNA测序分析,揭示了成功老龄化个体中免疫系统的高度应答活性 首次在单细胞水平上系统解析了超级百岁老人和百岁老人的免疫重塑特征,发现CD8效应记忆T细胞和终末分化B细胞在长寿组中富集,并揭示了CD14单核细胞的高抗原呈递能力可能协助T和B细胞活性 未提及具体局限性 研究衰老过程中免疫系统的动态调控及其分子机制,寻找健康衰老的生物标志物 7名超级百岁老人、3名百岁老人和4名老年对照的外周血单核细胞 机器学习 老年疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 87,215个外周血单核细胞,来自14名个体(7名超级百岁老人、3名百岁老人、4名老年对照) Illumina 单细胞RNA-seq Illumina NovaSeq NA
29 2026-05-15
Transcriptional regulatory network analysis identifies GRN as a key regulator bridging chemotherapy and immunotherapy response in small cell lung cancer
2025-02-05, Journal of hematology & oncology IF:29.5Q1
研究论文 通过构建转录调控网络,确定GRN为连接小细胞肺癌化疗和免疫治疗反应的关键调节因子 首次揭示GRN作为小细胞肺癌化疗和免疫治疗反应之间的桥梁调控因子,并提出基于GRN表达水平的患者分层策略 未明确提及局限性,但缺乏对GRN调控机制的深入验证,且样本量信息未在摘要中提供 探究小细胞肺癌对EP化疗和免疫治疗产生耐药的分子机制,并识别潜在的生物标志物 小细胞肺癌细胞系和肿瘤相关巨噬细胞 机器学习 肺癌 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
30 2026-05-15
Single-cell landscape of dynamic changes in CD8+ T cells, CD4+ T cells and exhausted T cells in hepatocellular carcinoma
2025-02-03, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 利用单细胞测序数据研究肝细胞癌中CD8+ T细胞、CD4+ T细胞和耗竭T细胞的动态变化景观及T细胞相关基因的预后价值 通过hdWGCNA算法识别与CD4 T细胞、CD8 T细胞和耗竭T细胞相关的基因模块,并利用AUCell算法揭示耗竭T细胞中信号通路活性的变化,构建基于七基因的预后模型 未提及具体的局限性,但样本量仅为12例肝细胞癌单细胞测序病例 探究T细胞相关基因在肝细胞癌预后中的价值 肝细胞癌患者的CD8+ T细胞、CD4+ T细胞和耗竭T细胞 机器学习 肝细胞癌 单细胞测序、hdWGCNA、AUCell、免疫组化、实时PCR NA 单细胞转录组数据 12例肝细胞癌单细胞测序样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
31 2026-05-15
Exploring biomarkers and molecular mechanisms of Type 2 diabetes mellitus promotes colorectal cancer progression based on transcriptomics
2025-02-03, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 基于转录组学探索2型糖尿病促进结直肠癌进展的生物标志物和分子机制 首次通过转录组学分析揭示O-连接糖基化在T2DM促进CRC进展中的关键作用,并构建了T2DM-CRC共病的诊断模型,鉴定COX11为潜在的免疫相关分子标志物 NA 探索2型糖尿病促进结直肠癌进展的潜在生物标志物和分子机制 结直肠癌患者肿瘤组织,伴或不伴2型糖尿病 NA 2型糖尿病,结直肠癌 转录组学,单细胞转录组分析,分子对接 逻辑回归,Lasso正则化 基因表达数据,单细胞转录组数据 NA NA 转录组测序,单细胞RNA测序 NA NA
32 2026-05-12
Cotton2035: From genomics research to optimized breeding
2025-02-03, Molecular plant IF:17.1Q1
综述 本文回顾了棉花基因组研究在过去十年中的进展,提出通过基因组到育种策略优化棉花育种,并倡议启动棉花ENCODE项目以系统解码基因组功能元件和调控网络 提出棉花ENCODE项目以系统解码功能元件和调控网络,强调单细胞测序和高分辨率时空组学技术结合多组学数据、基因编辑及人工智能推动基因组驱动育种 未具体讨论现有技术整合的挑战或潜在应用障碍 通过从基因组研究到育种的转变,优化棉花关键农艺性状的遗传改良 棉花(包括野生和栽培棉属物种) 基因组学 NA 单细胞测序, 高分辨率时空组学, 基因组编辑, 人工智能 NA 基因组序列, 多组学数据 NA NA 单细胞测序 NA NA
33 2026-05-10
B-cell interleukin 1 receptor 1 modulates the female adipose tissue immune microenvironment during aging
2025-Feb-13, Journal of leukocyte biology IF:3.6Q2
研究论文 该论文研究了B细胞白细胞介素1受体1(Il1r1)在衰老过程中调节雌性脂肪组织免疫微环境的作用 首次通过B细胞特异性敲除Il1r1小鼠模型,揭示了IL-1β-B细胞信号在衰老脂肪组织炎症反应中的性别特异性作用 研究仅关注了小鼠模型,未在人类样本中验证;且主要分析了雌性脂肪组织,对雄性机制探讨不足 探究IL-1β信号如何通过B细胞影响衰老相关脂肪组织炎症和代谢功能 小鼠内脏白色脂肪组织(vWAT)中的免疫细胞 免疫学 衰老相关代谢疾病 单细胞RNA测序 条件性基因敲除小鼠模型 基因表达数据 B细胞特异性Ilr1敲除小鼠(BKO)及对照小鼠的脂肪组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
34 2026-05-08
Diffusion-based generation of gene regulatory networks from scRNA-seq data with DigNet
2025-02-14, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 提出一种名为DigNet的离散扩散生成模型,用于从单细胞RNA测序数据中生成基因调控网络 利用多步马尔可夫扩散过程重建细胞特异性基因调控网络,结合iMetacell整合和非欧几里得离散空间建模,对数据噪声和网络稀疏性具有鲁棒性 未明确提及局限性,但可能受限于scRNA-seq数据的稀疏性和基因调控网络的复杂性 开发一种从scRNA-seq数据生成细胞特异性基因调控网络的有效方法 来自scRNA-seq数据的基因调控网络,以及乳腺癌免疫反应中的T细胞差异基因调控 机器学习 乳腺癌 单细胞RNA测序 离散扩散生成模型 基因表达数据 未明确提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
35 2026-05-08
Kernel-bounded clustering for spatial transcriptomics enables scalable discovery of complex spatial domains
2025-02-14, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 提出一种名为核边界聚类(KBC)的新算法,用于空间转录组数据中复杂空间区域的可扩展发现 首次在聚类算法中采用分布核来招募聚类成员,能够发现不同密度、大小和形状的聚类,并且是线性时间复杂度算法 当前结果仅基于Weisfeiler-Lehman方案,可能在其他数据变换下的表现未验证 开发一种高效且适应性强的聚类算法,解决空间转录组数据中复杂空间区域的识别问题 空间转录组数据中的组织基因表达和空间信息 数字病理学 NA 空间转录组学 核边界聚类(KBC) 基因表达数据、空间坐标 NA NA 空间转录组学 NA NA
36 2026-05-04
Loss of mucin 2 and MHC II molecules causes rare resistance to murine RV infection
2025-02-25, Journal of virology IF:4.0Q2
研究论文 该研究通过条件性敲除小鼠的分泌细胞(潘氏细胞、杯状细胞和肠内分泌细胞),发现黏蛋白2(MUC2)和MHC II分子的缺失导致小鼠对轮状病毒感染产生罕见的抵抗力 首次揭示杯状细胞产物MUC2与MHC II分子在轮状病毒易感性中的未知关联,并发现分泌细胞缺失可赋予小鼠罕见的抗感染能力 研究主要基于小鼠模型,可能不完全代表人类轮状病毒感染的机制;未明确MUC2和MHC II在抗病毒中的协同作用细节 探究肠道分泌细胞(尤其是杯状细胞)在轮状病毒感染发病机制中的作用 Atoh1条件性敲除小鼠(缺乏潘氏细胞、杯状细胞和肠内分泌细胞)及MUC2或MHC II缺陷小鼠 分子生物学 轮状病毒感染 单细胞RNA测序、条件性基因敲除 Atoh1条件性敲除小鼠模型、MUC2敲除小鼠模型、MHC II敲除小鼠模型 单细胞转录组数据 多种基因修饰小鼠品系,具体样本数量未在摘要中说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
37 2026-05-03
Molecular heterogeneity and development of the ventral tegmental area
2025-Feb, Current opinion in behavioral sciences IF:4.9Q1
研究论文 使用单细胞测序技术研究腹侧被盖区的分子异质性和发育过程 通过单细胞测序技术揭示多巴胺能神经元在发育过程中的高异质性和分子复杂性 NA 研究多巴胺能中脑(包括腹侧被盖区和黑质)在胚胎发育和成年期的转录特征 多巴胺能神经元 数字病理学 神经系统疾病 单细胞测序 NA 转录组数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
38 2026-05-02
scBSP: A fast and accurate tool for identifying spatially variable features from high-resolution spatial omics data
2025-Feb-07, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 scBSP是一个快速准确的开源工具,用于从高分辨率空间组学数据中识别空间可变特征 利用稀疏矩阵运算显著提升计算效率和内存使用,能在桌面电脑上10秒内处理超过18万个点的高清空间转录组数据,是当前处理此类数据最快的工具 未在文中明确说明局限性 开发一种高效计算工具,用于识别高分辨率空间组学数据中的空间可变生物学特征 空间组学数据中的空间可变基因和空间可变峰 机器学习 肾脏疾病 空间转录组学,10x Xenium NA 空间组学数据(二维和三维) 高分辨率空间转录组数据包含19950个基因和181367个点 10x Genomics 空间转录组学 10x Xenium 10x Xenium空间原位分析平台
39 2026-05-01
Inorganic pyrophosphatase 1: a key player in immune and metabolic reprogramming in ankylosing spondylitis
2025-02, Genes and immunity IF:5.0Q2
研究论文 通过孟德尔随机化和单细胞测序分析,发现无机焦磷酸酶1在强直性脊柱炎的免疫和代谢重编程中起关键作用 首次结合孟德尔随机化、表达量性状位点分析和单细胞代谢分析,鉴定出PPA1作为强直性脊柱炎中CD8+记忆T细胞代谢和免疫应答的关键基因 样本量较小(仅3例患者),且未涉及功能验证实验 探究免疫细胞和代谢物在强直性脊柱炎中的作用机制 强直性脊柱炎患者与非患者的椎骨骨髓血样本中的免疫细胞和代谢物 自然语言处理, 机器学习 强直性脊柱炎 单细胞测序, 孟德尔随机化, 表达量性状位点分析 NA 基因表达数据, 代谢数据 3例强直性脊柱炎患者和3例非患者的椎骨骨髓血样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10×单细胞测序
40 2026-04-29
Resident synovial macrophages in synovial fluid: Implications for immunoregulation
2025-Feb, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
研究论文 研究滑液中常驻滑膜巨噬细胞在免疫调节中的作用及其与滑膜屏障完整性的关系 首次在人类滑液中发现常驻滑膜巨噬细胞,并建立新的外植体模型,揭示其在炎性关节炎中上调促纤维化和促破骨信号通路 未提及具体局限性 探究滑液中常驻滑膜巨噬细胞与滑膜屏障完整性的关联及其在关节炎免疫病理中的作用 人类滑液中的常驻滑膜巨噬细胞 数字病理学 关节炎 scRNA-seq NA 基因表达数据 未明确提及样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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