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当前共找到 646 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2025-10-07 |
RNase L represses hair follicle regeneration through altered innate immune signaling
2025-Feb-04, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI172595
PMID:39903537
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研究论文 | 本研究揭示RNase L通过改变先天免疫信号通路抑制毛囊再生的机制 | 首次发现RNase L作为再生抑制基因，通过负反馈调节机制限制dsRNA-TLR3信号级联 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证尚不充分 | 探索哺乳动物再生能力的分子调控机制 | 人类参与者和小鼠模型（Rnasel-/-小鼠） | 分子生物学 | 组织再生障碍 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 基因敲除小鼠模型 | 转录组数据, 空间转录组数据 | 人类激光嫩肤治疗参与者和WIHN小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 362 | 2025-10-07 |
Recurrent ERBB2 alterations are associated with esophageal adenocarcinoma brain metastases
2025-Feb-26, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.02.19.25322558
PMID:40061311
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研究论文 | 通过多组学分析揭示食管腺癌脑转移中ERBB2基因的复发性改变及其临床意义 | 首次在食管腺癌脑转移中发现ERBB2基因的复发性扩增，并证明其与单克隆播散相关 | 样本量较小（10例），需要更大规模研究验证 | 探究食管腺癌脑转移的分子特征和临床治疗策略 | 食管腺癌脑转移患者及其匹配的原发肿瘤 | 数字病理学 | 食管癌 | 全基因组测序, 单细胞空间转录组学 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 10例食管腺癌脑转移患者 | NA | 全基因组测序, 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 363 | 2025-10-07 |
MolGene-E: Inverse Molecular Design to Modulate Single Cell Transcriptomics
2025-Feb-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.19.638723
PMID:40060426
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研究论文 | 开发了一种名为MolGene-E的深度生成框架，用于基于单细胞转录组数据设计新药物分子 | 首个能够利用单细胞组学数据设计新药物分子的机器学习方法，结合了跨模态数据协调和对比学习生成模型 | 单细胞组学数据存在噪声、异质性、稀缺性和高维度等挑战 | 开发能够调节单细胞转录组学的逆向分子设计方法 | 疾病细胞与健康细胞的转录组状态 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学 | 深度生成框架,跨模态模型,对比学习生成模型 | 单细胞转录组数据,化学扰动的大量转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 364 | 2025-10-07 |
Single cell analysis identifies distinct CD4 + T cells associated with the pathobiology of pediatric obesity related asthma
2025-Feb-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-88423-4
PMID:40000680
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学识别与儿童肥胖相关哮喘病理生物学相关的不同CD4+T细胞亚型 | 首次在儿童肥胖相关哮喘中鉴定出具有CDC42上调的特定CD4+T细胞亚群，并揭示其与糖皮质激素抵抗的关联机制 | 研究样本量有限，未涉及其他免疫细胞类型的分析 | 探究儿童肥胖相关哮喘中CD4+T细胞亚型的特征及其在疾病发生中的作用 | 儿童肥胖相关哮喘患者的CD4+T细胞 | 单细胞生物学 | 哮喘 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 涉及肥胖哮喘、单纯肥胖和健康体重对照组的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 365 | 2025-10-07 |
Cancer-Associated Fibroblasts Genes and Transforming Growth Factor Beta Pathway in Gastric Cancer for Novel Therapeutic Strategy
2025-Feb-26, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17050795
PMID:40075643
|
综述 | 本文综述了胃癌中癌症相关成纤维细胞基因及其与TGF-β通路的相互作用，为开发新治疗策略提供见解 | 整合单细胞RNA测序数据揭示CAFGs在广义CAFs（包括周细胞）中的表达模式，并系统评估其预后价值 | 与结直肠癌相比，胃癌中CAFGs功能机制研究不足，且缺乏足够的显微切割数据验证表达模式 | 总结CAFGs在胃癌中的分子特征、预后意义和功能机制，探索其治疗潜力 | 癌症相关成纤维细胞基因(CAFGs)和TGF-β信号通路 | 肿瘤微环境研究 | 胃癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 临床病理学研究 | NA | 基因表达数据, 临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 366 | 2025-10-07 |
Deciphering the generation of heterogeneity in esophageal squamous cell carcinoma metastasis via single-cell multiomics analysis
2025-Feb-04, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06154-6
PMID:39905485
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研究论文 | 通过单细胞多组学分析揭示食管鳞状细胞癌转移过程中异质性的产生机制 | 首次在单细胞水平整合scATAC-seq、scRNA-seq、ChIP-seq/CUT&Tag、Hi-C和bulk测序数据，系统解析ESCC转移中的染色质可及性调控网络 | 样本量较小（仅4例患者），且患者病理分期不同可能影响结果一致性 | 探究染色质可及性在食管鳞状细胞癌转移和异质性形成中的作用机制 | 食管鳞状细胞癌患者的癌组织和癌旁组织 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | scATAC-seq, scRNA-seq, ChIP-seq, CUT&Tag, Hi-C, bulk RNA-seq, bulk ATAC-seq | 多组学整合分析 | 单细胞测序数据、表观基因组数据、转录组数据 | 4例ESCC患者（T1a、T2b、T3b、T4a分期）的癌和癌旁组织 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量ATAC-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 367 | 2025-10-07 |
Differences in immune cells and gene expression in human milk by parity on integrated scRNA sequencing
2025-Feb, Clinical and experimental pediatrics
IF:3.2Q1
DOI:10.3345/cep.2024.01585
PMID:39810510
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研究论文 | 通过整合分析单细胞RNA测序数据，研究胎次对人类母乳中免疫细胞组成和基因表达的影响 | 首次利用公开scRNA-seq数据集系统分析胎次对人类母乳免疫细胞异质性的影响 | 使用公开数据集，样本量有限，需要进一步实验验证 | 阐明胎次对人类母乳免疫细胞异质性和基因表达的影响 | 人类母乳样本 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 公开数据集中的母乳样本（初产妇vs经产妇） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 368 | 2025-10-07 |
Mitochondrial Regulator CRIF1 Plays a Critical Role in the Development and Homeostasis of Alveolar Macrophages via Maintaining Metabolic Fitness
2025-Feb, Immune network
IF:4.3Q2
DOI:10.4110/in.2025.25.e9
PMID:40078782
|
研究论文 | 本研究揭示线粒体调节因子CRIF1通过维持代谢适应性在肺泡巨噬细胞发育和稳态中的关键作用 | 首次发现CRIF1作为特异性调节肺泡巨噬细胞代谢适应性的关键因子，区别于其他广泛作用的线粒体调节因子 | 研究主要关注CRIF1在肺泡巨噬细胞中的作用，对其他组织驻留巨噬细胞的影响尚未深入探讨 | 探究CRIF1在肺泡巨噬细胞代谢调节和稳态维持中的具体作用机制 | 肺泡巨噬细胞和小鼠模型 | 细胞生物学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序,转录组分析 | 基因敲除模型 | 基因表达数据,代谢数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 369 | 2025-10-07 |
The forkhead transcription factor FKH-7/FOXP acts in chemosensory neurons to regulate developmental decision-making
2025-Feb-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.17.638733
PMID:40027766
|
研究论文 | 研究发现FKH-7/FOXP转录因子在化学感应神经元中调控发育决策过程 | 首次揭示FKH-7/FOXP在化学感应神经元中的功能，建立了连接两个进化保守自闭症相关基因的新框架 | 研究在特定发育决策范式背景下进行，结果可能不适用于其他神经发育环境 | 探究FOXP1转录因子在神经发育中的具体分子机制 | 化学感应神经元、幼虫发育决策过程 | 神经科学 | 自闭症 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 370 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome analysis of the early immune response in the lymph nodes of Borrelia burgdorferi-infected mice
2025-Feb, Microbes and infection
IF:2.6Q3
DOI:10.1016/j.micinf.2024.105424
PMID:39306236
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析伯氏疏螺旋体感染小鼠淋巴结早期免疫反应的特征 | 首次在单细胞水平揭示伯氏疏螺旋体感染早期淋巴结的免疫景观，发现滤泡外免疫反应的关键特征 | 仅关注早期感染阶段（感染后四天），未研究长期感染动态 | 阐明伯氏疏螺旋体感染早期淋巴结免疫反应的细胞和分子机制 | 伯氏疏螺旋体感染小鼠模型的淋巴结淋巴细胞 | 单细胞组学 | 莱姆病 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 感染伯氏疏螺旋体的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 371 | 2025-10-07 |
A novel signature predicts prognosis in pancreatic cancer based on tumor membrane-associated genes
2025-Feb-28, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2025.e42791
PMID:40066030
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研究论文 | 基于肿瘤膜相关基因构建胰腺癌预后预测模型MaGPS | 首次整合单细胞RNA测序、空间转录组学和蛋白质表达数据，识别肿瘤上皮细胞特异性膜相关基因构建预后模型 | 研究基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 开发胰腺癌预后预测模型并探索潜在治疗靶点 | 胰腺癌患者 | 生物信息学 | 胰腺癌 | scRNA-seq, bulk RNA-seq, 空间转录组学, LASSO回归, Cox回归 | 预后风险预测模型 | 基因表达数据, 生存数据, 蛋白质表达数据 | 来自TCGA、ICGC和GEO数据库的多个患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 372 | 2025-10-07 |
High expression of stearoyl-coenzyme A desaturase in colorectal cancer oncogenic functions and its potential as a therapeutic target
2025-Feb-27, World journal of gastrointestinal surgery
IF:1.8Q2
DOI:10.4240/wjgs.v17.i2.100237
PMID:40061980
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研究论文 | 本研究探讨硬脂酰辅酶A去饱和酶在结直肠癌中的致癌功能及其作为治疗靶点的潜力 | 首次通过多中心高通量数据整合分析SCD在结直肠癌中的表达意义，并验证氯化两面针碱与SCD的靶向亲和性 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，缺乏体内实验验证 | 探索SCD在结直肠癌中的临床病理学意义及其作为治疗靶点的潜力 | 结直肠癌组织和细胞系 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 免疫组化染色、CRISPR基因敲除筛选、单细胞测序、分子对接 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、单细胞测序数据 | 2482例结直肠癌样本和1334例非癌结直肠组织对照 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 373 | 2025-10-07 |
Cross-species imputation and comparison of single-cell transcriptomic profiles
2025-Feb-26, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03493-x
PMID:40012008
|
研究论文 | 开发了跨物种单细胞转录组数据插补与比较的神经网络框架Icebear | 首次实现跨物种单细胞基因表达谱的准确预测，并揭示哺乳动物X染色体上调的进化适应机制 | 未明确说明模型验证的具体样本规模和应用场景限制 | 解决跨物种单细胞转录组比较的挑战，促进从模式生物到人类的知识迁移 | 真兽类哺乳动物和鸡的单细胞转录组数据 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经网络 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 374 | 2025-10-07 |
A humanized mouse model system mimics prenatal Zika infection and reveals premature differentiation of neural stem cells
2025-Feb-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.21.639556
PMID:40060457
|
研究论文 | 开发了一种人源化小鼠模型系统，模拟产前寨卡病毒感染并揭示神经干细胞过早分化的机制 | 建立了首个能够模拟人类产前寨卡病毒感染表型谱的人源化免疫健全小鼠模型系统 | 小鼠模型与人类生理存在差异，需要进一步验证临床转化价值 | 建立可靠的产前寨卡病毒感染实验模型并研究其致病机制 | 人源化小鼠模型和寨卡病毒感染后的脑组织 | 传染病模型 | 寨卡病毒感染 | 单细胞RNA测序 | 人源化小鼠模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 375 | 2025-10-07 |
MIG-21 is a novel regulator of Wnt and Netrin signaling in gonad migration identified from published scRNA-seq data and functionally validated in C. elegans
2025-Feb-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.24.639896
PMID:40060509
|
研究论文 | 本研究通过分析已发表的秀丽隐杆线虫单细胞RNA测序数据，发现了一个新的生殖系干细胞生态位调节因子MIG-21，并验证其在引导远端尖端细胞迁移中的功能 | 首次发现MIG-21基因整合Wnt和Netrin信号通路信息来指导细胞迁移，揭示了传统筛选方法因基因冗余而被掩盖的遗传网络 | 研究仅在线虫模型中进行验证，未在其他生物体系中确认该机制的普适性 | 探索生殖系干细胞生态位调节的新机制 | 秀丽隐杆线虫的远端尖端细胞(DTC) | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 经典遗传学技术, RNAi敲低, 活细胞成像 | NA | 单细胞RNA测序数据, 成像数据 | 成年雌雄同体线虫的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 376 | 2025-10-07 |
Molecular differences between young and mature stria vascularis from organotypic explants and transcriptomics
2025-Feb-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.111832
PMID:40028281
|
研究论文 | 本研究通过建立幼年和成熟小鼠耳蜗血管纹组织外植体模型并进行单细胞RNA测序，揭示了血管纹发育和维持的关键分子差异 | 开发了首个幼年和成熟小鼠耳蜗血管纹全组织外植体模型，并结合单细胞RNA测序技术系统分析发育过程中的分子变化 | 研究仅使用小鼠模型，结果向人类转化的有效性需要进一步验证 | 研究耳蜗血管纹在发育过程中的分子差异，为治疗血管纹退化相关听力损失提供新见解 | 新生和成熟小鼠的耳蜗血管纹组织 | 单细胞转录组学 | 听力损失 | 单细胞RNA测序, 组织外植体培养 | 小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 新生和成熟小鼠的耳蜗血管纹组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 377 | 2025-10-07 |
A Nerve-Fibroblast Axis in Mammalian Lung Fibrosis
2025-Feb-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.09.611003
PMID:39314391
|
研究论文 | 本研究揭示了哺乳动物肺纤维化中交感神经与表达α1-肾上腺素能受体的肌成纤维细胞之间形成的新型促纤维化轴 | 首次发现并表征了跨物种保守的神经-成纤维细胞轴，揭示了神经对组织重塑的关键贡献 | 纤维化机制尚未完全阐明，需要进一步研究验证 | 探究肺纤维化中肌成纤维细胞积累的机制 | 小鼠和人类纤维化肺组织、肺成纤维细胞、支气管肺泡灌洗液 | 病理生物学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序, 光学透明化, 全肺成像, 基因删除, 共培养, 精准肺切片 | NA | 基因表达数据, 组织图像, 测序数据 | 多种肺纤维化患者的肺组织和成纤维细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 378 | 2025-10-07 |
Shiba: a versatile computational method for systematic identification of differential RNA splicing across platforms
2025-Feb-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf098
PMID:39997221
|
研究论文 | 开发了Shiba计算方法用于系统识别不同平台间的差异RNA剪接 | 能够捕获注释和未注释的剪接事件，解决连接读段不平衡问题，统计框架对样本量不敏感，并扩展了单细胞RNA-seq分析功能 | NA | 开发一个跨平台的差异RNA剪接分析方法 | RNA剪接事件 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 统计框架 | RNA测序数据 | n=1 RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 379 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing defines distinct disease subtypes and reveals hypo-responsiveness to interferon in asymptomatic Waldenstrom's Macroglobulinemia
2025-Feb-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56323-w
PMID:39929803
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示无症状华氏巨球蛋白血症的疾病亚型和干扰素低反应性特征 | 首次在单细胞水平定义了华氏巨球蛋白血症的分子亚型，并发现干扰素低反应性这一治疗脆弱点 | 样本量相对有限（79例患者），需要进一步验证研究 | 解析华氏巨球蛋白血症进展的肿瘤内在和免疫机制 | 华氏巨球蛋白血症患者、冒烟型骨髓瘤患者和健康捐赠者的骨髓肿瘤和免疫细胞 | 单细胞组学 | 华氏巨球蛋白血症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 294,206个骨髓细胞，来自30例AWM/WM患者、26例冒烟型骨髓瘤患者和23例健康捐赠者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 380 | 2025-10-07 |
Deep learning-based cell-specific gene regulatory networks inferred from single-cell multiome data
2025-Feb-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf138
PMID:40037709
|
研究论文 | 开发了一种基于深度学习的框架scMultiomeGRN，用于从单细胞多组学数据推断细胞特异性基因调控网络 | 通过构建模态特异性邻居聚合器和跨模态注意力模块，独特整合单细胞RNA测序和ATAC测序数据来学习转录因子的潜在表示 | 单细胞测序数据固有的高丢失率可能影响网络推断的准确性 | 从单细胞多组学数据推断细胞特异性基因调控网络 | 转录因子调控网络，特别是阿尔茨海默病相关的SPI1和RUNX1调控网络 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 深度学习框架 | 单细胞多组学数据 | 多个基准数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |