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当前共找到 649 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2025-10-07 |
Deciphering the generation of heterogeneity in esophageal squamous cell carcinoma metastasis via single-cell multiomics analysis
2025-Feb-04, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06154-6
PMID:39905485
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研究论文 | 通过单细胞多组学分析揭示食管鳞状细胞癌转移过程中异质性的产生机制 | 首次在单细胞水平整合scATAC-seq、scRNA-seq、ChIP-seq/CUT&Tag、Hi-C和bulk测序数据，系统解析ESCC转移中的染色质可及性调控网络 | 样本量较小（仅4例患者），且患者病理分期不同可能影响结果一致性 | 探究染色质可及性在食管鳞状细胞癌转移和异质性形成中的作用机制 | 食管鳞状细胞癌患者的癌组织和癌旁组织 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | scATAC-seq, scRNA-seq, ChIP-seq, CUT&Tag, Hi-C, bulk RNA-seq, bulk ATAC-seq | 多组学整合分析 | 单细胞测序数据、表观基因组数据、转录组数据 | 4例ESCC患者（T1a、T2b、T3b、T4a分期）的癌和癌旁组织 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量ATAC-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 362 | 2025-10-07 |
Differences in immune cells and gene expression in human milk by parity on integrated scRNA sequencing
2025-Feb, Clinical and experimental pediatrics
IF:3.2Q1
DOI:10.3345/cep.2024.01585
PMID:39810510
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研究论文 | 通过整合分析单细胞RNA测序数据，研究胎次对人类母乳中免疫细胞组成和基因表达的影响 | 首次利用公开scRNA-seq数据集系统分析胎次对人类母乳免疫细胞异质性的影响 | 使用公开数据集，样本量有限，需要进一步实验验证 | 阐明胎次对人类母乳免疫细胞异质性和基因表达的影响 | 人类母乳样本 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 公开数据集中的母乳样本（初产妇vs经产妇） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 363 | 2025-10-07 |
Mitochondrial Regulator CRIF1 Plays a Critical Role in the Development and Homeostasis of Alveolar Macrophages via Maintaining Metabolic Fitness
2025-Feb, Immune network
IF:4.3Q2
DOI:10.4110/in.2025.25.e9
PMID:40078782
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研究论文 | 本研究揭示线粒体调节因子CRIF1通过维持代谢适应性在肺泡巨噬细胞发育和稳态中的关键作用 | 首次发现CRIF1作为特异性调节肺泡巨噬细胞代谢适应性的关键因子，区别于其他广泛作用的线粒体调节因子 | 研究主要关注CRIF1在肺泡巨噬细胞中的作用，对其他组织驻留巨噬细胞的影响尚未深入探讨 | 探究CRIF1在肺泡巨噬细胞代谢调节和稳态维持中的具体作用机制 | 肺泡巨噬细胞和小鼠模型 | 细胞生物学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序,转录组分析 | 基因敲除模型 | 基因表达数据,代谢数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 364 | 2025-10-07 |
The forkhead transcription factor FKH-7/FOXP acts in chemosensory neurons to regulate developmental decision-making
2025-Feb-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.17.638733
PMID:40027766
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研究论文 | 研究发现FKH-7/FOXP转录因子在化学感应神经元中调控发育决策过程 | 首次揭示FKH-7/FOXP在化学感应神经元中的功能，建立了连接两个进化保守自闭症相关基因的新框架 | 研究在特定发育决策范式背景下进行，结果可能不适用于其他神经发育环境 | 探究FOXP1转录因子在神经发育中的具体分子机制 | 化学感应神经元、幼虫发育决策过程 | 神经科学 | 自闭症 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 365 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome analysis of the early immune response in the lymph nodes of Borrelia burgdorferi-infected mice
2025-Feb, Microbes and infection
IF:2.6Q3
DOI:10.1016/j.micinf.2024.105424
PMID:39306236
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析伯氏疏螺旋体感染小鼠淋巴结早期免疫反应的特征 | 首次在单细胞水平揭示伯氏疏螺旋体感染早期淋巴结的免疫景观，发现滤泡外免疫反应的关键特征 | 仅关注早期感染阶段（感染后四天），未研究长期感染动态 | 阐明伯氏疏螺旋体感染早期淋巴结免疫反应的细胞和分子机制 | 伯氏疏螺旋体感染小鼠模型的淋巴结淋巴细胞 | 单细胞组学 | 莱姆病 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 感染伯氏疏螺旋体的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 366 | 2025-10-07 |
A novel signature predicts prognosis in pancreatic cancer based on tumor membrane-associated genes
2025-Feb-28, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2025.e42791
PMID:40066030
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研究论文 | 基于肿瘤膜相关基因构建胰腺癌预后预测模型MaGPS | 首次整合单细胞RNA测序、空间转录组学和蛋白质表达数据，识别肿瘤上皮细胞特异性膜相关基因构建预后模型 | 研究基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 开发胰腺癌预后预测模型并探索潜在治疗靶点 | 胰腺癌患者 | 生物信息学 | 胰腺癌 | scRNA-seq, bulk RNA-seq, 空间转录组学, LASSO回归, Cox回归 | 预后风险预测模型 | 基因表达数据, 生存数据, 蛋白质表达数据 | 来自TCGA、ICGC和GEO数据库的多个患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 367 | 2025-10-07 |
High expression of stearoyl-coenzyme A desaturase in colorectal cancer oncogenic functions and its potential as a therapeutic target
2025-Feb-27, World journal of gastrointestinal surgery
IF:1.8Q2
DOI:10.4240/wjgs.v17.i2.100237
PMID:40061980
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研究论文 | 本研究探讨硬脂酰辅酶A去饱和酶在结直肠癌中的致癌功能及其作为治疗靶点的潜力 | 首次通过多中心高通量数据整合分析SCD在结直肠癌中的表达意义，并验证氯化两面针碱与SCD的靶向亲和性 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，缺乏体内实验验证 | 探索SCD在结直肠癌中的临床病理学意义及其作为治疗靶点的潜力 | 结直肠癌组织和细胞系 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 免疫组化染色、CRISPR基因敲除筛选、单细胞测序、分子对接 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、单细胞测序数据 | 2482例结直肠癌样本和1334例非癌结直肠组织对照 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 368 | 2025-10-07 |
Cross-species imputation and comparison of single-cell transcriptomic profiles
2025-Feb-26, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03493-x
PMID:40012008
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研究论文 | 开发了跨物种单细胞转录组数据插补与比较的神经网络框架Icebear | 首次实现跨物种单细胞基因表达谱的准确预测，并揭示哺乳动物X染色体上调的进化适应机制 | 未明确说明模型验证的具体样本规模和应用场景限制 | 解决跨物种单细胞转录组比较的挑战，促进从模式生物到人类的知识迁移 | 真兽类哺乳动物和鸡的单细胞转录组数据 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经网络 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 369 | 2025-10-07 |
A humanized mouse model system mimics prenatal Zika infection and reveals premature differentiation of neural stem cells
2025-Feb-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.21.639556
PMID:40060457
|
研究论文 | 开发了一种人源化小鼠模型系统，模拟产前寨卡病毒感染并揭示神经干细胞过早分化的机制 | 建立了首个能够模拟人类产前寨卡病毒感染表型谱的人源化免疫健全小鼠模型系统 | 小鼠模型与人类生理存在差异，需要进一步验证临床转化价值 | 建立可靠的产前寨卡病毒感染实验模型并研究其致病机制 | 人源化小鼠模型和寨卡病毒感染后的脑组织 | 传染病模型 | 寨卡病毒感染 | 单细胞RNA测序 | 人源化小鼠模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 370 | 2025-10-07 |
MIG-21 is a novel regulator of Wnt and Netrin signaling in gonad migration identified from published scRNA-seq data and functionally validated in C. elegans
2025-Feb-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.24.639896
PMID:40060509
|
研究论文 | 本研究通过分析已发表的秀丽隐杆线虫单细胞RNA测序数据，发现了一个新的生殖系干细胞生态位调节因子MIG-21，并验证其在引导远端尖端细胞迁移中的功能 | 首次发现MIG-21基因整合Wnt和Netrin信号通路信息来指导细胞迁移，揭示了传统筛选方法因基因冗余而被掩盖的遗传网络 | 研究仅在线虫模型中进行验证，未在其他生物体系中确认该机制的普适性 | 探索生殖系干细胞生态位调节的新机制 | 秀丽隐杆线虫的远端尖端细胞(DTC) | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 经典遗传学技术, RNAi敲低, 活细胞成像 | NA | 单细胞RNA测序数据, 成像数据 | 成年雌雄同体线虫的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 371 | 2025-10-07 |
PLXNB1 and other signaling drives a pathologic astrocyte state contributing to cognitive decline in Alzheimer's Disease
2025-Feb-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.24.639868
PMID:40060644
|
研究论文 | 本研究通过单核转录组数据分析发现PLXNB1等信号驱动病理性星形胶质细胞状态Ast10，该状态与阿尔茨海默病认知衰退相关 | 首次通过大规模单核转录组数据meta分析鉴定出关键的病理性星形胶质细胞亚群Ast10，并验证其在认知衰退中的独立作用 | 研究主要基于转录组数据，需要进一步功能实验验证具体分子机制 | 探究阿尔茨海默病中病理性星形胶质细胞状态的驱动机制及其在认知衰退中的作用 | 人脑组织样本、小鼠模型、人iPSC来源的星形胶质细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单核RNA测序, 空间转录组学, 基因敲除 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据 | 869个大脑样本 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 372 | 2025-10-07 |
Molecular differences between young and mature stria vascularis from organotypic explants and transcriptomics
2025-Feb-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.111832
PMID:40028281
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研究论文 | 本研究通过建立幼年和成熟小鼠耳蜗血管纹组织外植体模型并进行单细胞RNA测序，揭示了血管纹发育和维持的关键分子差异 | 开发了首个幼年和成熟小鼠耳蜗血管纹全组织外植体模型，并结合单细胞RNA测序技术系统分析发育过程中的分子变化 | 研究仅使用小鼠模型，结果向人类转化的有效性需要进一步验证 | 研究耳蜗血管纹在发育过程中的分子差异，为治疗血管纹退化相关听力损失提供新见解 | 新生和成熟小鼠的耳蜗血管纹组织 | 单细胞转录组学 | 听力损失 | 单细胞RNA测序, 组织外植体培养 | 小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 新生和成熟小鼠的耳蜗血管纹组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 373 | 2025-10-07 |
A Nerve-Fibroblast Axis in Mammalian Lung Fibrosis
2025-Feb-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.09.611003
PMID:39314391
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研究论文 | 本研究揭示了哺乳动物肺纤维化中交感神经与表达α1-肾上腺素能受体的肌成纤维细胞之间形成的新型促纤维化轴 | 首次发现并表征了跨物种保守的神经-成纤维细胞轴，揭示了神经对组织重塑的关键贡献 | 纤维化机制尚未完全阐明，需要进一步研究验证 | 探究肺纤维化中肌成纤维细胞积累的机制 | 小鼠和人类纤维化肺组织、肺成纤维细胞、支气管肺泡灌洗液 | 病理生物学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序, 光学透明化, 全肺成像, 基因删除, 共培养, 精准肺切片 | NA | 基因表达数据, 组织图像, 测序数据 | 多种肺纤维化患者的肺组织和成纤维细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 374 | 2025-10-07 |
Shiba: a versatile computational method for systematic identification of differential RNA splicing across platforms
2025-Feb-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf098
PMID:39997221
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研究论文 | 开发了Shiba计算方法用于系统识别不同平台间的差异RNA剪接 | 能够捕获注释和未注释的剪接事件，解决连接读段不平衡问题，统计框架对样本量不敏感，并扩展了单细胞RNA-seq分析功能 | NA | 开发一个跨平台的差异RNA剪接分析方法 | RNA剪接事件 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 统计框架 | RNA测序数据 | n=1 RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 375 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing defines distinct disease subtypes and reveals hypo-responsiveness to interferon in asymptomatic Waldenstrom's Macroglobulinemia
2025-Feb-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56323-w
PMID:39929803
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示无症状华氏巨球蛋白血症的疾病亚型和干扰素低反应性特征 | 首次在单细胞水平定义了华氏巨球蛋白血症的分子亚型，并发现干扰素低反应性这一治疗脆弱点 | 样本量相对有限（79例患者），需要进一步验证研究 | 解析华氏巨球蛋白血症进展的肿瘤内在和免疫机制 | 华氏巨球蛋白血症患者、冒烟型骨髓瘤患者和健康捐赠者的骨髓肿瘤和免疫细胞 | 单细胞组学 | 华氏巨球蛋白血症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 294,206个骨髓细胞，来自30例AWM/WM患者、26例冒烟型骨髓瘤患者和23例健康捐赠者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 376 | 2025-10-07 |
Deep learning-based cell-specific gene regulatory networks inferred from single-cell multiome data
2025-Feb-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf138
PMID:40037709
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研究论文 | 开发了一种基于深度学习的框架scMultiomeGRN，用于从单细胞多组学数据推断细胞特异性基因调控网络 | 通过构建模态特异性邻居聚合器和跨模态注意力模块，独特整合单细胞RNA测序和ATAC测序数据来学习转录因子的潜在表示 | 单细胞测序数据固有的高丢失率可能影响网络推断的准确性 | 从单细胞多组学数据推断细胞特异性基因调控网络 | 转录因子调控网络，特别是阿尔茨海默病相关的SPI1和RUNX1调控网络 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 深度学习框架 | 单细胞多组学数据 | 多个基准数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 377 | 2025-10-07 |
Pluripotency factor Tex10 finetunes Wnt signaling for spermatogenesis and primordial germ cell development
2025-Feb-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57165-2
PMID:39988597
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研究论文 | 本研究揭示了多能性因子Tex10通过调控Wnt信号通路在精子发生和原始生殖细胞发育中的关键作用 | 首次发现Tex10通过结合H3K4me3标记的Psmd3和Psmd7基因启动子激活其表达，从而抑制Wnt信号通路 | 研究主要基于小鼠模型，在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究Tex10在精子发生和原始生殖细胞发育中的分子机制 | 小鼠睾丸组织、胚胎干细胞和原始生殖细胞 | 发育生物学 | 男性不育症 | 条件性基因敲除、dTAG-degron系统、bulk RNA测序、单细胞RNA测序、染色质占据研究 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、染色质结合数据 | Tex10敲除小鼠和野生型对照小鼠 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 378 | 2025-10-07 |
ELLIPSIS: robust quantification of splicing in scRNA-seq
2025-Feb-04, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf028
PMID:39936571
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研究论文 | 开发了一种名为ELLIPSIS的工具，用于在单细胞RNA测序中稳健地量化剪接事件 | 利用局部观察到的读取覆盖度、流动保守性和细胞类型内相似性特性，能够量化新型剪接事件 | NA | 开发在单细胞RNA测序中稳健量化剪接的工具 | 单细胞RNA测序数据中的剪接事件 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 379 | 2025-10-07 |
Jellyfish stings-induced cardiac failure was ameliorated through AAG-mediated glycogen-driven ATP production
2025-Feb, Exploration (Beijing, China)
DOI:10.1002/EXP.20230089
PMID:40040825
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研究论文 | 本研究揭示了水母蜇伤导致的心力衰竭通过AAG介导的糖原驱动ATP产生得到改善的机制 | 首次发现AAG通过促进糖原代谢和糖酵解/线粒体代谢转换来改善水母蜇伤引起的心力衰竭 | 具体分子机制仍需进一步阐明，临床转化潜力有待验证 | 探究AAG在改善水母蜇伤引起的心力衰竭中的作用机制 | 水母蜇伤引起的心力衰竭患者和相关的分子通路 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,空间转录组技术 | 基因敲除模型 | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 380 | 2025-10-07 |
Overexpression of ornithine decarboxylase 1 mediates the immune-deserted microenvironment and poor prognosis in diffuse large B-cell lymphoma
2025-Feb, Journal of the National Cancer Center
IF:7.6Q1
DOI:10.1016/j.jncc.2024.10.001
PMID:40040873
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研究论文 | 本研究通过机器学习识别弥漫性大B细胞淋巴瘤中具有干细胞特征的高风险亚群，并揭示ODC1过表达与免疫荒漠微环境共同导致不良预后的机制 | 首次将ODC1过表达与DLBCL免疫荒漠微环境联系起来，建立了精准风险分层模型，并证明靶向ODC1可调节免疫治疗反应 | 研究基于回顾性数据，需要前瞻性临床试验验证治疗策略 | 改善弥漫性大B细胞淋巴瘤的风险分层和治疗策略 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤患者和细胞系 | 机器学习 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 基因组分析, 体外实验 | 机器学习算法 | 转录组数据, 基因组数据, 单细胞RNA测序数据 | 2133例DLBCL样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |