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当前共找到 652 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2025-10-07 |
A humanized mouse model system mimics prenatal Zika infection and reveals premature differentiation of neural stem cells
2025-Feb-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.21.639556
PMID:40060457
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研究论文 | 开发了一种人源化小鼠模型系统，模拟产前寨卡病毒感染并揭示神经干细胞过早分化的机制 | 建立了首个能够模拟人类产前寨卡病毒感染表型谱的人源化免疫健全小鼠模型系统 | 小鼠模型与人类生理存在差异，需要进一步验证临床转化价值 | 建立可靠的产前寨卡病毒感染实验模型并研究其致病机制 | 人源化小鼠模型和寨卡病毒感染后的脑组织 | 传染病模型 | 寨卡病毒感染 | 单细胞RNA测序 | 人源化小鼠模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 362 | 2025-10-07 |
MIG-21 is a novel regulator of Wnt and Netrin signaling in gonad migration identified from published scRNA-seq data and functionally validated in C. elegans
2025-Feb-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.24.639896
PMID:40060509
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研究论文 | 本研究通过分析已发表的秀丽隐杆线虫单细胞RNA测序数据，发现了一个新的生殖系干细胞生态位调节因子MIG-21，并验证其在引导远端尖端细胞迁移中的功能 | 首次发现MIG-21基因整合Wnt和Netrin信号通路信息来指导细胞迁移，揭示了传统筛选方法因基因冗余而被掩盖的遗传网络 | 研究仅在线虫模型中进行验证，未在其他生物体系中确认该机制的普适性 | 探索生殖系干细胞生态位调节的新机制 | 秀丽隐杆线虫的远端尖端细胞(DTC) | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 经典遗传学技术, RNAi敲低, 活细胞成像 | NA | 单细胞RNA测序数据, 成像数据 | 成年雌雄同体线虫的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 363 | 2025-10-07 |
PLXNB1 and other signaling drives a pathologic astrocyte state contributing to cognitive decline in Alzheimer's Disease
2025-Feb-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.24.639868
PMID:40060644
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研究论文 | 本研究通过单核转录组数据分析发现PLXNB1等信号驱动病理性星形胶质细胞状态Ast10，该状态与阿尔茨海默病认知衰退相关 | 首次通过大规模单核转录组数据meta分析鉴定出关键的病理性星形胶质细胞亚群Ast10，并验证其在认知衰退中的独立作用 | 研究主要基于转录组数据，需要进一步功能实验验证具体分子机制 | 探究阿尔茨海默病中病理性星形胶质细胞状态的驱动机制及其在认知衰退中的作用 | 人脑组织样本、小鼠模型、人iPSC来源的星形胶质细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单核RNA测序, 空间转录组学, 基因敲除 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据 | 869个大脑样本 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 364 | 2025-10-07 |
Molecular differences between young and mature stria vascularis from organotypic explants and transcriptomics
2025-Feb-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.111832
PMID:40028281
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研究论文 | 本研究通过建立幼年和成熟小鼠耳蜗血管纹组织外植体模型并进行单细胞RNA测序，揭示了血管纹发育和维持的关键分子差异 | 开发了首个幼年和成熟小鼠耳蜗血管纹全组织外植体模型，并结合单细胞RNA测序技术系统分析发育过程中的分子变化 | 研究仅使用小鼠模型，结果向人类转化的有效性需要进一步验证 | 研究耳蜗血管纹在发育过程中的分子差异，为治疗血管纹退化相关听力损失提供新见解 | 新生和成熟小鼠的耳蜗血管纹组织 | 单细胞转录组学 | 听力损失 | 单细胞RNA测序, 组织外植体培养 | 小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 新生和成熟小鼠的耳蜗血管纹组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 365 | 2025-10-07 |
A Nerve-Fibroblast Axis in Mammalian Lung Fibrosis
2025-Feb-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.09.611003
PMID:39314391
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研究论文 | 本研究揭示了哺乳动物肺纤维化中交感神经与表达α1-肾上腺素能受体的肌成纤维细胞之间形成的新型促纤维化轴 | 首次发现并表征了跨物种保守的神经-成纤维细胞轴，揭示了神经对组织重塑的关键贡献 | 纤维化机制尚未完全阐明，需要进一步研究验证 | 探究肺纤维化中肌成纤维细胞积累的机制 | 小鼠和人类纤维化肺组织、肺成纤维细胞、支气管肺泡灌洗液 | 病理生物学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序, 光学透明化, 全肺成像, 基因删除, 共培养, 精准肺切片 | NA | 基因表达数据, 组织图像, 测序数据 | 多种肺纤维化患者的肺组织和成纤维细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 366 | 2025-10-07 |
Shiba: a versatile computational method for systematic identification of differential RNA splicing across platforms
2025-Feb-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf098
PMID:39997221
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研究论文 | 开发了Shiba计算方法用于系统识别不同平台间的差异RNA剪接 | 能够捕获注释和未注释的剪接事件，解决连接读段不平衡问题，统计框架对样本量不敏感，并扩展了单细胞RNA-seq分析功能 | NA | 开发一个跨平台的差异RNA剪接分析方法 | RNA剪接事件 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 统计框架 | RNA测序数据 | n=1 RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 367 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing defines distinct disease subtypes and reveals hypo-responsiveness to interferon in asymptomatic Waldenstrom's Macroglobulinemia
2025-Feb-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56323-w
PMID:39929803
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示无症状华氏巨球蛋白血症的疾病亚型和干扰素低反应性特征 | 首次在单细胞水平定义了华氏巨球蛋白血症的分子亚型，并发现干扰素低反应性这一治疗脆弱点 | 样本量相对有限（79例患者），需要进一步验证研究 | 解析华氏巨球蛋白血症进展的肿瘤内在和免疫机制 | 华氏巨球蛋白血症患者、冒烟型骨髓瘤患者和健康捐赠者的骨髓肿瘤和免疫细胞 | 单细胞组学 | 华氏巨球蛋白血症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 294,206个骨髓细胞，来自30例AWM/WM患者、26例冒烟型骨髓瘤患者和23例健康捐赠者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 368 | 2025-10-07 |
Deep learning-based cell-specific gene regulatory networks inferred from single-cell multiome data
2025-Feb-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf138
PMID:40037709
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研究论文 | 开发了一种基于深度学习的框架scMultiomeGRN，用于从单细胞多组学数据推断细胞特异性基因调控网络 | 通过构建模态特异性邻居聚合器和跨模态注意力模块，独特整合单细胞RNA测序和ATAC测序数据来学习转录因子的潜在表示 | 单细胞测序数据固有的高丢失率可能影响网络推断的准确性 | 从单细胞多组学数据推断细胞特异性基因调控网络 | 转录因子调控网络，特别是阿尔茨海默病相关的SPI1和RUNX1调控网络 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 深度学习框架 | 单细胞多组学数据 | 多个基准数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 369 | 2025-10-07 |
Pluripotency factor Tex10 finetunes Wnt signaling for spermatogenesis and primordial germ cell development
2025-Feb-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57165-2
PMID:39988597
|
研究论文 | 本研究揭示了多能性因子Tex10通过调控Wnt信号通路在精子发生和原始生殖细胞发育中的关键作用 | 首次发现Tex10通过结合H3K4me3标记的Psmd3和Psmd7基因启动子激活其表达，从而抑制Wnt信号通路 | 研究主要基于小鼠模型，在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究Tex10在精子发生和原始生殖细胞发育中的分子机制 | 小鼠睾丸组织、胚胎干细胞和原始生殖细胞 | 发育生物学 | 男性不育症 | 条件性基因敲除、dTAG-degron系统、bulk RNA测序、单细胞RNA测序、染色质占据研究 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、染色质结合数据 | Tex10敲除小鼠和野生型对照小鼠 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 370 | 2025-10-07 |
ELLIPSIS: robust quantification of splicing in scRNA-seq
2025-Feb-04, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf028
PMID:39936571
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研究论文 | 开发了一种名为ELLIPSIS的工具，用于在单细胞RNA测序中稳健地量化剪接事件 | 利用局部观察到的读取覆盖度、流动保守性和细胞类型内相似性特性，能够量化新型剪接事件 | NA | 开发在单细胞RNA测序中稳健量化剪接的工具 | 单细胞RNA测序数据中的剪接事件 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 371 | 2025-10-07 |
Jellyfish stings-induced cardiac failure was ameliorated through AAG-mediated glycogen-driven ATP production
2025-Feb, Exploration (Beijing, China)
DOI:10.1002/EXP.20230089
PMID:40040825
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研究论文 | 本研究揭示了水母蜇伤导致的心力衰竭通过AAG介导的糖原驱动ATP产生得到改善的机制 | 首次发现AAG通过促进糖原代谢和糖酵解/线粒体代谢转换来改善水母蜇伤引起的心力衰竭 | 具体分子机制仍需进一步阐明，临床转化潜力有待验证 | 探究AAG在改善水母蜇伤引起的心力衰竭中的作用机制 | 水母蜇伤引起的心力衰竭患者和相关的分子通路 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,空间转录组技术 | 基因敲除模型 | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 372 | 2025-10-07 |
Overexpression of ornithine decarboxylase 1 mediates the immune-deserted microenvironment and poor prognosis in diffuse large B-cell lymphoma
2025-Feb, Journal of the National Cancer Center
IF:7.6Q1
DOI:10.1016/j.jncc.2024.10.001
PMID:40040873
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研究论文 | 本研究通过机器学习识别弥漫性大B细胞淋巴瘤中具有干细胞特征的高风险亚群，并揭示ODC1过表达与免疫荒漠微环境共同导致不良预后的机制 | 首次将ODC1过表达与DLBCL免疫荒漠微环境联系起来，建立了精准风险分层模型，并证明靶向ODC1可调节免疫治疗反应 | 研究基于回顾性数据，需要前瞻性临床试验验证治疗策略 | 改善弥漫性大B细胞淋巴瘤的风险分层和治疗策略 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤患者和细胞系 | 机器学习 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 基因组分析, 体外实验 | 机器学习算法 | 转录组数据, 基因组数据, 单细胞RNA测序数据 | 2133例DLBCL样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 373 | 2025-10-07 |
ETVs dictate hPSC differentiation by tuning biophysical properties
2025-Feb-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56591-6
PMID:40011454
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研究论文 | 本研究揭示了ETV转录因子通过调控细胞生物物理特性决定人类多能干细胞分化的机制 | 首次确立ETV转录因子作为细胞生物物理特性和谱系分化的关键调控因子 | 研究主要基于体外模型，体内验证尚需进一步研究 | 探索转录网络如何调控细胞生物物理特性及其在干细胞分化中的作用 | 人类多能干细胞(hPSCs)、类原肠胚和胰腺分化模型 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 374 | 2025-10-07 |
Investigating Gene Expression Noise Reduction by MicroRNAs and MiRISC Reinforcement by Self-Feedback Regulation of mRNA Degradation
2025-Feb-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.11.637731
PMID:39990448
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研究论文 | 通过数学建模和单细胞RNA测序数据分析研究microRNA通过自我反馈调控降低基因表达噪声的机制 | 首次同时分析mRNA降解和表达噪声，并发现通过mRNA降解的自我反馈控制实现噪声降低 | NA | 研究microRNA介导的基因表达噪声降低机制及其与代谢消耗的平衡 | miRNA靶向的mRNAs和miRISC mRNAs（AGO1/2/3和TNRC6A/B/C） | 系统生物学 | NA | 数学建模，单细胞RNA测序 | 负自我反馈环路模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 全RNA单细胞RNA-seq |
| 375 | 2025-10-07 |
Kernel-bounded clustering for spatial transcriptomics enables scalable discovery of complex spatial domains
2025-Feb-14, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.278983.124
PMID:39909714
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研究论文 | 提出一种名为核边界聚类(KBC)的新聚类算法，用于空间转录组学数据分析 | 首次使用分布核来招募聚类成员，能够发现不同密度、大小和形状的聚类，并且是线性时间复杂度的聚类算法 | NA | 开发能够有效处理大规模空间转录组数据集的快速聚类方法 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 核边界聚类(KBC) | 基因表达谱和空间信息 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 376 | 2025-10-07 |
Single-cell delineation of the microbiota-gut-brain axis: Probiotic intervention in Chd8 haploinsufficient mice
2025-Feb-12, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100768
PMID:39914389
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研究论文 | 本研究通过构建CHD8单倍体不足小鼠模型，利用单细胞转录组技术探索了肠道微生物群-肠-脑轴在自闭症谱系障碍中的作用机制 | 首次在单细胞分辨率下构建了ASD相关神经和肠道变化的转录组图谱，并发现乳酸杆菌干预可选择性挽救社交缺陷 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探索肠道微生物群通过肠-脑轴对神经系统的影响机制 | 野生型和CHD8单倍体不足突变小鼠的脑组织和肠道组织 | 单细胞转录组学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 野生型和突变型小鼠在三个发育阶段的脑和肠道组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 377 | 2025-10-07 |
STMiner: Gene-centric spatial transcriptomics for deciphering tumor tissues
2025-Feb-12, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100771
PMID:39947134
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研究论文 | 提出一种名为STMiner的空间转录组学分析方法，通过直接分析基因空间分布来解读肿瘤组织 | 利用2D高斯混合模型和最优传输理论直接表征基因的空间分布，而非基于细胞捕获位点的分析方法 | 未在摘要中明确说明研究局限性 | 解决肿瘤组织空间转录组数据分析中的挑战，包括区域边界不清、细胞密度不均和细胞异质性高等问题 | 肿瘤组织的空间转录组数据 | 空间转录组学 | 肿瘤 | 空间转录组学 | 2D高斯混合模型, 最优传输理论 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 378 | 2025-10-07 |
Characterization of canine tumor-infiltrating leukocyte transcriptomic signatures reveals conserved expression patterns with human osteosarcoma
2025-Feb-11, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-03950-3
PMID:39932553
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析犬类骨肉瘤中肿瘤浸润免疫细胞的转录组特征，并与人类骨肉瘤进行比较研究 | 首次在犬类骨肉瘤模型中系统分析肿瘤浸润免疫细胞的转录组特征，并揭示与人类骨肉瘤的保守表达模式 | 使用公开可用的单细胞RNA测序数据，样本来源有限；存在物种特异性差异 | 研究骨肉瘤肿瘤微环境对免疫细胞转录组特征的影响，并进行跨物种比较 | 犬类骨肉瘤肿瘤浸润免疫细胞和循环白细胞 | 单细胞转录组学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 计算分析、差异表达分析 | 单细胞转录组数据 | 公开可用的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 379 | 2025-10-07 |
Neutrophil-induced pyroptosis promotes survival in patients with hepatoblastoma
2025-Feb-11, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03922-z
PMID:39932547
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研究论文 | 本研究通过构建中性粒细胞诱导焦亡评分系统，揭示了其在肝母细胞瘤预后预测中的价值 | 首次构建基于ELANE、CASP1和NOD2基因的中性粒细胞诱导焦亡评分系统，并发现其与肝母细胞瘤良好预后正相关 | 样本量较小（仅38例患者），需要更大规模研究验证 | 探索中性粒细胞诱导焦亡与肝母细胞瘤预后的关系 | 肝母细胞瘤患者肿瘤样本 | 生物信息学 | 肝母细胞瘤 | RNA测序，单细胞RNA测序，免疫组化 | LASSO回归 | 基因表达数据，单细胞数据 | 38例肝母细胞瘤患者 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 380 | 2025-10-07 |
Identification of Wnt-5a Receptors Important in Diabetic and Non-Diabetic Corneal Epithelial Wound Healing
2025-Feb-03, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.2.64
PMID:39998459
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和DNA甲基化分析鉴定Wnt-5a在糖尿病和非糖尿病角膜上皮伤口愈合中的关键受体 | 首次在糖尿病角膜中通过单细胞RNA测序发现ROR2启动子低甲基化导致其蛋白表达增加，并证实ROR2是Wnt-5a介导伤口愈合的主要受体 | 研究样本来源于死后供体眼睛，可能无法完全反映活体情况；仅使用体外细胞模型验证功能 | 确定介导Wnt-5a刺激糖尿病角膜上皮伤口愈合的Wnt受体 | 人角膜缘上皮细胞（来自糖尿病和非糖尿病供体） | 生物医学研究 | 糖尿病角膜病变 | 单细胞RNA测序, DNA甲基化分析, qRT-PCR, western blot, 免疫染色, siRNA转染 | 体外细胞伤口愈合模型 | 基因表达数据, 甲基化数据, 蛋白质表达数据 | 来自糖尿病和非糖尿病供体的人角膜缘上皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |