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当前共找到 646 篇文献，本页显示第 341 - 360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2025-10-07 |
Spatial profiling of the interplay between cell type- and vision-dependent transcriptomic programs in the visual cortex
2025-Feb-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2421022122
PMID:39946537
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组分析揭示了视觉经验对初级视觉皮层L2/3神经元细胞类型空间组织和转录程序的调控机制 | 首次结合空间转录组学和单核RNA-seq数据，应用多任务理论揭示L2/3细胞类型空间分区与基因表达连续性的关联，并识别出视觉剥夺诱导的两个独立转录程序 | 研究仅聚焦于L2/3细胞类型，分析基于500个基因的空间转录组数据，可能未涵盖所有相关基因 | 探究视觉经验在关键期内如何影响哺乳动物新皮层神经元细胞类型的空间组织和转录调控 | 初级视觉皮层(V1)的L2/3神经元细胞类型 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组分析, 单核RNA-seq | 多任务理论, 2D流形模型 | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 正常饲养和暗饲养条件下的L2/3细胞 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 342 | 2025-10-07 |
CellGAT: A GAT-Based Method for Constructing a Cell Communication Network Integrating Multiomics Information
2025-Feb-27, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15030342
PMID:40149878
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研究论文 | 提出一种基于图注意力网络的细胞通讯网络构建方法CellGAT，整合多组学信息预测细胞间通讯 | 首次将蛋白质-蛋白质相互作用信息整合到细胞通讯网络构建中，使用图注意力网络和节点嵌入算法 | NA | 开发更准确的细胞间通讯预测方法 | 多细胞生物中的细胞通讯网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，图注意力网络，节点嵌入算法 | GAT（图注意力网络） | 基因表达数据，蛋白质相互作用数据，蛋白质复合物数据，通路信息 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 343 | 2025-10-07 |
VPS25 Promotes an Immunosuppressive Microenvironment in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2025-Feb-22, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15030323
PMID:40149859
|
研究论文 | 本研究探讨VPS25在头颈部鳞状细胞癌中促进免疫抑制微环境的作用机制 | 首次揭示VPS25通过上调PVR表达激活PVR-TIGIT免疫抑制信号轴，促进肿瘤免疫逃逸 | 研究主要基于TCGA数据集和细胞系实验，需要更多临床样本验证 | 探究ESCRT机制成分VPS25在HNSCC肿瘤进展和免疫调节中的作用 | 头颈部鳞状细胞癌组织和CAL27细胞系 | 肿瘤免疫学 | 头颈部鳞状细胞癌 | RNA测序，单细胞RNA测序，免疫组织化学，空间转录组学 | NA | 基因表达数据，组织图像，单细胞转录组数据 | TCGA数据集和HNSCC组织芯片 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学，bulk RNA测序 | NA | NA |
| 344 | 2025-10-07 |
Comprehensive analysis and experimental validation of disulfidptosis-associated prognostic signature and immune microenvironment characterization of gastric cancer
2025-Feb-25, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03883-3
PMID:39998563
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研究论文 | 本研究通过综合分析二硫化物死亡相关基因构建胃癌预后模型并验证其临床意义 | 首次基于二硫化物死亡相关基因建立胃癌预后特征模型，并通过单细胞测序和体外实验验证APC11基因的功能 | 研究样本量有限，需要更大规模临床队列验证模型的普适性 | 探索二硫化物死亡在胃癌发生发展中的作用并建立预后预测模型 | 胃癌组织和细胞系 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞测序, siRNA, qRT-PCR, Western blot, CCK-8, Transwell实验 | LASSO-Cox回归模型 | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 345 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomics reveals prognostically LYZ+ fibroblasts and colocalization with FN1+ macrophages in diffuse large B-cell lymphoma
2025-Feb-25, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-03968-7
PMID:39998673
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学等技术识别了弥漫性大B细胞淋巴瘤中具有预后意义的LYZ+成纤维细胞和FN1+巨噬细胞亚型 | 首次在DLBCL中发现LYZ+成纤维细胞与FN1+巨噬细胞的空间共定位及其预后价值 | 样本量相对有限（空间转录组学仅11例），需要在更大队列中验证 | 探索DLBCL肿瘤微环境中成纤维细胞和巨噬细胞亚型的预后意义 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤患者和非小细胞肺癌患者 | 数字病理学 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤 | 空间转录组学, bulk转录组学, 免疫组织化学, 多重免疫荧光, 自身抗体检测 | 单变量Cox回归, 随机森林分析 | 空间转录组数据, 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 临床数据 | 空间转录组学11例, bulk转录组学2499例, IHC 37例, mIF 56例, 血浆样本240例 | NA | 空间转录组学, bulk RNA-seq, 免疫组织化学, 多重免疫荧光 | NA | NA |
| 346 | 2025-10-07 |
CD4+ T cell-innate immune crosstalk is critical during Staphylococcus aureus craniotomy infection
2025-Feb-24, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.183327
PMID:39989461
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示了CD4+ T细胞在金黄色葡萄球菌开颅手术感染中的关键作用及其与先天免疫细胞的相互作用机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术系统揭示开颅手术感染中CD4+ T细胞的转录异质性及其与单核/巨噬细胞的广泛相互作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探究CD4+ T细胞在金黄色葡萄球菌开颅手术感染中的免疫功能和作用机制 | 小鼠模型和人类开颅手术感染样本 | 免疫学 | 细菌感染 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq), 细胞过继转移, 抗体中和实验 | 动物模型 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 347 | 2025-10-07 |
Effect of aging on pulmonary cellular responses during mechanical ventilation
2025-Feb-13, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.185834
PMID:39946196
|
研究论文 | 本研究探讨衰老对机械通气期间肺细胞反应的影响 | 首次通过单细胞RNA测序揭示衰老小鼠在机械通气下肺泡巨噬细胞炎症反应减弱和内皮细胞细胞连接形成改变的分子机制 | 研究仅使用雄性小鼠模型，未考虑性别差异；体外实验未能完全模拟体内复杂微环境 | 探究衰老如何影响机械通气过程中的肺细胞反应和损伤易感性 | 年轻和老年雄性小鼠的肺组织细胞 | 单细胞生物学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序，体外功能分析 | NA | 基因表达数据，功能实验数据 | 年轻和老年雄性小鼠群体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 348 | 2025-10-07 |
Inhibition of histone methyltransferase EZH2 for immune interception of colorectal cancer in Lynch syndrome
2025-Feb-13, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.177545
PMID:39946195
|
研究论文 | 本研究通过EZH2抑制剂GSK503干预林奇综合征小鼠模型和结肠类器官，探索表观遗传调控在结直肠癌免疫预防中的作用机制 | 首次揭示EZH2抑制剂通过表观遗传重编程增强免疫反应，为林奇综合征携带者提供癌症预防新策略 | 研究基于小鼠模型和类器官，临床转化效果需进一步验证 | 开发针对林奇综合征的免疫干预策略以预防结直肠癌发生 | 林奇综合征小鼠模型和体外培养的结肠类器官 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, ChIP测序, 表观遗传分析 | 动物模型, 类器官模型 | 基因表达数据, 表观遗传数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, ChIP-seq | NA | NA |
| 349 | 2025-10-07 |
Characterization and bioinformatic filtering of ambient gRNAs in single-cell CRISPR screens using CLEANSER
2025-Feb-12, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100766
PMID:39914388
|
研究论文 | 开发了一种名为CLEANSER的混合模型，用于过滤单细胞CRISPR筛选中的环境gRNA噪声 | 利用CRISPR混合实验表征环境gRNA，开发了包含gRNA和细胞特异性归一化参数的混合模型 | NA | 提高单细胞CRISPR筛选实验中gRNA-细胞分配准确性 | 单细胞CRISPR筛选中的环境gRNA污染 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序CRISPR筛选 | 混合模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 350 | 2025-10-07 |
Regulation of lung progenitor plasticity and repair by fatty acid oxidation
2025-Feb-10, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.165837
PMID:39927460
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研究论文 | 本研究揭示了脂肪酸氧化代谢通路在调控肺祖细胞修复和肺纤维化发展中的关键作用 | 首次发现脂肪酸氧化基因在IPF肺脏肺泡上皮细胞中表达显著降低，并证明CPT1a缺失导致肺祖细胞获得异常中间状态 | 研究主要基于小鼠模型，在人类疾病中的直接适用性需要进一步验证 | 探究代谢通路在肺泡再生和肺纤维化发展中的作用机制 | 肺祖细胞、肺泡上皮细胞、小鼠模型 | 细胞生物学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序、组织染色、基因抑制、药物抑制 | NA | 基因表达数据、组织图像数据 | IPF患者肺组织、基因工程小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 351 | 2025-10-07 |
Targeting fibroblast-endothelial cell interactions in LAM pathogenesis using 3D spheroid models and spatial transcriptomics
2025-Feb-04, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.187899
PMID:39903528
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研究论文 | 本研究通过3D球体模型和空间转录组学探索淋巴管平滑肌瘤病中成纤维细胞-内皮细胞相互作用的机制 | 首次结合空间转录组学和3D共培养球体模型揭示LAM发病机制中PDGFR/FGFR信号通路的关键作用，并发现索拉非尼比雷帕霉素更有效抑制细胞侵袭 | 研究主要基于体外模型，需要进一步体内验证；样本量有限 | 探索淋巴管平滑肌瘤病的发病机制并寻找潜在治疗靶点 | 淋巴管平滑肌瘤病患者肺组织、原代LAM成纤维细胞、淋巴管内皮细胞和TSC2缺失型肾血管平滑肌脂肪瘤细胞 | 空间转录组学 | 淋巴管平滑肌瘤病 | 空间转录组学, 激酶阵列, 3D球体共培养 | 3D球体模型 | 基因表达数据, 细胞侵袭数据 | 未明确样本数量 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 352 | 2025-10-07 |
Identification and Validation of Key Biomarkers in the Proximal Aqueous Humor Outflow Pathway
2025-Feb-25, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb47030147
PMID:40136401
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研究论文 | 通过转录组分析识别并验证了房水流出通路中关键细胞的生物标志物 | 首次通过微阵列与单细胞RNA测序数据交叉验证，发现了TM细胞标志物CTTNBP2和MGARP，以及SCE细胞新标志物JAM2、PODXL和IFI27 | 研究仅使用体外培养细胞，未进行体内功能验证 | 识别和验证小梁网和Schlemm管内皮细胞的关键生物标志物 | 人源小梁网细胞和Schlemm管内皮细胞 | 生物信息学 | 青光眼 | 微阵列, 单细胞RNA测序, qPCR | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 微阵列 | NA | NA |
| 353 | 2025-10-07 |
Esr1-Dependent Signaling and Transcriptional Maturation in the Medial Preoptic Area of the Hypothalamus Shapes the Development of Mating Behavior during Adolescence
2025-Feb-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.26.640339
PMID:40060480
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探索了下丘脑内侧视前区在青春期发育过程中对交配行为形成的分子机制 | 首次揭示Esr1在MPOA区GABA能神经元转录成熟过程中的关键作用，并发现其调控性别特异性基因调控网络 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及其他物种验证 | 探究青春期神经系统发育过程中激素信号调控交配行为形成的分子机制 | 青春期发育过程中的雄性和雌性小鼠 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序,原位杂交 | NA | 基因表达数据,行为数据 | 青春期发育不同阶段的雄性和雌性小鼠 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 354 | 2025-10-07 |
CD271 regulates osteogenic differentiation of ectomesenchymal stem cells via the RhoA/ROCK signaling pathway
2025-Feb-20, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114068
PMID:39826451
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研究论文 | 本研究探讨了CD271通过RhoA/ROCK信号通路调控外间充质干细胞成骨分化的机制 | 首次揭示CD271通过调控RhoA/ROCK信号通路影响外间充质干细胞的成骨分化过程 | NA | 研究CD271对外间充质干细胞成骨分化的影响及其分子机制 | 外间充质干细胞(EMSCs)和CD271缺陷小鼠 | 干细胞生物学 | 颌骨发育异常 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | CD271缺陷小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 355 | 2025-10-07 |
CITEgeist: Cellular Indexing of Transcriptomes and Epitopes for Guided Exploration of Intrinsic Spatial Trends
2025-Feb-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.15.638331
PMID:40027773
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研究论文 | 开发了一种名为CITEgeist的新型空间转录组学反卷积工具，利用来自同一组织切片的抗体捕获数据作为参考 | 首次提出使用同一组织切片上的抗体捕获数据作为参考进行空间转录组学反卷积，避免了传统scRNA-seq参考的依赖 | 需要抗体捕获数据作为参考，可能受限于抗体可用性和质量 | 开发无需scRNA-seq参考的空间转录组学反卷积方法 | ER+乳腺癌肿瘤组织样本 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学，抗体捕获技术 | 数学优化模型 | 空间转录组数据，蛋白质表达数据 | 临床试验中的治疗前后ER+乳腺癌肿瘤样本 | NA | 空间转录组学，单细胞多组学 | NA | NA |
| 356 | 2025-10-07 |
Role of cancer stem cell heterogeneity in intrahepatic cholangiocarcinoma
2025-Feb-28, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-24-1286
PMID:40104739
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析肝内胆管癌中癌症干细胞异质性及其对预后的影响 | 首次在单细胞水平系统揭示肝内胆管癌中不同癌症干细胞亚群的异质性特征及其与预后的关联 | 样本量有限，主要依赖公共数据库数据，需要更大规模临床验证 | 研究癌症干细胞异质性对肝内胆管癌预后的影响 | 肝内胆管癌患者样本和公共数据库中的单细胞RNA测序数据 | 单细胞组学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学，生物信息学分析 | AUCell, CellChat, SCENIC, CIBERSORT | 单细胞RNA测序数据，批量RNA测序数据，临床数据 | GSE142784数据集和TCGA数据库中的肝内胆管癌样本 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 357 | 2025-10-07 |
Fast, flexible analysis of differences in cellular composition with crumblr
2025-Feb-27, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5921338/v1
PMID:40060050
|
研究论文 | 开发了一种名为crumblr的可扩展统计方法，用于分析单细胞技术产生的细胞组成差异数据 | 采用精度加权线性混合模型处理计数比率数据，并能在细胞谱系层次结构的多个水平上进行统计检验，通过多元方法提高检测效力 | NA | 开发统计分析方法以识别细胞类型频率的变化 | 单细胞RNA测序数据集（涉及衰老、结核感染T细胞、前列腺癌骨转移和SARS-CoV-2感染） | 生物信息学 | 前列腺癌, 结核病, COVID-19 | 单细胞RNA测序 | 线性混合模型 | 单细胞计数数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 358 | 2025-10-07 |
Cluster replicability in single-cell and single-nucleus atlases of the mouse brain
2025-Feb-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.24.639959
PMID:40060489
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研究论文 | 评估小鼠大脑单细胞和单核RNA测序图谱中细胞簇的可重复性 | 使用全转录组邻域投票方法识别了2009对相互匹配的细胞簇对，并发现这些簇在多个物种数据集中具有一致的空间定位和协调的基因表达 | 下丘脑的高度异质性限制了细胞簇的可重复性，区分相近细胞簇比区分大多数其他簇更具挑战性 | 评估单细胞和单核RNA测序研究中细胞簇的生物学稳健性和可重复性 | 小鼠大脑细胞 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | 邻域投票算法 | 基因表达数据 | 超过400万个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 359 | 2025-10-07 |
Cell Type-Agnostic Transcriptomic Signatures Enable Uniform Comparisons of Neurodevelopment
2025-Feb-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.24.639936
PMID:40060479
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研究论文 | 通过单细胞转录组元分析开发细胞类型无关的转录组特征，实现神经发育的跨数据集统一比较 | 开发了细胞类型无关的发育年龄预测模型，在人类和小鼠大脑中均表现出良好泛化能力 | NA | 建立统一的神经发育比较框架，预测细胞发育状态 | 人类和小鼠大脑发育细胞、人类神经类器官 | 生物信息学 | 神经发育疾病 | 单细胞转录组测序 | 正则化回归模型 | 单细胞转录组数据 | 超过280万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 360 | 2025-10-07 |
Novel therapeutic strategy: Nrf2 activation in targeting senescence-related changes in chronic obstructive pulmonary disease
2025-Feb-28, Journal of thoracic disease
IF:2.1Q3
DOI:10.21037/jtd-24-710
PMID:40083491
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研究论文 | 本研究探讨通过激活Nrf2靶向衰老相关变化以缓解慢性阻塞性肺疾病进展的治疗潜力 | 首次在单细胞水平揭示Nrf2激活对衰老纤毛上皮细胞及相关分泌表型的调控作用 | 研究主要基于动物模型和体外实验，尚未进行人体临床试验 | 探索Nrf2激活作为治疗慢性阻塞性肺疾病的新策略 | 衰老支气管上皮细胞、COPD小鼠模型 | 生物医学研究 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞转录组分析、体外细胞模型、动物模型 | COPD小鼠模型 | 基因表达数据、病理学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |