单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 639 篇文献，本页显示第 341 - 360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2025-10-07 |
Matrix stiffness regulates mitochondria-lysosome contacts to modulate the mitochondrial network, alleviate the senescence of MSCs
2025-Feb, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13746
PMID:39353686
|
研究论文 | 本研究探讨基质硬度通过调控线粒体-溶酶体接触影响间充质干细胞衰老的机制 | 首次揭示基质硬度通过调控M-L接触影响线粒体网络和功能进而导致MSC衰老的分子机制 | 未明确M-L接触调控线粒体稳态的具体信号通路 | 探究基质硬度如何通过调控线粒体-溶酶体接触影响间充质干细胞衰老 | 人间充质干细胞 | 细胞生物学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序,原子力显微镜 | NA | 基因表达数据,力学性能数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 342 | 2025-10-07 |
Maternal infection with SARS-CoV-2 during early pregnancy induces hypoxia at the maternal-fetal interface
2025-Feb, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13749
PMID:39375953
|
研究论文 | 本研究探讨了孕早期SARS-CoV-2感染对母胎界面缺氧状态的影响 | 首次发现孕早期SARS-CoV-2感染会诱导母胎界面缺氧并伴随代谢异常，且这种影响随孕周增加而逐渐缓解 | 样本量有限，长期影响仍需进一步研究 | 探究SARS-CoV-2感染对母胎界面的影响机制 | 孕早期感染SARS-CoV-2孕妇的胎盘样本 | 病理学 | COVID-19 | 免疫荧光,免疫组化,单细胞RNA测序,代谢组学测序 | NA | 组织样本,基因表达数据,代谢数据 | 孕6-8周和12-16周孕妇胎盘样本 | NA | 单细胞RNA测序,代谢组学测序 | NA | NA |
| 343 | 2025-10-07 |
Extraembryonic mesoderm cells derived from human embryonic stem cells rely on Wnt pathway activation
2025-Feb, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13761
PMID:39385268
|
研究论文 | 本研究开发了一种通过激活Wnt通路从人primed胚胎干细胞分化产生胚外中胚层细胞及其后续间充质干细胞的方案 | 首次证明人primed胚胎干细胞可分化为胚外中胚层细胞并产生具有特定分化潜能的间充质干细胞 | 未明确说明样本数量和研究规模 | 探索人primed胚胎干细胞向胚外中胚层细胞分化的可能性及其后续发育潜能 | 人primed胚胎干细胞、胚外中胚层细胞、间充质干细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞转录组分析、免疫染色分析、细胞分选、三维分化培养 | NA | 转录组数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 344 | 2025-10-07 |
Evidence for a lipofibroblast-to-Cthrc1 + myofibroblast reversible switch during the development and resolution of lung fibrosis in young mice
2025-Feb, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.00482-2023
PMID:39401861
|
研究论文 | 本研究通过遗传谱系追踪和单细胞转录组学揭示了年轻小鼠肺纤维化过程中脂成纤维细胞与Cthrc1+肌成纤维细胞之间的可逆转换机制 | 首次发现活化的肌成纤维细胞包含四个具有不同促肺泡生成和促纤维化特征的亚群，并证实脂成纤维细胞特征高的细胞群在纤维化发生和消退过程中分别作为起源和归宿 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据仅通过数据挖掘获得，需要进一步实验验证 | 解析肺纤维化过程中活化肌成纤维细胞的异质性及其在纤维化消退过程中的分化轨迹 | 年轻小鼠肺组织及人类特发性肺纤维化数据集 | 单细胞生物学 | 肺纤维化 | 遗传谱系追踪, 单细胞转录组学, 数据挖掘, 类器官培养 | NA | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据 | 小鼠模型和人类IPF数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 345 | 2025-10-07 |
Myeloid Mir34a suppresses colitis-associated colon cancer: characterization of mediators by single-cell RNA sequencing
2025-Feb, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-024-01380-9
PMID:39425000
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了髓系细胞中Mir34a缺失通过调控巨噬细胞极化状态抑制结肠炎相关结肠癌的机制 | 首次在体内证明髓系特异性Mir34a通过维持巨噬细胞M1样状态发挥肿瘤抑制作用，并发现新的炎症性CAC细胞亚型 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 阐明髓系细胞中Mir34a在结肠炎相关结肠癌中的肿瘤抑制机制 | 髓系特异性Mir34a敲除小鼠的结肠炎相关结肠癌模型 | 单细胞测序 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 346 | 2025-10-07 |
Aging alters the effect of adiponectin receptor signaling on bone marrow-derived mesenchymal stem cells
2025-Feb, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14390
PMID:39462849
|
研究论文 | 本研究探讨衰老如何改变脂联素受体信号对骨髓间充质干细胞的影响 | 首次揭示衰老通过改变脂联素受体表达和下游信号通路激活差异，逆转脂联素受体激动剂对骨再生的治疗效果 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类样本中验证 | 阐明衰老对脂联素受体信号在骨稳态和骨折修复中作用的调节机制 | 年轻和老年小鼠的骨髓间充质干细胞 | 干细胞生物学 | 骨质疏松 | 单细胞测序, 体内染色 | NA | 基因表达数据, 蛋白表达数据 | 年轻和老年小鼠骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 347 | 2025-10-07 |
Sensory neuroimmune signaling in the pathogenesis of Stevens-Johnson syndrome and toxic epidermal necrolysis
2025-Feb, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.10.015
PMID:39481654
|
研究论文 | 本研究探讨了感觉神经免疫信号在史蒂文斯-约翰逊综合征和中毒性表皮坏死松解症发病机制中的作用 | 首次揭示CGRP-RAMP1轴通过HCN2离子通道增强CD8+T细胞IL-15/IL-18受体表达和细胞毒性，阐明神经元素在皮肤炎症中的调控机制 | 未明确不同触发药物对神经免疫信号通路的影响差异 | 探究SJS/TEN发病过程中的神经免疫调节机制 | 健康对照和SJS/TEN患者的循环CD8+T细胞及皮肤组织 | 免疫学 | 史蒂文斯-约翰逊综合征/中毒性表皮坏死松解症 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,ELISA,LEGENDplex,免疫荧光染色,钙成像,Smart-seq,3D皮肤模型 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,图像数据 | 健康对照和SJS/TEN患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 348 | 2025-10-07 |
From metabolomics to therapeutics: identifying causal metabolites and potential drugs for the treatment of osteoarthritis
2025-Feb, Inflammopharmacology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s10787-024-01594-w
PMID:39488818
|
研究论文 | 通过代谢组学孟德尔随机化研究识别骨关节炎的因果代谢物和潜在治疗靶点 | 首次采用大规模代谢组学孟德尔随机化方法系统识别与骨关节炎因果相关的血液代谢物 | 研究基于欧洲人群数据，结果可能不适用于其他族裔群体 | 识别骨关节炎的因果代谢物和潜在治疗靶点 | 骨关节炎患者和健康对照人群 | 生物信息学 | 骨关节炎 | 孟德尔随机化, 全基因组关联研究, 单细胞测序, 蛋白质相互作用网络分析 | NA | 基因组数据, 代谢组数据, 基因表达数据 | 总计231,625例病例和1,218,499例对照 | NA | 全基因组关联分析, 单细胞测序 | NA | NA |
| 349 | 2025-10-07 |
Immune-responsive gene-1: The mitochondrial Key to Th17 Cell Pathogenicity in CNS Autoimmunity
2025-Feb-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.24.573264
PMID:38234838
|
研究论文 | 本研究揭示了免疫应答基因1在调节中枢神经系统自身免疫疾病中致病性Th17细胞的关键作用 | 首次发现免疫应答基因1通过NLRP3/IL-1β轴调控巨噬细胞MHC II类分子表达，从而影响致病性Th17细胞极化 | 研究主要基于动物模型EAE，在人类多发性硬化症中的直接验证仍需进一步研究 | 探究免疫应答基因1在中枢神经系统自身免疫疾病中对Th17细胞致病性的调控机制 | 实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)小鼠模型、原代脑胶质细胞、骨髓嵌合体 | 免疫学 | 多发性硬化症 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 适应性转移实验 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 350 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomic sequencing analysis of mechanistic insights into the IFN-γ signaling pathway in different tumor cells
2025-Feb, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-024-03574-6
PMID:39090422
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序分析IFN-γ信号通路在不同肿瘤微环境中的机制作用 | 首次在单细胞水平系统揭示IFN-γ通路在肿瘤细胞中的双重功能及其调控网络 | 基于公共数据库的回顾性分析，缺乏实验验证 | 探究IFN-γ信号通路在不同肿瘤微环境中的作用机制及其与预后的关系 | 多种肿瘤类型的肿瘤细胞、基质细胞和免疫细胞 | 生物信息学 | 泛癌分析 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 单变量Cox回归模型 | 基因表达数据 | TCGA和GEO数据库中的多肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 351 | 2025-10-07 |
Arming AAV9 with a Single-Chain Fragment Variable Antibody Against PD-1 for Systemic Glioblastoma Therapy
2025-Feb, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-024-04406-y
PMID:39138760
|
研究论文 | 本研究开发了一种利用AAV9病毒系统递送抗PD-1单链抗体治疗胶质母细胞瘤的靶向免疫疗法 | 首次将AAV9病毒载体与抗PD-1单链抗体结合，实现系统性给药后在肿瘤微环境局部表达免疫检查点抑制剂 | 研究仅在免疫健全的小鼠模型中进行，尚未进行临床验证 | 开发针对胶质母细胞瘤的新型靶向免疫治疗策略 | 胶质母细胞瘤肿瘤微环境中的T细胞 | 癌症免疫治疗 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 免疫健全的胶质母细胞瘤小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 352 | 2025-10-07 |
Progress in toxicogenomics to protect human health
2025-Feb, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-024-00767-1
PMID:39223311
|
综述 | 本文综述了毒理基因组学在利用转录组学等分子特征评估环境与药物暴露毒性方面的研究进展 | 重点介绍了高通量剂量反应建模、单细胞转录组学和多组学等新兴方法在毒理学机制研究中的创新应用 | NA | 推动毒理基因组学在毒理学测试和风险评估中的应用以保护人类健康 | 环境与药物暴露的毒理学效应 | 生物信息学 | NA | 转录组学、单细胞转录组学、多组学分析 | 网络推断分析、模式匹配方法、人工智能 | 分子特征数据（转录本、蛋白质、代谢物、表观基因组修饰） | NA | NA | 单细胞RNA-seq、多组学分析 | NA | NA |
| 353 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing delineates T-cell clonality and pathogenesis of the parapsoriasis disease group
2025-Feb, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.09.004
PMID:39278361
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术解析了副银屑病疾病谱中T细胞克隆性及其发病机制 | 首次在副银屑病病变中发现NPY+先天淋巴样细胞群，并提出'多克隆性斑块型副银屑病'作为独立疾病实体 | 样本量有限（大斑块病变8例，小斑块病变7例），需要更大规模研究验证 | 表征副银屑病疾病谱的细胞和分子特征 | 副银屑病至早期蕈样肉芽肿谱系患者的皮肤活检组织 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 15例副银屑病病变（8例大斑块，7例小斑块），并与特应性皮炎、银屑病和健康对照皮肤比较 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 354 | 2025-10-07 |
Evidence of Alveolar Macrophage Metabolic Shift Following Stereotactic Body Radiation Therapy -Induced Lung Fibrosis in Mice
2025-Feb-01, International journal of radiation oncology, biology, physics
DOI:10.1016/j.ijrobp.2024.09.018
PMID:39278419
|
研究论文 | 本研究通过小鼠模型探究立体定向放射治疗后肺泡巨噬细胞代谢变化与放射性肺纤维化的关系 | 首次发现肺泡巨噬细胞在放射性肺损伤中经历从脂肪酸代谢向胆固醇生物合成的代谢转变 | 研究局限于小鼠模型，临床转化意义需进一步验证 | 阐明巨噬细胞在放射性肺损伤发展中的作用机制 | 野生型和CCR2 KO小鼠的肺组织 | 病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，组织学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据，流式细胞数据，组织图像 | 小鼠肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 355 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA Sequencing Analysis Reveals Cancer-associated Fibroblast Signature for Prediction of Clinical Outcomes and Immunotherapy in Gastric Cancer
2025 Feb-Mar 01, Journal of immunotherapy (Hagerstown, Md. : 1997)
DOI:10.1097/CJI.0000000000000539
PMID:39206772
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析胃癌中的癌症相关成纤维细胞，建立CAF评分系统用于预测患者预后和免疫治疗反应 | 首次基于单细胞RNA测序建立癌症相关成纤维细胞评分系统，并验证其在预测胃癌免疫治疗反应和化疗疗效方面的价值 | NA | 开发能够预测胃癌患者免疫治疗疗效和预后的生物标志物 | 胃癌患者及其肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 356 | 2025-10-07 |
Instrumental variable estimation for compositional treatments
2025-02-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-89204-9
PMID:39934389
|
研究论文 | 本文在工具变量设置下为成分数据提供因果视角，并开发考虑成分样本空间特殊结构的多元方法 | 首次在工具变量框架下系统分析成分数据的因果推断问题，提出考虑成分数据特殊结构的统计变换和回归技术 | 在合成和真实微生物组数据上的比较分析显示了所提方法的优势和局限性 | 为成分数据提供有效的因果效应估计框架和指导 | 成分数据，包括生态学中的物种丰度、单细胞测序数据中的细胞类型组成和微生物组研究中的扩增子丰度数据 | 机器学习 | NA | 统计数据变换，回归技术 | 工具变量模型 | 成分数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 357 | 2025-10-07 |
Bioinformatics analysis of coronary microvascular dysfunction in rats based on single-cell RNA sequencing
2025-02-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-85318-2
PMID:39934189
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析大鼠冠状动脉微血管功能障碍的单细胞基因表达谱 | 首次在大鼠冠状动脉微血管功能障碍模型中系统分析单细胞水平的基因表达特征，特别是内皮细胞的表型分类 | 研究仅基于大鼠模型，样本量相对有限，未进行临床验证 | 探索冠状动脉微血管功能障碍的发病机制和潜在治疗靶点 | 大鼠冠状动脉微血管功能障碍模型的心脏组织细胞 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 55,419个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 358 | 2025-10-07 |
Identification of metabolism-related subtypes and feature genes of pre-eclampsia
2025-02-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-89140-8
PMID:39930027
|
研究论文 | 本研究通过代谢相关基因识别了先兆子痫的三种亚型，并确定了五个与疾病进展密切相关的特征基因 | 首次基于代谢特征对先兆子痫进行亚型分类，并利用机器学习算法筛选出五个关键特征基因 | 研究依赖于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 探索先兆子痫的代谢相关亚型及其特征基因 | 先兆子痫患者基因表达数据 | 生物信息学 | 先兆子痫 | 单细胞RNA测序，定量逆转录PCR，加权基因共表达网络分析 | 共识聚类，机器学习算法 | 基因表达数据 | 来自Gene Expression Omnibus数据库的先兆子痫数据集 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 359 | 2025-10-07 |
Gene Regulation of Neutrophils Mediated Liver and Lung Injury through NETosis in Acute Pancreatitis
2025-Feb, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-024-02071-w
PMID:38884700
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，揭示了中性粒细胞通过NETosis在重症急性胰腺炎介导的肝肺损伤中的关键作用 | 首次系统性鉴定出FPR1、ITGAM和C5AR1作为NETs形成的关键基因，并证明抑制NETs释放可减轻SAP的全身炎症反应和肝肺损伤 | 研究主要基于小鼠模型和公共数据库数据，需要在人类患者中进行进一步验证 | 探索重症急性胰腺炎介导多器官损伤的分子机制 | 小鼠胰腺组织、肝组织、肺组织及外周血 | 生物信息学 | 急性胰腺炎 | 转录组测序, RT-PCR, 免疫组化, ELISA, 免疫荧光, 单细胞测序 | Limma, DEseq2, ssGSEA, ROC分析 | 基因表达数据, 组织切片图像, 血清蛋白数据 | 小鼠胰腺、肝、肺组织及人类外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 360 | 2025-10-07 |
Starfysh integrates spatial transcriptomic and histologic data to reveal heterogeneous tumor-immune hubs
2025-Feb, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-024-02173-8
PMID:38514799
|
研究论文 | 开发了一种整合空间转录组学和组织学数据的计算方法Starfysh，用于揭示肿瘤-免疫异质性空间枢纽 | 无需单细胞RNA测序参考数据，结合原型分析和已知细胞类型标记，能够推断跨多个组织的共享空间邻域 | NA | 开发能够整合空间转录组学和组织学数据的计算方法，以更好地表征复杂组织中的空间动态 | 雌激素受体阳性乳腺癌、三阴性乳腺癌和化生性乳腺癌组织 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学，组织学图像分析 | 深度生成模型 | 空间基因表达数据，组织学图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |