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当前共找到 641 篇文献，本页显示第 341 - 360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2025-10-07 |
Mechanistic elucidation of human pancreatic acinar development using single-cell transcriptome analysis on a human iPSC differentiation model
2025-02-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-88690-1
PMID:39920294
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析研究人iPSC分化模型中胰腺腺泡细胞的发育机制 | 首次在hiPSC分化模型中鉴定REG4作为胰腺腺泡祖细胞标志物，并发现cAMP信号通路在腺泡细胞分化中的关键作用 | 研究依赖于小鼠体内分化模型，体外分化效率仍需优化 | 阐明胰腺外分泌腺泡谱系的发育机制，建立hiPSC定向分化为胰腺腺泡细胞的方法 | 人诱导多能干细胞分化的胰腺腺泡细胞 | 单细胞组学 | 胰腺外分泌疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 342 | 2025-10-07 |
Identification of the immune infiltration and biomarkers in ulcerative colitis based on liquid-liquid phase separation-related genes
2025-02-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-89252-1
PMID:39915583
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研究论文 | 基于液-液相分离相关基因鉴定溃疡性结肠炎的免疫浸润特征和生物标志物 | 首次将液-液相分离机制与溃疡性结肠炎免疫浸润联系起来，筛选出7个核心诊断基因并发现两个具有不同免疫特征的分子亚型 | NA | 探索液-液相分离相关基因在溃疡性结肠炎免疫浸润中的作用并寻找诊断生物标志物 | 溃疡性结肠炎患者样本和细胞模型 | 生物信息学 | 溃疡性结肠炎 | 机器学习算法、微阵列、单细胞RNA测序、qRT-PCR | 机器学习算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 343 | 2025-10-07 |
Deep learning powered single-cell clustering framework with enhanced accuracy and stability
2025-02-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-87672-7
PMID:39900656
|
研究论文 | 提出了一种名为scG-cluster的深度结构聚类方法，用于提高单细胞RNA测序数据的聚类精度和稳定性 | 开发了双拓扑邻接图和双拓扑自适应图卷积网络(TAGCN)，通过整合节点分布信息和注意力机制来增强图表示，并采用残差连接防止过平滑 | NA | 解决单细胞RNA测序数据聚类中图卷积网络的过平滑问题，提高细胞类型识别的准确性和稳定性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞群体 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图卷积网络(GCN), 双拓扑自适应图卷积网络(TAGCN) | 单细胞RNA测序数据 | 六个不同的scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 344 | 2025-10-07 |
Integrating bulk and single-cell RNA sequencing data: unveiling RNA methylation and autophagy-related signatures in chronic obstructive pulmonary disease patients
2025-02-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-87437-2
PMID:39893187
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研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA测序和单细胞RNA测序数据，揭示了慢性阻塞性肺疾病中RNA甲基化和自噬相关特征 | 首次系统整合bulk RNA-seq和scRNA-seq数据研究COPD中RNA甲基化与自噬的关联，发现FTO和IGF2BP2作为关键RNA甲基化调控因子在巨噬细胞中表达下调 | 研究主要基于公共数据库数据，部分发现需要通过动物模型验证，样本来源和数量有限 | 研究RNA甲基化调控因子及其与自噬在COPD发病机制中的作用 | COPD患者和非COPD患者的肺组织样本，COPD小鼠模型 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 流式细胞术 | 逻辑回归, WGCNA, 基因集富集分析 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的COPD和非COPD患者样本，具体数量未明确说明 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 345 | 2025-10-07 |
Comprehensive analysis reveals the tumor suppressor role of macrophage signature gene FCER1G in hepatocellular carcinoma
2025-02-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-88071-8
PMID:39893200
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和基因组分析揭示巨噬细胞特征基因FCER1G在肝细胞癌中的肿瘤抑制作用 | 首次系统性地识别巨噬细胞相关特征基因并构建基于LASSO回归的预后预测模型，发现FCER1G在HCC中的肿瘤 suppressor 功能 | 样本量较小（仅7个HCC样本），未发现MSI和TMB评分的显著差异 | 探索肝细胞癌中巨噬细胞特征基因及其对患者预后的影响 | 肝细胞癌患者样本和巨噬细胞 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，基因组分析，主成分分析，t-SNE降维，LASSO回归 | LASSO回归模型 | 单细胞测序数据，基因组数据 | 7个HCC样本（来自GEO数据库），TCGA-LIHC队列验证 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 346 | 2025-10-07 |
MSC-EVs and UCB-EVs promote skin wound healing and spatial transcriptome analysis
2025-02-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-87592-6
PMID:39893214
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研究论文 | 本研究探讨间充质干细胞来源细胞外囊泡和脐带血来源细胞外囊泡通过调节关键信号通路促进皮肤伤口愈合和减少瘢痕形成的机制 | 首次结合空间转录组学技术系统分析两种来源细胞外囊泡对皮肤伤口愈合过程中细胞异质性和信号通路的调控作用 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体临床试验验证 | 探究细胞外囊泡促进皮肤伤口愈合和减少瘢痕形成的分子机制 | 人真皮成纤维细胞和小鼠皮肤伤口模型 | 空间转录组学 | 皮肤创伤 | 超速离心法、透射电镜、纳米颗粒追踪分析、Western blot、细胞划痕实验、细胞迁移实验、细胞增殖实验、空间转录组学 | NA | 空间转录组数据、组织学图像、细胞实验数据 | 小鼠皮肤组织样本（分组对照） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 347 | 2025-10-07 |
Atypical memory B cells acquire Breg phenotypes in hepatocellular carcinoma
2025-Feb-25, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.187025
PMID:39998891
|
研究论文 | 本研究整合单细胞转录组和B细胞受体测序技术，揭示了肝细胞癌中非典型记忆B细胞获得调节性B细胞表型的新机制 | 首次发现肝细胞癌中非典型记忆B细胞获得调节性B细胞表型，并证实肿瘤细胞可赋予外周血B细胞免疫抑制功能 | 未明确说明样本数量和研究人群特征 | 探究肿瘤微环境对肿瘤浸润B淋巴细胞发育和功能的影响 | 肝细胞癌患者的肿瘤浸润B细胞和外周血B细胞 | 单细胞生物学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组测序, B细胞受体测序 | 轨迹分析, 基因调控网络分析 | 单细胞RNA测序数据, BCR序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, BCR测序 | NA | NA |
| 348 | 2025-10-07 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomics Delineate the Microstructure and Immune Landscape of Intrahepatic Cholangiocarcinoma in the Leading-Edge Area
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202412740
PMID:39716897
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组技术揭示了肝内胆管癌前沿区域的微结构特征和免疫景观 | 首次系统描绘了肝内胆管癌前沿区域肿瘤细胞与免疫微环境的相互作用，发现了由MAIT细胞、SPP1+巨噬细胞、POSTN+ CAFs和内皮细胞组成的独特'三元结构' | 样本量较小（仅9例患者），需要更大规模研究验证发现 | 探究肝内胆管癌前沿区域的肿瘤细胞特征及其与免疫微环境的相互作用 | 9例肝内胆管癌患者的肿瘤核心区、癌旁组织和前沿区域组织 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 9例肝内胆管癌患者 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 349 | 2025-10-07 |
Streptococcus lutetiensis inhibits CD8+ IL17A+ TRM cells and leads to gastric cancer progression and poor prognosis
2025-Feb-09, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00810-2
PMID:39924593
|
研究论文 | 本研究通过微生物组和单细胞分析揭示路氏链球菌通过抑制CD8+ IL17A+ TRM细胞促进胃癌进展 | 首次发现路氏链球菌在胃癌组织中富集并通过激活Nrf2介导的氧化应激反应抑制CD8IL17A TRM细胞 | NA | 探究胃微生物组对胃癌进展和免疫调节的影响 | 胃癌患者组织样本和小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 胃癌 | 16s rRNA测序, 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 微生物组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 350 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing reveals the mechanisms of multiple myeloma progression: clarity or confusion?
2025-Feb, Annals of hematology
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s00277-025-06241-0
PMID:39918600
|
综述 | 本文综述单细胞测序技术在揭示多发性骨髓瘤进展机制中的新见解 | 系统总结单细胞测序技术在多发性骨髓瘤克隆进化、微环境转化和表观遗传改变研究中的突破性发现 | NA | 探讨单细胞测序技术对多发性骨髓瘤生物学机制和治疗策略研究的贡献 | 多发性骨髓瘤及其微环境 | 单细胞组学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞组学数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 351 | 2025-10-07 |
FOXO4-DRI induces keloid senescent fibroblast apoptosis by promoting nuclear exclusion of upregulated p53-serine 15 phosphorylation
2025-Feb-24, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-07738-0
PMID:39994346
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现瘢痕疙瘩中衰老成纤维细胞增加，并揭示了FOXO4-DRI通过促进p53-serine15磷酸化核外排诱导衰老成纤维细胞凋亡的机制 | 首次在瘢痕疙瘩中发现p53-serine15磷酸化上调并通过FOXO4-DRI促进其核外排诱导衰老细胞凋亡 | 研究主要基于体外模型，需要进一步体内实验验证 | 探究瘢痕疙瘩中衰老成纤维细胞的分子机制及潜在治疗策略 | 瘢痕疙瘩组织样本和成纤维细胞 | 细胞生物学 | 瘢痕疙瘩 | 单细胞RNA测序,磷酸化特异性蛋白芯片,Western blotting | NA | 基因表达数据,蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 352 | 2025-10-07 |
Gene expression patterns of the developing human face at single cell resolution reveal cell type contributions to normal facial variation and disease risk
2025-Feb-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.18.633396
PMID:39868299
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研究论文 | 通过单细胞分辨率构建人类面部发育基因表达图谱，揭示细胞类型对正常面部变异和疾病风险的贡献 | 首次构建人类颅面发育的单细胞核RNA测序图谱，涵盖胚胎期6个关键时间点，识别了颅神经嵴细胞等主要细胞类型及其亚型 | 样本数量有限（24个胚胎），仅涵盖4-8周胚胎期，未覆盖更早或更晚发育阶段 | 解析人类颅面发育的细胞和遗传机制，探索面部形态变异和颅面疾病的发育起源 | 人类胚胎颅面组织（24个胚胎，涵盖4-8孕周6个时间点） | 发育生物学 | 颅面畸形 | 单核RNA测序（snRNA-seq），空间转录组学 | NA | 基因表达数据，空间定位数据 | 24个人类胚胎 | NA | 单核RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 353 | 2025-10-07 |
Spatial profiling of the interplay between cell type- and vision-dependent transcriptomic programs in the visual cortex
2025-Feb-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2421022122
PMID:39946537
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研究论文 | 本研究通过空间转录组分析揭示了视觉经验对初级视觉皮层L2/3神经元细胞类型空间组织和转录程序的调控机制 | 首次结合空间转录组学和单核RNA-seq数据，应用多任务理论揭示L2/3细胞类型空间分区与基因表达连续性的关联，并识别出视觉剥夺诱导的两个独立转录程序 | 研究仅聚焦于L2/3细胞类型，分析基于500个基因的空间转录组数据，可能未涵盖所有相关基因 | 探究视觉经验在关键期内如何影响哺乳动物新皮层神经元细胞类型的空间组织和转录调控 | 初级视觉皮层(V1)的L2/3神经元细胞类型 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组分析, 单核RNA-seq | 多任务理论, 2D流形模型 | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 正常饲养和暗饲养条件下的L2/3细胞 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 354 | 2025-10-07 |
Comprehensive analysis and experimental validation of disulfidptosis-associated prognostic signature and immune microenvironment characterization of gastric cancer
2025-Feb-25, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03883-3
PMID:39998563
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研究论文 | 本研究通过综合分析二硫化物死亡相关基因构建胃癌预后模型并验证其临床意义 | 首次基于二硫化物死亡相关基因建立胃癌预后特征模型，并通过单细胞测序和体外实验验证APC11基因的功能 | 研究样本量有限，需要更大规模临床队列验证模型的普适性 | 探索二硫化物死亡在胃癌发生发展中的作用并建立预后预测模型 | 胃癌组织和细胞系 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞测序, siRNA, qRT-PCR, Western blot, CCK-8, Transwell实验 | LASSO-Cox回归模型 | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 355 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomics reveals prognostically LYZ+ fibroblasts and colocalization with FN1+ macrophages in diffuse large B-cell lymphoma
2025-Feb-25, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-03968-7
PMID:39998673
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学等技术识别了弥漫性大B细胞淋巴瘤中具有预后意义的LYZ+成纤维细胞和FN1+巨噬细胞亚型 | 首次在DLBCL中发现LYZ+成纤维细胞与FN1+巨噬细胞的空间共定位及其预后价值 | 样本量相对有限（空间转录组学仅11例），需要在更大队列中验证 | 探索DLBCL肿瘤微环境中成纤维细胞和巨噬细胞亚型的预后意义 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤患者和非小细胞肺癌患者 | 数字病理学 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤 | 空间转录组学, bulk转录组学, 免疫组织化学, 多重免疫荧光, 自身抗体检测 | 单变量Cox回归, 随机森林分析 | 空间转录组数据, 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 临床数据 | 空间转录组学11例, bulk转录组学2499例, IHC 37例, mIF 56例, 血浆样本240例 | NA | 空间转录组学, bulk RNA-seq, 免疫组织化学, 多重免疫荧光 | NA | NA |
| 356 | 2025-10-07 |
CD4+ T cell-innate immune crosstalk is critical during Staphylococcus aureus craniotomy infection
2025-Feb-24, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.183327
PMID:39989461
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示了CD4+ T细胞在金黄色葡萄球菌开颅手术感染中的关键作用及其与先天免疫细胞的相互作用机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术系统揭示开颅手术感染中CD4+ T细胞的转录异质性及其与单核/巨噬细胞的广泛相互作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探究CD4+ T细胞在金黄色葡萄球菌开颅手术感染中的免疫功能和作用机制 | 小鼠模型和人类开颅手术感染样本 | 免疫学 | 细菌感染 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq), 细胞过继转移, 抗体中和实验 | 动物模型 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 357 | 2025-10-07 |
Effect of aging on pulmonary cellular responses during mechanical ventilation
2025-Feb-13, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.185834
PMID:39946196
|
研究论文 | 本研究探讨衰老对机械通气期间肺细胞反应的影响 | 首次通过单细胞RNA测序揭示衰老小鼠在机械通气下肺泡巨噬细胞炎症反应减弱和内皮细胞细胞连接形成改变的分子机制 | 研究仅使用雄性小鼠模型，未考虑性别差异；体外实验未能完全模拟体内复杂微环境 | 探究衰老如何影响机械通气过程中的肺细胞反应和损伤易感性 | 年轻和老年雄性小鼠的肺组织细胞 | 单细胞生物学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序，体外功能分析 | NA | 基因表达数据，功能实验数据 | 年轻和老年雄性小鼠群体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 358 | 2025-10-07 |
Inhibition of histone methyltransferase EZH2 for immune interception of colorectal cancer in Lynch syndrome
2025-Feb-13, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.177545
PMID:39946195
|
研究论文 | 本研究通过EZH2抑制剂GSK503干预林奇综合征小鼠模型和结肠类器官，探索表观遗传调控在结直肠癌免疫预防中的作用机制 | 首次揭示EZH2抑制剂通过表观遗传重编程增强免疫反应，为林奇综合征携带者提供癌症预防新策略 | 研究基于小鼠模型和类器官，临床转化效果需进一步验证 | 开发针对林奇综合征的免疫干预策略以预防结直肠癌发生 | 林奇综合征小鼠模型和体外培养的结肠类器官 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, ChIP测序, 表观遗传分析 | 动物模型, 类器官模型 | 基因表达数据, 表观遗传数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, ChIP-seq | NA | NA |
| 359 | 2025-10-07 |
Characterization and bioinformatic filtering of ambient gRNAs in single-cell CRISPR screens using CLEANSER
2025-Feb-12, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100766
PMID:39914388
|
研究论文 | 开发了一种名为CLEANSER的混合模型，用于过滤单细胞CRISPR筛选中的环境gRNA噪声 | 利用CRISPR混合实验表征环境gRNA，开发了包含gRNA和细胞特异性归一化参数的混合模型 | NA | 提高单细胞CRISPR筛选实验中gRNA-细胞分配准确性 | 单细胞CRISPR筛选中的环境gRNA污染 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序CRISPR筛选 | 混合模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 360 | 2025-10-07 |
Regulation of lung progenitor plasticity and repair by fatty acid oxidation
2025-Feb-10, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.165837
PMID:39927460
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研究论文 | 本研究揭示了脂肪酸氧化代谢通路在调控肺祖细胞修复和肺纤维化发展中的关键作用 | 首次发现脂肪酸氧化基因在IPF肺脏肺泡上皮细胞中表达显著降低，并证明CPT1a缺失导致肺祖细胞获得异常中间状态 | 研究主要基于小鼠模型，在人类疾病中的直接适用性需要进一步验证 | 探究代谢通路在肺泡再生和肺纤维化发展中的作用机制 | 肺祖细胞、肺泡上皮细胞、小鼠模型 | 细胞生物学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序、组织染色、基因抑制、药物抑制 | NA | 基因表达数据、组织图像数据 | IPF患者肺组织、基因工程小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |