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当前共找到 644 篇文献，本页显示第 321 - 340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2025-10-07 |
Instrumental variable estimation for compositional treatments
2025-02-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-89204-9
PMID:39934389
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研究论文 | 本文在工具变量设置下为成分数据提供因果视角，并开发考虑成分样本空间特殊结构的多元方法 | 首次在工具变量框架下系统分析成分数据的因果推断问题，提出考虑成分数据特殊结构的统计变换和回归技术 | 在合成和真实微生物组数据上的比较分析显示了所提方法的优势和局限性 | 为成分数据提供有效的因果效应估计框架和指导 | 成分数据，包括生态学中的物种丰度、单细胞测序数据中的细胞类型组成和微生物组研究中的扩增子丰度数据 | 机器学习 | NA | 统计数据变换，回归技术 | 工具变量模型 | 成分数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 322 | 2025-10-07 |
Bioinformatics analysis of coronary microvascular dysfunction in rats based on single-cell RNA sequencing
2025-02-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-85318-2
PMID:39934189
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析大鼠冠状动脉微血管功能障碍的单细胞基因表达谱 | 首次在大鼠冠状动脉微血管功能障碍模型中系统分析单细胞水平的基因表达特征，特别是内皮细胞的表型分类 | 研究仅基于大鼠模型，样本量相对有限，未进行临床验证 | 探索冠状动脉微血管功能障碍的发病机制和潜在治疗靶点 | 大鼠冠状动脉微血管功能障碍模型的心脏组织细胞 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 55,419个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 323 | 2025-10-07 |
Identification of metabolism-related subtypes and feature genes of pre-eclampsia
2025-02-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-89140-8
PMID:39930027
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研究论文 | 本研究通过代谢相关基因识别了先兆子痫的三种亚型，并确定了五个与疾病进展密切相关的特征基因 | 首次基于代谢特征对先兆子痫进行亚型分类，并利用机器学习算法筛选出五个关键特征基因 | 研究依赖于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 探索先兆子痫的代谢相关亚型及其特征基因 | 先兆子痫患者基因表达数据 | 生物信息学 | 先兆子痫 | 单细胞RNA测序，定量逆转录PCR，加权基因共表达网络分析 | 共识聚类，机器学习算法 | 基因表达数据 | 来自Gene Expression Omnibus数据库的先兆子痫数据集 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 324 | 2025-10-07 |
SCEMENT: scalable and memory efficient integration of large-scale single-cell RNA-sequencing data
2025-Feb-04, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf057
PMID:39985442
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研究论文 | 提出一种可扩展且内存高效的单细胞RNA测序数据整合方法SCEMENT | 将ComBat中的线性回归模型扩展至无监督稀疏矩阵设置，实现大规模单细胞数据的高效整合 | 仅支持Linux平台，未提及对其他操作系统的兼容性 | 开发能够处理大规模单细胞RNA测序数据的高效整合算法 | 单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 线性回归模型 | 基因表达数据 | 数百万个细胞，数十至数百个真实单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 325 | 2025-10-07 |
Gene Regulation of Neutrophils Mediated Liver and Lung Injury through NETosis in Acute Pancreatitis
2025-Feb, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-024-02071-w
PMID:38884700
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，揭示了中性粒细胞通过NETosis在重症急性胰腺炎介导的肝肺损伤中的关键作用 | 首次系统性鉴定出FPR1、ITGAM和C5AR1作为NETs形成的关键基因，并证明抑制NETs释放可减轻SAP的全身炎症反应和肝肺损伤 | 研究主要基于小鼠模型和公共数据库数据，需要在人类患者中进行进一步验证 | 探索重症急性胰腺炎介导多器官损伤的分子机制 | 小鼠胰腺组织、肝组织、肺组织及外周血 | 生物信息学 | 急性胰腺炎 | 转录组测序, RT-PCR, 免疫组化, ELISA, 免疫荧光, 单细胞测序 | Limma, DEseq2, ssGSEA, ROC分析 | 基因表达数据, 组织切片图像, 血清蛋白数据 | 小鼠胰腺、肝、肺组织及人类外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 326 | 2025-10-07 |
Starfysh integrates spatial transcriptomic and histologic data to reveal heterogeneous tumor-immune hubs
2025-Feb, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-024-02173-8
PMID:38514799
|
研究论文 | 开发了一种整合空间转录组学和组织学数据的计算方法Starfysh，用于揭示肿瘤-免疫异质性空间枢纽 | 无需单细胞RNA测序参考数据，结合原型分析和已知细胞类型标记，能够推断跨多个组织的共享空间邻域 | NA | 开发能够整合空间转录组学和组织学数据的计算方法，以更好地表征复杂组织中的空间动态 | 雌激素受体阳性乳腺癌、三阴性乳腺癌和化生性乳腺癌组织 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学，组织学图像分析 | 深度生成模型 | 空间基因表达数据，组织学图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 327 | 2025-10-07 |
Meteorin-like protein/METRNL/Interleukin-41 ameliorates atopic dermatitis-like inflammation
2025-Feb, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.16150
PMID:38727640
|
研究论文 | 本研究探讨了METRNL/IL-41蛋白在特应性皮炎样炎症中的保护作用及其分子机制 | 首次揭示METRNL通过结合KIT受体激活β-Catenin信号通路，抑制免疫细胞扩增来缓解特应性皮炎炎症 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 阐明METRNL在特应性皮炎中的功能作用和调控机制 | 特应性皮炎患者样本和MC903诱导的AD样小鼠模型 | 免疫学 | 特应性皮炎 | 多重免疫染色, 单细胞RNA-seq, RNA-seq | NA | 血清样本, 皮肤组织样本, 测序数据 | 特应性皮炎患者和健康对照的皮肤及血清样本，MC903诱导的AD小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, RNA-seq | NA | NA |
| 328 | 2025-10-07 |
The analysis of transcriptomic signature of TNBC-searching for the potential RNA-based predictive biomarkers to determine the chemotherapy sensitivity
2025-Feb, Journal of applied genetics
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s13353-024-00876-x
PMID:38722458
|
研究论文 | 本研究通过RNA测序分析三阴性乳腺癌患者对化疗敏感性的转录组特征，识别出24个与化疗反应和生存预后相关的基因 | 首次结合FFPE样本RNA测序、乳腺癌细胞系药物敏感性数据和单细胞RNA测序分析，系统识别三阴性乳腺癌化疗敏感性相关基因标志物 | 样本量相对较小（46例），需要进一步验证研究 | 识别三阴性乳腺癌患者新辅助化疗疗效相关的基因表达标志物 | 三阴性乳腺癌患者肿瘤样本和乳腺癌细胞系 | 转录组学 | 乳腺癌 | RNA测序，单细胞RNA测序 | PLSR分析 | 转录组数据，单细胞表达数据 | 46例TNBC患者FFPE样本（26例pCR，20例pPR），63个乳腺癌细胞系，3个已发表单细胞RNA-seq数据集 | NA | RNA-seq，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 329 | 2025-10-07 |
The potential molecular markers of inflammatory response in KOA with AD based on single-cell transcriptome sequencing analysis and identification of ligands by virtual screening
2025-Feb, Molecular diversity
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11030-024-10854-4
PMID:38622351
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序分析探索膝骨关节炎合并阿尔茨海默病的潜在分子标志物和药物靶点 | 首次结合单细胞转录组测序和虚拟筛选技术研究KOA与AD的分子关联机制，并识别出TXNIP、MMP3和MMP13作为新型生物标志物 | 研究机制尚未完全阐明，需要进一步实验验证 | 探索膝骨关节炎影响阿尔茨海默病发展的分子机制，筛选潜在生物标志物和治疗药物 | 膝骨关节炎合并阿尔茨海默病的分子通路和生物标志物 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病, 骨关节炎 | 单细胞转录组测序, 虚拟筛选, 分子动力学模拟 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 330 | 2025-10-07 |
Unraveling the metastatic niche in breast cancer bone metastasis through single-cell RNA sequencing
2025-Feb, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-024-03594-2
PMID:39066875
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示乳腺癌骨转移中的转移微环境特征 | 首次在乳腺癌骨转移中鉴定出具有不良预见的特殊亚型（State 1）细胞，并系统揭示了FN1、SPP1、MDK等关键分子在转移微环境中的复杂相互作用网络 | NA | 研究乳腺癌骨转移的转移微环境特征及其分子机制 | 乳腺癌原发肿瘤、淋巴结转移灶和骨转移灶 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, TCGA数据分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 331 | 2025-10-07 |
Ferroptosis-Related Gene Signatures in Epilepsy: Diagnostic and Immune Insights
2025-Feb, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-024-04385-0
PMID:39052183
|
研究论文 | 本研究通过分析铁死亡相关基因在癫痫中的作用，建立了诊断模型并探讨了其与免疫反应的关联 | 首次系统性地识别了7个关键铁死亡相关基因在癫痫中的核心作用，并构建了高效的诊断模型 | 研究样本量相对有限，需要更大规模的验证研究 | 探索铁死亡相关基因在癫痫发病机制中的作用及其诊断价值 | 癫痫患者和小鼠模型的组织样本 | 生物信息学 | 癫痫 | qRT-PCR, 单细胞RNA测序, CIBERSORT, MCP-counter, WGCNA | 诊断模型 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 91名癫痫患者和小鼠癫痫脑组织 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 332 | 2025-10-07 |
Distinct immunometabolic signatures in circulating immune cells define disease outcome in acute-on-chronic liver failure
2025-Feb-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000907
PMID:38761406
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了急性慢性肝衰竭患者循环免疫细胞中不同的免疫代谢特征与疾病预后的关联 | 首次在单细胞水平上识别出ACLF恢复与非恢复患者经典单核细胞的两种不同免疫代谢状态，并发现淋巴细胞群中普遍存在的应激耐受状态 | 样本量相对有限，需要更大规模研究验证发现 | 探究急性慢性肝衰竭患者免疫细胞免疫代谢特征与疾病预后的关系 | 急性慢性肝衰竭患者、急性失代偿肝硬化患者和健康个体的循环免疫细胞 | 单细胞生物学 | 肝衰竭 | 单细胞转录组测序，代谢组学，功能验证实验 | NA | 单细胞RNA测序数据，代谢组数据 | ACLF患者、AD肝硬化患者和健康个体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 333 | 2025-10-07 |
High rates of placental inflammation among samples collected by the Multi-Omics for Mothers and Infants consortium
2025-Feb, American journal of obstetrics and gynecology
IF:8.7Q1
DOI:10.1016/j.ajog.2024.04.034
PMID:38697337
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研究论文 | 通过多组学母婴联盟收集的胎盘样本分析显示发展中国家胎盘炎症与早产存在关联 | 首次在发展中国家多中心研究中证实胎盘炎症与早产的关联，并发现地理和人群差异 | 样本量有限（166例早产和175例足月产），仅部分样本进行转录组分析（35例早产和21例足月产） | 分析早产和正常足月产胎盘样本的形态学和基因表达特征 | 胎盘样本（基底板、胎盘或绒毛膜绒毛、绒毛膜板） | 数字病理学 | 产科并发症 | 苏木精-伊红染色，形态学分析，批量转录组学，单细胞RNA测序数据分析 | NA | 组织切片图像，基因表达数据 | 341例单胎分娩（166例早产，175例足月产），其中56例进行RNA分析（35例早产，21例足月产） | NA | 批量转录组学 | NA | NA |
| 334 | 2025-10-07 |
Modulation of the Immunological Milieu in Acute Aneurysmal Subarachnoid Hemorrhage: The Potential Role of Monocytes Through CXCL10 Secretion
2025-Feb, Translational stroke research
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s12975-024-01259-4
PMID:38780865
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研究论文 | 本研究探讨动脉瘤性蛛网膜下腔出血中免疫细胞的作用，重点关注单核细胞通过CXCL10分泌调节免疫微环境 | 首次在aSAH患者脑脊液中鉴定出CD8+CD161+细胞群体，并发现单核细胞亚群高表达CXCL10 | 样本量有限，HMOX1表达差异仅显示趋势而未达显著水平 | 研究动脉瘤性蛛网膜下腔出血免疫反应的细胞和分子机制 | 动脉瘤性蛛网膜下腔出血患者和非动脉瘤性蛛网膜下腔出血患者的脑脊液样本 | 单细胞组学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR | NA | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据 | aSAH和naSAH患者脑脊液样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 335 | 2025-10-07 |
Mechanistic elucidation of human pancreatic acinar development using single-cell transcriptome analysis on a human iPSC differentiation model
2025-02-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-88690-1
PMID:39920294
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析研究人iPSC分化模型中胰腺腺泡细胞的发育机制 | 首次在hiPSC分化模型中鉴定REG4作为胰腺腺泡祖细胞标志物，并发现cAMP信号通路在腺泡细胞分化中的关键作用 | 研究依赖于小鼠体内分化模型，体外分化效率仍需优化 | 阐明胰腺外分泌腺泡谱系的发育机制，建立hiPSC定向分化为胰腺腺泡细胞的方法 | 人诱导多能干细胞分化的胰腺腺泡细胞 | 单细胞组学 | 胰腺外分泌疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 336 | 2025-10-07 |
Identification of the immune infiltration and biomarkers in ulcerative colitis based on liquid-liquid phase separation-related genes
2025-02-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-89252-1
PMID:39915583
|
研究论文 | 基于液-液相分离相关基因鉴定溃疡性结肠炎的免疫浸润特征和生物标志物 | 首次将液-液相分离机制与溃疡性结肠炎免疫浸润联系起来，筛选出7个核心诊断基因并发现两个具有不同免疫特征的分子亚型 | NA | 探索液-液相分离相关基因在溃疡性结肠炎免疫浸润中的作用并寻找诊断生物标志物 | 溃疡性结肠炎患者样本和细胞模型 | 生物信息学 | 溃疡性结肠炎 | 机器学习算法、微阵列、单细胞RNA测序、qRT-PCR | 机器学习算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 337 | 2025-10-07 |
TNBC response to paclitaxel phenocopies interferon response which reveals cell cycle-associated resistance mechanisms
2025-02-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-82218-9
PMID:39905117
|
研究论文 | 本研究通过实验与计算相结合的方法揭示了三阴性乳腺癌对紫杉醇的反应机制及耐药性 | 发现紫杉醇反应模拟干扰素反应，并鉴定ELF3上调作为紫杉醇耐药的新生物标志物 | 研究主要基于细胞系实验，需要进一步临床验证 | 探索紫杉醇对三阴性乳腺癌细胞的分子响应机制及耐药性 | 三阴性乳腺癌细胞系 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, siRNA敲低, 活细胞成像 | 转录因子富集分析 | 基因表达数据, 成像数据 | 细胞系研究，具体样本量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 338 | 2025-10-07 |
Deep learning powered single-cell clustering framework with enhanced accuracy and stability
2025-02-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-87672-7
PMID:39900656
|
研究论文 | 提出了一种名为scG-cluster的深度结构聚类方法，用于提高单细胞RNA测序数据的聚类精度和稳定性 | 开发了双拓扑邻接图和双拓扑自适应图卷积网络(TAGCN)，通过整合节点分布信息和注意力机制来增强图表示，并采用残差连接防止过平滑 | NA | 解决单细胞RNA测序数据聚类中图卷积网络的过平滑问题，提高细胞类型识别的准确性和稳定性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞群体 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图卷积网络(GCN), 双拓扑自适应图卷积网络(TAGCN) | 单细胞RNA测序数据 | 六个不同的scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 339 | 2025-10-07 |
Integrating bulk and single-cell RNA sequencing data: unveiling RNA methylation and autophagy-related signatures in chronic obstructive pulmonary disease patients
2025-02-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-87437-2
PMID:39893187
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA测序和单细胞RNA测序数据，揭示了慢性阻塞性肺疾病中RNA甲基化和自噬相关特征 | 首次系统整合bulk RNA-seq和scRNA-seq数据研究COPD中RNA甲基化与自噬的关联，发现FTO和IGF2BP2作为关键RNA甲基化调控因子在巨噬细胞中表达下调 | 研究主要基于公共数据库数据，部分发现需要通过动物模型验证，样本来源和数量有限 | 研究RNA甲基化调控因子及其与自噬在COPD发病机制中的作用 | COPD患者和非COPD患者的肺组织样本，COPD小鼠模型 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 流式细胞术 | 逻辑回归, WGCNA, 基因集富集分析 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的COPD和非COPD患者样本，具体数量未明确说明 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 340 | 2025-10-07 |
Comprehensive analysis reveals the tumor suppressor role of macrophage signature gene FCER1G in hepatocellular carcinoma
2025-02-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-88071-8
PMID:39893200
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和基因组分析揭示巨噬细胞特征基因FCER1G在肝细胞癌中的肿瘤抑制作用 | 首次系统性地识别巨噬细胞相关特征基因并构建基于LASSO回归的预后预测模型，发现FCER1G在HCC中的肿瘤 suppressor 功能 | 样本量较小（仅7个HCC样本），未发现MSI和TMB评分的显著差异 | 探索肝细胞癌中巨噬细胞特征基因及其对患者预后的影响 | 肝细胞癌患者样本和巨噬细胞 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，基因组分析，主成分分析，t-SNE降维，LASSO回归 | LASSO回归模型 | 单细胞测序数据，基因组数据 | 7个HCC样本（来自GEO数据库），TCGA-LIHC队列验证 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |