单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 646 篇文献，本页显示第 321 - 340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2025-10-07 |
Ferroptosis-Related Gene Signatures in Epilepsy: Diagnostic and Immune Insights
2025-Feb, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-024-04385-0
PMID:39052183
|
研究论文 | 本研究通过分析铁死亡相关基因在癫痫中的作用，建立了诊断模型并探讨了其与免疫反应的关联 | 首次系统性地识别了7个关键铁死亡相关基因在癫痫中的核心作用，并构建了高效的诊断模型 | 研究样本量相对有限，需要更大规模的验证研究 | 探索铁死亡相关基因在癫痫发病机制中的作用及其诊断价值 | 癫痫患者和小鼠模型的组织样本 | 生物信息学 | 癫痫 | qRT-PCR, 单细胞RNA测序, CIBERSORT, MCP-counter, WGCNA | 诊断模型 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 91名癫痫患者和小鼠癫痫脑组织 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 322 | 2025-10-07 |
Distinct immunometabolic signatures in circulating immune cells define disease outcome in acute-on-chronic liver failure
2025-Feb-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000907
PMID:38761406
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了急性慢性肝衰竭患者循环免疫细胞中不同的免疫代谢特征与疾病预后的关联 | 首次在单细胞水平上识别出ACLF恢复与非恢复患者经典单核细胞的两种不同免疫代谢状态，并发现淋巴细胞群中普遍存在的应激耐受状态 | 样本量相对有限，需要更大规模研究验证发现 | 探究急性慢性肝衰竭患者免疫细胞免疫代谢特征与疾病预后的关系 | 急性慢性肝衰竭患者、急性失代偿肝硬化患者和健康个体的循环免疫细胞 | 单细胞生物学 | 肝衰竭 | 单细胞转录组测序，代谢组学，功能验证实验 | NA | 单细胞RNA测序数据，代谢组数据 | ACLF患者、AD肝硬化患者和健康个体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 323 | 2025-10-07 |
High rates of placental inflammation among samples collected by the Multi-Omics for Mothers and Infants consortium
2025-Feb, American journal of obstetrics and gynecology
IF:8.7Q1
DOI:10.1016/j.ajog.2024.04.034
PMID:38697337
|
研究论文 | 通过多组学母婴联盟收集的胎盘样本分析显示发展中国家胎盘炎症与早产存在关联 | 首次在发展中国家多中心研究中证实胎盘炎症与早产的关联，并发现地理和人群差异 | 样本量有限（166例早产和175例足月产），仅部分样本进行转录组分析（35例早产和21例足月产） | 分析早产和正常足月产胎盘样本的形态学和基因表达特征 | 胎盘样本（基底板、胎盘或绒毛膜绒毛、绒毛膜板） | 数字病理学 | 产科并发症 | 苏木精-伊红染色，形态学分析，批量转录组学，单细胞RNA测序数据分析 | NA | 组织切片图像，基因表达数据 | 341例单胎分娩（166例早产，175例足月产），其中56例进行RNA分析（35例早产，21例足月产） | NA | 批量转录组学 | NA | NA |
| 324 | 2025-10-07 |
Modulation of the Immunological Milieu in Acute Aneurysmal Subarachnoid Hemorrhage: The Potential Role of Monocytes Through CXCL10 Secretion
2025-Feb, Translational stroke research
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s12975-024-01259-4
PMID:38780865
|
研究论文 | 本研究探讨动脉瘤性蛛网膜下腔出血中免疫细胞的作用，重点关注单核细胞通过CXCL10分泌调节免疫微环境 | 首次在aSAH患者脑脊液中鉴定出CD8+CD161+细胞群体，并发现单核细胞亚群高表达CXCL10 | 样本量有限，HMOX1表达差异仅显示趋势而未达显著水平 | 研究动脉瘤性蛛网膜下腔出血免疫反应的细胞和分子机制 | 动脉瘤性蛛网膜下腔出血患者和非动脉瘤性蛛网膜下腔出血患者的脑脊液样本 | 单细胞组学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR | NA | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据 | aSAH和naSAH患者脑脊液样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 325 | 2025-10-07 |
Mechanistic elucidation of human pancreatic acinar development using single-cell transcriptome analysis on a human iPSC differentiation model
2025-02-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-88690-1
PMID:39920294
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析研究人iPSC分化模型中胰腺腺泡细胞的发育机制 | 首次在hiPSC分化模型中鉴定REG4作为胰腺腺泡祖细胞标志物，并发现cAMP信号通路在腺泡细胞分化中的关键作用 | 研究依赖于小鼠体内分化模型，体外分化效率仍需优化 | 阐明胰腺外分泌腺泡谱系的发育机制，建立hiPSC定向分化为胰腺腺泡细胞的方法 | 人诱导多能干细胞分化的胰腺腺泡细胞 | 单细胞组学 | 胰腺外分泌疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 326 | 2025-10-07 |
Identification of the immune infiltration and biomarkers in ulcerative colitis based on liquid-liquid phase separation-related genes
2025-02-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-89252-1
PMID:39915583
|
研究论文 | 基于液-液相分离相关基因鉴定溃疡性结肠炎的免疫浸润特征和生物标志物 | 首次将液-液相分离机制与溃疡性结肠炎免疫浸润联系起来，筛选出7个核心诊断基因并发现两个具有不同免疫特征的分子亚型 | NA | 探索液-液相分离相关基因在溃疡性结肠炎免疫浸润中的作用并寻找诊断生物标志物 | 溃疡性结肠炎患者样本和细胞模型 | 生物信息学 | 溃疡性结肠炎 | 机器学习算法、微阵列、单细胞RNA测序、qRT-PCR | 机器学习算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 327 | 2025-10-07 |
TNBC response to paclitaxel phenocopies interferon response which reveals cell cycle-associated resistance mechanisms
2025-02-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-82218-9
PMID:39905117
|
研究论文 | 本研究通过实验与计算相结合的方法揭示了三阴性乳腺癌对紫杉醇的反应机制及耐药性 | 发现紫杉醇反应模拟干扰素反应，并鉴定ELF3上调作为紫杉醇耐药的新生物标志物 | 研究主要基于细胞系实验，需要进一步临床验证 | 探索紫杉醇对三阴性乳腺癌细胞的分子响应机制及耐药性 | 三阴性乳腺癌细胞系 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, siRNA敲低, 活细胞成像 | 转录因子富集分析 | 基因表达数据, 成像数据 | 细胞系研究，具体样本量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 328 | 2025-10-07 |
Deep learning powered single-cell clustering framework with enhanced accuracy and stability
2025-02-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-87672-7
PMID:39900656
|
研究论文 | 提出了一种名为scG-cluster的深度结构聚类方法，用于提高单细胞RNA测序数据的聚类精度和稳定性 | 开发了双拓扑邻接图和双拓扑自适应图卷积网络(TAGCN)，通过整合节点分布信息和注意力机制来增强图表示，并采用残差连接防止过平滑 | NA | 解决单细胞RNA测序数据聚类中图卷积网络的过平滑问题，提高细胞类型识别的准确性和稳定性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞群体 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图卷积网络(GCN), 双拓扑自适应图卷积网络(TAGCN) | 单细胞RNA测序数据 | 六个不同的scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 329 | 2025-10-07 |
Single-cell landscape of dynamic changes in CD8+ T cells, CD4+ T cells and exhausted T cells in hepatocellular carcinoma
2025-02-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-88377-7
PMID:39900964
|
研究论文 | 通过单细胞测序分析肝细胞癌中CD8+ T细胞、CD4+ T细胞和耗竭T细胞的动态变化景观 | 首次使用hdWGCNA算法识别与T细胞亚群相关的基因模块，并揭示耗竭T细胞中信号通路活性的改变 | 仅包含12例肝细胞癌样本，样本量相对较小 | 研究T细胞相关基因在肝细胞癌预后中的价值 | 肝细胞癌患者组织样本 | 单细胞分析 | 肝细胞癌 | 单细胞测序, 免疫组化, 实时PCR | hdWGCNA, AUCell算法 | 单细胞测序数据, 转录组数据 | 12例肝细胞癌单细胞测序样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 330 | 2025-10-07 |
Exploring biomarkers and molecular mechanisms of Type 2 diabetes mellitus promotes colorectal cancer progression based on transcriptomics
2025-02-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-88520-4
PMID:39901036
|
研究论文 | 本研究通过转录组学分析探索2型糖尿病促进结直肠癌进展的分子机制和生物标志物 | 首次发现O-连接糖基化相关过程在T2DM促进CRC进展中的关键作用，并鉴定COX11作为潜在的免疫相关分子标志物 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步的实验验证 | 探索2型糖尿病促进结直肠癌进展的分子机制和潜在生物标志物 | 结直肠癌患者的肿瘤组织，包括伴有和不伴有2型糖尿病的患者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 转录组学分析，基因本体分析，基因集富集分析，单细胞转录组分析 | 逻辑回归模型，LASSO正则化 | 基因表达数据，单细胞转录组数据 | 结直肠癌患者肿瘤组织样本（具体数量未明确说明） | NA | 转录组测序，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 331 | 2025-10-07 |
Integrating bulk and single-cell RNA sequencing data: unveiling RNA methylation and autophagy-related signatures in chronic obstructive pulmonary disease patients
2025-02-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-87437-2
PMID:39893187
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA测序和单细胞RNA测序数据，揭示了慢性阻塞性肺疾病中RNA甲基化和自噬相关特征 | 首次系统整合bulk RNA-seq和scRNA-seq数据研究COPD中RNA甲基化与自噬的关联，发现FTO和IGF2BP2作为关键RNA甲基化调控因子在巨噬细胞中表达下调 | 研究主要基于公共数据库数据，部分发现需要通过动物模型验证，样本来源和数量有限 | 研究RNA甲基化调控因子及其与自噬在COPD发病机制中的作用 | COPD患者和非COPD患者的肺组织样本，COPD小鼠模型 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 流式细胞术 | 逻辑回归, WGCNA, 基因集富集分析 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的COPD和非COPD患者样本，具体数量未明确说明 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 332 | 2025-10-07 |
Comprehensive analysis reveals the tumor suppressor role of macrophage signature gene FCER1G in hepatocellular carcinoma
2025-02-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-88071-8
PMID:39893200
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和基因组分析揭示巨噬细胞特征基因FCER1G在肝细胞癌中的肿瘤抑制作用 | 首次系统性地识别巨噬细胞相关特征基因并构建基于LASSO回归的预后预测模型，发现FCER1G在HCC中的肿瘤 suppressor 功能 | 样本量较小（仅7个HCC样本），未发现MSI和TMB评分的显著差异 | 探索肝细胞癌中巨噬细胞特征基因及其对患者预后的影响 | 肝细胞癌患者样本和巨噬细胞 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，基因组分析，主成分分析，t-SNE降维，LASSO回归 | LASSO回归模型 | 单细胞测序数据，基因组数据 | 7个HCC样本（来自GEO数据库），TCGA-LIHC队列验证 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 333 | 2025-10-07 |
MSC-EVs and UCB-EVs promote skin wound healing and spatial transcriptome analysis
2025-02-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-87592-6
PMID:39893214
|
研究论文 | 本研究探讨间充质干细胞来源细胞外囊泡和脐带血来源细胞外囊泡通过调节关键信号通路促进皮肤伤口愈合和减少瘢痕形成的机制 | 首次结合空间转录组学技术系统分析两种来源细胞外囊泡对皮肤伤口愈合过程中细胞异质性和信号通路的调控作用 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体临床试验验证 | 探究细胞外囊泡促进皮肤伤口愈合和减少瘢痕形成的分子机制 | 人真皮成纤维细胞和小鼠皮肤伤口模型 | 空间转录组学 | 皮肤创伤 | 超速离心法、透射电镜、纳米颗粒追踪分析、Western blot、细胞划痕实验、细胞迁移实验、细胞增殖实验、空间转录组学 | NA | 空间转录组数据、组织学图像、细胞实验数据 | 小鼠皮肤组织样本（分组对照） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 334 | 2025-10-07 |
Atypical memory B cells acquire Breg phenotypes in hepatocellular carcinoma
2025-Feb-25, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.187025
PMID:39998891
|
研究论文 | 本研究整合单细胞转录组和B细胞受体测序技术，揭示了肝细胞癌中非典型记忆B细胞获得调节性B细胞表型的新机制 | 首次发现肝细胞癌中非典型记忆B细胞获得调节性B细胞表型，并证实肿瘤细胞可赋予外周血B细胞免疫抑制功能 | 未明确说明样本数量和研究人群特征 | 探究肿瘤微环境对肿瘤浸润B淋巴细胞发育和功能的影响 | 肝细胞癌患者的肿瘤浸润B细胞和外周血B细胞 | 单细胞生物学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组测序, B细胞受体测序 | 轨迹分析, 基因调控网络分析 | 单细胞RNA测序数据, BCR序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, BCR测序 | NA | NA |
| 335 | 2025-10-07 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomics Delineate the Microstructure and Immune Landscape of Intrahepatic Cholangiocarcinoma in the Leading-Edge Area
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202412740
PMID:39716897
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组技术揭示了肝内胆管癌前沿区域的微结构特征和免疫景观 | 首次系统描绘了肝内胆管癌前沿区域肿瘤细胞与免疫微环境的相互作用，发现了由MAIT细胞、SPP1+巨噬细胞、POSTN+ CAFs和内皮细胞组成的独特'三元结构' | 样本量较小（仅9例患者），需要更大规模研究验证发现 | 探究肝内胆管癌前沿区域的肿瘤细胞特征及其与免疫微环境的相互作用 | 9例肝内胆管癌患者的肿瘤核心区、癌旁组织和前沿区域组织 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 9例肝内胆管癌患者 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 336 | 2025-10-07 |
Streptococcus lutetiensis inhibits CD8+ IL17A+ TRM cells and leads to gastric cancer progression and poor prognosis
2025-Feb-09, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00810-2
PMID:39924593
|
研究论文 | 本研究通过微生物组和单细胞分析揭示路氏链球菌通过抑制CD8+ IL17A+ TRM细胞促进胃癌进展 | 首次发现路氏链球菌在胃癌组织中富集并通过激活Nrf2介导的氧化应激反应抑制CD8IL17A TRM细胞 | NA | 探究胃微生物组对胃癌进展和免疫调节的影响 | 胃癌患者组织样本和小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 胃癌 | 16s rRNA测序, 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 微生物组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 337 | 2025-10-07 |
Leveraging programmed cell death patterns to predict prognosis and therapeutic sensitivity in OSCC
2025-Feb, Oral diseases
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/odi.15139
PMID:39315471
|
研究论文 | 本研究通过整合12种程序性细胞死亡模式构建细胞死亡指数(CDI)，用于口腔鳞状细胞癌的预后预测和治疗敏感性评估 | 首次整合多种程序性细胞死亡模式构建CDI生物标志物，并利用单细胞RNA-seq数据验证关键基因在癌细胞分化中的作用 | 研究基于回顾性数据，需要前瞻性研究验证CDI的临床实用性 | 开发口腔鳞状细胞癌预后预测和治疗反应评估的新型生物标志物 | 口腔鳞状细胞癌患者 | 生物信息学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA-seq, Cox回归分析, LASSO分析, Kaplan-Meier生存分析 | 预后预测模型, 列线图 | 基因表达数据, 临床数据 | 多个独立患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 338 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing reveals the mechanisms of multiple myeloma progression: clarity or confusion?
2025-Feb, Annals of hematology
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s00277-025-06241-0
PMID:39918600
|
综述 | 本文综述单细胞测序技术在揭示多发性骨髓瘤进展机制中的新见解 | 系统总结单细胞测序技术在多发性骨髓瘤克隆进化、微环境转化和表观遗传改变研究中的突破性发现 | NA | 探讨单细胞测序技术对多发性骨髓瘤生物学机制和治疗策略研究的贡献 | 多发性骨髓瘤及其微环境 | 单细胞组学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞组学数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 339 | 2025-10-07 |
FOXO4-DRI induces keloid senescent fibroblast apoptosis by promoting nuclear exclusion of upregulated p53-serine 15 phosphorylation
2025-Feb-24, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-07738-0
PMID:39994346
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现瘢痕疙瘩中衰老成纤维细胞增加，并揭示了FOXO4-DRI通过促进p53-serine15磷酸化核外排诱导衰老成纤维细胞凋亡的机制 | 首次在瘢痕疙瘩中发现p53-serine15磷酸化上调并通过FOXO4-DRI促进其核外排诱导衰老细胞凋亡 | 研究主要基于体外模型，需要进一步体内实验验证 | 探究瘢痕疙瘩中衰老成纤维细胞的分子机制及潜在治疗策略 | 瘢痕疙瘩组织样本和成纤维细胞 | 细胞生物学 | 瘢痕疙瘩 | 单细胞RNA测序,磷酸化特异性蛋白芯片,Western blotting | NA | 基因表达数据,蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 340 | 2025-10-07 |
Gene expression patterns of the developing human face at single cell resolution reveal cell type contributions to normal facial variation and disease risk
2025-Feb-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.18.633396
PMID:39868299
|
研究论文 | 通过单细胞分辨率构建人类面部发育基因表达图谱，揭示细胞类型对正常面部变异和疾病风险的贡献 | 首次构建人类颅面发育的单细胞核RNA测序图谱，涵盖胚胎期6个关键时间点，识别了颅神经嵴细胞等主要细胞类型及其亚型 | 样本数量有限（24个胚胎），仅涵盖4-8周胚胎期，未覆盖更早或更晚发育阶段 | 解析人类颅面发育的细胞和遗传机制，探索面部形态变异和颅面疾病的发育起源 | 人类胚胎颅面组织（24个胚胎，涵盖4-8孕周6个时间点） | 发育生物学 | 颅面畸形 | 单核RNA测序（snRNA-seq），空间转录组学 | NA | 基因表达数据，空间定位数据 | 24个人类胚胎 | NA | 单核RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |