单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 641 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2025-10-07 |
PD-L1 promotes tumor metastasis by regulating the infiltration of FGFBP2(+)Tm cells in colorectal cancer
2025-Feb, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-024-03223-w
PMID:39558101
|
研究论文 | 本研究揭示PD-L1通过调控FGFBP2(+)记忆T细胞浸润促进结直肠癌转移的机制 | 首次发现PD-L1通过抑制CXCL9/CXCL10分泌减少FGFBP2(+)记忆T细胞浸润，并证实该细胞亚群在转移灶中通过促血管生成促进肿瘤转移 | NA | 探究PD-L1表达与肿瘤转移的关系及其免疫调控机制 | 结直肠癌患者样本和小鼠转移模型 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 测序数据、病理样本 | 外周血、淋巴结、结肠息肉、原发肿瘤和肝转移样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 302 | 2025-10-07 |
E2F1 Promotes the Occurrence of Head and Neck Squamous Cell Carcinoma and Serves as a Prognostic Biomarker
2025-Feb, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-024-05097-w
PMID:39565537
|
研究论文 | 本研究探讨E2F1在头颈部鳞状细胞癌中的生物学功能及预后价值 | 首次结合转录组和单细胞测序数据系统分析E2F1在HNSCC中的预后价值及免疫调控作用 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 探索E2F1在头颈部鳞状细胞癌中的生物学功能和预后价值 | 头颈部鳞状细胞癌患者样本 | 生物信息学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,转录组分析 | Lasso-Cox回归模型,列线图模型 | 基因表达数据,单细胞测序数据 | TCGA和GEO数据库中的HNSCC患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 303 | 2025-10-07 |
Integrated analysis and systematic characterization of the regulatory network for human germline development
2025-Feb, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2024.11.005
PMID:39571792
|
研究论文 | 通过整合多组学数据构建人类原始生殖细胞数据库并系统解析其调控网络 | 首次系统整合人类原始生殖细胞发育不同阶段的多组学数据，构建了hPGCdb数据库并识别了关键转录因子和调控网络 | 人类原始生殖细胞发育过程难以直接观察，主要依赖已有数据整合分析 | 解析人类原始生殖细胞发育的调控机制 | 人类原始生殖细胞(PGCs) | 生物信息学 | NA | RNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq, 单细胞RNA-seq, CRISPRi | NA | 基因组学数据 | 581个RNA-seq样本, 54个ATAC-seq样本, 45个ChIP-seq样本, 69个单细胞RNA-seq样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq | NA | NA |
| 304 | 2025-10-07 |
TRAIL induces podocyte PANoptosis via death receptor 5 in diabetic kidney disease
2025-Feb, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2024.10.026
PMID:39571905
|
研究论文 | 本研究揭示TRAIL通过死亡受体5诱导足细胞发生PANoptosis在糖尿病肾病中的关键作用 | 首次发现TRAIL/DR5信号通路在糖尿病肾病足细胞PANoptosis中的核心作用机制 | 样本量较小（3例正常 vs 3例DKD），主要依赖小鼠模型验证 | 探究TRAIL/DR5信号通路在糖尿病肾病足细胞损伤中的作用机制 | 人类肾脏样本、培养的人足细胞、糖尿病小鼠模型 | 单细胞生物学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序, siRNA沉默, 基因过表达 | NA | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据 | 3例正常人肾脏样本, 3例糖尿病肾病患者肾脏样本, 多种糖尿病小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 305 | 2025-10-07 |
A Study on the Inflammatory Response of the Brain in Neurosyphilis
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202406971
PMID:39574316
|
研究论文 | 本研究通过整合蛋白质组学和单细胞转录组学分析，揭示了神经梅毒中炎症介导脑损伤的机制 | 首次通过整合蛋白质组学和单细胞转录组学方法鉴定出Toll样/NF-κB信号通路是神经梅毒中枢神经系统损伤的关键通路，并发现单核细胞来源的巨噬细胞是关键的炎症反应细胞 | 未明确说明样本数量和具体实验设计的局限性 | 探究神经梅毒中炎症介导脑损伤的分子机制 | 神经梅毒患者的中枢神经系统和外周血炎症细胞 | 神经科学 | 神经梅毒 | 蛋白质组学, 单细胞转录组学, 体外脑类器官模型 | 体外脑类器官模型 | 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 306 | 2025-10-07 |
High CD44 expression and enhanced E-selectin binding identified as biomarkers of chemoresistant leukemic cells in human T-ALL
2025-Feb, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-024-02473-7
PMID:39580584
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别了T细胞急性淋巴细胞白血病中化疗耐药细胞的特征标志物 | 首次在人类T-ALL中发现具有高CD44表达和增强E-选择素结合能力的化疗耐药白血病细胞群体 | 样本量相对有限（39例人类T-ALL样本），需要更大规模研究验证 | 探索T-ALL化疗耐药机制并识别相关生物标志物 | 人类T-ALL细胞和患者样本 | 单细胞组学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 39例人类T-ALL样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 307 | 2025-10-07 |
Integrating bulk RNA-seq and scRNA-seq data to explore diverse cell death patterns and develop a programmed cell death-related relapse prediction model in pediatric B-ALL
2025-02-15, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-86148-y
PMID:39955305
|
研究论文 | 本研究通过整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，探索了儿童B细胞急性淋巴细胞白血病中多种程序性细胞死亡模式，并开发了与复发相关的预测模型 | 首次系统整合批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据分析儿童B-ALL中16种程序性细胞死亡模式，并构建了基于7个关键基因的复发预测模型 | NA | 识别程序性细胞死亡相关生物标志物并开发儿童B-ALL复发预测模型 | 儿童B细胞急性淋巴细胞白血病患者 | 生物信息学 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | RNA-seq, scRNA-seq, Cox回归分析 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 308 | 2025-10-07 |
B-cell signatures characterize the immune landscape and predict LUAD prognosis via the integration of scRNA-seq and bulk RNA-seq
2025-02-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-89213-8
PMID:39953119
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，构建基于B细胞特征的肺腺癌预后风险模型 | 首次通过整合单细胞和批量RNA测序数据识别B细胞特征基因，构建肺腺癌预后风险模型 | 研究基于公共数据库的回顾性数据，需要进一步实验验证 | 阐明B细胞在肺腺癌中的作用并构建预后预测模型 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | LASSO回归模型 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的4个数据集(GSE164983, GSE50081, GSE37745, GSE30219)和TCGA-LUAD数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 309 | 2025-10-07 |
Glioblastoma Cortical Organoids Recapitulate Cell-State Heterogeneity and Intercellular Transfer
2025-Feb-07, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-23-1336
PMID:39373549
|
研究论文 | 本研究利用胶质母细胞瘤皮质类器官模型，揭示了肿瘤细胞与非恶性细胞间广泛的mRNA和GFP转移现象 | 相比匹配的胶质瘤球模型，GBM皮质类器官更准确地重现了患者肿瘤中恶性细胞状态的多样性和表达程序，并首次系统观察到细胞间广泛的转录本转移 | 模型系统仍为体外类器官，可能无法完全模拟体内肿瘤微环境的复杂性 | 建立更真实的胶质母细胞瘤微环境模型，研究肿瘤细胞与非恶性细胞间的相互作用 | 胶质母细胞瘤皮质类器官中的恶性细胞和神经胶质细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 310 | 2025-10-07 |
Multimodal Profiling of Peripheral Blood Identifies Proliferating Circulating Effector CD4+ T Cells as Predictors for Response to Integrin α4β7-Blocking Therapy in Inflammatory Bowel Disease
2025-Feb, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2024.09.021
PMID:39343250
|
研究论文 | 通过多模态分析外周血免疫特征，识别增殖性循环效应CD4+T细胞作为炎症性肠病患者对整合素α4β7阻断治疗反应的预测标志物 | 首次整合多组学数据识别出对vedolizumab治疗无应答者的特异性T细胞特征，并建立机器学习预测模型 | 样本量相对有限，需要在更大队列中验证预测模型的普适性 | 寻找炎症性肠病生物治疗反应的可靠预测标志物 | 接受vedolizumab治疗的炎症性肠病患者外周血样本 | 生物医学 | 炎症性肠病 | 质谱流式细胞术,单细胞RNA测序,单细胞BCR/TCR测序,血清蛋白质组学,多参数流式细胞术 | 机器学习 | 单细胞多组学数据 | 2个前瞻性队列的炎症性肠病患者 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞BCR/TCR测序,质谱流式细胞术,蛋白质组学 | NA | NA |
| 311 | 2025-10-07 |
Matrix stiffness regulates mitochondria-lysosome contacts to modulate the mitochondrial network, alleviate the senescence of MSCs
2025-Feb, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13746
PMID:39353686
|
研究论文 | 本研究探讨基质硬度通过调控线粒体-溶酶体接触影响间充质干细胞衰老的机制 | 首次揭示基质硬度通过调控M-L接触影响线粒体网络和功能进而导致MSC衰老的分子机制 | 未明确M-L接触调控线粒体稳态的具体信号通路 | 探究基质硬度如何通过调控线粒体-溶酶体接触影响间充质干细胞衰老 | 人间充质干细胞 | 细胞生物学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序,原子力显微镜 | NA | 基因表达数据,力学性能数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 312 | 2025-10-07 |
Maternal infection with SARS-CoV-2 during early pregnancy induces hypoxia at the maternal-fetal interface
2025-Feb, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13749
PMID:39375953
|
研究论文 | 本研究探讨了孕早期SARS-CoV-2感染对母胎界面缺氧状态的影响 | 首次发现孕早期SARS-CoV-2感染会诱导母胎界面缺氧并伴随代谢异常，且这种影响随孕周增加而逐渐缓解 | 样本量有限，长期影响仍需进一步研究 | 探究SARS-CoV-2感染对母胎界面的影响机制 | 孕早期感染SARS-CoV-2孕妇的胎盘样本 | 病理学 | COVID-19 | 免疫荧光,免疫组化,单细胞RNA测序,代谢组学测序 | NA | 组织样本,基因表达数据,代谢数据 | 孕6-8周和12-16周孕妇胎盘样本 | NA | 单细胞RNA测序,代谢组学测序 | NA | NA |
| 313 | 2025-10-07 |
Extraembryonic mesoderm cells derived from human embryonic stem cells rely on Wnt pathway activation
2025-Feb, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13761
PMID:39385268
|
研究论文 | 本研究开发了一种通过激活Wnt通路从人primed胚胎干细胞分化产生胚外中胚层细胞及其后续间充质干细胞的方案 | 首次证明人primed胚胎干细胞可分化为胚外中胚层细胞并产生具有特定分化潜能的间充质干细胞 | 未明确说明样本数量和研究规模 | 探索人primed胚胎干细胞向胚外中胚层细胞分化的可能性及其后续发育潜能 | 人primed胚胎干细胞、胚外中胚层细胞、间充质干细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞转录组分析、免疫染色分析、细胞分选、三维分化培养 | NA | 转录组数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 314 | 2025-10-07 |
Evidence for a lipofibroblast-to-Cthrc1 + myofibroblast reversible switch during the development and resolution of lung fibrosis in young mice
2025-Feb, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.00482-2023
PMID:39401861
|
研究论文 | 本研究通过遗传谱系追踪和单细胞转录组学揭示了年轻小鼠肺纤维化过程中脂成纤维细胞与Cthrc1+肌成纤维细胞之间的可逆转换机制 | 首次发现活化的肌成纤维细胞包含四个具有不同促肺泡生成和促纤维化特征的亚群，并证实脂成纤维细胞特征高的细胞群在纤维化发生和消退过程中分别作为起源和归宿 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据仅通过数据挖掘获得，需要进一步实验验证 | 解析肺纤维化过程中活化肌成纤维细胞的异质性及其在纤维化消退过程中的分化轨迹 | 年轻小鼠肺组织及人类特发性肺纤维化数据集 | 单细胞生物学 | 肺纤维化 | 遗传谱系追踪, 单细胞转录组学, 数据挖掘, 类器官培养 | NA | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据 | 小鼠模型和人类IPF数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 315 | 2025-10-07 |
Myeloid Mir34a suppresses colitis-associated colon cancer: characterization of mediators by single-cell RNA sequencing
2025-Feb, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-024-01380-9
PMID:39425000
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了髓系细胞中Mir34a缺失通过调控巨噬细胞极化状态抑制结肠炎相关结肠癌的机制 | 首次在体内证明髓系特异性Mir34a通过维持巨噬细胞M1样状态发挥肿瘤抑制作用，并发现新的炎症性CAC细胞亚型 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 阐明髓系细胞中Mir34a在结肠炎相关结肠癌中的肿瘤抑制机制 | 髓系特异性Mir34a敲除小鼠的结肠炎相关结肠癌模型 | 单细胞测序 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 316 | 2025-10-07 |
Aging alters the effect of adiponectin receptor signaling on bone marrow-derived mesenchymal stem cells
2025-Feb, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14390
PMID:39462849
|
研究论文 | 本研究探讨衰老如何改变脂联素受体信号对骨髓间充质干细胞的影响 | 首次揭示衰老通过改变脂联素受体表达和下游信号通路激活差异，逆转脂联素受体激动剂对骨再生的治疗效果 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类样本中验证 | 阐明衰老对脂联素受体信号在骨稳态和骨折修复中作用的调节机制 | 年轻和老年小鼠的骨髓间充质干细胞 | 干细胞生物学 | 骨质疏松 | 单细胞测序, 体内染色 | NA | 基因表达数据, 蛋白表达数据 | 年轻和老年小鼠骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 317 | 2025-10-07 |
Sensory neuroimmune signaling in the pathogenesis of Stevens-Johnson syndrome and toxic epidermal necrolysis
2025-Feb, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.10.015
PMID:39481654
|
研究论文 | 本研究探讨了感觉神经免疫信号在史蒂文斯-约翰逊综合征和中毒性表皮坏死松解症发病机制中的作用 | 首次揭示CGRP-RAMP1轴通过HCN2离子通道增强CD8+T细胞IL-15/IL-18受体表达和细胞毒性，阐明神经元素在皮肤炎症中的调控机制 | 未明确不同触发药物对神经免疫信号通路的影响差异 | 探究SJS/TEN发病过程中的神经免疫调节机制 | 健康对照和SJS/TEN患者的循环CD8+T细胞及皮肤组织 | 免疫学 | 史蒂文斯-约翰逊综合征/中毒性表皮坏死松解症 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,ELISA,LEGENDplex,免疫荧光染色,钙成像,Smart-seq,3D皮肤模型 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,图像数据 | 健康对照和SJS/TEN患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 318 | 2025-10-07 |
From metabolomics to therapeutics: identifying causal metabolites and potential drugs for the treatment of osteoarthritis
2025-Feb, Inflammopharmacology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s10787-024-01594-w
PMID:39488818
|
研究论文 | 通过代谢组学孟德尔随机化研究识别骨关节炎的因果代谢物和潜在治疗靶点 | 首次采用大规模代谢组学孟德尔随机化方法系统识别与骨关节炎因果相关的血液代谢物 | 研究基于欧洲人群数据，结果可能不适用于其他族裔群体 | 识别骨关节炎的因果代谢物和潜在治疗靶点 | 骨关节炎患者和健康对照人群 | 生物信息学 | 骨关节炎 | 孟德尔随机化, 全基因组关联研究, 单细胞测序, 蛋白质相互作用网络分析 | NA | 基因组数据, 代谢组数据, 基因表达数据 | 总计231,625例病例和1,218,499例对照 | NA | 全基因组关联分析, 单细胞测序 | NA | NA |
| 319 | 2025-10-07 |
Immune-responsive gene-1: The mitochondrial Key to Th17 Cell Pathogenicity in CNS Autoimmunity
2025-Feb-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.24.573264
PMID:38234838
|
研究论文 | 本研究揭示了免疫应答基因1在调节中枢神经系统自身免疫疾病中致病性Th17细胞的关键作用 | 首次发现免疫应答基因1通过NLRP3/IL-1β轴调控巨噬细胞MHC II类分子表达，从而影响致病性Th17细胞极化 | 研究主要基于动物模型EAE，在人类多发性硬化症中的直接验证仍需进一步研究 | 探究免疫应答基因1在中枢神经系统自身免疫疾病中对Th17细胞致病性的调控机制 | 实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)小鼠模型、原代脑胶质细胞、骨髓嵌合体 | 免疫学 | 多发性硬化症 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 适应性转移实验 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 320 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomic sequencing analysis of mechanistic insights into the IFN-γ signaling pathway in different tumor cells
2025-Feb, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-024-03574-6
PMID:39090422
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序分析IFN-γ信号通路在不同肿瘤微环境中的机制作用 | 首次在单细胞水平系统揭示IFN-γ通路在肿瘤细胞中的双重功能及其调控网络 | 基于公共数据库的回顾性分析，缺乏实验验证 | 探究IFN-γ信号通路在不同肿瘤微环境中的作用机制及其与预后的关系 | 多种肿瘤类型的肿瘤细胞、基质细胞和免疫细胞 | 生物信息学 | 泛癌分析 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 单变量Cox回归模型 | 基因表达数据 | TCGA和GEO数据库中的多肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |