单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 652 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2025-10-07 |
Prenatal exposure on nanoplastics: A study of spatial transcriptomics in hippocampal offspring
2025-Feb-01, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2024.125480
PMID:39644950
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术探究母体暴露于纳米塑料对大鼠后代海马区发育的影响 | 首次应用空间转录组学技术系统研究纳米塑料暴露对后代海马区细胞类型特异性基因表达的影响 | 研究仅针对大鼠模型，人类相关性需进一步验证 | 探究母体纳米塑料暴露对后代海马区发育的神经毒性机制 | 母体暴露于聚苯乙烯纳米塑料的大鼠后代海马区组织 | 空间转录组学 | 神经发育障碍 | 空间转录组测序 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 242 | 2025-10-07 |
Multiplexing cortical brain organoids for the longitudinal dissection of developmental traits at single-cell resolution
2025-Feb, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02555-5
PMID:39653820
|
研究论文 | 开发了脑类器官多重分析方法和计算工具，用于在单细胞分辨率下解析神经发育轨迹 | 开发了互补的多重分析策略和新的计算方法SCanSNP，克服了双细胞和低质量细胞识别的关键问题 | NA | 建立高度可扩展的脑疾病和神经多样性建模资源 | 人多能干细胞系来源的脑类器官 | 单细胞分析 | 脑疾病 | 单细胞RNA测序 | SCanSNP | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 243 | 2025-10-07 |
DEHP-mediated oxidative stress leads to impaired testosterone synthesis in Leydig cells through the cAMP/PKA/SF-1/StAR pathway
2025-Feb-01, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2024.125503
PMID:39657860
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析结合体内外实验，揭示了DEHP通过诱导氧化应激抑制cAMP/PKA/SF-1/StAR通路，从而损害睾丸间质细胞睾酮合成的机制 | 首次整合单细胞RNA测序与功能验证，阐明DEHP通过氧化应激-cAMP/PKA/SF-1/StAR轴损害睾酮合成的新机制 | 未明确DEHP暴露的具体剂量-效应关系，且机制研究主要集中于单一信号通路 | 探究环境塑化剂DEHP损害睾丸间质细胞功能的具体分子机制 | 小鼠睾丸间质细胞 | 分子毒理学 | 男性生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序, 体外细胞实验, 体内动物实验, 氧化应激指标检测 | NA | 单细胞转录组数据, 生化指标数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 244 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome sequencing analysis of physiological and immune profiling of crucian carp (Carassius auratus) gills
2025-Feb, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2024.110087
PMID:39662647
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序分析鲫鱼鳃组织的生理和免疫功能特征 | 首次在单细胞水平注释并分析鲫鱼鳃瓣间细胞团的功能异质性，建立基因调控网络并识别免疫调节相关关键基因 | 仅针对鲫鱼单一物种进行研究，未涉及其他鱼类或更广泛的比较分析 | 探究鲫鱼鳃组织在单细胞水平的生理和免疫功能特征 | 鲫鱼鳃组织细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序，组织学分析，加权基因共表达网络分析 | NA | 单细胞转录组数据，组织学图像 | 鲫鱼鳃组织样本（鉴定出19种细胞类型） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 245 | 2025-10-07 |
TEAD1-Mediated Trans-Differentiation of Vascular Smooth Muscle Cells into Fibroblast-Like Cells Contributes to the Stabilization and Repair of Disrupted Atherosclerotic Plaques
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202407408
PMID:39665254
|
研究论文 | 本研究揭示了TEAD1通过Wnt4/β-Catenin通路促进血管平滑肌细胞向成纤维样细胞转分化，从而增强动脉粥样硬化斑块稳定性和破裂后修复机制 | 首次发现TEAD1是驱动VSMCs向成纤维样细胞转分化的关键转录因子，并阐明其通过Wnt4/β-Catenin通路发挥作用 | 研究主要基于小鼠TS模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 探究动脉粥样硬化斑块破裂后修复机制及潜在治疗靶点 | 血管平滑肌细胞(VSMCs)及其转分化过程 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 谱系追踪, 药理学处理, AAV基因治疗 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 动脉粥样硬化小鼠TS模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 246 | 2025-10-07 |
Activation of STAT6 in Intestinal Epithelial Cells Predisposes to Gut Inflammation
2025-Feb, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202451394
PMID:39670708
|
研究论文 | 本研究通过构建肠道上皮细胞STAT6持续激活的小鼠模型，揭示了STAT6信号通路在肠道炎症发生中的关键作用 | 首次在肠道上皮细胞中特异性研究STAT6激活对肠道炎症的影响，并发现其通过调控未折叠蛋白反应、MTORC和MYC信号通路等机制加剧结肠炎 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据的验证相对有限 | 探究STAT6在肠道上皮细胞中的激活对肠道炎症的调控机制 | VillinCre_STAT6vt转基因小鼠和人类IBD患者队列 | 分子生物学 | 炎症性肠病 | RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 转基因小鼠模型和人类IBD患者队列 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 247 | 2025-10-07 |
iFlpMosaics enable the multispectral barcoding and high-throughput comparative analysis of mutant and wild-type cells
2025-Feb, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02534-w
PMID:39672980
|
研究论文 | 介绍iFlpMosaics工具包，用于在相同组织微环境中实现突变型和野生型细胞的多光谱标记与高通量比较分析 | 开发了能够实现比率依赖性诱导和单细胞克隆追踪的新遗传工具，可在同一时间窗口和组织微环境中同时标记多种荧光标记的野生型和Cre突变细胞 | NA | 更准确地理解诱导基因突变如何影响组织发育、稳态和疾病过程中的单细胞生物学 | 小鼠遗传嵌合体中的突变型和野生型细胞 | 遗传学 | NA | 多光谱成像、荧光激活流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 图像、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 248 | 2025-10-07 |
Prevention of Intrauterine Adhesion with Platelet-Rich Plasma Double-Network Hydrogel
2025-Feb, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400336
PMID:39673358
|
研究论文 | 研究富血小板血浆双网络水凝胶预防宫腔粘连的效果及机制 | 开发了基于海藻酸钠的PRP双网络水凝胶，通过蛋盒离子交联和纤维蛋白双网络结构增强治疗效果 | 未明确说明研究样本量及临床转化时间表 | 探索新型水凝胶材料对宫腔粘连的预防和治疗效果 | 宫腔粘连患者子宫内膜组织 | 组织工程与再生医学 | 宫腔粘连 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 249 | 2025-10-07 |
Dissecting the cellular reprogramming and tumor microenvironment in left- and right-sided Colorectal Cancer by single cell RNA sequencing
2025-Feb, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2024.12.002
PMID:39675521
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析左右侧结直肠癌的细胞重编程和肿瘤微环境差异 | 首次在单细胞水平系统比较左右侧结直肠癌的肿瘤微环境特征和细胞间相互作用 | 使用公共数据库数据，样本来源可能存在异质性 | 解析左右侧结直肠癌肿瘤微环境的细胞组成和功能差异 | 结直肠癌患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 55个结直肠癌样本中的126,279个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 250 | 2025-10-07 |
SYISL Knockout Promotes Embryonic Muscle Development of Offspring by Modulating Maternal Gut Microbiota and Fetal Myogenic Cell Dynamics
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202410953
PMID:39680624
|
研究论文 | 本研究揭示SYISL基因敲除通过调节母体肠道微生物群和胎儿肌源性细胞动态促进胚胎肌肉发育的机制 | 首次发现SYISL通过母体肠道微生物-丁酸-HDAC-H3K9ac/H3K27ac通路和独立于组蛋白乙酰化的肌源性细胞动态调控双重途径影响胚胎肌肉发育 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类或其他物种中验证 | 探究SYISL基因敲除促进胚胎肌肉发育的分子机制 | 小鼠胚胎肌肉组织和母体肠道微生物群 | 发育生物学 | 肌肉疾病 | RNA-seq, ChIP-seq, scRNA-seq, 粪便微生物移植 | 基因敲除小鼠模型 | 基因组学数据，单细胞转录组数据 | 野生型和SYISL敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq, 染色质免疫沉淀测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 251 | 2025-10-07 |
Mesenchymal Stem Cells Prevent SLC39A14-Dependent Hepatocyte Ferroptosis through Exosomal miR-16-5p in Liver Graft
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202411380
PMID:39680749
|
研究论文 | 本研究揭示了间充质干细胞通过外泌体miR-16-5p抑制SLC39A14依赖的肝细胞铁死亡，从而预防肝移植缺血再灌注损伤的机制 | 首次发现SLC39A14作为肝细胞铁死亡的促发靶点，并阐明hBMSCs通过外泌体miR-16-5p调控该过程的治疗机制 | 研究主要聚焦于SLC39A14和miR-16-5p的机制，可能涉及其他未探索的调控通路 | 探究肝移植缺血再灌注损伤中肝细胞铁死亡的分子机制及治疗策略 | 人肝移植组织、肝细胞、人骨髓源性间充质干细胞 | 单细胞测序分析 | 肝移植缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据、体外和体内实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 252 | 2025-10-07 |
Single-Nucleus and Spatial Transcriptome Profiling Delineates the Multicellular Ecosystem in Hepatocellular Carcinoma After Hepatic Arterial Infusion Chemotherapy
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202405749
PMID:39686623
|
研究论文 | 本研究通过单核RNA测序和空间转录组学描绘了肝动脉灌注化疗后肝细胞癌的多细胞生态系统 | 首次整合单核RNA测序和空间转录组学技术系统分析HAIC治疗后肝癌的肿瘤生态系统，发现三级淋巴结构形成和中间耗竭CD8 T细胞扩增等新现象 | 样本量相对有限，需要更大规模验证研究 | 阐明肝动脉灌注化疗后肝细胞癌的肿瘤微环境变化 | 初治和HAIC治疗后的肝细胞癌肿瘤样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 治疗初治和HAIC治疗后肝癌样本 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 253 | 2025-10-07 |
Aberrant Chitinase 3-Like 1 Expression in Basal Cells Contributes to Systemic Sclerosis Fibrosis
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202310169
PMID:39686726
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现系统性硬化症中基底细胞异常表达的几丁质酶3样1蛋白通过IL-17RA信号通路促进纤维化 | 首次在系统性硬化症中鉴定出高表达Chi3L1的基底细胞亚群，并阐明其通过IL-17RA介导的NF-κB和MAPK信号通路促进纤维化的新机制 | 研究样本量有限，动物模型不能完全模拟人类疾病复杂性 | 探究系统性硬化症纤维化的分子机制并寻找潜在治疗靶点 | 系统性硬化症患者皮肤样本、血清样本和博来霉素诱导的小鼠模型 | 单细胞组学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 系统性硬化症患者和健康对照的皮肤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 254 | 2025-10-07 |
Application of Single-Cell Genomics to Animal Models of Periodontitis and Peri-Implantitis
2025-Feb, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.14093
PMID:39695834
|
综述 | 本综述探讨了单细胞基因组学技术与牙周炎和种植体周围炎动物模型结合应用的现状与前景 | 整合单细胞RNA测序技术与动物模型，揭示牙周疾病中的细胞异质性和细胞特异性作用，并开始应用于种植体周围炎研究 | 叙述性综述，缺乏系统性文献检索和质量评估 | 综合当前关于单细胞基因组学技术与牙周炎和种植体周围炎动物模型整合应用的知识 | 牙周炎和种植体周围炎的动物模型 | 单细胞基因组学 | 牙周疾病 | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | 基因敲除模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间基因组学 | NA | NA |
| 255 | 2025-10-07 |
Tracking adipose-derived stem cell exosomes applied in a mouse crush injury model: insights from fluorescent labeling and spatial transcriptomics - an experimental study
2025-Feb-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000002166
PMID:39705130
|
研究论文 | 本研究通过荧光标记和空间转录组学追踪脂肪来源干细胞外泌体在小鼠坐骨神经挤压伤模型中的作用机制 | 首次结合荧光标记和空间转录组学技术系统追踪ADSC-exos在神经再生过程中的分布及分子机制 | 本研究为动物实验，结果向临床转化需进一步验证；样本量有限 | 探究脂肪来源干细胞外泌体促进神经再生的具体作用机制 | 小鼠坐骨神经挤压伤模型 | 空间转录组学 | 周围神经损伤 | 荧光标记, 空间转录组学, 基因本体分析 | NA | 空间基因表达数据, 荧光成像数据 | 小鼠神经挤压伤模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 256 | 2025-10-07 |
Investigating biological nitrogen fixation via single-cell transcriptomics
2025-Feb-25, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/erae454
PMID:39563004
|
综述 | 本文总结了单细胞转录组学在解析豆科植物根瘤共生分子机制方面的关键发现 | 首次系统整合多个豆科植物的单细胞转录组数据，揭示根瘤共生的保守转录程序和细胞谱系动态 | 仅涵盖三种模式豆科植物的研究，未涉及非豆科作物的工程化应用 | 探索通过单细胞转录组学解析生物固氮机制，为工程化根瘤共生提供理论基础 | 蒺藜苜蓿、百脉根和大豆的根瘤共生系统 | 植物生物学 | NA | 单细胞转录组学 | 轨迹推断，RNA速率分析 | 单细胞RNA测序数据 | 三种豆科植物的根瘤组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 257 | 2025-10-07 |
Mapping of the T-cell Landscape of Biliary Tract Cancer Unravels Anatomic Subtype-Specific Heterogeneity
2025-Feb-17, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-1173
PMID:39570809
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间分析揭示胆道癌不同解剖亚型中T细胞景观的特异性异质性 | 首次在单细胞和空间水平系统描绘胆道癌各亚型的T细胞多样性，发现肝外胆管癌特有的T细胞耗竭特征和肝内胆管癌的免疫抑制特征 | 样本量相对有限（16例患者），需要更大规模研究验证发现 | 阐明胆道癌不同解剖亚型的T细胞免疫特征差异 | 胆道癌患者（包括肝内胆管癌、肝外胆管癌和胆囊癌）的CD3+ T细胞 | 单细胞生物学 | 胆道癌 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序, 空间分析 | NA | 单细胞转录组数据, 空间分布数据, 病理切片图像 | 16例患者的36个样本，分析355张病理切片 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 258 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing applications in acute myeloid leukemia
2025-Feb, Leukemia & lymphoma
IF:2.2Q3
DOI:10.1080/10428194.2024.2422833
PMID:39496597
|
综述 | 本文综述单细胞测序技术在急性髓系白血病研究中的应用进展 | 系统总结单细胞测序从细胞处理到生物信息分析的技术进展及其在AML研究中的创新应用 | 未涉及具体实验数据验证，主要为文献综述性质 | 探讨单细胞测序技术如何推动急性髓系白血病研究并改善临床实践 | 急性髓系白血病的遗传和表型异质性 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 259 | 2025-10-07 |
CD137 Protein Expression Pattern Determines the Functional Role of Galectin-9 in Colorectal Cancer
2025-Feb, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.23838
PMID:39503215
|
研究论文 | 本研究通过分析结直肠癌单细胞测序数据开发预后评分系统，并探讨LGALS9基因作为治疗靶点的潜力 | 发现LGALS9在结直肠癌中的作用取决于CD137蛋白表达模式，提出CD137水平可作为LGALS9靶向治疗疗效预测指标 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步临床验证 | 开发结直肠癌预后工具并探索LGALS9基因的治疗潜力 | 结直肠癌患者数据和小鼠结直肠癌模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | Scissor算法 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 260 | 2025-10-07 |
COMPREHENSIVE CHARACTERIZATION OF CYTOKINES IN PATIENTS UNDER EXTRACORPOREAL MEMBRANE OXYGENATION: EVIDENCE FROM INTEGRATED BULK AND SINGLE-CELL RNA SEQUENCING DATA USING MULTIPLE MACHINE LEARNING APPROACHES
2025-Feb-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002425
PMID:39503329
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞RNA测序数据，利用多种机器学习方法构建了细胞因子相关基因分类器，用于预测ECMO患者的预后 | 首次整合bulk和单细胞RNA测序数据，应用多种机器学习算法识别关键细胞因子相关基因，并构建ECMO预后预测模型 | 研究样本量有限，仅基于三个ECMO支持数据集和医院队列 | 全面表征ECMO患者细胞因子表达特征，构建预后预测模型 | 接受体外膜肺氧合(ECMO)治疗的患者 | 机器学习 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | SVM, RF, Lasso, XGBoost, ANN | 基因表达数据 | 三个ECMO支持数据集（两个bulk RNA-seq和一个单细胞RNA-seq）及医院队列 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA |