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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2025-10-06 |
LOX+ iCAFs in HNSCC have the potential to predict prognosis and immunotherapy responses revealed by single cell RNA sequencing analysis
2025-Feb-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-91036-6
PMID:40016474
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析发现LOX+ iCAFs在头颈鳞状细胞癌中具有预测预后和免疫治疗反应的潜力 | 首次通过单细胞RNA测序识别LOX+ iCAFs亚型,并建立其与HNSCC预后和免疫治疗反应的关联 | 研究样本量有限,验证队列仅包含102名患者 | 探索头颈鳞状细胞癌中癌相关成纤维细胞的功能作用及其临床意义 | 头颈鳞状细胞癌患者样本和CAL-27、UM-SCC-1细胞系 | 单细胞分析 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | Seurat聚类分析 | 单细胞RNA测序数据,bulk RNA测序数据 | GSE103322数据集和102名HNSCC患者验证队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 242 | 2025-10-06 |
Bioinformatics analysis of shared biomarkers and immune pathways of preeclampsia and periodontitis
2025-Feb-27, BMC pregnancy and childbirth
IF:2.8Q1
DOI:10.1186/s12884-025-07277-w
PMID:40016711
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研究论文 | 通过生物信息学分析发现先兆子痫和牙周炎共享的生物标志物和免疫通路 | 首次系统识别先兆子痫和牙周炎的共享枢纽基因和免疫通路,并构建诊断模型 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要实验验证 | 探索先兆子痫和牙周炎的共同发病机制 | 牙周组织和胎盘组织的基因表达数据 | 生物信息学 | 先兆子痫和牙周炎 | 转录组分析,单细胞RNA测序 | XG-Boost,机器学习 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的多个转录组数据集 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 243 | 2025-10-06 |
Integration and functionality of human iPSC-derived microglia in a chimeric mouse retinal model
2025-Feb-27, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03393-8
PMID:40016767
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研究论文 | 本研究开发了一种包含人iPSC来源小胶质细胞的嵌合体小鼠视网膜模型,用于研究人类小胶质细胞在视网膜环境中的功能 | 创建了首个包含异种移植人类小胶质细胞的离体嵌合体视网膜模型,实现了超过86%的人类小胶质细胞整合率 | 研究仅进行了14天的培养观察,长期功能维持和安全性尚未评估 | 开发能够准确模拟人类小胶质细胞功能的视网膜疾病研究模型 | 人类诱导多能干细胞来源的小胶质细胞和小鼠视网膜组织 | 神经科学 | 视网膜退行性疾病 | 单细胞RNA测序,免疫染色,抗体中和实验 | 嵌合体小鼠视网膜模型 | 基因表达数据,图像数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 244 | 2025-10-06 |
A novel stemness-related lncRNA signature predicts prognosis, immune infiltration and drug sensitivity of clear cell renal cell carcinoma
2025-Feb-27, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06251-6
PMID:40016772
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研究论文 | 本研究开发了一种基于干性相关长链非编码RNA的预后特征模型,用于预测透明细胞肾细胞癌的预后、免疫浸润和药物敏感性 | 首次将RNA干性评分与WGCNA分析相结合识别SRlncRNAs,并构建了包含6个SRlncRNAs的预后特征模型,同时开发了基于网络的临床应用计算器 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要更多前瞻性研究验证模型的临床实用性 | 探索干性相关长链非编码RNA在透明细胞肾细胞癌预后预测中的作用并开发风险分层模型 | 透明细胞肾细胞癌患者 | 生物信息学 | 肾癌 | RNA-seq, scRNA-seq, RT-qPCR, WGCNA, LASSO回归, Cox回归 | 机器学习算法, 预后特征模型 | 基因表达数据, 临床数据 | TCGA-KIRC和GSE29609队列样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 245 | 2025-05-10 |
Single-cell RNA-seq and pathological phenotype reveal the functional atlas and precise roles of Sox30 in testicular cell development and differentiation
2025-Feb-19, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07442-1
PMID:39971903
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和病理表型分析,揭示了Sox30在睾丸细胞发育和分化中的功能图谱和精确作用 | 首次详细描述了Sox30在睾丸细胞中的具体功能,特别是在初级精母细胞分化中的作用,并揭示了Sox30缺失对细胞间通讯和转录因子网络的影响 | 研究主要基于小鼠模型,结果在人类中的适用性尚需验证 | 阐明Sox30在睾丸细胞发育和分化中的精确作用机制 | 小鼠睾丸细胞 | 单细胞测序 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量,但涉及野生型和Sox30缺失型小鼠的睾丸细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 246 | 2025-05-10 |
Unravelling genotype-phenotype correlations in Stargardt disease using patient-derived retinal organoids
2025-Feb-19, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07420-7
PMID:39971915
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研究论文 | 利用患者来源的视网膜类器官研究Stargardt病的基因型-表型相关性 | 首次使用患者来源的iPSCs生成视网膜类器官,成功模拟了STGD1的病理特征并揭示了基因型与表型之间的相关性 | 研究仅涉及两名单等位基因未解决的STGD1患者和一名双等位基因受影响对照,样本量较小 | 探究STGD1的细胞和分子特征及其基因型-表型相关性 | STGD1患者和对照的iPSCs来源的视网膜类器官 | 遗传性视网膜疾病研究 | Stargardt病 | iPSC技术、视网膜类器官培养、scRNA-Seq、全基因组测序、长读长RNA测序 | 视网膜类器官模型 | 基因测序数据、单细胞RNA测序数据、RNA-seq数据 | 两名单等位基因未解决的STGD1患者和一名双等位基因受影响对照 | NA | NA | NA | NA |
| 247 | 2025-05-10 |
Polycystic ovary syndrome and epithelial-mesenchymal transition: Mendelian randomization and single-cell analysis insights
2025-Feb-19, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-025-01617-2
PMID:39972362
|
研究论文 | 本研究通过转录组学和单细胞RNA测序结合孟德尔随机化分析,探索了与多囊卵巢综合征(PCOS)中上皮-间质转化(EMT)相关的关键基因及其分子调控机制 | 首次从转录组学和单细胞RNA测序角度结合孟德尔随机化分析,鉴定出与PCOS风险降低相关的三个EMT相关基因(NUCB2、PGF、CRIM1),并发现成纤维细胞是PCOS病理中的关键细胞群 | 研究仅基于公共数据库数据,缺乏实验验证 | 探索PCOS中EMT相关关键基因及其分子调控机制 | 多囊卵巢综合征(PCOS)患者样本 | 生物信息学 | 多囊卵巢综合征 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、孟德尔随机化(MR)分析 | NA | 转录组数据 | 公共数据库中的PCOS样本数据 | NA | NA | NA | NA |
| 248 | 2025-05-10 |
Precise gene expression deconvolution in spatial transcriptomics with STged
2025-Feb-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf087
PMID:39970279
|
研究论文 | 提出了一种名为STged的新型计算框架,用于从空间转录组学数据中精确解卷积细胞类型特异性基因表达谱 | STged通过整合基于图的空间相关性和参考基因特征,超越了传统的细胞类型解卷积方法,能够重建混合点中的细胞类型特异性基因表达谱 | NA | 解决空间转录组学中细胞类型特异性基因表达模式被掩盖的问题 | 人类胰腺导管腺癌、人类鳞状细胞癌数据集以及小鼠肾脏组织 | 数字病理学 | 胰腺癌、鳞状细胞癌 | 空间转录组学 | 非负最小二乘回归框架 | 基因表达数据 | 人类和小鼠组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 249 | 2025-05-07 |
Immune microenvironment spatial landscapes of tertiary lymphoid structures in gastric cancer
2025-Feb-04, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-025-03889-3
PMID:39901202
|
research paper | 该研究探讨了胃癌中三级淋巴结构(TLS)对免疫微环境空间景观的影响及其预后价值 | 首次全面分析了胃癌中TLS的免疫微环境空间特征,并开发了基于免疫细胞密度和空间特征的风险评分模型 | 样本量相对较小(单细胞测序仅12例,空间转录组仅2例) | 阐明TLS在胃癌免疫微环境中的作用机制及其预后意义 | 胃癌患者的肿瘤组织和免疫微环境 | digital pathology | gastric cancer | multispectral fluorescence imaging, single-cell RNA sequencing, spatial transcriptomics | Density and Spatial Score risk model | image, transcriptomic data | 59例接受免疫治疗的GC患者(预后分析),110例GC患者(免疫细胞分析),12例单细胞测序样本(4例TLS阳性,8例阴性),2例空间转录组样本 | NA | NA | NA | NA |
| 250 | 2025-05-07 |
Single-cell sequencing provides clues about the developmental genetic basis of evolutionary adaptations in syngnathid fishes
2025-Feb-03, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.97764
PMID:39898521
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序技术探索了海龙科鱼类进化适应的发育遗传基础 | 首次构建了海湾管鱼胚胎的单细胞RNA测序图谱,揭示了其特殊性状(如雄性怀孕、无齿等)的发育遗传机制 | 研究仅针对单一物种(海湾管鱼)的胚胎阶段,未来需要跨物种和多发育阶段的比较研究 | 探究海龙科鱼类特殊性状的发育遗传基础 | 海湾管鱼胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 海湾管鱼胚胎样本(具体数量未明确说明) | NA | NA | NA | NA |
| 251 | 2025-05-07 |
Optimized gene transduction in human lung organoids: A high-efficiency method for advanced research applications
2025-Feb-03, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-07461-w
PMID:39900972
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研究论文 | 本文优化了一种提高慢病毒载体在人iPSC来源肺类器官中转导效率的方法 | 通过物理破坏类器官增加表面积并结合旋转接种法,显著提高了转导效率 | 方法可能不适用于其他类型的类器官或细胞模型 | 提高基因转导效率以促进肺研究和疾病模型研究 | 人iPSC来源的肺类器官 | 生物医学工程 | 肺疾病 | 慢病毒载体转导、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 252 | 2025-05-07 |
IgG Signalling Involves in Skin Inflammation of Atopic Dermatitis
2025-Feb, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.70058
PMID:39912287
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研究论文 | 本研究探讨了IgE产生B细胞及其他免疫球蛋白同种型(特别是IgG)在特应性皮炎(AD)皮肤病变中的作用 | 揭示了IgG在AD皮肤炎症中的潜在作用及其通过巨噬细胞促进Th2炎症的机制 | 未明确IgG具体通过何种机制激活巨噬细胞及促进炎症 | 研究IgE产生B细胞及其他免疫球蛋白同种型在AD皮肤病变中的作用 | 特应性皮炎患者及非过敏性健康受试者的皮肤病变和PBMCs | 免疫学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序、BCR库分析 | NA | mRNA数据、单细胞RNA测序数据 | AD患者及健康受试者的皮肤病变和PBMCs样本 | NA | NA | NA | NA |
| 253 | 2025-10-07 |
PFKFB3 decreases α-ketoglutarate production while partial PFKFB3 knockdown in macrophages ameliorates arthritis in tumor necrosis factor-transgenic mice
2025-Feb-20, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114102
PMID:39870011
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研究论文 | 本研究探讨PFKFB3在类风湿关节炎巨噬细胞中的作用机制及其对疾病发展的影响 | 首次揭示PFKFB3通过调控谷氨酸脱氢酶活性和α-酮戊二酸产生来调节巨噬细胞极化状态 | 研究主要基于细胞和小鼠模型,人类样本验证仍需进一步扩展 | 探究PFKFB3在类风湿关节炎巨噬细胞活化中的作用及其分子机制 | RA患者PBMCs、THP-1细胞、条件性PFKFB3敲除小鼠的骨髓源性巨噬细胞 | 免疫学 | 类风湿关节炎 | 单细胞测序、免疫共沉淀、基因敲除、细胞培养 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据、细胞表型数据 | RA患者和健康志愿者的PBMCs、THP-1细胞系、基因工程小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 254 | 2025-10-07 |
Targeted FTO knockout in endothelial cells Boosts adhesion and lowers inflammatory infiltration to alleviate pulmonary arterial hypertension
2025-Feb-16, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151339
PMID:39869947
|
研究论文 | 本研究探讨了内皮细胞特异性FTO敲除对肺动脉高压发展的影响 | 首次揭示内皮细胞FTO在肺动脉高压中的作用机制,发现其通过调节内皮细胞粘附和炎症细胞浸润影响疾病发展 | 研究主要聚焦于内皮细胞,未涉及其他细胞类型在肺动脉高压中的潜在作用 | 探究FTO蛋白在肺动脉高压发病机制中的作用 | 内皮细胞和肺动脉高压小鼠模型 | 单细胞生物学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序,基因敲除 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 255 | 2025-10-07 |
Engineered Extracellular Vesicles Modified by Angiopep-2 Peptide Promote Targeted Repair of Spinal Cord Injury and Brain Inflammation
2025-02-04, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.4c14675
PMID:39853366
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研究论文 | 本研究开发了Angiopep-2肽修饰的工程化细胞外囊泡,用于促进脊髓损伤的靶向修复和减轻脑部炎症 | 首次将Angiopep-2肽应用于脊髓损伤治疗,通过褪黑素预处理增强工程化细胞外囊泡的功能,实现同时对脊髓损伤部位和脑部的靶向治疗 | NA | 开发能够靶向脊髓损伤部位并具有抗炎修复功能的工程化细胞外囊泡 | 小鼠脊髓损伤模型、M2小胶质细胞、神经元和少突胶质前体细胞 | 生物医学工程 | 脊髓损伤 | 单细胞测序, 单核测序, 免疫荧光, miRNA测序 | NA | 测序数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 256 | 2025-10-07 |
Mouse gut blueprint: regionality and resilience
2025-Feb, Trends in immunology
IF:13.1Q1
DOI:10.1016/j.it.2025.01.004
PMID:39880712
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研究论文 | 利用空间转录组学构建小鼠肠道全面图谱,研究其在扰动条件下的适应性与恢复能力 | 首次通过空间转录组学揭示小鼠肠道区域化结构的适应能力及其协调响应机制 | NA | 探索小鼠肠道在扰动条件下的适应性与恢复机制 | 小鼠肠道组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 257 | 2025-10-07 |
Spatially resolved transcriptomics and graph-based deep learning improve accuracy of routine CNS tumor diagnostics
2025-Feb, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-024-00904-z
PMID:39880907
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研究论文 | 开发结合空间转录组学和图神经网络的神经病理学空间转录组分析方法,用于中枢神经系统肿瘤的精确诊断 | 提出NePSTA方法,能够从单个5微米组织切片同时进行形态学和分子神经病理学诊断,克服了传统分子诊断对DNA质量和数量的限制 | 需要在四个医疗中心的130名参与者中进行进一步验证,方法对组织样本处理可能有特殊要求 | 提高中枢神经系统肿瘤常规诊断的准确性 | 中枢神经系统恶性肿瘤患者和健康捐赠者的组织样本 | 数字病理学 | 中枢神经系统肿瘤 | 空间转录组学,DNA甲基化分析,下一代测序 | 图神经网络 | 空间转录组数据,组织图像数据 | 130名参与者(包括CNS恶性肿瘤患者和健康捐赠者) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 258 | 2025-10-07 |
Automated Laser-Assisted Single-Cell Sorting for Cell Functional and RNA Sequencing
2025-Feb-28, ACS sensors
IF:8.2Q1
DOI:10.1021/acssensors.4c02417
PMID:39843241
|
研究论文 | 开发了一种自动化激光辅助单细胞分选系统,用于细胞功能研究和RNA测序 | 将激光诱导正向转移技术与高通量皮升微孔阵列相结合,实现高效自动化的单细胞分选 | NA | 开发高效准确单细胞分选技术用于下游分析 | 单细胞,特别是稀有转染PC-9细胞 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序,激光诱导正向转移 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 259 | 2025-10-07 |
NFE2-driven neutrophil polarization promotes pancreatic cancer liver metastasis progression
2025-02-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.115226
PMID:39827463
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和空间转录组学揭示了胰腺癌肝转移中NFE2驱动的中性粒细胞极化促进转移进展的机制 | 首次发现NFE2是调控中性粒细胞表型极化的关键转录因子,并阐明其在胰腺癌肝转移前沿通过诱导中性粒细胞胞外陷阱形成的具体机制 | NA | 探究胰腺癌肝转移过程中中性粒细胞的免疫重塑作用及其分子机制 | 胰腺癌肝转移组织中的中性粒细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间分布数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 260 | 2025-10-07 |
Combining T cell receptor sequencing and transcriptomics to characterize tissue-resident T cells from human gut biopsies
2025-Feb-16, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151353
PMID:39837221
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研究论文 | 本研究首次结合流式细胞术、T细胞受体测序和转录组学技术分析人类胃肠道活检组织中的组织驻留T细胞 | 首次将流式细胞术、TCR测序和转录组学技术相结合,从批量分选的T细胞和单细胞水平分析T细胞受体库 | 概念验证研究,样本量有限,多种技术整合仍处于发展初期 | 表征人类胃肠道活检组织中组织驻留T细胞的特性 | 胃和结肠活检样本及血液样本,来自伴有或不伴有糜烂性胃炎相关炎症的患者 | 免疫学 | 胃肠道疾病 | T细胞受体测序,转录组学,流式细胞术,单细胞测序 | NA | 基因表达数据,TCR序列数据 | 胃、结肠活检样本和血液样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞测序,下一代测序 | NA | NA |