单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 652 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomic characterization of a Carnegie stage 7 human embryo
2025-Feb, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-024-01597-3
PMID:39794460
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术对卡内基第7期人类胚胎进行单细胞分辨率分析 | 首次使用空间转录组学技术分析完整人类原肠胚，揭示了中胚层亚型早期特化和原始生殖细胞位置等新发现 | 人类早期胚胎组织获取困难，仅分析了两个胚胎样本 | 研究人类原肠胚发育过程中的细胞谱系多样化和形态发生运动 | 卡内基第7期人类胚胎 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，免疫荧光验证 | NA | 空间转录组数据，三维模型数据 | 2个人类胚胎（1个用于主要分析，1个用于验证） | NA | 空间转录组学，Stereo-seq | NA | 82个连续冷冻切片，Stereo-seq技术 |
| 182 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals intrahepatic signature related to pathobiology of duck hepatitis A virus type 3 (DHAV-3) infection
2025-Feb, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2025.104798
PMID:39799860
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了鸭甲型肝炎病毒3型感染过程中易感与抗性鸭子的肝内分子特征差异 | 首次在鸭病毒性肝炎研究中应用单细胞RNA测序技术，识别了PLAC8作为促进DHAV-3感染的宿主因子，并发现了补体凝血级联和ANGPTL4在易感鸭子中的特异性失调 | 样本量相对有限（14只感染鸭+4只健康对照），研究聚焦于肝脏组织可能忽略其他器官的病理变化 | 解析DHAV-3感染过程中鸭子肝脏的分子病理特征和免疫反应机制 | DHAV-3易感鸭、抗性鸭和健康对照鸭的肝脏细胞 | 单细胞转录组学 | 病毒性肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 14只感染鸭（包含易感和抗性个体）和4只健康对照鸭，共140万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 183 | 2025-10-07 |
Left superior cervical ganglia lymph node mimicry and its role in rat ventricular arrhythmias following myocardial infarction
2025-Feb, Acta physiologica (Oxford, England)
DOI:10.1111/apha.14279
PMID:39803764
|
研究论文 | 本研究探讨左侧颈上神经节在心肌梗死后室性心律失常中的作用机制 | 首次揭示颈上神经节通过神经生长因子介导神经-免疫互作参与心律失常的机制 | 研究仅在大鼠模型中进行，需进一步临床验证 | 研究心肌梗死后颈上神经节对神经-心脏通讯的功能意义 | 心肌梗死模型大鼠 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | RNA-seq, 空间转录组学, qPCR, 蛋白质印迹 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 电生理数据 | 心肌梗死模型大鼠 | NA | 空间转录组学, RNA-seq | NA | NA |
| 184 | 2025-10-07 |
Specialized pericyte subtypes in the pulmonary capillaries
2025-Feb, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-024-00349-1
PMID:39806101
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和单细胞RNA测序鉴定出肺毛细血管中两种不同的周细胞亚型 | 首次发现Higd1b作为周细胞特异性标记基因，并揭示了两种功能不同的周细胞亚型在缺氧条件下的差异反应 | 研究主要聚焦于肺和心脏组织，其他器官周细胞的特异性尚未验证 | 探究肺毛细血管周细胞的生物学特性和在肺动脉高压中的作用 | 小鼠模型和人类肺周细胞 | 细胞生物学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析,RNAscope,基因敲入小鼠模型 | Higd1b-CreERT2敲入小鼠模型 | 基因表达数据,细胞表型数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 185 | 2025-10-07 |
Droplet microfluidics: unveiling the hidden complexity of the human microbiome
2025-Feb-25, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d4lc00877d
PMID:39775305
|
综述 | 本文系统介绍了液滴微流控技术在揭示人类微生物组复杂性的原理、功能和应用 | 重点阐述液滴微流控在增强单细胞测序技术、培养不可培养微生物及研究微生物相互作用方面的突破性作用 | 作为综述文章未涉及具体实验数据验证 | 探讨液滴微流控技术在微生物组研究中的转化潜力 | 人类微生物组 | 微生物组学 | NA | 液滴微流控，单细胞测序 | NA | 基因组数据，RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，基因组测序 | NA | NA |
| 186 | 2025-10-07 |
Spatial proteomics reveals sirtuin 1 to be a determinant of T-cell infiltration in human melanoma
2025-Feb-18, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljae433
PMID:39739311
|
研究论文 | 本研究通过空间蛋白质组学技术揭示SIRT1是黑色素瘤中T细胞浸润的关键决定因子 | 首次结合多种空间蛋白质组学技术系统分析黑色素瘤微环境，发现SIRT1作为mTOR信号负调控因子在T细胞富集区高表达 | 研究主要基于小鼠模型和回顾性数据分析，需要进一步临床验证 | 解析决定肿瘤浸润淋巴细胞分布的生物学过程及其对免疫检查点抑制剂疗效的影响 | 人类黑色素瘤组织样本和同源小鼠黑色素瘤模型 | 空间蛋白质组学 | 黑色素瘤 | 显微镜技术,基质辅助激光解吸质谱成像,液相色谱-质谱联用,单细胞RNA测序,生物信息学分析 | NA | 蛋白质组数据,转录组数据,免疫组织化学数据 | 人类黑色素瘤组织样本和两种同源小鼠模型 | NA | 空间蛋白质组学,单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 187 | 2025-10-07 |
PTN secreted by cardiac fibroblasts promotes myocardial fibrosis and inflammation of pressure overload-induced hypertrophic cardiomyopathy through the PTN-SDC4 pathway
2025-Feb-15, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2024.123356
PMID:39765325
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现心脏成纤维细胞分泌的PTN通过PTN-SDC4通路促进压力超负荷诱导的肥厚型心肌病的心肌纤维化和炎症反应 | 首次揭示心脏成纤维细胞通过分泌PTN配体与巨噬细胞SDC4受体相互作用在压力超负荷诱导的肥厚型心肌病中的关键作用机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 探索压力超负荷诱导的肥厚型心肌病中心脏不同细胞间的通讯网络 | 横主动脉缩窄手术诱导的肥厚型心肌病小鼠模型 | 单细胞转录组学 | 肥厚型心肌病 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 免疫荧光, Western blot, 超声心动图 | NA | 单细胞RNA测序数据, 实验验证数据 | GSE137167数据集的小鼠心脏单细胞数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 188 | 2025-10-07 |
SPP1-mediated M2 macrophage polarization shapes the tumor microenvironment and enhances prognosis and immunotherapy guidance in nasopharyngeal carcinoma
2025-Feb-06, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113944
PMID:39742726
|
研究论文 | 本研究探讨SPP1在鼻咽癌肿瘤微环境中的作用及其通过调控M2巨噬细胞极化影响预后的机制 | 首次揭示SPP1通过CD44/JAK2/STAT3信号通路促进M2巨噬细胞极化的机制，并建立基于机器学习的SPP1相关M2巨噬细胞特征标志 | 研究主要基于回顾性数据，需要进一步的前瞻性研究验证 | 探索SPP1在鼻咽癌肿瘤微环境中的作用及其临床意义 | 鼻咽癌患者样本和肿瘤细胞-巨噬细胞共培养体系 | 肿瘤免疫学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序，转录组分析，体外共培养实验 | 机器学习框架 | 转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 福建肿瘤医院鼻咽癌队列、GEO数据库数据集和单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 189 | 2025-10-07 |
Unveiling the role of ACTL6A in uveal melanoma metastasis and immune microenvironment
2025-Feb-06, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113841
PMID:39746274
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析揭示ACTL6A在葡萄膜黑色素瘤转移和免疫微环境中的作用 | 发现ACTL6A作为葡萄膜黑色素瘤预后不良的风险因子，并通过单细胞转录组测序鉴定出新的免疫细胞亚群 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，缺乏实验验证 | 评估ACTL6A在葡萄膜黑色素瘤预后和发展中的机制和临床价值 | 葡萄膜黑色素瘤患者样本和肿瘤微环境 | 生物信息学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析 | Kaplan-Meier分析, QUANTISEQ, MCP-counter | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 来自TCGA和8个GEO数据库的葡萄膜黑色素瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 190 | 2025-10-07 |
Shared chemoresistance genes in ESCC and cervical Cancer: Insights from pharmacogenomics and Mendelian randomization
2025-Feb-06, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113933
PMID:39755112
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化和药物基因组学方法，识别食管鳞状细胞癌和宫颈癌中共享的化疗耐药基因 | 首次结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化方法，系统分析CD8+T效应记忆细胞在两种上皮源性肿瘤化疗耐药中的关键作用 | 研究依赖于现有基因组关联研究数据，样本来源和数量可能存在限制 | 探索食管鳞状细胞癌和宫颈癌化疗耐药的共同遗传机制 | 食管鳞状细胞癌和宫颈癌患者样本 | 生物信息学 | 食管癌,宫颈癌 | 单细胞RNA测序,孟德尔随机化,MTT检测,免疫组化 | 孟德尔随机化模型 | 基因组数据,单细胞转录组数据 | 多个队列的基因组关联研究数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 191 | 2025-10-07 |
KLF2-dependent transcriptional regulation safeguards the heart against pathological hypertrophy
2025-Feb, Journal of molecular and cellular cardiology
IF:4.9Q2
DOI:10.1016/j.yjmcc.2024.12.010
PMID:39733990
|
研究论文 | 本研究揭示了转录因子KLF2在心脏中的保护作用，证明其通过直接调控与心脏肥大相关基因来抑制病理性心脏肥大 | 首次证明KLF2是心脏肥大的负调控因子，并发现辛伐他汀可通过提升KLF2表达缓解心肌细胞肥大 | 研究主要基于动物模型和细胞实验，尚未在人类临床环境中验证 | 探究转录因子KLF2在心肌细胞生物学中的作用及其对心脏肥大的调控机制 | 雄性C57BL/6J小鼠、新生大鼠心室肌细胞、人胚胎干细胞来源的心肌细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, RNA-seq, CUT&Tag | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据 | 多种动物模型和细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 192 | 2025-10-07 |
Laser-capture microdissection for spatial transcriptomics of immunohistochemically detected neurons
2025-Feb, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2024.108150
PMID:39736395
|
研究论文 | 开发了一种用于免疫组化检测神经元空间转录组学的IHC/LCM-Seq方法 | 使用铝试剂和聚乙烯磺酸开发创新的RNA保存策略，在4%甲醛固定脑组织的游离切片中保持RNA完整性 | NA | 开发用于免疫组化检测神经元空间转录组学的高灵敏度方法 | 纹状体胆碱能中间神经元和促性腺激素释放激素(GnRH)神经元 | 空间转录组学 | NA | 激光捕获显微切割，免疫组织化学，RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 成年雄性大鼠和小鼠的GnRH神经元 | Illumina | bulk RNA-seq | NextSeq | Illumina NextSeq平台 |
| 193 | 2025-10-07 |
Sex-dependent molecular landscape of Alzheimer's disease revealed by large-scale single-cell transcriptomics
2025-Feb, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.14476
PMID:39737748
|
研究论文 | 通过大规模单细胞转录组学研究揭示阿尔茨海默病中性别依赖的分子特征 | 首次利用大规模单细胞转录组图谱系统揭示阿尔茨海默病中性别特异的分子变化，包括细胞类型特异性基因表达、通路改变和细胞间通讯模式 | 研究仅基于前额叶皮层样本，未涵盖其他脑区；机制验证实验不足 | 探究阿尔茨海默病中性别差异的分子机制 | 人类前额叶皮层细胞 | 单细胞转录组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 差异基因表达分析、通路富集分析、基因调控网络构建、细胞通讯分析 | 单细胞转录组数据 | 大规模人类前额叶皮层单细胞图谱 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 194 | 2025-10-07 |
Aldehyde Dehydrogenase 2 Lactylation Aggravates Mitochondrial Dysfunction by Disrupting PHB2 Mediated Mitophagy in Acute Kidney Injury
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202411943
PMID:39737891
|
研究论文 | 本研究揭示了ALDH2乳酸化通过破坏PHB2介导的线粒体自噬加重急性肾损伤中线粒体功能障碍的机制 | 首次发现ALDH2蛋白的K52位点乳酸化修饰及其在急性肾损伤中的致病作用，并阐明其通过促进PHB2泛素化降解抑制线粒体自噬的分子机制 | 研究主要基于细胞和小鼠模型，在人类患者中的验证仍需进一步研究 | 探究乳酸化修饰在急性肾损伤发病机制中的作用及分子机制 | 急性肾损伤患者和小鼠的肾组织、HK-2人肾小管上皮细胞 | 分子生物学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序, 免疫沉淀-质谱分析, 腺相关病毒感染 | NA | 基因表达数据, 蛋白质相互作用数据 | AKI患者和小鼠肾组织样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 195 | 2025-10-07 |
A Distinguished Roadmap of Fibroblast Senescence in Predicting Immunotherapy Response and Prognosis Across Human Cancers
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202406624
PMID:39739618
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现成纤维细胞在肿瘤相关细胞群中表现出最显著的细胞衰老特征，并开发了成纤维细胞衰老相关转录组特征用于预测免疫检查点抑制剂反应和预后 | 首次系统性地揭示了成纤维细胞衰老在肿瘤免疫治疗耐药中的关键作用，并开发了基于机器学习的预测框架 | 需要进一步的临床验证来确认这些发现的临床应用价值 | 探究细胞衰老与肿瘤免疫治疗耐药的关系，并开发预测免疫治疗反应的生物标志物 | 人类多种癌症类型中的成纤维细胞和肿瘤微环境 | 生物信息学 | 多种癌症 | 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9筛选, 机器学习 | 机器学习框架 | 单细胞转录组数据, 基因组编辑数据 | 多个验证队列和内部队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 196 | 2025-10-07 |
Tertiary Lymphoid Structures are Linked to Enhanced Antitumor Immunity and Better Prognosis in Muscle-Invasive Bladder Cancer
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202410998
PMID:39739621
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法探讨三级淋巴结构在肌层浸润性膀胱癌中的预后价值及免疫机制 | 首次系统揭示CXCL13+ T细胞通过CXCR5/NR4A2轴促进三级淋巴结构形成的机制，并开发了TLS特异性基因标志物 | 研究样本量有限，机制研究仍需进一步实验验证 | 探究三级淋巴结构与肌层浸润性膀胱癌预后的关系及其免疫机制 | 肌层浸润性膀胱癌患者样本 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序,免疫组织化学 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据,组织图像数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | NA |
| 197 | 2025-10-07 |
Clonal GZMK+CD8+ T cells are identified as a hallmark of the pathogenesis of cGVHD-induced bronchiolitis obliterans syndrome after allogeneic hematopoietic stem cell transplantation
2025-Feb, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105535
PMID:39740295
|
研究论文 | 本研究通过多组学技术鉴定出克隆性GZMK+CD8+ T细胞是cGVHD诱导的闭塞性细支气管炎综合征发病机制的关键标志物 | 首次发现循环GZMK+CD8+ T细胞在cGVHD-BOS患者中积累，并证实GZMK可诱导人成纤维细胞表达纤维化必需蛋白 | 样本量有限（22例cGVHD患者和11例对照），需更大规模研究验证 | 探索cGVHD诱导的闭塞性细支气管炎综合征的发病机制 | 异基因造血干细胞移植后患者和小鼠模型 | 免疫学 | 移植物抗宿主病 | 质谱流式细胞术,RNA测序,定量细胞因子阵列,单细胞RNA测序,单细胞V(D)J测序 | NA | 单细胞数据,基因表达数据,蛋白质数据 | 22例cGVHD患者和11例无cGVHD患者 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞V(D)J测序 | NA | NA |
| 198 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics of esophageal squamous cell carcinoma with lymph node metastases
2025-Feb, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-024-01369-x
PMID:39741182
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术研究食管鳞癌淋巴结转移的细胞和分子特征 | 首次结合单细胞测序、空间转录组学和多重免疫组化技术系统分析食管鳞癌淋巴结转移的细胞亚群和分子机制 | 样本量较小（12例患者），需要更大规模研究验证 | 探索食管鳞癌淋巴结转移的细胞和分子特征 | 食管鳞癌患者的原发肿瘤组织、癌旁组织、转移性和非转移性淋巴结 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫组化 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 免疫组化图像 | 12例转移性食管鳞癌患者，共分析161,333个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 199 | 2025-10-07 |
CD300E+ macrophages facilitate liver regeneration after splenectomy in decompensated cirrhotic patients
2025-Feb, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-024-01371-3
PMID:39741181
|
研究论文 | 本研究探讨脾切除术后CD300E+巨噬细胞在肝硬化患者肝脏再生中的作用机制 | 首次发现CD300E+巨噬细胞通过分泌NAMPT促进肝细胞NAD合成从而驱动肝脏再生 | 样本量有限（54例患者，3对配对肝组织），需更大规模研究验证 | 探索脾切除后肝硬化患者肝脏再生的免疫机制 | 失代偿期肝硬化患者及小鼠肝硬化模型 | 单细胞生物学 | 肝硬化 | 单细胞RNA测序 | 小鼠肝硬化模型，共培养系统 | 单细胞转录组数据，临床数据 | 54例患者，3对配对肝组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 200 | 2025-10-07 |
SPOCK2 controls the proliferation and function of immature pancreatic β-cells through MMP2
2025-Feb, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-024-01380-2
PMID:39741186
|
研究论文 | 本研究揭示了SPOCK2通过调控MMP2表达抑制未成熟胰腺β细胞增殖的分子机制 | 首次发现SPOCK2作为细胞外基质蛋白通过MMP2-β整合素-FAK-c-JUN通路调控未成熟β细胞增殖的新机制 | 研究主要基于干细胞来源的β细胞，需要进一步验证在原生胎儿β细胞中的适用性 | 探索调控未成熟胰腺β细胞增殖和功能的分子机制 | 人多能干细胞来源的β细胞(SC-β-cells) | 干细胞生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, 双向表达调控 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |