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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2025-10-06 |
Myelin-reactive CD8+ T cells influence conventional dendritic cell subsets towards a mature and regulatory phenotype in experimental autoimmune encephalomyelitis
2025-Feb-28, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03377-8
PMID:40022134
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研究论文 | 本研究揭示了髓鞘反应性CD8+ T细胞通过调节传统树突状细胞亚群表型抑制实验性自身免疫性脑脊髓炎的机制 | 首次发现髓鞘反应性CD8+ T细胞可直接与cDC1相互作用并通过旁分泌机制调节CD11b cDC,诱导成熟调节性树突状细胞表型 | 研究主要基于小鼠EAE模型,人类多发性硬化症的适用性需要进一步验证 | 阐明髓鞘反应性CD8+ T细胞在实验性自身免疫性脑脊髓炎中的免疫调节机制 | 小鼠模型中的髓鞘反应性CD8+ T细胞和传统树突状细胞亚群(cDC1和CD11b cDC) | 免疫学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序,过继性T细胞转移,体外共培养 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 182 | 2025-10-06 |
Estimating the cis -heritability of gene expression using single cell expression profiles controls false positive rate of eGene detection
2025-Feb-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.24.639892
PMID:40060452
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研究论文 | 开发了一种名为scGeneHE的新统计方法,用于从单细胞RNA测序数据中准确估计基因表达的顺式遗传力 | 提出了首个能够直接使用单细胞表达谱而非伪批量数据来估计基因表达遗传力的方法,解决了传统方法导致的假阳性率膨胀问题 | 方法性能依赖于模拟参数设置,需要在实际应用中进一步验证 | 开发准确估计基因表达顺式遗传力的统计方法,控制eGene检测的假阳性率 | 基因表达性状和遗传调控 | 生物信息学 | 免疫介导疾病 | 单细胞RNA测序 | 泊松混合效应模型 | 单细胞基因表达数据 | 来自969个个体、11种免疫细胞类型、总计822,552个细胞的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 183 | 2025-10-06 |
Unveiling the cell-type-specific landscape of cellular senescence through single-cell transcriptomics using SenePy
2025-Feb-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57047-7
PMID:39987255
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研究论文 | 开发了基于单细胞转录组学的细胞衰老分析算法SenePy,用于识别不同细胞类型和组织中的衰老细胞 | 创建了首个能够定义细胞类型特异性衰老特征的分析平台,优于体外研究获得的衰老特征 | NA | 开发识别细胞衰老的分析工具并研究其在衰老和疾病中的作用 | 小鼠和人类细胞 | 生物信息学 | 肿瘤发生、炎症、心肌梗死 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 72个小鼠样本和64个人类样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 184 | 2025-10-06 |
Emergence of inflammatory fibroblasts with aging in Hermansky-Pudlak syndrome associated pulmonary fibrosis
2025-Feb-22, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-07589-9
PMID:39987372
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了Hermansky-Pudlak综合征相关肺纤维化中炎症性成纤维细胞随年龄增长而出现的机制 | 首次在HPS小鼠模型中鉴定出年龄依赖性的SAA3炎症性肺成纤维细胞增加,并发现HPS1和HPS2亚型中不同的细胞相互作用机制 | 研究样本量有限,仅包含小鼠模型和三名HPS1患者 | 探究肺纤维化发生和发展的纵向细胞相互作用机制 | 年轻和年老HPS小鼠模型及HPS1患者的肺组织 | 单细胞基因组学 | 肺纤维化 | scRNA-seq, 共培养实验 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 多亚型HPS小鼠模型和3名HPS1患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 185 | 2025-10-06 |
Single-Cell Omics for Transcriptome CHaracterization (SCOTCH): isoform-level characterization of gene expression through long-read single-cell RNA sequencing
2025-Feb-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.29.590597
PMID:38746128
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研究论文 | 开发了一套名为SCOTCH的计算方法套件,用于长读长单细胞RNA测序数据的转录组表征 | 利用Oxford Nanopore R10流动池降低测序错误率的优势,无需传统短读长条形码空间构建方法,通过亚外显子识别策略和动态阈值实现精确的异构体比对和新异构体发现 | NA | 开发针对长读长单细胞RNA测序数据的计算方法,提升转录组复杂性分析能力 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 长读长单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | Oxford Nanopore, PacBio, 10X Genomics, Parse Biosciences, Illumina | 单细胞RNA测序, 长读长测序 | Nanopore R9流动池, Nanopore R10流动池, PacBio测序平台 | 支持Nanopore和PacBio测序平台,兼容10X Genomics和Parse Biosciences单细胞文库制备方案 |
| 186 | 2025-10-06 |
Multiple Myeloma Insights from Single-Cell Analysis: Clonal Evolution, the Microenvironment, Therapy Evasion, and Clinical Implications
2025-Feb-14, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17040653
PMID:40002248
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综述 | 通过单细胞技术解析多发性骨髓瘤的克隆演化、肿瘤微环境相互作用及治疗耐药机制 | 系统整合单细胞多组学技术揭示多发性骨髓瘤细胞异质性、克隆演化轨迹及肿瘤微环境在治疗抵抗中的作用机制 | 单细胞技术临床应用面临成本高昂、数据复杂性、缺乏标准化分析流程及伦理问题等挑战 | 探讨多发性骨髓瘤的疾病进展机制并推动个体化治疗策略发展 | 多发性骨髓瘤的肿瘤细胞、肿瘤微环境及临床患者 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞转录组学、单细胞基因组学、单细胞多组学 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 187 | 2025-10-06 |
Suppressing recurrence in Sonic Hedgehog subgroup medulloblastoma using the OLIG2 inhibitor CT-179
2025-Feb-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54861-3
PMID:39904981
|
研究论文 | 本研究探讨OLIG2抑制剂CT-179在SHH亚型髓母细胞瘤中抑制肿瘤复发的治疗潜力 | 首次发现脑渗透性口服OLIG2抑制剂CT-179可通过破坏OLIG2二聚化、磷酸化和DNA结合来靶向肿瘤干细胞 | 研究主要基于临床前模型,尚未进行人体临床试验 | 开发针对SHH亚型髓母细胞瘤OLIG2+肿瘤干细胞的特异性治疗方法 | SHH亚型髓母细胞瘤外植体类器官、PDX模型和GEM模型 | 癌症研究 | 髓母细胞瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 多种临床前模型(未明确具体样本数量) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 188 | 2025-10-06 |
BRD4 inhibition rewires cardiac macrophages toward a protective phenotype marked by low MHC class II expression
2025-Feb-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00438.2024
PMID:39716819
|
研究论文 | 本研究揭示BRD4抑制剂通过调控心脏巨噬细胞表型转化,减少促炎单核细胞招募并促进修复性表型,从而改善心脏缺血再灌注损伤 | 首次阐明BRD4抑制剂通过细胞自主机制调控心脏巨噬细胞MHC-II表达和NF-κB信号通路,实现巨噬细胞表型重编程 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 探究BET抑制剂改善心脏结构和功能的细胞机制 | 心脏巨噬细胞、单核细胞、心脏成纤维细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 基因敲除 | NA | 基因表达数据 | 小鼠心脏组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 189 | 2025-10-06 |
Variants and vaccines impact nasal immunity over three waves of SARS-CoV-2
2025-Feb, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-02052-z
PMID:39833605
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析不同SARS-CoV-2变异株和疫苗接种状态对鼻黏膜免疫反应的影响 | 首次系统比较了原始毒株、Delta和Omicron变异株感染下鼻黏膜单细胞水平的免疫反应差异,并揭示了疫苗接种对鼻腔巨噬细胞的激活作用 | 样本量相对有限,未涵盖所有SARS-CoV-2变异株,且主要关注急性感染期 | 探究SARS-CoV-2不同变异株和疫苗接种状态如何影响人类鼻黏膜的细胞免疫反应 | 接种和未接种疫苗的成人Delta和Omicron SARS-CoV-2急性感染者的鼻咽拭子样本 | 单细胞基因组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确具体样本数量,包括接种和未接种疫苗的Delta、Omicron和原始毒株感染者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 190 | 2025-10-06 |
SELP+ TEC:CD8+ T cell crosstalk associates with improved radiotherapy efficacy in cervical cancer
2025-Feb-03, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02244-7
PMID:39901166
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研究论文 | 本研究探讨了宫颈癌中SELP+肿瘤内皮细胞与CD8+ T细胞通过ACKR1-CCL5轴的相互作用对放疗疗效的影响 | 首次发现SELP在宫颈癌特定内皮细胞亚群中的表达与抗癌免疫反应相关,并揭示了SELP TEC与CD8+ T细胞通过ACKR1-CCL5轴互作的新机制 | SELP影响抗癌免疫的具体机制及其在放疗反应中的确切作用尚未完全阐明 | 探究SELP在宫颈癌中对抗癌免疫的影响及其在放疗反应中的作用机制 | 宫颈癌患者肿瘤组织样本、单细胞RNA测序数据和批量RNA测序数据 | 癌症免疫学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 205例宫颈癌患者肿瘤组织样本,8例患者的42,159个细胞的scRNA-seq数据,187例放疗患者的批量RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 191 | 2025-10-06 |
Inhibition of methylthioadenosine phosphorylase provides protection from experimental acute kidney injury
2025-Feb-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.19.639065
PMID:40027701
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研究论文 | 本研究探讨抑制甲基硫腺苷磷酸化酶(MTAP)对实验性急性肾损伤的保护作用 | 首次提出MTAP抑制作为急性肾损伤的新型肾脏保护策略 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床适用性有待验证 | 开发急性肾损伤的新型治疗策略 | 急性肾损伤小鼠模型和人类单细胞RNA测序数据 | 肾脏病学 | 急性肾损伤 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 组织学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 192 | 2025-10-06 |
A single-cell transcriptomic atlas of developing inhibitory neurons reveals expanding and contracting modes of diversification
2025-Feb-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.19.636192
PMID:40027755
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研究论文 | 本研究通过构建发育中抑制性神经元的单细胞转录组图谱,揭示了SST+神经元多样化的三种不同模式 | 开发了计算流程富集和整合稀有细胞类型,构建了包含超过51,000个SST+神经元的发育图谱,首次发现抑制性神经元多样化的三种模式:不变、扩张和收缩 | 主要基于小鼠数据,人类数据验证有限;稀有细胞类型的捕获仍存在技术挑战 | 探究大脑皮层抑制性神经元多样性在发育过程中的形成机制 | 小鼠和人类胎儿的生长抑素表达(SST+)抑制性神经元 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | 计算分析流程 | 单细胞转录组数据 | 超过51,000个小鼠SST+神经元 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 193 | 2025-10-06 |
Tissue extracellular vesicles suppress neonatal cardiac regeneration: a Pak2-Erk1/2-mediated macrophage paracrine signaling
2025-Feb-14, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2024193
PMID:39949198
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研究论文 | 本研究揭示了新生儿心肌组织来源的细胞外囊泡通过Pak2-Erk1/2轴调控巨噬细胞旁分泌活动,从而抑制心肌细胞增殖的机制 | 首次发现出生后第8天心肌组织来源的细胞外囊泡通过Pak2-Erk1/2信号通路调控巨噬细胞功能,进而影响心肌细胞增殖能力 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类样本中验证;具体囊泡内容物的作用机制仍需进一步探索 | 探究心肌组织来源的细胞外囊泡对新生儿心脏再生能力的影响机制 | 小鼠心肌组织、细胞外囊泡、巨噬细胞、新生儿心肌细胞 | 心血管生物学 | 心血管疾病 | 生物信息学分析、高通量组学、单细胞测序、共培养实验 | NA | 单细胞测序数据、组学数据 | 小鼠出生后第1天和第8天心肌组织 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 194 | 2025-10-06 |
Similarities and differences in the response and molecular characteristics of peripheral sensory neurons associated with pain and itch
2025-Feb-14, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2024202
PMID:39953797
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研究论文 | 本研究通过双光子钙成像和单细胞RNA测序技术,探索了背根神经节神经元对疼痛和瘙痒刺激的响应差异及分子特征 | 首次系统比较了多感觉神经元和单感觉神经元对疼痛和瘙痒的响应差异,并揭示了不同神经元亚群在慢性疼痛和瘙痒发展中的独特转录组变化 | 研究主要聚焦于背根神经节神经元,未涉及中枢神经系统的调控机制 | 探究外周感觉神经元对疼痛和瘙痒刺激的响应差异及分子机制 | 小鼠背根神经节神经元 | 神经科学 | 慢性疼痛和瘙痒 | 双光子钙成像, 单细胞RNA测序 | NA | 钙成像数据, 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 195 | 2025-10-06 |
The impact of ambient contamination on demultiplexing methods for single-nucleus multiome experiments
2025-Feb-10, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5977005/v1
PMID:39989953
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研究论文 | 本研究评估了基因型分型解复用方法在单核多组学实验中对环境RNA/DNA污染的敏感性 | 开发了ambisim基因型感知读取水平模拟器,能够灵活控制环境分子比例并生成真实的联合snRNA/snATAC数据 | 研究主要基于模拟数据,虽然验证了两个真实数据集,但样本数量有限 | 评估不同解复用方法在单核多组学测序实验中对环境污染的鲁棒性 | 单核RNA-seq和ATAC-seq数据 | 单细胞测序分析 | NA | 单核多组学测序,基因型分型解复用 | NA | 单细胞多组学测序数据 | 两个联合snRNA/snATAC数据集 | NA | 单核多组学,单核RNA-seq,单核ATAC-seq | NA | NA |
| 196 | 2025-10-06 |
The impact of ambient contamination on demultiplexing methods for single-nucleus multiome experiments
2025-Feb-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.06.636969
PMID:39975005
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研究论文 | 本研究评估了基因分型解复用方法在单核多组学实验中对环境RNA/DNA污染的敏感性 | 开发了ambisim基因分型感知读取水平模拟器,可灵活控制环境分子比例并生成真实的联合snRNA/snATAC数据 | 方法在不同数据集和模式间的一致性存在差异,需要改进对环境材料的建模 | 评估基因分型解复用方法在单核多组学实验中的性能表现 | 单核RNA-seq和ATAC-seq数据 | 单细胞测序分析 | NA | 单核多组学测序,基因分型解复用 | ambisim模拟器 | 单核RNA-seq和ATAC-seq测序数据 | 两个联合snRNA/snATAC数据集 | NA | 单核多组学测序 | NA | NA |
| 197 | 2025-10-06 |
IL-4 induces CD22 expression to restrain the effector program of virtual memory T cells
2025-02-07, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adk4841
PMID:39919198
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现CD22作为IL-4诱导的虚拟记忆CD8 T细胞表面标志物,并揭示其抑制T细胞效应程序的作用机制 | 首次发现CD22可作为IL-4诱导的虚拟记忆CD8 T细胞选择性表面标志物,并揭示CD22对T细胞效应程序的固有调控功能 | 寄生虫感染模型中IL-4依赖性T细胞激活和扩张的具体调控机制仍需进一步阐明 | 探究IL-4依赖性虚拟记忆CD8 T细胞激活和扩张的调控机制 | 虚拟记忆CD8 T细胞 | 免疫学 | 寄生虫感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 198 | 2025-10-06 |
Fucosylated haptoglobin promotes inflammation via Mincle in sepsis: an observational study
2025-Feb-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56524-3
PMID:39904983
|
观察性研究 | 本研究揭示了败血症患者血浆中岩藻糖基化结合珠蛋白通过Mincle受体促进炎症反应的作用机制 | 首次发现败血症患者血浆中Hp在Asn207和Asn211位点的末端岩藻糖基化水平升高,并阐明其通过Mincle受体激活炎症反应的分子机制 | 观察性研究设计,无法确定因果关系;样本量未明确说明;动物模型结果需要进一步验证 | 探究岩藻糖基化结合珠蛋白在败血症炎症反应中的作用机制 | 败血症患者血浆样本、小鼠模型、巨噬样细胞群体 | 分子生物学 | 败血症 | 单细胞RNA测序,蛋白质纯化,细胞因子检测 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 199 | 2025-10-06 |
Current molecular understanding of central nervous system schwannomas
2025-02-05, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-025-01937-w
PMID:39910685
|
综述 | 本文全面概述了中枢神经系统神经鞘瘤的分子生物学研究现状 | 总结了新型遗传改变如SH3PXD2A::HTRA1融合基因、VGLL融合和SOX10突变,以及单细胞测序和多组学分析等先进技术的应用 | 对神经鞘瘤分子生物学的理解仍不完整,存在现有争议需要解决 | 阐明神经鞘瘤发生和进展的分子机制,指导新治疗靶点开发 | 中枢神经系统神经鞘瘤 | 神经肿瘤学 | 神经鞘瘤 | 单细胞测序, 多组学分析, 基因表达分析, 表观遗传调控分析 | NA | 基因组数据, 表观遗传数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学分析 | NA | NA |
| 200 | 2025-10-06 |
CRISPR-Cas9 screening identifies the role of FER as a tumor suppressor
2025-02, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6374
PMID:39648412
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研究论文 | 通过CRISPR-Cas9筛选发现FER作为肿瘤抑制基因在肿瘤发生发展中的关键作用 | 首次通过体内全基因组CRISPR-Cas9筛选鉴定FER为肿瘤抑制基因,并系统揭示其在肿瘤起始和进展中的功能机制 | 未明确FER在具体肿瘤类型中的作用机制,缺乏临床样本验证 | 系统性识别肿瘤抑制基因以理解肿瘤发生机制并开发早期诊断策略 | FER基因及其在肿瘤发生发展中的功能 | 功能基因组学 | 肿瘤 | CRISPR-Cas9筛选,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |