单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 672 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2025-05-09 |
SpaCcLink: exploring downstream signaling regulations with graph attention network for systematic inference of spatial cell-cell communication
2025-Feb-12, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-025-02141-x
PMID:39939849
|
研究论文 | 提出了一种名为SpaCcLink的空间细胞间通讯分析方法，该方法考虑了细胞内受体的下游影响，并系统地研究了通讯的空间模式和下游信号网络 | SpaCcLink是首个考虑细胞内下游信号传导反应的空间细胞间通讯分析方法，能够系统地解码受细胞间通讯影响的下游基因和信号通路 | 未提及具体的技术限制或数据限制 | 深入理解细胞间通讯机制及其下游信号调控 | 人类和小鼠的空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组技术 | 图注意力网络(GAT) | 空间转录组数据 | 未提及具体样本数量 |
| 182 | 2025-05-09 |
Single-cell transcriptome analysis reveals the dysregulated monocyte state associated with tuberculosis progression
2025-Feb-12, BMC infectious diseases
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12879-025-10612-3
PMID:39939918
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示了与结核病进展相关的单核细胞状态失调 | 揭示了经典和非经典单核细胞在结核病进展中的动态变化及其潜在机制，并识别了关键基因和转录因子 | 研究依赖于公开的单细胞RNA-seq数据，可能受限于样本来源和处理方法的异质性 | 探究单核细胞亚群在结核病免疫反应中的作用 | 单核细胞亚群 | 生物信息学 | 结核病 | 单细胞RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 来自SRP247583的公开数据集 |
| 183 | 2025-05-09 |
STMiner: Gene-centric spatial transcriptomics for deciphering tumor tissues
2025-Feb-12, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100771
PMID:39947134
|
研究论文 | STMiner利用2D高斯混合模型和最优传输理论直接表征基因的空间分布，而非表达这些基因的细胞捕获位置（spots），以解决肿瘤组织空间转录组数据分析中的挑战 | 提出直接分析整体基因表达模式而非spots的方法，有效减轻背景偏差和数据稀疏性的影响，揭示被传统spot分析工具忽略的关键基因集和空间结构 | 未明确提及具体样本量或验证范围 | 解决肿瘤组织空间转录组数据分析中的挑战，促进新的生物学发现 | 肿瘤组织的空间转录组数据 | 空间转录组学 | 肿瘤 | 2D高斯混合模型，最优传输理论 | 高斯混合模型 | 空间转录组数据 | NA |
| 184 | 2025-05-09 |
Integrating Hypoxia Signatures from scRNA-seq and Bulk Transcriptomes for Prognosis Prediction and Precision Therapy in Cervical Squamous Cell Carcinoma and Endocervical Adenocarcinoma
2025-Feb-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26031362
PMID:39941131
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量转录组数据中的缺氧特征，构建了一个CESC特异性缺氧相关评分风险模型，用于预后预测和精准治疗 | 首次结合scRNA-seq和批量转录组数据识别CESC特异性缺氧基因集，并构建了CSHRS风险模型 | 研究样本量未明确说明，且模型验证可能需要在更大规模队列中进行 | 探索CESC中缺氧的机制，开发个性化治疗方案 | 宫颈鳞状细胞癌和宫颈内膜腺癌(CESC) | 数字病理学 | 宫颈癌 | scRNA-seq, WGCNA, LASSO, Cox回归分析 | CSHRS风险模型, nomogram模型 | RNA测序数据 | NA |
| 185 | 2025-05-09 |
H4K12 Lactylation Activated-Spp1 in Reprogrammed Microglia Improves Functional Recovery After Spinal Cord Injury
2025-Feb, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.70232
PMID:39939834
|
研究论文 | 本研究探讨了SPP1信号通路在脊髓损伤中的作用及其调控机制，并评估了其作为治疗靶点的潜力 | 揭示了H4K12乳酸化激活的Spp1在重编程小胶质细胞中的作用，以及其对脊髓损伤后功能恢复的改善 | NA | 探索SPP1信号通路在脊髓损伤中的功能及调控机制，并研究其作为治疗靶点的潜力 | 脊髓损伤（SCI）及小胶质细胞/巨噬细胞 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、假时间分析、DNA-pulldown | NA | RNA测序数据 | NA |
| 186 | 2025-05-09 |
Single-Cell Analysis of Endothelial Cell Injury in IgA Nephropathy
2025-Feb, Immunity, inflammation and disease
DOI:10.1002/iid3.70149
PMID:39945225
|
research paper | 该研究通过单细胞RNA测序分析IgA肾病（IgAN）患者肾脏活检样本，重点研究肾内皮细胞的参与机制 | 首次揭示了IL-6通过Rac1负调控HRGECs中VE-cad表达的新机制 | 研究样本来源于公共数据库，未明确说明样本量大小 | 探究IgAN中肾损伤的分子机制 | IgA肾病患者的肾脏组织及人肾小球内皮细胞（HRGECs） | digital pathology | IgA肾病 | scRNA-seq, AUCell分析, hdWGCNA | NA | 基因表达数据 | NA |
| 187 | 2025-05-09 |
Decidual stromal cells: fibroblasts specialized in immunoregulation during pregnancy
2025-Feb, Trends in immunology
IF:13.1Q1
DOI:10.1016/j.it.2024.12.007
PMID:39947975
|
research paper | 该论文探讨了蜕膜基质细胞（DSCs）在妊娠期间的免疫调节作用及其与成纤维细胞的相似性 | 通过单细胞RNA测序揭示了人类和小鼠DSCs的不同类型及其在正常和病理妊娠中的免疫反应作用 | 未提及具体的研究样本量或实验设计的详细限制 | 研究蜕膜基质细胞在妊娠期间的免疫调节机制 | 蜕膜基质细胞（DSCs）和成纤维细胞 | 免疫学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 188 | 2025-05-09 |
Integrating multiscale mathematical modeling and multidimensional data reveals the effects of epigenetic instability on acquired drug resistance in cancer
2025-Feb, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012815
PMID:39951474
|
research paper | 通过整合多尺度数学模型和多维数据，揭示了表观遗传不稳定性对癌症获得性耐药的影响 | 开发了一个新的多尺度数学模型，结合表观遗传和细胞群体动力学，从进化角度揭示了DTP细胞亚群的出现和间歇治疗效果的动力学特征 | 研究主要基于PC9细胞的数据，可能不适用于所有癌症类型 | 阐明药物耐受性持久细胞（DTP细胞）在癌症获得性耐药中的作用机制 | PC9细胞和肺癌的单细胞RNA-seq数据 | 计算生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA-seq | 多尺度数学模型 | 基因组数据 | NA |
| 189 | 2025-05-09 |
Tissue-Resident Regulatory T Cells Expressing CD83 Maintain Local Homeostasis and Restrict Th2 Responses in Asthma
2025-Feb, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202451525
PMID:39955650
|
研究论文 | 本研究首次探讨了肺组织驻留调节性T细胞（Tregs）中CD83表达在稳态和哮喘中的作用，揭示了CD83在屏障组织中的重要性 | 首次阐明CD83在非淋巴组织Tregs（NLT-Tregs）中的生物学意义，特别是在肺组织稳态和哮喘Th2反应调控中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类组织中的验证仍需进一步研究 | 探究CD83在肺组织驻留Tregs中的功能及其在哮喘发病机制中的作用 | 肺组织驻留调节性T细胞（Tregs）和哮喘模型小鼠 | 免疫学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序、基因敲除模型 | CD83条件性敲除小鼠（CD83cKO） | 基因表达数据、细胞表型分析 | 未明确说明具体样本量（使用基因工程小鼠模型） |
| 190 | 2025-05-09 |
Therapeutic Potential of Inhibiting Hmox1 in Sepsis-Induced Lung Injury: A Molecular Mechanism Study
2025-Feb, Journal of biochemical and molecular toxicology
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jbt.70134
PMID:39959930
|
研究论文 | 本研究揭示了Hmox1抑制剂通过激活FSP1/CoQ10/NADPH通路增强自噬活性并抑制铁死亡，从而减轻脓毒症诱导的肺损伤 | 首次发现Hmox1抑制剂通过调节自噬-铁死亡通路减轻脓毒症肺损伤的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化效果尚需验证 | 探索Hmox1抑制剂对脓毒症肺损伤的治疗潜力及其分子机制 | 肺泡上皮细胞和脓毒症小鼠模型 | 分子机制研究 | 脓毒症肺损伤 | RNA-seq、scRNA-seq、透射电镜 | LPS诱导的肺泡上皮细胞损伤模型和CLP诱导的脓毒症小鼠模型 | 转录组数据、细胞实验数据、动物实验数据 | 多个公共数据集（GSE236391、GSE263867、GSE207651）和实验模型 |
| 191 | 2025-05-08 |
MAIT cells protect against sterile lung injury
2025-Feb-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115275
PMID:39918959
|
研究论文 | 研究MAIT细胞在无菌性肺损伤中的保护作用及其机制 | 首次揭示了MAIT细胞通过促进cDC1驱动的抗纤维化途径在无菌性肺损伤中的保护作用 | 研究主要基于小鼠模型和人类scRNA-seq数据，未涉及其他动物模型或更广泛的人类样本 | 探索MAIT细胞在无菌性肺损伤中的功能及其保护机制 | MAIT细胞及其在无菌性肺损伤中的作用 | 免疫学 | 肺纤维化 | scRNA-seq, 光谱分析, 过继转移 | 小鼠模型 | RNA序列数据 | 小鼠模型和人类特发性肺纤维化患者的scRNA-seq数据 |
| 192 | 2025-05-08 |
Osteocyte connexin hemichannels and prostaglandin E2 release dictate bone marrow mesenchymal stromal cell commitment
2025-Feb-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2412144122
PMID:39937859
|
研究论文 | 本研究揭示了骨细胞连接蛋白43（Cx43）半通道通过释放前列腺素E2（PGE2）调控骨髓间充质干细胞和祖细胞（BM-MSPCs）命运决定的关键作用 | 首次发现骨细胞Cx43半通道通过PGE2释放调控BM-MSPCs的谱系定向，揭示了基质结合骨细胞与BM-MSPCs之间的精确调控通讯机制 | 研究主要基于转基因小鼠模型，人类骨细胞中Cx43半通道的作用尚需进一步验证 | 探究骨细胞如何与BM-MSPCs通讯以协调骨形成 | 骨髓间充质干细胞和祖细胞（BM-MSPCs） | 骨生物学 | 骨代谢疾病 | 流式细胞术、单细胞RNA测序 | 转基因小鼠模型（R76W和Δ130-136突变体） | 基因表达数据、细胞表型数据 | 两种转基因小鼠模型的BM-MSPCs |
| 193 | 2025-05-08 |
Enhanced conversion of T cells into CAR T cells by modulation of the MAPK/ERK pathway
2025-Feb-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.101970
PMID:39938523
|
研究论文 | 通过调节MAPK/ERK通路增强T细胞向CAR T细胞的转化 | 揭示了CAR T细胞生成过程中MAPK/ERK通路的关键作用，并通过单细胞多组学分析区分了转导和非转导T细胞的分子特征 | 研究主要基于体外实验，未涉及体内CAR T细胞功能的验证 | 探索CAR T细胞生成过程中的分子机制，以提高CAR T细胞的转化效率 | T细胞和CAR T细胞 | 免疫治疗 | 癌症 | 单细胞多组学分析 | NA | 转录组数据 | 健康供体和患者的T细胞 |
| 194 | 2025-05-08 |
Combining T cell receptor sequencing and transcriptomics to characterize tissue-resident T cells from human gut biopsies
2025-02-16, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151353
PMID:39837221
|
研究论文 | 本研究首次结合流式细胞术、T细胞受体测序和转录组学，分析来自人类肠道活检组织的T细胞 | 首次将流式细胞术、TCR测序和转录组学结合，从批量分选的T细胞和单细胞水平分析T细胞库 | 研究为概念验证性质，样本量有限，且仅关注特定炎症条件下的T细胞反应 | 深入理解胃肠道T细胞在黏膜免疫中的作用及其在炎症条件下的反应 | 人类胃、结肠活检样本及血液样本中的T细胞 | 免疫学 | 胃炎 | NGS, 流式细胞术, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据, TCR序列数据 | 来自有/无炎症患者的胃、结肠活检样本及血液样本 |
| 195 | 2025-05-08 |
Targeted FTO knockout in endothelial cells Boosts adhesion and lowers inflammatory infiltration to alleviate pulmonary arterial hypertension
2025-02-16, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151339
PMID:39869947
|
研究论文 | 本研究探讨了内皮细胞特异性FTO敲除对肺动脉高压（PAH）发展的影响 | 首次揭示了内皮细胞中FTO的缺失通过调节内皮粘附和炎症反应缓解PAH的机制 | 研究主要关注内皮细胞中的FTO作用，未全面探讨其他细胞类型中FTO的可能影响 | 探索FTO在肺动脉高压中的作用及其潜在治疗策略 | 内皮细胞和肺动脉高压模型 | 分子生物学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除模型 | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量 |
| 196 | 2025-05-08 |
Autonomous function of Antennapedia in adult muscle precursors directly connects Hox genes to adult muscle development
2025-Feb-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204341
PMID:39918891
|
研究论文 | 本研究揭示了果蝇Hox基因Antennapedia在成年飞行肌发育中的自主功能，直接连接Hox基因与成年肌肉发育 | 挑战了T2作为'Hox-free'区域的观念，揭示了Antp通过调控细胞周期速率和Hedgehog信号传导在成年飞行肌发育中的关键作用 | 研究仅针对果蝇模型，结果在其他生物中的普适性尚待验证 | 探究Hox基因在成年肌肉发育中的直接作用机制 | 果蝇成年飞行肌前体细胞(AMPs) | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组学、CRISPR技术、功能获得性实验 | NA | 基因表达数据 | 果蝇翅盘单细胞样本 |
| 197 | 2025-05-08 |
Mesenchymal retinoic acid signaling is required for normal diaphragm development in mice
2025-Feb-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202402182R
PMID:39921473
|
研究论文 | 本研究探讨了间充质视黄酸信号在小鼠正常膈肌发育中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序分析揭示了发育中膈肌的10种不同细胞群，并发现间充质细胞是CDH和视黄酸信号相关基因的主要表达者 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 更好地理解膈肌发育和先天性膈疝(CDH)的病因学 | 小鼠发育中的膈肌 | 发育生物学 | 先天性膈疝 | 单细胞RNA测序 | 条件性视黄酸受体显性阴性敲入小鼠模型 | RNA测序数据 | NA |
| 198 | 2025-05-08 |
Mechanism of Ca2+ overload caused by STIM1/ORAI1 activation of store-operated Ca2+ entry (SOCE) in hydrogen peroxide-induced mitochondrial damage and apoptosis in human primary melanocytes
2025-Feb-12, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-025-10329-1
PMID:39937331
|
研究论文 | 研究氧化应激下正常人黑色素细胞中Ca2+水平变化的调控机制，为白癜风发病机制和治疗提供新见解和潜在临床治疗靶点 | 揭示了STIM1/ORAI1激活的SOCE在H2O2诱导的线粒体损伤和凋亡中的作用机制 | 研究仅基于体外实验，未涉及动物模型或临床试验 | 探究氧化应激下黑色素细胞中Ca2+水平变化的调控机制 | 正常人黑色素细胞(NHMs) | 细胞生物学 | 白癜风 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫荧光、定量实时PCR、western blotting | NA | RNA测序数据、蛋白质表达数据 | NA |
| 199 | 2025-05-08 |
Characterization of canine tumor-infiltrating leukocyte transcriptomic signatures reveals conserved expression patterns with human osteosarcoma
2025-Feb-11, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-03950-3
PMID:39932553
|
研究论文 | 本研究通过公开可用的犬骨肉瘤单细胞RNA测序数据，比较了肿瘤浸润免疫细胞与循环白细胞，揭示了与人类骨肉瘤保守的转录组模式 | 首次在犬骨肉瘤模型中系统分析肿瘤浸润免疫细胞的转录组特征，并与人类骨肉瘤进行比较，发现保守的转录组响应模式 | 研究依赖于公开数据集，可能受限于样本数量和数据质量 | 探究骨肉瘤肿瘤微环境对免疫细胞转录组的影响 | 犬骨肉瘤肿瘤浸润免疫细胞和循环白细胞 | 免疫肿瘤学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 公开可用的犬骨肉瘤scRNA-seq数据集 |
| 200 | 2025-05-08 |
Neutrophil-induced pyroptosis promotes survival in patients with hepatoblastoma
2025-Feb-11, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03922-z
PMID:39932547
|
研究论文 | 本研究探讨了中性粒细胞诱导的细胞焦亡（NIP）与肝母细胞瘤（HB）患者生存之间的关系 | 构建了基于中性粒细胞和细胞焦亡相关基因的NIP评分，揭示了NETs相关中性粒细胞在诱导细胞焦亡和延长生存中的关键作用 | 样本量较小（仅38例患者），且研究结果需要进一步验证 | 揭示中性粒细胞诱导的细胞焦亡与肝母细胞瘤患者预后的关系 | 肝母细胞瘤患者 | 肿瘤免疫学 | 肝母细胞瘤 | RNA测序（bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq），LASSO回归，KEGG/GO/GSVA/ssGSEA富集分析 | LASSO回归模型 | RNA测序数据，临床数据 | 38例肝母细胞瘤患者（来自上海儿童医学中心） |