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当前共找到 649 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-02-11 |
Sex-dependent molecular landscape of Alzheimer's disease revealed by large-scale single-cell transcriptomics
2025-Feb, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.14476
PMID:39737748
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研究论文 | 本研究利用大规模单细胞转录组图谱揭示了阿尔茨海默病中显著的性别依赖性分子特征 | 首次通过大规模单细胞转录组学系统揭示阿尔茨海默病的性别依赖性分子景观，识别了性别特异性的基因表达模式、通路改变和细胞间通讯变化 | 研究仅基于人类前额叶皮层样本，可能无法完全反映其他脑区或疾病阶段的性别差异 | 探究阿尔茨海默病中性别差异的分子机制 | 人类前额叶皮层的单细胞转录组数据 | 单细胞转录组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 大规模样本（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2026-02-10 |
Hepatic Arterial Flow-Induced Portal Tract Fibrosis in Portal Hypertension: The Role of VCAM-1 and Osteopontin-Expressing Macrophages
2025-Feb-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.31.634947
PMID:39975181
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研究论文 | 本研究探讨了门脉高压中肝动脉血流增加通过VCAM-1和表达骨桥蛋白的巨噬细胞驱动门管区纤维化的分子机制 | 揭示了肝动脉缓冲反应诱导的动脉血流增加通过VCAM-1介导的巨噬细胞招募和Spp1+巨噬细胞驱动纤维化的新机制 | 研究基于大鼠模型，结果在人类中的适用性需进一步验证；未涉及长期疾病进展或治疗干预的评估 | 探究门脉高压中肝动脉血流增加导致门管区纤维化的分子机制 | Sprague-Dawley大鼠门脉高压模型中的肝脏组织、巨噬细胞和门脉成纤维细胞 | NA | 门脉高压 | 单细胞RNA测序、RNA-FISH、微CT、免疫细胞分析、转录组分析 | NA | 图像数据、转录组数据、血流动力学数据 | Sprague-Dawley大鼠门脉高压模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2026-02-08 |
Longitudinal single-cell profiles of lung regeneration after viral infection reveal persistent injury-associated cell states
2025-Feb-06, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.12.002
PMID:39818203
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学结合谱系追踪技术，探索了小鼠肺部在流感损伤后的再生过程，揭示了不同细胞区室的异步响应和持久性损伤相关细胞状态 | 首次利用纵向单细胞转录组学结合谱系追踪，系统描绘了肺部损伤后的再生动态，并鉴定出一种持久存在的损伤诱导毛细血管内皮细胞（iCAP），该细胞状态与人类肺部退行性疾病中的内皮异常相似 | 研究基于小鼠模型，可能无法完全反映人类肺部再生过程；且未深入探讨iCAP细胞在疾病中的具体功能机制 | 理解肺部损伤后气体交换表面功能再生的细胞和分子机制，并探索其与人类发育和疾病的相关性 | 小鼠肺部细胞，特别是肺泡微环境中的细胞，包括损伤诱导的毛细血管内皮细胞（iCAP） | 单细胞转录组学 | 肺部疾病 | 单细胞转录组学，谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-02-07 |
Consequences of training data composition for deep learning models in single-cell biology
2025-Feb-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.19.639127
PMID:40060416
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研究论文 | 本研究系统探讨了训练数据组成对单细胞转录组学深度学习模型行为的影响 | 首次系统研究训练数据组成对单细胞基础模型性能的影响，揭示了模型泛化能力与数据多样性的关系 | 研究主要聚焦于人类造血系统，结论在其他生物系统或疾病中的普适性有待验证 | 探究训练数据组成如何影响单细胞转录组学深度学习模型的性能 | 人类造血系统的单细胞转录组数据 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | 深度学习模型 | 单细胞转录组数据 | 包含成体和发育组织、疾病状态及扰动图谱的多种细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2026-02-07 |
Single-cell transcriptomics of X-ray irradiated Drosophila wing discs reveals heterogeneity related to cell-cycle status and cell location
2025-Feb-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.10.627868
PMID:39990483
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学分析了X射线辐射对果蝇翅盘的影响，揭示了基于细胞周期状态和细胞位置的异质性 | 首次在果蝇翅盘中应用单细胞RNA测序研究X射线辐射效应，并采用Herfindahl-Hirschman Index量化基因表达异质性，发现辐射响应在区域间和区域内均存在非均匀性 | 研究仅聚焦于果蝇翅盘这一相对简单的组织，可能无法完全代表更复杂组织或哺乳动物系统的辐射响应 | 探究X射线辐射对组织细胞异质性的影响，特别是基因表达在空间和功能上的差异 | 果蝇翅盘中的上皮细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量，但涉及果蝇翅盘细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2026-02-05 |
A Temporal and Spatial Atlas of Adaptive Immune Responses in the Lymph Node Following Viral Infection
2025-Feb-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.31.635509
PMID:39975238
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研究论文 | 本研究介绍了一种名为AIR-SPACE的整合方法，结合高分辨率空间转录组学与配对的高保真长读长T/B细胞受体测序，用于解析病毒感染后淋巴结内适应性免疫应答的时空动态 | 开发了AIR-SPACE这一创新方法，首次实现了在原生空间背景下同时分析细胞转录组和适应性免疫受体库，并构建了病毒感染后淋巴结适应性免疫应答的全面时空图谱 | 研究目前仅应用于小鼠模型和痘苗病毒感染场景，尚未在人类样本或其他病原体感染中得到验证 | 解析病毒感染后淋巴结内适应性免疫应答的时空动态和组织结构 | 小鼠腘窝淋巴结在痘苗病毒感染后的适应性免疫细胞 | 空间转录组学 | 病毒感染 | 空间转录组学，长读长测序，T/B细胞受体测序 | NA | 空间转录组数据，受体序列数据 | 五个不同时间点的小鼠腘窝淋巴结样本 | NA | 空间转录组学，单细胞多组学 | NA | NA |
| 7 | 2026-02-05 |
Frizzled5 controls murine intestinal epithelial cell plasticity through organization of chromatin accessibility
2025-02-03, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.10.021
PMID:39579769
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研究论文 | 本研究揭示了Frizzled5（Fzd5）作为Wnt通路受体，通过调控染色质可及性来控制小鼠肠道上皮细胞的可塑性，影响干细胞自我更新和谱系生成 | 首次整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序分析，阐明Fzd5通过组织染色质可及性来调控肠道上皮细胞命运，特别是在干细胞和祖细胞中 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及人类样本或临床验证，且机制细节仍需进一步探索 | 探究Fzd5在肠道上皮细胞可塑性中的调控作用 | 小鼠肠道上皮细胞，包括Lgr5标记的肠道干细胞和Krt19标记的细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞ATAC测序（scATAC-seq） | NA | 单细胞转录组数据，单细胞染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 8 | 2026-02-03 |
Single-Cell RNA Profiling of Ocular Adnexal Sebaceous Carcinoma Reveals a Complex Tumor Microenvironment and Identifies New Biomarkers
2025-Feb, American journal of ophthalmology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.ajo.2024.10.001
PMID:39393421
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研究论文 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术深入分析了眼附件皮脂腺癌的转录组特征，揭示了其复杂的肿瘤微环境，并鉴定了CALML5作为敏感的诊断标志物 | 首次在单细胞分辨率下对眼附件皮脂腺癌进行转录组分析，揭示了肿瘤微环境的细胞组成和分子通路变化，并发现CALML5作为新的生物标志物 | 样本量较小（仅6例患者标本），且为回顾性观察性病例系列研究，可能限制结果的普遍性 | 探究眼附件皮脂腺癌的肿瘤组成、转录特征及潜在治疗靶点，以推动医疗进展 | 眼附件皮脂腺癌患者标本（包括原发性肿瘤、Paget样扩散肿瘤及正常组织） | 数字病理学 | 眼附件皮脂腺癌 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据，免疫组织化学图像数据 | 6例患者标本（3例原发性肿瘤，2例Paget样扩散肿瘤，1例正常组织），共29,219个细胞；另加存档队列（28例OaSC，25例鳞状细胞癌和OSSN，12例基底细胞癌） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9 | 2026-02-03 |
The critical role of endoplasmic reticulum stress and the stimulator of interferon genes (STING) pathway in kidney fibrosis
2025-Feb, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2024.10.021
PMID:39566842
|
研究论文 | 本研究探讨了内质网应激和STING通路在肾脏纤维化中的关键作用 | 揭示了STING作为内质网应激的上游激活因子，并发现STING与PERK的物理相互作用，以及STING激动剂诱导PERK激活的新机制 | 内质网应激在肾脏疾病中的精确激活机制仍不完全清楚 | 研究内质网应激在肾脏疾病中的激活机制及其在肾脏纤维化中的作用 | 慢性肾脏病患者、小鼠急性及慢性肾损伤模型（顺铂、单侧输尿管梗阻、叶酸和TFAM敲除小鼠） | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 转录组学分析、空间转录组学 | NA | 转录组数据、空间转录组数据 | 慢性肾脏病患者及多种小鼠模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 10 | 2026-02-03 |
Single-Cell Transcriptomics Identifies Selective Lineage-Specific Regulation of Genes in Aortic Smooth Muscle Cells in Mice
2025-Feb, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.321482
PMID:39744838
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学技术，识别了小鼠主动脉平滑肌细胞中第二心场和心脏神经嵴谱系特异性基因的差异表达 | 首次在对照主动脉中探索了两种谱系来源的平滑肌细胞之间的转录组差异，并识别了谱系特异性上调基因 | 研究仅基于14周龄雄性小鼠，样本量有限，且未涉及疾病模型 | 探究主动脉平滑肌细胞中谱系特异性基因调控的差异 | 小鼠主动脉根部和升主动脉的平滑肌细胞 | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 单核转座酶可及染色质测序, RNA原位杂交 | NA | 单细胞RNA测序数据, 染色质可及性数据, 空间表达数据 | 14只14周龄雄性小鼠（SHF追踪和CNC追踪各半） | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-02-03 |
Opportunities and challenges in the application of single-cell transcriptomics in plant tissue research
2025-Feb, Physiology and molecular biology of plants : an international journal of functional plant biology
IF:3.4Q1
DOI:10.1007/s12298-025-01558-6
PMID:40070535
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在植物组织研究中的应用、挑战及整合多源单细胞多模态数据的方法 | 总结了整合多源单细胞RNA测序和单细胞多模态数据的方法，以构建全面的细胞图谱并探索跨模态的因果关系和基因调控机制 | 单细胞RNA测序实验通常无法全面捕获所有细胞和基因，且单模态数据不足以解释细胞状态和系统变化 | 探讨单细胞转录组学在植物组织研究中的机遇与挑战，以及整合方法在揭示生物变化中的应用和价值 | 植物组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多模态 | NA | NA |
| 12 | 2026-01-28 |
Uncovering the Signatures of Cellular Senescence in the Human Dorsolateral Prefrontal Cortex
2025-Feb-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.19.639091
PMID:40027780
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单核RNA测序技术，构建了人类背外侧前额叶皮层衰老和细胞衰老的转录组图谱 | 结合Visium空间转录组学和单核RNA测序，首次在非病理人类组织中系统揭示了背外侧前额叶皮层细胞衰老的异质性和细胞类型特异性特征 | 研究基于非病理组织，可能未完全反映疾病状态下的衰老特征；细胞衰老的罕见性和异质性仍带来识别挑战 | 探索人类背外侧前额叶皮层在衰老过程中的细胞衰老特征和转录组变化 | 人类背外侧前额叶皮层的非病理组织样本 | 数字病理学 | 老年疾病 | 空间转录组学，单核RNA测序 | NA | 空间转录组数据，单核RNA测序数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 10x Visium，10x Chromium | Visium空间转录组学用于空间基因表达分析，单核RNA测序用于细胞类型特异性转录组分析 |
| 13 | 2026-01-24 |
Immunomodulatory effects of traditional chinese medicine on cancer: insights from network pharmacology and single-cell RNA sequencing data on the treatment of lung adenocarcinoma with shenling baizhu powder
2025-Feb-28, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01550-z
PMID:40019596
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研究论文 | 本研究结合网络药理学和单细胞RNA测序数据，探讨了参苓白术散治疗肺腺癌的免疫调节机制 | 首次整合网络药理学与单细胞RNA测序技术，系统揭示了传统中药复方通过调节巨噬细胞相关基因（ALOX5、IL2RA、MMP9、PPARG）影响肿瘤免疫微环境的分子机制 | 研究主要基于生物信息学分析和分子对接模拟，缺乏体内外实验验证；临床样本量未明确说明 | 探究参苓白术散治疗肺腺癌的免疫调节作用机制 | 肺腺癌患者样本（正常组与LUAD组） | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，网络药理学，分子对接 | 机器学习 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2026-01-24 |
Single-cell profiling and clinical characteristics analysis of lung squamous carcinoma
2025-Feb-27, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01556-7
PMID:40014154
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了肺鳞状细胞癌的肿瘤微环境和临床特征，构建了预后风险评分模型 | 首次结合TCGA和GEO数据库对504个LUSC样本进行单细胞RNA测序，并利用计算算法分析免疫细胞浸润和免疫检查点基因特征，识别出具有不同免疫和临床特征的两个基因簇 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，缺乏前瞻性验证，且样本量虽大但可能受数据来源异质性影响 | 阐明肺鳞状细胞癌的肿瘤微环境景观和临床特征，并开发预后预测模型 | 肺鳞状细胞癌患者样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，q-PCR，免疫荧光 | COX比例风险模型，加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据，临床数据 | 504个肺鳞状细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2026-01-07 |
Dissection of Gαs and Hedgehog signaling crosstalk reveals therapeutic opportunities to target adenosine receptor 2b in Hedgehog-dependent tumors
2025-Feb-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.21.639530
PMID:40060632
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研究论文 | 本文通过组织学、bulk RNA测序和单细胞RNA测序，揭示了Gαs信号通路失活与Hedgehog信号在基底细胞癌中的相互作用，并提出了靶向腺苷受体2B作为潜在治疗策略 | 首次发现Gαs通路失活驱动的肿瘤与经典Hedgehog SMO驱动的肿瘤相似，并证明腺苷2B受体激活可抑制Hedgehog信号和肿瘤形成 | 研究主要基于小鼠模型，人类BCC中的临床验证尚需进一步探索 | 探究Gαs与Hedgehog信号通路的交叉调控机制，并寻找基底细胞癌的治疗新靶点 | 小鼠基底细胞癌样肿瘤及人类基底细胞癌样本 | 数字病理学 | 基底细胞癌 | 组织学分析、bulk RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 图像、RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2026-01-07 |
Spatially distinct cellular and molecular landscapes define prognosis in triple negative breast cancer
2025-Feb-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.10.637503
PMID:39990419
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，深入分析了三阴性乳腺癌中不同预后患者的细胞和分子异质性 | 首次利用空间转录组学技术，系统揭示了三阴性乳腺癌不同预后背后的空间和分子异质性，并识别出能高精度分类预后的上皮基因特征 | 研究样本量相对较小（32例），且为回顾性设计，可能限制结果的普遍性 | 探究三阴性乳腺癌不同预后的细胞和分子基础，以推动精准诊断和治疗策略 | 三阴性乳腺癌患者的FFPE组织样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 卷积神经网络（CNN） | 空间转录组数据 | 32例女性患者（17例良好预后，15例不良预后） | NA | 空间转录组学 | GeoMX® Digital Spatial Profiler | GeoMx人类全转录组图谱（WTA）面板 |
| 17 | 2026-01-01 |
Annexin A's Life in Pan-Cancer: Especially in Glioma Immune Cells
2025-02-26, Neuromolecular medicine
IF:3.3Q2
DOI:10.1007/s12017-024-08827-9
PMID:40011350
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研究论文 | 本文通过整合多组学数据，全面评估了ANXA2和ANXA4在多种癌症中的表达模式及功能影响，特别聚焦于胶质母细胞瘤 | 利用单细胞测序分析揭示ANXA2和ANXA4在胶质母细胞瘤中主要由M2巨噬细胞表达，并强调了使用多种分析方法识别差异表达基因的重要性 | 分析工具之间存在差异，可能影响结果的一致性 | 研究ANXA家族在泛癌分析及胶质瘤中的预后意义和功能作用 | ANXA2和ANXA4基因，以及胶质母细胞瘤和低级别胶质瘤 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 单细胞测序分析，多组学数据整合 | NA | 基因组数据，单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2026-01-01 |
Cross-tissue multi-omics analyses reveal the gut microbiota's absence impacts organ morphology, immune homeostasis, bile acid and lipid metabolism
2025-Feb, iMeta
IF:23.7Q1
DOI:10.1002/imt2.272
PMID:40027481
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研究论文 | 本研究通过跨组织多组学分析，揭示了肠道菌群缺失对器官形态、免疫稳态、胆汁酸和脂质代谢的影响 | 首次结合空间转录组学、单细胞RNA测序和靶向胆汁酸代谢组学，系统评估了无菌小鼠中肠道菌群缺失的多器官效应，并发现了自噬驱动的脂滴分解和ZBTB20-LPL轴在脂质稳态中的关键作用 | 研究基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类；且仅比较了无菌和特定病原体自由状态，未涵盖菌群组成变化的中间状态 | 探究肠道菌群缺失如何影响宿主器官形态、免疫稳态及代谢过程 | 无菌小鼠和特定病原体自由小鼠的多个器官 | 多组学分析 | 非传染性疾病 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 靶向胆汁酸代谢组学 | NA | 转录组数据, 代谢组数据 | 无菌和特定病原体自由小鼠的多器官样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 19 | 2025-12-31 |
A Complete Spatial Map of Mouse Retinal Ganglion Cells Reveals Density and Gene Expression Specializations
2025-Feb-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.10.637538
PMID:39990332
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学和机器学习技术，绘制了小鼠视网膜神经节细胞亚型的完整空间分布图，揭示了其密度和基因表达的特异性 | 首次结合en-face冷冻切片、空间转录组学和机器学习，全面映射所有已知RGC亚型的空间分布，并发现亚型内基因表达沿背腹轴或在ART区域内外存在意外变异 | ART区域与灵长类黄斑的基因谱相关性有限，提示小鼠与灵长类中央视觉的特化可能不同，研究结果可能受物种差异限制 | 探索小鼠视网膜神经节细胞亚型的空间分布特化和基因表达模式，以理解其视觉功能基础 | 小鼠视网膜神经节细胞亚型 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，机器学习 | 机器学习 | 空间转录组数据，图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 20 | 2025-12-29 |
Mechanism of Ca2+ overload caused by STIM1/ORAI1 activation of store-operated Ca2+ entry (SOCE) in hydrogen peroxide-induced mitochondrial damage and apoptosis in human primary melanocytes
2025-Feb-12, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-025-10329-1
PMID:39937331
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研究论文 | 本研究探讨了氧化应激下正常人黑色素细胞中钙离子水平变化的调控机制，揭示了STIM1/ORAI1激活导致钙超载进而引发线粒体损伤和细胞凋亡的途径 | 首次在人类原代黑色素细胞中揭示了氧化应激通过上调STIM1/ORAI1表达，激活SOCE导致钙超载，进而诱导线粒体功能障碍和细胞凋亡的具体机制 | 研究主要基于体外细胞实验，缺乏动物模型验证；样本量相对有限；未探讨其他钙信号通路可能的作用 | 探究氧化应激下黑色素细胞钙离子水平变化的调控机制，为白癜风发病机制和治疗提供新见解和潜在临床治疗靶点 | 正常人黑色素细胞 | 细胞生物学 | 白癜风 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫荧光、实时定量PCR、Western blotting | NA | 单细胞RNA测序数据、蛋白质表达数据、细胞功能检测数据 | 未明确具体样本数量，使用正常人黑色素细胞进行实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |