单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 10507 篇文献，本页显示第 1961 - 1980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1961 | 2025-11-22 |
Histology-Based Virtual RNA Inference Identifies Pathways Associated With Metastasis Risk in Colorectal Cancer
2025-Nov, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2025.100866
PMID:40803647
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于组织学图像的虚拟RNA推断方法，用于识别结直肠癌转移风险相关的通路 | 首次利用匹配的大规模结直肠癌空间转录组数据训练深度学习模型，直接从H&E染色组织图像推断空间转录组水平的分子信息 | 仅凭组织学图像无法完全捕获某些肿瘤相关通路 | 开发从标准H&E组织图像推断空间分子信息的方法，用于结直肠癌预后评估 | 结直肠癌患者组织样本 | 数字病理 | 结直肠癌 | 空间转录组学，深度学习 | UNI, ResNet-50, Vision Transformer, Vision Mamba | 组织图像，基因表达数据 | 45名患者，超过300,000个Visium位点 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 1962 | 2025-11-22 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Bidirectional Development of Infantile Hemangioma
2025-Nov-01, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.10.593
PMID:41177260
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示婴儿血管瘤的双向发育机制 | 首次在人类婴儿血管瘤中构建单细胞图谱，发现血管瘤壁细胞通过释放VEGFA和PGF配体促进内皮细胞增殖和血管生成的新机制 | 样本量较小（仅3名婴儿），缺乏功能验证实验 | 深入理解婴儿血管瘤的发病机制和潜在治疗策略 | 3名婴儿血管瘤患者的肿瘤组织样本 | 单细胞测序 | 婴儿血管瘤 | 单细胞RNA测序，免疫荧光共定位 | NA | 单细胞转录组数据，免疫荧光图像 | 3名婴儿血管瘤患者的36,237个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1963 | 2025-11-22 |
Monohaloacetamide disinfection by-products are potential risk factors for the quality of mouse oocytes
2025-Nov-01, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.119343
PMID:41187544
|
研究论文 | 本研究系统评估了单卤乙酰胺对雌性小鼠的生殖毒性及其分子机制 | 首次系统比较不同单卤乙酰胺的生殖毒性等级，并通过单细胞RNA测序揭示其分子机制 | 研究仅使用小鼠模型，人类相关性需进一步验证；暴露浓度可能高于实际环境水平 | 评估单卤乙酰胺消毒副产物的生殖毒性及其作用机制 | 雌性小鼠卵母细胞 | 毒理学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序,氧化应激生物标志物检测,线粒体功能测定 | 小鼠模型 | 基因表达数据,组织病理学图像,生化指标 | 未明确具体样本数量，但涉及雌性小鼠群体实验 | NA | 单细胞RNA测序 | Smart-seq2 | Smart-seq2单细胞RNA测序技术 |
| 1964 | 2025-11-22 |
Leptin Receptor-Expressing (LepR+) Fibroblasts Activated by BMP Signaling Promote Bone Resorption in Developmental Odontogenic Cysts
2025-Nov, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
DOI:10.1016/j.labinv.2025.104239
PMID:40946915
|
研究论文 | 本研究揭示了发育性牙源性囊肿中表达瘦素受体的成纤维细胞通过BMP信号通路促进骨吸收的新机制 | 首次发现LepR+成纤维细胞通过与活化浆细胞的相互作用驱动发育性牙源性囊肿的骨吸收过程 | 研究样本量有限，仅针对最常见的发育性牙源性囊肿（含牙囊肿）进行分析 | 阐明发育性牙源性囊肿中骨吸收的原因和机制 | 发育性牙源性囊肿（含牙囊肿）和埋伏牙的牙滤泡组织 | 单细胞基因组学 | 牙源性囊肿 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 含牙囊肿和埋伏牙牙滤泡组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1965 | 2025-11-22 |
ITGB5-mediated biomechanical regulation in pancreatic ductal adenocarcinoma stroma impacts tumor progression and prognosis
2025-Oct-21, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07119-5
PMID:41121153
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据与生物力学分析，揭示ITGB5在胰腺导管腺癌基质中的生物力学调控作用及其对肿瘤进展的影响 | 首次整合磁共振弹性成像、原子力显微镜和单细胞RNA测序技术系统研究PDAC的生物力学特性，并发现ITGB5作为CAFs中调控基质硬度的关键基因 | 对临床预后的影响仍需临床研究证实，目前仅为单中心前瞻性研究 | 探索胰腺导管腺癌基质硬化机制并寻找新的治疗靶点 | 胰腺导管腺癌组织样本、癌症相关成纤维细胞、动物模型 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 磁共振弹性成像, 原子力显微镜, 加权基因共表达网络分析 | WGCNA, 预后预测模型 | 转录组数据, 生物力学数据, 单细胞测序数据 | 来自TCGA的PDAC样本数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1966 | 2025-11-22 |
Keratin 15 Regulates Cell Proliferation in Outer Enamel Epithelium
2025-Oct-16, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345251368346
PMID:41103018
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了角蛋白15在牙釉质外上皮细胞增殖调控中的关键作用 | 首次发现角蛋白15是牙釉质外上皮的特异性标记基因，并阐明其通过抑制p38 MAPK通路调控牙上皮细胞增殖的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系，在人类牙齿发育中的直接适用性需要进一步验证 | 探究牙釉质外上皮在牙齿发育中的功能角色和分子机制 | 小鼠牙胚（出生后7天切牙和胚胎14天第一磨牙）及牙上皮细胞系CLDE | 发育生物学 | 牙齿发育异常 | 单细胞RNA测序，体外器官培养，基因敲低 | NA | 单细胞转录组数据，基因表达数据 | 小鼠牙胚样本和牙上皮细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1967 | 2025-11-22 |
Single cell transcriptional profiling of monocytes from asthma patients show a predisposition for an inflammatory response
2025-Oct-14, Cytotherapy
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.jcyt.2025.07.008
PMID:41263748
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序分析哮喘患者单核细胞的转录特征及其对γMSCs治疗的反应 | 首次在单细胞水平揭示哮喘患者单核细胞的干扰素反应特征及γMSCs治疗对单核细胞转录组的调控作用 | 样本量有限，需要更大规模研究验证 | 比较哮喘患者与健康对照单核细胞转录组差异，评估γMSCs治疗对哮喘患者单核细胞的影响 | 哮喘患者和健康对照者的血液单核细胞 | 单细胞组学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 哮喘患者和健康对照的血液单核细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1968 | 2025-11-22 |
Molecular signals associated with intraperitoneal chemotherapy resistance in gastric cancer with peritoneal metastasis through PIPS GC trial integrated translational research
2025-Oct-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-19515-4
PMID:41083688
|
研究论文 | 通过PIPS-GC临床试验的整合转化研究，识别胃癌腹膜转移患者对腹腔内紫杉醇联合系统化疗反应的生物标志物 | 首次通过整合全外显子组测序、转录组测序和空间转录组学分析，发现THSD4作为预测胃癌腹膜转移化疗反应的潜在生物标志物 | 样本量较小（仅9例患者），需要进一步研究验证THSD4的临床实用性 | 识别能够预测胃癌腹膜转移患者对腹腔内紫杉醇联合系统化疗反应的生物标志物 | 胃癌腹膜转移患者 | 数字病理学 | 胃癌 | 全外显子组测序,转录组测序,单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 基因组数据,转录组数据,空间转录组数据 | 9例胃癌患者（6例反应组，3例无反应组） | NA | 全外显子组测序,转录组测序,单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 1969 | 2025-11-22 |
GSTA1 Conferred Tolerance to Osimertinib and Provided Strategies to Overcome Drug-Tolerant Persister in EGFR-Mutant Lung Adenocarcinoma
2025-Oct-10, Journal of thoracic oncology : official publication of the International Association for the Study of Lung Cancer
IF:21.0Q1
DOI:10.1016/j.jtho.2025.10.001
PMID:41076079
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示EGFR突变肺腺癌中奥希替尼诱导的药物耐受持续细胞形成机制，并提出联合GSTA1抑制剂的新治疗策略 | 首次发现RSPH1-CALML4-GSTA1调控轴在药物耐受持续细胞形成中的作用，阐明GSTA1通过促进奥希替尼降解和PROS1-AXL信号介导免疫抑制的新机制 | 样本量有限，机制研究仍需进一步验证 | 阐明EGFR突变肺腺癌中奥希替尼诱导药物耐受持续细胞的分子机制并开发克服策略 | 接受一线奥希替尼治疗的肺腺癌患者样本和临床前模型 | 单细胞转录组学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 接受奥希替尼治疗的肺腺癌患者队列（包含基线、药物耐受持续和稳定耐药状态样本） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1970 | 2025-11-22 |
Single-Cell RNA-Seq Dissects Specific Marker in Glioblastoma Based on Gene Regulatory Networks
2025-Oct, Iranian journal of biotechnology
IF:1.6Q4
DOI:10.30498/ijb.2025.528387.4159
PMID:41255833
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据构建基因调控网络，解析胶质母细胞瘤的分子亚型特异性标志物 | 首次结合单细胞RNA测序和基因调控网络分析胶质母细胞瘤亚型特异性调控机制，发现GATA3作为新型预后标志物 | 样本量有限，需要更大规模验证；分析方法依赖于计算推断的拷贝数变异和转录因子结合基序 | 识别胶质母细胞瘤的关键调控因子和亚型特异性标志物，改善患者分层和治疗效果 | 胶质母细胞瘤恶性细胞及其分子亚型（前神经型、经典型、间充质型） | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，基因调控网络分析，差异基因表达分析，配体-受体相互作用分析 | 共识聚类，基因调控网络模型 | 单细胞RNA测序数据，批量RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1971 | 2025-11-22 |
Epigenetic Adaptation Drives Monocyte Differentiation into Microglia-Like Cells Upon Engraftment into the Central Nervous System
2025-Jul-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.09.612126
PMID:39314467
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示单核细胞在进入中枢神经系统后通过表观遗传重编程获得小胶质细胞特异性标记物表达的能力 | 挑战了传统认为单核细胞与驻留小胶质细胞可通过特定标记物区分的范式，首次证明单核细胞能在中枢神经系统中通过表观遗传适应转化为小胶质细胞样细胞 | NA | 探究单核细胞在中枢神经系统中的表观遗传适应机制及其对小胶质细胞标记物特异性的影响 | 骨髓嵌合体模型中的单核细胞和小胶质细胞 | 表观遗传学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, 流式细胞术, 免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据, 流式细胞数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 1972 | 2025-11-22 |
Comprehensive profiling of migratory primordial germ cells reveals niche-specific differences in non-canonical Wnt and Nodal-Lefty signaling in anterior vs posterior migrants
2025-Jun-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.29.610420
PMID:39257761
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了小鼠迁移过程中原始生殖细胞及其周围体细胞生态位的转录异质性 | 首次揭示了前后位置迁移PGCs在非经典Wnt和Nodal-Lefty信号通路的生态位特异性差异，并验证了人类中的保守性 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据的验证依赖于重新分析已发表数据集 | 阐明迁移过程中原始生殖细胞与不同体细胞生态位相互作用的分子机制 | 小鼠原始生殖细胞和周围体细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序，全胚胎免疫荧光染色 | 轨迹推断方法 | 单细胞转录组数据，免疫荧光图像数据 | 13,262个小鼠PGCs和7,868个周围体细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1973 | 2025-11-22 |
White and Brown Adipose Tissue Share a Common Fibro-Adipogenic Progenitor Population
2025-May-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.28.656577
PMID:40501707
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序发现白色和棕色脂肪组织共享共同的纤维-脂肪生成祖细胞群 | 首次在棕色脂肪组织中鉴定出纤维-脂肪生成祖细胞样细胞，扩展了脂肪祖细胞群的认识 | 使用体外培养的原代前脂肪细胞，可能无法完全反映体内情况 | 研究脂肪组织异质性及其祖细胞身份 | 培养的原代白色和棕色前脂肪细胞 | 单细胞生物学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | 轨迹分析、调控网络分析 | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1974 | 2025-11-22 |
Delineation of signaling routes that underlie differences in macrophage phenotypic states
2025-Apr, NAR molecular medicine
DOI:10.1093/narmme/ugaf013
PMID:41255709
|
研究论文 | 通过质谱蛋白质组学分析揭示人类巨噬细胞不同功能状态下的信号通路差异 | 首次通过磷酸化蛋白质组学结合转录组数据系统识别免疫抑制性巨噬细胞的关键激酶和转录调控因子 | 研究主要基于体外培养的原代巨噬细胞，临床验证仍需进一步深入 | 阐明巨噬细胞表型状态差异背后的信号通路机制 | 人类原代巨噬细胞和肿瘤患者的单细胞测序数据 | 蛋白质组学 | 癌症 | 质谱蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、单细胞测序、转录组分析 | NA | 蛋白质组数据、磷酸化蛋白质组数据、转录组数据、单细胞测序数据 | NA | NA | 质谱蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1975 | 2025-11-22 |
Prognostic and Immunological Implications of Telomere Maintenance-Related Genes in Breast Cancer: A Mechanistic Exploration
2025, Breast cancer (Dove Medical Press)
DOI:10.2147/BCTT.S545745
PMID:41255412
|
研究论文 | 本研究通过分析乳腺癌中端粒维持相关基因构建风险模型，用于预后预测和治疗评估 | 首次系统构建基于端粒维持相关基因的乳腺癌风险预测模型，并结合单细胞RNA测序验证关键基因表达 | 研究基于回顾性数据集，需要前瞻性研究验证模型的临床适用性 | 探讨端粒维持相关基因在乳腺癌中的预后价值和免疫学意义 | 乳腺癌患者及其基因表达数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, Cox回归分析, LASSO回归, 孟德尔随机化分析 | 风险预测模型 | 基因表达数据 | 多个乳腺癌数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1976 | 2025-11-22 |
The Intestinal Immune Network for IgA Production is Involved in the Development and Progression of Sepsis: A Multi-Omics Study
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S548786
PMID:41255589
|
研究论文 | 通过多组学方法研究肠道IgA生成免疫网络在脓毒症发生发展中的作用 | 首次整合bulk RNA测序、单细胞RNA测序、临床试验、动物研究和孟德尔随机化分析，系统揭示肠道IgA免疫网络在脓毒症中的作用机制 | NA | 阐明肠道IgA生成免疫网络在脓毒症发生发展中的作用机制 | 脓毒症患者、动物模型、免疫细胞 | 生物信息学 | 脓毒症 | bulk RNA测序,单细胞RNA测序,孟德尔随机化分析,机器学习 | LASSO,Cox回归,诺莫图模型 | 基因表达数据,临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 1977 | 2025-11-22 |
Integrative pharmacovigilance and AI-based framework uncovers potential drug triggers in juvenile idiopathic arthritis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1653003
PMID:41256847
|
研究论文 | 本研究开发了一个结合药物警戒和人工智能的框架，用于识别可能引发或加重幼年特发性关节炎的药物 | 首次整合了四种不相称性算法、三种机器学习模型和毒理基因组学分析，并通过新生成的转录组数据进行多层级验证 | 研究主要依赖于回顾性数据库分析，样本量相对有限，需要进一步的前瞻性研究验证 | 识别可能触发或加重幼年特发性关节炎的药物安全信号 | 幼年特发性关节炎患者和药物安全报告数据 | 自然语言处理 | 幼年特发性关节炎 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 机器学习 | DMPNN, GCN, SVM | 文本报告, 分子描述符, 化学指纹, 结构图, 转录组数据 | FAERS数据库10,012,438份报告，47个个体（39名JIA患者和8名对照）的bulk RNA-seq数据，30个单细胞RNA-seq样本（21个内部PBMC样本和9个公共sJIA样本） | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1978 | 2025-11-22 |
Immune snapshots along the inflammation-to-cancer road in bladder urothelium
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1685237
PMID:41256858
|
综述 | 本文综述了膀胱尿路上皮从炎症到癌症过程中免疫微环境的动态演变过程 | 整合了空间转录组学、单细胞技术和尿液外泌体分析等新技术，提供了炎症-癌症连续过程中的精确免疫快照 | 作为小型综述，可能未涵盖该领域所有最新研究进展 | 阐明膀胱尿路上皮从炎症到癌症过程中的免疫学转变机制 | 膀胱尿路上皮的免疫微环境 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 空间转录组学,单细胞技术,尿液外泌体分析 | NA | 转录组数据,单细胞数据,外泌体数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1979 | 2025-11-22 |
Machine learning-driven exploration of therapeutic targets for atrial fibrillation-joint analysis of single-cell and bulk transcriptomes and experimental validation
2025, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2025.1652467
PMID:41257259
|
研究论文 | 通过机器学习分析心房颤动患者的转录组数据，探索新的治疗靶点和分子机制 | 结合单细胞和批量转录组数据的联合分析，应用三种机器学习算法筛选关键基因，并通过实验验证 | 样本来源仅限于GEO数据库和右心耳组织，需要进一步扩大样本验证 | 探索心房颤动的治疗靶点和诊断生物标志物 | 心房颤动患者的转录组数据和右心耳组织样本 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, RT-qPCR, western blot | LASSO, SVM-RFE, 随机森林, 列线图模型 | 转录组数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1980 | 2025-11-22 |
The analysis reveals novel hub genes and pathways associated with Tetralogy of Fallot
2025, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2025.1604939
PMID:41257258
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞RNA-seq数据，识别了法洛四联症相关的核心基因和通路 | 首次在单细胞分辨率下验证法洛四联症中脂肪酸代谢通路在心肌细胞中的特异性富集 | 样本量有限，仅使用了两个数据集进行验证 | 探索法洛四联症的核心基因和通路，为疾病预防和干预提供潜在靶点 | 法洛四联症患者的心脏组织 | 生物信息学 | 先天性心脏病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qRT-PCR, 功能富集分析 | NA | 基因表达数据 | 基于两个数据集GSE146220和GSE217772 | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |