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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1961 | 2026-01-15 |
HDGF derived from Müller cells enhances the activation of microglia in diabetic retinopathy
2025-Aug-07, Journal of biomedical research
IF:2.2Q3
DOI:10.7555/JBR.38.20240386
PMID:40770862
|
研究论文 | 本研究探讨了肝细胞瘤衍生生长因子(HDGF)在糖尿病视网膜病变(DR)中介导炎症的作用,发现HDGF主要由Müller细胞产生并靶向小胶质细胞,促进其激活和炎症反应 | 首次揭示HDGF在DR中作为Müller细胞来源的炎症介质,通过靶向小胶质细胞并上调整合素β2来驱动炎症过程,并验证了HDGF中和作为潜在治疗策略 | 研究主要基于体外细胞培养和小鼠模型,尚未在人类临床样本中全面验证HDGF阻断的治疗效果,且具体信号通路机制有待进一步阐明 | 阐明HDGF在糖尿病视网膜病变炎症反应中的作用机制,并探索其作为治疗靶点的潜力 | 糖尿病视网膜病变患者房水样本、公共单细胞RNA测序数据集、培养的Müller细胞和小胶质细胞、DR小鼠模型 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序、酶联免疫吸附试验、定量逆转录PCR、Western印迹、荧光免疫染色 | NA | RNA测序数据、蛋白质表达数据、免疫荧光图像 | 未明确样本数量,但包括患者房水、公共数据集、细胞培养和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1962 | 2026-01-15 |
CD36 promotes iron accumulation and dysfunction in CD8+ T cells via the p38-CEBPB-TfR1 axis in early-stage hepatocellular carcinoma
2025-07, Clinical and molecular hepatology
IF:14.0Q1
DOI:10.3350/cmh.2024.0948
PMID:40037690
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研究论文 | 本研究揭示了CD36通过p38-CEBPB-TfR1轴促进早期肝细胞癌中CD8+ T细胞铁积累和功能障碍的新机制 | 首次发现CD36通过介导oxLDL-p38-CEBPB轴上调TfR1,导致CD8+ T细胞铁积累和功能障碍 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 探究早期肝细胞癌肿瘤微环境中CD8+ T细胞功能障碍的机制 | 早期肝细胞癌肿瘤微环境中的CD8+ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | RNA测序数据,流式细胞数据 | 小鼠肝细胞癌模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1963 | 2026-01-15 |
UHRF1-mediated epigenetic reprogramming regulates glycolysis to promote progression of B-cell acute lymphoblastic leukemia
2025-Apr-29, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07532-0
PMID:40301374
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研究论文 | 本研究揭示了UHRF1通过表观遗传重编程调控糖酵解,从而促进B细胞急性淋巴细胞白血病进展的分子机制 | 首次利用单细胞转录组测序技术发现UHRF1与B-ALL进展的关联,并阐明了UHRF1-SFRP5-WNT5A-P38 MAPK-HK2信号轴在表观遗传和代谢重编程中的作用,同时鉴定出UHRF1靶向抑制剂UM164 | 未明确说明样本的具体数量及临床特征细节,体内外实验的转化潜力需进一步验证 | 探索复发难治性B细胞急性淋巴细胞白血病的分子机制,以改善临床预后 | B细胞急性淋巴细胞白血病细胞 | 单细胞组学 | 白血病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1964 | 2026-01-15 |
inDrops-2: a flexible, versatile and cost-efficient droplet microfluidic approach for high-throughput scRNA-seq of fresh and preserved clinical samples
2025-Jan-11, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae1312
PMID:39797728
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研究论文 | 本文介绍了inDrops-2,一种开源、灵活且成本效益高的液滴微流控单细胞RNA测序技术,适用于新鲜和保存的临床样本 | inDrops-2技术以6倍低于商业系统的成本,实现了与最先进商业系统相匹配的灵敏度,并支持指数和线性扩增两种协议 | NA | 开发一种高灵敏度、低成本、适用于大规模单细胞RNA测序的开源技术 | 人类肺癌样本中的新鲜和保存细胞 | 单细胞测序 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 多个人类肺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | inDrops-2 | 开源液滴微流控单细胞RNA测序平台,支持指数和线性扩增协议 |
| 1965 | 2026-01-15 |
Phase 1 study of chidamide in combination with venetoclax, azacitidine, aclarubicin, cytarabine and G-CSF for refractory/relapsed acute myeloid leukemia: clinical safety, efficacy, and correlative analysis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1698710
PMID:41459484
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研究论文 | 本研究评估了西达本胺联合维奈托克、阿扎胞苷、阿柔比星、阿糖胞苷和G-CSF(CACAG-VEN方案)在复发/难治性急性髓系白血病(R/R-AML)患者中的疗效、安全性及相关生物学机制 | 首次在R/R-AML患者中评估CACAG-VEN联合方案的疗效和安全性,并利用单细胞RNA测序揭示了治疗后MCL1、HIF1A和ABCC1下调等分子机制 | 样本量较小(34例患者),为单臂I期研究,缺乏对照组,随访时间中位数为461天,可能不足以评估长期疗效和安全性 | 评估CACAG-VEN方案作为R/R-AML挽救诱导治疗的安全性和疗效,并探索其分子作用机制 | 复发或难治性急性髓系白血病(R/R-AML)患者 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据,单细胞RNA测序数据 | 34例R/R-AML患者(难治性17例,复发17例),其中4例患者在治疗前后进行了骨髓样本的单细胞RNA测序(共8个样本) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1966 | 2026-01-14 |
KCNV2-Deficient Retinal Organoid Model of Cone Dystrophy-In Vitro Screening for AAV Gene Replacement Therapy
2025-Dec-31, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27010449
PMID:41516321
|
研究论文 | 本研究建立了KCNV2缺陷的人视网膜类器官模型,用于评估AAV基因替代疗法的载体效力 | 首次利用患者来源和基因编辑的视网膜类器官作为生理相关模型,在体外评估AAV基因治疗载体的效力,并通过单细胞RNA测序在单细胞分辨率下验证治疗效果 | 研究为体外模型,仍需动物实验和临床试验进一步验证;类器官模型可能无法完全模拟体内视网膜的复杂微环境 | 开发用于评估基因治疗载体效力的视网膜疾病模型,并筛选先导治疗候选物 | KCNV2基因缺陷的人视网膜类器官 | 基因治疗 | 视网膜锥细胞营养不良 | 单细胞RNA测序,基因编辑,AAV载体构建 | 视网膜类器官模型 | 基因表达数据,蛋白质定量数据 | 来自两个独立来源的视网膜类器官:患者血液来源的iPSCs和对照细胞系的基因编辑产物 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1967 | 2026-01-14 |
MFAP5 Activates ITGA5 to Drive Tooth Germ Mineralization Through the MAPK/ERK Pathway: Insights from Single-Cell Transcriptomics
2025-Dec-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27010394
PMID:41516268
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术构建了小型猪牙胚的高分辨率细胞图谱,揭示了MFAP5通过激活ITGA5并驱动MAPK/ERK通路来调控牙胚矿化的新机制 | 首次在牙胚发育中识别出MFAP5作为牙源性程序的新调控因子,并阐明其通过MFAP5-ITGA5-ERK/MAPK信号轴以细胞状态特异性方式驱动矿化的机制 | 研究主要基于体外功能实验和小型猪模型,其在人类牙胚发育中的直接适用性及体内功能验证仍需进一步探索 | 探究牙胚矿化的分子调控机制 | 小型猪的牙胚组织 | 单细胞转录组学 | 牙科发育与再生 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x单细胞RNA测序平台 |
| 1968 | 2026-01-14 |
Primordial cardiomyocytes orchestrate myocardial morphogenesis and vascularization but are dispensable for regeneration
2025-Dec-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.29.696817
PMID:41502935
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序在成年斑马鱼心脏中发现了一个独特的、表达特定标记物的心肌细胞亚群,并揭示了其在心脏形态发生中的关键作用及其在再生过程中的非必要性 | 首次在成年斑马鱼心脏中鉴定出一个独特的原始心肌细胞亚群,并明确其在心脏发育(形态发生和血管化)中起关键组织者作用,但在心脏再生中并非必需,揭示了发育与再生程序之间的根本差异 | 研究主要基于斑马鱼模型,结论在哺乳动物或人类中的普适性尚需验证;原始心肌细胞再生能力有限的分子机制尚未完全阐明 | 探究脊椎动物心脏中不同心肌细胞亚群在心脏发育和修复中的具体作用 | 成年斑马鱼心脏中的心肌细胞亚群 | 发育生物学、心脏再生 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、遗传消融技术 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1969 | 2026-01-14 |
Macrophage-Dendritic Cell-T-Cell Tetrads Orchestrate Antitumor Immunity and Response to Checkpoint Blockade
2025-Dec-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.24.696419
PMID:41509466
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研究论文 | 本文识别了一种由巨噬细胞、cDC1s、CD4 T细胞和CD8 T细胞组成的空间组织多细胞免疫单元,称为“四联体”,它协调抗肿瘤免疫和对检查点阻断的反应 | 首次发现并定义了“四联体”这一多细胞免疫单元,揭示了其在抗肿瘤免疫和检查点阻断反应中的关键作用,并明确了ICOS-ICOSL通路的重要性 | 研究主要基于小鼠和人类肿瘤的成像与转录组学数据,可能未涵盖所有肿瘤类型或治疗场景,且临床样本量有限 | 定义调控有效抗肿瘤免疫的细胞结构,以解释免疫检查点抑制剂仅对部分患者有效的机制 | 小鼠和人类肿瘤中的免疫细胞,包括巨噬细胞、cDC1s、CD4 T细胞和CD8 T细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 多重成像和空间转录组学 | NA | 图像和转录组数据 | 小鼠和人类肿瘤样本,具体数量未明确 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1970 | 2026-01-14 |
Multi-Omics Integration Identifies TNFRSF1A as a Causal Mediator of Immune Microenvironment Reprogramming in Diabetic Kidney Disease
2025-Dec-26, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27010279
PMID:41516155
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研究论文 | 本研究通过多组学整合方法,揭示了TNFRSF1A在糖尿病肾病免疫微环境重编程中的因果中介作用 | 首次结合单细胞RNA测序、空间转录组学、伪时间轨迹分析、细胞间通讯分析和孟德尔随机化等多种技术,系统性地鉴定了TNFRSF1A作为糖尿病肾病进展的因果驱动因子 | 研究未排除其他调控通路的参与,且斑马鱼模型与人类疾病存在物种差异 | 探究糖尿病肾病进展中的炎症介质及其因果驱动机制 | 糖尿病肾病患者的肾脏组织及斑马鱼胚胎模型 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 伪时间轨迹分析, 细胞间通讯分析, 孟德尔随机化 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 未明确说明人类样本数量,使用斑马鱼胚胎模型进行验证 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1971 | 2026-01-14 |
Eurotium cristatum-Fermented White Tea Ameliorates DSS-Induced Colitis by Multi-Scale
2025-Dec-25, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods15010072
PMID:41517138
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研究论文 | 本研究探讨了冠突散囊菌发酵白茶(FWT)通过多尺度机制改善DSS诱导的小鼠结肠炎 | 首次结合单细胞/空间转录组学揭示FWT通过增强肠上皮细胞、杯状细胞和干细胞群,优化功能并诱导抗菌和免疫调节因子,修复肠道屏障 | 研究基于小鼠模型,人类应用需进一步验证;机制涉及多因素,具体因果关联需深入探究 | 探究FWT对结肠炎的治疗效果及其多尺度作用机制 | DSS诱导的结肠炎小鼠模型 | NA | 结肠炎 | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1972 | 2026-01-14 |
DUSP5 Downregulation in Nucleus Accumbens Core Correlates with Cocaine-Induced Maladaptive Synaptic Plasticity
2025-Dec-23, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15010032
PMID:41511316
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研究论文 | 本研究探讨了双特异性磷酸酶5(DUSP5)在可卡因诱导的伏隔核核心区(NAcore)突触可塑性中的作用 | 首次探索DUSP5在可卡因成瘾中的具体作用,揭示了其与可卡因诱导的突触可塑性及行为适应的关联 | 研究主要基于大鼠模型和公开数据库,尚未在人体中进行验证 | 探究可卡因成瘾中NAcore突触可塑性的分子机制 | 大鼠可卡因自我给药模型、可卡因处理的NAcore单细胞RNA测序数据 | 神经科学 | 药物成瘾 | 单细胞RNA测序、分子分析 | 大鼠可卡因自我给药模型 | RNA测序数据、行为数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1973 | 2026-01-14 |
Effects of TGFBR1 on Proliferation of Dermal Papilla Cells in Fine-Wool Sheep
2025-Dec-23, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani16010036
PMID:41514724
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研究论文 | 本研究探讨了TGFBR1基因对细毛羊真皮乳头细胞增殖的影响及其分子机制 | 首次通过单细胞转录组测序在细毛羊真皮乳头细胞中鉴定出TGFBR1为差异表达基因,并验证其通过调控Wnt/β-catenin、BMP和Notch等多条信号通路抑制细胞增殖 | 研究主要基于体外细胞实验,缺乏体内动物模型的验证,且信号通路调控的具体分子机制有待进一步阐明 | 探究TGFBR1在细毛羊毛囊发育和周期性生长中的生物学功能及分子机制 | 细毛羊的真皮乳头细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组测序、RT-qPCR、EDU染色、CCK-8检测 | NA | 基因表达数据、细胞增殖数据 | 未明确说明具体样本数量,但涉及细毛羊真皮乳头细胞的原代分离培养 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1974 | 2026-01-14 |
Emerging Technologies for Exploring the Cellular Mechanisms in Vascular Diseases
2025-Dec-23, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27010164
PMID:41516041
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综述 | 本文综述了用于探索血管疾病细胞机制的新兴技术,包括单细胞与空间转录组学、超分辨率成像、微流控器官芯片、CRISPR基因编辑和人工智能等 | 整合多种前沿技术(如单细胞多组学、器官芯片和人工智能)来系统评估其在血管疾病研究中的转化准备度、局限性和临床应用潜力 | 现有技术仍需要多中心大规模验证研究、实验协议标准化以及与临床数据和人类样本的进一步整合 | 评估新兴技术在揭示血管疾病细胞分子机制、促进靶向治疗和精准诊断发展方面的应用 | 血管疾病(VDs)和心血管疾病(CVDs)的细胞与分子基础 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学、空间转录组学、超分辨率成像、光声成像、微流控器官芯片、CRISPR/Cas9基因编辑、人工智能 | NA | 多组学数据、成像数据、临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 1975 | 2026-01-14 |
scANMF: Prior Knowledge and Graph-Regularized NMF for Accurate Cell Type Annotation in scRNA-seq
2025-Dec-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27010125
PMID:41516004
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scANMF的细胞类型注释框架,它通过整合先验知识和图正则化非负矩阵分解来提高单细胞RNA测序数据中细胞类型注释的准确性 | scANMF创新性地将标记基因信息、部分标签监督和局部流形结构整合到一个统一的注释模型中,解决了现有工具依赖单一先验知识的局限性 | 方法在高质量先验知识受限的应用中表现突出,但未明确讨论其在完全无先验知识情况下的性能 | 开发一个准确且稳健的单细胞RNA测序数据细胞类型注释框架 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解 | 基因表达数据 | 多个真实scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1976 | 2026-01-14 |
Integrative Multi-Omics and Machine Learning Reveal Shared Biomarkers in Type 2 Diabetes and Atherosclerosis
2025-Dec-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27010136
PMID:41516018
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和机器学习方法,揭示了2型糖尿病与动脉粥样硬化之间的共享生物标志物和分子机制 | 结合多组学分析、机器学习算法(包括人工神经网络)和单细胞RNA测序数据,识别了IL1B、MMP9和P2RY13作为共享枢纽基因,并强调了巨噬细胞极化失衡在两种疾病中的核心作用 | 研究结果具有初步性,受限于现有数据和方法,需要进一步的实验和临床研究来验证其有效性 | 阐明2型糖尿病与动脉粥样硬化之间的共享分子机制,并识别潜在的生物标志物和治疗靶点 | 基因表达谱数据,包括来自GEO数据库的动脉粥样硬化和2型糖尿病相关基因表达数据,以及单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 心血管疾病 | 基因表达分析,功能富集分析(GO/KEGG),蛋白质-蛋白质相互作用网络分析,机器学习方法,单细胞RNA测序 | 人工神经网络(ANN) | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1977 | 2026-01-14 |
From Genes to Malformations: Molecular Mechanisms Driving the Pathogenesis of Congenital Anomalies of the Kidney and Urinary Tract
2025-Dec-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27010017
PMID:41515896
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综述 | 本文综述了先天性肾脏和尿路畸形(CAKUT)的分子机制,包括基因变异、信号通路、纤毛功能及细胞外基质异常在疾病发生中的作用 | 整合了全外显子组和全基因组测序、拷贝数变异分析的最新发现,并强调了人类肾脏类器官、基因编辑及单细胞或空间转录组学等新兴工具在机制探索中的应用 | CAKUT具有高度异质性,其临床表现受遗传背景、表观遗传调控及环境因素(如母体糖尿病和胎儿缺氧)的复杂影响,机制尚未完全阐明 | 阐明CAKUT的分子发病机制,以改善诊断、加深生物学理解并支持靶向治疗策略的开发 | 先天性肾脏和尿路畸形(CAKUT) | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 全外显子组测序、全基因组测序、拷贝数变异分析、单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 基因组数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 1978 | 2026-01-14 |
Hematopoietic EphA4 deficiency alters microglial heterogeneity and improves chronic spatial memory after brain injury
2025-Dec-05, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-30648-4
PMID:41350381
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研究论文 | 本研究探讨了造血细胞特异性EphA4缺失如何通过影响小胶质细胞异质性和神经免疫重塑,改善创伤性脑损伤后的慢性空间记忆功能 | 首次揭示了外周免疫来源的EphA4信号在调控小胶质细胞异质性及长期神经功能恢复中的关键作用,并利用单细胞RNA测序技术鉴定了特定的小胶质细胞亚群 | 研究主要基于小鼠模型,其结论在人类中的适用性有待验证;且未深入探讨EphA4信号影响小胶质细胞功能的具体分子机制 | 探究外周免疫细胞来源的EphA4信号在创伤性脑损伤后小胶质细胞动态变化及神经功能恢复中的作用 | 造血细胞特异性EphA4敲除的骨髓嵌合小鼠及创伤性脑损伤模型 | 神经科学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量,使用骨髓嵌合小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1979 | 2026-01-14 |
The SPI1/LILRB2 axis modulates macrophage tolerance via crosstalk with TLR8 signaling: implications for sepsis immunotherapy
2025-Oct-27, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-025-02125-1
PMID:41144021
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研究论文 | 本研究揭示了转录因子SPI1通过上调抑制性受体LILRB2来抑制TLR8信号通路,从而调控巨噬细胞LPS耐受的新分子机制 | 首次发现SPI1/LILRB2轴通过抑制TLR8介导的MyD88/NF-κB信号来增强免疫抑制表型,为脓毒症免疫治疗提供了新靶点 | SPI1作用的特异性需进一步确认,LILRB2抑制TLR8的配体特异性和背景需阐明,TLR8在LPS耐受中的主导作用需更多验证 | 探究巨噬细胞LPS耐受的分子机制及其在脓毒症免疫治疗中的应用潜力 | 巨噬细胞 | 分子免疫学 | 脓毒症 | 分子生物学技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1980 | 2026-01-14 |
SIGEL: a context-aware genomic representation learning framework for spatial genomics analysis
2025-Sep-22, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03748-7
PMID:40983914
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研究论文 | 本文提出了一种名为SIGEL的上下文感知基因组表示学习框架,用于从空间转录组数据中生成具有空间信息的基因表示 | 开发了一种成本效益高的框架,通过利用空间基因组上下文从ST数据中推导基因流形,生成的基因表示具有上下文感知、生物学意义明确且跨样本稳健的特点 | NA | 为空间基因组分析开发一种能够生成具有空间信息的基因表示的计算框架 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 表示学习框架 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |