单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 3354 篇文献，本页显示第 1941 - 1960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1941 | 2025-03-05 |
Global landscape of hepatic organoid research: A bibliometric and visual study
2025-Feb-27, World journal of hepatology
IF:2.5Q2
DOI:10.4254/wjh.v17.i2.95624
PMID:40027550
|
研究论文 | 本文通过文献计量分析，研究了全球肝脏类器官研究的科学产出，评估了当前成就和未来趋势 | 利用CiteSpace 6.3.R1进行文献计量分析，揭示了肝脏类器官研究的关键领域和未来趋势 | 研究仅限于Web of Science Core Collection中的文献，可能未涵盖所有相关研究 | 分析全球肝脏类器官研究的科学产出，评估当前成就和未来趋势 | 肝脏类器官研究 | 生物医学研究 | 肝病 | 文献计量分析 | NA | 文献数据 | 991篇文章 |
| 1942 | 2025-03-05 |
Uncovering immune cell heterogeneity in hepatocellular carcinoma by combining single-cell RNA sequencing with T-cell receptor sequencing
2025-Feb-27, World journal of hepatology
IF:2.5Q2
DOI:10.4254/wjh.v17.i2.99046
PMID:40027555
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞RNA测序和T细胞受体测序，揭示了肝细胞癌中免疫细胞的异质性 | 首次结合单细胞RNA测序和T细胞受体测序技术，分析肝细胞癌中免疫细胞亚群的异质性及其功能，并发现新的T细胞簇和潜在生物标志物基因 | 研究样本量未明确提及，可能限制了结果的普遍性 | 研究肝细胞癌中免疫细胞亚群的异质性及其在肿瘤发展中的作用 | 肝细胞癌组织和癌旁正常组织中的免疫细胞 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 1943 | 2025-03-05 |
Inhibition of methylthioadenosine phosphorylase provides protection from experimental acute kidney injury
2025-Feb-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.19.639065
PMID:40027701
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研究论文 | 本研究探讨了甲基硫腺苷磷酸化酶（MTAP）抑制作为急性肾损伤（AKI）新型肾保护策略的潜力 | 首次提出MTAP抑制作为AKI的潜在治疗策略，并通过RNA测序揭示了其对炎症、氧化磷酸化和细胞存活相关通路的调节作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据的验证尚不充分 | 探索MTAP抑制在AKI中的肾保护作用及其机制 | AKI小鼠模型和人类单细胞RNA测序数据 | 代谢组学 | 急性肾损伤 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠模型和人类单细胞RNA测序数据 |
| 1944 | 2025-03-05 |
Single-cell transcriptomics identifies a dampened neutrophil function and accentuated T-cell cytotoxicity in tobacco flavored e-cigarette exposed mouse lungs
2025-Feb-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.17.638715
PMID:40027777
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了烟草味电子烟暴露对小鼠肺部免疫细胞功能的影响 | 首次使用单细胞RNA测序技术详细描述了烟草味电子烟暴露后小鼠肺部免疫细胞的功能变化，特别是Ly6G-中性粒细胞功能的减弱和T细胞细胞毒性的增强 | 研究样本量较小（每组每性别仅2只小鼠），且为初步研究，需要进一步验证和扩展 | 探讨烟草味电子烟暴露对小鼠肺部免疫细胞功能的影响 | C57BL/6J小鼠 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA seq） | NA | RNA测序数据 | 71,725个细胞，每组每性别2只小鼠 |
| 1945 | 2025-03-05 |
The endothelial growth factor Angiopoietin-2 is an accurate prognostic biomarker in patients with acetaminophen-induced acute liver failure
2025-Feb-21, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.02.19.25322567
PMID:40034764
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研究论文 | 本研究评估了血管生成素-2（ANGPT2）作为对乙酰氨基酚（APAP）诱导的急性肝衰竭（ALF）患者不良预后的生物标志物的有效性 | 首次发现ANGPT2在APAP诱导的ALF患者中作为预后生物标志物的有效性，尤其是在早期表现的患者中具有更高的预测价值 | 研究样本量相对较小，且仅针对APAP诱导的ALF患者，未涵盖其他原因引起的ALF | 评估ANGPT2作为APAP诱导的ALF患者不良预后的生物标志物的有效性 | APAP诱导的急性肝衰竭患者 | 生物医学 | 急性肝衰竭 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | RNA测序数据、血浆样本数据 | 两个独立队列：Phoenix队列（n=43）和ALF研究组队列（n=80），合并后总样本量为110 |
| 1946 | 2025-03-05 |
Shared Lineage, Distinct Outcomes: Yap and Taz Loss Differentially Impact Schwann and Olfactory Ensheathing Cell Development Without Disrupting GnRH-1 Migration
2025-Feb-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.13.638196
PMID:40027653
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和基因敲除实验，研究了Yap和Taz在嗅鞘细胞（OECs）和施万细胞发育中的作用，发现它们对GnRH-1神经元迁移无影响 | 揭示了Yap和Taz在OECs和施万细胞发育中的不同作用，并首次证明这些变化不影响GnRH-1神经元的迁移 | 研究仅限于小鼠胚胎模型，未涉及人类或其他哺乳动物 | 探究Yap和Taz在嗅鞘细胞和施万细胞发育中的作用及其对GnRH-1神经元迁移的影响 | 小鼠胚胎鼻部组织中的嗅鞘细胞、施万细胞和GnRH-1神经元 | 神经生物学 | NA | 单细胞RNA测序、基因敲除 | NA | 基因表达数据 | 小鼠胚胎鼻部组织 |
| 1947 | 2025-03-05 |
A prevalent Krt8-to-Krt5 cellular state transition in skin is co-opted by p63 for enamel organ development
2025-Feb-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.11.637463
PMID:39990386
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了p63在牙釉质器官（EO）发育中的关键作用，特别是其在调控Krt8到Krt5细胞状态转变中的功能 | 揭示了p63在牙釉质器官发育中调控Krt8到Krt5细胞状态转变的新机制，并发现这一机制与皮肤发育中的类似过程共享 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类牙釉质器官发育的复杂性 | 探讨p63在牙釉质器官发育中的具体作用及其分子机制 | 小鼠切牙的牙釉质器官细胞 | 分子生物学 | 牙釉质疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠切牙的牙釉质器官细胞样本 |
| 1948 | 2025-03-05 |
Powerful and accurate case-control analysis of spatial molecular data with deep learning-defined tissue microniches
2025-Feb-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.07.637149
PMID:39975274
|
研究论文 | 本文介绍了一种结合深度学习和统计原理的方法VIMA，用于发现与疾病相关的空间特征 | VIMA方法通过变分自编码器提取组织小块的生物内容，定义大量微环境，并使用严格的统计学方法识别与病例对照状态相关的微环境 | NA | 识别与疾病相关的关键空间结构 | 空间分子数据 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病、溃疡性结肠炎、类风湿性关节炎 | 空间转录组学、CODEX、免疫组织化学 | 变分自编码器 | 空间分子数据 | 140基因空间转录组数据集、54标记CODEX数据集、7标记免疫组织化学数据集 |
| 1949 | 2025-03-05 |
Spatial transcriptomic clocks reveal cell proximity effects in brain ageing
2025-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08334-8
PMID:39695234
|
研究论文 | 本研究通过构建空间分辨的单细胞转录组图谱，揭示了大脑老化过程中细胞邻近效应的影响 | 开发了空间老化时钟，利用机器学习模型识别老化和再生的空间及细胞类型特异性转录组特征，并发现T细胞和神经干细胞对邻近细胞的显著影响 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需验证 | 研究大脑老化过程中细胞间相互作用及其对组织衰退的影响 | 420万个来自20个不同年龄段的成年小鼠大脑细胞 | 生物信息学 | 老年疾病 | 空间转录组学 | 机器学习模型 | 单细胞转录组数据 | 420万个细胞 |
| 1950 | 2025-03-05 |
Cross-tissue multi-omics analyses reveal the gut microbiota's absence impacts organ morphology, immune homeostasis, bile acid and lipid metabolism
2025-Feb, iMeta
IF:23.7Q1
DOI:10.1002/imt2.272
PMID:40027481
|
研究论文 | 本文通过比较无菌小鼠和特定病原体自由小鼠，利用空间转录组学、单细胞RNA测序和靶向胆汁酸代谢组学，系统地评估了肠道微生物群缺失对器官形态、免疫稳态、胆汁酸和脂质代谢的影响 | 揭示了肠道微生物群缺失对多个器官的形态、免疫细胞、胆汁酸和脂质代谢的显著影响，特别是发现了无菌小鼠中自噬驱动的脂滴分解和ZBTB20-LPL轴在血浆脂质稳态中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探讨肠道微生物群缺失对宿主器官形态、免疫稳态和代谢的影响 | 无菌小鼠和特定病原体自由小鼠 | 代谢组学 | NA | 空间转录组学、单细胞RNA测序、靶向胆汁酸代谢组学 | NA | 转录组数据、代谢组数据 | 无菌小鼠和特定病原体自由小鼠 |
| 1951 | 2025-03-05 |
Shiba: A versatile computational method for systematic identification of differential RNA splicing across platforms
2025-Jan-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.30.596331
PMID:38895326
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Shiba的计算方法，用于系统识别跨平台的差异RNA剪接 | Shiba方法在捕获注释和未注释的剪接事件方面具有卓越的准确性、敏感性和可重复性，解决了连接读取不平衡的问题，显著减少了假阳性 | 尽管Shiba在样本大小方面具有灵活性，但其在单细胞RNA-seq中的应用仍需进一步验证 | 开发一种全面的方法来识别和分析跨RNA-seq平台的差异RNA剪接 | RNA剪接事件 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 模拟数据和真实RNA-seq数据集 |
| 1952 | 2025-03-05 |
scDMSC: Deep multi-view subspace clustering for single-cell multi-omics data
2025-Jan-22, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3532784
PMID:40031269
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研究论文 | 本文提出了一种基于深度多视图子空间学习的无监督聚类算法scDMSC，用于单细胞多组学数据的聚类分析 | 通过加权重建协调组学数据的异质性，并利用深度子空间学习识别共享的潜在特征，揭示了组学之间的相关性 | 未明确提及算法的计算复杂度或在大规模数据集上的性能限制 | 开发一种新的聚类算法，以更好地处理单细胞多组学数据的高维性、稀疏性和异质性 | 单细胞多组学数据 | 机器学习 | NA | 单细胞多组学测序技术 | 深度多视图子空间学习 | 单细胞多组学数据 | 多个真实和模拟数据集 |
| 1953 | 2025-03-05 |
Tumor-initiating cells escape tumor immunity via CCL8 from tumor-associated macrophages in mice
2025-Jan-07, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI180893
PMID:39774471
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研究论文 | 本研究揭示了肿瘤起始细胞（TICs）通过肿瘤相关巨噬细胞（Reg-TAMs）的CCL8介导的GAS6/AXL/MERTK信号通路逃避免疫清除的机制 | 首次结合单细胞RNA测序（scRNA-Seq）和双重组酶谱系追踪技术，鉴定了WNT激活的恶性细胞亚群作为体内TICs，并揭示了TICs与Reg-TAMs之间的互作机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类肿瘤中进行验证 | 探究肿瘤起始细胞（TICs）如何逃避免疫清除，并寻找新的免疫治疗策略 | 肿瘤起始细胞（TICs）和肿瘤相关巨噬细胞（Reg-TAMs） | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、双重组酶谱系追踪、化学抑制剂、基因敲除小鼠模型 | NA | RNA测序数据、基因表达数据 | 小鼠模型 |
| 1954 | 2025-03-05 |
Role of pericytes in regulating penile angiogenesis and nerve regeneration
2025-Jan-01, Asian journal of andrology
IF:3.0Q1
DOI:10.4103/aja202455
PMID:39162179
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综述 | 本文综述了周细胞在调节阴茎血管生成和神经再生中的作用，特别是在糖尿病性和神经性勃起功能障碍（ED）中的具体机制 | 本文通过综述2000年至2023年PubMed上的研究成果，深入探讨了周细胞功能障碍在ED发病机制中的重要作用，为未来研究提供了新的方向 | 本文主要基于文献综述，缺乏原始实验数据支持，且对周细胞在ED中的具体机制仍需进一步研究 | 分析周细胞在勃起功能障碍（ED）中的具体作用，特别是糖尿病性和神经性ED | 周细胞及其在ED中的作用 | 生物医学 | 勃起功能障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 文献数据 | NA |
| 1955 | 2025-03-05 |
Single-Cell Sequencing and Transcriptome Analysis Explored Changes in Midnolin-Related Immune Microenvironment and Constructed Combined Prognostic Model for Pancreatic Cancer
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S503326
PMID:40026303
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研究论文 | 本文通过单细胞测序和转录组分析探索了与midnolin相关的免疫微环境变化，并构建了胰腺癌的联合预后模型 | 首次结合MIDN表达、10个midnolin相关基因的预后模型和M1细胞浸润构建联合预后模型，为胰腺癌的免疫治疗提供了新视角 | 未明确说明样本量及具体实验细节 | 探索midnolin相关基因及免疫浸润细胞在胰腺癌预后中的价值，并构建联合预后模型 | 胰腺癌 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序, CIBERSORT, Cox回归, LASSO | 联合预后模型 | 单细胞数据, 转录组数据 | NA |
| 1956 | 2025-03-05 |
Integration of Single Cell and Bulk RNA-Sequencing Reveals Key Genes and Immune Cell Infiltration to Construct a Predictive Model and Identify Drug Targets in Endometriosis
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S497643
PMID:40026309
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，探索子宫内膜异位症的免疫机制和分子差异，并构建诊断和预测模型 | 首次整合单细胞和批量RNA测序数据，识别关键基因和免疫细胞浸润，构建高精度的预测模型并预测潜在药物靶点 | 研究样本量有限，且仅针对增殖期子宫内膜，未涵盖其他疾病阶段 | 探索子宫内膜异位症的免疫机制和分子差异，构建诊断和预测模型 | 子宫内膜异位症患者的增殖期子宫内膜和健康对照 | 数字病理学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量RNA测序（RNA-seq）、RT-qPCR | LASSO回归 | 基因表达数据 | 子宫内膜异位症患者和健康对照的基因表达数据 |
| 1957 | 2025-03-05 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Peripheral Immune Cell Senescence and Inflammatory Phenotypes in Patients with Premature Ovarian Failure
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S496130
PMID:40026314
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了早发性卵巢功能不全（POF）患者外周免疫细胞的衰老和炎症表型，并探讨了外周与卵巢局部免疫反应之间的相互作用 | 首次利用单细胞RNA测序技术详细描绘了POF患者的外周免疫微环境，并识别了与疾病相关的关键基因和细胞类型 | 样本量较小，仅包括3名健康个体和4名POF患者，可能限制结果的普遍性 | 探讨POF患者外周免疫微环境的复杂性及其与卵巢局部免疫反应的相互作用 | 早发性卵巢功能不全（POF）患者的外周血单核细胞（PBMCs） | 单细胞组学 | 早发性卵巢功能不全 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 3名健康个体和4名POF患者的外周血单核细胞 |
| 1958 | 2025-03-04 |
RNA research for drug discovery: Recent advances and critical insight
2025-May-05, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149342
PMID:39983851
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综述 | 本文探讨了RNA研究领域的最新进展及其在药物开发中的关键作用 | 强调了反义寡核苷酸（ASOs）、mRNA疗法和RNA干扰（RNAi）等重要发现，以及高通量测序、单细胞RNA测序和表观转录组学等技术在揭示RNA生物学复杂性方面的进展 | RNA稳定性、递送和脱靶效应等挑战仍然存在，需要持续创新和伦理考量 | 探讨RNA研究在药物发现中的转化潜力 | RNA生物学及其在治疗多种疾病中的应用 | 生物信息学 | 多种疾病 | 高通量测序、单细胞RNA测序、表观转录组学 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 1959 | 2025-03-04 |
Integration of single-cell RNA sequencing and network pharmacology to elucidate the effect of Yantiao Formula on alleviating ALI by regulating the polarization of alveolar macrophages
2025-Mar-13, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2025.119436
PMID:39914692
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和网络药理学，探讨了炎调方（YTF）通过调节肺泡巨噬细胞极化缓解急性肺损伤（ALI）的分子机制 | 首次结合单细胞RNA测序、网络药理学和分子对接技术，揭示了炎调方通过调节巨噬细胞极化缓解脓毒症诱导的急性肺损伤的机制 | 研究主要基于动物模型和体外细胞实验，尚未进行临床试验验证 | 探讨炎调方治疗脓毒症诱导的急性肺损伤的潜在分子机制 | 脓毒症诱导的急性肺损伤模型 | 数字病理学 | 急性肺损伤/急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、网络药理学、分子对接 | NA | RNA测序数据、药理学数据 | NA |
| 1960 | 2025-03-04 |
Identification of pathogenic PD-1+CD8+ T cells for effective chimeric antigen receptor therapy in a murine model of Sjögren's disease
2025-Mar-03, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.43144
PMID:40026078
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研究论文 | 本研究旨在识别干燥综合征（SjD）中的致病性CD8+ T细胞，并开发针对性的治疗策略 | 首次识别出PD-1+CD8+ T细胞在干燥综合征中的致病作用，并展示了PD-1靶向CAR-T细胞疗法在SjD模型小鼠中的疗效 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类患者中进行大规模临床试验 | 开发针对干燥综合征中致病性CD8+ T细胞的靶向治疗策略 | 干燥综合征患者和小鼠模型 | 免疫学 | 干燥综合征 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术、T细胞受体（TCR）分析 | CAR-T细胞疗法 | RNA序列数据、流式细胞术数据 | 干燥综合征患者和小鼠模型的样本 |