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当前共找到 10572 篇文献,本页显示第 1921 - 1940 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1921 2026-05-06
High-dimensional profiling of immune responses to kidney transplant reveals heterogeneous T helper 1 and B cell effectors associated with rejection
2025-Apr, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons IF:8.9Q1
研究论文 通过对肾移植后免疫应答进行高维分析,揭示了与排斥反应相关的异质性T辅助1细胞和B细胞效应器 首次在单细胞分辨率下系统描绘了肾移植排斥反应中不同内型涉及的免疫亚群多样性,并整合了表型、转录和克隆状态分析 信息未提供 探究肾移植后免疫排斥反应的机制,区分不同排斥反应内型中的免疫亚群特征 76名肾移植患者的血液CD4 T细胞和B细胞 数字病理学 肾脏疾病 单细胞RNA测序,T/B细胞受体测序,血浆细胞因子谱分析,批量RNA测序 NA 测序数据,细胞因子表达数据 76名肾移植受者 NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA NA
1922 2026-05-06
Graft-derived extracellular vesicles transport miRNAs to modulate macrophage polarization after heart transplantation
2025-Apr, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons IF:8.9Q1
研究论文 本研究利用小鼠心脏移植模型和单细胞RNA测序,揭示移植物来源的细胞外囊泡通过携带miRNA调节巨噬细胞极化,影响心脏移植后免疫排斥反应 首次发现移植物CD63阳性巨噬细胞来源的细胞外囊泡携带microRNA-363和microRNA-709,通过Fcho2/Notch1信号通路诱导受体脾脏M1型巨噬细胞极化,揭示了器官间免疫通讯的新机制 基于小鼠模型,结论在人体的适用性需进一步验证;未详细说明EV分离和表征的具体方法;未探讨其他可能参与的免疫细胞类型 探究心脏移植后移植物与受体脾脏之间免疫细胞相互作用的动态机制 小鼠心脏移植模型中的CD45免疫细胞,包括移植心脏和脾脏中的单核细胞/巨噬细胞亚群 机器学习 心血管疾病 单细胞RNA测序 非监督聚类 单细胞转录组数据 小鼠异位移植模型,具体样本量未在摘要中说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1923 2026-05-06
Eosinophilic esophagitis drives tissue fibroblast regenerative programs toward pathologic dysfunction
2025-Apr, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1
研究论文 该研究利用单细胞RNA测序等技术,揭示嗜酸性食管炎如何驱动组织成纤维细胞从再生程序转变为病理功能障碍 首次通过单细胞RNA测序结合功能实验,发现EoE成纤维细胞保留软骨细胞等硬细胞再生程序但失去脂肪细胞等软细胞分化能力,并揭示CD73和ATP代谢异常在致病机制中的关键作用 文中未明确提及局限性 探究慢性嗜酸性食管炎炎症诱导病理性成纤维细胞及其功能障碍的分子机制 嗜酸性食管炎患者和健康对照的食管成纤维细胞 数字病理学 嗜酸性食管炎 单细胞RNA测序、荧光激活细胞分选、成纤维细胞分化与迁移实验 NA 单细胞转录组数据、免疫染色图像、流式细胞数据 EoE患者与健康对照的活检样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台
1924 2026-05-06
Esophageal epithelial Ikkβ deletion promotes eosinophilic esophagitis in experimental allergy mouse model
2025-Apr, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1
研究论文 本研究利用条件性敲除食管上皮细胞中Ikkβ的小鼠模型,探讨上皮IKKβ/NF-κB信号在嗜酸性食管炎发病机制中的作用 首次证明食管上皮Ikkβ缺失会促进实验性过敏小鼠模型中嗜酸性食管炎的发展,并建立了更接近人类EoE的小鼠模型 未提及具体局限性 阐明上皮IKKβ/NF-κB信号在嗜酸性食管炎发病机制中的作用 条件性敲除食管上皮细胞中Ikkβ的小鼠(IkkβEEC-KO小鼠) 数字病理学 嗜酸性食管炎 单细胞RNA测序, RNA测序 NA 基因表达数据, 转录组数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
1925 2026-05-06
Thymic and T-cell intrinsic critical roles associated with severe combined immunodeficiency and Omenn syndrome due to a heterozygous variant (G201R) in PSMB10
2025-Apr, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1
研究论文 该论文报告了一例由PSMB10基因杂合变异(G201R)导致的严重联合免疫缺陷和Omenn综合征,并揭示了该变异在胸腺和T细胞内在中的关键作用 首次阐明PSMB10 G201R杂合变异通过显性负效应降低免疫蛋白酶体表达,影响CD8 T细胞阳性选择、T细胞受体库多样性和自身反应性T细胞的阴性选择,并证明胸腺植入可能带来治疗益处 仅基于单个患者及其家族研究,样本量有限;未进行更广泛的队列验证或动物模型实验来进一步证实机制 对携带PSMB10杂合变异的婴儿进行免疫学和分子特征描述,以理解该变异导致严重联合免疫缺陷和Omenn综合征的机制 一名携带PSMB10 p.G201R杂合变异的婴儿及其父母 机器学习 免疫缺陷病 流式细胞术、免疫印迹、人工胸腺类器官T细胞发育、单细胞RNA测序 NA 生物数据 1名患者及其父母的外周血单核细胞、EB病毒转化B细胞、成纤维细胞和CD34+细胞;人类胸腺组织用于单细胞测序 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium平台用于人类胸腺单细胞RNA测序
1926 2026-05-06
Endothelial FOSL1 drives angiotensin II-induced myocardial injury via AT1R-upregulated MYH9
2025-Apr, Acta pharmacologica Sinica IF:6.9Q1
研究论文 本研究揭示了FOSL1通过上调MYH9促进血管紧张素II诱导的心肌损伤的分子机制 首次发现FOSL1直接结合MYH9启动子并激活其转录,以及FOSL1/MYH9轴在Ang II诱导的血管重塑中的关键作用 未说明样本大小和人类验证实验 探究血管紧张素II诱导心肌损伤后血管重塑的分子机制 小鼠心脏内皮细胞和人脐静脉内皮细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞测序, 双荧光素酶报告基因, 染色质免疫沉淀 NA 基因表达数据, 序列数据 小鼠和细胞样本,具体数量未说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1927 2026-05-06
Meta-analyses of mouse and human prostate single-cell transcriptomes reveal widespread epithelial plasticity in tissue regression, regeneration, and cancer
2025-01-17, Genome medicine IF:10.4Q1
研究论文 通过对小鼠和人类前列腺单细胞转录组进行荟萃分析,揭示组织退化、再生和癌症中广泛的上皮可塑性 利用随机矩阵理论去噪并建立参考细胞类型分类,通过最优传输比较跨物种上皮细胞群体的转录组相似性,以及结合拷贝数变异分析揭示前列腺癌进展中的转录程序 未提及具体限制 研究前列腺上皮细胞在组织稳态、退化、再生及癌症中的动态变化和可塑性 小鼠和人类前列腺组织中的上皮细胞群体 数字病理学 前列腺癌 单细胞RNA测序 随机矩阵理论, 最优传输 单细胞转录组数据 新生成和已发表的多个小鼠和人类前列腺单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1928 2026-05-06
SenPred: a single-cell RNA sequencing-based machine learning pipeline to classify deeply senescent dermal fibroblast cells for the detection of an in vivo senescent cell burden
2025-01-14, Genome medicine IF:10.4Q1
研究论文 基于单细胞RNA测序的机器学习管道SenPred,用于分类深层衰老的真皮成纤维细胞,以检测体内衰老细胞负荷 首次利用2D和3D培养的深层衰老成纤维细胞的单细胞转录组数据,构建机器学习模型预测衰老;发现3D模型比2D更准确检测体内衰老细胞 目前仅为概念验证,仅针对特定细胞类型(真皮成纤维细胞)和衰老触发条件,无法推广到其他组织(如肺成纤维细胞) 开发一个基于单细胞RNA测序的机器学习管道,以精准检测体内衰老成纤维细胞,助力衰老相关疾病研究 人类真皮成纤维细胞(2D和3D培养的深层衰老细胞,以及体内皮肤组织) 机器学习 老年疾病 单细胞RNA测序 机器学习管道(未指定具体模型类型,如CNN等,故输出NA) 单细胞转录组数据 未明确提及样本数量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1929 2026-05-06
Single-Cell Transcriptomics Reveals Evolutionary Reconfiguration of Embryonic Cell Fate Specification in the Sea Urchin Heliocidaris erythrogramma
2025-01-06, Genome biology and evolution IF:3.2Q2
研究论文 利用单细胞转录组学揭示了海胆物种Heliocidaris erythrogramma胚胎细胞命运决定的进化重构 首次通过跨物种单细胞转录组时间序列分析,识别出海洋无脊椎动物发育调控网络的进化变化,发现主要生命史转变中细胞命运决定的时空分离 主要基于表达相关性推断调控相互作用,缺乏直接的实验验证,且仅比较了两个物种的祖先和衍生状态 研究胚胎发育中细胞命运决定的进化变化及其与表型多样性的关联 两种海胆:Heliocidaris erythrogramma(衍生状态)和Lytechinus variegatus(祖先状态)的胚胎细胞 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 两种海胆物种的多个发育时间点单细胞样本 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA NA
1930 2026-05-05
CrebA regulation of secretory capacity: genome-wide transcription profiling coupled with in vivo DNA binding studies
2025-12-10, Genetics IF:3.3Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序和体内DNA结合研究,探索果蝇CrebA转录因子对分泌能力的调控机制 将单细胞RNA测序与体内DNA结合研究结合,系统分析CrebA在胚胎组织中的转录调控网络,揭示其与靶基因结合位点与功能调控的关系 尚不清楚功能性结合与非功能性结合的区别,以及CrebA是否在所有胚胎组织中均为主要分泌途径基因表达驱动因子 研究CrebA转录因子在果蝇胚胎中调控分泌能力的作用机制及其保守性 果蝇胚胎唾液腺及CrebA空突变体胚胎 分子生物学 NA 单细胞RNA测序、DNA结合分析、转录组分析 NA 单细胞转录组数据 CrebA空突变体胚胎与野生型胚胎的单细胞RNA测序数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1931 2026-05-05
Immune reconstitution following allogeneic hematopoietic cell transplantation and CAR-T therapy: dynamics, determinants, and directions
2025-06, Best practice & research. Clinical haematology
综述 综述异基因造血干细胞移植和CAR-T治疗后免疫重建的动态过程、决定因素及未来方向 综合比较了异基因造血干细胞移植和CAR-T治疗两种情境下免疫重建的动力学特征,并提出了基于先进免疫分析技术(如流式细胞术和单细胞RNA测序)的个性化监测策略 未涉及具体患者队列数据,可能缺乏对临床实践中复杂因素的深入量化分析 总结免疫重建的动力学知识,评估不同移植和CAR-T治疗方案的影响,探讨优化免疫监测和治疗的个性化策略 异基因造血干细胞移植和CAR-T治疗后的患者 机器学习 血液系统疾病 流式细胞术, 单细胞RNA测序 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序, 流式细胞术 NA NA
1932 2026-05-05
Divergent Plastid Genomes in the Deepest-Branching Apicomplexan Parasites
2025-05-30, Genome biology and evolution IF:3.2Q2
研究论文 利用单细胞测序技术解析了最深分支顶复门寄生虫中质体基因组的多样性与进化 首次获取了所有四个已知古簇虫谱系中未培养代表的质体基因组数据,填补了顶复门质体基因组进化中的关键空白 未提及光合作用相关基因,且样本来自未培养的物种,可能限制基因组完整性的评估 研究顶复门寄生虫中质体(apicoplast)基因组的起源与进化 古簇虫谱系(archigregarines)中未培养代表的质体基因组 生物信息学 疟疾等相关寄生虫疾病 单细胞测序 NA 基因组序列 所有4个已知古簇虫谱系中未培养的代表性样本 NA NA NA NA
1933 2026-05-05
Cell Type Resolved Expression of Duplicate Genes Retained From Whole Genome Duplication in Atlantic salmon
2025-04-30, Genome biology and evolution IF:3.2Q2
研究论文 利用单细胞转录组学解析大西洋鲑全基因组复制后保留的重复基因的细胞类型特异性表达 首次通过单细胞转录组学技术,在细胞类型水平上研究全基因组复制事件后重复基因的表达差异和进化后果,并揭示不同细胞类型对细菌感染的转录反应差异 研究仅针对肝脏组织,且统计能力因细胞类型异质性而有所降低 理解全基因组复制事件后重复基因的细胞特异性表达及其功能与进化意义 大西洋鲑肝脏组织中的主要细胞类型(如肝细胞和免疫细胞) 数字病理学 细菌感染(由杀鲑气单胞菌引起) 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序数据 大西洋鲑肝脏组织样本(具体数量未在摘要中提及) NA 单细胞RNA-seq NA NA
1934 2026-05-05
Evidence of off-target probe binding in the 10x Genomics Xenium v1 Human Breast Gene Expression Panel compromises accuracy of spatial transcriptomic profiling
2025-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 研究10x Genomics Xenium平台基因表达探针组中脱靶结合对空间转录组分析准确性的影响 开发了Off-target Probe Tracker(OPT)软件工具,通过探针序列比对识别脱靶结合,并利用正交的空间和单细胞转录组数据验证预测结果 未提及具体局限性,但研究仅针对乳腺癌组织样本和特定基因面板,可能限制推广性 评估基于探针的空间转录组技术中脱靶结合对基因表达谱准确性的影响,提高数据生物学可解释性 10x Genomics Xenium v1人类乳腺癌基因表达面板中的280个基因 数字病理学 乳腺癌 空间转录组测序,单细胞RNA测序 NA 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 使用已发表的乳腺癌数据集,同一肿瘤块采集的Xenium、Visium CytAssist和3'单细胞RNA-seq样本 10x Genomics 空间转录组学,单细胞RNA测序 10x Xenium, 10x Visium CytAssist 10x Genomics Xenium v1 Human Breast Gene Expression Panel, Visium CytAssist, 10x 3'单细胞RNA测序
1935 2026-05-04
Loss of mucin 2 and MHC II molecules causes rare resistance to murine RV infection
2025-02-25, Journal of virology IF:4.0Q2
研究论文 该研究通过条件性敲除小鼠的分泌细胞(潘氏细胞、杯状细胞和肠内分泌细胞),发现黏蛋白2(MUC2)和MHC II分子的缺失导致小鼠对轮状病毒感染产生罕见的抵抗力 首次揭示杯状细胞产物MUC2与MHC II分子在轮状病毒易感性中的未知关联,并发现分泌细胞缺失可赋予小鼠罕见的抗感染能力 研究主要基于小鼠模型,可能不完全代表人类轮状病毒感染的机制;未明确MUC2和MHC II在抗病毒中的协同作用细节 探究肠道分泌细胞(尤其是杯状细胞)在轮状病毒感染发病机制中的作用 Atoh1条件性敲除小鼠(缺乏潘氏细胞、杯状细胞和肠内分泌细胞)及MUC2或MHC II缺陷小鼠 分子生物学 轮状病毒感染 单细胞RNA测序、条件性基因敲除 Atoh1条件性敲除小鼠模型、MUC2敲除小鼠模型、MHC II敲除小鼠模型 单细胞转录组数据 多种基因修饰小鼠品系,具体样本数量未在摘要中说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1936 2026-05-03
CausalGRN: deciphering causal gene regulatory networks from single-cell CRISPR screens
2025-Dec-31, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出CausalGRN算法框架,从单细胞CRISPR筛选数据中推断因果基因调控网络并预测未知扰动效应 通过自适应阈值校正消除稀疏单细胞RNA-seq数据中的虚假偏相关,结合扰动观测结果对无向图进行有向定向,实现因果关系推断 在多个实验数据集和模拟中验证,但未提及对大规模数据集的计算效率或罕见扰动类型的适用性限制 开发一种从单细胞CRISPR筛选数据推断因果基因调控网络的计算方法 单细胞CRISPR筛选数据中的基因调控网络 机器学习 不适用 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、CRISPR筛选 网络传播模型(自适应阈值校正及有向图定向) 单细胞基因表达数据 在多种模拟和实验数据集上验证,具体样本数量未在摘要中提供 不适用 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 不适用 不适用
1937 2026-05-03
ABCA4-mutant human retinal organoids sequencing reveals organoids application in inherited retinal diseases
2025-Dec, Experimental eye research IF:3.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析ABCA4突变的人类视网膜类器官,验证其作为遗传性视网膜疾病模型的可行性 首次通过单细胞RNA测序在细胞和转录组水平验证人类视网膜类器官能够捕捉ABCA4突变导致的Stargardt病早期分子变异 NA 验证人类视网膜类器官作为ABCA4突变引起的Stargardt病疾病模型的能力 2名Stargardt病患者与健康对照的视网膜类器官 机器学习 遗传性视网膜疾病, 斯塔加特病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 2个患者样本和健康对照的视网膜类器官 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
1938 2026-05-03
Alterations in Resident Immune Cells in Prenatal Trisomy 21 Lungs
2025-Nov-26, Cells IF:5.1Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了产前唐氏综合征(T21)胎儿肺部的免疫细胞变化,发现B细胞显著减少,可能解释了对呼吸道感染的易感性增加 首次在产前阶段利用单细胞RNA测序技术系统描绘唐氏综合征胎儿肺部免疫细胞图谱,并发现B细胞数量和成熟标志物的显著改变 样本量较小(T21组5例,对照组4例),且仅关注产前阶段,未探讨出生后免疫系统的变化 探究产前唐氏综合征胎儿肺部免疫细胞的变化,以解释其对呼吸道感染易感性增高的原因 产前唐氏综合征(T21)和非唐氏综合征(非T21)胎儿的肺部组织 数字病理学 唐氏综合征 单细胞RNA测序, 荧光原位杂交, 免疫荧光染色, qRT-PCR NA 单细胞转录组数据, 组织切片图像 5例唐氏综合征胎肺和4例非唐氏综合征胎肺 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
1939 2026-05-03
Mouse cortical cellular diversification through lineage progression of radial glia
2025-11-03, Genes & development IF:7.5Q1
研究论文 通过时间序列单细胞RNA测序和单核ATAC测序,研究小鼠皮层放射状胶质细胞谱系进程驱动的细胞多样化 首次结合时间序列scRNA-seq和snATAC-seq,系统揭示了放射状胶质细胞从早期到晚期转变过程中,通过限制广泛表达的转录因子到特定阶段和细胞类型,驱动皮层细胞多样化的染色质可及性机制 未提及 研究小鼠皮层放射状胶质细胞内在程序如何驱动皮层细胞多样化 纯化的小鼠皮层祖细胞(放射状胶质细胞、中间神经元祖细胞、中间胶质祖细胞) 单细胞组学 NA scRNA-seq, snATAC-seq NA 基因表达数据, 染色质可及性数据 多个胚胎和出生后阶段的小鼠皮层祖细胞样本 NA 单细胞RNA测序, 单核ATAC测序 NA NA
1940 2026-05-03
Highly accurate reference and method selection for universal cross-data set cell type annotation with CAMUS
2025-Nov-03, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 提出了一种名为CAMUS的跨数据集细胞类型注释方法,通过通用参考数据和方法选择策略实现高准确率和高效率的注释 首次提出一种通用的参考数据和方法选择策略,用于跨数据集细胞类型注释,显著提升注释准确率 未明确提及局限性,但可能依赖于参考数据集的多样性和覆盖度 开发一种能够自动选择最佳参考数据和方法的高准确率细胞类型注释方法 跨物种单细胞RNA测序、单细胞空间转录组和单细胞ATAC测序数据集 机器学学习 NA 单细胞RNA测序, 单细胞空间转录组, 单细胞ATAC测序 NA 基因表达矩阵 672对跨物种单细胞RNA测序数据集、80个单细胞空间转录组数据集和5个单细胞ATAC测序数据集 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组, 单细胞ATAC测序 NA NA
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