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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1901 2026-01-17
A core stemness-associated module reveals PLK1, NUF2, KIF23, CDCA8, TOP2A, CENPF, AURKA, and ASPM as key genes in rectal cancer
2025-Dec-10, European journal of medical research IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞转录组学和高维共表达网络分析,识别出一个与直肠癌干细胞相关的八基因核心模块,并验证了其诊断和预后价值 首次结合单细胞图谱和高维共表达网络分析,在直肠癌中定义了一个与干细胞特性相关的八基因特征,并揭示了其与G2/M检查点及免疫微环境的关联 研究主要基于体外实验和生物信息学分析,缺乏体内和临床验证 识别直肠癌特异性癌症干细胞生物标志物和治疗靶点 直肠癌干细胞样细胞群 数字病理学 直肠癌 单细胞转录组学, qRT-PCR, 分子对接 hdWGCNA 单细胞RNA-seq数据, 批量RNA-seq数据 来自GSE199726、TCGA-READ和GEO GSE90627队列的样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1902 2026-01-17
Unveiling the role of angiogenesis-related biomarkers in diabetic nephropathy via transcriptomics
2025-Dec-09, Diabetology & metabolic syndrome IF:3.4Q2
研究论文 本研究通过转录组学分析,结合孟德尔随机化和单细胞RNA测序,鉴定了糖尿病肾病中与血管生成相关的生物标志物,并探讨了其在疾病中的作用 首次整合公共数据库数据、孟德尔随机化分析和单细胞RNA测序,系统识别了CD44、HSPG2、LPAR1和PTGES作为糖尿病肾病的新型生物标志物和风险因子,并构建了诊断列线图 研究主要依赖公共数据库的回顾性数据,缺乏前瞻性临床验证;样本来源和数量可能受限,且机制研究尚需进一步实验证实 探索糖尿病肾病中血管生成相关生物标志物,为临床诊断和治疗提供理论依据 糖尿病肾病患者的转录组数据及相关生物样本 生物信息学 糖尿病肾病 转录组学分析、孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、qRT-PCR、Western blotting NA 转录组数据、基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1903 2026-01-17
Comprehensive profiling of smoke-induced T cells in mice implicates clonal γδT17 cells as a hallmark of COPD
2025-Dec-08, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序、TCR测序和流式细胞术验证,全面分析了吸烟诱导的小鼠T细胞变化,揭示了克隆性γδT17细胞作为慢性阻塞性肺疾病(COPD)的标志物及其保护性作用 首次在吸烟诱导的COPD模型中,通过单细胞多组学技术系统表征了T细胞的改变,并发现克隆性扩增的γδT17细胞在炎症中具有保护功能,为COPD的早期预防和治疗提供了新靶点 研究基于小鼠模型,结果在人类COPD患者中的适用性需进一步验证;单细胞测序技术可能无法完全捕获所有细胞亚群或低丰度细胞类型 探究吸烟诱导的慢性阻塞性肺疾病(COPD)中T细胞的免疫反应机制,以寻找新的治疗靶点 小鼠模型中的T细胞,特别是吸烟暴露后肺组织和循环系统中的γδ T细胞 单细胞组学 慢性阻塞性肺疾病 单细胞RNA测序, TCR测序, 流式细胞术 NA 单细胞转录组数据, TCR序列数据, 流式细胞数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1904 2026-01-17
Pan-cancer profiling links C1orf50 to DNA repair and immune modulation in ovarian cancer
2025-Dec-08, Journal of ovarian research IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过泛癌分析揭示了C1orf50在卵巢癌中与DNA修复和免疫调节的关联 首次将C1orf50与卵巢癌的基因组不稳定性、DNA修复缺陷和免疫抑制微环境联系起来,并利用单细胞RNA测序数据深入分析其免疫调节作用 研究主要基于公共数据集,缺乏实验验证,且结论需要前瞻性研究和功能实验进一步确认 探究C1orf50在多种癌症特别是卵巢癌中的功能及其在免疫基因组背景下的作用 多种癌症类型,重点关注卵巢癌,使用TCGA和单细胞RNA测序公共数据集 生物信息学 卵巢癌 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1905 2026-01-17
Prognostic significance of somatic mutations in myeloid cells of men with chronic heart failure - interaction between loss of Y chromosome and clonal haematopoiesis
2025-Dec, European journal of heart failure IF:16.9Q1
研究论文 本研究探讨了男性慢性心力衰竭患者中体细胞突变(特别是Y染色体丢失和克隆性造血)的预后意义及其相互作用 首次在慢性心力衰竭患者中系统评估了Y染色体丢失与克隆性造血驱动突变(如DNMT3A和TET2)的共现及其对死亡率的联合影响,并通过单细胞RNA测序揭示了LOY单核细胞的促纤维化信号增强机制 研究主要针对男性患者,未包括女性;样本量相对有限,且验证队列仅针对HFrEF患者;机制研究基于缺血性心力衰竭患者,可能不适用于所有心力衰竭类型 评估Y染色体丢失和克隆性造血突变在男性慢性心力衰竭患者中的预后价值及其相互作用 781名男性慢性心力衰竭患者,涵盖全谱左心室射血分数,包括HFrEF患者验证队列 心血管疾病 慢性心力衰竭 单细胞RNA测序 NA 基因测序数据、临床预后数据 781名男性慢性心力衰竭患者,外加一个HFrEF患者验证队列 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1906 2026-01-17
METTL3/RBM15 augments the stability of Kdm6b mRNA and promotes STAT1-mediated macrophage activation and atherosclerosis
2025-Dec, Experimental & molecular medicine
研究论文 本研究通过多组学分析揭示了METTL3/RBM15介导的m6A修饰通过增强Kdm6b mRNA稳定性,进而促进STAT1介导的巨噬细胞活化及动脉粥样硬化发展的分子机制 首次系统阐明了m6A修饰在巨噬细胞分化与活化过程中的动态调控网络,并发现Kdm6b通过去甲基化Jak1诱导其磷酸化的新机制 研究主要基于小鼠模型,人类临床样本验证尚不充分;METTL3抑制剂STM2457的系统性效应可能涉及其他细胞类型 探究m6A修饰在巨噬细胞活化及动脉粥样硬化发展中的调控作用 巨噬细胞分化与活化过程、动脉粥样硬化小鼠模型 表观遗传学 心血管疾病 MeRIP-seq, RNA-seq, 单细胞RNA-seq, Western blot, qPCR, RIP-qPCR, 共免疫沉淀 基因敲除小鼠模型 测序数据、蛋白质印迹数据、PCR数据 未明确样本数量,使用巨噬细胞特异性Kdm6b敲除小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
1907 2026-01-17
Metastasis-Initiating Osteosarcoma Subpopulations Establish Paracrine Interactions with Lung and Tumor Cells to Create a Metastatic Niche
2025-Nov-14, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究通过多种模型揭示了骨肉瘤中一个低增殖亚群通过响应肺上皮细胞来源的IL1α,维持促转移细胞因子如IL6和CXCL8的产生,从而启动肺转移,并表明破坏IL1信号可显著减少转移进展 识别了骨肉瘤中启动转移的低增殖细胞亚群及其与肺上皮细胞的旁分泌相互作用机制,首次将IL1α-IL6/CXCL8轴确定为转移的关键驱动因素 研究主要基于体外模型和动物实验,人类临床样本的直接验证有限,且未全面探讨其他潜在转移机制 揭示骨肉瘤肺转移的细胞和分子机制,以开发针对转移的靶向疗法 骨肉瘤细胞亚群、肺上皮细胞、小鼠模型和人类异种移植模型 肿瘤生物学 骨肉瘤 单细胞RNA测序、体外器官型转移模型、基因组和药理学干扰 NA 基因表达数据、细胞培养数据、动物模型数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1908 2026-01-17
Integrating bulk and single-cell RNA sequencing analysis to reveal characterization of mechanical stimulus-related genes and prognostic signatures in breast cancer
2025-Nov-13, Breast cancer research : BCR IF:6.1Q1
研究论文 本研究整合了bulk和单细胞RNA测序分析,揭示了乳腺癌中机械刺激相关基因的特征,并构建了一个用于预测患者预后的评分模型 首次整合bulk和单细胞RNA测序数据,构建了一个基于机械刺激相关基因的乳腺癌预后评分模型,并在单细胞分辨率上揭示了机械刺激对肿瘤免疫微环境的影响 NA 识别基于机械刺激相关基因的分子亚型并建立预后评分模型,以预测乳腺癌患者预后并理解机械刺激在肿瘤微环境中的作用 乳腺癌患者 数字病理学 乳腺癌 bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 LASSO-Cox回归模型 RNA测序数据 NA NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
1909 2026-01-17
Tool Comparison for Detecting Tumour Cells in Endometrial Cancer via Single-Cell Copy Number Variations Analysis
2025-Nov, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 本研究比较了四种基于单细胞转录组数据推断拷贝数变异以预测子宫内膜癌细胞的主要工具(SCEVAN、CopyKAT、InferCNV和sciCNV)的可靠性 首次系统评估了多种单细胞CNV推断工具在子宫内膜癌中的性能,并提出了通过选择富含上皮细胞的亚克隆来减少假阳性的策略 InferCNV和sciCNV工具不直接预测肿瘤细胞,其CNV评分分布曲线未能清晰区分恶性和非恶性细胞群体,因此无法评估其性能 评估单细胞CNV分析工具在检测子宫内膜癌细胞中的可靠性,并为研究人员提供改进预测准确性的建议 子宫内膜癌细胞 数字病理学 子宫内膜癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 使用公开可用的scRNA-seq数据,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1910 2026-01-17
Identification of Disulfidptosis-Associated Hub Genes in Psoriasis via Integrated Transcriptomic and Experimental Validation Approaches
2025-Nov, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 本研究通过整合转录组学和单细胞RNA测序数据,结合机器学习方法,识别了与银屑病相关的二硫化物死亡相关枢纽基因,并探讨了其在疾病发病机制中的作用 首次将新发现的细胞死亡途径——二硫化物死亡与银屑病联系起来,并利用整合的转录组学和单细胞RNA测序数据结合机器学习方法识别了相关的枢纽基因 研究主要基于生物信息学分析和小鼠模型验证,需要在人类临床样本中进行进一步的功能验证 探究二硫化物死亡相关基因在银屑病发病机制中的作用,并识别潜在的生物标志物和治疗靶点 银屑病皮损和非皮损皮肤组织,以及咪喹莫特诱导的银屑病样小鼠模型 生物信息学 银屑病 转录组学分析,单细胞RNA测序,Western blotting LASSO回归,随机森林 转录组数据,单细胞RNA测序数据 多个数据集(GSE106992,GSE11239,GSE162183)和小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
1911 2026-01-17
Foxn3 is required to suppress aberrant ciliogenesis in nonphotoreceptor retinal neurons
2025-Jul-22, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究探讨了转录因子Foxn3在抑制视网膜非感光神经元中异常纤毛发生中的作用 首次揭示了Foxn3作为关键转录抑制因子,通过直接结合并抑制纤毛基因及其反式激活因子的启动子,来防止非感光神经元形成类似感光细胞的纤毛结构 研究主要基于小鼠模型,其在人类视网膜中的具体作用机制尚需进一步验证 探究视网膜细胞类型间纤毛结构差异的建立与维持机制 视网膜特异性条件性敲除(Foxn3CKO)小鼠的视网膜神经元,特别是双极细胞和无长突细胞 发育生物学 纤毛病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、染色质分析、转录测定 条件性基因敲除小鼠模型 基因表达数据、电生理数据、染色质结合数据 Foxn3CKO小鼠及其对照 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1912 2026-01-17
Genomic and Single-Cell Analyses Characterize Patient-Derived Tumor Organoids to Enable Personalized Therapy for Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2025-Jul-15, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究通过建立头颈部鳞状细胞癌患者来源的肿瘤类器官,结合基因组和单细胞分析,揭示了肿瘤异质性、顺铂耐药机制,并识别了潜在治疗靶点 利用患者来源的肿瘤类器官模型,结合bulk和单细胞RNA测序,首次在类器官中表征了分子亚型和瘤内转录异质性,并发现了一种与顺铂耐药和不良预后相关的混合上皮-间质转化样程序,识别了amphiregulin作为关键调节因子 研究样本量相对较小(31例患者),且主要基于体外类器官模型,其体内生理环境模拟和长期临床验证仍需进一步研究 改善头颈部鳞状细胞癌的生物学理解并开发个性化疗法 头颈部鳞状细胞癌患者及其来源的肿瘤类器官 数字病理学 头颈部鳞状细胞癌 bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 患者来源的肿瘤类器官模型 基因组数据, 转录组数据, 组织病理学数据 31例头颈部鳞状细胞癌患者 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1913 2026-01-17
LSD1 inhibition corrects dysregulated MHC-I and dendritic cells activation through IFNγ-CXCL9-CXCR3 axis to promote antitumor immunity in HNSCC
2025-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究阐明了LSD1抑制通过IFNγ-CXCL9-CXCR3轴调控MHC-I和树突状细胞激活,从而增强头颈鳞状细胞癌抗肿瘤免疫的机制 首次揭示了LSD1抑制通过激活H3K4me2并直接与MHC-I相互作用来诱导抗肿瘤免疫的新机制 研究主要基于小鼠模型和体外共培养实验,在人体内的直接验证尚不充分 阐明LSD1在头颈鳞状细胞癌抗肿瘤免疫中的作用机制 头颈鳞状细胞癌小鼠模型、人类头颈鳞状细胞癌细胞、外周血单个核细胞 肿瘤免疫学 头颈鳞状细胞癌 流式细胞术、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、蛋白质表达数据 小鼠模型、人类细胞系、TCGA数据库数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1914 2026-01-17
Smooth muscle cell-specific CD47 deletion suppresses atherosclerosis
2025-Jan-15, Life sciences IF:5.2Q1
研究论文 本研究探讨了平滑肌细胞特异性CD47缺失对动脉粥样硬化的抑制作用 首次揭示了TSP1-CD47信号在调节VSMC表型中的作用,并证明SMC特异性Cd47缺失能抑制动脉粥样硬化病变形成 未详细探讨CD47缺失对其他细胞类型或全身代谢的长期影响,且主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 研究血管平滑肌细胞TSP1-CD47信号在调节VSMC表型和动脉粥样硬化发展中的作用 人类和小鼠的血管平滑肌细胞、动脉粥样硬化组织、SMC特异性Cd47敲除小鼠 心血管疾病研究 动脉粥样硬化 单细胞RNA测序、免疫组织化学、分子生物学技术、细胞特异性敲除小鼠模型 NA 基因表达数据、组织图像、细胞实验数据 人类动脉粥样硬化血管组织、小鼠模型(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
1915 2026-01-17
Efficient and accurate detection of viral sequences at single-cell resolution reveals putative novel viruses perturbing host gene expression
2025-Jan-02, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种基于高度保守氨基酸域的方法,用于在批量及单细胞转录组学数据中高效、准确地检测病毒序列,并应用于识别恒河猴PBMC数据中的潜在新病毒 该方法不依赖参考基因组,能保留单细胞分辨率,通过细胞条形码追踪,覆盖超过10万种RNA病毒物种,实现病毒存在与宿主基因表达的并行分析 未明确提及具体样本量或实验验证细节,可能受限于数据质量和病毒保守域的覆盖范围 开发一种高效准确的病毒检测方法,以理解病毒感染对人类健康的影响并预测潜在流行病 病毒序列(特别是RNA病毒)及宿主基因表达,应用于恒河猴外周血单个核细胞数据 生物信息学 病毒感染 高通量测序,单细胞转录组学 基于保守氨基酸域的检测方法 转录组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
1916 2026-01-16
Type 2 diabetes Reprograms Bone Marrow Hematopoiesis and Dysregulates Immune Signaling in Response to Stroke
2025-Dec-30, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨了2型糖尿病如何通过重编程骨髓造血功能和失调免疫信号通路来恶化中风后的免疫反应和预后 首次在单细胞水平上揭示了2型糖尿病背景下中风后骨髓造血功能的重编程、细胞间通讯网络的重组以及代谢与免疫信号通路的失调 研究基于小鼠模型,其结论在人类中的普适性有待验证;研究主要关注骨髓,未全面评估外周免疫器官的影响 阐明2型糖尿病恶化中风预后的潜在免疫机制 对照(db/+)和糖尿病(db/db)小鼠的骨髓细胞 单细胞组学与免疫学 2型糖尿病与缺血性中风 单细胞RNA测序,GeoMx数字空间谱分析,nCounter分析,流式细胞术 伪时间轨迹分析,CellChat细胞通讯分析,AUCell富集分析 单细胞转录组数据,空间转录组数据,基因表达数据,流式细胞数据 对照和糖尿病小鼠模型(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学,数字分子谱分析 GeoMx DSP,nCounter GeoMx数字空间谱分析用于空间基因表达分析,nCounter用于靶向基因表达分析
1917 2026-01-16
A stem cell knockout village reveals lineage rewiring and a non-canonical islet cell fate in monogenic diabetes
2025-Dec-25, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文通过建立敲除村框架,利用纵向单细胞RNA测序分析79个人类多能干细胞突变系,揭示了单基因糖尿病中细胞命运重连和非经典胰岛细胞命运的形成机制 首次引入敲除村框架进行大规模纵向单细胞RNA测序分析,揭示了单基因糖尿病基因突变导致β细胞向肠嗜铬样细胞命运转变的新机制,并预测验证了ISL1作为关键下游效应因子 研究主要基于体外干细胞分化模型,可能无法完全模拟体内复杂环境;突变系数量虽多,但仅覆盖30个发育调节因子 探究单基因糖尿病中基因突变如何改变发育轨迹并产生病理细胞状态 79个人类多能干细胞突变系,靶向30个发育调节因子(包括15个糖尿病基因),分化为胰岛细胞 单细胞组学 单基因糖尿病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 79个干细胞突变系,覆盖五个胰岛分化阶段 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1918 2026-01-16
Site-specific ERα phosphorylation determines sex-dependent metabolic, reproductive, and body-compositional phenotypes in mice
2025-Dec-19, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过构建ERα特定丝氨酸位点磷酸化缺陷的基因敲入小鼠,揭示了位点特异性ERα磷酸化对小鼠代谢、生殖和身体组成的性别依赖性调控作用 首次在体内系统研究了ERα两个保守磷酸化位点(S171和S216)的生理功能,并发现这些位点对代谢、生殖和骨骼表型具有性别特异性的调控作用 研究仅限于小鼠模型,人类中的相关性尚需验证;机制研究主要基于转录组分析,具体的信号通路和分子机制有待深入 探究雌激素受体α(ERα)特定磷酸化位点在调节代谢、生殖和身体组成中的生理功能 ERα S171A和S216A磷酸化缺陷基因敲入小鼠 分子生物学 代谢性疾病 基因敲入、单细胞空间转录组学、代谢谱分析 NA 转录组数据、代谢数据、骨骼密度数据 基因敲入小鼠模型 NA 单细胞空间转录组学 NA NA
1919 2026-01-16
CellMentor: cell-type aware dimensionality reduction for single-cell RNA-sequencing data
2025-Dec-11, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文介绍了一种名为CellMentor的全监督降维方法,用于单细胞RNA测序数据分析 CellMentor是一种基于非负矩阵分解的全监督降维方法,首次将细胞类型标签直接整合到优化目标中,以最小化已知群体内的变异并最大化类型间的区分 NA 开发一种改进的单细胞RNA测序数据降维方法,以优化细胞类型识别 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 非负矩阵分解 基因表达谱 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1920 2026-01-16
Aire-dependent interferon signalling shapes thymocyte maturation and central tolerance in mice
2025-Dec-09, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了Aire蛋白通过调控胸腺干扰素信号通路,影响胸腺细胞成熟和中枢免疫耐受的机制 首次在单细胞分辨率下系统揭示了Aire缺陷如何通过干扰素信号通路影响胸腺微环境中多种免疫细胞的转录组特征 研究仅限于小鼠模型,未在人类样本中验证;机制研究主要基于转录组分析,缺乏功能实验的直接验证 阐明Aire缺陷如何通过干扰素信号通路影响免疫细胞发育和中枢耐受 Aire缺陷型和野生型小鼠的胸腺、骨髓和淋巴结免疫细胞 单细胞组学 自身免疫性疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 Aire缺陷型和野生型小鼠的胸腺、骨髓和淋巴结组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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